2QHAA

From structure to function: insights into the catalytic substrate specificity and thermostability displayed by bacillus subtilis mannanase bcman
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
HTVSPVNPNAQQTTKTVMNWLAHLPNRTENRVLSGAFGGYSHDTFSMAEADRIRSATGQSPAIYGCDYARGWLETANIEDSIDVSCNSDLMSYWKNGGIPQISLHLANPAFQSGHFKTPITNDQYKKILDSSTAEGKRLNAMLSKIADGLQELENQGVPVLFRPLHEMNGEWFWWGLTSYNQKDNERISLYKQLYKKIYHYMTDTRGLDHLIWVYSPDANRDFKTDFYPGASYVDIVGLDAYFQDAYSINGYDQLTALNKPFAFTEVGPQTANGSFDYSLFINAIKQRYPKTIYFLAWNDEWSPAVNKGASALYHDSWTLNKGEIWNGDSLTPIVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-1,4-mannanase
publication title From Structure to Function: Insights into the Catalytic Substrate Specificity and Thermostability Displayed by Bacillus subtilis Mannanase BCman
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 128
structure length 336
sequence length 336
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2007-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2qhaA00
1XRVA 1OT2A 3T0BA 2YL5A 1UR2A 4AD2A 2WANA 4MNJA 4PEEA 4BQ3A 1CLXA 1I1XA 1VEMA 4GIAA 2WVTA 1TCMA 4AD5A 1KFWA 1AQHA 2J8GA 2E3ZA 3EDDA 1KWKA 5D8ZA 5I24A 2BHUA 4JFWA 3SCRA 4PMYA 1KQYA 2DDXA 2ZXQA 4PMDA 5BCAA 4PBGA 1BF2A 5D9OA 4L4OA 1KCLA 4JKLA 1OGBA 2WWDA 1GVIA 4UOQA 1GOOA 4CCDA 2WMIB 3D5HA 3CO4A 3N15A 1R86A 4WK9A 1OINA 3AMKA 1X6LA 1F4HA 1OD8A 2WCGA 3KEHA 2YDQA 1XD0A 4AW7A 3NDZA 1JYWA 1B3ZA 3F4VA 3L4WA 2ZXBA 3VINA 4EK7A 1KXVA 1Q6GA 3FHAA 2DSKA 1BHGA 1JDCA 1TA3A 5CPSA 3WUEA 5F7UA 4S3JA 2WK2A 3LPFA 5A8NA 4BQ4A 2WBGA 3AIRA 2X05A 2BVTA 2DT2A 4PMXA 4PSPA 3UETA 2X1IA 3CUFA 3FAWA 5JBEA 1HKIA 4D71A 1CXFA 4ZFMA 2WMJA 5A69A 4KMQA 2C8NA 1EDGA 1WE5A 1H0IA 4EKJA 3W82A 1H4PA 1E70M 3ARXA 3ARTA 4IISA 1Q6CA 1ISZA 4GQQA 8A3HA 4D6IA 2YLLA 1HP5A 3RCNA 1Q4NX 4ZXOA 3OG2A 4HA3A 4UR9A 5BROA 3VX1A 4CU7A 4JHOA 5LYRA 3BC9A 2XVKA 2BY1A 1HN1A 3AOFA 3ZIZA 5E0FA 3AMGA 3CHCA 1NOFA 1CGVA 4PTMA 4DM2A 5A2BA 3GDBA 3AIWA 3GXFA 4QLKA 3RO8A 4U2YA 4EAMA 1PIFA 2PWDA 1QNQA 2XFFA 1JZ4A 5ECUA 3VD7A 4AYSA 4ZEPA 3NSMA 1X6NA 2QF8A 4BA0A 3WQWA 1GOQA 2RGMA 1US2A 1GONA 2WVVA 1W1YA 3L4VA 4BCEA 2EPKX 3UEQA 3IK2A 2B31A 1W9PA 1JZ3A 4QLJA 3GH5A 2F8QA 2VZSA 1KB3A 3QOMA 2G3IA 3EBVA 1PBGA 2NT0A 5E70A 1PAMA 1QI3A 1GCYA 2ZICA 3ALGA 5A6AA 4D6HA 1MFVA 1U30A 3WQ8A 2VX6A 3WQ4A 3AMLA 3VVGA 3ZJ6A 1E1FA 2WZEA 3DC0A 1PPIA 2FH6A 3VIJA 4UQCA 4UFIA 3TTOA 4W5ZA 1KGUA 5DEZA 3GBEA 1W9XA 2WNWA 4WIWA 1NWRA 4OBRA 3BLKA 3DYPA 5CXPA 2E9LA 4JCMA 5E0CA 5CSUA 3MKKA 1W32A 5A95A 3MSGA 1E5NA 2Y4SA 1CXIA 2BS9A 4OOUA 3IJ8A 1R7AA 4V28A 3VPLA 2ZUVA 3N12A 2WZHA 3AS3A 2XWEA 2OWWA 4CVUA 5D4YA 3L4UA 4F8XA 1RPKA 2Z1KA 4M8UA 2OSXA 4QFUA 1EOMA 5LA0A 4JFUA 2UY5A 3GXMA 1XSIA 2BVYA 6TAAA 3AZSA 3QOKA 4A3YA 4C7DA 3AXXA 4F9DA 1E0WA 1XHGA 1QNSA 1VFMA 1K9TA 3T0AA 1NWSA 2DSUA 4Z2KA 3CIVA 1XYFA 2J7CA 1W9DM 1UD6A 3VDCA 3VM5A 4W86A 1LG2A 1UA7A 1GZJA 4GQRA 3GNRA 3KE0A 4HZ7A 5BRPA 3WH6A 3B8SA 2WHLA 3CTTA 4M80A 3VDHA 3N13A 1XSKA 3VGBA 1KQZA 1ODZA 1KBBA 3A3HA 5C8BB 4YPJA 1BSIA 6CGTA 2J79A 1JAKA 5JUVA 3MMUA 3T0DA 4HOXA 4AZGA 4NI3A 4D6CA 4UFJA 4QCEA 1S46A 2CKSA 4MJ4A 5A8PA 1CGXA 4MTVA 4DUXA 1CIUA 3G6LA 4GZIA 3SCQA 5I23A 3MUY1 1WDSA 3NUKA 1CBGA 1VBUA 2W61A 3WNMA 4GPNA 4HZ6A 4OIFA 4AIUA 1PX3A 3VILA 4H8VA 1VJSA 1B90A 2X0YA 1MVYA 4OUEA 1NWTA 2G3MA 5GNXA 4GINA 1KXQA 3OLGA 2PWHA 2XWDA 1CECA 4MB4A 2Y5EA 2VZOA 4BS0A 1UKOA 1JDAA 4XX6A 2D1ZA 5DO8A 3WENA 1QI5A 3WUBA 3VIPA 3AS1A 4NRRA 2E40A 3VGDA 3BMVA 3M46A 2VR5A 1O6IA 1GOWA 1W1TA 1XSJA 2J7EA 6A3HA 1C3FA 3MSDA 5CPTA 1E15A 1ZU8A 4GZEA 3WDHA 3AMDA 2WHKA 3GBDA 3HN3A 3LPOA 5GNYA 2ZUWA 1EIBA 1QI2A 3KL3A 5IDIA 2CITA 3WY1A 1CGYA 3CBWA 5HDRA 4AZBA 5M3WA 4TTGA 2CBUA 1PJ9A 4TUFA 3SCOA 1G0CA 1CPUA 4P8UA 2XVLA 1UR1A 1NP0A 5CLWA 4LYQA 3WD1A 2YBUA 1DWFM 1E6ZA 1GOMA 1ZS2A 3MUIA 4E8CA 2O9RA 2ZXAA 2VX4A 4OBSA 3VD3A 4OJYA 2W91A 3MO4A 3WDPP 1OCQA 2GVYA 4CN6A 2XFYA 4U33A 3WQ5A 3AZTA 4NZCA 2DSZA 3ZR5A 4AMCA 1VBRA 1NP2A 2XYLA 5CJ5A 2C0HA 5FL0A 4EANA 1E43A 1MQQA 3TTQA 4P8VA 1CEOA 3ARRA 2ZUTA 3PHAA 4W88A 4F66A 1W1VA 2XSAA 1Q6FA 3WF3A 4PYSA 3K8MA 5ABFB 1AVAA 5HBFA 2DGAA 1JZ2A 4W7WA 1C93A 2GJPA 3PZVA 1W91A 2E8ZA 2X8RA 1PZ2A 3FAXA 2CHNA 4AZIA 4MB1A 3WF1A 1WP6A 4OKDA 1AQMA 5EB8A 2FHFA 2GK1A 3BAXA 3TP4A 1J11A 4D1JA 3MV01 1HNYA 4AZCB 2ZXDA 3RM4A 3ZOAA 1DP0A 3SURA 1BLIA 2D2OA 1GHRA 4JL1A 3BSGA 1HKJA 4H7VA 1HF6A 1CGWA 2CHOA 3PZTA 1NARA 3WF0A 4J3VA 1UZ4A 5FL1A 2OYMA 4P7QA 2J8FA 5CLTA 3T08A 4AZHA 1WZAA 3K8LA 4J7RA 1QNPA 3K4AA 2WVSA 1CDGA 1I75A 2V38A 2V3FA 1GQLA 3VX0A 4UNIA 2BXYA 4WSJA 1W1PA 1UKPA 1GHSA 1BPLB 3K1DA 1V02A 3OZPA 2WMKA 4AY1A 3CZEA 2OWCA 2W63A 1ZBKA 4F9JA 1QNOA 3RPMA 2ZX5A 3W29A 4E8DA 1CXLA 4Z2IA 1MQPA 2BHZA 2BHYA 4U31A 1FP9A 5FIPA 1I1WA 3RIKA 3W28A 2PF0A 4M29A 5EBAA 7TAAA 2UY3A 5BXRA 2WMIA 1FH9A 2J47A 5M5DA 3N17A 1LL4A 1VAHA 1UKSA 5D9PA 4FLOA 2FGZA 4R5EA 3A47A 3BH4A 4UQBA 2FHBA 4H8UA 2DT3A 4NSBA 1BFNA 3ZO9A 1ITCA 1GQIA 1SR0A 4W7VA 4S3KA 3WEOA 1XD1A 1M03A 3BAYA 3VD9A 3S2CA 1EGZA 1NOUA 4CGTA 5A6BA 3PN8A 3W37A 1JZ5A 3APGA 3UG3A 1JYVA 4DUVA 3GH4A 2WHJA 2C7FA 2GJXB 2JEPA 1M01A 4WKFA 1VB9A 3U5YA 1MXGA 5I2UA 4TXEA 1FOBA 2A3AA 4R27A 1NOWA 2F2HA 1HKMA 3VM7A 2Y2WA 3CHEA 4ACZA 5GNZA 1TE1A 2D20A 3WD4A 1IV8A 2Q8XA 3WEZA 1H1NA 1BGGA 3CUGA 4U3AA 3CMJA 4MB3A 1B3YA 2NT1A 5ABEA 2CIPA 3SCVA 2XM2A 3ARUA 1EOKA 3WNOA 5M17A 1EO7A 3AXHA 2DEPA 3ECQA 4CCCA 3L2LA 2W62A 4YHGA 2PBGA 1V3KA 1H0GA 4UFKA 2JFEX 3NCOA 4P7OA 1HJWA 3MANA 4GI6A 2GDVA 2WMFA 1JI2A 1GUVA 1U2YA 5IFPA 2JALA 2OYKA 3WELA 4JL2A 2VX5A 3AZRA 4RE3A 3T2QA 4CN1A 4N42A 4JZ5A 5ABGA 3WD0A 3WL1A 3VIMA 1UKTA 2YKKA 3WMCA 1LJYA 1UR0A 4TX8A 1RD6A 1V08A 1WCGA 2ZIDA 3ZSSA 2WB5A 4KRTA 3WSUA 1VIWA 3BAKA 3AHTA 4WF7A 3CZLA 1UZ1A 2NW0A 1U33A 1JDDA 1C8YA 4HA1A 1H41A 1WPCA 3VIFA 3VMOA 1H2JA 1FFQA 2Y8KA 1TVNA 5A2CA 2WYSA 1Q6EA 1YHTA 5M03A 4LXFA 1EO5A 3HMCA 3SEPA 4H41A 4AZ5A 1HX0A 1C7SA 2WC7A 1KXTA 2O92A 3WL0A 3L4YA 2D0HA 3OGVA 4MAVA 1CZ1A 2O9PA 2GFTA 4CUCA 1WO2A 1J0YA 1GVYA 4HU8A 4PRWA 4M24A 1G5AA 3T2PA 1QBAA 1BYBA 4CCEA 3AIEA 1PEZA 3WNPA 3WQVA 2J7BA 5HNNA 4UOJA 3VGGA 3WMBA 1E6QM 1UWUA 4DWSA 1ECEA 4OOZA 1DEDA 4ZE4A 1HXJA 3ZMRA 1JZ8A 4AD1A 3BAWA 1W9VA 1JFHA 4D1IA 3ZT5A 1HIZA 4U5IA 3NSXA 3EMCA 4IPNB 1VFUA 2Y8VA 1V3HA 3AI0A 5A6MA 5A6BD 2WBKA 1QHOA 2DH2A 4W5UA 1SFSA 1H3GA 5IXEA 1WDQA 1D7FA 3MU7A 5E6YA 4IPLA 1JG9A 4P7NA 5E09A 5I5RA 1ZJAA 1UQZA 1ZBCA 7A3HA 4M1RA 4E2OA 1TA3B 1QVBA 1QW8A 1F4AA 4UZUA 3VIOA 4N0RA 1OGSA 2EXOA 2OLHA 1E73M 1W3LA 3N18A 3POCA 4MPKA 5DFAA 4PMRA 1WB0A 3WFLA 3O6AA 3WNNA 4ZENA 1QBBA 1YQ2A 1QOXA 4AZ6A 3NJ3A 1CNVA 3UERA 3SUVA 2DPEA 4FF5A 3MV11 2QV4A 5EMYA 1E6PA 1KGWA 4UCFA 1GJUA 2ZWYA 2OSYA 1B1YA 4W89A 4QDMA 3W24A 3AIVA 4TVUA 2JF7A 3AIUA 2WKLA 3M6DA 4J3TA 4B9YA 5JBFA 2E9MA 2GUYA 1UHVA 1LG1A 1GOKA 1BQCA 1JD9A 4XB3A 2EQDA 3DHUA 1ITXA 3SUSA 2XTKA 2D0FA 4WSKA 3VIHA 1UD3A 1VEPA 1CXEA 2WWCA 3RJYA 5FKYA 4LQ1A 5DT5A 4KRUA 4WJXA 3UR7A 1GW1A 4D6DA 2EO7A 2VZVA 3GXIA 2PI6A 2EEXA 1L0PA 1OWQA 1W3KA 1MW3A 2VRKA 1LWJA 3AIBA 2WVVB 2QLYA 3D3AA 3F5JA 4AEEA 4Z2JA 3SCUA 1H5VA 3FHQA 1DWHM 1HP4A 3THCA 2ZUMA 4AIOA 2YA2A 3EMQA 4D6EA 4YN5A 1GQJA 3AFBA 2FH8A 1FFRA 3OB8A 3WNKA 5D9NA 3BSHA 4CD5A 3PZQA 2EPMX 4D6GA 1E6NA 1QI0A 2PC8A 2XPKA 1ZBVA 3OLDA 2FGLA 1UD5A 3RM8A 1UWSA 3W53A 4DWSD 1ZBWA 2BY2A 2A3CA 1C8QA 4P8WA 3ARYA 4W8AA 4CD7A 4IM4A 1NH6A 2A3EA 3ZR6A 1IT0A 2QPUA 4K68A 5DMYA 2JE8A 1BYCA 1CENA 1E3ZA 4HA4A 2YDRA 2FHCA 3CZ8A 3GYCA 2VCCA 3EDEA 1E4IA 3DECA 1V0NA 1P6WA 4KWUA 3U57A 3VKKA 3ZM8A 2A3HA 4CKQA 1BGAA 2G4FA 2ZUSA 2WAGA 1WDPA 3MUAA 3SCTA 3WMSA 2XIBA 3FY1A 3U7VA 3KL5A 1UUQA 2ZE0A 4RE4A 1JZ6A 5LA1A 3OA5A 1MQRA 2BVDA 2D22A 3VGHA 4LGXA 1PZ3A 2ESCA 3W81A 3VDBA 3B9EA 2XUCA 2YA1A 3OIHA 1WKYA 4W85A 1H49A 1JNDA 2G3JA 2ZX6A 5BYWA 1J0JA 2VJXA 1RP9A 1HL9A 4URIA 5CSYA 2JIEA 2W67A 1UH3A 3ZJ7A 1N82A 4XZBA 5GQBA 1TR1A 2W4XA 3U7BA 4AEFA 5FD0A 3ZT7A 2VOTA 2DIEA 3K46A 1OGGA 2VT0A 4MB5A 5DF0A 4BF7A 1DWAM 5JBDA 1V02E 1UWQA 2FDMA 4B16A 2CBVA 4P7RA 3AJ7A 3BXWA 3VMPA 4HTYA 3TONA 1GOIA 2YL8A 4PMNA 3L2MA 3DYMA 3TTYA 1SMDA 5CPQA 1JGIA 5BRQA 2RGLA 4W87A 1CTNA 2QMJA 3LPGA 7CGTA 1E40A 1CGUA 2BV9A 1V6VA 2J4GA 2Y24A 2YDSA 2ZX7A 3WIJA 1TZ7A 3WDQA 4IUGA 1LL6A 3EDFA 1A3HA 2DIJA 2J25A 1LLOA 1PX8A 2YIHA 1KR1A 4J27A 2XVPA 3L4XA 4BQ2A 3W25A 1UR8A 1EXPA 4JCLA 3VDAA 2E0PA 2DT1A 1V6WA 2PWFA 4AC1X 2DSWA 2XIIA 2X2YA 4W93A 4HPGA 3OLIA 1NQ6A 4UQ9A 2VX7A 2OWXA 4D72A 4GKLA 4WLCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XRV A;  1OT2 A;  3T0B A;  2YL5 A;  1UR2 A;  4AD2 A;  2WAN A;  4MNJ A;  4PEE A;  4BQ3 A;  1CLX A;  1I1X A;  1VEM A;  4GIA A;  2WVT A;  1TCM A;  4AD5 A;  1KFW A;  1AQH A;  2J8G A;  2E3Z A;  3EDD A;  1KWK A;  5D8Z A;  5I24 A;  2BHU A;  4JFW A;  3SCR A;  4PMY A;  1KQY A;  2DDX A;  2ZXQ A;  4PMD A;  5BCA A;  4PBG A;  1BF2 A;  5D9O A;  4L4O A;  1KCL A;  4JKL A;  1OGB A;  2WWD A;  1GVI A;  4UOQ A;  1GOO A;  4CCD A;  2WMI B;  3D5H A;  3CO4 A;  3N15 A;  1R86 A;  4WK9 A;  1OIN A;  3AMK A;  1X6L A;  1F4H A;  1OD8 A;  2WCG A;  3KEH A;  2YDQ A;  1XD0 A;  4AW7 A;  3NDZ A;  1JYW A;  1B3Z A;  3F4V A;  3L4W A;  2ZXB A;  3VIN A;  4EK7 A;  1KXV A;  1Q6G A;  3FHA A;  2DSK A;  1BHG A;  1JDC A;  1TA3 A;  5CPS A;  3WUE A;  5F7U A;  4S3J A;  2WK2 A;  3LPF A;  5A8N A;  4BQ4 A;  2WBG A;  3AIR A;  2X05 A;  2BVT A;  2DT2 A;  4PMX A;  4PSP A;  3UET A;  2X1I A;  3CUF A;  3FAW A;  5JBE A;  1HKI A;  4D71 A;  1CXF A;  4ZFM A;  2WMJ A;  5A69 A;  4KMQ A;  2C8N A;  1EDG A;  1WE5 A;  1H0I A;  4EKJ A;  3W82 A;  1H4P A;  1E70 M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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