3IIXA

X-ray structure of the fefe-hydrogenase maturase hyde from t. maritima in complex with methionine and 5'deoxyadenosine
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
MTGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKICVFEKDTACIPVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Adomet binding protein
molecule keywords Biotin synthetase, putative
publication title Unexpected electron transfer mechanism upon AdoMet cleavage in radical SAM proteins
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 141
structure length 344
sequence length 347
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3iixA00
3QPYA 1SSGA 1S3HA 3BG3A 2A85A 2BX7A 1PIIA 1FQ0A 3TNOA 4Z08A 4WZHA 1G7VA 1R47A 3PVFA 1KLZA 2ZA1A 4UMAA 3CWOX 4GC4A 2H90A 2E6FA 4L4LA 2QCDB 4JX4A 3W71A 4UTKA 1C29A 4LVDA 4GUJA 4JNMA 2JGQA 1JCJA 1NAL1 1AK5A 3EWWA 3FJ6A 5DCBA 1VRDA 1SZNA 1Q3NA 4O50A 2Y7EA 3TQKA 1TV5A 3SIZA 1J4EA 1FCVA 1KM0A 3UYCA 5AB3A 3MBDA 3EX2A 4JTSA 4JY8A 4R7JA 3B06A 5J5DA 5G4WA 2NXGA 3NL3A 1DJQA 3PBWA 3STEA 4O0ZA 1OABA 3G18A 3GXNA 2ZDRA 4MPQA 2E5BA 1VHNA 3RNDA 2YXGA 4HPXA 1O60A 3M7WA 2J6XA 2BSLA 2H6RA 2BLEA 1OG0A 1ADOA 4E2BA 4AHQA 3PG9A 1K03A 2C19A 4WXYA 4WX2A 4BI5A 1FUYA 4A22A 5K4ZA 3LGEA 4ADTA 3MMTA 3R2GA 3S5ZA 3BG9A 2ZZ2A 3DHFA 3UWZA 2E77A 3TC6A 3QF0A 4UTHA 4YWIA 3A5FA 1YYAA 1OX4A 2Y61A 3S5OA 2WV8A 1MEWA 3L21A 4JYDA 1FBAA 2FB2A 2Y6ZA 1X1OA 5EBUA 4RZ5A 2C15A 3TAKA 1TPDA 3MI2A 4Y6GA 1YDNA 3N14A 3P81A 3DZ1A 3PM6A 2KZHA 1VCFA 3UWUA 1TTQA 3A9IA 1KBJA 4O52A 3W2MA 4O14A 4IJBA 3MHUA 4ADSA 1VH7A 2DZSA 1P4CA 3G8RA 3ZFHA 3N2XA 3G3DA 1GEQA 3W1XA 3FKKA 1VLIA 3PSWA 4DQWA 3W7JA 3W1LA 5DY3A 4DBEA 2YR1A 4I7WA 3U6WA 4ADUA 1Q6OA 1JUEA 1Q6RA 2VFDA 2GQ9A 1QO2A 1FWNA 4LNYA 1DQWA 4PC8A 4R33A 3CPRA 4QITA 1KM6A 2NX9A 3NPUA 3HPXA 1PL9A 4QIUA 1KTCA 1K8ZA 1D3GA 4W9TA 4EF8A 1EIXA 1VC4A 2OT0A 1JQVA 4DO6A 2CLLA 3FYPA 3TFXA 3NQ2A 2DP3A 5U4NA 4QQ3A 3I7RA 3KOFA 3W07A 1JUBA 2QDGA 2EAWA 3ABQA 3LX9A 2E09A 3O63A 3T78A 4C1LA 2VC6A 4IOTA 3NOEA 6TIMA 5CPOA 4QJ1A 1WBJA 1C9DA 3C0JA 5F2LA 1SR9A 1WXJA 5FF0A 5F2IA 1TYGA 3P74A 1A5CA 2ATMA 4M7TA 1VZWA 4PCFA 4AWUA 5C2XA 1G4PA 5DXXA 4NZJA 1YXCA 1H7NA 2NXIA 2VEMA 1XI3A 4ZQOA 3LRLA 5G2WA 5D33A 3W7PA 2ISSA 3GDRA 1TPB1 2E5DA 5FEXA 3W74A 1LBMA 3W1RA 3HG5A 3TR2A 3DI0A 4UFHA 4K6AA 4GRSA 1B57A 4HPJA 3W1UA 2FJKA 1Z41A 2QAPA 1JCYA 1YPIA 1BWLA 4FNRA 3UY7A 3IRDA 3LCHA 1OFAA 4H6KA 5CSRA 1M6JA 4R53A 3SFKA 2ZRUA 4IXHA 5FEZA 3SSJA 3EKZA 4FHAA 2CLFA 3CB8A 3GNDA 4RXGA 4WXZA 5K4XA 1UASA 4AHPA 1P1XA 4HNTA 1TJPA 5CSSA 3SY5A 3NNTA 2E1DA 3MI6A 1DV7A 4MIMA 1SO5A 1IXOA 1KFLA 4ZQCA 3VFLA 4AF0B 3PY2A 1G4TA 3C2VA 2I14A 3GB6A 4O53A 3B4UA 5FF4A 1QAPA 4UCGA 4PEKA 3UY8A 3TSDA 3K30A 2ZRYA 1V7YA 3PS7A 4XUGA 3IIZA 4CQ9A 4E2DA 2V2CA 3UPBA 2FPTA 3L9CA 3DFQA 4TMBA 8TIMA 4BWLA 5CPNA 3C6CA 3MP3A 3EWYA 2Y85A 5D32A 1B4EA 4ZZ9A 1ZAHA 3HMJG 4YLWA 1UUOA 3BLIA 1PV8A 3VE9A 2OMAA 4KKXA 5HQEA 3LXBA 1KV8A 2NUWA 3CT7A 4FXSA 3LXCA 5AHFA 4IWWA 1XUZA 3TE9A 3T4CA 5IBXA 3T44A 2NWSA 4NXKA 3EXSA 4ONVA 1KM2A 2NXHA 2B7PA 3S42A 4S2BA 2H8XA 2Q8ZA 4X2RA 3DFPA 2NUXA 3KVMA 1JULA 3GNNA 1SQ7A 5LHEA 2WQPA 4TO8A 3MW7A 4CNOA 4EWND 2YFOA 4Q33A 1OX6A 2ISWA 5CPLA 3G22A 1EA0A 4PH6A 1H50A 4LRSA 1GVSA 4O57A 4WOQA 2Y70A 4O16A 1AW5A 3EX4A 4J9JA 4DPPA 3FA5A 5D03A 1FDYA 4MLJA 2NLIA 4HSOA 3LHTA 4DF0A 1JCXA 2BXVA 3W2JA 3MYOA 2QCCA 2VEPA 1VJIA 4JN6A 1OYBA 3H53A 5EY5A 4NVTA 1XDLA 5FEPA 4JXCA 3HO8A 1ZCOA 3UWVA 1B3OA 5FF2A 1L6YA 3IEBA 3NPXA 1H1ZA 1VYRA 3PSVA 1GZGA 1W5QA 2ZFAA 2JKAA 2GVGA 2YYUA 3GIYA 1A50A 2QF7A 2OCZA 4RXFA 4UFKA 3W87A 2HS6A 4AVFA 2X1SA 2QJIA 2WSYA 1UCWA 3G1XA 3P60A 2CFFA 2CLIA 3MWAA 4HNVA 5J5RA 4ZQMA 5CZSA 5G5IA 3F4WA 3JS3A 2H3BA 4AF0A 2W6RA 4JTEA 3FFSA 1VHCA 1DHPA 4UFIA 3HIJA 1LBFA 1UUMA 4GNJA 3TIMA 4NUWA 2E6AA 5D38A 1KV5A 1K7XA 1KFEA 3RFAA 1W3TA 1GVFA 2FTPA 1OF8A 3TW6A 1VYSX 3QZEA 2YDAA 4M5PA 5HWNA 3TQVA 1O95A 2EF9A 3NQ8A 1FWTA 3R13A 3E12A 2YSWA 5KZEA 1AW1A 4O1BA 1XUUA 5CGQA 2Q3RA 4QISA 3NQ6A 1BTMA 4MLRA 1GVOA 2ZBTA 3WK0A 4O0KA 3OVRA 3LHUA 1Q45A 3OHIA 5D2WA 3HGJA 5CZJA 4AH7A 2NUYA 3L68A 3DKLA 4QM1A 1H7WA 3EXRA 3NXFA 5CKSA 3W22A 4HSNA 3R89A 4IPJA 5AYZA 1YDVA 4PA8A 1QDSA 1LROA 1KM1A 3A24A 3AO0A 4K7VA 1ONRA 2A7PA 3H54A 3TCEA 4O28A 1I2NA 1ML1A 3OA3A 2Z6IA 1VCVA 3MP4A 1QO5A 3W72A 3MYPA 3LI1A 3LRKA 1EEPA 3W73A 4CNPA 3G3MA 3F4NA 3STCA 1I2PA 3NEVA 3NL6A 2FFCA 2A6LA 3GKFA 4LUJA 1C8VA 1IF2A 1G7UA 1L9WA 1KFCA 1OFQA 3HB9A 5BOOA 4UTWA 3L0GA 2RFGA 4WY0B 3O05A 1LP6A 4HT3A 3V75A 3NM1A 1D9EA 4HNNA 3I7QA 2Y7GA 3TA6A 1R2TA 1M5WA 1LM1A 3DI1A 1A5BA 4IX0A 5HWJA 4AAJA 4Z1CA 2ABAA 2O7QA 3WJXA 4UTUA 4PTNA 4LT9A 3NO5A 4KFNA 3VI2A 3KFTA 3WJZA 4O18A 1FWSA 2G95A 4RZ4A 3CU2A 3TDFA 3M5VA 1T0OA 3HQ1A 4OWGA 2RH9A 1XCFA 3SGZA 4CCCA 3TH6A 3M44A 1EB3A 3CWNA 4Y9AA 3O1NA 3PBUA 3EX1A 1SW3A 1HFBA 3P5YA 3LCGA 4WY0F 2HSAA 2TYSA 3MP5A 1WAUA 2JBMA 4N02A 3DAQA 4O4VA 1SFJA 2WSQA 4O54A 1S5VA 3OVPA 1MZHA 4GFSA 3N73A 5DXYA 1XM3A 3M6YA 1XBYA 5EYWA 4UTTC 3I6RA 4O15A 2VEIA 1TTPA 3KHJA 4LTSA 2ATSA 4NJKA 1D3HA 4UIOA 2B4GA 3GX9A 4KWVA 3W70A 4YL2A 3RU6A 2Q3OA 3R12A 1T8XA 3LHZA 2XFWA 2R8WA 4FXRA 4MJZA 1F6PA 4MFDA 3DFSA 2ZA2A 1YXDA 3B03A 1SW0A 3L0KA 4WD0A 1FCBA 3QMSA 4AB4A 4AEOA 3OIXA 1ZALA 3UZJA 4QAIA 3IIPA 2YW4A 1LCOA 2AQWA 1W37A 1Y0EA 1IGSA 1OVDA 4Z0JA 2D73A 3T7VA 2FDSA 1VQTA 2XN2A 4UTLA 4AHOA 5T26A 3HGRA 2FB3A 4GUFA 2WO5A 3M5YA 3IIXA 3NM3A 1K7FA 4M19A 2HMCA 4ML9A 2B7QA 3W83A 5KSWA 5C54A 1R46A 1LOSA 3LTSA 3WJYA 5LNRA 1K02A 3W7QA 4LS1A 1KFKA 5EL1A 1EUNA 3BW2A 3Q94A 4Y90A 4LUIA 4TX9A 1KLYA 1FDJA 5KZDA 4UTMA 5I3IA 1WX0A 1LRNA 4UXDA 1RR2A 4JS3A 3L0NA 3QEZA 4BI7A 4C1KA 1LZOA 3DBPA 5D2TA 1O5KA 4LV4A 1DORA 2YPIA 2ZTJA 4QNWA 3STGA 5K9XA 4HKPA 4D2JA 1OYCA 2WNQA 3NDOA 3KAOA 1H7RA 4JTFA 1RQEA 5AYXA 1TPEA 1W5PA 2YCEA 5HUOA 1GYLA 1W56A 2QUVA 4FNSA 5BNKA 3PBYA 2YFNA 1ZFJA 3NL2A 4M6VA 4H4IA 2Z0IA 4BFAA 3QC3A 4XWUA 5HNRA 1VGAA 3P7YA 3TK7A 1GOXA 4P61A 1EPXA 2RKXA 3RLVA 1F2JA 3TV8A 3PBVA 1DKWA 3TFCA 3EWUA 3C2OA 4GUGA 5D02A 4YMZA 3T40A 4LRTA 2Y63A 1AG1O 4JTHA 2J27A 3LCLA 2ZYFA 4PL1A 1TIMA 2JGYA 2R91A 3BK0A 3PF3A 4N9BA 4AMAA 1GJPA 3W84A 2DZTA 3W1QA 3TXZA 2EKCA 2J9XA 1KBIA 4N6FA 1L6WA 4UTJA 3P80A 3UWQA 2GUUA 4UFMA 3NA8A 1OFRA 2Z1BA 3IVUA 3BO9A 2GJLA 2I9EA 1F76A 3GR7A 4UUIA 3W6YA 3ZWSA 3Q2DA 3S9YA 2ZTKA 3ATYA 2G97A 1KTBA 4DELA 1HTIA 3STFA 2HTMA 1N7KA 1NF0A 4XBKA 1QPQA 3E0IA 5KMYA 1RD5A 2QCDA 3AJXA 4FNUA 2J24A 4FIQA 1Z44A 3HGOA 2W0UA 1PS9A 3LLDA 3INPA 3VCRA 5LGXA 2YYTA 4OGZA 2GOUA 3W2NA 2VFIA 2QUTA 4IXXA 1FXQA 4LS2A 1OFPA 4GJ1A 3W7LA 1JQXA 3LHYA 2VKZG 2NWRA 3LV5A 4RLIA 4FB7A 1L2UA 4X3ZA 4A21A 1W31A 2CU0A 4MOZA 1QMLA 3B04A 4MY8A 1SFLA 1TO3A 4JYFA 1YDOA 3SI9A 3O6DA 4DXVA 4BR1A 4JTJA 2G5WA 4ZQPA 3GR8A 2CLOA 1K7EA 5F1VA 3THAA 3LCIA 3M5XA 2QCNA 3WK3A 1JVNA 1DL3A 4IMGA 3C4UA 3E02A 1ZY9A 1G4SA 3NL5A 1I2QA 3LM7A 4DO5A 2C14A 1EWEA 4EOUA 4YCOA 5I3JA 4WUIA 2QR6A 1Z48A 4NJJA 1XC4A 4PODA 4UTIA 4O1CA 3CEPA 3MHGA 2A6NA 1X7FA 3G24A 5K7JA 3FOKA 1ME7A 5CG7A 1MO0A 3WK1A 3G1SA 3GDKA 1LORA 1OK6A 2BTMA 4FO4A 2A5HA 3MBFA 4GWEA 4FNTA 4U28A 1J2WA 1A5SA 2VFHA 2B7NA 4JICA 3VNDA 5CZTA 4L4MA 3UWWA 2LLEA 4XTDA 2TRSA 2CZDA 3NQMA 1AL7A 3TMLA 3UD6A 2QKFA 1PCKA 2GVLA 2J9YA 2JKPA 2CZFA 4FX6M 1WBHA 3LCFA 2VFEA 2JKEA 2QDHA 1WOAA 3MHFA 3W7HA 2UV8G 5KINA 1DJNA 4OU1A 2JK2A 3TJLA 5BW6A 1DVJA 3BARA 3KX6A 3IVSA 4JD4A 2C16A 5FF7A 4IPIA 3ABOA 4Z1AA 1EP3A 1FCUA 3I7SA 3EB2A 2V8ZA 1TRIA 1RVGA 5D37A 3BG5A 4K36A 5LZLA 1SO4A 1W5OA 1TREA 4M6QA 1DBTA 1HO1A 2VXNA 1DOSA 1SZFA 2HS8A 3GYEA 4OBTA 2X1RA 2PRMA 1SPQA 4A2SA 4ICNA 1KTNA 4CNNA 4O1AA 5TIMA 3QMRA 1SZGA 1GT8A 1TJRA 2CZEA 4UR7A 3SJ3A 4DO4A 3A5VA 1QR7A 1JCMP 3DENA 3P8JA 4K37A 1OFOA 1EX5A 2NV1A 2YX0A 2E68A 4MZYA 3O07A 3A21A 4POCA 2R94A 2Y7FA 3OEXA 3ABSA 2A0NA 2ZZ3A 4MFEA 3ZS4A 2DORA 1BKSA 1TPVA 3PG8A 2Y7DA 1VPXA 3QJAA 4K8HA 2QEZA 1DQXA 5C6MA 1TB3A 3L5MA 3BVJA 2TPSA 4UC5A 2X2GA 3SGUA 1GVQA 3U8GA 1YTDA 4LOCA 1XFBA 2VOMA 4RV8A 4O1DA 1H1YA 4HIBA 3B0UX 2DU2A 3Q37A 1W0MA 4N2YA 2FQIA 1M7PA 1IXPA 3FIGA 3PWAA 2ABBA 3GXTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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