2FTPA

Crystal structure of hydroxymethylglutaryl-coa lyase from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
MNLPKKVRLVEVGPRDGLQNEKQPIEVADKIRLVDDLSAAGLDYIEVGSFVSPKWVPQMAGSAEVFAGIRQRPGVTYAALAPNLKGFEAALESGVKEVAVFAAASEAFSQRNINCSIKDSLERFVPVLEAARQHQVRVRGYISCVLGCPYDGDVDPRQVAWVARELQQMGCYEVSLGDTIGVGTAGATRRLIEAVASEVPRERLAGHFHDTYGQALANIYASLLEGIAVFDSSVAGLGGCPYAKGATGNVASEDVLYLLNGLEIHTGVDMHALVDAGQRICAVLGKSNGSRAAKALLAKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords hydroxymethylglutaryl-CoA lyase
publication title Crystal Structure of hydroxymethylglutaryl-CoA lyase from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 112
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 4.1.3.26: 3-hydroxy-3-isohexenylglutaryl-CoA lyase.
pdb deposition date 2006-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ftpA00
3QRHA 1C29A 1FY6A 1H7XA 5LGXA 2EF9A 3ELFA 3S8HA 1QO5A 1X1OA 4O4WA 4ZVJA 3EB2A 3SIZA 5DCEA 3PBVA 3VNDA 4JTEA 3M5XA 2RKXA 3CTLA 1O94A 4WY0F 3DI0A 4ZQCA 3RK8A 3IGUA 4M6VA 2EAWA 2CLEA 3NQEA 5CZ0A 4XUGA 1FWWA 1AMKA 5E0KA 1X8FA 4UR8A 4CCEA 3NL3A 2Q3RA 1GYLA 5HMSA 2JK2A 3FKRA 5FEXA 4I7WA 1NF7A 4JTLA 3TE9A 4FIQA 2Q8ZA 3M1ZA 3NAVA 3P7YA 4NXKA 3HG2A 4ADSA 1EWEA 4AHOA 2VEMA 2FIQA 1OYBA 4FNSA 5KTLA 5K4XA 1H7PA 4AF0B 3N73A 1OFDA 5CG7A 1TPH1 1U5JA 4D2JA 4UC5A 6ALDA 4HPJA 3ANYA 2BXVA 4BI7A 1MXSA 2DZSA 2NXGA 3UWZA 2P10A 2J27A 3G1VA 5A8GA 3S5OA 3T40A 2J6XA 1PHQA 3MYPA 3S1XA 1LCOA 1V5XA 4N9BA 3TV8A 3B0VC 2G5WA 4DQWA 3O1NA 3UD6A 5DLCA 3TSBA 3GDRA 3C2OA 1K7FA 5CZJA 2AAMA 4UTLA 3DFPA 4FF7A 1I2PA 1VYSX 3P80A 3W2LA 3EKZA 1KM0A 2NLIA 5DCBA 3W1MA 2A7RA 3TXVA 2CW6A 3LRMA 1TTQA 2NUYA 1ZY9A 4I7UA 5BNKA 5HR7A 4GUJA 1PE1A 3TJXA 2VENA 3B05A 4IMFA 3RF9A 1OK4A 1PCWA 3EXTA 1S5VA 3TFXA 5TQLA 2E6DA 3NZRA 1VHNA 4N9DA 4IMEA 3P61A 1ONRA 5I3FA 2NUXA 1VGAA 4LWWA 4MY8A 3W1NA 2A0NA 4WJEA 4S2CA 4GC4A 3E49A 3OIXA 4PA8A 2WNQA 5FI8A 3PVFA 3P62A 5KMYA 1QR7A 2YX0A 4IWWA 2DJXA 1K8ZA 2E5CA 3OA3A 2V0TA 4JXCA 3EWBX 3GNNA 4NJHA 3MP4A 4GRSA 3N19B 3FJ6A 1X7FA 3SFKA 4WD0A 4MPQA 4KKXA 2WKJA 2ZDRA 3PB0A 3NQ7A 4EWND 5AOUA 1H5YA 4N9EA 2WPBA 2ZA3A 2FFCA 3A23A 4J9JA 1W5NA 3W83A 4A3UA 1R47A 2QDGA 1ZHAA 1LTDA 1LOQA 3DFQA 3B8DA 3M5ZA 5AHLA 3Q94A 3PBYA 3HJZA 4JY9A 1FCQA 2BWGA 3W23A 1QWGA 3NO5A 3QJAA 3GDMA 3UY8A 1Q6RA 1UUOA 7TIMA 1VRDA 1VYRA 3LCWA 3SGZA 1JRCA 3TUUA 2C18A 3HPSA 3P60A 4GWEA 2NX9A 3S5NA 4LRSA 3T44A 2X1UA 4IX2A 3TXZA 1I2QA 4AXKA 1XKYA 2QAFA 3STGA 1YADA 4DF2A 1KFBA 3C4UA 3CM4A 3MO7A 2QJGA 3VCRA 3W22A 3GAKA 3WK3A 2NUWA 2DZVA 1X6UA 2ALDA 1QPRA 1FUYA 2C1HA 3TW6A 5J5RA 4JTSA 5CPLA 5E1QA 2BLEA 1KM2A 4O1DA 3L68A 3W7RA 2H8XA 3LTYA 4Q4KA 3PSVA 1MEIA 4QM1A 2YFOA 3LHUA 4YLWA 1I2NA 3ABRA 5D32A 2C14A 3GAYA 1JCYA 5AC6A 3RU6A 1EP3A 2Y63A 2P0OA 3UQNA 2DP3A 2DZPA 3TX9A 3MI3A 3NEVA 2ABAA 5F4XA 4JICA 2QCMA 1ICSA 1ZAJA 2PCQA 1KM4A 4ZZ9A 3GKAA 1EA0A 1DBTA 2DZWA 2TSYA 3P81A 1PIIA 4O52A 2WSYA 2YFNA 3ZS4A 2EGZA 4POCA 1ALDA 5K4ZA 3DBPA 5D04C 3QSTA 5LNRA 1WAUA 1TPVA 3TC7A 4FXRA 4N4PA 4W9TA 1DQXA 2B4GA 1SZGA 5MHBA 3EX2A 4DELA 3S1VA 1LDCA 3ZFHA 2CLKA 3W7QA 4O28A 4PTNA 3DFNA 4ZQMA 3SI9A 3C6CA 3LV6A 3GVGA 4GUFA 3W7KA 2YW3A 1NEYA 2I1OA 5GVJA 2R91A 1JRBA 1Z42A 1LORA 3GIYA 2A4AA 4IUOA 2EPHA 4JTUA 2VXNA 3V75A 1W0MA 1LRNA 2RH9A 4JTGA 2ATMA 1FDYA 2BX7A 5LNUA 5TIMA 5J5DA 3T4CA 4IQLA 3C2EA 1OX4A 2A5HA 5G1YA 4ZL1A 4ZQPA 3W7DA 4NU7A 1ZNNA 3W9ZA 4P61A 2ZYFA 3RFAA 3N2MA 1F05A 4AB4A 1DVJA 4XTIA 3UY7A 3EX4A 5D2TA 2WNNA 3G8RA 1G67A 1AL7A 2FPVA 3F03K 3M44A 2TRSA 1T0OA 3FYOA 1IIGA 3CWNA 2V81A 3NVTA 4O0ZA 4UMBA 4KWWA 1K8YA 2Y89A 1QPOA 2WQPA 4NT0A 1RVGA 3W76A 4N6FA 4X22A 2A21A 1WX0A 2FQIA 3OVQA 1O4UA 2JKEA 5D09A 5LNWA 4TX9A 1P0NA 2ISWA 1KBJA 3OG3A 1YXCA 2CLOA 3IIZA 4CLMA 2CLMA 3NYZA 1NAL1 5K2ZA 2NWRA 4FXSA 2E68A 1P4CA 1OVDA 3C61A 3C2VA 3PUEA 3HF3A 1Q6OA 4CNOA 1ME7A 2CZDA 4FNUA 1SZFA 2W6RA 3CC1A 5I3IA 1Q6LA 2XN1A 1H1YA 2YXGA 3O63A 4RZ6A 4EVZA 3LLFA 2WO5A 3QMRA 1W37A 1W31A 1TQJA 1UBSA 5BOOA 1PS9A 4M7SA 2F84A 3P82A 3MHUA 2Y62A 1FCBA 2Z0IA 1TO3A 4UNLA 4LC8A 3HGRA 1GVOA 3IIOA 1FXPA 1RZMA 2QCGA 3MHFA 1WDWA 3TKFA 3W1QA 1MZHA 3S9YA 2Z6IA 4LT9A 1FWSA 1TJPA 1G4PA 4UIOA 3SJ3A 3UNDA 2X1SA 3S6DA 1SSDA 3M41A 2QF7A 4LTSA 4FO4A 3SZ8A 3WJYA 1S5WA 4HHPA 4IOTA 3NQMA 1Z44A 4CNPA 2D73A 1KV8A 2JKAA 4MZ8A 1FWRA 4UTTA 4C1KA 3G0UA 4PL2A 1RQHA 5HWJA 2J9YA 3S1UA 2NX1A 3W85A 3GXNA 3E12A 2YW4A 1Z48A 5FF0A 1QOPA 1A5BA 2FTPA 1W1ZA 1JCLA 3EX1A 3W7OA 1QDSA 1B3OA 3E0IA 4UFHA 3F4WA 2ZFAA 4ZQNA 5FEPA 1BEUA 1GG1A 3MW7A 3PBWA 4DXVA 3P74A 5AFDA 1N55A 2YGYA 3W7LA 4Y9AA 5EMUA 3VFLA 4LU0A 4HNNA 2RDTA 1EP1A 2V82A 1XL9A 4TMCA 3L5MA 4IGHA 1I4NA 1VHCA 4IMGA 3LOTA 3MJYA 1K7XA 4BR1A 4QIUA 2QCCA 5F4WA 3SY5A 2C15A 1IXNA 2ZZ6A 1ZCOA 1LRTA 2B7NA 3LXBA 2NXIA 5A5WA 1HO4A 3CEPA 3G3DA 2TMDA 4UTWC 2ZQ0A 3LI1A 3E96A 2C0AA 2F7FA 4LRTA 3M43A 4FX7A 1J4EA 1IXOA 3CWOX 5AHMA 1S5TA 1W8SA 1F74A 1SFJA 2YPIA 1DV7A 3UZJA 1WA3A 3G0XA 3OBKA 3Q58A 2J9ZA 3ATZA 4MVAA 4UUIA 4GE8A 3O6DA 3PS7A 1XBXA 3IIXA 3W74A 4O57A 1FQ0A 1FX6A 4PCFA 4BF9A 1ICQA 1H1ZA 1M6JA 2HSAA 1EEPA 4OU1A 4AEOA 5K9DA 1F6PA 4N02A 3ABQA 4L4MA 1AG1O 4NJGA 4KFPA 4GUHA 2E5BA 3W86A 4AMAA 5D2YA 3G24A 3TQKA 1K03A 2PRHA 4WX2A 3IRDA 3TW7A 1XUZA 2QKFA 4UTIA 5I3KA 3W71A 1F76A 3QW3A 1EIXA 3H54A 4OT7A 3RMJA 2BTMA 3IVTA 3W7MA 3NPXA 2DJLA 4UFIA 4O17A 3BARA 4O19A 2ZRYA 3PBUA 3LDVA 5LNVA 5EKYA 2C16A 3HG4A 4MUZA 2V9DA 1GTEA 5CSRA 4DBEA 4PODA 3DI1A 4ONVA 5AHNA 3WFAA 2I14A 3C8FA 1EX5A 3C0JA 1NFBA 4JGDA 1YYAA 5H2ZA 4O12A 2DZXA 5D03A 4RX0A 4AWSA 5HUOA 1JCMP 3CEUA 4QQ3A 1A50A 2QAPA 4HNTA 3LCIA 3SR7A 3IIPA 1KTCA 5LKYA 1X1ZA 3GX9A 3KRSA 5CPNA 2VFFA 3UYCA 5LHFA 3EX3A 3N2XA 3MMTA 3DFOA 3MBFA 3W1PA 4MKNA 4QSHA 1JCXA 1F7BA 3T78A 1QPQA 3G1SA 4O0KA 2DORA 5D37A 3W88A 1F73A 5D33A 1XBZA 1XFBA 2ISVA 1TV8A 5LGZA 4UFKA 1F5ZA 1G4TA 2GJNA 4LOCA 3QC3A 5I3HA 1MO0A 1JULA 3LXCA 3HG5A 2V2CA 4MLJA 2QUVA 4EOUA 3EEGA 4O18A 1FDZA 4N4QA 3TJLA 4YCOA 3GZ3A 1KA9F 4H4IA 1XDLA 3N9RA 1ZAHA 3UPWA 3LLDA 3WJSA 2NXHA 4ZQRA 2ZZ5A 3TCEA 2ZZ4A 3YPIA 3IGSA 2QCFA 4GUGA 4UMAA 1VLIA 1GT8A 4DEFA 1OYAA 4H3DA 4ZMGA 4RK8A 3DKLA 2A7NA 4HNVA 4FEZA 3NL2A 3DXIA 2WNZA 3M9YA 3W7EA 3EKLA 4K37A 5L9FA 4PL1A 5DBTA 4UTJA 4QISA 1O95A 3M0ZA 5AYYA 3TAOA 1GJPA 3HPZA 1TMHA 2OMAA 1L2UA 2BZNA 4RLIA 2PURA 4OHQA 2A7PA 2G95A 3CT7A 3GDTA 2G96A 4GFSA 4C1LA 1AL8A 1IIHA 4UFJA 3B06A 3STEA 4NJJA 4IMDA 3P8JA 3PC0A 4O8RA 5K9CA 2VFGA 2WV8A 3BPWA 1AW5A 4O15A 1K8XA 3W1XA 3CU2A 3FIGA 5C6MA 4JYEA 1R30A 3A5FA 1YPIA 2VFDA 2X1RA 5DY3A 5C55A 2H90A 2R14A 4DF0A 3TAKA 3W6YA 1HTIA 4UTKA 5FEZA 4UTMA 3LHYA 2A85A 2YDAA 3B0PA 4PEKA 3W7CA 4BK9A 3NDOA 4JDBA 4R53A 3WJWA 3ATYA 4UFLA 1VLWA 3NNTA 1B4KA 4AF0A 3TROA 1BWKA 1LLWA 4M6PA 1R2RA 3IVSA 4BFAA 1TPDA 3CB8A 4JD4A 3NPVA 4ADTA 2OX1A 1VZWA 2Y70A 4K7VA 5HULA 3PM6A 4PH6A 3TFCA 1H50A 4NXSA 4A29A 2Z6JA 4ICNA 1GG0A 2O7SA 1OFBA 4WY0B 1GPWA 1OX6A 1WBHA 3BK0A 1WQ5A 1KM6A 3MWAA 3TQ0A 3L2IA 5D02A 1G69A 3IIVA 1LBFA 3NQ2A 4XKYB 3WJXA 1FDJA 1PVNA 1OFOA 3LERA 1G6CA 2Y85A 3H53A 4JTHA 3GDKA 1GZGA 2NX3A 2VKZG 3GK0A 5F2MA 3LTSA 3BLIA 4JYDA 2C6QA 2H6RA 4HN4A 3NOEA 2ZZ7A 3LX9A 4N9CA 5CSSA 1KV5A 3W7JA 4O1BA 2YZRA 3R13A 2Y88A 3P84A 5F1VA 3FKKA 5C2XA 2R94A 3PUOA 1FWNA 2V5BA 1JUEA 5I3GA 3OEXA 1RPXA 5EA9A 3QZEA 1VPXA 4FX6M 3GLCA 3IGXA 1CW2A 1H7WA 3W87A 1HO1A 2ZRXA 1R2TA 4NZFA 1I2OA 1TTJA 3L0NA 3KRZA 2B7QA 2Y7EA 3C56A 5G2WA 5C54A 2J88A 4QNEA 1QMLA 3W70A 4FB7A 2CWNA 3N14A 1SO5A 1ADOA 1OX5A 1D3GA 3BG3A 4NQ1A 3ABSA 3NGJA 1D3HA 3G1XA 1EWDA 4R7JA 3MI2A 3ZR4A 4O10A 3HIJA 4Y90A 1GEQA 2TPSA 1R46A 5HNRA 3UXDA 2KZHA 3W7HA 1AK5A 4NVTA 3R5EA 1IXPA 3MI6A 3VE9A 1DORA 4CQ8A 1O60A 3TSDA 3NG3A 3FFSA 3TMLA 1TB3A 4LV9A 3HGJA 4O1AA 1DHPA 1GWJA 1SZNA 1NSJA 4UXDA 5AYXA 1KLYA 1R2SA 4KWVA 1FXQA 3G1HA 3NQCA 3O16A 4U28A 3S5ZA 1YDVA 1VS1A 4DPQA 2Y7DA 2E6YA 4LC6A 2A6NA 3GDLA 5EY5A 2CU0A 3NM1A 1SW0A 2PRLA 3U8GA 5G4EA 2GVGA 3LRKA 3W7IA 3AJXA 2FB2A 3W1LA 2O7QA 3CQ0A 2ZRVA 1O5XA 1Y0EA 3HQ1A 3O6CA 3C52A 3PWAA 2E5DA 1G7VA 1KFLA 1M5WA 4E38A 2FDSA 3LCHA 1TREA 2B0MA 3GNDA 1Q3NA 2ZTKA 3PUDA 2QCDB 3W1RA 5DBUA 4EF9A 1DL3A 2CLLA 3W2NA 1JJKA 1OYCA 3F1QA 4UTHA 2V2DA 1KFCA 3HB9A 4O16A 4R33A 1GTHA 1PV8A 1UASA 1I45A 1OFRA 1HUVA 2FLIA 5EL1A 3G3MA 3W2MA 2WJZA 3VE7A 1GYNA 2YYTA 1LLZA 4WXZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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