4XV0 | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	EASQSIDQLIKRKGKLYFGTATDRGLLQREKNAAIIQADLGQVTPENSMKWQSLENNQGQLNWGDADYLVNFAQQNGKSIRGHTLIWHSQLPAWVNNINNADTLRQVIRTHVSTVVGRYKGKIRAWDVVNEIFNEDGTLRSSVFSRLLGEEFVSIAFRAARDADPSARLYINDYNLDRANYGKVNGLKTYVSKWISQGVPIDGIGSQSHLSGGGGSGTLGALQQLATVPVTELAITELDIQGAPTTDYTQVVQACLSVSKCVGITVWGISDKDSWRASTNPLLFDANFNPKPAYNSIVGILQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Beta-xylanase
publication title	Crystal structure of an endo-beta-1,4-xylanase (glycoside hydrolase family 10/GH10) enzyme from Trichoderma reesei rcsb
source organism	Hypocrea jecorina
total genus	128
structure length	302
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2015-01-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xv0A00

2O9RA 1PAMA 1EXPA 1BYAA 3WH7A 1BAGA 3GDBA 3OLIA 1EA9C 2PBGA 4W87A 5LA1A 3VU2A 2DSUA 1Q6GA 1WB0A 1J9YA 2ZX7A 4JAWA 3L2LA 3ZSTA 1EHAA 1V02E 2NT0A 3WNNA 4TVUA 5I2UA 4HMDA 3PZUA 3JUGA 2QMJA 1J0HA 4WKFA 1KCKA 1E0WA 2WCAA 5CG0A 4P7NA 4TXEA 2MANA 3POHA 4GQRA 3ALGA 4GINA 1EOKA 1H49A 2D1ZA 1B0IA 2FGZA 2VURA 3T2OA 2EPLX 1Q4NX 3VVGA 1ISYA 3N12A 2RGLA 3MMWA 5DF0A 1QBBA 4NRRA 1JDAA 5AYIA 3WL1A 1AQ0A 1GVIA 5BCAA 1J0YA 4OUEA 3BSGA 1ITXA 4XV0A 5DMYA 3WFZA 3TOPA 1W1VA 4JCMA 4P8VA 4MNMA 5A6KA 1C8XA 1JAEA 1FHDA 2J7CA 3OA5A 4YN5A 5A8PA 3VDBA 4F9JA 2QV4A 3WD0A 4CD4A 1XCXA 1D7FA 1QPKA 3UR7A 3VUPA 1Q6EA 4W5ZA 1UA3A 2FHFA 2W4XA 4B15A 3K8KA 1H11A 4H04A 4XUYA 1D2KA 3S6TA 4MNLA 4QP0A 2CITA 2WANA 1VJZA 2J62A 2PWHA 4MAVA 3DHPA 1V3IA 5IXEA 3T0BA 3N13A 3MSGA 2AOSA 2CHOA 3VIJA 1J01A 1MQRA 2WZIA 3VKKA 3QHMA 3WMSA 1UWTA 1VBUA 4AY1A 1UR9A 3WY1A 5I24A 1JFHA 4N42A 4NZCA 2GJPA 2RGMA 2WMHA 4AWEA 3CUGA 1KB3A 3VGHA 2OLHA 1GHRA 1L0PA 1ZBKA 3DYMA 2XVNA 1NWUA 1HIZA 1GQKA 1JZ3A 3GXMA 5ABEA 1CECA 3AZSA 2YL6A 1LG1A 3TTQA 1M53A 4LXFA 1CXIA 4AISA 4DWSB 3CUFA 2BNJA 2F2HA 2IXVA 2YBTA 2VQTA 4GI6A 4GZIA 1OBAA 4HOWA 1OINA 2XVKA 2BFGA 1WDSA 4R27A 4W8BA 1XSJA 1H2JA 2YIHA 4OBSA 1W3KA 3WN6A 4Z2HA 1JZ7A 1UR8A 5HPOA 1V02A 4DWSD 3W29A 3MUY1 3AMLA 3AZRA 1W3LA 4W8LA 1V0NA 4HA4A 2Y5EA 4L4OA 3BMVA 4W89A 4DM2A 2E9LA 2W66A 5E9AA 2JIWA 3PN8A 5JIPA 3CTTA 2EEXA 2BY0A 1FP8A 3AMKA 2VX4A 2JFEX 1QI4A 8A3HA 3CHEA 3W38A 3MV11 3PZGA 4PMXA 2WWCA 1E70M 2GFTA 5JBEA 2EXOA 4J3UA 4D6IA 4ML4A 4GIAA 2XFYA 3DC0A 4H7VA 4AD2A 4DWSA 1R86A 3BMWA 4AIEA 1PX4A 1XRVA 1JAKA 2GJXB 2X0HA 4E2OA 3CHCA 3N1AA 5BRPA 2VJXA 4GO8A 1WO2A 4HTYA 2CXGA 3W28A 1JD7A 4U2YA 2W92A 8CGTA 3ARUA 2VRJA 3WF3A 3QOKA 4UTFA 3WNLA 1FFRA 1GORA 4W7WA 1E1EA 3T2QA 4URIA 1CGTA 3BAJA 2J74A 3CUHA 2G3NA 5IHRA 1I75A 2QPSA 2J7BA 3WBAA 3FHAA 3WD1A 3ZIZA 3L4YA 1QVBA 5I79A 1NP0A 1ECEA 3ZT6A 5CPQA 3ZO9A 3K8MA 4CD6A 4GI8A 5KEZA 1WDQA 2YOCA 2GJXA 2XVPA 1R7AA 5I5RA 1US3A 2OSWA 1QI2A 3M46A 2CEQA 1W1TA 4AZGA 4ZE4A 4JIEA 3RM8A 3MS8A 5BYWA 5CGTA 4C7FA 1NWSA 4HPHA 1TFVA 1KR1A 5A3HA 2XVGA 3I3DA 3ARZA 4NSBA 2J78A 4FMVA 2VX6A 3BH4A 3EYPA 4J3XA 4MNJA 2BS9A 2X05A 2DDXA 4Q7NA 1V6XA 5FL0A 2A3HA 3F5LA 4KWUA 4BA0A 1QNOA 4JCLA 3EMCA 5IHSA 2D23A 4PTXA 5DT5A 4AZHA 4QDMA 1UD3A 3ARPA 2IXUA 2XYLA 1OM0A 4PEEA 3GZAA 4CCEA 2WCSA 1OIMA 4UFLA 3GNRA 2CBJA 3AIBA 1W9BM 1ZL1A 1NOFA 1EDGA 1L8NA 5EFDA 3HU7A 2OSXA 4KRUA 1E3XA 1UA7A 4KGJA 1E9LA 1BPLB 2XUCA 4ACZB 4LGXA 2HISA 1CXEA 1NQ6A 3CUIA 4U31A 5A1AA 2ESCA 4F9DA 5ABGA 2YJQA 1C93A 2DH3A 1JG9A 3SCVA 4CN1A 3WENA 1HKKA 3WH8A 2C0HA 3GH7A 2BVYA 1GQIA 4HOZA 1GQLA 3WMCA 2XHYA 3FAXA 5EBAA 1V0LA 3MKKA 2WCGA 1NOUA 3OBAA 1UZ1A 5A8NA 2J4GA 4J27A 1X6LA 3F5KA 3OIHA 4CUCA 3WDHA 3S2CA 3VGBA 2YA1A 3L4XA 2ZOXA 3SCPA 1H3GA 1E55A 1C7SA 1GOWA 4EK7A 2ZUTA 4AD5A 1OD0A 3QGVA 1KGUA 3AFBA 4W93A 1BYBA 1SMDA 2YL5A 3EBVA 1XV8A 2D0FA 4AD3A 4PUEA 1RP9A 1HJWA 5CPSA 4B16A 1CXHA 2WXDM 1RD6A 3SUVA 3SUWA 4P8UA 2YDSA 1UH4A 1ISVA 5A8MA 1PX8A 2O9OA 5D8WA 5GPRA 1XC6A 3RDKA 3WDPP 3AOFA 4E4PA 1UD2A 4CN6A 1E4MM 3SCQA 4PMVA 3SCRA 1M7XA 1Q6CA 2AAAA 2WVTA 4OOUA 4PCTA 1D3CA 2Y2WA 1JDCA 3ARXA 2BY2A 2JF6A 1B3ZA 2JEQA 3WD4A 1OWQA 2YLAA 5M17A 5A2BA 1QNPA 3ZMRA 2WHMA 2AMGA 4CU8A 5DO8A 4B9ZA 3WIJA 5HXMA 1EGZA 3AZTA 2WVVB 3FAWA 2CYGA 3KL5A 3CHDA 5A6JA 3SCTA 1R7OA 2D3LA 4D6JA 4LX4A 3EDJA 2B31A 4UZSA 4QCFA 2O9TA 3AIUA 4PYSA 1FA2A 2VQUA 3DHUA 4J28A 2NSXA 3IANA 3DYOA 1EO5A 2Z1KA 1E6RA 2EJ1A 4A3HA 5E0CA 2WHLA 2J8FA 5DEZA 3QHOA 3BLKA 4GZJA 3A4AA 3ZT7A 1QHPA 5CPTA 5LYRA 4XX6A 1WCGA 4BQ2A 3RO8A 1W2VA 1O6IA 2W91A 3K1DA 3K4AA 4Z2GA 5AC4A 4FLQA 3RIKA 1E6XM 4JFTA 4BZYA 1WAWA 1MFVA 3CGTA 4S3JA 4WJXA 4BF7A 5A94A 3L2MA 4UFIA 1BVNP 4HOXA 1GQJA 2BHYA 2WMFA 1WDRA 2VOTA 3WELA 2WVVA 1J0JA 4HZ8A 2CPUA 1B30A 2E4TA 4JL1A 3VM5A 5A95A 1WE5A 1XYZA 1MFUA 2HVMA 1W9UA 4M81A 4PTWA 3VDCA 2WSPA 4OZOA 2D22A 3WQ6A 4TVCA 1QNQA 1S46A 3WFLA 1UWQA 5A69A 5GNYA 3CPUA 2QMKA 1SFSA 3U57A 2OWCA 1HKMA 4MNKA 3VDAA 1BFNA 1BVZA 3CO4A 3NJ3A 4FF5A 4J3TA 1GNXA 4AZ6A 2FH8A 5CLWA 1HF6A 3CBWA 2VVSA 1Y7VA 1JGIA 1MXDA 1CGUA 5E6YA 4JFWA 3PZMA 1R8LA 1GW1A 5CXPA 3N04A 2VZUA 4H2CA 2XIBA 2BHUA 1HKIA 1ODUA 4BQ4A 3BCFA 3PBGA 4U5KA 3J7HA 1W32A 4W7UA 3PZTA 3M6DA 2X1IA 3WQVA 4LPCA 3VDHA 2Q8XA 2VR5A 2WYSA 1J10A 2CIPA 4HMEA 1RPKA 4FK9A 3RPMA 4AZBA 3KZSA 1Q6DA 1U33A 6A3HA 3GH4A 4PMUA 2WC3A 5CZKA 4WKHA 2C7FA 4XZBA 1BG4A 1HP5A 2YL9A 1KWKA 5FL1A 1JI2A 3PZQA 4H41A 5C70A 3AQUA 1HJVA 5M3WA 1HP4A 2J7HA 1KXVA 4FLOA 4MPKA 3MMDA 1ESWA 4C7GA 1AVAA 2E40A 3WD2A 1GUVA 4GKLA 1V08A 3PZNA 4QAWA 4EKJA 3VGEA 1G0CA 1JF6A 3AXHA 3T0AA 1K9TA 5AYBA 1VFFA 4FLSA 1HJUA 2OYKA 3VGGA 1OD8A 4W84A 1ISXA 4P8WA 1XH1A 1PBGA 1HVXA 1UKTA 2VMFA 2DT1A 5I23A 3TA9A 3FXYA 4DUWA 1GOKA 1C90A 3VIMA 1TR1A 5E70A 1DEDA 1LL6A 1EDQA 5D9PA 3SCSA 5FD0A 2VUYA 3GNPA 2X8RA 5D9NA 1H5VA 2OYMA 5CJ5A 3ZSSA 1TA3B 1W1YA 1JZ4A 3WH5A 1AQHA 1GJUA 2OSYA 4UQCA 3PZIA 1WZMA 2G3IA 3WUEA 3N17A 2J75A 3KWXA 1EQPA 1XHGA 2J47A 2D20A 1E1FA 3FN9A 5CQ1A 1BYDA 3THDA 4UOZA 1E56A 2D0GA 3PHAA 5HBFA 5I0DA 4ZENA 1OGGA 3AIEA 3U5UA 3L4UA 1MW2A 3CZ8A 2UY2A 3GTNA 4U2ZA 1J0IA 1GOQA 4F8XA 1VEPA 1ITCA 1KWGA 2V3FA 4H8VA 4KH2A 3W81A 4AD4A 1VRXA 2VNCA 5C71A 5AY7A 3RILA 2E8ZA 1OGBA 1UKOA 1GCYA 3WUBA 2V5CA 1HX0A 3VINA 2FDMA 5KZ6A 2VT0A 2DSKA 1FP9A 4V28A 1KXHA 3UCQA 5DT7A 1BF2A 3KE0A 1GOOA 3WDJA 1JZ2A 1TA3A 9CGTA 1ZBCA 2ZXQA 5ABHA 4GXPA 2DT3A 2YDRA 1CDGA 3WMBA 1TZ7A 2Y8VA 4UZUA 1EHNA 5A8OA 1TG7A 1GPFA 4XZWA 3AIQA 1BG9A 2WZEA 3OLGA 4D6EA 3UG5A 2F8QA 2VCBA 1I1WA 1B3WA 1M01A 4PMNA 1LQ0A 3BAWA 3OZPA 1W9PA 4MB1A 4UOQA 2WW5A 4W85A 4AEEA 2XWEA 4EANA 1QNSA 2WAGA 2XJ7A 3VPLA 1J11A 1NWTA 1FFQA 3EDDA 3WH6A 1G9HA 2YBUA 4M1RA 1H1NA 4AZ7A 3W24A 3VNYA 2YKKA 3L4ZA 3WDIA 3WKZA 1CGXA 3CMJA 3T08A 1H09A 1DWGM 4JFSA 4PSPA 3EMZA 4PBGA 3UESA 1KCLA 1OT1A 1UKPA 2ZWZA 4FLRA 4IM4A 1E15A 4CN4A 1WZLA 3A6OA 3L4WA 1V0KA 4U33A 2E8YA 3PTMA 3AHYA 2G3JA 2A3BA 1M04A 4WSJA 1W3JA 2ZIDA 1CGWA 4UFMA 1TMQA 3A47A 5A2AA 5ABFB 3VD7A 2DPEA 2EPKX 3ARTA 1CYGA 3FHQA 4D6CA 2VCCA 2J77A 4JKKA 2GVYA 3AHTA 1Q6FA 4BQ5A 4M29A 3WEMA 1KXTA 1UR0A 3BSHA 4D6DA 1BTCA 1F4HA 3D5HA 1UWIA 3KL3A 4CVUA 4DM1A 1JYNA 1XH0A 1LF1A 2DQXA 2O92A 1FHLA 3OGSA 3NCOA 3CZLA 1CIUA 1KQZA 3N9KA 1E4LA 3GXDA 1FH7A 4AW7A 1V3MA 2FH6A 3ARSA 3VX0A 4QLKA 1WPCA 4PUDA 1CBGA 1UG6A 2V3EA 2W62A 5ABFA 2WLZA 4WSKA 3CH9A 2WHKA 4P7QA 3TONA 5A6LA 4NRSA 4PMRA 4WLCA 1W1PA 3QHNA 1C92A 4J3VA 1OIFA 1E73M 3AICA 4W8AA 3LMYA 3MMUA 5IDIA 1OB0A 2VZOA 1E3ZA 4AZIA 3CZEA 3U7VA 4OBRA 2OWXA 4V2XA 1DHKA 5TD4A 3A3HA 1UUQA 3ZJ7A 3GH5A 4JFVA 5A8QA 1ZBWA 2W67A 3WQWA 3PZ9A 4U5IA 2YLLA 2VC9A 3U7BA 1JZ6A 4MJ2A 2BVTA 2PF0A 1ZB5A 1TUXA 2YA2A 1MW3A 3NIYA 1JYVA 4H8UA 1LLOA 4D1IA 2JIEA 1A3HA 2WK2A 3II1A 4LQ1A 4TX6A 2VTFA 1ZJBA 2WSKA 2F61A 4GQQA 1CPUA 5BXSA 4M80A 4S3KA 5EB8A 4PTMA 3VD5A 2Z1SA 4R5EA 3WL0A 4Y7EA 1EIBA 2UY3A 2WMKA 2X2YA 1X1NA 3L4TA 3W6LA 3OLDA 2VL4A 1QW8A 1KBKA 3AHXA 1J18A 2PWGA 2UY5A 3UR8A 4UFHA 4MB3A 3VTRA 3BGAA 1GZJA 2EBNA 3IJ8A 1HL9A 2CESA 3K46A 4LYQA 1KQYA 1HJXA 2EPMX 3AJ7A 3ZR6A 2YL8A 1E0XA 1UZ4A 4OKDA 1CXKA 3IJ9A 1PJ9A 1E72M 4HA1A 2W63A 4HZ7A 1H41A 4J7RA 3VIIA 2JALA 2XWDA 4JKMA 5CGMA 3SCNA 2VRKA 3VIOA 1G94A 4ACZA 2X0YA 3OGVA 2WLYA 1W9XA 1HL8A 5ECUA 5E0FA 4C7DA 1YHTA 2CNCA 4CVWA 4E8DA 2YDQA 1CLVA 3WQ4A 1WDPA 1FOBA 3RJXA 1HJQA 2W5FA 2GDVA 3ARYA 1C3FA 2ZXAA 1UD5A 2XGIA 4PSRA 4MDOA 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1E6PA 1HT6A 4PTVA 1VBRA 4HPGA 2DIEA 3FY1A 1V3HA 1VFUA 4WIWA 2DGAA 6TAAA 3AXXA 2VI0A 1QI3A 3ARRA 5LA2A 4KMQA 4HMCA 4UFJA 5HNNA 3VGFA 1J12A 3WD3A 2WC7A 3NSXA 1HJSA 2J7EA 2UWFA 2VR4A 1EDTA 5IFPA 4TTGA 1V3KA 1CXFA 1WZAA 1XSIA 4GZEA 4AYSA 1B90A 1C7TA 1F4AA 5CSUA 5A6BD 4UQ9A 1B2YA 4LYPA 5E6ZA 2JF7A 4GO9A 3N18A 3ARWA 3CHFA 1JFXA 3T09A 1VFMA 4WKAA 3O9NA 4RE4A 1J0KA 2EPOA 4J3SA 4P7RA 1HKJA 1CNVA 3ZQ9A 1MW0A 1VIWA 3BAYA 3CUJA 1E40A 1YQ2A 4QFUA 4UQDA 3W0KA 4YPJA 4IUGA 1H4PA 1NARA 4PRWA 3NSNA 3W26A 3NYDA 1P6WA 5A6BA 3ALFA 1V6VA 3GYCA 4OOZA 2ZUVA 1UH2A 2IUZA 2JEPA 3CLWA 2J7GA 1OGSA 1IZJA 1V6WA 2GK1B 3B9AA 2XFRA 4RE2A 4TX8A 1XD0A 4A3YA 1PX3A 2ZUWA 1ZBVA 1JD9A 2PI6A 1BSIA 4MB5A 1C8QA 3AS0A 4MTVA 2D3NA 3APGA 2DIJA 1JNDA 1TCMA 2VX5A 1IV8A 1B1YA 5A2CA 1PEZA 3ZJ6A 1FH9A 2WBKA 3VM7A 3WDQA 5A6MA 1TE1A 3AS1A 4P7LA 1V6YA 2WKGA 3WBEA 1EQCA 4X0VA 1PIFA 2ZX6A 4OJYA 2FHCA 4J3WA 3CZJA 2CBVA 2O9PA 3RM4A 1V0MA 3A4XA 1GJWA 2G8ZA 1LWJA 4PCSA 1VEOA 1H0IA 1CGVA 1AQMA 2BXZA 3W37A 2DT2A 2ZUMA 3EMQA 1RH9A 2NT1A 3FNDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KXQ A;  2QPU A;  4D6G A;  4YHG A;  5F7U A;  4WF7 A;  4CCD A;  1V3J A;  3OLE A;  4KGL A;  5D8Z A;  3AIR A;  2W61 A;  1JL8 A;  3I3E A;  3HMC A;  4QLL A;  4HU8 A;  5JIW A;  1JZ8 A;  1B3X A;  2PWF A;  2BXY A;  1NM9 A;  2XFF A;  2VVN A;  4IPL A;  1KR0 A;  4P8X A;  2CBU A;  3SUR A;  3WQ8 A;  3WEZ A;  7CGT A;  4Z2K A;  2E0P A;  5GNX A;  4JKL A;  3ARQ A;  3NDY A;  5HDR A;  5FCZ A;  1RP8 A;  1CWY A;  4YHE A;  3VD4 A;  4MDP A;  3IAP A;  1HNY A;  1PZ3 A;  3AXI A;  1UKS A;  3WDR A;  1GOI A;  1PIG A;  4MAD A;  4UR9 A;  1XGZ A;  4JZ5 A;  4PN2 A;  4U3A A;  2XPK A;  2CHN A;  3AYS A;  1PPI A;  1GOM A;  4AMC A;  1JI1 A;  1DTU A;  1CZ1 A;  2TAA A;  2V3D A;  1R85 A;  3BC9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XV0A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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