4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/peptide
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
4UFJA 4B3LA 4UOZA 1Q6DA 4H41A 4N0RA 5BXSA 1C3FA 1EQPA 1M7XA 5JUVA 5A6BA 5A6SA 4UFLA 1TZ7A 3WD4A 5I5RA 3TTYA 1CTNA 4KRUA 2NT1A 1QW8A 1M04A 3ZR6A 1EHNA 3VINA 4LYRA 3WDHA 4DUVA 7CGTA 2C7FA 3VGFA 1BG9A 4FMVA 3RIKA 2WKGA 4GQRA 1UWSA 5IHSA 2EQDA 3RM8A 1UD2A 2JEPA 1UWUA 3ZJKA 3FNDA 4NZCA 3U7BA 1ZBVA 1UWQA 2XIBA 3BSHA 1NWRA 2D24A 3N1AA 4LPCA 3LMYA 4JAWA 3AXHA 1GQIA 4B16A 3BCDA 4GZJA 4CVUA 4H8VA 1NM9A 3AXIA 4X0NA 1WP6A 1UH4A 3VDCA 4GINA 1KQZA 3IAQA 1V3KA 1CDGA 1BVNP 1MW2A 1UQZA 3IJ8A 2HVMA 2VX7A 3QHOA 2XVKA 2W63A 4PMXA 5CG0A 2QMKA 3AOFA 4U3CA 4R27A 1NOUA 4P8XA 1XHGA 2D0GA 3VX1A 3VGBA 1CENA 2E40A 3SIMA 1OGBA 2FHFA 6A3HA 1ISYA 4ATDA 3WEMA 4ACZB 1QI0A 3K4DA 5I79A 5A6JA 3K1DA 4Z2GA 1UKSA 2F61A 2J7BA 1MW0A 4S3KA 1B2YA 3EMZA 3VKKA 1HKMA 2O9RA 1ZL1A 1PX8A 5D9NA 2CIPA 1RP8A 3SUUA 2YBUA 1C90A 1NOFA 1SR0A 4M8UA 1Y7VA 2V3EA 1CBGA 3W28A 6TAAA 3S2CA 2VL4A 1EXPA 1BGGA 1XCWA 3AQUA 4QLJA 2IXVA 3MSDA 1UD3A 1J18A 1V6XA 4QCEA 4F9DA 1FFQA 2FDMA 2YDQA 1E4NA 1PPIA 1SMDA 3A4WA 2GJXB 1CGTA 4M56A 2PWFA 3T2OA 1H09A 1ZBKA 1PBGA 3MO4A 5LA0A 4P7LA 3D3AA 2DDXA 3MU7A 2A3CA 2AOSA 3ZJ6A 1KFWA 1JZ4A 1EOMA 4HZ7A 1KQYA 4AZBA 5I3DA 1OINA 4AIUA 1W1TA 3WNLA 4ZEPA 1BQCA 3AMKA 1UZ4A 1M01A 3CUFA 3PZ9A 2JFEX 2WYSA 5BXPA 5A8OA 3RMEA 2EPLX 2YL6A 1NARA 5CZKA 3WD0A 3BGAA 1KXHA 4D6EA 2E3ZA 2NSXA 4HTYA 2J7GA 2B31A 1CEOA 2WCSA 1WCGA 4DWSA 3MUZ1 1JFXA 4CUCA 1IV8A 4HOXA 1OT2A 2J25A 2DT3A 1BYBA 2V5CA 3AIVA 2QPSA 3HMCA 3ZSSA 3WH6A 2CERA 1MXDA 2VMFA 4J3VA 4M24A 3WL0A 1KB3A 1CGUA 3WNPA 1PX4A 5KZ6A 1BLIA 1KXVA 2GDVA 2OSYA 3WY1A 1GOMA 3N9KA 1FH8A 1HP5A 4EKJA 4PUDA 1KWGA 1U33A 1J0ZA 3BC9A 4U2ZA 3HJEA 1C91A 4FK9A 4A3HA 2JALA 3ARWA 3AIEA 4OZOA 2DSUA 4NF7A 2D23A 5GNZA 2XVPA 3OBAA 4KRTA 2YA1A 4IISA 2VTFA 3ZSTA 2YDRA 2BY0A 4W89A 5GNYA 5LA1A 4K68A 3W27A 2CKRA 1JDAA 3MSGA 1R7AA 1ISZA 3WFLA 1EOKA 1JL8A 2J7DA 3ZT6A 3GBDA 4MB3A 1ISVA 4ZFMA 1GOKA 4M82A 3GXDA 2XSBA 4J3XA 3TONA 3VUPA 4ZENA 1BFNA 3I3EA 3UG3A 2D1ZA 1UD4A 1UH2A 1IZJA 5HPOA 3BAJA 1HJQA 1UR1A 2GSJA 4PSPA 5I2UA 4MNKA 1VJSA 4BQ3A 3WENA 1JXJA 4W88A 1OB0A 4H8UA 1E3XA 1L0PA 3W53A 5BYWA 3A3HA 4AC1X 2WK2A 4CD7A 2ZWYA 4ZE4A 2G8ZA 5HBFA 1JF5A 1UR2A 1MVYA 5LYRA 3RM9A 4ATWA 4H04A 2OWWA 4QAWA 1V3MA 2XGIA 4UQAA 5DO8A 3SUVA 3T0AA 5ECUA 4BA0A 3BAYA 2WMHA 1HJSA 3PTQA 3MMUA 4JKMA 2F2HA 3GH5A 4KGLA 2A3EA 3II1A 2J74A 4W86A 3WQ4A 1ODUA 1CGYA 4AIEA 1QI4A 1B90A 3VD3A 2DT2A 2YL8A 4D6HA 5A6KA 2X1IA 4AZCB 1JNEA 2E8ZA 4D72A 5CQ1A 1UUQA 3PZQA 3MUIA 1JIBA 1V3JA 3VVGA 3RM4A 5A2AA 5M17A 5A1AA 1R87A 4DWSB 5BRQA 5A6LA 1UG6A 4HMCA 3WQ8A 1JGIA 3ARYA 3F4VA 3WBEA 4IUGA 2G4FA 1LL6A 4PMOA 1XCXA 1NWSA 1O6IA 1O7AA 2WHKA 2DH2A 3ARTA 1JZ5A 3AICA 3CUGA 2Y5EA 4W85A 1HL9A 1TVNA 1J0IA 2ZXBA 5E0CA 1TE1A 3VMPA 2W61A 2WPGA 1UZ1A 2D2OA 2O9PA 2Y4SA 2WANA 3LPGA 3ALGA 1XH1A 3WH9A 3L4UA 4TVDA 1EO7A 3AYSA 4CU7A 2QLYA 4U33A 3D5HA 2CEQA 3JUGA 1MWOA 4H7VA 4HZ8A 1ZS2A 1JZ7A 1OIMA 1KBKA 2ZUTA 2ZXDA 5FL1A 2ZICA 4E8CA 2XWDA 4BS0A 3KL5A 4XB3A 2VZSA 4JL2A 4M1RA 5AYIA 4AD1A 1ZU8A 1NP0A 4AMCA 3VDAA 3WMCA 1W91A 3PZIA 3IANA 1XYZA 4W5ZA 1E3ZA 1FP9A 2VCCA 4V27A 1HT6A 3S6TA 1V0KA 2BY1A 3EYPA 1B3ZA 4WKAA 2ZX8A 5FIPA 5E0FA 3ARRA 3T2PA 4EK7A 2EPOA 3WFZA 3UESA 5A8PA 1FA2A 2VX6A 4PTVA 3TP4A 3CO4A 1BGAA 1IT0A 2V3FA 1EDGA 4FLOA 3SCQA 3CPUA 4WKFA 3EDJA 3POHA 2GVYA 4AD0A 2BVDA 4URIA 1VEMA 3WD2A 1K6AA 3WN6A 1E0XA 3L2LA 3WNOA 3BSGA 4GIAA 4AZGA 5F7UA 4NRRA 2HISA 3ZR5A 3MMDA 1M03A 4AZHA 4OBRA 4KWUA 2J7FA 4NI3A 3PZGA 1BYAA 2EBNA 3WQ6A 2VC9A 2DH3A 4NSBA 3ZJ8A 5M5DA 4OKDA 1QPKA 3THDA 4X9YA 3BLPX 4XUYA 1U2YA 4TXEA 3AS0A 3WEZA 3WQVA 2WHJA 4TUFA 3VD4A 1JDCA 3PBGA 2JE8A 2ZX5A 1CGXA 1GVYA 2CESA 3PZUA 1WZMA 3FAWA 4P7RA 1WDRA 2DSZA 1H0IA 1H1NA 1J9YA 2WWCA 1WB0A 1MYRA 1EQCA 3EDEA 1NH6A 3ZIZA 4PMQA 3RILA 3DECA 1GZJA 3BAXA 3EMCA 2WB5A 2WC3A 2XHYA 1CGWA 3APGA 2VURA 3WF4A 3J7HA 2EO7A 4HU8A 1XH0A 2XM2A 1PIFA 2UY4A 1GQJA 4P8WA 2DT0A 1E9LA 3AZSA 4TTGA 1I75A 5GQBA 3AS2A 1VFOA 4AIOA 4WKHA 1X1NA 3ARPA 6CGTA 1ZBCA 3AHZA 3L4YA 2E0PA 4IM4A 3W24A 1WZKA 3DHPA 1RP9A 1E6XM 1HN1A 3THCA 3ALFA 4MAZA 2ZUWA 3K8KA 3AIBA 4ZXLA 1WKYA 1HXJA 2YOCA 5AYBA 3MKKA 3WUFA 4KGJA 4MNMA 3LPOA 4U31A 1WPCA 1GQLA 1W32A 4CD8A 1MW1A 3VM5A 3BXWA 4PUEA 1G1YA 3OLEA 1F4AA 2CKSA 1UA3A 4PTMA 1CPUA 5A3HA 1I1XA 2VR5A 5CLWA 2FGLA 1JAEA 4UNIA 3K8MA 1VIWA 2J78A 5CPQA 2DIJA 2YIHA 2MANA 2VOTA 1AQHA 4MTVA 4LX4A 3ARQA 2E9LA 4CN6A 2WMJA 3WUBA 4GI8A 5I0DA 1MFVA 3WF0A 2XYLA 3W37A 4OOZA 3GBEA 1B30A 1QOXA 1KCKA 4PMVA 1BVZA 3G6LA 5HPCA 1E5NA 1OCQA 1XC6A 5IFTA 3UG5A 2WMIB 3ZJ7A 1Q6GA 3WL1A 3PHAA 3AHVA 4C7GA 4J7RA 3WKZA 3AHYA 4UOJA 1X6NA 3W29A 2YDSA 1AVAA 1QNPA 3VGDA 1CLVA 3M6DA 5CSUA 3OG2A 4W8AA 4RE3A 2TAAA 4V28A 3NSMA 4KH2A 2VRKA 3BH4A 2WHMA 1FH7A 3GM8A 2O9TA 3PTKA 3CIVA 5CGTA 3TTSA 2J77A 3TOPA 2J47A 2WVUA 2XVLA 3AROA 2OWCA 2QF8A 4MAVA 3T09A 3PZOA 2PB1A 3WQWA 1J01A 1OD8A 3VIKA 1Q4NX 3NDYA 3UCQA 2DEPA 1Q6FA 1WZLA 3GH4A 3RO8A 1JDDA 1CXEA 2WCGA 1GHRA 1TMQA 3E1F1 4E4PA 3WIJA 1Q6EA 2WLZA 2NW0A 2FHCA 1ECEA 2PWDA 4Z2JA 1UOKA 3MUAA 3N04A 3EDFA 1OM0A 1W9DM 2XFYA 2YL5A 2D22A 4DM2A 1UD6A 4M29A 5A8NA 1C7SA 4HA1A 4PMYA 1TA3B 3NUKA 2BV9A 3POCA 3EMQA 1CNVA 3CGTA 5I6SA 2E9BA 4WSKA 1KBBA 3QHNA 4B9ZA 5CPSA 4RE2A 1MQQA 1E0WA 1DWGM 4H2CA 1E6QM 1K9DA 4L4OA 2DSVA 1ISXA 3ECQA 1Q6CA 1G5AA 2BHUA 2O92A 2D0FA 4Q7NA 1QBBA 2WLYA 4HA4A 5D8ZA 1EIBA 3I3BA 3SCPA 3SCWA 1PAMA 3VDHA 3WNNA 2WVVB 1JZ6A 1UR8A 1TG7A 3T2QA 4JFTA 2YBTA 2J8GA 3N17A 1HJXA 2BHZA 1JZ3A 2W91A 3AYRA 3F5LA 1CXHA 3DC0A 2C8NA 4W84A 4PCTA 3SUSA 1TCMA 4WK9A 1CIUA 1VBRA 2W62A 1XD1A 2EEXA 1G9HA 2AMGA 4AZ6A 2GJPA 2BY2A 1GNXA 4IPNB 4UFIA 3AIWA 4CCDA 3SCNA 5ABFA 2VZVA 1BAGA 3IK2A 1JI1A 1E70M 3ZO9A 3F5JA 2A3AA 4Z2KA 8A3HA 1EHAA 3VD9A 1US3A 2PWGA 1JYWA 1G0CA 4LXFA 3W0KA 2QHAA 1UR4A 3ZT7A 5AC5A 1GW1A 3CUIA 3AMLA 4J28A 3FXYA 1J0KA 3SURA 3CZ8A 3OLDA 3VIJA 3SUWA 1UYQA 1JG9A 1IZKA 1W9UA 3IAPA 1CXKA 4C7FA 1X6LA 4GPNA 4BF7A 2X09A 2JF7A 1Z32X 1GOQA 1UKQA 4UFMA 2Y8KA 2PWEA 3W38A 1DWFM 3VGGA 4UZUA 3VILA 3QHMA 1J0YA 2WNWA 2ZUMA 1QI5A 2PWHA 1FFRA 2VZTA 2BVTA 3WDPP 4UTFA 4AZ5A 2WVSA 2JIWA 2FHBA 4Z2LA 1RPKA 4OBSA 4BZYA 5A6AA 3WEOA 2EJ1A 1AMYA 3RPMA 1UD5A 1ZJBA 1J10A 1JF6A 4UQBA 2XFFA 4FF5A 2VCBA 4H8HA 1H4PA 5GPRA 1JD7A 4MADA 1GPFA 1ZB5A 3QOMA 5DT7A 1B3XA 4HOWA 4U5KA 2G3NA 1VEOA 3TA9A 2W5FA 2WBKA 4JL1A 4X0VA 4CN4A 3W6LA 4AWEA 3GZAA 3HN3A 2ZWZA 3SCVA 1LF1A 1JZ8A 3CZKA 2DT1A 4ATLA 1BPLB 2VR4A 3OZOA 5CXPA 3WD1A 1E4LA 4JIEA 2BY3A 2FGZA 4JZ5A 4CGTA 4M80A 4AD3A 2PBOA 4GZIA 1H49A 3UR8A 1UHVA 3PZNA 4D6GA 3VGEA 3T0BA 1F4HA 4S3JA 3K46A 3VIGA 3EDKA 1OGGA 1E6PA 3KEHA 4AD2A 4JFSA 5E9AA 4AZIA 1PJ9A 4GI6A 4F9JA 1RH9A 4F66A 1E56A 1HIZA 1E6RA 1D7FA 2Y2WA 1WDSA 2VRQA 2GK1A 2OYLA 1ESWA 1E55A 3KE0A 3SCUA 4J3SA 1C7TA 1EDTA 1RD6A 3UG4A 2XM1A 1FHDA 7A3HA 4DUWA 2W4XA 2PI6A 4W7VA 5JBFA 4PYSA 4CD6A 5BXRA 4YPJA 2D0HA 3T08A 1BHGA 2WZHA 5ABGA 1JD9A 3FW6A 3FN9A 4XZWA 1DTUA 2CBUA 3FY1A 4TOQA 4OJYA 3AZRA 3AIQA 4L4PA 2VCAA 3WQ5A 4PEEA 2XSAA 1GORA 4RE4A 4PRWA 2XUCA 3AXXA 5BXTA 5CGMA 2VQTA 4E2OA 4LQ1A 4U5IA 2VJXA 1BG4A 2BHYA 2EXOA 1HNYA 2VT0A 3L4TA 3CZGA 3VD5A 8CGTA 4JCLA 2WC7A 2O9OA 1EGZA 1BTCA 2XJ7A 2E8YA 3WUEA 2ZX6A 1CLXA 5EBAA 1WZAA 1JNDA 4CD5A 1E73M 5I23A 4ML4A 4D71A 2EPNA 3B8SA 1LG1A 3MUY1 3UETA 1ITCA 4AEFA 1YQ2A 2D20A 3ZOAA 4TTUA 2ZXAA 3IJ9A 4W7WA 5C8BB 4OIFA 4D6FA 3GXMA 1WDQA 1JFHA 1VEPA 3QOKA 1FP8A 1R86A 3DYPA 4WJXA 3W81A 4GO8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1KM6 A;  3OB8 A;  5DXY A;  4PC8 A;  3T05 A;  3WH5 A;  1P0D A;  2XVG A;  1ODZ A;  4P00 B;  3CL6 A;  3NO1 A;  2CZV A;  3ARZ A;  2BGS A;  3I3D A;  2HPJ A;  1QVB A;  3GA8 A;  4D6J A;  3ZMR A;  1UZH A;  3KRS A;  5L4E A;  2AQO A;  4WDX A;  4A22 A;  2PUZ A;  1ENU A;  3JRK A;  1W9P A;  3C2V A;  2DSK A;  5HXR A;  1N8W A;  2PBG A;  1W31 A;  1EJR C;  4Y9M A;  3A4X A;  2XFR A;  3LPP A;  4ICC X;  1TJP A;  1OX4 A;  3LV6 A;  3O7U A;  4IXX A;  4US5 A;  3WLO A;  4I7W A;  2YFO A;  4GQQ A;  3WMS A;  4KS0 A;  1OFO A;  3RJY A;  2XZ7 A;  5C7H A;  1LZO A;  3DHU A;  3QV6 A;  4B5S A;  2ZX9 A;  3H2F A;  4MB4 A;  1K8Y A;  1VAH A;  3VOC A;  3C50 A;  1KNP A;  3NSN A;  4WHB A;  3Q67 A;  2I16 A;  3SBF A;  3BIC A;  1VFF A;  1A5N C;  5LOV E;  2DZX A;  4BK9 A;  4M6U A;  1GVQ A;  1KTN A;  3B8V A;  4XBJ A;  4KHP T;  2BFG A;  1SSG A;  1JYN A;  3S9I A;  3FEM A;  4Q6X A;  3W71 A;  1GZG A;  3UT0 A;  4IMG A;  1T8X A;  3R89 A;  3KVL A;  6REQ A;  4D6C A;  5D2W A;  1C9D A;  3TFX A;  3UG8 A;  5GJN A;  2ACZ A;  1LOR A;  2O4Q A;  3L2M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4UFJ A;  4B3L A;  4UOZ A;  1Q6D A;  4H41 A;  4N0R A;  5BXS A;  1C3F A;  1EQP A;  1M7X A;  5JUV A;  5A6B A;  5A6S A;  4UFL A;  1TZ7 A;  3WD4 A;  5I5R A;  3TTY A;  1CTN A;  4KRU A;  2NT1 A;  1QW8 A;  1M04 A;  3ZR6 A;  1EHN A;  3VIN A;  4LYR A;  3WDH A;  4DUV A;  7CGT A;  2C7F A;  3VGF A;  1BG9 A;  4FMV A;  3RIK A;  2WKG A;  4GQR A;  1UWS A;  5IHS A;  2EQD A;  3RM8 A;  1UD2 A;  2JEP A;  1UWU A;  3ZJK A;  3FND A;  4NZC A;  3U7B A;  1ZBV A;  1UWQ A;  2XIB A;  3BSH A;  1NWR A;  2D24 A;  3N1A A;  4LPC A;  3LMY A;  4JAW A;  3AXH A;  1GQI A;  4B16 A;  3BCD A;  4GZJ A;  4CVU A;  4H8V A;  1NM9 A;  3AXI A;  4X0N A;  1WP6 A;  1UH4 A;  3VDC A;  4GIN A;  1KQZ A;  3IAQ A;  1V3K A;  1CDG A;  1BVN P;  1MW2 A;  1UQZ A;  3IJ8 A;  2HVM A;  2VX7 A;  3QHO A;  2XVK A;  2W63 A;  4PMX A;  5CG0 A;  2QMK A;  3AOF A;  4U3C A;  4R27 A;  1NOU A;  4P8X A;  1XHG A;  2D0G A;  3VX1 A;  3VGB A;  1CEN A;  2E40 A;  3SIM A;  1OGB A;  2FHF A;  6A3H A;  1ISY A;  4ATD A;  3WEM A;  4ACZ B;  1QI0 A;  3K4D A;  5I79 A;  5A6J A;  3K1D A; 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