3HPX | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	407
structure length	407
Chain Sequence	IVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	2-isopropylmalate synthase
publication title	Removal of the C-terminal regulatory domain of alpha-isopropylmalate synthase disrupts functional substrate binding pubmed doi rcsb
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	148
structure length	407
sequence length	407
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2009-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3hpxA01

4G1KA 4DQWA 1ML1A 1TPVA 4LS0A 1KBIA 3LHVA 3HPSA 1VYRA 1VQTA 3W7NA 4TIMA 3FYOA 1G69A 2PURA 3SECA 2C13A 2X1SA 1BWKA 3W74A 2ZZ6A 3E49A 3PSVA 1SSDA 4DF2A 3C2VA 4FEZA 3W1NA 3OVQA 2CLKA 4N2YA 3L2IA 1AMKA 1FCBA 5D2TA 2Q3OA 3MUXA 1PCWA 4H4IA 3W7OA 2VFDA 4EF9A 4AF0A 1OFRA 5HR6A 1WOBA 2XN0A 4AVFA 2BLEA 4X22A 3L5AA 3GLCA 5E93A 3QRHA 5CG7A 1B4KA 4WJEA 1N7KA 3LTSA 3PAJA 3PR2A 2Y7DA 3W9ZA 3IIOA 1Q3NA 3P82A 2RFGA 3MI3A 3RK8A 4OU1A 3W7JA 4ML9A 3WK2A 3CB8A 3QW4B 2CLMA 2JGQA 3THAA 4PCFA 5DXXA 4MKNA 1X8FA 1K8YA 3P8IA 3H54A 4MFDA 3C2RA 2ATMA 2JGYA 4UNKA 4WY0F 1XDLA 1H62A 2J24A 3NQ8A 1GVOA 1WA3A 1Z41A 3LLFA 3W1PA 5FF0A 4ONVA 1R47A 3UXAA 3LCWA 3M41A 3DFSA 5CPMA 3D0CA 4K37A 1D3GA 1HO1A 1H7RA 1LBLA 3LTYA 2C1HA 1XDMA 3NPWA 5K9CA 1SQ7A 1TV8A 2FFCA 1F5ZA 1OHLA 4IXHA 1TTJA 3R2GA 3DFQA 1Z48A 1V5XA 1NAL1 4ALDA 3UWYA 1KM2A 3NL5A 4MZYA 2OJPA 4NT0A 4DO5A 3PUDA 2CZEA 4O54A 3NO5A 3TXVA 3GB6A 4JTUA 1NEYA 3IIXA 3MMTA 3G24A 4Z0SA 3UPBA 2CU0A 4W9TA 1HFBA 2X1TA 3LCLA 2DZSA 1QO2A 1ZJIA 1KW1A 2CZ5A 3Q37A 2DZVA 2QAFA 2JK2A 5F4SA 2C18A 4AF0B 1XC4A 4N9DA 5KZMA 2DZPA 5D09A 1YTEA 3IIVA 3OEXA 1EWDA 3E02A 3TC6A 4HHPA 4OT7A 1C8VA 4HSNA 5FI8A 2PE4A 2YZRA 1U83A 2NUXA 1OX4A 4FXRA 2WSQA 2KZHA 2Z6IA 2PC4A 2QUUA 3O15A 3W70A 4U4MA 5KZDA 5H2ZA 2Z1BA 1AL7A 1R30A 1TV7A 3N9SA 3FIGA 5FEZA 4JTLA 4TR9A 3LXBA 3GAYA 4NUWA 5FEWA 5F2LA 5A5WA 3W1XA 1OVDA 4O0ZA 1NF7A 3QW3A 3UD6A 1OF6A 1DVJA 4GNJA 1S5WA 5HMSA 2BSLA 1GT8A 5K4XA 5C5YA 4HKPA 3GDLA 1P5BA 4EVZA 3W2JA 2AQWA 3EEGA 4QIUA 5I3FA 3R12A 4LVBA 4AB4A 2X1UA 3NQGA 2R91A 3M5YA 3FJ6A 2QCFA 3W85A 2A4AA 5D2XA 4CCDA 4IX2A 3W7GA 4BK9A 1LM1A 3U6WA 4GUJA 4NVTA 4Y6GA 1DHPA 1H1YA 1W5MA 1UASA 3NQEA 5U4NA 3BGGA 3EX4A 3JR2A 5AHLA 3A22A 3WK0A 1CX9A 3A23A 4PTNA 1F05A 3W7KA 4Q33A 4UFLA 4NZFA 5KSWA 4FHAA 3TX9A 3NQMA 2D73A 1TQJA 2WOQA 3CWOX 3EX6A 2Q8LA 2QEZA 4XUGA 1AW2A 4JGDA 3W2KA 4TMBA 1F2JA 3G1DA 3CT7A 1LLWA 1DKWA 3ZS4A 1YPIA 5HULA 3CWNA 2EGZA 3GXPA 4JEQA 2FQIA 3RLUA 3QJAA 2E6FA 3KVLA 1G6CA 2TMDA 5CSRA 4RJEA 1O5KA 1IGSA 3DGRA 5DBUA 1C29A 1OX4B 1TTPA 2B7QA 2DZUA 2ZFAA 4LUIA 2GPTA 4FX6M 2VKZG 4LY8A 3TQVA 1L6YA 2CZFA 3S6DA 3LCGA 3W7QA 1LP6A 3BLEA 3LCXA 1L6WA 2ZA3A 3FKKA 3GAKA 1G7UA 3C2FA 3W2MA 1JRCA 1TPH1 2DJLA 1DJQA 1T99A 2NUYA 4LOCA 2P0OA 3L21A 1DORA 1TPWA 1YYAA 4GUFA 4RZ5A 3B0PA 3F4WA 4GE8A 1JQXA 2VEMA 5AC8A 3JRKA 3TKFA 2YFOA 3N2MA 3PY2A 4JYEA 1G4TA 4JXCA 4UFMA 3NYZA 3VKJA 3NNTA 3LGEA 1TJRA 3FJLA 2E1DA 3IEBA 3LRLA 3A21A 3WJZA 1VS1A 3BW4A 4IOTA 5LNSA 3G22A 3DKLA 3IV3A 1G4SA 2JBMA 4N4PA 3G1VA 1KTBA 2WKJA 4DF1A 1O4UA 3LLDA 5J5RA 3MP4A 4WXZA 3C8FA 1SZFA 3TUUA 1QWGA 3LRMA 1FWWA 3G0SA 3PUEA 4WXYA 4HN4A 1VLWA 4WOZA 2CLHA 1J5TA 5CPLA 1UUMA 3EB2A 4NJJA 3AO0A 4OHQA 1AL8A 2Q8ZA 1TYGA 3M7WA 2FPVA 3L0NA 4H6KA 4MLRA 1AG1O 3TAOA 4AEOA 3USBA 1TREA 2HS8A 3WK3A 2X2GA 4UMAA 1J2WA 5CPNA 2O7QA 4AWUA 3UXDA 1DQWA 4JN6A 1TPB1 3OG3A 2QF7A 4LVDA 3TV8A 1W5QA 1O94A 4LV9A 3W76A 2Q3RA 1ICSA 5EKYA 5I3GA 4IUOA 1QPRA 3QQ1A 5CZTA 3GDMA 1Q45A 4BR1A 4XBSA 2GQ8A 2Y61A 3WJXA 3NZRA 3P84A 4XWUA 2HS6A 4IXXA 4NXKA 4FNQA 1W3NA 1W5PA 3IGXA 5BW6A 5HWJA 2XN1A 1TTIA 3BARA 4CNNA 3DFOA 3WJYA 1KV5A 1QMLA 5FF2A 5G1TA 3W7EA 4MYXA 4O1CA 4FXSA 3CIXA 3KRSA 3EX1A 2ZDRA 3CHVA 1PHQA 4ZZ9A 4I7UA 4IMDA 1I2OA 4MY1A 1SUXA 1KTNA 2OX1A 2AAMA 4PH6A 3LX9A 2ISWA 2WJZA 1E51A 2J88A 3P5ZA 2ZZ3A 2NX1A 3QSTA 1DJNA 4OV4A 3TSBA 1FCQA 2EPHA 4UR8A 3LTPA 2ISSA 2V81A 1A5CA 4JX4A 2QCGA 4JTGA 4KKXA 3VNDA 3OVRA 2YPIA 3N2XA 3I68A 3IGSA 1VCFA 3C52A 3GVGA 2ZRUA 1AW5A 3DI0A 3DXIA 3W7MA 4NX5A 1ZAHA 1ZCOA 3G0XA 2H3DA 4LUJA 3CQ0A 1N55A 3S5OA 3DU0A 2NV1A 1R2RA 3QMRA 1AK5A 2VELA 3GKFA 3G0UA 5EBUA 2CLFA 1Q6OA 2YX0A 3LBMA 5AOUA 5G4WA 1OK6A 3GIYA 2A6LA 5C2XA 3W1TA 1SW3A 4E38A 4AWTA 4CCCA 4KFPA 2YGYA 4Z1CA 3KFTA 1A5SA 4Z0JA 3W75A 1KFJA 5BRBA 3NDOA 4QNWA 1K7XA 3DENA 3KOFA 2J9ZA 3O05A 4WUIA 1IXQA 1K3UA 3HG3A 3O16A 4JX5A 4X2RA 5MHBA 2B7NA 5KINA 1TQXA 3I7QA 2PRMA 4K8HA 4ZQMA 4FNSA 4DPPA 3G8EA 3QFEA 1QCWA 4Y90A 3PB0A 1ALDA 1SO5A 3NQFA 3LHUA 1T96A 5CZSA 1W8SA 1FWNA 3SJ3A 1SO4A 4FNUA 1PIIA 3TSMA 3Q2DA 4PEKA 3S5YA 2TSYA 3ABSA 3O1NA 1JR1A 3BG3A 1VHCA 1XBZA 3A5FA 1M5WA 4JIPA 2V5LA 1GOXA 3ZR4A 4FB7A 2ZRVA 3MJYA 4EOUA 2Y85A 4IPJA 2B7OA 4PC8A 4BI7A 1LROA 1OYCA 1SU5A 3G1FA 3GXTA 3ELFA 1KLYA 2VFEA 2LLEA 2QJGA 4JD4A 1MXSA 5ABTA 3W71A 3MWAA 2PCQA 4JIQA 3U8GA 2ZRZA 4GC4A 3LV6A 3TMLA 1W3TA 1TO3A 4QNEA 1DQXA 4Y96A 1GG1A 5AC6A 3B03A 1JCYA 3TE9A 3B05A 2BX7A 4UMBA 3CEPA 3W1RA 2V8ZA 2ZZ2A 5TBOA 4JTSA 4LT9A 1H1ZA 3E96A 4JS3A 2EAWA 1A50A 1K8XA 3HMJG 3O07A 2WNNA 4XTIA 1YXDA 1Q6RA 3NOEA 4FX8A 3LCFA 3P61A 4S2CA 2QCNA 3STEA 1HUVA 3P8JA 4ICNA 5HJLA 3WJSA 1JCLA 4R33A 2YYTA 3EWBX 5LNRA 1WQ5A 1WV2A 3LXAA 5KITA 1GVRA 1W5NA 1KV8A 1QPQA 1GJPA 2QR6A 5D02A 2EF9A 3P60A 3HGSA 1GVSA 1WAUA 2WPBA 4HPXA 4YWIA 2CLEA 1OX5A 3KHJA 2A0NA 4UTUA 5LZLA 4N6EA 4N02A 4MZ1A 4NNBA 4Z08A 1M7PA 3W1QA 4JTJA 2YDAA 5C55A 3W1LA 2CLIA 1NF0A 4K6AA 1TIMA 3TDFA 3UWWA 1WYIA 3W2NA 4LNYA 3W3OA 4UTHA 1F7BA 4IQLA 4LS2A 3UPWA 4MY8A 3C56A 3NQVA 4Q32A 4BFAA 2H90A 5J5DA 3IVSA 1ZHAA 1KM4A 5E1QA 1FY6A 3OBKA 4AXKA 3MI6A 4K7VA 1KFEA 3GNNA 4UTKA 3SZ8A 3BGJA 1QPOA 3MI2A 4NQ1A 1HTIA 1SFLA 4O17A 3M5XA 2R14A 3DFPA 3MYOA 1GVFA 4GJ1A 3F1QA 2CZDA 2ZA1A 2R8WA 3NPUA 4JR5A 1ZALA 1VLIA 3GKAA 1LTDA 2OT1A 3RU6A 3DHFA 3W22A 1GG0A 1TPDA 1VPXA 5HNRA 1FDYA 3QYQA 2W6RA 2C6QA 1ZENA 4K36A 2C19A 3Q94A 5SWUA 1H7NA 1JCMP 1YXYA 5BNKA 3C61A 1RPXA 5FEPA 2GJLA 4RCXA 4MLJA 1T8XA 1OX6A 2AGKA 3E12A 5EL1A 5LNVA 4A3UA 2JKPA 3TIMA 3M16A 1MSSA 1JRBA 1EEPA 3LBCA 4MUZA 1H50A 4Z1AA 5CSSA 3JS3A 1TTQA 1RVGA 2Y70A 1Q6QA 1KM6A 4LW7A 3EWUA 1OYBA 1IF2A 1QOQA 1DV7A 4JX6A 4XBKA 1IXOA 2TYSA 5D03A 1I2PA 3DKJA 3W7HA 4UFJA 4M6QA 5AYZA 1NFBA 5I3JA 4OE7A 3RLVA 4BWLA 3DZ1A 5L6UA 4BI6A 5LHFA 2GOUA 1OYAA 1EIXA 5AB3A 5AN7A 5DBTA 5DCDA 2J6XA 3T40A 3E0IA 2WNQA 4UIOA 2FTPA 2OZ0A 5HINA 3TQKA 1XKYA 4JTFA 3W87A 1K7EA 1A5BA 3L0KA 1XBYA 4O53A 3NG3A 4O15A 1EWEA 5F4XA 2V5BA 1TRIA 2C15A 3I7SA 4GFSA 3G1AA 4FNPA 3EWWA 3QEZA 4C1KA 2VENA 3LCIA 1I2QA 2OT0A 2NZLA 3I6RA 3P5YA 3HGJA 1DBTA 5DCBA 1J4EA 1TMHA 3TC7A 2P1FA 3N34A 2Y88A 1EP1A 3NL6A 4JY8A 4AHPA 5F1VA 3H55A 2J9XA 1MEIA 3DBPA 1VR6A 3GZ3A 2WSRA 4HSOA 4ZQNA 5AFDA 2NLIA 1YTKA 4L4MA 3R5EA 3SR7A 4A22A 1WBJA 5AHMA 1JJKA 3G3MA 1F74A 3S0CA 1YDVA 2G5WA 4CQ8A 3FEMA 1UJPA 4O57A 3A24A 3OHIA 1NVMA 3CC1A 4ZQOA 1G7VA 3QSRA 5CPOA 4IGHA 3P81A 5CGQA 2WO5A 5AHEA 1RD5A 3SGZA 3PG8A 1P1XA 3MHUA 2YR1A 2A85A 5D04C 4HT3A 3VCRA 4QISA 3C6CA 1VZWA 2CWNA 4P61A 2E5CA 2ZZ7A 5LNWA 3P62A 2ZBTA 3N73A 3W07A 5EYWA 2J9YA 4EIVA 3TK7A 1ZNNA 3S1WA 4LS1A 3CTLA 2I9EA 2E6AA 3BO9A 4XKYA 1OFBA 5FF3A 4I9AA 2V0TA 4GXMA 2FB3A 1F6KA 2YW3A 4A21A 1RZMA 2VC6A 5IM51 3CU2A 5LHEA 1LRTA 2C3ZA 2Y6ZA 3FS2A 1LZOA 1S5VA 4Z1BA 4GUIA 4DXVA 1XBXA 3W2LA 5AHIA 4MJZA 5DXYA 1OFPA 3M5VA 3L9CA 1KLZA 1JCJA 5G2WA 7TIMA 3M6YA 3QF0A 3HG5A 1H7XA 1LBFA 4UCGA 3RMJA 4OV9A 1L2UA 4DBEA 2CLLA 1ME9A 3QMTA 4FO4A 5FF4A 1H7OA 3F03K 3KX6A 3BPWA 1OG0A 1OFAA 2V30A 4O18A 2HMCA 5HR7A 5AYXA 2A1YA 1D3HA 1XBVA 3V75A 1EUNA 2QUVA 3EKZA 1Q6LA 4RK8A 3PWAA 1G67A 5D37A 3LHZA 4JYFA 1WDWA 1XI3A 2H8XA 2ZZ1A 1EPXA 4Y9AA 1OFEA 1V7YA 2GVJA 3ATZA 4JYDA 3UWZA 2NX3A 2ZA2A 4JNMA 4M6VA 3HIJA 3SIZA 4CNOA 1FDJA 3C0JA 4A29A 1BKSA 1A53A 3S9YA 5DELA 1MEHA 4JY9A 3O6CA 3QPZA 1YXCA 3W88A 2I1OA 3KVJA 4TO8A 3B8DA 4FIQA 1X6UA 5DN1A 5HUOA 2W0UA 1D9EA 4IJBA 5D2WA 3STFA 3PSWA 3MBDA 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2ZTJA 4LRTA 5F2IA 2DZTA 3R89A 3W73A 5DLCA 3ANYA 5BMXA 3LXCA 1YTDA 2BZNA 2DZXA 5G1YA 1OFOA 4BF9A 4UTMA 1YADA 4DBDA 3LI0A 4ZVJA 1RQEA 3ZWTA 1YDOA 4O4VA 3NEVA 4J9JA 4N4QA 3T44A 3VE9A 4QSHA 3HPXA 3Q58A 2QCCA 3PB2A 4N9CA 3E9AA 1MZHA 1ICPA 3R8RA 1IXPA 1THFD 1SPQA 4O8RA 2V2CA 2NV2A 5U7SA 1FXQA 1LRQA 1P0NA 1QR7A 3T78A 2ISVA 2JKAA 3W84A 3TMQA 3GX9A 3GYEA 4DO6A 3FYPA 3MO7A 4M19A 4UXDA 3B4UA 1GWJA 2Z0IA 5T26A 5K2ZA 2YSWA 1TPC1 3LDVA 3RF9A 3FKRA 1LOLA 3T4CA 5DY2A 5EY5A 1K02A 4MVAA 1EX5A 3CLMA 3OVPA 4UUIA 3HO8A 4IPIA 4PODA 2VEKA 1FCUA 2QCHA 1LYXA 1LORA 2QCLA 1OFQA 3W7IA 2E68A 3L0GA 3P7YA 3QPYA 5F4WA 3L5MA 3TAKA 2FLIA 2ALDA 2O7SA 1B4EA 1NSJA 5BOOA 1TPFA 3TCEA 3UYCA 1UCWA 3NQDA 4M5PA 2YCEA 5K4ZA 1AW1A 2VFHA 3DFNA 4POCA 4B5NA 3KVMA 3MHFA 4UTWA 3QC3A 3G1XA 3NQ7A 3HG2A 1P0KA 3NL2A 2QKFA 3PULA 2YFNA 1F6PA 3NA8A 2FPTA 3M43A 3L65A 3I7RA 3WJWA 3EXRA 4JTEA 4LC8A 1TJPA 3LV5A 1TCDA 2E5DA 4O52A 1F73A 2Z2UA 3MW7A 2QAPA 3NAVA 3NZ1A 2C16A 4M7TA 1TRDA 3GDRA 1PL9A 1QPNA 4ZQRA 1K8ZA 3IVUA 2GQAA 1ME8A 4RZ4A 3GDTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3HPXA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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