3TAOA

Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SRKPLIAGNWKMNLNHYEAIALVQKIAFSLPDKYYDRVDVAVIPPFTDLRSVQTLVDGDKLRLTYGAQDLSPHDSGAYTGDVSGAFLAKLGCSYVVVGHSERRTYHNEDDALVAAKAATALKHGLTPIVCIGEHLDVREAGNHVAHNIEQLRGSLAGLLAEQIGSVVIAYEPVWAIGTGRVASAADAQEVCAAIRKELASLASPRIADTVRVLYGGSVNAKNVGDIVAQDDVDGGLVGGASLDGEHFATLAAIAAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structural and functional characterization of Mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 99
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3taoA00
1KLZA 5IBXC 1DJNA 1FDJA 3HPZA 3DFTA 4OGZA 5DCEA 2NZLA 3LHWA 4RK8A 1ML1A 1LOSA 1LLWA 1LBMA 1XC4A 1K7XA 3C4UA 2W6RA 3O1NA 2A1YA 2JKEA 4RX0A 1NVMA 3TJXA 1ZFJA 4O12A 1GVQA 3N9RA 3G8EA 1R2RA 4HT3A 2CLKA 1JUBA 3OVPA 3BLIA 4YWIA 2QCCA 3GKAA 2WJZA 1QO2A 2QCNA 3NPWA 1N55A 4AF0B 2J88A 1R2TA 1FCQA 1YYAA 3DH7A 3FKRA 1SQ7A 1F5ZA 4JTTA 5HMSA 5DXXA 2EF9A 2H3DA 4O4WA 3PWAA 1AL7A 4PL2A 4WQ6A 4OQVA 1F74A 4NJKA 5IM51 3LM7A 5HWMA 1TYGA 1LM1A 3JS3A 4NUWA 5AHIA 3G1DA 2ZRWA 1TV8A 3DXIA 3O15A 3RMJA 3P7YA 4EF9A 3LCXA 3W72A 4IOTA 4MOZA 2BSLA 1SSGA 4KWWA 1D3GA 4O17A 2GJNA 3BK0A 3UD6A 1PCWA 1OJXA 4OV4A 3QH2A 2CLHA 2A5HA 4K8HA 2EKCA 5K4XA 1TPC1 2Z2UA 1PVNA 5U4NA 3HF3A 3P62A 1UUMA 4POCA 1OK4A 2P1FA 1DVJA 4XTDA 3G1AA 4Y90A 2YFNA 3TU9A 3D0CA 4WY0A 4UTKA 2V5LA 1QR7A 3C2FA 4LVGA 3TROA 2ZZ7A 3GLCA 2NXIA 4O1AA 5EKYA 1NFBA 1Z41A 1KFKA 1YTKA 3W1QA 3NQ8A 4UTLA 4LWWA 4NX0A 1QOPA 2TSYA 4PA8A 1H7PA 3P67A 5BNKA 3ABQA 3GKFA 4WOZA 5J5RA 5TBOA 3TMLA 1OX5A 3LB0A 3HGJA 4RKAA 1QPRA 3HJZA 5AHNA 3BW4A 3UYCA 2DZXA 2XN1A 1X8FA 4XQ6A 1OX4B 2A0NA 3QJAA 1KM4A 1C9DA 3P82A 4FNUA 1SR9A 3LRMA 2X16A 4JICA 2J6XA 3L5AA 4IMDA 4IPIA 1BEUA 4IUOA 4O13A 1B57A 1A5SA 1SO5A 5AHEA 2CLMA 4KWVA 3LOTA 4ZMGA 3HG2A 4JYFA 3BLEA 2F7FA 5K9DA 3PSWA 1J4EA 4RJEA 4XKYB 2NUYA 4NJJA 4DPQA 4EIVA 5AOUA 1PIIA 2PURA 5I3IA 3U8GA 3UXAA 2HTMA 4JYEA 2GOUA 5EA9A 4BI7A 3W7KA 2A6LA 3QZEA 4DO6A 3MBDA 5EMUA 1AMKA 4FNSA 3NQDA 2YXGA 3IIZA 3VFLA 3W6YA 2ZBTA 3UWYA 2BZNA 3SECA 3THQA 5I3GA 5D03A 3N34A 1KTNA 4GC4A 1VLWA 2R8WA 2TRSA 1YADA 3TC6A 3KRZA 1EPXA 2QCDB 2NXGA 3O16A 1JCMP 4PODA 2ZRZA 1IF2A 5F2IA 3DI1A 4QM1A 4XWUA 3T44A 1NSJA 4U28A 2O7QA 2C0AA 2R94A 2YW4A 3CWOX 4MIMA 3T55A 3NZ1A 4EF8A 3CIXA 1YDOA 3SI9A 4MZ1A 2WSRA 5G4WA 1TQJA 1DJQA 3CHVA 5AN7A 2FPVA 3FA5A 3IGXA 3M9YA 5EY5A 4UTMA 3A5VA 3A24A 3I7RA 4PH6A 5L9FA 1K7FA 4BR1A 3WJZA 3M6YA 5U7SA 1A5CA 3S5ZA 3CC1A 1NF0A 3PBUA 1OYBA 3FEMA 3ZS4A 1DKWA 2ABBA 3E49A 3W75A 2X1SA 1RD5A 2B7NA 3BG3A 3CWNA 3W7RA 3W85A 4CCCA 2VFIA 3EX6A 4M19A 5MHBA 3NL6A 5LHFA 1G7VA 3VE7A 4NJHA 3MHFA 3L68A 1OVDA 3W83A 1GG1A 3TK7A 4CQAA 2W79A 3TAKA 2TYSA 5HQEA 3UXDA 4ZQNA 3O6YX 1S5TA 3GDKA 1R2SA 1T99A 1TRIA 1H7NA 1BWKA 1JULA 2KZHA 2NWRA 3N14A 5D02A 1LRTA 1KV5A 4HPXA 4O54A 1OK6A 4HNNA 4FNPA 3L5MA 5I3FA 4ONVA 4LRTA 3DFOA 4CCEA 3GAYA 2PE4A 3LCGA 5C5YA 1I2QA 1TPH1 3NQFA 3BG9A 1YPIA 2FTPA 1DORA 3NDOA 4UC5A 5D09A 1T8XA 2YYUA 3NQ7A 3I7SA 1IXQA 3NQGA 3A22A 4LVBA 4ICNA 3DU0A 3HPXA 4Y6GA 4X2RA 4AWUA 1LOQA 4N6EA 2Z6IA 3LX9A 1ICQA 2FQIA 3W1UA 3FIGA 3MMTA 3NQAA 2OX1A 4JR5A 3TXVA 3TR2A 2CZFA 1FWTA 3M7WA 1T96A 1F2JA 3SR7A 3I65A 1UASA 1HO1A 3IV3A 5LSMA 3O07A 3I6RA 3USBA 3FS2A 4JTEA 2V81A 4XZ9A 1OG0A 2J9YA 3G0UA 3LXCA 4G1KA 1IXOA 2YFOA 3NL2A 3EX2A 4FEZA 3ELFA 3HG3A 3NA8A 3A5FA 3LI1A 5KZMA 3I68A 3G1YA 3VNDA 5LKYA 5K4ZA 2WQPA 4NJIA 3W87A 3DFNA 1LROA 3G1HA 4Y8FA 3LHTA 4A2RA 3TW7A 3W1RA 3HGSA 1H7WA 3IEBA 3Q2DA 1J2WA 4CQ8A 5CKSA 4OV9A 3HBLA 2QUTA 2DORA 4QQ3A 4YLWA 3TX9A 3P84A 4OBTA 4DF1A 2P0OA 1O5KA 4WJEA 3SJ3A 2G95A 1XBZA 4UTUA 5HINA 2J9ZA 3W1NA 4MLRA 4HNVA 2AQWA 3G1SA 1TPB1 3W7CA 3GDMA 2X30A 3MI3A 4ZQOA 3B0VC 5SWUA 2DZSA 2WNNA 3ZFHA 4FNQA 4P61A 4A22A 3W7JA 2FFCA 3QF0A 4AWTA 5J5DA 3TA6A 1G4TA 3V75A 1SZNA 1JCYA 4E2BA 4N9BA 1V7YA 4AHQA 1VRDA 4UFJA 4K37A 1H7OA 1ZCOA 2ZQ0A 3KRUA 3PC0A 3IIPA 3LCWA 3TFXA 3O06A 3G1XA 4JN6A 1K8YA 1WDWA 1ZENA 3GR8A 3TIMA 1LP6A 1FCVA 3MYPA 3IGSA 5D30A 5KZEA 3PBYA 4N9EA 3S42A 5D2TA 1LORA 1IXPA 3S5YA 3L21A 2ABAA 1JQXA 1HG3A 1ZAJA 4TU1A 4XTIA 4BWLC 1ZY9A 1KFEA 2E77A 3JRKA 4TIMA 4UCGA 3TW6A 4AF0A 7TIMA 3EXRA 4AVFA 1ME8A 4CLMA 3C52A 3TNOA 3NQEA 3PS7A 4NZFA 5ABTA 2QCGA 2Q3RA 1XKYA 2YPIA 3N73A 1OFAA 4HKPA 4BFAA 1OFDA 5CZTA 1FDYA 3S1VA 5G1YA 5FEXA 1G4SA 4CNPA 3NZRA 4O1DA 1DV7A 1VH7A 2VEKA 1X7FA 1W56A 3AO0A 2QUUA 3R8RA 3LHZA 4ADSA 4UTWA 1AK5A 1QPNA 4TR9A 1ICPA 3O6CA 3NYZA 4JTHA 3B05A 3GAKA 5DELA 4HSNA 3KX6A 3BARA 3THAA 2JKAA 1VJIA 1QCWA 1QWGA 3G22A 4R34A 4C1KA 1P0KA 3W7OA 2YW3A 4K7YA 5CZ0A 1SSDA 3C2RA 5FEWA 1WBHA 3W7LA 3AJXA 3LV5A 1PS9A 3LHUA 3E96A 4E38A 3W07A 1I2NA 1TPUA 4M6QA 1OABA 3W7NA 3NPUA 4UFLA 1JR1A 2A4AA 1W3NA 2BLEA 4UTTA 3ABRA 4H4IA 1VR6A 3INPA 1H7XA 1OX4A 3ZWSA 3M5YA 1LTDA 1SZFA 1XUZA 4PC8A 3UPBA 1M7OA 4RXFA 2B7OA 1GJPA 1QNVA 3TMQA 5KITA 2W0UA 2FIQA 4DO5A 4M6PA 1B3OA 3TQKA 4NVTA 3TCEA 1GTHA 1PCKA 3OA3A 3T7VA 1KBIA 1PL9A 4UR8A 4XKYA 3IVUA 2JBMA 3C0JA 3R13A 2EAWA 4JY8A 3CQ0A 2V2DA 4L4LA 5AYYA 5IBXA 1WOAA 1H7RA 5LNUA 2ZFAA 1SW7A 3LTPA 3Q58A 4FB7A 2B7PA 1LCOA 1I2OA 4NJGA 4LRSA 4DO4A 2FLIA 1S3HA 1ZAIA 3TQ0A 2RFGA 1TTQA 5C2XA 4AAJA 1SO6A 4L4MA 3HMJG 1IGSA 1W3IA 3WJYA 3SW6A 4LT9A 4IMGA 4GRSA 4ZQRA 3EX1A 4IQLA 1TO3A 2OZ0A 3KHJA 3P60A 1Q45A 4Q32A 3W1PA 1KFJA 3M1ZA 3B8DA 1LLZA 4H6KA 1XDLA 1TPWA 1WXJA 3M43A 1UUOA 4IJBA 3PM6A 3TKFA 1Q6OA 5G1TA 1Q3NA 5CPMA 2DZPA 2E5DA 2EGZA 1MEWA 2Q3OA 4M6VA 1LZOA 1D3HA 2YDAA 2FB2A 3QMRA 4LS2A 5AB3A 3LBMA 2VEMA 1DL3A 3LTYA 1T0OA 1IXNA 5DBTA 3O63A 1HFBA 3ATYA 1BKSA 4PEKA 3LDVA 3NQ2A 1PHQA 3HOJA 5EBUA 3NQ6A 2V82A 1C8VA 5CSRA 3M5XA 1F7BA 2VFGA 3L2IA 1EWDA 3SSJA 3BLFA 1GWJA 1EB3A 4I9AA 1ADOA 1JCLA 3W2KA 3TUUA 1EUNA 4NNCA 2E6FA 3H53A 4QIUA 5HUOA 3NQVA 4MYXA 5HUPA 1PV8A 2LLEA 3Q94A 1GT8A 3DENA 5K9XA 3T40A 1YDNA 3P61A 3S6DA 2V2HA 2GJLA 3SZ8A 1G6CA 3GNDA 2Q8ZA 4JTLA 3SGUA 5DBUA 3CB8A 3DKLA 3HPSA 4GE8A 4K7VA 5LNWA 3EB2A 1WQ5A 1TSIA 4NT0A 4AMAA 1GVSA 2RDWA 2GQ9A 4UFKA 2OT0A 4DF2A 1N7KA 1QFEA 3IVTA 3RLVA 4S2CA 1KTCA 1VCGA 4A3UA 3W7PA 1H61A 2BXVA 1VC4A 2QKFA 4M7TA 1SW3A 4YMZA 2QCLA 4UTIA 4LUJA 3EX3A 5E1QA 4UNKA 2I14A 2V8ZA 5H91A 3H55A 3MUXA 3PVFA 3OIXA 2FPTA 3W1AA 3W7DA 4UUIA 3RLUA 1WYIA 4ML9A 5F1VA 2CZDA 3EKZA 3S9YA 3GK0A 1GEQA 4JDYA 2C19A 2QUVA 3JR2A 1ZAHA 5AHMA 1O60A 5HJLA 3KFTA 4WUIA 4IWWA 1KM6A 3VI2A 3ZWTA 3BG5A 1K3UA 1KM0A 4AHPA 3OVQA 3HGRA 1GVRA 4Z0JA 4UMBA 4JDBA 4ORMA 2RDTA 3G1FA 3LCIA 4GFSA 2CLOA 4LS0A 1ME7A 1ZJIA 1AG1O 3W2LA 4UNLA 1Q6LA 1DBTA 3CEPA 4XBKA 1LRQA 3BGJA 1ZHAA 2H8XA 2Y7FA 3DHDA 3UY8A 1VYRA 3W1MA 3NPVA 3A21A 3M0ZA 2E1DA 2RHGA 2QJGA 4RR4A 4O28A 2ZDRA 2WSYA 4CQ9A 4GWEA 3P5YA 2H6RA 4K39A 3HGOA 5AYXA 4AEOA 3S5NA 4LC6A 5F4SA 2GQAA 3GDTA 4O50A 4GUJA 3QPYA 3LBCA 3BW2A 4FXSA 5E0KA 3UZ5A 1GG0A 1I2RA 3RK8A 4Z08A 1TCDA 1MEHA 4JXCA 1K7EA 2C6QA 4NXKA 1SO3A 2A7NA 3TH6A 3ZR4A 1VHNA 3LHYA 1W37A 2VFHA 1CI1A 4Q4KA 1SPQA 4O8RA 4UMAA 4YCOA 3NEVA 3IVSA 3M41A 3PUEA 1TRDA 1KM1A 4FNTA 2CLEA 4AWSA 2NX3A 1M7PA 1I2PA 3KVKA 2Y62A 4BI6A 1DQWA 2H3BA 3W9ZA 2D73A 5FEPA 2GVGA 3MI2A 3F1QA 4Z1DA 4R33A 2QCHA 1RR2A 5DY2A 3QEZA 1BTMA 3PAJA 4CCDA 1MEIA 1DOSA 2E6DA 3PR2A 1XXXA 5FF7A 5CG7A 1UB3A 5F4WA 1J5TA 3UNDA 1ALDA 1FWSA 2RH9A 3LLDA 3EWWA 1FQ0A 3KOFA 1RQHA 1L2UA 2E5BA 3EXTA 2J27A 4BF9A 3TE9A 1RVGA 3UWQA 2VC6A 3WK0A 1FXPA 1W0MA 3R2GA 3QFEA 5KZDA 3W7MA 4GUGA 2QJHA 3ABSA 1H63A 1EWEA 1DHPA 3NPXA 4TX9A 3CPRA 3GYEA 4FF7A 1JJKA 5K2ZA 4MFDA 3U6WA 1Z44A 3KVLA 3EWUA 1CX9A 1TPDA 3PY2A 2HS6A 4RXGA 1W54A 2AAMA 3QMSA 1U83A 2C18A 2Y88A 3LLFA 4IXHA 5KTLA 3G0SA 3MYOA 4DELA 3WK3A 2BWGA 3M44A 2HMCA 4O57A 1XDMA 5DLCA 4OT7A 4GUIA 3PBWA 3S8HA 4JX6A 1A5BA 3S1XA 3MP3A 2Y63A 4MUZA 1ME9A 3QC3A 1KA9F 1Q6QA 5G2HA 1JUKA 5F2MA 4JD4A 5TIMA 1LBFA 4YXGA 3GVGA 1MO0A 4AH7A 2QCMA 1N8FA 4QNEA 5CPOA 4TO8A 1M5WA 3G18A 3HG5A 1TQXA 3UQNA 3GB6A 4JS3A 3DFSA 2YCEA 1ZALA 1XM3A 1FY6A 4QAIA 3PF3A 1EIXA 4O1CA 1H1YA 3DHFA 1AW1A 1FXQA 5CGQA 5CZJA 3L0GA 5I3JA 4N6FA 1VYPX 3G0XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KRU A;  1KLZ A;  4MAV A;  1FDJ A;  1ZSX A;  4UQA A;  3FK4 A;  3EDK A;  3N6J A;  1HF6 A;  1A80 A;  3LHW A;  1J10 A;  1YIX A;  1LBM A;  1XC4 A;  4L6D A;  2JKE A;  1MNZ A;  1ZFJ A;  4J27 A;  4HCL A;  3N9R A;  4KCV A;  3L4V A;  4ZXL A;  4I9J A;  4YWI A;  3QV7 A;  2G4J A;  2QCC A;  4AF0 B;  2QV5 A;  3GW3 A;  3SAZ A;  1R2T A;  1FCQ A;  3WNK A;  4RE2 A;  2WCS A;  1PYF A;  5DXX A;  3VGF A;  4PL2 A;  1AL7 A;  4ZR8 A;  4OQV A;  4NJK A;  5HWM A;  3MT1 A;  1LM1 A;  3ZJ8 A;  1XH2 A;  4MSS A;  3DXI A;  3W72 A;  4PMX A;  4QDW A;  4KWW A;  5BYW A;  1TVN A;  2GJN A;  3BK0 A;  3BSH A;  3PZG A;  3QH2 A;  3JW7 A;  2Q09 A;  4GX8 A;  1TPC 1;  4TOQ A;  3PFM A;  3P62 A;  2PDC A;  5HAT A;  3WEL A;  4Q8T A;  1HP4 A;  3D0C A;  4URI A;  4X0V A;  3C2F A;  3GTH A;  1Z41 A;  3LA4 A;  2PWF A;  1QOP A;  1X6N A;  2TSY A;  4OOU A;  1BYB A;  3P67 A;  5CJN A;  2R82 A;  4AD2 A;  1OX5 A;  3LB0 A;  3H12 A;  3BW4 A;  2E3Z A;  3UYC A;  3RIT A;  4D6I A;  2VZO A;  3BAI A;  1ECE A;  2QGY A;  4A8L A;  2BAS A;  4GYP C;  5JU6 A;  1M53 A; 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