4LV4A

A noncompetitive inhibitor for m. tuberculosis's class iia fructose 1,6-bisphosphate aldolase
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
345
structure length
320
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGEKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title A Noncompetitive Inhibitor for Mycobacterium tuberculosis's Class IIa Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 133
structure length 320
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2013-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lv4A00
2XFWA 2ISWA 1XXXA 5L6UA 2NX1A 1OYCA 1A5AA 2A7NA 1ZAJA 1YDOA 1R47A 2QCDA 4E2BA 1SFLA 2BXVA 3WJXA 2VEPA 2WNNA 4N02A 4RCXA 3F4NA 4GUGA 1EWEA 3G1XA 3OVPA 5HWJA 1KBJA 3W2LA 3FOKA 3GDRA 2YPIA 4DEFA 1AG1O 2ISSA 3NL6A 2ZTKA 2C16A 1Z44A 3LV5A 1Q6RA 3T78A 4GFSA 3M5VA 2Z6IA 1C9DA 3G3DA 4OV9A 2WNZA 3LCHA 2EGZA 1F05A 2A7RA 1H7PA 1LM1A 1VCGA 4LC8A 4Y8FA 1WA3A 3HIJA 1D3GA 3DZ1A 2E5CA 3PULA 3BW2A 3S0CA 1FWRA 4IMCA 3NNTA 4L4MA 4YWIA 4K38A 1TB3A 3FIGA 3LHUA 1LP6A 1GG0A 2BLEA 3HF3A 5D04C 1WX0A 1OJXA 5CZTA 1NEYA 1EUNA 2VFIA 3W85A 2V2HA 5DY2A 3B04A 4LVBA 2B7QA 1GVFA 2VC6A 1TV8A 4Y96A 4I7VA 3L0GA 1FY6A 1H7NA 4N6EA 1FCBA 6ALDA 4GE8A 3LHTA 1A53A 1OX5A 3W75A 4FHAA 5HQEA 3W74A 3MYPA 4BI5A 4JTGA 4O57A 3H53A 1ME7A 2QCNA 2WSYA 1H51A 5F1VA 2NWSA 2G96A 2QF7A 1P4CA 5D03A 3S5NA 3TW6A 3THAA 3S6DA 3NM1A 4JY8A 1WQ5A 5C54A 2TPSA 2QUTA 3Q2DA 2DP3A 1H50A 3INPA 5HJLA 4QNWA 3JS3A 3C2VA 1YTDA 1YTKA 3HOJA 3GKAA 1Z41A 4JIQA 4HHPA 2WQPA 2FDSA 5LNSA 4XBSA 5E1QA 1J4EA 3LERA 4FO4A 4PFMA 2GUUA 4C1KA 4UCGA 2C0AA 1A5BA 1X1OA 3P80A 4GNJA 4BFAA 3A9IA 3GZ3A 1K03A 3CHVA 1YTEA 3LM7A 3IIOA 1RZMA 2HSAA 3QMTA 1H7XA 3W6YA 2CLEA 2YYTA 4IMGA 4XKYB 3EX2A 3W73A 1GYNA 3PBYA 3NOEA 4HNUA 3HB9A 4NJHA 3G8RA 3O07A 3ANYA 2Q8LA 3HG4A 1WBJA 4MLJA 1HO4A 5FI8A 1YLVA 3NQDA 4JX4A 2VFFA 3CTLA 2X1RA 5D05A 2A21A 3ABSA 4IOTA 1YDVA 4M6PA 4LUJA 4ZQMA 1LORA 1IGSA 3IIPA 1R30A 1BEUA 4MOZA 3CWOX 3NYZA 4CQ8A 2C13A 1ZY9A 3GXPA 2E5BA 5F4SA 1FDYA 3KFTA 2A85A 3N9RA 1TPWA 1I2PA 3LTYA 2FJKA 4MY1A 5LNRA 1CX9A 4UMBA 3G22A 4UMAA 3NQ7A 1SQ7A 1RQHA 5FF3A 5DN1A 3E96A 2V8ZA 3DHDA 2FIQA 1JCYA 3M5ZA 3KRUA 1LBLA 1JUEA 1OABA 5G2IA 5A8GA 1LOLA 2JGYA 1G4PA 5EL1A 2QCEA 3WK3A 2A7PA 2GQAA 5LNVA 3SECA 2VFEA 3C8FA 4N4PA 1FCVA 3C2EA 4UTKA 5IBXC 3QQ1A 4UXDA 2QR6A 1GG1A 4FF7A 3HGRA 1UBSA 1BWLA 2QCLA 4HPXA 3GNDA 3LBMA 3MHGA 4RKAA 1R2RA 4DELA 1O94A 3M41A 3LTPA 2FB2A 4DF1A 5AC6A 3W7LA 1Q6LA 1DVJA 2GPTA 2Q8ZA 3NM3A 4ADTA 1QNVA 3NQGA 3W7IA 4R7JA 4JYFA 4PC8A 4XKYA 3QMRA 4DO6A 3HPSA 1OF8A 3P84A 1DJQA 1EB3A 4AMAA 3P67A 4AXKA 5EY5A 5D37A 3W2KA 3TE9A 5TIMA 3TQKA 1Z42A 1XI3A 4GWEA 3MJYA 2ZZ6A 4JN6A 1XBYA 1LYXA 3IV3A 3W23A 1I4NA 4FNRA 3KVJA 3GDMA 1JQVA 4POCA 3YPIA 4A3UA 3UXDA 4WOQA 3MI3A 3IVUA 1ME8A 2ZRXA 3HGOA 1S3HA 3NZRA 2DORA 3W1XA 4LVDA 5DELA 3L5AA 4S1FA 4ORIA 3M0ZA 1DORA 4HKPA 3LHZA 4Q32A 1HL2A 1SZFA 3S8HA 1MO0A 3M5YA 4IXXA 4QJ1A 4UFIA 4DPQA 3BARA 4R34A 1XUZA 3TDFA 5AHIA 5L9FA 3O6YX 1K8XA 1L9WA 1ZCOA 4TU1A 3RU6A 4O19A 4JDYA 2ZRVA 4DO4A 1NF0A 1AW1A 3SI9A 1JUBA 4IMDA 1B3OA 4LC6A 5EYWA 1W3IA 2J9ZA 5HNRA 4FEZA 2B7PA 2J6XA 1RQBA 2QCFA 1SO4A 4LV9A 4TMCA 3BK0A 1L6WA 1W5OA 2YW3A 2DZTA 1VGAA 3DFOA 3W1NA 4FIRA 4CCEA 3HG5A 3BW4A 3S5YA 1P0KA 4IX0A 1FX6A 3F1QA 2WOQA 3GX9A 3NGJA 4N2YA 3GAYA 1QCWA 1MZHA 5LKYA 3TQ0A 1ALDA 3W71A 3T40A 2JKPA 3BG3A 1SW7A 2YDAA 3GR7A 5DXYA 4LVGA 1M7OA 2W79A 4YCOA 2A1YA 2BTMA 3L5LA 5EBUA 5D09A 3GB6A 2ATSA 1GVSA 4AH7A 4PL1A 4WUIA 5E93A 2VELA 4EVZA 2NWRA 2A5HA 4A2RA 4Y6GA 2RHGA 5CPOA 2YW4A 4NZFA 2TMDA 4IJBA 4J9JA 3Q58A 3MI6A 4HT3A 2YCEA 1TPEA 4QITA 1RPXA 2PC4A 2NUXA 4OT7A 3FJ6A 3S42A 2ZRUA 1EWDA 2EKCA 3NVTA 4UTMA 4JTEA 3L68A 2R14A 1TRIA 2CZ5A 4OQVA 1QO5A 3H54A 3TNOA 5AC8A 2PRLA 3VI2A 3WJSA 1W1ZA 5KZEA 2DJXA 1OYBA 1JCXA 5G1YA 5D2WA 2EAWA 1QFEA 2VXNA 4K7YA 4OV4A 2OJPA 1H1ZA 4U4MA 1W37A 5DCDA 1LRQA 3SY5A 1LTDA 4NZJA 1ICQA 3G1YA 3L65A 4GBUA 4BI7A 4CNNA 1ZALA 5T26A 2EHHA 4OGZA 3I6RA 4NQ1A 4RV8A 1R2TA 2CLIA 3IVSA 3TSDA 3N34A 4ADSA 3W86A 1F74A 2ABBA 1VCFA 1KM3A 1W3NA 1GTEA 4FXRA 4NJGA 3W7RA 3IEBA 3VE9A 3UD6A 4JX6A 5KZMA 4NJJA 1XBVA 2GVGA 4LRSA 3PG8A 2ALDA 5A5WA 3GIYA 1ZJIA 3TMLA 3DKLA 1WBHA 4M7TA 1XL9A 2YGYA 2ZQ0A 3GAKA 3PVFA 5IBXA 1SPQA 1S5WA 2CLOA 4O54A 3PB2A 5C6MA 3CU2A 4ZQCA 1H61A 2CFFA 1IXOA 1JCNA 2HMCA 1T96A 4O0ZA 5F2GA 2QCDB 2NV1A 1KFEA 1FWNA 3TC7A 2C18A 4M19A 1B9BA 1P5BA 2BSLA 2NV2A 1DOSA 3UQNA 4H3DA 1HO1A 1W56A 4KWVA 3QM3A 4S2CA 4CQAA 3P81A 3I7QA 1N55A 2JK2A 3QYQA 5F2LA 4I7WA 2C15A 4MJMA 4AWTA 1RD5A 1QPQA 3TSMA 5TBOA 2PRMA 1THFD 3T55A 3VE7A 4RZ5A 1OX6A 4ZQNA 4EWND 4XUGA 4Q33A 3MI2A 5HMSA 4HSOA 4WQ6A 1EPXA 1R2SA 2QCHA 4MYXA 3O6DA 3EWWA 3NQ6A 1VYSX 2X1TA 3G1FA 1FQ0A 3E9AA 1KM2A 5LHEA 3TR2A 5C5YA 3DGRA 5HUOA 3N3MA 5D30A 3HG2A 4UFJA 5FESA 3ZR4A 4ZQPA 3LI0A 3S5OA 1SO5A 4KWWA 2I14A 3QJAA 5F2IA 3NDOA 5HWNA 2QJHA 3MUXA 3BV4A 4PEKA 1I2QA 4N9EA 4ML9A 3SSJA 5E0KA 2PCQA 4RR4A 1NF7A 3LHWA 3U2OA 1OK6A 2Y7DA 4LNYA 4GC4A 2CZFA 3UYCA 3W9ZA 4O1BA 2ZZ5A 4YMZA 2FQIA 5H2ZA 3EB2A 3HO8A 4O53A 1KTNA 3SZ8A 3TH6A 2V2DA 1TPFA 3TFXA 3TJXA 3UZ5A 3E02A 4IQLA 3M47A 4O8RA 3GR8A 4ZVJA 2NZLA 1U83A 2NUYA 3LCXA 1UASA 3W72A 4ZMGA 3C6CA 5AHEA 2J88A 1GQNA 4FB7A 1LROA 1OYAA 4MKNA 1TV5A 1NSJA 3TX9A 4NJKA 1XKYA 8TIMA 3QFEA 2O7QA 5LGXA 1AL7A 3IIVA 3W1PA 1QAPA 4P2VA 3RFAA 2FPYA 3KHJA 3W76A 4NX0A 3FLUA 3G1HA 4JS3A 1F7BA 2G97A 5KITA 3E12A 4Z1CA 2QEZA 4MUZA 2JKEA 4RLIA 3W70A 3UWWA 1H62A 1ME9A 3M5XA 3LRKA 1GWJA 1NFBA 4NU7A 2C3ZA 4TMBA 1W0MA 4HNTA 3IGUA 3STFA 4UFKA 2GJLA 3N2MA 3LBCA 2C1HA 1XC4A 3G0UA 3N2XA 2ATMA 3B0UX 1EUAA 3W83A 3QEZA 5D32A 3P62A 1KLZA 3EX6A 4R53A 3OVRA 4XTIA 3HPZA 1AW2A 4X2RA 1PS9A 1HTIA 3IIZA 4Z0JA 3G1AA 1GVOA 3G18A 1VLWA 2QCGA 3W7PA 3ABRA 5C55A 3W1QA 3B05A 3R13A 2YZRA 4M7SA 4NNAA 1VCVA 3WJWA 2WKJA 3E0IA 1JUKA 3G0XA 3I7SA 1JCJA 3OHIA 3RMJA 3BG9A 5HR7A 1GT8A 1OFDA 3L66A 1G4SA 1HFBA 1ZFJA 2I1OA 3CT7A 1A5SA 4AAJA 3ATZA 4BF9A 4N9BA 5BMXA 1OHLA 3UWZA 1KTCA 2YYUA 2RKXA 4WZHA 4FIQA 3PSWA 2BX7A 2WPBA 2CLHA 4JYDA 3C52A 3CB8A 4FX8A 1OG0A 3FEMA 5I3KA 3EWZA 2ZZ3A 1PE1A 2CZEA 3ZWTA 3A24A 1P1XA 3NZ1A 2WJZA 3FA5A 4UTUA 3P82A 1OFRA 3E49A 4JDBA 3W7JA 3USBA 4MY8A 4AF0B 1GOXA 2E1DA 1SUXA 3EX1A 5K3VA 2DZVA 4B5NA 4G1KA 4O13A 4AVFA 2ZDRA 4BK9A 1KM4A 3G1DA 3QPZA 3S1XA 4GUJA 3O6CA 3WFAA 1K02A 5F2MA 4MJZA 1YXYA 5CGQA 3STGA 4LY8A 4EIVA 1QPNA 3AJXA 1SR9A 4LS0A 2OZ0A 2Y6ZA 3QMSA 3EWYA 5DY3A 2DZSA 3TIMA 3LLFA 2A4AA 2H8XA 3LCIA 4N6FA 5LGZA 1GTHA 1TJPA 4IMFA 3HG3A 1UUMA 4WJEA 5AYXA 5U7SA 1L6YA 1DHPA 3RLUA 3TU9A 4A2SA 1XFBA 1TTIA 1LZOA 3LGEA 5FF2A 4ALDA 2OCZA 3EKLA 3O16A 4PCFA 3CEPA 4NVTA 4JNMA 3O05A 3G24A 3P7YA 4O50A 3I65A 3VCRA 1TSIA 5AFDA 1VJIA 4K7VA 4JX5A 4MZ8A 3C2RA 3DXIA 4UTWC 1GZGA 4NNCA 2ZYFA 1JRCA 3IIXA 3R12A 1SZGA 5HR6A 3HGSA 4O1DA 1VLIA 1VRDA 3M7WA 3QH2A 2QKFA 2W0UA 2FLIA 3TCEA 3EXSA 3MO7A 4O17A 5CZ0A 5KMYA 3OA3A 3B0PA 4WY0B 3SGZA 4M5PA 3GKFA 1VS1A 4D2JA 2H6RA 3LB0A 3CQ0A 5BNKA 5EPDA 2OX1A 1OK4A 4CNPA 4IXHA 2O7SA 4AF0A 1RVGA 2HTMA 3BPWA 4ZL1A 2VENA 2A2IA 1WDWA 4GUFA 3WJZA 4AHPA 3LX9A 3DFNA 3W7QA 4UFHA 3DI1A 3NG3A 4WY0F 1OFEA 3GLCA 3P8IA 3NL3A 4RZ6A 3R8RA 1XBXA 2AGKA 5AHMA 3KRSA 3QW3A 4O1AA 1C29A 3GVGA 2QCMA 2QUUA 2Y61A 3QPYA 3MBDA 2Z6JA 3WK2A 3N9SA 1XCFA 3QF0A 1TO3A 5K7JA 4X22A 1KM5A 4EF8A 3QSRA 4HPJA 1FCQA 2Y7GA 3H55A 1A5CA 3W1LA 3BO9A 2A6LA 3PUOA 2YX0A 4Z08A 4R33A 4FNQA 2FTPA 3A21A 3L0NA 3WK1A 3DFQA 2GOUA 3CM4A 2JBMA 3W2NA 7TIMA 2VKZG 1QR7A 4Z1AA 1YYAA 1F6PA 1JRBA 4N9DA 2F7FA 2DZUA 4CLMA 2E6DA 5AHLA 3NQVA 1U5JA 3DBPA 2GQ8A 4O11A 3EXTA 3B4UA 1EA0A 3FKRA 1O95A 1YXCA 3QQ0A 4PH6A 5CPNA 2UV8G 1QWGA 4K6AA 4QAIA 1H60A 4Y90A 3WK0A 3LCFA 1H7RA 3M6YA 2E68A 5D2VA 3TSBA 3DFTA 1TTPA 4AWSA 4WY0A 5C2XA 2G95A 5SWUA 1EP3A 5BMWA 1F76A 3THQA 5FEZA 1QPOA 1IXQA 4WD0A 2Y85A 1GYLA 1Y0EA 1N7KA 1GEQA 4O14A 1D9EA 2HS8A 5FEPA 2DZPA 4PODA 5CG7A 2P1FA 3W7GA 1W8SA 3W7CA 3KVLA 1X7FA 4HNNA 4E2DA 3TXZA 1TQXA 4GXMA 1VYRA 1I45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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