3KAOA

Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from staphylococcus aureus
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKSNQKIASIEQLSNNEGIISALAFDQRGALKRMMAKHQTEEPTVAQIEQLKVLVAEELTQYASSILLDPEYGLPASDARNKDCGLLLAYEKTGYDVNAKGRLPDCLVEWSAKRLKEQGANAVKFLLYYDVDDAEEINIQKKAYIERIGSECVAEDIPFFLEVLTYDDNIPDNGSVEFAKVKPRKVNEAMKLFSEPRFNVDVLKVEVPVNMKYVEGFAEGEVVYTKEEAAQHFKDQDAATHLPYIYLSAGVSAELFQETLKFAHEAGAKFNGVLCGRATWSGAVQVYIEQGEDAAREWLRTTGFKNIDDLNKVLKDTATSWKQRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase
publication title Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from Staphylococcus aureus
rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
total genus 123
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kaoA00
4NU7A 4H3DA 3DI1A 3NQGA 1VYPX 1YADA 4K6AA 3P8IA 1WOBA 3C52A 4O57A 2B0MA 3EXRA 4XBKA 4LTSA 1TV7A 5I3IA 1TREA 1K8ZA 3M5ZA 4I9AA 4N4PA 3LHWA 4DPQA 1P5BA 4Q33A 1RVGA 3G1YA 1VH7A 1TSIA 3DBPA 2FB2A 1SU5A 3THQA 1FUYA 2WNNA 3HIJA 1IIHA 2JGQA 4MFEA 5SWUA 1EEPA 1AK5A 2DZUA 2FPYA 1TCDA 3P67A 1UB3A 5J5RA 2V0TA 3U8GA 4JTSA 2J27A 3VE7A 4ZVJA 3NQ8A 3UD6A 2O7QA 3BW3A 4LVAA 3NAVA 1WAUA 2DP3A 1OHLA 1RZMA 4MJMA 4KKXA 5BOOA 3UY7A 3LHVA 3LXBA 1DJQA 4DBEA 2B7NA 3DFNA 4TU1A 4GNJA 4M6QA 3GZ3A 1LROA 1NF7A 3G24A 3G3MA 1AW1A 2Q8ZA 3W1LA 4DXVA 3G1SA 5CPNA 3FEMA 4NJKA 2Q3OA 1H7OA 1HTIA 3SFKA 3M5XA 2TYSA 2YFOA 1UUOA 4QSHA 5EBUA 5G2WA 4Q4KA 1KFBA 4N2YA 1XDMA 1QPQA 3NXFA 5DCBA 3BV4A 3N73A 4XWUA 1KM6A 4M6PA 1O5XA 3IVUA 2KZHA 2QUUA 2B7OA 2YPIA 3R2GA 5A5WA 3LCWA 1QPNA 4WOZA 3DGRA 4UTTC 3TSBA 1M7OA 3TV8A 4OQVA 1MSSA 3SGUA 1J2WA 2Z6IA 1K3UA 3M0ZA 1TV8A 3S5OA 3SI9A 5IBXA 4RV8A 3NL6A 4CLMA 3MBDA 1TYGA 4R53A 5DY3A 3DHDA 4KWWA 4UTKA 4MLJA 3IGXA 3GXTA 4LS1A 3NQCA 4PTNA 2Y89A 1P1XA 3OG3A 4GWEA 1VC4A 1I8JA 2TRSA 4E2BA 3BLEA 3SZ8A 3LBMA 3M5VA 3P7YA 3QSTA 5D33A 4DF0A 2V81A 4FEZA 1X7FA 4AHPA 1RQHA 1O5KA 4IQLA 2V5LA 2DORA 5AN7A 1JQXA 2Y7FA 1JCJA 2PRLA 3PBWA 1YYAA 4LU0A 2G96A 3QPZA 3NQDA 3Q94A 3R13A 3STCA 4LNYA 1OFPA 1KBIA 4M19A 3IV3A 1K8YA 3P8JA 3TFCA 4MPQA 5G4EA 4O8RA 3QRHA 4KFOA 3EB2A 5EKYA 3HG3A 1L6YA 3GAKA 1C9DA 2ZBTA 5HULA 1H51A 3MI2A 3W9ZA 4NJJA 3NZRA 5G2HA 1WX0A 1JCLA 4NT0A 1P0KA 1LLWA 3FJLA 3B06A 1H1ZA 5G1TA 2RHGA 1EA0A 1FCUA 3HG4A 4MZYA 3TNOA 5FEPA 1JQVA 1SFLA 3C4UA 1N7KA 3IVTA 5BW6A 3TH6A 3FS2A 3T40A 3BPWA 2E6YA 2PCQA 4WD0A 5LHEA 5K2ZA 2HSAA 3JRKA 3DFQA 3MHFA 2GJLA 3F4WA 4JTJA 1R2RA 3LV5A 3JR2A 3NGJA 3W2UA 1MEHA 2WV8A 1I2QA 4IMGA 4QIUA 4S1FA 1SO4A 3GDLA 1G6CA 2NV2A 1HUVA 2WKJA 4A22A 2TMDA 1D9EA 3NYZA 3S5NA 3BLIA 1XUZA 3KRZA 3EX6A 4PCFA 4Y90A 1QWGA 1FDYA 3KAOA 3OHIA 4IXXA 4EF8A 2CZDA 1Z44A 4W9TA 1SO3A 2JKAA 1TMHA 2E5CA 5I3GA 4UTIA 4NNCA 5F2LA 4WY0A 1S5WA 2F84A 5G5IA 1OFDA 2OZ0A 4LW7A 5AOUA 1OFQA 3QYQA 4BI7A 4CNPA 3STEA 4JTFA 4UTJA 5FF7A 3VI2A 4UMBA 1S5TA 1Q6RA 2BLEA 2NV1A 4K7VA 2QCNA 1F7BA 3TROA 4RZ5A 3QPYA 3W71A 1GOXA 3U2OA 1PCKA 2JKEA 1W3IA 2RKXA 4YXGA 2ABBA 1KM1A 8TIMA 4OGZA 2GQ9A 3F03K 4ORMA 3B03A 1J4EA 3NPXA 4MY1A 2OT0A 2PE4A 3LTSA 1CI1A 3DFSA 4NNAA 2ZYFA 2ZQ0A 2FPVA 1NSJA 4PFMA 4WOQA 2ZRXA 3UWWA 1GG1A 4EIVA 4YLWA 3W7MA 3KOFA 2CLEA 1B4KA 3N34A 1FY6A 3M43A 3P84A 2NX3A 4IUOA 3O63A 1G4EA 4O1CA 3UWQA 3C3NA 1F76A 3NQ6A 2G95A 2PC4A 3C6CA 3VFLA 1W5OA 5FI8A 4P61A 1DORA 1EWDA 3PUEA 3PBYA 4E2DA 5D2XA 1LBFA 1C8VA 1JCXA 4OWGA 3M44A 1XBXA 2FPTA 4O1BA 4O4VA 3P61A 1SPQA 5F4XA 3T7VA 3LRLA 2XN0A 3ABOA 1OYAA 5LHFA 4GFSA 3LLDA 4TMCA 1LBLA 1K7XA 1YDVA 1GYLA 4ALDA 2J9ZA 2O7SA 2V2CA 3O6DA 4JTTA 4ADSA 2DZTA 2CLFA 3BLFA 4NZJA 4EWND 5DBTA 3O06A 4UFLA 3MW7A 3NA8A 3BW2A 1EUAA 3TMQA 1LM1A 4K8HA 2BX7A 2YW3A 1O94A 2ZZ4A 4NJHA 1ALDA 4O12A 3ZWTA 3N19B 1NVMA 3RU6A 3HMJG 2R14A 3DI0A 4JX5A 3LGEA 3TXVA 1M5WA 2H8ZA 3LXCA 3NVTA 3A24A 4R33A 1VPXA 1LP6A 3KVMA 1QAPA 3HPZA 1I2NA 4JN6A 1KM2A 5DCEA 2J88A 3Q58A 3NEVA 3W2JA 3DHFA 1QMLA 4B5NA 3QF0A 4XTIA 5BNKA 4K36A 2E77A 2TSYA 1GVRA 5AHMA 4RLIA 2DZWA 4Z1CA 1DV7A 5AHNA 5F4SA 3GKAA 4YL2A 5F4WA 1ZCOA 4AWTA 4AHQA 3K30A 3W72A 3N14A 3WJZA 3P5YA 1SR9A 3G1HA 1XBYA 4LRTA 3W2KA 3L0GA 3HGRA 1UBSA 1B9BA 2QEZA 4LV4A 3LRMA 1X1ZA 3E02A 3R12A 4UFHA 4IMEA 2X2GA 1R2TA 3CWOX 1H7XA 1OX5A 1OF6A 3T44A 2Z0IA 4LOCA 5CSSA 3KXQA 3KFTA 1H50A 3W7IA 2NX9A 4QNWA 2V30A 1MEIA 3FOKA 2ZZ1A 2VENA 3TUUA 3TCEA 1F74A 4HPXA 2RH9A 4N4QA 5F2IA 1LTDA 2C18A 4O0ZA 5CPOA 2Q8LA 4N9EA 1W31A 3L2IA 1K7EA 2ZRVA 3CM4A 3TE9A 4BR1A 3W88A 3PY2A 3W7JA 4BI6A 1H7PA 3HF3A 5IBXC 5AHFA 2ISWA 3W23A 4FIRA 4UMAA 1A50A 3L65A 4WZHA 1W56A 4O10A 4MJZA 2UV8G 4Z0SA 1H62A 1GVOA 1A5SA 3BARA 4JNMA 2HS6A 2VEIA 2YW4A 4NXKA 4IMDA 2P1FA 1OVDA 2Y85A 2AGKA 3S5YA 3NPUA 2ZRUA 1Q3NA 1QPOA 1PVNA 3U6WA 2V8ZA 4BK9A 3P82A 4UNKA 1TTJA 2ZZ6A 4M5PA 5LGXA 2BTMA 3BG3A 5HWMA 1W5NA 4JDBA 1ZALA 3HPSA 1N8FA 2Y6ZA 1XBZA 2R91A 3B05A 2CW6A 3EXTA 3CEPA 3UNDA 2Y70A 1VJIA 1TB3A 2X1SA 2Y61A 5I3JA 5D30A 6ALDA 3LDVA 3LI0A 1R30A 4PC8A 1RQBA 1W5MA 4LS0A 3LCIA 2CZ5A 4IMFA 5T26A 1OK4A 3A5FA 3TK7A 1ZHAA 3S1WA 3UZ5A 1J5TA 2YR1A 3MYOA 4K38A 4M6VA 4KWVA 2W6RA 1ZAJA 2E09A 1HO1A 4ZQMA 3USBA 1SW0A 4NJGA 1K8XA 2J24A 1QDSA 1ZENA 5G2IA 1F6KA 1IXOA 3E96A 4JICA 4WX2A 1MXSA 2QCMA 2C3ZA 4U4MA 1TTPA 4LV9A 4DELA 1TJRA 1ZAIA 3QMTA 3W1RA 4IX0A 3S5ZA 3UQNA 5KTLA 5K9XA 2QR6A 4FO4A 3EX4A 3GKFA 3WJXA 3LRKA 1N55A 4CQ9A 4YMZA 2CLLA 4GE8A 4OBTA 1B4EA 3F4NA 5DELA 2QDGA 4NUWA 3W1UA 1AMKA 2WNQA 3MJYA 4UFJA 4FF7A 4N6EA 3W1NA 3MP4A 1YDNA 5FEZA 2WPBA 1I2RA 3W7EA 2FJKA 4Z0JA 3MHUA 3BVJA 2LLEA 4JY8A 2E1DA 1KFKA 2DZSA 2V2HA 1JRBA 1Z48A 3QSRA 1ZJIA 1I4NA 3RK8A 3CIWA 4EOUA 5DCDA 4MYAA 3WK1A 3DFTA 4JTHA 4NZFA 2ABAA 4MYXA 2RDWA 2ZA1A 2DZXA 3MWAA 4UTWA 1P0NA 3MBFA 3TC6A 1TPDA 3E49A 4X9SA 1SZGA 3QQ1A 4K39A 3GLCA 4GUFA 3C8FA 4FX7A 1JCNA 2OJPA 3GDRA 4IMCA 3SJ3A 1XUUA 1RQEA 4IWWA 4UNLA 2J6XA 3STGA 3B0UX 1KFLA 3TAKA 1PHWA 1VCGA 3G0UA 4NJIA 4HKPA 5D2YA 3WK2A 4N9BA 3NL5A 2CZEA 1WBJA 3HOJA 5CZ0A 1YPFA 2X1RA 3P80A 4JTKA 4BWLA 1VLIA 3UWVA 3GDTA 2ZRWA 1NF0A 3PULA 4MZ8A 1WOAA 3FFSA 1IGSA 5A8GA 3BO9A 3QQ0A 4HT3A 2FIQA 4FNRA 2I14A 4XKYA 1XXXA 5KINA 4MFDA 1GEQA 1IXQA 2JKPA 3W7KA 3AJXA 4UFKA 1OFEA 2CLOA 1VGAA 2AQWA 3I65A 5EMUA 2RDTA 2A6LA 3S8HA 3DKJA 2C16A 1XCFA 4ZQNA 1OX4A 4JS3A 1L2UA 3V75A 4JXCA 2CLHA 1XDLA 3CIXA 4RZ6A 5KZDA 1QOQA 5AHLA 1SZEA 1RR2A 1V7YA 4ZMGA 2YDAA 5AB3A 1VRDA 3MUXA 1JUEA 4AAJA 1OABA 1BWLA 2VFHA 5G4WA 1FWWA 5D03A 2NWSA 3LM7A 4LT9A 1L6SA 1DJNA 4LUIA 2H6RA 2VFEA 1LOSA 1OG0A 1OJXA 4GUJA 2GVJA 3W76A 5KMYA 3SGZA 1LYXA 1H63A 3LERA 1PS9A 3I68A 2NZLA 2QJGA 3E9AA 2X16A 4MUZA 1FWNA 2CFFA 4JTIA 3NZ1A 3L21A 3KX6A 1XL9A 2QCCA 2ZA3A 3EXSA 4HNVA 1LRTA 3GR8A 3UY8A 1TPUA 2A21A 3JS3A 3GDKA 3VE9A 1XKYA 1FDJA 5HMSA 4YCOA 3LTYA 3KVKA 4IXHA 1T96A 4Y8FA 5D02A 3H53A 5HINA 1QPRA 3ATYA 5LNWA 3S1UA 5D38A 3FIGA 3L5MA 3F1QA 5BMXA 3LCFA 3NG3A 4WY0F 5FF2A 1KBJA 1XM3A 3W3OA 1FX6A 1NAL1 3ZWSA 4BFAA 1KTCA 3C2OA 1SSDA 3RMJA 1I45A 2B7QA 1KTBA 1WDWA 3BGJA 1FWSA 4ZQCA 3W74A 2OT1A 5E1QA 4OV4A 5HNRA 2H90A 2GPTA 1AG1O 3LV6A 3Q2DA 5CPMA 5TQLA 1HFBA 5HWNA 4CCEA 2GJNA 1SZFA 5C54A 3IIZA 3TQKA 3L66A 5F1UA 3TW7A 3GVGA 2JK2A 4WY0B 2DZPA 3PG9A 4MKNA 5D2TA 4DO5A 2NXIA 4IJBA 1G7VA 1IIGA 5DLCA 3QJAA 1VZWA 2XN1A 2Y7GA 4NNBA 4ML9A 4WJEA 3BGGA 3EWXA 4KFPA 1T8XA 3W7NA 2H8XA 1FCQA 5LGZA 3HGSA 1YDOA 5ABTA 1A53A 2I9EA 3NNTA 3H54A 4AF0A 5AHEA 2HS8A 2HTMA 2V2DA 1F5ZA 3LCGA 4DQWA 2NXHA 3S42A 3UWUA 2OX1A 2NXGA 1R46A 5K4ZA 3R8RA 3B8DA 5CPLA 4DEFA 4CNOA 4UTMA 3W75A 1ICSA 1JULA 4RCXA 1T99A 3W1MA 2YYTA 5CZJA 1A5BA 5LKYA 4CQAA 2A5HA 4DBDA 2WO5A 1TRDA 4LY8A 1AW2A 1W1ZA 3GDMA 4JTUA 3UZJA 5FESA 4UFIA 1OX6A 3P5ZA 1JCMP 1KFEA 3DZ1A 5CG7A 3ZFHA 4G1KA 2HMCA 1EWEA 4LC8A 3W7LA 3G1FA 1W3NA 3PAJA 4IPIA 3KHJA 5K9DA 4AWUA 1THFD 3HGJA 1AL7A 5KITA 4HSOA 4DO6A 4UFMA 3S0CA 1JRCA 5G1YA 5FEWA 1H61A 4UCGA 1QNVA 1VLWA 4JEQA 2C15A 2W79A 4JR5A 4ZQRA 3GXNA 4HNTA 4QISA 4O0KA 1DL3A 1VCVA 5KZEA 3ATZA 3MI3A 4JIPA 3VKJA 2ATMA 2VEPA 1S5VA 3UXDA 5K7JA 4ZL1A 3PBVA 1PL9A 3NPVA 1RD5A 4AHOA 3INPA 3M6YA 3W70A 3NQAA 2BWGA 2VELA 3GK0A 1UUMA 3M7WA 4Z1AA 2EF9A 4CNNA 3TKFA 4K7YA 4ADTA 1H7WA 2ZA2A 5D2VA 3HBLA 5CZTA 3PSVA 4IX2A 4ZQPA 1VYSX 3W1PA 3CLMA 2QCLA 3EX1A 3DFOA 5AFDA 4FNPA 1UJPA 3QC3A 3YPIA 1Y0EA 5K9CA 2EKCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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