4M6P | Genus

Total Genus 173

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	173
sequence length	481
structure length	472
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELEA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT). pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	173
structure length	472
sequence length	481
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-08-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4m6pA02

3LTSA 4JNMA 5D32A 3W76A 5K3VA 4DBEA 4IMEA 1GTEA 1PE1A 1ZFJA 2CZDA 1ZHAA 4NNAA 1HL2A 3QJAA 2CLEA 5CSSA 2UV8G 3GVGA 1G4TA 4X22A 1FDZA 5F4SA 5FF3A 2QUUA 2NZLA 3QC3A 1PVNA 5LKYA 1YXCA 1TCDA 2DP3A 1LORA 1EP2A 1OFEA 3PUEA 3STFA 3LRLA 4Q4KA 1BTMA 1YPIA 1H60A 1VCGA 2ZZ6A 3D0CA 4RCXA 4IPJA 5KTLA 2A2IA 3EX4A 4L4LA 3KVJA 5F4WA 4K8HA 3FYPA 1P0KA 3B0UX 5HWNA 3QSRA 4RZ5A 4YLWA 1FXPA 4I7WA 4KFPA 2PRHA 1XM3A 3TKFA 3W2MA 1O5XA 2ZZ1A 4DELA 3R89A 4JICA 5T26A 4FB7A 2F7FA 3W2LA 1QOQA 2NXIA 1AK5A 2BX7A 3LTYA 5DN1A 3UY8A 1KV5A 1LBMA 3NR0A 4AF0A 1DQWA 4O4VA 4LS0A 5I3IA 3UWWA 3MYPA 1DJNA 4AWSA 2H3DA 3S9YA 3DFSA 1IF2A 4HN4A 4PFMA 4CQAA 1NAL1 4JTGA 1TIMA 1RVGA 4LW7A 4N9EA 1KM1A 3QH2A 4A3UA 3DH7A 1LOQA 4L4MA 2JKEA 3W7EA 4JTUA 4XWUA 4JTKA 3FJLA 1FWTA 2B7NA 3PUOA 4HSNA 3M1ZA 3PULA 1SPQA 3TC7A 2B7QA 4WX2A 4OHQA 2QAPA 4LVAA 2Y7FA 2HMCA 5D09A 1TTPA 2NUYA 3ATZA 1EP3A 3E96A 4PL1A 3WJWA 3G1HA 3N9SA 5D04C 4O0ZA 3L21A 1XDMA 5DLCA 3ZWTA 1IXNA 5LHEA 3W74A 3SJ3A 3NPWA 4AH7A 1XCFA 3C8FA 2JKPA 1RQBA 1W3IA 3LX9A 2J9YA 2VELA 3RU6A 4EVZA 3VFLA 4Y90A 3O06A 2R94A 4LVFA 2TRSA 2QCCA 1EWEA 5K9CA 1WXJA 4R53A 4Y9AA 4LUIA 3W7RA 5I3HA 3MHUA 4JTLA 4DEFA 3P80A 4IJBA 1ZY9A 2C18A 1YYAA 2PE4A 3DFQA 2QAFA 1SQ7A 4LV4A 4WUIA 3SECA 1OK6A 4LY8A 4AHQA 3G1VA 3E02A 5G2WA 4XQ6A 4K37A 1THFD 4BF9A 1W5NA 3NQGA 3P5ZA 4QIUA 3CB8A 3CIXA 3NO5A 4MUZA 4NJJA 2Y63A 3TQKA 1GG1A 3W88A 4UTWC 1SO3A 1CX9A 3DFPA 3I7RA 5D37A 4MYXA 4RX0A 1VS1A 3OA3A 2GQ8A 3B4UA 3G3MA 1FUYA 3STEA 4DXVA 3M5XA 1WOAA 1EA0A 2BSLA 1W37A 3V75A 1P5BA 3I7SA 3O07A 2OT0A 3MYOA 4JN6A 1JRBA 4M7SA 3HQ1A 3NQ8A 3KAOA 1UB3A 3O6DA 4NT0A 4LNYA 3L0KA 4JX6A 3GX9A 1UUOA 3ABSA 2DJLA 1DL3A 1XUUA 4RXFA 3STCA 1TPFA 4MKNA 4KFOA 5L6UA 2A1YA 2A7NA 4QSHA 7TIMA 3S5NA 2PRMA 3NYZA 1QAPA 4Y8FA 4MZ8A 3N14A 3ATYA 4IX2A 1TMHA 3HOJA 1S3HA 4NNCA 3JR2A 1YTDA 3FKRA 4WQ6A 5AYXA 3WFAA 1KM6A 3H53A 5FF4A 2RHGA 3KHJA 2DORA 5BW6A 5D30A 5HUOA 2BZNA 3K30A 4FX6M 5FF7A 5CSRA 2A7PA 3NG3A 1M7OA 3HPXA 2ZFAA 3NPUA 2QCHA 4K8EA 3MO7A 4H6KA 3HGOA 1XDLA 1H63A 4PODA 3USBA 1H51A 3PWAA 3LCFA 5EA9A 3P60A 1RR2A 2BLEA 2VEKA 2ZA3A 3CIWA 3LLFA 4Z1AA 2OCZA 3L0NA 4CNPA 4HPXA 1S5TA 3GYEA 1BWLA 3LCLA 4O1AA 4HIBA 1KFCA 4ZQMA 3TW7A 5AHEA 2VEPA 3PB0A 3G1DA 1L2UA 2QCDA 5I3JA 5TQLA 3TDFA 1FCBA 1NF7A 1RPXA 3C3NA 1R2TA 5J5DA 4AHOA 3FIGA 2RDUA 4EF9A 3LHUA 2P0OA 1V5XA 4JX5A 3GDLA 3P82A 3SGZA 3M7WA 1GWJA 3LM7A 4HNNA 4DO5A 4XBSA 3W1TA 3CEPA 3TW6A 3EKZA 1TPUA 3GZ3A 3I65A 5LNSA 3QQ0A 4FO4A 3W73A 2X1RA 2E6FA 1TPC1 1GOXA 1LBLA 4CQ9A 4ADTA 1Q6LA 3UPBA 3N2MA 1FQ0A 4FNQA 2Y61A 1I4NA 1A5CA 4Q32A 1OX5A 5AC8A 5KZEA 2YYTA 5HQEA 5HWJA 5K7JA 4ZQCA 3ABOA 3KX6A 3PS7A 2W79A 1KFJA 3JS3A 5AHNA 3B05A 1FWNA 3S5YA 3MW7A 4U28A 2QCDB 3W7OA 4LC8A 2RDWA 3G22A 2Q8LA 2X16A 3TSDA 4M6VA 2HSAA 2QCNA 1SU5A 3G1AA 4Y96A 3TQVA 3ZWSA 3BG3A 2ISSA 3RMJA 3M5YA 3RK8A 3VI2A 3SFKA 5AC7A 4TMBA 3L5AA 2E5CA 4JEQA 1DV7A 1KBJA 4NJHA 3G8RA 4S2BA 2WKJA 1ONRA 4JDYA 1XKYA 4GUGA 1S5WA 2QF7A 3LV6A 3UPWA 1HO4A 3N3MA 1OFQA 3N34A 1B57A 4HT3A 4LU0A 1W31A 4LVDA 4O8RA 4JTTA 6TIMA 4JY8A 5CPMA 2YSWA 1PL9A 5F1VA 2V5BA 3DZ1A 1IXOA 5EL1A 2WNZA 4DO4A 3KOFA 3P7YA 2WOQA 3W1PA 1FWWA 1W0MA 1K7FA 2DZSA 3OVQA 3NQVA 2NX1A 3LRKA 3C6CA 3GAYA 3BV4A 3WK3A 4BI5A 4O11A 3P62A 4NJIA 3LOTA 2E5DA 3PSVA 1QPRA 3O8AA 1LYXA 1XBXA 3NL6A 3DKJA 3RFAA 2VFDA 3IEBA 3T40A 3CT7A 2NV2A 1L9WA 5HR6A 1AL8A 3HO8A 1H1YA 2CU0A 3W07A 3ABQA 3M6YA 1FWRA 3RF9A 1GVSA 1K7XA 1Z42A 4XTDA 2ABBA 3C4UA 4QJ1A 5ABTA 1MO0A 2A0NA 3O63A 2WV8A 4UTHA 1LLZA 1Y0EA 3KXQA 3N73A 4UTWA 3HG3A 4RKAA 1M5WA 1DJQA 1EB3A 4BWLA 1ZCOA 2WJZA 1AW5A 1W1ZA 1JCJA 2FIQA 3QF0A 3NQ6A 4ORMA 4B5NA 1KW1A 3GXPA 4X9SA 3TFCA 3CQ0A 3C2RA 1VYPX 3UWUA 2C15A 3LTPA 3G24A 3PF3A 2YR1A 3NQFA 4IPIA 1OFBA 1W54A 3UXAA 1BWKA 1AG1O 5J5RA 3I6RA 3G1SA 1PS9A 1KM3A 1R2SA 2CLFA 2PCQA 3HF3A 3KVKA 4E0CA 3AJXA 2QUVA 3VE7A 4XTIA 3T55A 1PCKA 5U7SA 2PURA 5KMYA 4ZL1A 4Q33A 5BMWA 3CHVA 5FF0A 3BW4A 5D2YA 5FEPA 1VYRA 4K6AA 4NZJA 4CNNA 4QAIA 2OJPA 1KM0A 3DFTA 3FS2A 5E0KA 1SSGA 3KRUA 1KTBA 2QJHA 1Q6RA 3R5EA 1R30A 5AC6A 4WOQA 5K4ZA 4JTFA 2J9ZA 2NXGA 3HB9A 1TSIA 1TYGA 2Y7EA 1TPDA 3MI6A 1EUAA 2VEMA 3EWYA 4K7YA 3TU9A 4FIQA 2DZVA 5DBTA 1EIXA 1VCFA 2FTPA 3L66A 2YDAA 2VFHA 3M5ZA 4Z08A 1H61A 1WAUA 5KZMA 3T7VA 2XN2A 3W7HA 4UCGA 3L9CA 3NZ1A 3B0VC 2JBMA 3EXSA 5DCDA 1R46A 2C19A 3G1FA 5KZDA 4WXYA 4YMZA 1JUKA 3CC1A 2B0MA 1G4PA 1FY6A 3ZR4A 3G3DA 3B0PA 2CZFA 3BLEA 3GK0A 4FX8A 4R7JA 4FF7A 4PL2A 1K7EA 4ONVA 3HMJG 1OFPA 2GQ9A 3FOKA 3W7MA 4LRTA 4ORIA 2DZUA 5IBXA 1K03A 3BLIA 4JDBA 3W72A 3OBKA 4AAJA 2CLHA 1XUZA 5MHBA 2GQAA 1KFLA 5G4EA 4OV9A 2QCLA 3W7LA 1N7KA 2OX1A 5FEWA 3W1AA 2O7QA 4MY8A 1PHWA 1LRQA 3LHVA 1AW1A 3F1QA 2DZWA 3IGUA 4P61A 2V30A 1D3HA 4M6QA 3NEVA 5DCEA 4MLRA 1OG0A 3NGJA 4WY0B 4GUIA 1HO1A 4JTIA 2CLOA 3IIOA 1L6SA 2OT1A 2CLLA 3M0ZA 3EEGA 1AMKA 4FNRA 5F4XA 1LM1A 3SY5A 3DU0A 4UMBA 5D33A 5AFDA 3SGUA 3QSTA 4KFNA 3H55A 3DGRA 1TV7A 1QPOA 4W9TA 4UFLA 2H8ZA 1A5BA 4IXXA 4MVAA 3S0CA 4BI6A 1UCWA 5FF2A 2X1SA 2ABAA 3TK7A 1Z48A 2C14A 2QCMA 3U8GA 3QYQA 1H7OA 1JQVA 3NQCA 3BW3A 1W5PA 3A23A 2ATSA 3OVRA 2V82A 3S6DA 4NU7A 3S5OA 4OQVA 2I1OA 1G7UA 3NPVA 4DBDA 2YX0A 4POCA 3W87A 5BNKA 1OYCA 3QMTA 4GRSA 5LSMA 3TMLA 4YXGA 4C1LA 4KWVA 5AHFA 3FA5A 4JD4A 3TAOA 2V5LA 2XN1A 3TIMA 3W84A 4BR1A 1W5OA 1WA3A 2EGZA 1F05A 3L0GA 3TJXA 1VHCA 4K38A 4WZHA 3W7QA 2W6RA 1F6KA 3ZS4A 1MXSA 2Q3RA 3P84A 2QCEA 4NXKA 3GR8A 2J27A 3R2GA 4O53A 4MYAA 1HFBA 2Z1BA 3HJZA 5D2WA 3E12A 2D73A 1YDOA 3S8HA 1G4EA 3MWAA 3LXCA 2V81A 4Z1BA 3TNOA 1F2JA 2QJGA 5F2MA 2ZZ2A 5GVJA 1QDSA 3P5YA 4I7VA 2R14A 4Z1DA 4X3ZA 4YCPA 3HGSA 3BVJA 4LT9A 2Y89A 2ZRVA 8TIMA 1Q3NA 4PTNA 1KV8A 2X1UA 2Y7DA 1GVFA 4M6PA 1K8ZA 4S2CA 1JULA 1X8FA 1GVRA 3W3OA 2ISWA 4RR4A 3W1RA 3LBCA 4EOUA 5DY3A 3RLUA 4OBTA 1LCOA 1OJXA 3PG9A 2DZTA 1O94A 1ME7A 4EF8A 2DJXA 2GJLA 3IIPA 4TIMA 5C54A 3QEZA 2JKAA 4MPQA 1SO4A 3IIZA 1H7RA 5KITA 3MP4A 2QUTA 5LGZA 2IQTA 1FXQA 4A22A 3UYCA 4OV4A 3W86A 3WJYA 3PVFA 1TB3A 3QPYA 5CPNA 1NFBA 2C16A 1MEIA 4GBUA 4NXSA 4RJEA 4O1CA 3L5LA 3EWUA 1Q6OA 1XBYA 2BXVA 1LRNA 2E68A 2YXGA 1DBTA 1H7PA 2CFFA 1GVQA 1WQ5A 2ALDA 4QISA 4MY1A 3OEXA 1VR6A 1Q6QA 1ZAJA 4O15A 1KTCA 4NX0A 5HMSA 3TE9A 3PSWA 2QCFA 1RQHA 3P67A 4WJEA 4E2BA 2C0AA 3UY7A 2P10A 3NA8A 1LDCA 4JTJA 1IIHA 2E1DA 3ANYA 1TO3A 4N2YA 4PA8A 4ZQRA 1LRTA 3IVTA 4QQ3A 1KA9F 1U83A 3RNDA 1BKSA 1WBHA 2XN0A 3PUDA 1WYIA 1H1ZA 4R34A 3QRHA 5A8GA 4OWGA 4GE8A 4QNWA 3W23A 4FNTA 2EHHA 5HINA 3SI9A 2J9XA 2A21A 2QDGA 4DPQA 3P61A 5KSWA 2FFCA 2QJIA 3W22A 3TFXA 1Z44A 1W3TA 5G2HA 4JXCA 2GVJA 1M7PA 5TBOA 1ME9A 1C9DA 4QM1A 2J88A 5CPLA 3GNNA 3O6CA 5A5WA 4O13A 4HKPA 5HJLA 1A53A 2G97A 1YTKA 3OHIA 3Q94A 3BGGA 1NF0A 2BWGA 4MOZA 2YW3A 2C3ZA 3W70A 5CZTA 4DF0A 1YDVA 2C13A 2QKFA 3C2VA 4X2RA 1D9EA 1FBAA 4LVBA 3MI3A 4CCCA 3O15A 3DBPA 4JYFA 3W1MA 2A4AA 3NM3A 1F5ZA 2OMAA 2DZXA 3G1XA 1TPB1 4XZ9A 3WK1A 4JTHA 4ALDA 4RZ6A 3LCXA 3V1PA 1P0NA 1KFBA 5EMUA 5K9DA 1X1ZA 3R13A 2VKZG 4N4QA 1RD5A 1I2RA 3LXAA 3THQA 4UFIA 2B7PA 3WJZA 5G5IA 2G96A 3EWWA 3NPXA 2E6YA 2YGYA 1F6PA 3DI0A 4CCEA 1SZEA 2FQIA 1SFJA 4N9BA 5EYWA 3M9YA 5LNWA 3W1UA 3IIXA 5CG7A 3DFOA 1G4SA 5H91A 4LRSA 1QMLA 3GR7A 4UMCA 3I7QA 4O1DA 3W2JA 4JYEA 3TXZA 5C5YA 1LROA 4AVFA 2Y7GA 2Z6JA 2NWSA 4LUJA 2J6XA 1TPH1 3IV3A 1I2QA 1HUVA 4UR8A 3T78A 1SUXA 2Y88A 4N4PA 3IIVA 3S1WA 3GKFA 1ZAIA 2EPHA 3UWQA 3SSJA 1RV8A 1SW7A 3W85A 2V2CA 2AAMA 2NX3A 3B04A 2TPSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4M6PA

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