1ZFJ | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	490
structure length	476
Chain Sequence	SNWDTKFLKKGYTFDDVLLIPAESHVLPNEVDLKTKLADNLTLNIPIITAAMDTVTGSKMAIAIARAGGLGVIHKNMSITEQAEEVRKVKRSENGVIIDPFFLTPEHKVSEAEELMQRYRISGVPIVETLANRKLVGIITNRDMRFISDYNAPISEHMTSEHLVTAAVGTDLETAERILHEHRIEKLPLVDNSGRLSGLITIKDIEKVIEFPHAAKDEFGRLLVAAAVGVTSDTFERAEALFEAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIAEIRAHFPNRTLIAGNIATAEGARALYDAGVDVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQVTAIYDAAAVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMFAGTDEAPGETEIYQGRKYKTYRGMGSIAAMKKNKLVPEGIEGRVAYKGAASDIVFQMLGGIRSGMGYVGAGDIQELHENAQFVEMSGAGLIESHPHDVQITNEAPNYS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	INOSINE MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title	Characteristics and crystal structure of bacterial inosine-5'-monophosphate dehydrogenase. pubmed doi rcsb
source organism	Streptococcus pyogenes
total genus	122
structure length	476
sequence length	490
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	1999-03-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1zfjA00

3M5VA 4K8EA 4FXRA 5CZJA 3EWZA 2G97A 3DKJA 4JS3A 3KVKA 4NUWA 4TMBA 3W71A 1EWDA 3FYOA 5E0KA 3KXQA 1F2JA 3HJZA 3QMSA 4A21A 4A2RA 1VCFA 3VE9A 5G5IA 3Q94A 3LB0A 5I3JA 4UNKA 4K8HA 3C61A 1HFBA 1AMKA 2R94A 1ZY9A 5HQEA 2WV8A 3LTSA 2CZ5A 4JY9A 4OT7A 4DQWA 3SECA 3V75A 1KV5A 1NEYA 1QCWA 3PF3A 2NWSA 1H7NA 1H7WA 4JX4A 2Z0IA 4Q33A 3N9RA 3W7LA 4WY0A 2ZRUA 3NPUA 1GYLA 3LM7A 3QQ1A 3CM4A 1VHCA 1TQJA 3MYPA 2FLIA 5J5RA 1TPUA 4NJKA 2QJGA 1OK6A 4WXZA 3TDFA 2DJXA 1L6YA 3LI1A 1XCFA 3TW6A 3DFSA 3DH7A 3NAVA 1VLWA 2A6NA 1XFBA 2CLFA 3LGEA 3STCA 3DENA 4BF9A 1R2RA 4ZVJA 1GVFA 3FA5A 4UMBA 4ZQPA 5KZEA 4LVDA 2NUWA 3B06A 1B9BA 3TKFA 1GZGA 3BLFA 1FCUA 4N4PA 1ADOA 3DFQA 2QUVA 3S5YA 1EA0A 3KX6A 2A2IA 2ZA1A 5K2ZA 1YXDA 1XUZA 3IGSA 4ADUA 1P1XA 1O60A 4LNYA 5AHNA 5LKYA 4ML9A 2ZTJA 4GUGA 2ATSA 3PM6A 5BNKA 3C2EA 3W85A 3LDVA 4EF9A 3VFLA 3K30A 1ZAHA 5EYWA 2QF7A 5LZLA 3HPZA 3STEA 5D32A 2JGYA 5L9FA 1X6UA 5H91A 1G69A 1WDWA 3O07A 4FNSA 3W2NA 3N73A 4Z1DA 3TXZA 4JTEA 5AOUA 2QCHA 2Y6ZA 3CWOX 2I14A 1QMLA 3LBMA 4DF0A 3L65A 5D05A 4XZ9A 1UASA 1QNVA 3G8EA 1OFPA 3NQEA 1D3GA 4QSHA 1CI1A 4IXXA 3C2RA 3MP4A 3M1ZA 1O5XA 4HN4A 4EF8A 4N4QA 3TSMA 1TSIA 3FJ6A 3BG9A 3C56A 3DGRA 6ALDA 4YWIA 5HWJA 1YDVA 1C9DA 3HIJA 3KAOA 1QOQA 3QMTA 5F1UA 2P0OA 3EX3A 1OFOA 3MP3A 4QNEA 1H7XA 3B4UA 1SUXA 1SW0A 2E09A 2CU0A 4JTIA 4M6PA 2HS8A 2DJLA 1ICPA 2NWRA 4I9AA 5KZDA 3WJXA 4GRSA 1QR7A 1A5AA 2DZTA 1XBVA 1JULA 3DZ1A 3FKRA 3NPVA 3NQ2A 3KFTA 1QPRA 2E6FA 2Y89A 4AXKA 4JTLA 4B5NA 3PBWA 4MY1A 4M7TA 3PULA 1D9EA 2QCLA 5EA9A 1TTIA 3VE7A 4GUJA 1IGSA 5F4SA 3G3MA 5LNVA 1QFEA 2H90A 3PG9A 4NZFA 3TCEA 4QQ3A 2GPTA 3WK0A 3UQNA 4O1DA 3INPA 2E6DA 3TC7A 4AMAA 1J2WA 5DXYA 1OX4B 1TV5A 1I2QA 3HBLA 3L5MA 1QWGA 2OCZA 2ZA2A 3W7HA 3PB0A 4UTTC 3GAKA 3S6DA 5L6UA 4YXGA 3W1PA 3GDLA 1MSSA 1OYAA 3A22A 2OMAA 1F6PA 1XBYA 5FF7A 2J9YA 4EOUA 4XQ6A 4LVBA 2W6RA 4NT0A 2YXGA 3DHFA 3LV5A 2CLOA 3H55A 3TW7A 4AHQA 3LXCA 2C6QA 4YCOA 4I7WA 1EP2A 3FIGA 5LNSA 3HB9A 3C2VA 1HO1A 1VYPX 2E5BA 3IVUA 1V7YA 4POCA 5AC7A 3JR2A 1O4UA 2A7PA 3U2OA 5HINA 1HL2A 2V9DA 3JS3A 5HR6A 1RVGA 4PA8A 3W6YA 3C0JA 2GVJA 5C2XA 3BK0A 3M5XA 3SFKA 4ZQMA 1GVRA 2CFFA 1FDYA 4UTUA 4N6FA 1DORA 1LZOA 4IWWA 2Y63A 3P62A 4MLJA 1SW7A 2XN2A 3MBFA 2FTPA 4Y6GA 1JCLA 2ZRZA 1H50A 5IM51 3PUOA 1PL9A 4UTIA 4A2SA 1K7XA 3N2XA 5AYXA 1Q3NA 2YW3A 2GJNA 3E0IA 2EKCA 2XN0A 3HGJA 4XUGA 3QZEA 3W7JA 1RQEA 4KFPA 2J24A 1L9WA 5AHFA 1M5WA 2C16A 4BI5A 4O10A 1WBHA 3ZWTA 3FKKA 1Q6OA 3GDKA 1IXNA 1OX4A 3FEMA 3TFXA 1EX5A 4DELA 3UY7A 3WJWA 4O52A 4JTFA 1Q6RA 1JQVA 1U83A 2W79A 4ZZ9A 2Y7DA 3IEBA 3LBCA 2KZHA 1VGAA 1QOPA 2DORA 3GXPA 3W83A 4UFHA 1JJKA 4LS2A 3ELFA 3N19B 4LC6A 3NM1A 1GG1A 2H8ZA 3TMQA 2LLEA 2QAFA 1F7BA 4UFKA 3GIYA 5DCBA 2A6LA 1UBSA 1XDMA 2QCEA 2RDUA 5KITA 4O4WA 1KM6A 4JYDA 3L0GA 2X1TA 5D2XA 5K9DA 5CKSA 3NQVA 5FF4A 4KWVA 2DP3A 1H7PA 1FBAA 1FWTA 2EHHA 2V5LA 1OFRA 1SZFA 2E1DA 3B05A 1SSDA 4JNMA 3NO5A 4JTUA 3UWZA 2RH9A 2V0TA 4GNJA 4UXDA 3SR7A 3NDOA 5C5YA 1LBLA 2G5WA 1VQTA 3L5LA 1TB3A 3BG3A 4MYXA 5G4EA 2R14A 1GVQA 1TPWA 1I8JA 3G1HA 4M19A 4O11A 1V5XA 3BGGA 5EMUA 3CIWA 3OVQA 5IBXA 2CLEA 3NEVA 3W2LA 3D0CA 3C52A 4DF2A 4IXHA 4Y9AA 1YYAA 1ZFJA 4NJHA 1DL3A 2O7SA 4O18A 1UB3A 4MJMA 4X2RA 1AW5A 4RKAA 4N6EA 3VCRA 1DOSA 7TIMA 1W3TA 1PE1A 2JKEA 2NX9A 4O1AA 3G0UA 3BG5A 3FYPA 1TV8A 2NX3A 3DFOA 3LHZA 1KFBA 3CWNA 4C1LA 1M7PA 2C3ZA 5EKYA 1OG0A 1FXPA 3G1SA 3NQ6A 3R12A 5DBUA 3PUEA 3W7GA 5LGZA 4O19A 3UWYA 4RXFA 2E5DA 5DCEA 1OHLA 3LRLA 1GTHA 1FWRA 4UC5A 4HNVA 1VPXA 1TPH1 1YPIA 3EXRA 3M0ZA 4N9BA 2YPIA 6TIMA 5J5DA 3E49A 4UUIA 1VHNA 4IX2A 1SO6A 1MEHA 2TMDA 3HQ1A 5AYYA 5C6MA 2X16A 3P8JA 2FPTA 4IPIA 3NQMA 1TPC1 4CCDA 4LC8A 3LCGA 1XDLA 3NGJA 4UNLA 3W1RA 3GXTA 1FQ0A 4TMCA 2TYSA 4YCPA 4IMDA 4UTLA 2EF9A 1OK4A 3O15A 3ATYA 1LTDA 3S5OA 4K38A 4M7SA 3EXTA 2H3DA 3PSVA 3F1QA 1XBZA 3DFNA 4XKYA 3MW7A 3R89A 4YL2A 1LP6A 2NUXA 1H62A 3I7SA 4JYFA 1VYSX 4ZL1A 1W54A 1W3IA 2B7OA 3IVTA 4FXSA 3UPBA 3TK7A 1DHPA 2B7NA 4E2DA 4FEZA 5HJLA 1TYGA 3MHGA 3RMJA 2CLLA 4WOZA 5MHBA 2VOMA 2HS6A 4DEFA 1NVMA 1T0OA 4U28A 1OYBA 3UYCA 4IX0A 5D2WA 2V82A 2QCMA 1QO5A 5CSRA 5G2WA 1NSJA 1WA3A 1S5VA 2ALDA 3TIMA 4R53A 3F4WA 1ZHAA 2HMCA 2V81A 2DZUA 4XWUA 1LLWA 3OVRA 3IIPA 4AEOA 1TO3A 5HMSA 5KSWA 1GQNA 2OT1A 5HULA 3MHFA 2C14A 4RZ4A 3BARA 2V2CA 5D09A 4NX5A 3R5EA 3M43A 4LS0A 2WNQA 3M7WA 5D2VA 2WNZA 3T44A 2YFOA 1OFQA 3M16A 4GE8A 1EIXA 2JGQA 1WOBA 5BMWA 3W7EA 2DZSA 3W7QA 4N9CA 3UD6A 4LWWA 1TTPA 2GJLA 1R2TA 4JX6A 3UWWA 1TCDA 2Y70A 3NPWA 3O6YX 1OFBA 3RNDA 1Z41A 5K4XA 5CGQA 3LXBA 3LCFA 1K8XA 4DPQA 1MZHA 1G7VA 1VCGA 5FEXA 3BPWA 3N2MA 2FPYA 4IUOA 4EWND 3BO9A 3IIXA 5G2IA 2NZLA 4ADSA 3ZWSA 1JQXA 3HOJA 3KHJA 4OGZA 3EWWA 2FPVA 4LW7A 2WPBA 3PBUA 3L2IA 2V2DA 4HNUA 3G1DA 1YDNA 5BMXA 4GFSA 2OZ0A 1OABA 5LHEA 2BX7A 2BZNA 1LRNA 3GKAA 5AFDA 4GWEA 3TJLA 2Y7GA 4LS1A 1H1YA 4WD0A 1I4NA 3TFCA 4TIMA 2ABBA 3N34A 4JIPA 4L4LA 1BKSA 4O16A 5KINA 1KTBA 3EKLA 2ZZ6A 3MJYA 4ADTA 4HPJA 3B03A 3FFSA 4XTIA 1F73A 4RZ6A 4HHPA 2Y62A 4N2YA 3LRMA 2DZXA 3CC1A 1E51A 1KFLA 1SZEA 5FEZA 3T4CA 2QCDB 3RK8A 3P5ZA 2WQPA 2P10A 1YADA 4O15A 3L9CA 1JCXA 3P84A 3A5FA 4LTSA 5DXXA 1FCQA 2Q3OA 1ZNNA 3EWUA 3W1TA 3NL6A 2H6RA 4C1KA 1GVSA 3WJYA 4LUJA 5AHEA 1S5TA 1O94A 1THFD 4R7JA 4X9SA 4PCFA 1TJPA 4FF7A 4X3ZA 1B3OA 2GUUA 3GZ3A 4QNWA 5I3KA 1BWLA 3V1PA 1SR9A 2QDGA 5BOOA 2E77A 5EBUA 3LCWA 3EX1A 3TAKA 4GXMA 4LVGA 1AG1O 1KM3A 2RFGA 5I3HA 3W86A 4QISA 3Q58A 5F2GA 1LROA 3STFA 5G1YA 5EY5A 1WQ5A 4HNTA 5D03A 1LLZA 1OVDA 3G0XA 4OQVA 3M5ZA 2A4AA 1ALDA 3G3DA 4FNTA 5AC6A 3RLVA 3IIZA 2PRMA 3CEUA 4NQ1A 4NVTA 3EX4A 3T78A 1IIGA 1ZJIA 1WAUA 1ME8A 3GR7A 4AWUA 4IQLA 5HWNA 5IBXC 2E6AA 1ZAJA 4S2CA 2FIQA 4CQ9A 3W87A 3OVPA 1P4CA 1BWKA 4MUZA 3TMLA 2VEKA 2RDTA 4JDBA 1A53A 4HNNA 1W56A 4JTJA 5D2YA 3P7YA 4K7YA 4K39A 1YPFA 4GUIA 4Q4KA 4O14A 3W23A 3O16A 3TQ0A 3CHVA 3A24A 2YYUA 2YR1A 3W7NA 4JTGA 4NNCA 4ZMGA 4FO4A 1DQXA 4OE7A 5K9XA 2EGZA 3QF0A 1B4EA 1VYRA 4JX5A 3S8HA 2B7QA 3THAA 1SSGA 4NZJA 3HG4A 4WJEA 1TPB1 1DBTA 2F84A 3O1NA 2YCEA 4FNPA 4M6QA 4CLMA 1HO4A 2QUUA 3GXNA 1OF6A 4RCXA 2Q8ZA 4KFNA 4UIOA 1AW2A 4I7VA 2FJKA 5LNWA 1H61A 1JRBA 2ZZ2A 1H51A 2HSAA 4MOZA 4E0CA 3ABSA 2H3BA 3E9AA 2YFNA 3GNDA 5F2MA 1Z44A 3QH2A 3NPXA 1YTEA 2WSRA 2R8WA 4MPQA 3VI2A 1T99A 4O1CA 2ZRWA 5HUPA 4U4MA 3TQKA 2ZA3A 4OBTA 4MVAA 5D04C 1GYNA 2NXGA 4RV8A 3IGUA 4NJIA 3GB6A 3TSBA 3R2GA 5AHIA 3IRDA 3QJAA 2F7FA 3M9YA 1UUMA 4JN6A 1A5CA 1TRIA 3KRUA 4A3UA 3W7RA 4PL2A 3CQ0A 3RLUA 3M47A 4O50A 3QW3A 3TU9A 1K3UA 2R91A 2J6XA 4LV9A 1F5ZA 4MFDA 1UUOA 3HGRA 2I1OA 2GQ8A 4MZYA 3SZ8A 4QJ1A 4G1KA 1LOLA 1FX6A 4JTSA 5SWUA 3QPZA 2A1YA 5DN1A 3HPSA 3O63A 3THQA 3NVTA 2EPHA 4ONVA 3CU2A 3GNNA 3E96A 3DAQA 1W5OA 3O6DA 4Z0JA 4GJ1A 3IVSA 2C15A 1TTQA 3W1QA 4UFJA 2TPSA 1M6JA 1WYIA 4HSOA 4K36A 1D3HA 4UR8A 4BFAA 4FX8A 2B4GA 3KRZA 3MO7A 4ZQNA 2DZWA 1TPEA 1P5BA 4UR7A 1DVJA 3TSDA 3H54A 3CLMA 3PBVA 4PC8A 3R13A 3QW4B 4MZ1A 1X8FA 2DU2A 3NQDA 4WOQA 4JGDA 2BLEA 5DBTA 5CPLA 5LHFA 2Y85A 2J9XA 3SI9A 3PAJA 3LERA 4LOCA 2QKFA 1YLVA 1R30A 5I3GA 2X1SA 4IOTA 1S5WA 3MMTA 3TNOA 3LHYA 3G1YA 1N7KA 3PUDA 1WXJA 3G1FA 4JIQA 1NFBA 4ORMA 1WOAA 4AWSA 4LVAA 3S9YA 2QJIA 3W73A 1MO0A 1G4SA 4CNOA 5D30A 3W7CA 4UFMA 1XXXA 2GQAA 4DBEA 2GQ9A 3CTLA 1SFJA 1YDOA 2YZRA 3CEPA 4K37A 3W2KA 3F03K 4A22A 1XC4A 1P0NA 2YDAA 4LU0A 3A9IA 1VLIA 4HPXA 2QCFA 3C8FA 1K03A 1EUNA 3LCHA 1FWWA 2NXIA 1KM2A 2CLMA 4BI6A 4DF1A 5AN7A 1DQWA 5KTLA 3P81A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1ZFJA

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