1IGSA

Indole-3-glycerolphosphate synthase from sulfolobus solfataricus at 2.0 a resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Synthase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE
publication title 2.0 A structure of indole-3-glycerol phosphate synthase from the hyperthermophile Sulfolobus solfataricus: possible determinants of protein stability.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 100
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1995-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1igsA00
3KX6A 4IMGA 3WK1A 3JR2A 4CCCA 3S9YA 4EOUA 1QMLA 3ABOA 1KM5A 3M44A 4O4VA 3MBFA 3W2KA 3QMTA 4Q4KA 3W1PA 3PM6A 5EMUA 1H7PA 3W1AA 4XQ6A 1WA3A 5FF4A 3UYCA 2Q3OA 3O1NA 1L9WA 1OFQA 1W8SA 2G95A 2C0AA 4X9SA 5LSMA 5HWNA 1GG1A 1ADOA 4UMBA 1VS1A 1B4EA 2YW3A 3EX6A 3VI2A 3TUUA 4RLIA 1OX6A 3HJZA 3NZ1A 5G5IA 1FWRA 1LZOA 5DLCA 1PHQA 5U7SA 3GXTA 3JRKA 4FHAA 1R47A 3EB2A 1N55A 1YXCA 1KM3A 2IQTA 3MYPA 1BEUA 1I2NA 1KM6A 1G67A 4RKAA 5E1QA 2CZFA 3IV3A 3VCRA 2C6QA 3SIZA 5AHFA 2V0TA 5H2ZA 4ZQCA 4TO8A 1D3HA 3GNDA 1UUMA 2FPTA 5FF7A 3GAYA 4HSNA 5AYYA 4P61A 2J9YA 4LOCA 3TC6A 1FCVA 1HUVA 1SW7A 3LGEA 1H62A 3LTYA 3CC1A 2BX7A 3O06A 1MXSA 2YX0A 3F4WA 3KVKA 3TFCA 3PAJA 2OZ0A 3NQMA 4K6AA 2AQWA 3NQCA 2PE4A 4AWTA 3G1XA 3THAA 1YADA 3MI3A 1TQXA 1SU5A 3W23A 5BRBA 5KINA 1AW2A 3M9YA 4LS2A 3EEGA 3VNDA 1HO4A 2HS6A 1KTCA 4RZ5A 2DU2A 3HF3A 2XN0A 3HQ1A 3W7HA 3E96A 1X7FA 5K9XA 5AHLA 3A9IA 2PC4A 1RVGA 2R91A 4ML9A 5DBUA 4AWSA 4IMFA 3UXDA 3CIWA 4TMBA 2E68A 1F76A 4ZMGA 1G7UA 3TE9A 1M7PA 3MJYA 3W74A 4MVAA 5AN7A 3W7PA 2PRLA 2Y89A 2YXGA 5FESA 1KFBA 3PBYA 5G1YA 4TMCA 3DGRA 2ZYFA 4JXCA 1CX9A 2VEIA 1TTJA 3N73A 3PS7A 4LWWA 4XKYA 4GE8A 5G1TA 2CLMA 3N34A 4FNRA 4MJZA 1JJKA 5FEPA 3R2GA 1I2QA 2QCHA 1DJQA 1O94A 2Y7DA 3UY7A 1Q6OA 1T99A 4NU7A 1W37A 1YLVA 3DXIA 3W1XA 2ABBA 4Z0JA 4NVTA 3C6CA 3SECA 1GEQA 4K7VA 5K4XA 3G24A 5KITA 4LRSA 3U8GA 3CWOX 3GK0A 4O52A 3S5NA 1R30A 4GC4A 3EX2A 1D3GA 4XKYB 3T55A 2E6FA 4OWGA 4CQAA 3QPYA 4FB7A 4UTHA 1YDOA 3QF0A 1QFEA 3WFAA 1UB3A 4A29A 1LLWA 3GKFA 3S5YA 4ONVA 1RD5A 1QPOA 4PEKA 4OGZA 4OU1A 1X8FA 3I68A 4MJMA 5HINA 1TTQA 2WNZA 3PSVA 3W2MA 3W86A 3LV6A 3G1DA 1R2TA 4AH7A 4HNUA 4UTJA 3DENA 5K9CA 2ZBTA 2VFDA 4QAIA 1EWEA 1IXQA 1TPEA 5F2IA 3P60A 4WOQA 5HUOA 1K7EA 3ABQA 4N9DA 1YDNA 5G2WA 3EWUA 5D38A 2I1OA 3NL3A 2Y7FA 1FDJA 1KV8A 4Q32A 1M5WA 3MUXA 4NXKA 4RV8A 1LOQA 5KZDA 1GVOA 3IGXA 4GNJA 2OT1A 3BLIA 2NXHA 2V81A 3H53A 1EPXA 3NAVA 4XWUA 2E5DA 2ZRZA 3PUDA 2Z2UA 1EUNA 1O5XA 3Q2DA 3SZ8A 1B3OA 3KVLA 4Z0SA 2O7SA 3B05A 4NJIA 3SW6A 3I7RA 1GQNA 2ZRVA 1HO1A 4X22A 4DQWA 4ZQNA 3A23A 3L66A 4HN4A 1QPRA 3R8RA 2YW4A 3NPWA 3ABRA 1SO4A 3O07A 1WOAA 1FCBA 5LNSA 3U2OA 1DL3A 5BOOA 3MP3A 4ZZ9A 4WX2A 1KBIA 1A5BA 1I8JA 3QPZA 4UTUA 4XZ9A 1JULA 1MZHA 5AC6A 3M6YA 5TBOA 4HNNA 3C52A 3C56A 1VZWA 1GYLA 2B0MA 7TIMA 1KFEA 4NXSA 1NAL1 4JTTA 5AHIA 3CU2A 1VGAA 4HNVA 4O15A 3D0CA 1FY6A 3HG2A 1M7OA 3DAQA 2PCQA 2BZNA 3S1WA 3PUEA 3UXAA 2W0UA 4GBUA 1XDMA 3NQAA 3N19B 4A2SA 2HMCA 1MEHA 2H6RA 5AC8A 2A7PA 1QR7A 3H54A 1TTPA 1XBXA 2A1YA 1FBAA 3MHGA 3TSBA 3QQ0A 2J6XA 2FB2A 1OVDA 4IPJA 3QRHA 2V8ZA 4JTLA 1XUUA 3UPWA 3DH7A 3L67A 1KM2A 1R46A 2J9ZA 3HPXA 2P10A 3BG5A 2E5BA 2V5LA 3QH2A 1LM1A 1XCFA 2RDTA 5AC7A 3UWWA 1OF8A 3W70A 3T7VA 3QMRA 1I4NA 3ZS4A 3W83A 3C2EA 3Q94A 3TROA 1LBFA 2E09A 3F03K 2OMAA 1SZGA 3MO7A 2JBMA 5D04C 3KHJA 1OFBA 2FB3A 3NVTA 1VYSX 3TNOA 4IPIA 5K7JA 3LBCA 4CQ9A 2ZRXA 4ORIA 3LERA 4R7JA 1A5CA 1GJPA 1TPWA 1VCFA 2AAMA 2H8XA 3NDOA 3O63A 4DF1A 4JIQA 1H7OA 1QPQA 1ZNNA 3EWWA 1KFKA 4RJEA 2NXIA 3O6YX 2W6RA 1PHWA 4EVZA 3UWUA 2QDGA 3N9RA 2NWRA 2ZRYA 3QC3A 2YCEA 2J9XA 5DXYA 5IBXA 1RR2A 5K9DA 2WQPA 1DVJA 4WY0A 3W3OA 4PH6A 3M43A 3NXFA 2Q8LA 1KFCA 1T8XA 1JUEA 3GR8A 2C18A 2RH9A 5K2ZA 1S5TA 1UCWA 1F6PA 3S1VA 3P84A 3WK2A 4HSOA 4JTUA 4MFEA 4BWLC 4JX6A 3AO0A 3LCWA 4NJJA 1V5XA 1OABA 4JTEA 3HIJA 1A50A 3RLUA 3DU0A 1VQTA 3HMJG 3IGUA 4GUGA 3STCA 5F4WA 2NV2A 3KVMA 3M5YA 5HWMA 1UUOA 1OFDA 3SFKA 5EA9A 4WY0B 3ATZA 2B7PA 3P67A 5KMYA 2NX9A 2E6DA 2GUUA 3FFSA 3W7NA 4MY1A 4OV4A 1PL9A 4HHPA 2EKCA 1ICPA 2NX1A 1K8ZA 2WOQA 1DKWA 3QSTA 3RK8A 3VE9A 4LVGA 2TSYA 3I6RA 3SSJA 2CLFA 2E77A 3RMJA 3EX4A 1P0KA 4LT9A 3RFAA 2JKAA 3W7RA 3IIVA 3L21A 3NQGA 1TSIA 1ZAIA 1EP3A 4NNCA 2PRHA 1L6WA 1IIGA 5I3HA 5AYXA 4UMAA 1FWTA 4IMCA 5FF2A 3TCEA 1NSJA 3QMSA 1FX6A 4MY8A 2NUYA 1AG1O 5I3JA 3HG4A 2AGKA 3N3MA 2ABAA 2A85A 4GUIA 5HUPA 4WY0F 3DHFA 3L9CA 3HGOA 1QO5A 3WK0A 5GVJA 3HGJA 3G1YA 3FLUA 4O0KA 4IMDA 3CIXA 2C16A 5C2XA 2ZZ5A 1O95A 4P2VA 4CCEA 4MYAA 3LM7A 1TMHA 4BI5A 2X30A 1QPNA 1GTHA 4RCXA 3PBVA 3CM4A 3NPXA 3NOEA 3LOTA 4LY8A 3DKLA 1WXJA 2BLEA 2CU0A 3BPWA 4Z1AA 3N2MA 5K4ZA 2TRSA 1CW2A 1YTKA 2PRMA 4OV9A 5D03A 2D73A 4EWND 5D05A 4UC5A 4D2JA 1C9DA 5D2VA 2ZRUA 3DFSA 2YFOA 4ZQMA 1OK4A 5TQLA 3IVTA 1SSDA 2QKFA 3HGRA 2ZA2A 1Z42A 3GDKA 3L2IA 1LRNA 4YCOA 2B7OA 1H5YA 2ATMA 3LHWA 2J27A 2C3ZA 3STFA 3NR0A 2JGYA 1HL2A 2QAPA 3NYZA 1LRTA 4XTIA 3IVUA 3L5LA 1RQBA 3MHUA 3W1TA 3SI9A 1VC4A 3BG3A 1S5VA 2GVJA 4FNSA 3PBWA 3HOJA 3EKLA 5LHFA 3W84A 5FF3A 4DPPA 3P80A 4Z1DA 1SW0A 2G5WA 4KKXA 2VXNA 3TSMA 3OVPA 5CZJA 1GVSA 2Y7GA 4E0CA 2JGQA 1LOLA 3IIOA 1X6UA 4K7YA 2YGYA 3CB8A 3DFQA 5CZ0A 1K3UA 3GDMA 3G1VA 4S1FA 3N2XA 1P0NA 4PA8A 3B03A 1QAPA 2H3DA 3A24A 2ZZ4A 1A5SA 1H7WA 3O15A 1UJPA 3G0SA 1Z48A 1EWDA 3W75A 4GUHA 4O54A 2V2CA 3HPSA 4I7UA 3BW4A 2A4AA 2NZLA 1FWWA 1YXDA 1JVNA 2HS8A 3GNNA 3IRDA 1SFJA 5DXXA 1OJXA 5KZEA 4S2BA 3GLCA 1YXYA 3LXBA 2QUUA 4MZYA 4QSHA 3JS3A 1W31A 3W2NA 3W6YA 1FCQA 1TV5A 1F2JA 1HG3A 2FPYA 2QUVA 4MY9A 2V30A 2Y63A 3NQEA 4NZFA 4HPJA 2XN2A 1ZCOA 2QCLA 1SQ7A 2I14A 3NA8A 3W7CA 1BTMA 2E1DA 1CI1A 2V5BA 4L4MA 4HKPA 5F2GA 1PCWA 2X1SA 3C2RA 1OFEA 1MEIA 2FLIA 2VFIA 3TQVA 1LDCA 3I7SA 1G4EA 2EF9A 1TPUA 3YPIA 1DHPA 4ZVJA 1PCKA 1GVRA 3S8HA 5D02A 2Y70A 3DBPA 4O19A 3W2UA 2FFCA 3DI1A 4JTSA 4KFOA 4DO4A 4FXRA 2FIQA 5FEXA 4N9CA 1LTDA 5CSSA 1X1ZA 4LV9A 4YCPA 1AMKA 2PURA 1LORA 2GVLA 3BK0A 3GVGA 2OX1A 3MP5A 4OE7A 3TMLA 1JCJA 2BSLA 5EY5A 1LRQA 1EUAA 3HO8A 1JUBA 1MSSA 4UTIA 3P8IA 2A7NA 4AAJA 3W7IA 1RV8A 5CPOA 3QSRA 3LI0A 4BI7A 4KFNA 3BV4A 1EP1A 3TXZA 3FKKA 4O8RA 3W76A 3LXCA 1GZGA 3RNDA 4E2BA 4QNWA 5EL1A 5DCEA 4ADTA 3LCXA 4JN6A 5A5WA 2TYSA 3A5VA 1TV7A 3QZEA 4I7VA 2ZZ2A 4R34A 1ONRA 1Q6LA 3FIGA 1YPFA 3TXVA 3FA5A 3TV8A 1QOQA 3IIZA 4JTJA 4LS1A 5CSRA 3EWBX 4ZL1A 4TU1A 2Q8ZA 4WOZA 4JTHA 3G1FA 3M5ZA 4OBTA 5FEZA 2J24A 2RDUA 4O1CA 3P7YA 3GAKA 4LTSA 5AB3A 2Z6JA 4LVBA 1IXOA 3W07A 4H4IA 4ZQPA 3PULA 2DZVA 1OX4A 1K8XA 3W1NA 1TQJA 2XFWA 3EX3A 2NLIA 4JS3A 3UY8A 3W7JA 4AB4A 1OHLA 3LRMA 3NO5A 2Z1BA 3U6WA 4JEQA 4ICNA 1ICSA 3G0UA 5LHEA 3GIYA 4NNBA 3HPZA 3LTPA 1KM1A 5H91A 1RZMA 1TYGA 1OYAA 1TIMA 3RU6A 2JKPA 2VOMA 4Y90A 2Y85A 5FEWA 4WXYA 3NGJA 5CG7A 1K03A 3STEA 1TRDA 3SGUA 3OG3A 4GUFA 4O10A 3STGA 1H7RA 1N7KA 1F7BA 1OX4B 2QJHA 1XKYA 4J9JA 1RPXA 3GDRA 1L6SA 1OFPA 4LVDA 3DKJA 5LNWA 3C2VA 4R33A 3BW2A 4LVAA 3NQFA 3TK7A 4JTGA 1AK5A 4UR8A 1YPIA 1JCNA 1VYPX 4O18A 3TSDA 2Q3RA 3L0GA 2Y62A 5DBTA 1DBTA 1DV7A 4NJKA 3ZWSA 2BTMA 5CGQA 3GYEA 2A2IA 1EA0A 2EPHA 1Q6RA 3TMQA 1ME9A 4O16A 3SY5A 1F05A 1ME8A 3CTLA 1K7XA 1QWGA 2DORA 3W1UA 1H7NA 4A22A 5DELA 1XBVA 4A21A 4JYEA 1JRBA 2ZDRA 2QUTA 4EF8A 4K36A 1NF7A 2OCZA 1H61A 3UPBA 1KLZA 1G4TA 1Z44A 2ZZ3A 5LKYA 3GDLA 4KWVA 4UFHA 5E93A 2LLEA 3T44A 5L6UA 2V9DA 2VFFA 4UNKA 2QCDB 2V2HA 1TRIA 1J4EA 1I2RA 3BLEA 3KXQA 1GTEA 3CPRA 2ISSA 2VEPA 1WAUA 1LCOA 4OT7A 4LU0A 2CZEA 1AL8A 5T26A 4RXGA 5DY2A 5BNKA 4PTNA 2E6AA 5G2HA 1UASA 2ZRWA 4H6KA 3TFXA 1FDZA 3DZ1A 2A5HA 3NQ7A 3FYPA 2A0NA 4E38A 4UUIA 1OYCA 3R89A 4LV4A 2TMDA 4O13A 4LUJA 3NNTA 3LX9A 4JNMA 5CZSA 2Z6IA 2V2DA 2X1UA 1BKSA 2ALDA 1W56A 4DXVA 1TPVA 1VH7A 1BWKA 2FQIA 3BARA 4UTWA 2KZHA 2O7QA 2H3BA 1TV8A 4N02A 3W7KA 4Y8FA 1W5QA 5KTLA 4JTIA 1U83A 1DQXA 1JCYA 5ABTA 3M1ZA 1GT8A 1Y0EA 4U28A 1RQHA 2NX3A 3OIXA 3WJXA 2WJZA 2WKJA 4N9BA 3W71A 3TA6A 3W1MA 4RXFA 5I3KA 3B06A 1EIXA 2E5CA 2YZRA 1WBHA 4K37A 2VEKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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