4ADTA

Crystal structure of plasmodial plp synthase
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
278
structure length
273
Chain Sequence
DNDSILLKHGWCEMLKGGVIMDVKNVEQAKIAEKAGAIGVMILENIPTDGVARSVDPLKIEEIRKCISINVLAKVRIGHFVEAQILEELKVDMLDESEVLTMADEYNHINKHKFKTPFVCGCTNLGEALRRISEGASMIRTKGEAGTGNIIEAIKHIRTVNNEIKYLCSLDESEVYNFAKKLRAPIDLILLTRKLKRLPVVNFAAGGIATPADAAMCMQLGMDGVFVGSGIFESENPQKMASSIVMAVSNFNNPKILLNVSLGLGKAMHGNTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PYRIDOXINE BIOSYNTHETIC ENZYME PDX1 HOMOLOGUE, PUTATIVE
publication title Assembly of the Eukaryotic Plp-Synthase Complex from Plasmodium and Activation of the Pdx1 Enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium berghei
total genus 96
structure length 273
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4adtA00
4S1FA 3S1WA 2EAWA 2XN0A 4ZQRA 2JGYA 2NLIA 4IMEA 1GZGA 1AK5A 3CEUA 1KM4A 2Q8LA 4CQ9A 1L2UA 4BR1A 5LKYA 4JTGA 3W86A 4ZMGA 1OYAA 3EB2A 2VFDA 4FX6M 5KSWA 1G4EA 4ORIA 1ZENA 4POCA 1LLZA 3W7EA 4JGDA 2RHGA 1X6UA 2QCNA 4Z1BA 3G24A 1Q6RA 3U2OA 1UCWA 2ZTKA 1LOLA 1JRCA 3I7RA 5KZMA 4O18A 4NXSA 1VPXA 5AHNA 1RPXA 2J9XA 4O50A 4FNUA 5HINA 3P80A 3USBA 1MZHA 2NX9A 3ZS4A 3DFQA 2B7OA 1H7RA 4RV8A 3EEGA 3M47A 5F4SA 3AJXA 3MO7A 1G6CA 4A2RA 1IXPA 1Q3NA 5E93A 3L67A 2VFEA 2GQ8A 5D2XA 1DVJA 1QAPA 3W84A 2V81A 1VLIA 2PRHA 5L6UA 4DF0A 2E5CA 2ZRXA 3L0GA 1JCMP 3W1RA 3P8JA 2R8WA 2C16A 3I65A 1KM6A 2GJNA 2P10A 1N55A 2ZZ7A 3MI6A 2ZZ1A 3S5OA 2Y7GA 5BMXA 3CT7A 1TTIA 1KBJA 1ADOA 3UWZA 3N14A 3C2VA 3NM1A 3G18A 3L0NA 2CLFA 1VH7A 3N9RA 4AB4A 5K7JA 4IPIA 1T8XA 4R33A 3TAKA 4R7JA 1ZAIA 3NVTA 1DKWA 1VQTA 3C52A 3LCFA 3ANYA 1QO2A 1HL2A 4CQ8A 1JQVA 4FEZA 5D33A 2V2CA 2D73A 4IXXA 4XQ6A 2Q3RA 1BKSA 1D3HA 5D2TA 1AL8A 1GVQA 1P0KA 3PS7A 3UZJA 3PBVA 4RZ6A 4NUWA 2A4AA 3TQ0A 1WX0A 3PR2A 3T40A 4MYXA 3DHFA 5A5WA 4QM1A 4DO4A 1BEUA 1FDZA 2ISWA 3W7PA 4BWLA 4JD4A 3ABOA 4MLRA 4IMCA 2QCLA 3C3NA 4ADTA 4O53A 1YPFA 4JX5A 4XZ9A 1EA0A 1KM1A 1P1XA 2OZ0A 1H62A 4JTFA 5DLCA 2FPVA 1ONRA 2FPTA 4A29A 4QAIA 1XL9A 4S2CA 4UC5A 4R34A 2BTMA 3EXSA 4PH6A 2Y89A 5LSMA 5LHEA 4DF1A 1IIGA 1JUBA 1A5CA 2Y62A 5D38A 3BG9A 4MJMA 4HIBA 1R46A 4WUIA 1BWKA 2CLKA 2QUUA 1MSSA 2ZRZA 4KKXA 2DZVA 3ELFA 3QPYA 1XBZA 2CLLA 3QQ1A 1OG0A 3DFSA 4RZ4A 4DELA 3P84A 5KMYA 1QFEA 1Z44A 2J88A 4CNOA 3ATYA 4U28A 1H5YA 1R30A 2OMAA 2XN2A 3GAYA 1J4EA 5A8GA 1O95A 4UTTA 3TMLA 5HNRA 3W7JA 3LX9A 1TRIA 1MEHA 1SQ7A 4U4MA 3W7GA 3THAA 1NF7A 1LM1A 4CNPA 5I3IA 4B5NA 3LV5A 3MHGA 3R2GA 4NJJA 5KITA 2J9ZA 3FA5A 4YCPA 1GT8A 2DZTA 1WBJA 1R2TA 3GNNA 1UBSA 2PRLA 3G22A 1GOXA 3G8RA 2QCMA 4GUHA 3TFXA 4N02A 3GXNA 4K39A 4DPQA 4GC4A 4A22A 4MYAA 4GXMA 3QZEA 1V7YA 1YTEA 4AF0A 2C18A 2H90A 4HNUA 3VCRA 3LHUA 4WJEA 3WFAA 3W2JA 1W8SA 4MVAA 1OHLA 3YPIA 1EWEA 4FIQA 1KM0A 5KTLA 2WNZA 3W1PA 5L9FA 1X1ZA 4O0KA 4NZFA 5EMUA 4FIRA 1TTPA 1OYBA 4OBTA 2A5HA 5LNSA 1C29A 4QIUA 3IRDA 3PB0A 5EPDA 4BF9A 2Z6IA 4I7VA 2PE4A 4X2RA 5EY5A 3GDLA 4JNMA 2CZEA 3MP3A 3UWYA 1MO0A 1NEYA 1KTNA 3PUEA 1BTMA 2XFWA 4NQ1A 1Q6LA 3GAKA 5CPNA 1J2WA 4O10A 1Q6OA 4NNBA 1ML1A 3W7CA 3EWXA 8TIMA 5FF7A 1Q6QA 2BLEA 4O0ZA 2C6QA 1WV2A 5CZ0A 2WPBA 3DAQA 2ZTJA 3JRKA 3C6CA 3FLUA 4TIMA 1I8JA 1RV8A 3W7LA 5C2XA 4ZQCA 3W1MA 2JKEA 3B4UA 3P60A 4JTIA 4NT0A 2QJGA 1KM5A 3HPZA 2DZWA 4LWWA 1G69A 5F2GA 4LS0A 5G4EA 3LV6A 3TROA 5F2IA 1QOPA 2E6AA 3TFCA 3Q58A 4LY8A 3W22A 3LRKA 1TJPA 3LRLA 4EIVA 3IIPA 3LCLA 3TAOA 4LC8A 2ZA3A 1YPIA 3RLVA 4EOUA 4S2BA 1QPNA 4ALDA 4AVFA 3ATZA 1IXQA 1OFDA 4UTMA 5DBTA 2CFFA 4JYEA 1QDSA 1VYSX 3NQFA 4XWUA 3BW3A 4O13A 5F1VA 3TQVA 2X2GA 1WYIA 4E2BA 1QR7A 1SR9A 4Q4KA 3N2XA 5K2ZA 5HULA 3BGJA 3C8FA 1LRNA 3MMTA 2ZRUA 5DBUA 3B0VC 4GUJA 2E6YA 2CW6A 1F7BA 3KAOA 3NL5A 4CLMA 1MEIA 2E6DA 1TMHA 4N2YA 3S5ZA 3TSMA 1TPVA 3U6WA 2I14A 4H6KA 4IJBA 3NQCA 4GJ1A 1HFBA 4HPXA 1SU5A 3M5YA 1H63A 7TIMA 2CZDA 3S9YA 4P2VA 4IWWA 1N7KA 4GE8A 5LNRA 3GB6A 4M6VA 5HMSA 4K37A 1RVGA 3S5YA 5D2VA 5FEWA 1ZNNA 5TIMA 4IX0A 1LYXA 3TX9A 3LTPA 3D0CA 3UWQA 3FKRA 3C56A 2ZZ2A 1VYRA 3HJZA 3UY8A 2R91A 1WBHA 4BK9A 3LHYA 2ALDA 3HGOA 1LTDA 4UR8A 4HT3A 4WY0B 3SR7A 1SO6A 3B0PA 1YTKA 3TK7A 1FBAA 4QSHA 2Y7FA 3BG5A 3TR2A 1L6SA 5FEXA 1D9EA 2YXGA 4L4LA 3TXZA 3M41A 4GBUA 1W5NA 3LRMA 3CB8A 1WA3A 3VE9A 4C1KA 3GDMA 3T7VA 5HUOA 3NZ1A 1K7EA 4WOQA 5DY3A 2G5WA 3H53A 4JIPA 3GK0A 4N9BA 5F2MA 1G4PA 5AHMA 1EIXA 5GVJA 1DJQA 1G7UA 1GEQA 1ZALA 3TW7A 3TH6A 2TSYA 1VS1A 4UFMA 5EL1A 1SFJA 3E96A 4WXYA 3UY7A 1WAUA 4DPPA 4FX7A 3IV3A 1OK6A 3NG3A 5HR6A 3W85A 3S0CA 3NQEA 3G3DA 5D02A 5DCEA 4RR4A 3QJAA 1PCWA 4UNKA 1KFLA 2QEZA 1JCYA 2WJZA 5HQEA 2AAMA 1DL3A 3P7YA 4BI7A 5G1YA 1M5WA 2B7QA 1TQJA 4L4MA 3FKKA 3LCWA 3QW3A 3HG3A 2FFCA 3PULA 3OG3A 5CSRA 1J5TA 1FWTA 1CW2A 3DFTA 5BOOA 5J5RA 2YYTA 2DZSA 3Q94A 3EX6A 5FEPA 2H8ZA 5AYYA 1ICPA 5I3JA 4NNCA 1VCVA 5HWJA 3W7KA 2Y85A 3W71A 1DOSA 3M43A 3L5MA 2E1DA 1QO5A 3SW6A 2GPTA 4HSOA 1B4KA 4LV4A 1R2SA 4P61A 4UMCA 1L6YA 4GUFA 3W2LA 2ISVA 1HTIA 1TPEA 1NSJA 5CKSA 2JGQA 2WQPA 4AWTA 1F6KA 3IGSA 5FI8A 4JDYA 4WZHA 4N4PA 2X16A 2NX1A 2E09A 2H8XA 3IVSA 2W79A 2OT1A 4Y96A 5G4WA 1KFBA 3TSDA 2QJHA 4IMDA 1ZCOA 2NXGA 4MJZA 4O11A 3V75A 1VRDA 2C14A 1FXQA 4J9JA 3CEPA 3TIMA 4Z1AA 4RKAA 1H50A 2ZA2A 3PSWA 4DQWA 2V82A 4A21A 4O4WA 2CZFA 4LS2A 1XDLA 2AQWA 4PTNA 3GDRA 2Y70A 3QYQA 3PAJA 1K03A 3GR8A 3QEZA 4KWVA 3P62A 4UFJA 1K7FA 3W7RA 3HGJA 1I2RA 1KM2A 1LORA 2YPIA 2V2DA 4LVBA 3BLIA 3NA8A 1RQBA 4AHOA 1ZJIA 2PRMA 3OA3A 4X9SA 2VFHA 3S6DA 3I68A 4GFSA 2VFFA 3VE7A 2C0AA 1LCOA 3DENA 3W07A 1F2JA 2A7RA 1GVRA 1TPH1 1W5MA 1C8VA 2CU0A 2QCDB 3N3MA 2QDHA 1YLVA 4ZQOA 4MLJA 1W5OA 4Y9AA 3VNDA 3DI1A 4MOZA 3W73A 3N73A 1H7NA 1A5AA 4LOCA 3EWBX 4HHPA 2P0OA 3FFSA 3FS2A 3A23A 4JXCA 3BG3A 1T96A 4O4VA 3F1QA 4N4QA 1ZAJA 3TU9A 3CM4A 4O1AA 4Y90A 1FCBA 5G2WA 3MBFA 3LBCA 2OX1A 1VCGA 1ZFJA 1GTHA 4MZ1A 3P5ZA 4UTKA 3C2RA 4O19A 5AC8A 1F05A 3TE9A 1ME7A 3L66A 1KA9F 3HB9A 3MYPA 4GWEA 4ZZ9A 1YXYA 3HOJA 3L9CA 4BI6A 2V5LA 1KV5A 3NQDA 3QRHA 1QPOA 2DJLA 5LNWA 2KZHA 1CI1A 3GR7A 4HN4A 5TQLA 3OEXA 4LVDA 4TMBA 1TPWA 2OJPA 3MW7A 3I7QA 4RJEA 5FF2A 2B4GA 3LHWA 4AMAA 1OFOA 2YW3A 1D3GA 1TV7A 3WJWA 4LC6A 2GVLA 3PUDA 1F76A 4Z1CA 2ZQ0A 2E77A 3HIJA 1Q45A 3DFOA 3FJ6A 3G0UA 1SZGA 4JTLA 3BW4A 1O5KA 5DY2A 1QPRA 3O16A 3CU2A 1FUYA 2VFIA 3LGEA 4AAJA 3G3MA 1H61A 1SSDA 2HS6A 5EA9A 3B06A 4O17A 2DZPA 2VEPA 4CQAA 3TUUA 3UD6A 1AG1O 2VKZG 4LRTA 4Y6GA 3DH7A 3PSVA 3HGSA 5LGZA 3BGGA 2Y7DA 4UMBA 1VC4A 3L68A 5AYXA 1VR6A 5C55A 3M5ZA 1M7PA 2NWSA 3G1AA 3C61A 2GJLA 3TMQA 4UTWC 2A0NA 2DZUA 1DJNA 5CSSA 3NQ2A 2Q3OA 3G0SA 4OV4A 1CX9A 3HMJG 1XI3A 1XXXA 3O63A 1TSIA 4MZ8A 1A5BA 4TR9A 1JULA 1TRDA 4ICNA 4UFKA 3TJXA 3PBWA 2YW4A 3PG9A 1TV8A 4WY0A 2V9DA 1VHCA 3PBUA 3W83A 3WK2A 3CTLA 4X3ZA 3W70A 4UNLA 3CIXA 2GVGA 4JTUA 3QM3A 2TYSA 4FXSA 1TQXA 3ABQA 2YDAA 3P8IA 3IIVA 1JUEA 3LCIA 5D04C 5K9XA 3UXAA 3HBLA 3LXAA 2W0UA 3NR0A 2CLOA 2ABAA 3CC1A 1SUXA 1H7XA 5G2IA 1F74A 3TDFA 5LZLA 5U4NA 4Z08A 1JCNA 3UQNA 1XUUA 4MFDA 1G4TA 4O57A 4DF2A 2CLIA 1LOQA 4JTTA 1DV7A 1OK4A 3M0ZA 4ZQMA 1W31A 2DU2A 5AC6A 2VEIA 3NQVA 4ZQNA 1KM3A 2ATMA 4ORMA 5C5YA 4JTJA 1KFCA 2GVJA 4LRSA 5F2LA 3RK8A 4WXZA 4AEOA 3B03A 3O6YX 3OHIA 2GQ9A 5CZSA 4ZVJA 1GG0A 1QOQA 3E0IA 4XTIA 5D09A 1FWWA 1O5XA 3RF9A 2PURA 4FNTA 5FESA 1QMLA 1OX4B 4QISA 3SIZA 3W7IA 4M6QA 4UFHA 1R2RA 3WJZA 2QDGA 1HO1A 4UIOA 4IUOA 5AC7A 3DGRA 5F4WA 2ABBA 3OVRA 4O15A 4NNAA 3O15A 5MHBA 1K8ZA 2HSAA 2VELA 5EYWA 5BNKA 5AFDA 1IGSA 3INPA 2ZRVA 1LOSA 4NXKA 1SZNA 3GIYA 2UV8G 3QC3A 3TA6A 1H7WA 2CLEA 3AO0A 4TX9A 3W87A 1VHNA 1BWLA 2G95A 1VZWA 4YCOA 3LBMA 4WX2A 4JIQA 1JVNA 2EKCA 2ISSA 1GYLA 2YFNA 3TNOA 1HO4A 1TTQA 1P0NA 3MI3A 1I2OA 3W1TA 5G1TA 3IIXA 1XCFA 4HKPA 3QW4B 4MFEA 4RX0A 4LVGA 3NQAA 3DU0A 5LHFA 3N19B 4OV9A 3IVUA 2ZZ4A 3LHTA 1SPQA 1GVFA 2E5DA 4O54A 2FPYA 1ZHAA 2QR6A 1QNVA 3FIGA 5U7SA 2WO5A 3BW2A 2V8ZA 4FF7A 2J9YA 4NX5A 1SZFA 3LDVA 1TREA 2NZLA 2QUVA 1GJPA 1GTEA 1W37A 3NEVA 5I3HA 1OF6A 4JN6A 3UWVA 2TPSA 1T0OA 2QCDA 2NWRA 3E49A 1O60A 1EUAA 3M16A 1PE1A 2JKPA 4HPJA 1R47A 5H2ZA 4EF8A 2O7QA 1PHQA 5T26A 3LCGA 4NJHA 3P61A 3STEA 4JICA 3UXDA 3LCHA 3W1LA 3FJLA 3THQA 1JCLA 4E2DA 3NQ8A 3MWAA 2ZYFA 5H91A 1MEWA 1FCVA 1TPC1 4N9EA 1EP2A 3W7HA 1SSGA 4MIMA 3DZ1A 4CCEA 3G1HA 5FEZA 1THFD 2QAFA 3NL3A 4O1BA 4JEQA 3W2MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4S1F A;  5PTD A;  3S1W A;  2EAW A;  2VM8 A;  4L1G A;  3VAV A;  2CPU A;  4QLJ A;  2E9B A;  1XLG A;  2Q8L A;  1XSI A;  1PZ2 A;  5LKY A;  3LY0 A;  4BF7 A;  4XZH A;  1PDZ A;  1PKM A;  2D20 A;  3RG6 A;  3MUA A;  1G4E A;  4ORI A;  2DUZ A;  3U4F A;  1LLZ A;  1V51 A;  3DYM A;  4GVH A;  3SBF A;  1YX1 A;  2ZTK A;  1UKT A;  1LOL A;  4EXQ A;  2X7W A;  1JRC A;  3I7R A;  1RD6 A;  3S6T A;  5KZM A;  4NXS A;  1VPX A;  4L9Z A;  2J9X A;  3W6L A;  5HIN A;  1TX2 A;  1H7R A;  3CZJ A;  3S6O A;  3QKZ A;  4GX8 A;  4RV8 A;  1L2Q A;  5F4S A;  3AZS A;  3SCW A;  3DFY A;  4A2R A;  1OG6 A;  1X8C A;  4IG2 A;  1R8L A;  4PFH A;  2ZIC A;  4ZE4 A;  5FAJ A;  2OOG A;  3AWN A;  4GH3 A;  5BOF A;  4OUE A;  5D2X A;  5MF5 A;  4S39 A;  2PRH A;  3M07 A;  3OLI A;  4YHE A;  4Q8W A;  1N55 A;  3RR1 A;  1UW9 A;  3MI6 A;  3OZP A;  2ZZ1 A;  2Y8K A;  2Y7G A;  5CJN A;  4GAC A;  1ADO A;  2G3M A;  2Z00 A;  3H26 A;  1D8W A;  3VGD A;  2PWG A;  1BSI A;  1KQZ A;  3G18 A;  2VQT A;  2CBJ A;  2G3N A;  2OYK A;  3N9R A;  5K7J A;  3FY1 A;  1T8X A;  4R33 A; 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