3W2J | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-135 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-11-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w2jA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w2jA01

3TQ0A 1KM0A 1XFBA 4TR9A 1XC4A 3RF9A 2C1HA 4KFOA 1F2JA 1L6WA 3WK1A 4P61A 3KVKA 2O7SA 2FB2A 5LNUA 1C9DA 4ICNA 2O7QA 2GUUA 1R2TA 1LP6A 1TREA 3EWBX 2CZFA 1G6CA 1TIMA 3KVLA 1FXPA 4RK8A 3HG3A 5KZDA 2VFDA 4PTNA 2CWNA 4ZQNA 2WQPA 5LNRA 4GUJA 2FPVA 2ZA1A 4UMAA 3FFSA 3W07A 1H60A 3UWVA 1PHQA 4PFMA 3EWWA 3NOEA 3I68A 1EPXA 3DH7A 1RD5A 4HPJA 1C29A 4O17A 4S2BA 3BLEA 3MHFA 2QJGA 2E5DA 2QUTA 1I2PA 4RR4A 3MP3A 2PCQA 2ZRVA 3C2RA 5DELA 4DXVA 4BF9A 4MY8A 4MY9A 2FJKA 1Z42A 1IXPA 3GIYA 5FEPA 1FBAA 5FF7A 4FO4A 3W7DA 2CLHA 3NR0A 4Z0JA 3OA3A 4OQVA 2A4AA 4MJMA 2NUWA 3O1NA 4NX0A 1DQWA 2V2DA 4O53A 4TU1A 3W7GA 1S5WA 3B8DA 3R12A 3FJ6A 2QAFA 3QQ1A 1ZNNA 4JTIA 2A21A 4CNOA 1QCWA 3SY5A 3NQ8A 4LS2A 4WJEA 1IXQA 2EF9A 1J2WA 1VCVA 3BPWA 4DF1A 1F7BA 1VCGA 4I7WA 3TK7A 4ML9A 1LROA 4OBTA 1OYCA 4BI7A 3W1UA 2ZYFA 3MUXA 3NQ6A 2X16A 3GX9A 5HQEA 1EA0A 5HJLA 2DZXA 1QPOA 1O94A 3BV4A 2W6RA 4JD4A 1OX4B 4G1KA 4P2VA 1CX9A 5GVJA 1AW5A 2VOMA 2ZQ0A 1ZCOA 2J9XA 1F6KA 4TIMA 3N73A 1TTPA 3U2OA 4H3DA 4FNPA 5G1TA 1P1XA 4IX0A 4CCEA 4Z0SA 2VFIA 2ZRXA 4PCFA 3RNDA 2WNQA 5HR7A 1FWRA 1MXSA 4R34A 5G2HA 4IGHA 3W76A 4DEFA 1X1OA 3PG9A 5IBXC 1G4PA 3UZ5A 5G5IA 3QC3A 4WZHA 3PSWA 3CEUA 4ZQPA 1RQHA 3W84A 1KTCA 5G1YA 1TSIA 3TA6A 2JGQA 1K8XA 3S1XA 4ZVJA 3W85A 3PG8A 1RQBA 1Z44A 1TPEA 1F73A 3I7RA 4UFIA 3DXIA 3W7RA 3RMJA 3NQ7A 4HSNA 3PBVA 3MJYA 1TMHA 4C1KA 3LHUA 1IF2A 1KLZA 4JYFA 3O6CA 4IPJA 3NVTA 3UNDA 4X22A 2WOQA 2RFGA 3W2JA 3R8RA 4N4PA 1FDJA 2ZRYA 3CLMA 3TCEA 4Z08A 5LKYA 1ZFJA 2VFHA 4WUIA 1SU5A 3ABOA 3R5EA 4XTIA 1V7YA 2ZZ4A 3C6CA 4MLJA 3UPBA 2Y88A 1X7FA 1GOXA 3DKLA 1ME8A 4MJZA 1XUZA 3TQKA 4N2YA 4DF2A 4EIVA 3UPWA 1W3NA 4KWVA 3M6YA 3PVFA 1C8VA 3DAQA 4L4LA 2ZBTA 4U4MA 1QR7A 3QYQA 4IQLA 3E0IA 1MEWA 1KA9F 2B0MA 2V8ZA 3SR7A 3M5XA 4FXRA 4M5PA 1HO1A 3QRHA 3P82A 3LTSA 2CZDA 2J88A 2FQIA 4LV4A 3NEVA 1WAUA 1JCLA 3P5ZA 2EHHA 3H54A 1R47A 3CM4A 3KRUA 4AH7A 1W5PA 2CW6A 4Y9AA 3BG3A 3TH6A 3EXTA 2Q3RA 1P0KA 5AB3A 3CB8A 1OVDA 3NL5A 3QMRA 2R94A 4TMBA 2J6XA 3F1QA 5FEXA 4LS1A 3LI0A 5EKYA 4ZQCA 2J27A 3ZWSA 1QMLA 1DL3A 3I6RA 5J5DA 5K9CA 1OHLA 2A7NA 2I14A 3B04A 3W7EA 1AK5A 3M1ZA 4NXSA 3GK0A 3EKLA 5HNRA 3W1AA 5C6MA 2F7FA 4ZQMA 4NNBA 1GTHA 4ZZ9A 2GPTA 3G0SA 4POCA 3CTLA 4NZJA 4ADTA 2NUYA 2QUUA 3L67A 3GXNA 1N7KA 1DKWA 2D73A 5D2XA 1IXNA 1SO6A 3TAOA 3UXDA 3HG4A 2E6DA 2C18A 5G4WA 3TSDA 4TO8A 1X6UA 1FCQA 3S0CA 3B0UX 2BX7A 3DFPA 3ATZA 1D9EA 3GLCA 4X2RA 3U6WA 1SZNA 4UXDA 3LX9A 5CSRA 1G7VA 3GYEA 1D3HA 3T7VA 2DZPA 2QCGA 3M5VA 1K03A 1LBMA 3LHTA 3THQA 2A6LA 3O8AA 1W8SA 3QQ0A 4DBEA 3C61A 3PC0A 3EXRA 4O1AA 4IMFA 4LS0A 1LOLA 2OT1A 4IUOA 3A22A 4UCGA 1GG0A 1ME7A 3NZ1A 3STCA 2UV8G 3TE9A 2AGKA 3TMLA 3PS7A 1NAL1 3PB2A 2ISWA 2ZZ5A 3S5YA 2A7RA 3IIVA 1KM1A 4GJ1A 1KV5A 4O18A 4Z1CA 2BTMA 3RU6A 1H7PA 3NQDA 3GDRA 2NXGA 2A0NA 3NQGA 4ZQRA 4IJBA 2YZRA 4DELA 1Q3NA 4NJIA 5F4WA 1NVMA 1XUUA 1LM1A 4UTKA 4ONVA 3E12A 3LERA 4Y6GA 4FNQA 1XBZA 5AC8A 3JS3A 4RXFA 3STEA 1XKYA 3LCWA 2GJLA 3NQVA 2OJPA 3DGRA 1V5XA 3SI9A 2I1OA 3HJZA 3OHIA 4PH6A 1F74A 5KINA 3O06A 4O14A 2C19A 1GT8A 3NL3A 1QNVA 4MOZA 4WXYA 2CZ5A 4FNTA 4CNNA 3MP5A 1JVNA 3G1VA 1H61A 3S42A 4AWUA 4FIQA 1TPB1 4K37A 1ZHAA 2NV1A 1JCNA 1F5ZA 3IIZA 4J9JA 2J9YA 1SW0A 3KX6A 3W7JA 3S5OA 1W37A 1VCFA 3EEGA 4A2RA 2FPYA 5H2ZA 3BLIA 1AW2A 3G8RA 1ZAJA 5G2IA 5DXYA 4HT3A 2A85A 3THAA 1ZJIA 4DF0A 1TV7A 3KAOA 4UC5A 4EF8A 2ZDRA 3CPRA 3WK0A 3W2NA 3NQFA 1PVNA 5AOUA 5D09A 1WQ5A 2PRHA 4LTSA 5DXXA 3E49A 5D2YA 2WV8A 3MBFA 1GVSA 5EY5A 2Q8ZA 1G67A 4LW7A 1M6JA 1XI3A 1EEPA 3NXFA 3ABRA 3N14A 1H7OA 1P0NA 3FYOA 2WO5A 4IWWA 3P8IA 3E02A 4OE7A 1H7XA 4Q32A 1DJNA 4I9AA 4OV4A 1JUEA 3DU0A 3E9AA 3LM7A 1F05A 3IGXA 3P81A 3VE9A 4WY0A 3P60A 4PL2A 5BNKA 1DVJA 4RZ4A 4RX0A 4O13A 3O6DA 3W7PA 2E1DA 2XN2A 2HSAA 3HBLA 3T78A 1UUMA 1FCBA 5F4SA 2E68A 1UCWA 1FCVA 3A9IA 2YW3A 1GVFA 4QIUA 5LHEA 5EMUA 1W5MA 4O0KA 3W1LA 1O5XA 3W1XA 4ADSA 4FF7A 3STFA 1K02A 4EF9A 1O60A 1EUNA 2YFOA 2RDTA 3PUDA 4O8RA 4LV9A 2BZNA 3BGGA 3KFTA 1VLWA 3G8EA 3SJ3A 1IGSA 2G96A 3DI1A 1OG0A 2RH9A 3PR2A 1SQ7A 3I65A 3L65A 1KV8A 2R91A 5EA9A 3N34A 1KFKA 4DBDA 4YCPA 1FXQA 3TKFA 3TV8A 2DP3A 5CSSA 4D2JA 4QISA 2IQTA 1RVGA 2TRSA 2TMDA 2Y89A 2DORA 1LTDA 3W74A 1J5TA 5LGXA 1TO3A 1YXYA 1VYSX 3LHZA 2H90A 4Z1DA 1RQEA 1I2NA 1VH7A 3NL6A 4EWND 3TQVA 1OFBA 2A5HA 3DFQA 3GDKA 4LOCA 3WK3A 1KM3A 1DBTA 3L2IA 1QDSA 3LTPA 1LOSA 4NT0A 1LCOA 1RPXA 1VJIA 1TTIA 1RR2A 2X1RA 3EKZA 2QKFA 2YGYA 4UFKA 4JICA 5HINA 1A5SA 5CZSA 4JTGA 3NYZA 4GBUA 1BWKA 3LHWA 4M7TA 3TNOA 4M6QA 3OVQA 3OG3A 1JCMP 1B3OA 4GUHA 3B05A 4WY0B 3G18A 2Y61A 1VHCA 4RKAA 1JRCA 3NG3A 3MO7A 1QPRA 4DO4A 3G1AA 2Y7EA 3PM6A 3W2KA 4FX7A 1SZEA 3M44A 3KXQA 1Y0EA 1W31A 3O15A 4RCXA 2VEMA 2FFCA 5AHMA 2NXIA 3M5YA 3P62A 3C2FA 1X1ZA 1MEHA 1QFEA 3DBPA 2CLIA 4O57A 1SPQA 5AHNA 3M47A 1TPC1 4NVTA 1EWEA 2NUXA 1VYRA 2NX1A 1NF0A 1F6PA 2QAPA 2H8XA 3NM3A 4IOTA 4R53A 2YDAA 3MHUA 1TQXA 5IM51 4B5NA 2YCEA 3QPYA 3T55A 2XN1A 5FF2A 1W0MA 1HUVA 1PS9A 4CNPA 5KZEA 2W79A 3IGUA 1GEQA 5E93A 2B7QA 2ATMA 3FA5A 4DPPA 3TW6A 3W1NA 3K30A 5D02A 3IIXA 1EP3A 1H50A 2PE4A 3OEXA 5FF0A 1K8ZA 4JYDA 1G69A 1GVOA 2NWSA 1VQTA 3VFLA 3Q2DA 4XQ6A 3ABQA 3EX6A 4JXCA 3G0XA 3W75A 1KLYA 2X1SA 2FB3A 2V81A 2VKZG 4WXZA 3M7WA 5D38A 4AWSA 5F2IA 5MHBA 1ZY9A 3W88A 2A2IA 3INPA 3EX4A 5C2XA 3LLDA 3GDLA 2DU2A 4MKNA 3C2OA 2YR1A 3BW2A 3QZEA 4LRTA 4UTWA 4O4VA 4PL1A 4AF0B 3QH2A 1DQXA 2JKPA 4JTLA 5HMSA 4Y8FA 1TTJA 1U5JA 4CQAA 4UUIA 1FWNA 4JYEA 3P61A 2ALDA 1QO2A 2QEZA 3OIXA 1P5BA 1RV8A 4JTHA 3V1PA 4N02A 1ML1A 1WXJA 2I9EA 4A22A 3ANYA 3MP4A 1FWTA 1P4CA 3HF3A 3W3OA 3C0JA 2E5BA 3WFAA 4O1CA 3BLFA 5EBUA 5DBUA 2ZA2A 3NQ2A 2VEKA 4O10A 2RDWA 1JCYA 2WNNA 1OFDA 3TDFA 1JUBA 3LRKA 4GFSA 2PRLA 2Z0IA 5CPMA 1KM4A 1THFD 3W7LA 3GDMA 5KTLA 1B4EA 4E38A 4UMBA 3PWAA 3NM1A 1JQXA 1YLVA 3A24A 4K7VA 1VGAA 4O19A 2QCNA 1ALDA 1OF6A 4O52A 4CQ9A 1SO3A 1SFLA 3GXPA 1PHWA 4ZL1A 1YYAA 1PIIA 1FCUA 1IIGA 3LTYA 2JKEA 1WOAA 1WX0A 3SECA 5BMXA 3UY8A 1Q6OA 4O4WA 1S3HA 3PULA 4DO5A 3QJAA 2ATSA 3Q94A 1GTEA 3C2EA 2DJXA 3G1FA 1KFJA 4U28A 5ABTA 5F2MA 1H62A 5LNWA 5HR6A 4FX6M 4OU1A 3SGUA 1KFLA 1VPXA 1DJQA 1OABA 4JDYA 2OZ0A 1OFQA 1VC4A 2J9ZA 4ZMGA 2X2GA 4KWWA 5DBTA 2Z6IA 2GJNA 5TQLA 1GJPA 1WOBA 3IVTA 2VFEA 1S5TA 2WSRA 4DQWA 3EX1A 4JY9A 4MZ1A 5CPOA 3NZRA 3LBCA 4GUIA 3YPIA 3E96A 3W7HA 3R2GA 4QAIA 3NL2A 3G1YA 1SW3A 4E2BA 2OX1A 3HPSA 3EXSA 2TYSA 5F2LA 4YXGA 4AHOA 3QW3A 1WDWA 5LHFA 3W7KA 2CLMA 2QJIA 1XBYA 4RJEA 4K8HA 5DCBA 1B57A 1TPVA 3L9CA 4FNRA 3UQNA 4UTIA 5DCDA 3W23A 2OT0A 4JIPA 5I3FA 3LCGA 5L9FA 4R7JA 1A50A 4NQ1A 3G1HA 3T40A 4QITA 1K7EA 1ZAHA 4N9BA 3MYPA 4AAJA 4I7VA 1B9BA 1NF7A 1VR6A 3LXBA 3HB9A 5KMYA 2GOUA 4BI5A 4GE8A 4CQ8A 1TV8A 2DZTA 4RV8A 4O1BA 1I8JA 1SO5A 3OVPA 3S9YA 4FNUA 5LNVA 4UIOA 2C3ZA 4QQ3A 3HGOA 3W6YA 1FDYA 3GR7A 2TSYA 1X8FA 3WJSA 1I2OA 1BTMA 2W0UA 2V2HA 3W71A 4JX5A 1TYGA 2QUVA 3EWXA 1XXXA 1N55A 3H55A 1QAPA 2J24A 2X30A 2YFNA 2CU0A 2EKCA 5FF3A 3BW4A 3EB2A 3N3MA 2CLLA 3VKJA 3HPZA 5D2TA 2VELA 3WJYA 3LHYA 4H4IA 2PC4A 4NNCA 3UWWA 3ZFHA 1M7OA 3HGSA 1YADA 1XDMA 4O50A 1W3IA 4KFPA 2JGYA 4LVBA 1YPFA 5C54A 1NFBA 4FEZA 4MFEA 3M9YA 3H53A 3LXAA 3G22A 3F03K 4A3UA 1WBJA 6ALDA 3V75A 3ZS4A 5H91A 3DZ1A 3PBYA 5D2VA 3N9SA 3FOKA 1UJPA 2BLEA 2Y7FA 1W1ZA 4S2CA 3C3NA 5K3VA 1VZWA 1E51A 3P67A 5HUOA 3N2XA 4Z1AA 3UY7A 2Y6ZA 3NQMA 3DI0A 4BI6A 5CZ0A 3FLUA 4NX5A 3C4UA 4QSHA 1PCKA 3M0ZA 3L68A 3SIZA 4PODA 3QW4B 1AW1A 4K36A 5F4XA 4RLIA 3BGJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W2JA

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Chord Diagram

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