3NYZA

Crystal structure of kemp elimination catalyst 1a53-2
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAAYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLAIATEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDENDLDIALRIGARFIEIASRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAWQGISERNEIEELRKLGVNAFGIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
publication title Iterative approach to computational enzyme design.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 102
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nyzA00
4UTJA 5L6UA 2PURA 4EWND 2DZVA 3KX6A 2BXVA 3W7RA 3F1QA 3C4UA 5GVJA 2HTMA 2A21A 4R33A 4U4MA 1M6JA 1ZCOA 3B4UA 2E6AA 1OABA 1KM1A 4AH7A 2P10A 4E2DA 4YLWA 3CIXA 4HNUA 1KBIA 3NQ6A 3GDMA 3VE9A 1SFJA 1XBVA 2OT0A 1HUVA 5LNWA 4LNYA 2GPTA 4JN6A 4M7SA 5EL1A 1DBTA 5MHBA 1KFCA 1SPQA 4NZFA 1B57A 4I7WA 3S1VA 1J2WA 1C8VA 4X3ZA 1OK4A 3OG3A 4GXMA 2WNNA 3P62A 2CZFA 5CSRA 3T4CA 4ZQMA 1WBHA 2C14A 1CW2A 4O50A 4OT7A 5LNRA 1WOAA 1I45A 2JGYA 4PH6A 5FEXA 1DVJA 3TJXA 5FEPA 2DJXA 1LOSA 4IMDA 3DFQA 3W3OA 3DFOA 5D2YA 2A7NA 3OHIA 4UUIA 1DHPA 3SJ3A 2ZZ2A 4K7VA 4DELA 2QCMA 3ZR4A 2ZRZA 4M19A 3IGXA 3FJ6A 4ZVJA 1GVOA 2E09A 1Q45A 2AAMA 3QQ1A 1KFJA 5C6MA 3CM4A 1W0MA 3DAQA 3GR7A 4PA8A 3ZWSA 1W5PA 3GK0A 1X1ZA 3MMTA 1H50A 4BFAA 3HG2A 3EWZA 4LS0A 3NZ1A 1VLIA 4FO4A 4QNWA 1EP1A 3USBA 1GJPA 4KFNA 4XBSA 2C1HA 3CU2A 2W0UA 3W1TA 1R47A 2H3DA 1WV2A 1I8JA 3L5LA 3C2FA 1YADA 4FNPA 4Z08A 5DN1A 1Y0EA 1TQJA 2QUVA 5TBOA 4H3DA 3ANYA 3S5ZA 3LCXA 5D2TA 3MHUA 4K36A 2H8XA 2EGZA 4OE7A 3WK1A 2ZRXA 1TPEA 4HNVA 3F4WA 4Y8FA 2NX3A 1TPDA 3LB0A 1VYRA 4LC6A 4FNTA 1Q3NA 4AB4A 3EB2A 4JTSA 1DQXA 4NU7A 5IM51 4BI5A 4NUWA 1XBYA 5ABTA 2WOQA 1N8FA 1AW5A 2PCQA 4L4LA 5AHNA 3ZFHA 3HO8A 2XN1A 2TPSA 1YLVA 1VPXA 1ZY9A 2Q3RA 5TIMA 3MW7A 1AL7A 5T26A 3MUXA 3FYOA 4ADSA 1OX6A 2Y85A 4IOTA 4GC4A 3IIXA 4H6KA 2ZRWA 4MFDA 4LUJA 1TSIA 3P5YA 3MBDA 3L5AA 4ZQCA 4ZQOA 3THAA 3OEXA 4JTLA 3G1XA 3LCFA 3GZ3A 3PULA 4YL2A 1KM0A 4NT0A 2QR6A 4CNNA 2VEPA 1T8XA 4ZL1A 3DFSA 4NJKA 1SZFA 2GQAA 3HIJA 4FNSA 4JNMA 1VCVA 1YDNA 1G7VA 5CZSA 4JX5A 5F4SA 2CLMA 1D3GA 6TIMA 3FS2A 5DCEA 3NQ7A 1H7WA 4MOZA 1IF2A 4LVFA 2E1DA 3EX6A 2NXHA 4JR5A 2ZA2A 3IV3A 2RHGA 3NQFA 4J9JA 4M5PA 1OFOA 3N3MA 5KMYA 4ZZ9A 3NPWA 5AC8A 3L9CA 3NNTA 1I2QA 3N9SA 3NVTA 2A85A 1HFBA 4UFMA 3HGJA 3LBCA 3DH7A 3S5YA 3LTYA 1GTHA 4CNOA 2PE4A 3EKLA 1OYBA 3H53A 4WD0A 3VNDA 4IPIA 4A29A 1W5MA 1FX6A 1P4CA 4O16A 3U8GA 1BWKA 3LBMA 3LRMA 1VS1A 1NFBA 4N6EA 4GNJA 2WV8A 4K8HA 1KV5A 3P60A 4KWVA 1QO2A 5G2WA 4Z1BA 3UXDA 3WJYA 1TJRA 3N19B 4O53A 3BW2A 3C3NA 3IVSA 1JCNA 4QM1A 2Z0IA 3PF3A 3ATZA 2V81A 3T55A 3W85A 1OX5A 1HG3A 3TJLA 4UMCA 1P5BA 2C15A 1KTNA 1LZOA 1XDMA 4W9TA 2Q8LA 1R30A 4LVAA 5D05A 3T40A 4GUIA 5CKSA 3EXTA 1LM1A 4NJGA 1E51A 4WOQA 3LTPA 3ABOA 2CZ5A 1N55A 5AYXA 1VC4A 1TRIA 2PRHA 3N2MA 4U28A 4JIPA 1F05A 3DKJA 4IXHA 3CIWA 3CT7A 3LHTA 3QZEA 3UWVA 3GKAA 1Q6LA 3FLUA 3IVTA 5EY5A 3T7VA 2A2IA 4WY0B 3NQDA 2NV2A 3I6RA 1Q6RA 3KVJA 1KBJA 3TA6A 5D2XA 1OX4B 1AW1A 1TB3A 3W1MA 3I7QA 5AOUA 1V5XA 2V2DA 3B03A 4Z1CA 1A53A 2C19A 4CQAA 1KLZA 3KFTA 3C2OA 3PBUA 1KM3A 4E38A 1RQHA 1THFD 2I9EA 3G0XA 2Y61A 2WSQA 3TXVA 5KZMA 3M44A 4GJ1A 3PR2A 3EEGA 2CLIA 3RK8A 2ZBTA 4MKNA 3PBYA 1K7FA 4P2VA 3TW7A 3W75A 1VRDA 5G4EA 1FWRA 3W2KA 3A5VA 4OWGA 1SO6A 4JTUA 1X6UA 1H51A 5AHEA 1F5ZA 2CLKA 4EIVA 2CU0A 1H60A 1O95A 4GUGA 1KV8A 4K6AA 3UNDA 3MI2A 4Z0JA 3M1ZA 2DZXA 3NEVA 1H1ZA 4N02A 2G5WA 1KFBA 3R2GA 3UWQA 4CCEA 1FWSA 1O94A 1G69A 1SZNA 4E0CA 1SW7A 2BX7A 2JKPA 5D30A 1F73A 1TJPA 2Z2UA 1W3IA 2YDAA 3DI0A 2FPVA 3TSBA 5DY3A 1OFRA 2E6YA 1EUAA 4UIOA 4JTEA 4PCFA 4LC8A 2VEMA 3M5YA 4CCCA 2NWRA 2RH9A 3M0ZA 3PM6A 1GVRA 1K02A 2NWSA 2YCEA 1IXQA 1ZALA 4NXKA 4Y96A 3G3DA 1NF7A 1SZEA 1HO4A 4A2SA 4MY1A 4AHPA 5I3JA 4FNRA 4BI6A 3DENA 4EF9A 3HOJA 3UWYA 1FDJA 4AWSA 1I4NA 1ICQA 1H61A 1FWNA 3W76A 1QCWA 2TRSA 3NL3A 2HSAA 4Z0SA 3W88A 1FCVA 3E96A 3K30A 3WK2A 1NVMA 3QMSA 2E5DA 1K7XA 3QC3A 3WJSA 1W56A 5DY2A 1JRBA 1F76A 1JCLA 2ZDRA 4WJEA 4N4PA 3FKKA 2A1YA 4Y90A 1R46A 3FEMA 5CPOA 2E5CA 4DBDA 1FQ0A 3KRSA 1GG0A 3QMTA 3G24A 3KHJA 3N34A 3PG8A 1H7OA 2KZHA 3PVFA 4DPPA 2ZTKA 2NXIA 3T44A 3HF3A 2E6DA 5EPDA 1W54A 2YSWA 3N2XA 3LCWA 3BLEA 1MEHA 3NL2A 3EWXA 4QSHA 3PBVA 3BGJA 2GVLA 3NR0A 2HMCA 1VR6A 3EWUA 1G4TA 2P1FA 5HQEA 2HS8A 3CWNA 4LV4A 4DBEA 4O1DA 3M5ZA 2UV8G 2IQTA 3CLMA 1T0OA 5F2LA 5HUPA 4NX0A 4NZJA 5AYYA 1PCWA 1VQTA 2NUXA 4MJMA 1WA3A 1JCXA 4ZQRA 5KINA 4WY0A 5DXYA 3UWUA 1ZHAA 1QPOA 2NV1A 1XM3A 3HBLA 1OX4A 2QKFA 2V5LA 2FFCA 4LY8A 1MXSA 4TX9A 3MP5A 1H7XA 4O17A 4TU1A 5G1YA 4WX2A 2B7NA 1GG1A 2BZNA 3IIPA 1BTMA 1TTIA 3G1SA 2FJKA 2HS6A 4S2CA 3S0CA 1ADOA 1B4EA 3E49A 3ZS4A 4R53A 1VCGA 3GB6A 3W22A 1B9BA 5IBXA 3F4NA 2QUTA 4XKYB 2O7QA 5FF0A 2DZSA 1XFBA 1PVNA 3EX1A 2GVGA 4O0KA 3W2MA 1OFPA 3W7DA 1QPQA 2Y7DA 3SI9A 5HWMA 3W70A 2ATMA 4Z1AA 4DEFA 4LOCA 1Z41A 3W7KA 3PC0A 3WJXA 1MO0A 4ADTA 3TK7A 1ZFJA 3QPYA 3WK3A 3L66A 2FDSA 1H7PA 1MEIA 1N7KA 3C0JA 3C2RA 4Q32A 2ZZ7A 1H1YA 3NQ8A 2YFNA 3MHFA 3MI6A 2QF7A 1MSSA 2V5BA 4O1AA 4LW7A 3O6CA 4JXCA 1F74A 1EB3A 2Y89A 3N73A 1OFEA 4Y9AA 4X2RA 5D09A 1W31A 4LS2A 4TO8A 4ICNA 3E02A 4RCXA 5LGZA 1RVGA 4XZ9A 4DO4A 1YYAA 2CLHA 4KWWA 1QNVA 1P1XA 3S5OA 5G2HA 4JYEA 3P8JA 3W7NA 1G7UA 3QH2A 3W7QA 3MYPA 4GBUA 2WSYA 5KSWA 3W71A 3QSTA 1AW2A 4O28A 2CLLA 3NGJA 1SW0A 2V8ZA 3G22A 4HKPA 5LSMA 3KRZA 3QM3A 4FIQA 1O4UA 4FXSA 4HN4A 2A4AA 4MYAA 2OJPA 2G97A 4LVDA 1I2NA 1D3HA 3TE9A 1TTQA 4A21A 6ALDA 3TX9A 4UFJA 1S5WA 3N9RA 2FPYA 3UXAA 1B3OA 1MZHA 4KFPA 3QEZA 2V30A 4DF1A 4DQWA 1VH7A 3A23A 3NQ2A 3YPIA 3UYCA 1K8YA 2R91A 4KFOA 1GEQA 4MUZA 2ZZ3A 5CZJA 3NQMA 2Q3OA 3NA8A 1SO4A 5LKYA 4E2BA 1SZGA 3TAOA 1TV5A 1JUBA 3DFTA 3NQEA 3CB8A 1ICSA 2E5BA 3RLVA 3G8RA 1GWJA 3W9ZA 5FEWA 2FB3A 3O06A 3LERA 3GX9A 2G95A 3S8HA 3C2EA 1K7EA 4Q4KA 3CPRA 1OYAA 2Q8ZA 3BGGA 4B5NA 5F1VA 3P8IA 1Z44A 4GUJA 3PY2A 4NVTA 1KM4A 3KVMA 2B4GA 1GVQA 4O11A 1ALDA 3UY8A 1Q6QA 3OVQA 4UFLA 2QCCA 3W7OA 2Y7GA 1K3UA 4GRSA 1L2UA 1GVFA 4BF9A 3CEPA 1M5WA 4R7JA 1RR2A 1XL9A 1TPC1 4PFMA 5SWUA 3TMLA 5K9DA 4JICA 4NNAA 3GAKA 1KM5A 1U5JA 2QAPA 1LP6A 4XKYA 3B06A 2RFGA 1ZAJA 4JTTA 2GQ9A 1LBMA 1V7YA 2DORA 3PB2A 1XUZA 2ZRYA 1W8SA 5J5RA 1QPRA 1VLWA 1GTEA 2NXGA 3R13A 3LCHA 2WNZA 4LVBA 3LX9A 5HWNA 5CSSA 1DL3A 3TR2A 4I9AA 1AG1O 5DBTA 4ONVA 3NPUA 1TRDA 5K4XA 1BEUA 3LI0A 1OF6A 1I2OA 3WFAA 2ZZ1A 2FPTA 4HNNA 4JTHA 3OIXA 3MBFA 3TUUA 1QMLA 1TMHA 1RV8A 2ABBA 2NX1A 3LHYA 3LI1A 4YWIA 1AL8A 1YXDA 1P0NA 2P0OA 3G0SA 2VKZG 4O8RA 5CGQA 4UFHA 2J88A 3DKLA 3JRKA 4WXZA 5I3IA 3B0PA 3B0UX 1R2TA 1H7RA 1BWLA 4FX7A 3UWWA 4NJJA 7TIMA 3DU0A 3M7WA 4NXSA 1R2RA 1IXPA 1UCWA 1KFLA 4BK9A 1JRCA 4O19A 4UNLA 2X1RA 3EXSA 2OZ0A 4IMFA 5AN7A 2J24A 2C13A 2FB2A 2F84A 4RX0A 3P61A 3R8RA 2EF9A 3TAKA 4XBKA 1DOSA 1J4EA 2PRMA 3NQAA 5DCDA 1FUYA 1H63A 4UTLA 3OA3A 1I2PA 2R14A 2ZZ5A 4P61A 2ZRUA 2QDGA 3MWAA 3W1PA 1D9EA 3KRUA 2QJIA 3OVRA 3F03K 1X7FA 3PUOA 4UCGA 3TQKA 4DO5A 1JCJA 1LTDA 1PCKA 3DBPA 2VFFA 2JKAA 3S1XA 3EXRA 2CFFA 1JVNA 3GVGA 2ISSA 4N9BA 1QO5A 1J5TA 2CZDA 3FIGA 1JCMP 1PS9A 1OFDA 1VHCA 1TPFA 3GAYA 3RF9A 5AC6A 1W5QA 4POCA 3RLUA 3TROA 4O1BA 4WUIA 4A22A 1KM6A 1LDCA 5CPMA 2BSLA 4LU0A 2QCDB 4JIQA 2BLEA 3U6WA 3G1YA 4RZ4A 2YYUA 3W7JA 3QPZA 1FCQA 3ABQA 4PEKA 3LDVA 5I3FA 2DZWA 3LCIA 3UPBA 5AYZA 3IEBA 2EPHA 2NLIA 3THQA 3C8FA 3B0VC 2YXGA 3VI2A 3LXBA 3NXFA 4D2JA 4UTIA 5D32A 1YPIA 4FNUA 3GIYA 1FCBA 3W7LA 1C29A 4JX6A 1LBLA 1SQ7A 4IMCA 1Z48A 2NUYA 1HTIA 2V9DA 3SSJA 2W6RA 4JD4A 1HO1A 3M5XA 3HPZA 2QCLA 3PG9A 5BOOA 1SSGA 3LHVA 4NQ1A 1TIMA 3L68A 4IWWA 5K4ZA 5E0KA 1EP2A 3L0GA 5K7JA 3GNDA 3O1NA 1UB3A 3L65A 3MP4A 3G0UA 1A5AA 2VC6A 1ME8A 2ISWA 1T99A 1TYGA 5F4XA 4ORMA 4HHPA 2YGYA 3P5ZA 2GUUA 4WOZA 3O15A 3O8AA 4UC5A 2YFOA 1CX9A 5EBUA 3LOTA 1PIIA 1IIGA 3PUDA 4O4WA 4DF0A 2O7SA 3D0CA 4HIBA 1DQWA 1R2SA 3W1XA 4KKXA 3W07A 5LGXA 2TMDA 3MJYA 3CC1A 4NNBA 1VCFA 3A5FA 2ZFAA 4A2RA 3BW3A 4OV9A 4XWUA 4EVZA 1QOQA 4DO6A 4EOUA 1TV7A 3CHVA 3EWYA 4HNTA 4O52A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CT2 A;  3KX6 A;  2YIH A;  5A6B D;  3F1Q A;  3KL3 A;  4F0M A;  2A21 A;  2F6X A;  4U4M A;  4CEU C;  1MQQ A;  5DO8 A;  4DVO A;  2OQY A;  1OAB A;  4AH7 A;  5A6A A;  1JYN A;  4E2D A;  4IIB A;  4BS0 A;  1KBI A;  1XFC A;  3VE9 A;  5C7H A;  3GM8 A;  2OT0 A;  4V27 A;  5E0C A;  4LNY A;  2GPT A;  4JN6 A;  3ARV A;  4ZBC A;  1IWB A;  3PHA A;  4I7W A;  1UP2 A;  5AZ1 A;  3KOY A;  3OG3 A;  4GXM A;  3P62 A;  1OC5 A;  2DW6 A;  4ZQM A;  1GHR A;  1S1R A;  4GC3 A;  1R3W A;  4GKL A;  1FH8 A;  2DJX A;  2VUN A;  3BJT A;  2J47 A;  3ARR A;  4EXQ A;  1B2Y A;  2A7N A;  3CL6 A;  3ARW A;  4DEL A;  2VL4 A;  3FDG A;  3VII A;  2NSO A;  1DWJ M;  3ZR4 A;  1UKO A;  4M19 A;  1ZQ5 A;  4GIS A;  3QQ1 A;  1V79 A;  4PMR A;  3G1R A;  1MNZ A;  2R1N A;  3W4R A;  1W0M A;  3GR7 A;  4PA8 A;  3KLL A;  3DHU A;  3MMT A;  4BFA A;  2HDJ A;  4F2B A;  1ISY A;  3EDE A;  1J0J A;  1F3T A;  3NZ1 A;  1AQM A;  1VLI A;  1XSK A;  2BOE X;  3USB A;  4KFN A;  4XBS A;  4AYS A;  4O1E A;  1XLD A;  1XYC A;  2O4Q A;  4PGL A;  4C6C A;  1U1U A;  2FGB A;  3L5L A; 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