1VYRA

Structure of pentaerythritol tetranitrate reductase complexed with picric acid
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords PENTAERYTHRITOL TETRANITRATE REDUCTASE
publication title Atomic Resolution Structures and Solution Behavior of Enzyme-Substrate Complexes of Enterobacter Cloacae Pb2 Pentaerythritol Tetranitrate Reductase: Multiple Conformational States and Implications for the Mechanism of Nitroaromatic Explosive Degradation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1vyrA00
1FCQA 3KRSA 1GVOA 2VC6A 4IMGA 1GOXA 1IXQA 2QCDA 3LB0A 5D30A 5D02A 3NQ6A 1TPC1 3LGEA 2G96A 3MHGA 1FDYA 2ZFAA 3TMQA 2VFFA 1T0OA 3NQVA 2CZDA 4A2RA 5HJLA 5FESA 2CFFA 3TDFA 1WYIA 1WV2A 4TMBA 1O5XA 1N8FA 1XCFA 1TTQA 4OBTA 3SR7A 1AG1O 3CIWA 1TTPA 1YYAA 3L65A 5F4SA 1OYAA 2FTPA 3S5ZA 1LOLA 4RK8A 2BLEA 3ABSA 4MYXA 4A22A 1U5JA 4DO4A 2B4GA 4UXDA 1VR6A 2CU0A 2E6FA 3MWAA 1SU5A 4ZQMA 2QAPA 3NPUA 1OVDA 4JIPA 3FKKA 3C4UA 3BARA 3M6YA 3HPXA 3EWBX 3JS3A 2H6RA 1K3UA 4MPQA 1IXOA 3MW7A 3N73A 2OMAA 2JGQA 4K8HA 2QUTA 4M7TA 4RXGA 5LNVA 3N2MA 3LCGA 3MI6A 3GAKA 3W7PA 2DJLA 3EWZA 4UR8A 5A8GA 4OV4A 5AOUA 3NM3A 3CU2A 1OABA 3IGSA 1ME9A 3TFCA 4JICA 3IVUA 5FEZA 3I6RA 1LM1A 2ZCGA 3IIZA 2PRMA 4HPXA 2NV2A 2PC4A 1TPFA 4S1FA 3W7OA 4DBDA 3NR0A 1X6UA 3R5EA 3MYPA 1OYCA 2Y7EA 3CC1A 1FUYA 4MJMA 3QMSA 2BX7A 5BRBA 1GPWA 3G1XA 3O6DA 4ADUA 5HWJA 3DFPA 2TYSA 5CZ0A 1CX9A 3DZ1A 3QYQA 1LLZA 1VYPX 4LC8A 3SY5A 3M43A 1Q6QA 1L6WA 1ME8A 3GDRA 3GZ3A 5HULA 1TQXA 1JQVA 4O18A 5EKYA 5MHBA 3IIVA 3KFTA 2YGYA 3INPA 4K7YA 3GXPA 1FCUA 1ML1A 3B0PA 4JR5A 3FEMA 2J9XA 1I2PA 2AAMA 4Q33A 3NQDA 2CLOA 1XFBA 2QCDB 8TIMA 3BO9A 1Z41A 1TV8A 3MUXA 2WJZA 4GJ1A 1AL8A 3PY2A 3WK2A 1JQXA 1OX4B 3T7VA 1QPQA 3VNDA 3CEPA 4DBEA 1TV7A 4WY0F 2EF9A 2BWGA 4TR9A 3M5VA 4K38A 3HIJA 5F4WA 1LROA 2AQWA 4CNOA 1OG0A 4JTUA 3IGUA 3STEA 4JNMA 3IV3A 3NXFA 1DJQA 4O16A 2DZPA 3W7EA 1JJKA 4LVFA 3GX9A 2NV1A 4KKXA 4LRTA 3S5NA 5D04C 1LCOA 2Q3RA 4LT9A 5AHIA 3CHVA 4N4QA 3P81A 3S6DA 4UTLA 4PH6A 4AF0B 3WJSA 3PBWA 3OIXA 3PWAA 1OF6A 3QQ1A 3G8EA 1DOSA 1TQJA 3QMRA 2CLMA 1L2UA 3O1NA 3USBA 5FF0A 1V7YA 2J6XA 1R2SA 3GNDA 2GUUA 3M0ZA 2V82A 4AVFA 4KFPA 2Z1BA 4YWIA 4M6QA 3S5OA 4BI7A 2ABBA 5IM51 1WBHA 1VYSX 4ZMGA 1Q45A 4AH7A 2H8ZA 3PUDA 3MI3A 3HGOA 2VKZG 1AW2A 2EKCA 4DO6A 4W9TA 4LNYA 1F2JA 4FNQA 1QPNA 3RF9A 3P80A 3DFQA 4GRSA 4JX6A 1GVFA 3STCA 3NQAA 3W85A 6TIMA 2CZFA 4JDBA 2E09A 3SGZA 2GVGA 5E93A 4HNVA 3PBUA 5D2WA 1ZENA 3TE9A 4MJZA 3I7SA 3CPRA 5G4EA 1O4UA 3MP3A 1EX5A 5AYZA 1PVNA 2QCCA 1S3HA 3G1YA 2QDHA 4AMAA 3CB8A 1P4CA 4TX9A 3W7RA 3HG5A 3TJXA 4GE8A 4ALDA 5D09A 2GQ9A 3HGJA 1GT8A 2YX0A 3G3DA 1EIXA 4LS0A 3W2NA 1YTKA 3T55A 2E5CA 3HO8A 4HNUA 4UTJA 3NZRA 4CQAA 3S5YA 2VFEA 1AK5A 1JCLA 5G4WA 4WY0A 5AN7A 1NF7A 3B04A 1P5BA 3W2JA 3PC0A 5DCBA 2FJKA 3DFSA 4O10A 1Y0EA 5AC7A 1O95A 1GYLA 2FPYA 3OG3A 3N2XA 4LUIA 2ZTJA 2CLIA 3EXSA 4RZ6A 4JYEA 1SZFA 1TCDA 3UZJA 1JCMP 4LOCA 3RNDA 3KX6A 1K8YA 4EF9A 1OFDA 2QR6A 1SO3A 5LSMA 4NT0A 4XBKA 3B4UA 3SSJA 2XN2A 1UJPA 2JK2A 4Z1AA 1YPIA 2ZDRA 5KMYA 5I3IA 1WAUA 3EWXA 3HGSA 2ATSA 3BLEA 1O5KA 4JTJA 1RD5A 2QEZA 2XFWA 3LHZA 2HS8A 2NZLA 3C2VA 2VFIA 1G67A 1N7KA 4YXGA 1HO1A 3PS7A 3MYOA 1XXXA 2RH9A 5EBUA 1BTMA 2YW4A 4XKYB 4AXKA 5E0KA 3TSDA 4UUIA 2WSQA 5ABTA 3TJLA 1YLVA 2C1HA 1TPEA 3HQ1A 3W7NA 3TKFA 4HSOA 3L67A 3M5ZA 3NQMA 1LRNA 3TA6A 1XBYA 3QM3A 1G7UA 5LKYA 1W5NA 1IIHA 5CZJA 4ORMA 3W88A 4IPJA 1AW5A 3R8RA 1HFBA 1OK6A 1KBJA 1RQBA 1LYXA 3LXCA 4B5NA 4AWTA 1R46A 1NSJA 3GVGA 2NWRA 4UIOA 3T4CA 1DORA 3R2GA 5FEPA 4ZQNA 4WX2A 5LHEA 3P82A 1KM0A 1X8FA 5CPMA 1L6SA 2Z0IA 3UZ5A 4L4LA 2QJIA 5CG7A 1QMLA 3P60A 2NUWA 1PL9A 1O60A 1VCVA 4WOZA 5LNUA 4H4IA 1A5CA 5DY3A 3TU9A 5K4ZA 1AL7A 1KM3A 1SFJA 3QC3A 3G24A 4LU0A 2A0NA 3ZS4A 4H3DA 4AWUA 2EGZA 4DF1A 1JRCA 2AGKA 5LGZA 3WJXA 4JTEA 1T96A 3IRDA 3HG4A 3W7QA 3HG3A 2CZEA 4PEKA 4Y6GA 3P74A 4O4WA 4KFNA 2GJLA 4KWVA 3TCEA 1VLIA 3LHWA 5F4XA 5DCEA 1F6PA 3M16A 4JTKA 3W7JA 1FQ0A 4K7VA 4NQ1A 2O7QA 3LCFA 1XBXA 5LHFA 3DFOA 2CWNA 4MY8A 1EEPA 2QUVA 4M6VA 1KM5A 1W31A 4G1KA 4FNPA 3P62A 4M19A 4NU7A 5I3JA 3UY8A 4WJEA 2ZZ4A 2BXVA 1YXCA 4QJ1A 5LNWA 1F5ZA 4FXSA 1J2WA 1KM6A 2HMCA 2VEPA 3P67A 3AO0A 1S5WA 1KW1A 4QITA 1P0NA 3THAA 3W6YA 3QW3A 1HO4A 3P7YA 4LW7A 3LBMA 1W3TA 1MO0A 1RR2A 3P5ZA 1B57A 1KFLA 3JR2A 4FNUA 4I9AA 1T99A 2YYUA 3PSVA 1K7EA 4NZJA 2A85A 1TPDA 3PUOA 4IOTA 3FFSA 3CWOX 4JXCA 4KFOA 4BI6A 5I3FA 1K03A 4C1LA 1MSSA 3PBVA 4NZFA 1OFAA 1VH7A 3LV5A 1SO4A 3VE9A 3LLDA 4QSHA 1DHPA 3TXZA 4ADSA 3G1VA 2X1TA 1TRDA 1ZAJA 2GVJA 3PF3A 3M7WA 3ELFA 2JBMA 5I3HA 3NDOA 3W7HA 4N4PA 3GYEA 2WNQA 3PG9A 5AHLA 2IQTA 2RDUA 1LORA 3ZWSA 1FWTA 3DHDA 5EA9A 1BWKA 1YPFA 5BW6A 1SW0A 4JS3A 3QQ0A 1DJNA 3EKLA 1G4SA 3GDMA 3LCLA 4YL2A 4LVGA 3N19B 3GK0A 2A21A 1LBLA 3L0KA 2VFHA 4LUJA 5CSRA 4GXMA 1QNVA 4O1AA 1SW3A 1S5VA 7TIMA 3G1HA 4Z1CA 1DKWA 4UMBA 2F84A 1YDVA 4MYAA 3MHFA 2X1SA 4JN6A 4MY1A 1H1ZA 5K7JA 4JX5A 2Y63A 1E51A 2ZA2A 3EX4A 1RPXA 2OT0A 1KM1A 4IX2A 1SO6A 2ZZ7A 1UBSA 3EX1A 2DZUA 4MZ1A 1N55A 1H63A 1JCJA 2OCZA 2YZRA 1H51A 3W84A 2V2HA 1JR1A 5AB3A 1F6KA 3BW2A 4MY9A 4GNJA 2QCNA 5CPNA 2H8XA 5KTLA 1LZOA 2GQ8A 4GUGA 4ML9A 1H7RA 3VKJA 2ATMA 4IMFA 4ZZ9A 3DENA 5TQLA 1EP3A 3SIZA 2GOUA 4MZ8A 3L2IA 3NG3A 1Q3NA 3V75A 4FNSA 1KTNA 1M5WA 3W23A 2ZZ5A 5C5YA 3BV4A 3TC7A 4N02A 4IX0A 4MKNA 4DQWA 3P8IA 3DU0A 5L9FA 1GYNA 5LZLA 1MEIA 5D38A 2A5HA 4O17A 1UB3A 5K3VA 1W37A 3WK0A 3EXTA 5D2VA 4ZQRA 3N3MA 2DJXA 4HNNA 4ONVA 1QR7A 1D3GA 5BNKA 3PUEA 4XWUA 5HUPA 2QUUA 4DPQA 5FF7A 5HINA 3UWVA 5D05A 1EUNA 4UFJA 3BK0A 3NVTA 1CW2A 3RFAA 3CIXA 5CZSA 3F03K 1VHCA 5AC8A 3LHVA 1OFOA 4N6EA 1A53A 3C0JA 3N14A 1O94A 3KRUA 1FDZA 2ZA1A 4DEFA 3BG5A 1KFEA 2X16A 3H54A 1R2TA 5A5WA 1OF8A 2A4AA 1QWGA 3BGGA 4ICNA 3GKFA 4HIBA 3L0NA 4GUFA 4Z08A 4DF0A 3Q58A 4DELA 5C6MA 4Z1BA 2QKFA 3PSWA 1EP2A 2PCQA 3QW4B 5D37A 3B0UX 3MBFA 4I7WA 3IIPA 2WSYA 3DKJA 2UV8G 4GUHA 2I9EA 3IVSA 1XKYA 3U2OA 4X3ZA 3SZ8A 4NUWA 4RR4A 4C1KA 3QH2A 3W7DA 2RHGA 2XN1A 3BPWA 1KLYA 2NUYA 2OT1A 1WBJA 3WJZA 2B0MA 1R2RA 1K7XA 4HHPA 1J5TA 1HTIA 2J9ZA 2RKXA 3I7RA 1LP6A 1GVSA 4N6FA 3L66A 4GUIA 1MZHA 1AW1A 2ZZ2A 3SECA 3NL6A 4RZ5A 4Z0SA 1SSDA 1TMHA 2Z2UA 4PC8A 4CQ8A 1PIIA 3QSRA 4O57A 1JUBA 4FIRA 4J9JA 1KV8A 2H3BA 1SO5A 3DH7A 3NNTA 1PCWA 4JD4A 2D73A 3W1LA 3G3MA 3B0VC 3T78A 1DBTA 2VXNA 1GTHA 3DGRA 3E12A 5G2WA 1KTBA 1W0MA 2EPHA 4UMCA 3PR2A 3O6CA 4FX8A 1BKSA 5E1QA 1F76A 2PRHA 2NUXA 4JY8A 1XM3A 3QJAA 2VELA 2V5LA 1Z48A 2FB2A 3GNNA 3KVLA 1I2OA 1NAL1 2E1DA 4GC4A 2CZ5A 2CLFA 1QOQA 2YYTA 4UTTA 1ZALA 3PB2A 4JTHA 5G5IA 1WOBA 1QPOA 2DORA 2HS6A 5HR7A 1XDMA 2Y7DA 5AHEA 3KVMA 2XN0A 1RZMA 2B7NA 3NL5A 3LXAA 4UFLA 3W1PA 3QZEA 3PAJA 3S1WA 1LBFA 2VEKA 1RVGA 1XBZA 5K9XA 5K9DA 2GPTA 3EX3A 3HOJA 3VFLA 3W86A 1XL9A 1I8JA 1NVMA 1WX0A 4UFIA 3C8FA 1TYGA 1VRDA 1GVQA 1TB3A 2ZZ3A 5HUOA 1GEQA 1G4TA 4LVBA 4FHAA 1L9WA 3G0XA 3G0UA 4RV8A 4JTTA 3NQGA 3PB0A 1GZGA 1XUUA 3P84A 4PTNA 1OFBA 1F05A 4XQ6A 3WJYA 1DL3A 1FDJA 1KBIA 1MEWA 2W6RA 3A22A 1NFBA 1QO5A 2P0OA 2X1RA 3Q2DA 2V8ZA 3NQFA 3PULA 4UMAA 1VS1A 4NNBA 3CM4A 4IXXA 1F7BA 4JDYA 4CCEA 2Q8LA 2V0TA 1TPUA 2R94A 4TIMA 2C18A 3ABQA 2WQPA 3W07A 3TXVA 2WV8A 2Q3OA 5AYXA 3U6WA 1VPXA 3C2EA 4RLIA 1H7WA 3LHUA 1JUEA 5T26A 3C2OA 3FOKA 1WA3A 3QPYA 4O0KA 5KZMA 3EWWA 5FF2A 1C8VA 3B03A 2EHHA 2WKJA 5DBTA 3TSBA 1T8XA 4IMDA 5EL1A 1ICQA 2YDAA 3RLVA 1ALDA 1EWEA 3G1SA 2DZWA 3UD6A 4O4VA 5FF4A 1P0KA 3TMLA 4GBUA 3TUUA 4QISA 2QAFA 1BEUA 1YDOA 4X9SA 4M5PA 1YTEA 5K2ZA 5CPOA 2ZRUA 4IPIA 4UTTC 3G22A 3U8GA 3L5AA 4YCOA 1LRQA 1KTCA 1I2RA 2J24A 2RDTA 3YPIA 1YXDA 3BLIA 3LV6A 4R34A 4LV4A 5TIMA 2Y7FA 4MLJA 4FX7A 1W54A 4D2JA 1B4KA 2DZVA 1JULA 1FY6A 1W5MA 5HWMA 3MJYA 1QPRA 1W5QA 4WOQA 4WXZA 4Y96A 3UWZA 1SFLA 5GVJA 4JYFA 3NZ1A 4JY9A 2C0AA 3HGRA 3LM7A 1H61A 1UUOA 3W2LA 3TQ0A 2YFOA 1D9EA 3GXTA 3G1AA 1EPXA 1EB3A 4MOZA 1QOPA 3GR8A 3W72A 1XI3A 3LXBA 4DF2A 4UFHA 4MVAA 4O8RA 3TAOA 3DI1A 1FCVA 2EAWA 2PRLA 3PM6A 3W1AA 3LBCA 3GAYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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