2QAP | Genus

Total Genus 143

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	143
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title	Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases pubmed doi rcsb
source organism	Leishmania mexicana
total genus	143
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2007-06-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2qapA00

4JY8A 5G2HA 3W70A 3P80A 2P10A 2NX3A 3R2GA 4LS1A 1DBTA 2NXIA 1O5XA 3NDOA 1OK4A 1XBVA 3L66A 4ZQCA 3DENA 4IXHA 2VFIA 3E9AA 2V5LA 3V1PA 3NPWA 3VCRA 3W72A 2ZFAA 3PR2A 3RF9A 1OFQA 3G1YA 4N4QA 4ONVA 4BI7A 1S5VA 3NQAA 3IRDA 4NVTA 5HNRA 4RR4A 3DFTA 1TJPA 3BGJA 3CIWA 3ZWTA 5DBTA 1OFEA 3NL3A 3CTLA 4MFDA 3C2EA 3LXCA 1XUUA 2VFFA 1F7BA 2WPBA 3I7RA 1J2WA 1J5TA 3D0CA 1EWDA 1VCGA 5HWMA 5HULA 2VFEA 3PAJA 2H8ZA 1BWLA 4WJEA 1XI3A 4NJKA 4N6FA 1JCNA 3NZ1A 2V82A 2Y7EA 4LNYA 2B4GA 2EAWA 1SSDA 3N9SA 3ABSA 3GIYA 3E02A 1LBLA 4LC8A 1ME7A 4XBKA 5D2VA 4JYEA 2RDTA 3Q94A 1FDYA 3QPZA 3LHWA 1ICPA 4A2SA 4N2YA 2X16A 3QFEA 2ZCGA 1CW2A 4K7YA 3NEVA 5LHEA 2ISSA 1UASA 5BNKA 3FFSA 1OHLA 2CZEA 4JNMA 5K9DA 4AMAA 1P0KA 4ZQRA 3LBCA 4GUJA 1VYRA 3N73A 1OX5A 3HGOA 3G3DA 3W23A 5U4NA 4JTEA 3UY7A 4WD0A 3NQEA 3GKAA 3DKJA 3GLCA 1EX5A 2GUUA 3SFKA 3MHFA 3GX9A 5DBUA 2HMCA 1JUKA 2J88A 3MP3A 4JN6A 2FDSA 4L4LA 4ZQOA 4NNAA 3LV6A 5CG7A 4MY9A 4JR5A 3PM6A 2Z2UA 1GVRA 5LNRA 4AWTA 5FEPA 4Z1CA 3TIMA 2CLLA 1ZNNA 1H7NA 1AW5A 4UR7A 1XDLA 1KM2A 3HO8A 3UQNA 4Z0SA 1EA0A 5F4SA 1PL9A 1TPVA 3GXPA 3QMRA 3TX9A 1O95A 2CLFA 3LHYA 4QNEA 2YCEA 3PVFA 4GXMA 3MBFA 3HG3A 1R2SA 1W5NA 2YXGA 2PURA 1ONRA 2VEPA 1S5TA 4JX4A 3RMJA 4WUIA 4MVAA 1JQVA 2WNQA 2XN2A 3GDTA 1UCWA 4K38A 4UTWC 4H3DA 3HPXA 4GJ1A 2ALDA 1L9WA 3W1MA 4GFSA 1W0MA 1QAPA 3BG3A 2NV1A 5EKYA 1OX6A 2V9DA 1G4SA 4WY0B 4LY8A 4HNUA 5D33A 4N9DA 1HO1A 2ZRYA 3GXNA 3MHUA 1LOLA 2ZTKA 4O19A 3O6YX 1GG1A 1Q6QA 1EP2A 4FX8A 3DKLA 5LKYA 2E1DA 3NQVA 3G0SA 1GTHA 4FF7A 3L68A 4Z1DA 2F84A 1FWRA 1JCYA 2NUWA 5AYZA 1K03A 3QSRA 2ZZ2A 3C0JA 1M5WA 3S5YA 5J5DA 4X3ZA 4MLJA 2QAFA 4NZFA 1TTJA 1ZENA 4IQLA 1ZAJA 2WSRA 1OYBA 1CX9A 1IXQA 2XN0A 1QOQA 4GUGA 4EWND 4MYXA 2QR6A 1ZALA 2E68A 2QAPA 3W87A 1XL9A 5AYXA 1LTDA 1D3HA 1LORA 3DFPA 3WJZA 2ZA1A 5TBOA 4NXSA 4QITA 1H7RA 1YXCA 2NLIA 4JICA 3NQDA 2QCEA 3M5ZA 3TQVA 4LRSA 4PL2A 1TTIA 1KFCA 1DKWA 1GT8A 4C1LA 3QW4B 3QQ0A 4A2RA 1NF0A 3G1FA 3O15A 5E1QA 2Y62A 4QJ1A 3NM3A 4UR8A 2PE4A 2NWSA 3JR2A 5K9XA 3G0UA 3BLFA 3CPRA 3LRLA 2H6RA 3IIZA 3QJAA 3TK7A 2I9EA 1SW7A 5LNVA 3B0VC 4BR1A 1VHCA 3TW6A 5DN1A 1DJNA 4JEQA 5G2WA 1UBSA 3IIXA 4OT7A 3NAVA 4QSHA 1H1YA 3HB9A 3A5FA 1GEQA 3E49A 4IXXA 1SQ7A 3EX4A 2YGYA 3W1UA 3W07A 4PL1A 3PG8A 3P8IA 1BKSA 1DJQA 1THFD 2ABAA 5G4WA 4A3UA 4N6EA 2ATMA 4O50A 1C9DA 1WX0A 2GVJA 2ZA2A 1W5QA 2Q8LA 3STGA 3QM3A 1D9EA 2G97A 2TSYA 1IGSA 5FF7A 4M19A 4BWLA 1TV5A 1SU5A 3OBKA 3A9IA 4O28A 1OFAA 3P62A 3FKRA 5E93A 2NV2A 4R34A 5LHFA 1I45A 5AHFA 1KBJA 2QDHA 2BWGA 5G1TA 6ALDA 3B8DA 1V5XA 3HF3A 3WK0A 5C5YA 4MZ8A 1VRDA 3EEGA 1FXQA 3T7VA 3AJXA 3VFLA 3TCEA 4O1DA 4WOQA 2A7NA 2QUTA 4O18A 4JYFA 2HS8A 3NPXA 4JX5A 4I7UA 3M41A 3B0PA 2I14A 3L2IA 4IUOA 4IGHA 1MZHA 1U83A 3PC0A 2CU0A 3NQFA 3BLEA 4POCA 3W71A 3SGUA 5H91A 1YXDA 1T8XA 2OT0A 4ZQPA 2AAMA 4MKNA 1F2JA 1MO0A 2BTMA 1A50A 3QEZA 4JXCA 3GDRA 1S3HA 5AHNA 4FX7A 4P61A 3TXZA 2CFFA 4M6QA 3NO5A 3SR7A 4O1AA 2FPTA 5L9FA 1EUAA 5HR7A 5KZMA 1JULA 4AF0A 1MEHA 1KM1A 1OABA 4NJGA 5CZ0A 3BW4A 2A1YA 3S1UA 3VI2A 3LRMA 1IXNA 3P7YA 3KVJA 4ML9A 1RPXA 4QNWA 1H1ZA 4AWUA 4IMEA 4Y90A 3NYZA 4GE8A 3S9YA 3UY8A 2V81A 4PFMA 3KHJA 4C1KA 4HNTA 2GQAA 3KXQA 2FFCA 2B7QA 5GVJA 4JTIA 4RZ5A 3S0CA 2V2HA 1B9BA 3LCXA 3CQ0A 2CZ5A 1H7OA 1R2RA 2ISWA 1ZJIA 4HKPA 3WJXA 5I3JA 1LM1A 1Q6LA 4JTTA 3TSDA 1NAL1 4UNLA 5F1VA 4YXGA 1QPQA 3PUEA 3SI9A 1M7PA 2Y63A 1O5KA 4BFAA 3THAA 2YSWA 1QPOA 5LGXA 3SGZA 5D37A 1L2UA 5G4EA 2YFNA 1BWKA 3C56A 2J9ZA 1GYNA 2ZRVA 1IXOA 3M5VA 4X9SA 4Y9AA 3UPWA 4M6VA 3GR7A 5CPNA 3VE9A 4O4VA 3UXAA 1GVFA 3OHIA 3THQA 1JQXA 4AAJA 3VE7A 1KFKA 3EB2A 2C18A 3SZ8A 1SUXA 3G1VA 1PCKA 1SZGA 2JKAA 4S2BA 4WXZA 3W7DA 1W54A 3O05A 5DY2A 2NXHA 1QCWA 1K8XA 5TIMA 3TH6A 1FCQA 3R13A 4WOZA 2CLHA 3TROA 3KOFA 1LRQA 3PB2A 4OQVA 4AF0B 1W3TA 5CZSA 3T40A 1HTIA 3W1RA 3NQGA 4Y8FA 3QH2A 3WJWA 2ZZ5A 4O16A 3IVSA 7TIMA 1I2NA 5K4ZA 1OFPA 1TIMA 3LRKA 5AN7A 1DHPA 1OFOA 4YLWA 3UXDA 1RQBA 4DBEA 1OFBA 4H4IA 3ZS4A 1KA9F 3W2NA 3MBDA 2ZRUA 2QCGA 3PS7A 4N02A 1QWGA 3NQ6A 2B0MA 5C54A 2CLEA 3LCIA 4O0ZA 5CPMA 5HJLA 4WY0F 4HPXA 4O12A 5DXXA 3DU0A 3EWBX 4XQ6A 3ATYA 4S1FA 3S5OA 3OVPA 1ML1A 4GWEA 2FB3A 4HNVA 2E5BA 1FCBA 1GVQA 2QCMA 1XBZA 3TNOA 5I3IA 1E51A 3LCHA 2NX1A 4JS3A 1XDMA 1LOQA 4DO5A 3W7EA 3TMQA 2R8WA 5D2TA 1ZHAA 1PHQA 1PVNA 4MY1A 2A5HA 3LV5A 3R12A 2Y85A 1KM4A 3TKFA 1VC4A 3UWUA 1VR6A 1EB3A 1SSGA 4JY9A 4FXSA 3G22A 2PRHA 4A21A 4NUWA 3L21A 3BGGA 3ZWSA 3O06A 3ZR4A 3R8RA 1KBIA 5D38A 1QR7A 1X8FA 4NT0A 1W37A 3Q2DA 3W2JA 4ADSA 4QAIA 1YYAA 2WJZA 3FIGA 4UFIA 1NEYA 5HMSA 3K30A 4AH7A 4FXRA 4XTDA 4ZL1A 1JCJA 4JDBA 2E6FA 1ZY9A 3PBWA 5F2IA 3P5ZA 2G95A 2HTMA 4ZZ9A 1KFJA 2FPVA 1LDCA 4FB7A 5HR6A 4CQAA 3M16A 2E77A 5J5RA 3WFAA 4JYDA 3KAOA 4Y6GA 1LCOA 4N9EA 1W31A 1K7FA 1YADA 2JGQA 5HQEA 1RQHA 1ADOA 2CLIA 4BK9A 1LROA 2CZFA 5BMXA 1RVGA 5EPDA 3B03A 4PCFA 3DFSA 4LWWA 3HIJA 1AL8A 3W1LA 1EP3A 3C8FA 3CC1A 1YTKA 3LHVA 2I1OA 1QDSA 1A5AA 1SR9A 3TR2A 1W5MA 5EMUA 3KX6A 2FQIA 2YYTA 4ZQNA 4UTKA 3GAYA 5H2ZA 2A2IA 1GZGA 1FXPA 3AO0A 3W73A 2YX0A 5I3FA 4Q33A 2TMDA 3DBPA 4QIUA 3M6YA 1R30A 1OFDA 2B7NA 2NWRA 4ALDA 4GBUA 1TV8A 5G2IA 1FCUA 1GVOA 1OYAA 1YDNA 2Z6IA 4UNKA 1U5JA 4H6KA 5AC8A 1VHNA 4LTSA 1KV5A 3IEBA 2EKCA 2ABBA 4TR9A 2PRMA 4M7TA 2IQTA 3ABOA 1TPC1 5BMWA 3UWWA 1IF2A 1VS1A 2ATSA 1EIXA 3O6CA 3E96A 2V30A 5I3HA 1W5PA 3HPZA 5LSMA 3PUOA 2VOMA 4LUJA 3LGEA 4UTJA 1X6UA 3NPVA 4IX0A 1DQXA 3W74A 2Y7DA 3C52A 2P1FA 4KWVA 3C2VA 3BO9A 3LOTA 4O0KA 4UTWA 3UWVA 1Z41A 3C61A 3RFAA 3UWZA 2X1TA 3MYOA 3WK2A 4UFMA 3UYCA 4ADUA 2YW4A 1F6KA 2CW6A 3A22A 1K7XA 3HMJG 3CU2A 1WDWA 3IVUA 1YDOA 3P60A 2NUXA 4FO4A 3EWUA 2AGKA 1X1ZA 1P4CA 4JTHA 2BXVA 2VFDA 3HGJA 3W84A 2DZTA 5DY3A 3HGRA 4K6AA 2PCQA 4WQ6A 3BW2A 2RDWA 1QO2A 4JTJA 5D05A 4JDYA 2GQ9A 3EX1A 3L9CA 1EPXA 2EF9A 5CKSA 3G1HA 1K8YA 4IX2A 3B06A 3WK1A 4AB4A 1TPUA 3STCA 1DV7A 3B4UA 1UB3A 4UMCA 4R53A 5CZJA 1LYXA 2RHGA 4OBTA 1LBMA 5D02A 2F7FA 4FEZA 1FUYA 4IPJA 4HT3A 1A5BA 2ZZ7A 3EXRA 3W85A 3PUDA 3BW3A 4E0CA 1SW0A 2DZVA 1BEUA 3G1AA 1RR2A 5FI8A 3M0ZA 1JUBA 1OYCA 1GQNA 3M9YA 2QCHA 4LT9A 3U6WA 1OJXA 4FNSA 5DELA 3PY2A 5F1UA 1SFJA 1YPFA 3N19B 1TRIA 1QOPA 3GR8A 1WBJA 1QMLA 3C2OA 3W9ZA 1TPH1 3N14A 4QQ3A 1Q45A 3BARA 3BLIA 3W6YA 2FPYA 2OCZA 3B05A 3TC6A 1VYPX 5IBXC 1LLWA 3W2LA 1LRTA 3B04A 3RLUA 3GVGA 3UD6A 2J9YA 2QF7A 3TC7A 4L4MA 2H90A 4FHAA 4OV4A 3L5MA 5KZDA 1S5WA 1HUVA 4FIRA 1XCFA 4O1CA 1Q3NA 2TPSA 1K8ZA 2C19A 3Q37A 4TO8A 4DBDA 5KINA 4WZHA 3W1XA 3EWXA 3DFNA 3NPUA 4GUIA 1M6JA 4M7SA 2P0OA 1EP1A 3L5LA 1JCXA 2BLEA 3BK0A 2E6AA 4NJJA 2O7SA 1X7FA 3NA8A 1Y0EA 4RKAA 1RZMA 3CWOX 4Y96A 1DVJA 4N4PA 1QPRA 3CLMA 1DOSA 3OA3A 4XKYA 3LX9A 5C6MA 4K7VA 1FWSA 3I68A 4EIVA 2OZ0A 2VEKA 1T0OA 3NZRA 3EX3A 2A4AA 3QYQA 4AHPA 4NNBA 2J27A 3TSBA 1QO5A 3A23A 2VFGA 4O8RA 4DPPA 5AHIA 3SSJA 3TU9A 2RKXA 5F2MA 4R7JA 3PF3A 4UTTA 3R89A 4ORMA 3T78A 4X2RA 3W7JA 3ELFA 3IVTA 4UTTC 4LC6A 2WSQA 4GNJA 3FLUA 5T26A 3S6DA 1I8JA 4CLMA 1KFBA 1P5BA 2YW3A 1KTBA 1ME9A 4DQWA 1JRCA 4LRTA 1TV7A 2QCLA 4CNOA 2QJHA 3O16A 3RU6A 3RLVA 4IMFA 3NQCA 1B4KA 3MI2A 4MZ1A 3CEUA 5D04C 2B7OA 1V7YA 2DJLA 4LVAA 1KM6A 4MLRA 4W9TA 2OMAA 2J24A 2A6LA 4LVFA 4QM1A 2ZBTA 4FNTA 2ISVA 1LRNA 4K39A 3NXFA 2LLEA 4O54A 1ZAHA 1ZCOA 1VLWA 4IMDA 1W8SA 4JIPA 4I7WA 2ZZ4A 4EF9A 4UTUA 4O17A 2Y7FA 3GNDA 4B5NA 1VLIA 1SZFA 2X1RA 3MP4A 1YDVA 3BVJA 4GRSA 4XUGA 3TXVA 1KFLA 1K3UA 3UZ5A 5IM51 3LHUA 2E09A 4NX0A 1I2QA 3MHGA 1NVMA 4JTUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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