3IIZA

X-ray structure of the fefe-hydrogenase maturase hyde from t. maritima in complex with s-adenosyl-l-methionine
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
346
structure length
344
Chain Sequence
TGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKICVFEKDTACIPCVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Adomet binding protein
molecule keywords Biotin synthetase, putative
publication title Unexpected electron transfer mechanism upon AdoMet cleavage in radical SAM proteins
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 141
structure length 344
sequence length 346
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3iizA00
3W2NA 4BK9A 3TDFA 1UUOA 1YTEA 4FNTA 3GNNA 1KLZA 3EWXA 2ZA3A 3P5YA 4IPIA 2XFWA 2WV8A 4JXCA 3IIVA 3W7KA 1EP2A 4QNEA 1X1ZA 1Q6RA 4NX0A 3S1UA 3C3NA 2GUUA 2NWRA 3HOJA 4UFJA 5KITA 3PB0A 2NWSA 1MEIA 4DPQA 3RF9A 1MEWA 1M7OA 1KA9F 1L2UA 4LUIA 2Q8LA 2YYTA 2ZCGA 2QCNA 2GOUA 5CZJA 5D2VA 1TJPA 1ZJIA 1PHQA 3ZS4A 1ICQA 4WJEA 3VE9A 3ATZA 2KZHA 3L0NA 5DXYA 3P82A 5CPMA 4MZ1A 1UB3A 4JTIA 5I3JA 1GYNA 4FXSA 1VRDA 5C6MA 3LM7A 4ORMA 4GUJA 5I3GA 3DFQA 3NL3A 3G24A 5KZEA 1H1YA 3QQ0A 1XC4A 3NNTA 4JY9A 3QZEA 1JCLA 4A22A 1VH7A 3OA3A 4UTHA 3WJWA 1WQ5A 4LS1A 3EXRA 4LC8A 5A5WA 3NM3A 1WV2A 3PBUA 1DL3A 2B0MA 4PC8A 4IPJA 1R2RA 5DELA 1EA0A 3TMQA 4UMBA 3W7CA 4Q33A 4QITA 1KM0A 1I4NA 3LTYA 1I45A 3RFAA 3M1ZA 3HO8A 3FYPA 5LNRA 4ZQNA 4FEZA 5DY3A 2ZYFA 3G18A 1QPRA 1QOPA 4H6KA 1TPDA 4Z1DA 3W7OA 4IX2A 1OFRA 1A50A 5AHIA 2W0UA 5KZMA 3W2LA 2C16A 5J5DA 4N9CA 3LCXA 1JUKA 2VC6A 1JQXA 1ZNNA 3DKJA 4G1KA 3DXIA 3HIJA 3G1VA 4XKYA 4PA8A 2CU0A 5EPDA 1J4EA 5TIMA 3WJZA 3B8DA 4JDYA 4RLIA 1TPC1 3DKLA 1NFBA 1KFLA 2NV2A 3W1NA 3GK0A 4I7WA 3D0CA 2CW6A 1BEUA 2ZFAA 3CQ0A 3W1MA 1H51A 3IGSA 1W5NA 1S5TA 1OABA 2VKZG 2A21A 2A85A 2O7QA 5F4SA 1DQXA 2HTMA 2NX3A 3B03A 4XUGA 3W7MA 3H54A 1ZY9A 3NQ7A 5F1UA 4Y8FA 1T96A 3E02A 4UFKA 3I7QA 4DBEA 2W79A 1OHLA 5EL1A 1LRNA 3HJZA 4BWLA 1C8VA 3ABSA 3P84A 5I3HA 3GB6A 2QUVA 2QEZA 4GC4A 4O57A 3C52A 2VEPA 2FPVA 3CIXA 4LVGA 1EWDA 2O7SA 4ADUA 2WKJA 3I7SA 3UWYA 5L9FA 3W1XA 5T26A 4ADTA 3ABOA 1RZMA 3RNDA 1TYGA 3G0SA 1JUBA 1ZALA 4CQ9A 3T44A 1HL2A 2VFHA 2FJKA 4CQAA 3T4CA 5HWJA 1OYCA 3O6DA 5AHLA 3STFA 2X1UA 2OT0A 2R94A 1WXJA 1RV8A 1H7PA 1NSJA 1OFEA 5I3FA 2ZRZA 3MYPA 1DVJA 3L5MA 4NVTA 4AWTA 4CLMA 1FXPA 4K8HA 3N3MA 3G1DA 1K03A 2PC4A 3Q94A 3TQ0A 4LY8A 2E5BA 4ADSA 3SIZA 4JEQA 4LTSA 1V5XA 3S42A 1EP3A 1TRIA 1VGAA 4O4VA 2YX0A 3BARA 4H4IA 4N9EA 3EX3A 3TUUA 4IJBA 2ZZ6A 3NPWA 5GVJA 4EF8A 3FOKA 2NLIA 1LRQA 1H1ZA 1K8XA 4AHQA 3QJAA 4QIUA 1B57A 1QMLA 3VI2A 3HB9A 3DZ1A 4M6VA 4S2BA 3C2OA 2YPIA 1KBIA 2QUUA 1ZCOA 5AC6A 4LRSA 5HULA 2BXVA 4O11A 4NZFA 3UWQA 3GVGA 3BGGA 6TIMA 3RLUA 2B7QA 1EUAA 3NQGA 4UTUA 2Y7FA 1HUVA 1RQBA 4ZQRA 1KM6A 4R34A 3OBKA 3SY5A 1NEYA 2F7FA 4XBSA 3HMJG 3LCHA 3M47A 5CZTA 3TCEA 3BGJA 5DCEA 4X22A 4JD4A 3N9RA 2Q3OA 2YCEA 3W7DA 1TV5A 3N73A 5G2HA 3W22A 3S5OA 2H6RA 2PURA 3DAQA 3M7WA 4DEFA 4DF0A 1JCMP 1A5SA 1TTIA 2NZLA 5G1YA 1W5MA 4M5PA 3I7RA 3LXBA 3W1TA 1IXPA 3C6CA 2EKCA 1W5OA 3MHGA 4HNUA 2WQPA 1ZAJA 1JUEA 3LHYA 3TC6A 1ZFJA 1IIHA 1LYXA 2RH9A 2E77A 4NJHA 4AF0B 1VLIA 2TPSA 4NZJA 4EF9A 3PB2A 1QPOA 1MSSA 2VFEA 4PCFA 1G4PA 3CWNA 5FF2A 4N6EA 2PCQA 1JJKA 3G3MA 1WOBA 1KTCA 2AAMA 1LOSA 3GLCA 3GR7A 1TPB1 4OV4A 2VENA 2DZWA 5K2ZA 2YGYA 5F2LA 4O16A 2DZTA 2X2GA 5HUOA 4JNMA 3UXDA 3BW3A 1H7NA 1JCXA 1TPFA 1SZGA 3PULA 1KLYA 3ZFHA 5D2WA 4IMCA 5D30A 1MEHA 1TMHA 3IIXA 3GYEA 5D37A 1TPVA 3IIOA 1XUUA 3QC3A 1HFBA 1TPEA 3F03K 2Y88A 2E5CA 3P7YA 3EWZA 2XN0A 3O05A 4DXVA 2DJLA 3GKAA 2A7NA 4Z0JA 3NPXA 1U5JA 3B05A 3LHVA 4IWWA 4NNAA 3FYOA 4BFAA 4UTWA 4IMEA 3W1PA 1IXNA 4CNOA 5H2ZA 5U7SA 3F4WA 4MUZA 3PBYA 4O13A 4OV9A 3PSWA 4M6QA 2ZZ3A 3TQVA 1NAL1 1TREA 3JRKA 2V2HA 5D33A 1S3HA 5AB3A 1LBFA 3C4UA 2C0AA 1EEPA 1TSIA 3BO9A 4JTJA 2EGZA 2DZUA 2CLMA 4GUHA 1PVNA 2B7PA 2A7RA 3NVTA 1X6UA 1ME7A 3W7LA 2WSRA 1RR2A 1W56A 3B0VC 1PE1A 1L9WA 1UUMA 4X9SA 3KRSA 2FFCA 3L0KA 2QJHA 4FNRA 3UWVA 3W74A 1FY6A 3A24A 4UNLA 2NV1A 2DZSA 3EWWA 1FWRA 1HO1A 3M9YA 2CZFA 3S9YA 5L6UA 2GVJA 2GVGA 3WK1A 3L67A 5CGQA 1ZENA 1G69A 2WJZA 3SJ3A 3LXCA 2YW3A 3TH6A 3TXZA 2V0TA 3NQCA 3BG5A 4AH7A 3W23A 2HMCA 3MWAA 1BKSA 1QOQA 4O54A 1W1ZA 1YDNA 1TV7A 2CLFA 4NQ1A 4UTTC 1LLWA 4MLRA 3NL5A 2ATSA 4JTHA 2YYUA 4Z1BA 3G8EA 3V1PA 1R47A 4GUIA 5AHMA 1YXYA 3GDKA 4NJKA 2OX1A 3OEXA 1OFQA 3NXFA 3DFPA 4JX4A 1R30A 3USBA 2Y70A 1VZWA 2B7NA 2H3DA 1W3IA 1H63A 4Y96A 3NQDA 1JR1A 3MW7A 4ONVA 2EF9A 2VEMA 3M5VA 1OJXA 2B4GA 4IMDA 1ZAHA 3W7NA 3C56A 1L6SA 4TU1A 3LCIA 1YTDA 4RZ4A 4WX2A 1GT8A 3MUXA 2E5DA 3RK8A 2P10A 5AYZA 1GYLA 2GPTA 1TRDA 3MHFA 3PBVA 2E6AA 1YYAA 2NXHA 2I14A 3U8GA 3HGOA 3VFLA 4RZ6A 3A23A 1VR6A 3QM3A 2Z2UA 3IV3A 4D2JA 3M16A 4ZMGA 2ZRXA 3ABQA 3SSJA 2V8ZA 3EEGA 3W71A 1FWTA 4CCCA 2GVLA 4UR7A 1LROA 2J9ZA 3NL2A 1K7XA 4AHOA 4BR1A 1OFDA 4ZQMA 5G5IA 4JTGA 3E0IA 5CG7A 1VHCA 3S0CA 1RQEA 4DO5A 3KX6A 1OK4A 3PAJA 4HSOA 1FDZA 3UNDA 1TB3A 4UCGA 1A5CA 5HR7A 1A53A 1W3NA 5A8GA 5D09A 1ME9A 3OIXA 3W70A 2W6RA 1Z42A 4HPJA 3DFOA 4RX0A 5AC7A 2FLIA 1SO3A 1KM5A 3PF3A 2QCGA 3G1AA 3MP3A 4H3DA 4M6PA 2A6LA 3IVTA 5LSMA 3NO5A 5BOOA 3E9AA 2QCFA 4AWSA 2NUYA 3LHUA 2TMDA 1C9DA 4IGHA 2G97A 3PWAA 2G95A 4FX8A 5E0KA 4A21A 3A22A 4DPPA 5DBTA 3N34A 3NQAA 3NQMA 1ICPA 1ME8A 3INPA 3KRUA 4RV8A 1RPXA 3LCGA 1SFJA 1T8XA 4ZZ9A 3TR2A 3P67A 3S8HA 3O8AA 1KM3A 2DU2A 4CCDA 4N02A 3LX9A 4C1LA 1LRTA 1UJPA 4IXHA 1JRCA 4KFPA 1O60A 1WBJA 2YFNA 1N7KA 3W7IA 4JS3A 5HQEA 5BMWA 5AOUA 4K7YA 3N19B 4X3ZA 5D2YA 3W7JA 4HNVA 2CZDA 2YXGA 2VOMA 3PS7A 1B4KA 3I68A 3VCRA 1WBHA 2V30A 3PR2A 5EMUA 3M43A 1I2QA 1F05A 2C14A 3TMLA 1LDCA 1KM4A 4Z0SA 3NQ2A 4RXGA 4QM1A 1XDMA 2QCLA 3EWYA 3CLMA 3FKRA 3CB8A 3NZ1A 3S5NA 1QFEA 3L2IA 4BI6A 3U2OA 1EP1A 1PIIA 3G0XA 1H5YA 1GJPA 3DHDA 3MI3A 1K8YA 1Q6QA 3EX6A 4FIQA 2VXNA 4JYFA 1YADA 1DKWA 5IBXC 3QMSA 2Z6JA 3M44A 5E93A 2NXGA 1P4CA 3L68A 1AK5A 2RDWA 1OF8A 4JR5A 1PL9A 3GNDA 4MIMA 2WOQA 5CZSA 1BWLA 2ZTJA 4MY8A 4ZL1A 1LBLA 3TC7A 1F2JA 3TV8A 5H91A 4FNPA 3UYCA 4TO8A 3LRKA 1AL8A 2YFOA 4QQ3A 3HG3A 1WOAA 3LXAA 2E68A 1GVRA 3W88A 1H7XA 3SGUA 1OF6A 3BLEA 3PG9A 1D9EA 2FPYA 4FX6M 3O15A 1AW5A 1GWJA 1I2PA 3DFSA 4FHAA 4O8RA 2RKXA 4LVAA 4XBKA 1KW1A 2EPHA 4K37A 4R7JA 3DU0A 1BTMA 3NGJA 4HHPA 3O1NA 5U4NA 5DLCA 1Z41A 3BK0A 3IIPA 1K8ZA 5K9XA 2I9EA 2J24A 3N9SA 5F1VA 1WYIA 4K36A 4FIRA 3LRMA 5DY2A 1H61A 4MLJA 4FB7A 5K4XA 4M7TA 4MFDA 1J2WA 5FI8A 3HG4A 1EWEA 3EX1A 3MBFA 3B0PA 3TA6A 4O52A 3HQ1A 4MYXA 3PC0A 5TBOA 4OHQA 1ADOA 2JKAA 3W84A 3QRHA 4O50A 4OE7A 3W83A 4JTSA 2QAPA 2JKEA 5D03A 2FDSA 5F4WA 3A21A 1SUXA 1EX5A 1YXCA 1QPNA 1SU5A 5LHEA 1XBVA 2NUXA 2ZZ4A 4UUIA 1FCQA 3TQKA 3CPRA 1BWKA 4A3UA 3OVQA 2A2IA 3S6DA 4JTFA 5CPLA 1VYSX 4R33A 1JCYA 4LVFA 3M5YA 1IGSA 3C61A 4WD0A 3LI0A 5D38A 4UIOA 4HT3A 3T55A 1CW2A 4KKXA 1G4TA 4L4MA 5HWNA 4JTTA 3GZ3A 4WQ6A 3FEMA 3GAKA 1GG0A 5C2XA 1IXOA 4Z08A 4U28A 1Z44A 3W72A 3GR8A 4EWND 4QAIA 1JQVA 3V75A 1T99A 4GUGA 3MMTA 3CEUA 4ZQCA 3CC1A 4QISA 3GX9A 1FXQA 2A7PA 3THAA 1W31A 5KTLA 2TSYA 3S5YA 1KM1A 1DQWA 3VE7A 1M5WA 3E49A 3NM1A 5CPNA 4M19A 3FJ6A 4BI7A 3ABRA 1DOSA 4O0ZA 5K7JA 1QDSA 3DHFA 3L21A 3R13A 1P0KA 4U4MA 4Z1AA 4POCA 1JULA 1SFLA 4MY9A 1VCVA 2Q8ZA 1KV8A 2R8WA 3ZWTA 3W85A 5HMSA 5D32A 4WUIA 3C2RA 2CLHA 4JYEA 2JGYA 4XZ9A 4N2YA 2V5LA 3ANYA 4HKPA 5EKYA 3CIWA 3YPIA 4O12A 1SO4A 1FCBA 4PH6A 3W7GA 2NX1A 3HGSA 2DZVA 4MJZA 1I2RA 3AJXA 4AHPA 1OX5A 3P62A 3CTLA 4O19A 3QSRA 4Y6GA 3DENA 5AHFA 2QCHA 3LCWA 3TSBA 1KTBA 1UASA 3C2VA 1D3GA 3M41A 3UWWA 1ZHAA 3M0ZA 3THQA 1OVDA 2ZA2A 1AW1A 4PL2A 2FIQA 3HBLA 3NOEA 3HPSA 4O15A 4O14A 3W6YA 1VYRA 2CFFA 3N2XA 2FB2A 2GQAA 2ZA1A 1VHNA 1JCJA 5J5RA 2Y63A 4BF9A 2OT1A 3JR2A 1NVMA 4YCPA 5G4EA 3DH7A 4NT0A 4NX5A 3MI2A 1XFBA 3PSVA 3LTPA 3QSTA 2ABBA 4E38A 1IXQA 2DZXA 1QWGA 5D2XA 4PEKA 1UCWA 5BRBA 2AQWA 3P5ZA 3W7QA 2VFGA 3KHJA 1R2TA 3W7PA 4IOTA 3E12A 3WK2A 4WOQA 3LHTA 2X1TA 3N14A 2QCMA 4LOCA 3G1YA 4LV9A 3IVUA 4K38A 1OFAA 1FDJA 1GVOA 2VEIA 4E2DA 1YPIA 5D04C 2ISSA 2QUTA 3BG9A 4YMZA 4FXRA 1FCVA 1N55A 3UZJA 3GDMA 2GQ8A 2PRLA 4OGZA 4Y90A 2D73A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FHC A;  4Z2L A;  1PSC A;  1U22 A;  4ZBC A;  3EWX A;  2ANU A;  2P0I A;  4D1J A;  2WM0 A;  2WV8 A;  1EP2 A;  4NX0 A;  2XTK A;  1AD1 A;  3ZYZ A;  4O1E A;  2XVP A;  4E4F A;  2NWR A;  1MEI A;  1MXG A;  3LNP A;  2ZIC A;  2PF0 A;  1KA9 F;  1L2U A;  1V08 A;  4LUI A;  4B4F A;  4DNH A;  4KIE A;  2JAL A;  5D2V A;  3LS9 A;  4L61 A;  4MJ2 A;  2V3E A;  1ZJI A;  3ZS4 A;  3VE9 A;  4ZB0 A;  3ATZ A;  2KZH A;  1AH0 A;  2FGZ A;  4GPN A;  3KOX A;  4MZ1 A;  1UB3 A;  4JTI A;  4ES4 A;  1O7A A;  3LM7 A;  1ZBC A;  3G24 A;  2WHK A;  3NNT A;  4A22 A;  3IUI A;  2DH3 A;  1DIO A;  3N6Q A;  1Z8A A;  4HTY A;  3OW1 A;  3OA3 A;  2W63 A;  3GW3 A;  4UTH A;  3OU8 A;  1WQ5 A;  3EXR A;  3L4X A;  3BLO A;  1V8E A;  1VFO A;  4PR4 A;  4ZO7 A;  2B0M A;  4PC8 A;  4IPJ A;  1R2R A;  1NOU A;  1I4N A;  2OSX A;  3C0L A;  3A3W A;  4QLL A;  4AZB A;  4RNF A;  4ENL A;  2HXT A;  3M1Z A;  3IK4 A;  3DX5 A;  1EDT A;  1UBP C;  3AJ7 A;  5DY3 A;  1UZ4 A;  2J7B A;  9RUB A;  4H6K A;  1TPD A;  1A4L A;  3W7O A;  1E56 A;  3AFB A;  2YCL B;  4D71 A;  1P43 A; 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