2GK1 | Genus

Total Genus 8

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	8
sequence length	52
structure length	52
Chain Sequence	LWPWPQNFQTSDQRYVLYPNNFQFQYDVSSAAQPGCSVLDEAFQRYRDLLFG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Beta-hexosaminidase subunit alpha
publication title	Crystallographic Structure of Human beta-Hexosaminidase A: Interpretation of Tay-Sachs Mutations and Loss of G(M2) Ganglioside Hydrolysis. pubmed doi rcsb
total genus	8
structure length	52
sequence length	52
chains with identical sequence	C, E, G
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2006-03-31

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2gk1A02
3.30.379.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Chitobiase; domain 2	Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like	2gk1A01

1WB0A 4UQ9A 3ZIZA 1FHLA 2XG9A 1OINA 2ZX5A 3B8SA 1VAHA 4FMVA 3ARUA 4OJYA 1GOIA 4D6GA 4WIWA 1NOFA 1W2VA 2G3MA 5E6YA 4MNMA 1KB3A 1JIBA 3AIEA 2AMGA 1K6AA 2JIEA 3WL1A 4QCEA 1MW3A 5IFPA 1N82A 2WW5A 3L2LA 4J3XA 5TD4A 1SMDA 1VF8A 3WNMA 4B16A 1AMYA 1ZL1A 1CTNA 1RP8A 4W8AA 1UWRA 2WVSA 3UEQA 1E70M 4EE9A 1L0PA 3N17A 4OOZA 4QLKA 4EK7A 1MQQA 3CBWA 1UH4A 3BCFA 2VOTA 4HA1A 1E0VA 1V6VA 1J12A 4MNJA 2OYMA 1V08A 2VZOA 2DSUA 5JBDA 2EQDA 4JFUA 4NZCA 1UD5A 3ARWA 1HJSA 1FOBA 4HZ8A 2GJRA 4UFHA 1A3HA 2E9BA 4HMEA 3ZSTA 2D1ZA 4JL2A 3UG3A 4CCDA 5A8QA 2VRQA 2FHCA 1Q6CA 2DT0A 2ZOXA 1HIZA 3U5YA 4DWSA 3L4TA 1UA7A 1OM0A 2XVGA 4PMVA 1E4LA 3BSGA 4HA4A 3IANA 4IPLA 2ZUMA 3M46A 4PBGA 1MW1A 1ZJBA 3AIUA 2YA1A 2ZUUA 3K4DA 2EJ1A 3CUJA 2E9MA 4N42A 1UKTA 1PIGA 1V3KA 1ZB5A 2D3LA 3ZOAA 3ZQ9A 4AEFA 1PAMA 3VIJA 3WL0A 4NRRA 4D6EA 1NARA 3FHQA 3OIHA 3VDCA 3PZTA 3SCVA 1P6WA 1NWTA 2VRJA 2Y2WA 4P8UA 3AIRA 3AXIA 3WELA 2J79A 3WDHA 4FLSA 3WEZA 5I3DA 1W3KA 1GVYA 3N11A 5I2UA 1ECEA 5CZKA 3WD3A 3WH7A 2W63A 3ZT5A 3MO4A 2GFTA 2WMIA 1VJSA 3VIHA 2CBVA 2ESCA 3GXIA 5F7UA 3N04A 3SEPA 3W53A 1V6XA 2Y8VA 5E70A 4UZUA 1R87A 1GQLA 4J3SA 3N9KA 3UG4A 4MDPA 4Q22A 1A47A 1J0HA 1FP8A 1DWIM 2XWEA 1G9HA 2QPUA 3DHUA 3DYPA 1GUVA 1C91A 1DWJM 1NOUA 5A8PA 3L4XA 3ZJ6A 4D71A 1Z32X 3EMZA 1XV8A 1H0GA 2YBTA 1JNDA 5EB8A 4H7VA 1GOMA 2W67A 4OBSA 3VX1A 4P7OA 1GQJA 4J7RA 2WXDM 2YLAA 1UR4A 5CSYA 1EDTA 2V38A 3BCDA 5AYBA 3MUIA 3CUGA 2WMFA 4C7FA 4GO9A 4BQ4A 2D3NA 3GDBA 1HJVA 1J11A 1UD8A 2GDVA 1H1NA 1E4NA 3ARVA 2IXUA 1L8NA 4P8WA 3VO0A 1CZ1A 1NWRA 1CENA 1V0MA 1ZJAA 3I3BA 2BS9A 2WANA 3DYMA 2XWDA 1E1EA 4Z2IA 1G1YA 2Y24A 2XFFA 3WH8A 1XHGA 1PZ2A 9CGTA 1BYBA 1Q6DA 1WZMA 4P8XA 3PN8A 3ZJ7A 1ISVA 4PMQA 3VIPA 4Z2JA 3RJXA 4PMYA 8A3HA 1E56A 5I79A 1CXEA 1QI2A 3L4YA 3W6LA 3WY1A 2XIIA 1VB9A 3VOCA 3WF1A 1QBBA 2VNCA 4XZWA 4LGXA 3RIKA 1UD4A 3CIVA 3L4VA 2E9LA 4TTGA 3BSHA 3FXYA 3WMSA 4A4AA 4NSBA 4R5EA 3IAPA 3I3EA 3F4VA 1PBGA 2DT2A 3GBEA 3PZVA 3WF3A 1JDDA 1HKJA 4ATDA 4PTMA 1BAGA 4W88A 1ESWA 1JFHA 3WNLA 1K9TA 4DM2A 4M8UA 1DWFM 2J7BA 5IXEA 2GJXB 5HXMA 2PWFA 1UWIA 3VGFA 2WWCA 4AD2A 2FDMA 1V6WA 1XD1A 4TVDA 5A6BD 3MUZ1 3A6OA 2DPEA 2WC7A 2ZIDA 3HJEA 1LWJA 4D1IA 4BS0A 5FOOA 4ACZA 1GJWA 2JE8A 1GZJA 5BXSA 1G5AA 1QNPA 1R8LA 4F8XA 4CGTA 3OLEA 4UOJA 3RDKA 1AQMA 4R27A 4W5ZA 1CDGA 1B3WA 2DSWA 5EBAA 4CVUA 4CCCA 1ITCA 2XM1A 1OGSA 1E72M 2XVLA 4UQDA 2C8NA 5A6LA 3W82A 2FGZA 3CZGA 3MS8A 3N13A 4B3LA 1W91A 5CGMA 1W3JA 1E4IA 4X0NA 5D8ZA 1B3VA 1MWOA 2WVVB 1W9VA 3WQWA 4MB3A 1GCYA 3CPUA 3GNRA 2WZEA 2J7DA 1EA9C 7A3HA 4UFIA 1XSJA 5ECUA 3WQ6A 3PZIA 4JKMA 1QI4A 4W87A 3WF2A 3AJ7A 1H09A 3RM4A 3AICA 2J8GA 2D0FA 4DUVA 4JFWA 4W8BA 1KXHA 3O2LA 1QW9A 4YPJA 1K9EA 1UA3A 1TMQA 1OD0A 4CCEA 3U57A 1CEOA 4LYRA 3AHTA 2UY3A 1V6YA 1BVNP 4D72A 1H3GA 4MNLA 3DHPA 2IUZA 1RPKA 2XSAA 4MJ4A 2BVDA 1C8YA 4AZGA 5AY7A 4EANA 3VGBA 3AZRA 2XTKA 2IXVA 5A2CA 1XC6A 4JKLA 3BLKA 2GDUA 3CUHA 1FHDA 4KGLA 3PZOA 4JCLA 4J27A 1GVIA 3AZTA 1UZ1A 2V3FA 1V03A 4J3UA 2W5FA 2YBUA 1K9FA 2BHYA 2YDSA 1QNOA 3VINA 1PJ9A 1VBUA 5AYIA 1GQIA 4HPHA 4WF7A 3AMKA 3DYOA 1JXKA 2OWWA 3UR8A 2XIBA 2CCRA 4JFVA 2CHOA 3SCWA 3PZMA 1BG4A 2QMJA 3M7SA 3VDAA 1UR0A 3GXDA 4M81A 1XH1A 5I23A 2QPSA 1EIBA 1H41A 1JFXA 2ZUSA 2VL4A 1DEDA 1QI0A 3WDIA 3UG5A 1TR1A 2PF0A 5HPOA 4W89A 4PMDA 1KGXA 4CN6A 4Z2HA 1VFMA 3OZPA 3VNYA 3O9NA 1HKKA 1UWUA 1B31A 4MNKA 3RMEA 2EPOA 8CGTA 2EPNA 1C90A 2XM2A 3AIVA 1EHAA 1CGWA 3AXHA 1XRVA 2BXZA 1JDCA 3MUAA 1M53A 2WZIA 1CXFA 1ZBKA 2OSWA 3M6DA 1W1PA 4TTUA 1V0NA 3ECQA 3MKKA 2XHYA 3KEHA 2BY3A 2UY4A 1W1VA 2WAGA 3SCQA 1GQKA 1HX0A 1KBBA 2ZXBA 4UOQA 5GNZA 1LF1A 3CZLA 3L2MA 4GI8A 1CGUA 1WDQA 3VD5A 3VKKA 5CQ1A 5EMYA 4TUFA 5BRPA 2OSYA 3BMVA 2WCGA 4PTWA 3VNZA 3ZR6A 1V02E 2NT1A 5I77A 1TA3B 4C90A 1KGWA 1VEMA 1U30A 2JF6A 5A2BA 3VGHA 1M01A 4JCMA 5LA2A 4B3KA 2VT0A 2DGAA 1Y7VA 5JUVA 4JHOA 4B9ZA 1FH7A 4RE2A 4KRUA 2DSZA 3GH4A 2D2OA 4AD3A 4CD6A 3FW6A 1E73M 3VPLA 1UZ4A 5FL0A 3LPOA 5CPTA 1V6UA 1Q6FA 4UZSA 5DT7A 4RE3A 1E5NA 1E6ZA 4CU6A 1JYWA 1C93A 3WNNA 1VFOA 4GKLA 1UKSA 1NP0A 1OWQA 2WCAA 3AYSA 4OZOA 2PBGA 2PWEA 3N1AA 1US2A 1WCGA 3A4AA 1UG6A 4J28A 3WIJA 3A4XA 3AISA 4PYSA 4QLJA 5HOSA 1E9LA 3THDA 3RPMA 3AS2A 3VIFA 3AROA 3PZGA 1S46A 3BC9A 2DIJA 4D6FA 5AC4A 2VJXA 3VX0A 3RM8A 1VRXA 1QI3A 1ZU8A 1MQRA 2WYSA 4GXPA 4TOQA 1ITXA 2GK1B 2C7FA 2VR4A 4PCSA 5GNYA 3T2OA 5BXRA 1UH2A 1ZS2A 4TXEA 2J7HA 2YIHA 3W25A 3K1DA 2WKLA 1VFUA 6A3HA 1W9DM 1KXVA 4P8VA 4HA3A 2YLLA 3CH9A 2WM0A 1US3A 4GZEA 2GVYA 3WFZA 4AZ6A 5D9PA 2J77A 1JL8A 4AIUA 2ZICA 5BCAA 3WF0A 1UWSA 2O9PA 3FN9A 4HOZA 4FLOA 3VMOA 2JF7A 4J3WA 3QHNA 4TVUA 3VMPA 5FKYA 4U2ZA 2J7EA 1UR1A 4DWSB 5A95A 4WSKA 4M29A 1DWAM 3TTYA 4HOXA 2DSVA 2E40A 2CESA 3AI0A 3TTQA 3NDYA 3TA9A 2E3ZA 1H0IA 4JFTA 1QHOA 2WLYA 4LYPA 3ARSA 3RM9A 1HVQA 1OGGA 2BNJA 3QHOA 2DIEA 2FH6A 4AMCA 2G3JA 2FHFA 4CN1A 2W66A 4GINA 5CSUA 1KGUA 2WVTA 4QLLA 1B90A 4WKFA 1CIUA 4W86A 4HMCA 3SCNA 3TTSA 1UUQA 5BXPA 2ZE0A 3I3DA 4U3CA 1U33A 4GO8A 2VURA 1BQCA 2CHNA 4LPCA 3QOMA 3AZSA 2W4XA 2X0YA 4BZYA 1E15A 1EQPA 2J74A 4M1RA 1QHZA 4XX6A 4LX4A 2YA2A 4BQ2A 2UY2A 3EDJA 4CN4A 2WHMA 4J3VA 3W37A 1JD7A 1D7FA 2VQUA 3BAWA 3UERA 1E4MM 3ARPA 2GUYA 2XSBA 3OBAA 2Z1SA 3AIQA 3W24A 2B31A 1QW8A 3W81A 4DUXA 3B9EA 5BYWA 1SFSA 2VMFA 4NI3A 3QR3A 3IJ8A 2X2YA 3KL3A 4MDOA 3WSUA 3ARYA 3W0KA 1DWHM 4HPGA 5A2AA 3BMWA 1MXGA 3SURA 2YL9A 4URIA 4S3JA 5AC5A 1E0WA 3AYRA 1K9DA 2D24A 1GPFA 1XH2A 2BFGA 4OOUA 4DWSD 1JAEA 3BGAA 3ARXA 1W1TA 1BF2A 3AHVA 3BH4A 3U7VA 5A6AA 1WZKA 2YOCA 4WK9A 3WBAA 4HU0A 2O9OA 1FH8A 3ARRA 2CXGA 1E43A 4CKQA 5CPQA 1HNYA 5HPCA 3GH7A 3OGRA 1HL9A 1GNXA 3WH9A 4AXNA 1J18A 4AD0A 4IM4A 1HL8A 1MW0A 4H8HA 1M04A 3K8LA 5E9AA 1BVZA 3CHEA 1E71M 4EAMA 2PWHA 1BTCA 4JKKA 3VIGA 1O7AA 3AMGA 2J62A 1CLXA 3A47A 3AHZA 4B15A 2VRKA 3WQVA 4AIOA 4Y7EA 1FFRA 4D1JA 3CMGA 3ZR5A 4HP5A 1YQ2A 3VUPA 1ODUA 4MAVA 4HOWA 3MV01 2DT1A 5GQBA 3VTRA 4JIEA 1TG7A 4W8LA 3S2CA 3IJ7A 2YL6A 3OZOA 4E4PA 4WJXA 3LPPA 4F79A 3TOPA 1JZ6A 4P7NA 2J7FA 1ZBCA 1J0ZA 3VIOA 3CHCA 1PZ3A 1KR1A 2JALA 3WF4A 1H4PA 1NWSA 3AFBA 2CEQA 2WSKA 2BY2A 1ZBWA 2A3HA 1J0YA 3T0DA 3CMJA 1XYZA 3VU2A 1C7SA 1WE5A 4AZIA 4PTXA 3OLIA 3BXWA 3K46A 1QOXA 5A3HA 1WPCA 2OSXA 1E3ZA 4BQ3A 1CGYA 4ZE5A 4M56A 4WKHA 1GHRA 1GOOA 4AZBA 3WQ8A 1ISXA 2J7CA 2QF8A 3WNPA 1TVNA 5A1AA 2W61A 5DMYA 1CXLA 1G0CA 1VENA 2BVYA 4PEEA 2J75A 2WMKA 1KWGA 5DO8A 4CU8A 2OYKA 4D6HA 1CXKA 2HISA 2WBKA 1QBAA 3G6LA 2VTFA 5BWFA 1LL7A 3VGGA 3OGSA 4Q7NA 4ACZB 4HU8A 1EH9A 1CECA 3VIIA 5I0DA 3AOFA 3FNDA 1JZ7A 3PZUA 1E6NA 4H8VA 3LMYA 2ZX9A 5HBFA 1JF6A 4YHGA 2XGIA 4D6JA 2DDXA 2UY5A 2QHAA 1ISYA 1QVBA 3CLWA 3ZJ8A 3OB8A 4WKAA 2Z1KA 4DM1A 2X05A 1E6PA 2YA0A 4QFUA 2ZUTA 3FHAA 1AVAA 5D4YA 4E2OA 4PMNA 5ABFA 3PHAA 5FL1A 1AQ0A 4V28A 4JZ5A 2TAAA 1VFFA 4ATLA 5LYRA 3S6TA 5IFTA 1ISZA 3VVGA 2CYGA 1G94A 4CU7A 5DEZA 1JNEA 1WDPA 1J0IA 3MSGA 3AMDA 3VM5A 2CKRA 1TFVA 1ZBVA 2YDRA 3CUIA 1OD8A 2YKKA 1JF5A 4RL3A 3VDHA 1D3CA 1LWHA 2D20A 4U3AA 3PZ9A 4AIEA 4L4OA 3AIBA 1EXPA 2ZX8A 3VMNA 4UTFA 3WN6A 1I1WA 5IDIA 3DC0A 1X1NA 4XZBA 3F5KA 3IK2A 3NDZA 2W62A 1BSIA 3O6AA 3EMQA 5IHSA 2BHZA 1PIFA 2PBOA 1EOKA 3WH6A 1XCWA 2X0HA 3VDBA 2E0PA 2J4GA 2WLZA 2CITA 2O9RA 4OIFA 4AD1A 5D8WA 5C70A 1UR2A 4GI6A 2XJ7A 5LA0A 1PX4A 2X1IA 1W1YA 4AZCA 1W3HA 3D3AA 2F2HA 2VO5A 3WMBA 4OKDA 1MFVA 1UYQA 2QLYA 4MB5A 4PN2A 4CD4A 1VEOA 1MQPA 1KQYA 3WUBA 4KWUA 4V27A 2F61A 2VX6A 1HT6A 3VGEA 2CBIA 5BRQA 1KBKA 2A3BA 1X6NA 2WK2A 2CERA 2YL8A 3U7BA 3MV11 3W6MA 2CKSA 1V02A 4UQCA 1UWQA 3SUWA 2BY0A 2ZWYA 1W9BM 2O9TA 1E55A 1XCXA 1CGXA 1W3LA 3W38A 5E6ZA 1WNOA 1OIMA 4CD7A 4UOZA 5A94A 3OA5A 7TAAA 2DH2A 2HVMA 1KCLA 2WMJA 3WQ5A 2QMKA 1W2PA 3MUY1 3MANA 5EFFA 3FY1A 1KCKA 2FGLA 4HTYA 4M82A 3KL0A 1B3YA 4NRSA 1QNSA 1WDRA 1NQ6A 3K4AA 1CYGA 1E40A 5IHRA 3AHYA 1H2JA 1UKOA 3FAXA 1X6LA 1W9PA 5C8BB 3GBDA 1C92A 2VX4A 3NCOA 2AOSA 3MU7A 4J3TA 3L4UA 1SR0A 3AIWA 4AZ7A 2G41A 3A3HA 6CGTA 1HJWA 4UFKA 3WBEA 3JUGA 4U5KA 1HKIA 3T08A 3AS3A 4AISA 3HMCA 2G4FA 4C7GA 1V3LA 1KXTA 2G3IA 4FLRA 3WDPP 5I5RA 2OWCA 1V3JA 3WQ4A 1JG9A 4CD8A 5E0FA 1W32A 2J8FA 1V3MA 3EBVA 3VM7A 1H11A 4MTVA 5D9MA 1JD9A 5CGTA 1H49A 1IZJA 2JIWA 4F66A 1EOMA 3SUUA 3F5LA 5A6KA 2A3CA 2JFEX 3QOKA 2E8ZA 1BGGA 4AD4A 5CLTA 2BV9A 3CUFA 2YDQA 4MB4A 2FHBA 1WZAA 3WD1A 5FIPA 4JFSA 4H04A 1FH9A 4E8DA 2E8YA 1UKQA 3GM8A 1KXQA 4PUDA 4Z2GA 1HKMA 4UQEA 3LPFA 3NSNA 1WP6A 3SIMA 2G8ZA 1E0XA 2Y5EA 4FK9A 1MFUA 2JEQA 4A3YA 3ARQA 3WNOA 4QDMA 2V3EA 1R7AA 3RO8A 4FF5A 1UR9A 3VIMA 1AQHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UPM A;  2XIJ A;  3P8J A;  1FHL A;  2RDX A;  4QIU A;  2FVM A;  3B8S A;  4IG2 B;  3ARU A;  3KBN A;  3LX9 A;  4QM1 A;  2NQJ A;  4PE8 A;  5GJN A;  1A49 A;  2G3M A;  4HYW A;  2ZZ3 A;  3TEV A;  5E6Y A;  1JIB A;  3AIE A;  3B0X A;  3KBM A;  2AMG A;  1X6U A;  4L6O A;  3W2M A;  2C79 A;  3TKF A;  3WL1 A;  1UC4 A;  2WNQ A;  1YMY A;  1T5A A;  2V5J A;  5B7Y A;  1NSJ A;  3SM0 A;  1OAD A;  4UB9 A;  1XLG A;  1MO0 A;  2Y7D A;  3TW9 A;  1VKF A;  4AF0 B;  3GS6 A;  1UWR A;  2H8Z A;  3WLH A;  4A29 A;  1S2C A;  2NUX A;  2FVK A;  2X41 A;  4QLK A;  1R9X A;  2V30 A;  1UH4 A;  4HA1 A;  3T40 A;  4IIH A;  3WLQ A;  4J1O A;  2DSU A;  1WQ5 A;  3LCF A;  2EQD A;  3ARW A;  1R9Y A;  2GJR A;  1GYN A;  3D46 A;  4UFH A;  1R2T A;  2E9B A;  3S4T A;  4ZBC A;  3ZST A;  2D1Z A;  4FR6 A;  1IWA A;  1OFR A;  1QAT A;  5A8Q A;  2VRQ A;  3THQ A;  5MKG B;  2DT0 A;  3KVJ A;  3S6O A;  2BSL A;  1UZH A;  2PTW A;  1OM0 A;  4PMV A;  3Q65 A;  1KRB C;  3G8R A;  2ZUM A;  3SRH A;  1IXQ A;  1FWD C;  3WJY A;  3IUD A;  1C8V A;  2E9M A;  1UKT A;  4F0K A; 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2GK1A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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