1QNRA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
source organism Trichoderma reesei
total genus 138
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnrA00
5C71A 1E6NA 1V6XA 3K8LA 5IFTA 1JNEA 1H41A 2ZXQA 4PTWA 1NQ6A 3WEMA 1JAKA 1V02E 4FLOA 2GJXB 4TVCA 1YQ2A 1GQKA 1V6WA 4Z2HA 2BHZA 1F4HA 1PX4A 1TVNA 4U3CA 1W1TA 1SFSA 4PMXA 3L4VA 2YA0A 3AQUA 4QAWA 1XH1A 1BGGA 2ZUTA 4MJ2A 4J7RA 2XWDA 1XGZA 3APGA 2EPLX 2GJRA 4GI6A 1CNVA 3VIHA 4JCLA 4OJYA 1CXKA 2WANA 1QI5A 4B16A 1GVYA 1QOXA 3K8KA 3VILA 3OGVA 1JYVA 2V3DA 1QNPA 5BXSA 4Z2JA 4F79A 4WF7A 3FNDA 3VMOA 4UNIA 1UR9A 1B3WA 1FH8A 4HMEA 2JIWA 2WMJA 4FK9A 4XV0A 1V3HA 2VZTA 4PMQA 3T2OA 2ZICA 5JBEA 4D6IA 3AHXA 4B3KA 3L4XA 1FH7A 2V3FA 4W7UA 3MMDA 4QP0A 5A94A 1EQPA 4W93A 5D9NA 4GQQA 1EA9C 1JFHA 3VPLA 1V6YA 1LWJA 1B3YA 3WELA 2XM1A 4AEEA 5CPTA 3CUFA 1NWUA 1FP9A 3OGRA 3VNYA 4P8XA 4BQ5A 3AZSA 1C91A 4JKMA 3CIVA 4PUEA 3ZO9A 4HOWA 1UUQA 3T2QA 1H2JA 1UR0A 4CN1A 3WY1A 4H7VA 4C7DA 1W3KA 1EQCA 1QNOA 1VAHA 4AD5A 1X1NA 1H11A 4GI8A 4UQAA 2WWCA 4UFIA 2WWDA 3GXMA 5CPSA 4J3XA 1PIFA 2VX6A 1WAWA 4UCFA 4BF7A 4W86A 1LL4A 1MWOA 1KBKA 1JDCA 5DT7A 2VRQA 1PPIA 3SCSA 3VIFA 1CXEA 1JNDA 4UQCA 4WLCA 2O9PA 4U31A 4DM1A 4FMVA 1EIBA 3ZJ6A 4AD0A 3AMGA 1OM0A 1JYXA 3L2LA 1GOMA 1G1YA 1X6LA 4A3YA 4P7OA 4EK7A 4DWSB 1LG1A 4Q22A 1PJ9A 1R87A 3VMNA 5A6BD 4FLQA 4PMNA 4WKAA 1E15A 8A3HA 3FN9A 2JEPA 1KFWA 3GNRA 2G41A 2QV4A 1QI3A 2WVVA 3BSHA 4JL1A 4X0VA 3AIBA 2CETA 1JZ6A 5LA1A 1V6VA 2VL4A 3SCPA 3RCNA 3EMZA 1HJUA 2WZIA 2WZEA 3W6LA 3ZIZA 1UR2A 2J77A 4CN4A 2WMGA 2E40A 2A3CA 5CXPA 1JD7A 2WCSA 2A3EA 4S3JA 3VIJA 2J79A 3LMYA 4MDPA 1UR4A 3GDBA 4GO9A 1XRVA 2ZUWA 3LPFA 5HPCA 3S2CA 1BYBA 4CD5A 2CBJA 4AWEA 3WF1A 1C8YA 3QHNA 3VGHA 3MUIA 2WW5A 3BH4A 3EDDA 5F7UA 1QW9A 1E72M 1NP2A 5CGTA 2WNWA 1J0HA 2XVLA 4TX6A 1E40A 2QPUA 3WIJA 4B9ZA 1OGSA 3FXYA 3SCUA 1SMAA 3WF0A 2AMGA 1M53A 4WSKA 3WH6A 1W9PA 1GOIA 2VRKA 3A3HA 2X0YA 1EHAA 2DT3A 5DF0A 4DUVA 2WM0A 4JKKA 1BVZA 1BYCA 1LQ0A 1UZ1A 3AYSA 5A6MA 2XUCA 1GOWA 3RMEA 4PCSA 5ABFB 1GHRA 1E55A 1GOKA 6A3HA 3WEOA 4H8HA 4HZ6A 1WZMA 2NT0A 3UG4A 3VD4A 2NW0A 3AHTA 3TTOA 1ITCA 1K9EA 1JF5A 1MQQA 2J4GA 1MW0A 5C8BB 1FP8A 3K4DA 3OG2A 1K9FA 2WMKA 1TA3A 1UWIA 3ARTA 1CGYA 1ISVA 2CPUA 4F8XA 1B90A 3BLPX 3AIRA 4EKJA 4MNMA 3AIQA 3CUIA 3OIHA 1JZ2A 4D1JA 1XCXA 4MAVA 2D22A 3N18A 3W53A 3M6DA 3K8MA 5BXTA 3NSXA 1LF1A 3PTKA 2ZX9A 3HMCA 3WNMA 3IJ7A 2FHFA 2DIEA 1FOBA 1Z32X 1M04A 2DH2A 4D6CA 2AAAA 2YBTA 3BCDA 2D1ZA 4KWUA 5LYRA 2V5DA 2XG9A 2YA1A 1KWKA 4XX6A 4U2YA 5DMYA 2WXDM 4H41A 5IFPA 2CERA 1G01A 3AIUA 1R7AA 3W29A 1ODUA 2WMHA 4UFJA 4RE3A 1E0VA 3EBVA 2BY0A 3N04A 1UWSA 1QW8A 5GNXA 1HNYA 3VGFA 1HJVA 2WKGA 3MMUA 2IUZA 2GVYA 3BMWA 3WF4A 1DP0A 1B3XA 1VJZA 1WO2A 1UA3A 4PMDA 2DT1A 3SUUA 4NRRA 1NARA 3QOMA 1UD8A 2W62A 1OGGA 4DWSD 5KZ6A 1E4NA 3M07A 4W87A 8CGTA 5IXEA 1UKQA 5CG0A 1E9LA 1MFUA 3WFLA 1R85A 3IJ8A 3VU2A 2VMFA 1BF2A 3ARYA 3KEHA 3GXFA 3WBAA 1HKKA 1KR0A 5A6AA 4PTVA 1L0PA 2VOTA 1GNXA 4YPJA 1E0WA 4BQ4A 5A95A 5DT5A 2V38A 4XB3A 2EPKX 5JUVA 3CUGA 5JIWA 1CXLA 3L4TA 2DIJA 1JZ7A 1C7TA 3GTNA 5E09A 1HL8A 4J28A 1DWGM 2Y4SA 1E3XA 1V08A 4RE2A 4J3VA 5I78A 4AD2A 3ZR5A 1KCLA 1BYDA 1EO5A 3EDJA 3SUTA 1ISZA 3QOKA 1D7FA 3ZT6A 1KGUA 3VO0A 3TP4A 2W92A 3VVGA 5D8ZA 3OLGA 2VJXA 1W3HA 3WDJA 4HU8A 1KQZA 1Q4NX 1HXJA 1ZBKA 2WLZA 3SUSA 2F8QA 1KXQA 3WD3A 2V5CA 2G8ZA 1UH4A 1JYWA 4HP5A 4L4PA 1EXPA 3HJEA 5AYIA 4ZE5A 2OYKA 4TX8A 3F4VA 1B2YA 1E4IA 5EMYA 1KB3A 3FAXA 3BGAA 4CN6A 4HU0A 4P7RA 2CBIA 4M56A 2XTKA 5JBFA 2ZIDA 3AI0A 1CXFA 3NDZA 4UZSA 5CGMA 2J7DA 4AYSA 2ZUUA 4TVUA 4M29A 3BMVA 1MQRA 5A6JA 1I1WA 1XH0A 4GQRA 1R8LA 1FA2A 2YDSA 4Z2LA 1DWFM 2XVKA 4WJXA 1G0CA 3N1AA 1MQPA 3NUKA 5DFAA 1OGBA 3MMWA 2IXVA 3IK2A 5D9PA 3WL1A 3VKKA 4ZEPA 1E0XA 1UKPA 3AS2A 4OIFA 1Y7VA 2XIIA 2QMJA 4MJ4A 3CTTA 3DECA 2J7HA 2RGMA 4HOZA 1IV8A 1ZBVA 3K46A 1GONA 4HMDA 4JAWA 1VEMA 3WDPP 3ZJ8A 2VZOA 1XYZA 3UR7A 1ESWA 1FFRA 4PMOA 2O92A 1GCYA 1LLOA 1KQYA 1UD6A 2EQDA 1EDTA 2FGZA 3ZSSA 3N13A 3WNLA 2ZUNA 1OINA 1AMYA 1IZJA 4BA0A 3PTQA 2WVSA 5ABHA 2XVNA 3BAJA 4OOUA 1NM9A 1VFMA 3BSGA 4QCFA 3VGBA 3AISA 1OIFA 3J7HA 3PZQA 4AISA 4LGXA 1WPCA 4N42A 2QLYA 2JFEX 2WC3A 4LYPA 3KE0A 1NOUA 2UY3A 4J3SA 5IDIA 3I3BA 3GYCA 4B9YA 5TD4A 2WHJA 4JFTA 4CD6A 1PAMA 2J78A 3EDEA 2ZOXA 3IANA 3I3DA 1B3ZA 2OSXA 2G3NA 5ABGA 1MW2A 1UR1A 4YHGA 4PUDA 3RM9A 2CBVA 3WUBA 1NOWA 4YHEA 5HBFA 4ATWA 2VZUA 3AS0A 3WF2A 2YL9A 1ZJAA 3PZ9A 3SCTA 2WC4A 4GKLA 2PWGA 1FHLA 1VEOA 5D4YA 1GZJA 4MB1A 1BVNP 1J11A 4M82A 3FHQA 1PZ2A 4Z2IA 3W81A 3ZMRA 3SCVA 3AZTA 1U33A 1B0IA 4H8UA 5CPQA 2YA2A 3EMQA 3PZNA 3A4WA 2VVNA 1WDPA 2ZX6A 4U33A 3N9KA 2V3EA 4AZCA 1WCGA 4P7QA 4CGTA 3T0AA 1H0GA 4HTYA 2CKRA 4Y7EA 2ZWYA 3MUZ1 5M5DA 3UG3A 3B9DA 3VIIA 1J12A 4MADA 2BFGA 5GNYA 3VOCA 5A69A 1ZBWA 3AMLA 1C3FA 2YL8A 3RM4A 3W6MA 3ALGA 3THCA 3NCOA 1Q6CA 1D3CA 5AC5A 2DSZA 1J0YA 2VQUA 3GXDA 5EB8A 1W9VA 4CUCA 1E6RA 1ZBCA 2CXGA 3B8SA 3OGSA 5FD0A 1E71M 1M03A 3WQ6A 4LYQA 5A8QA 1R86A 4F66A 2GJPA 2CITA 1B9ZA 3ARXA 1HP5A 1MXDA 4PSPA 2DT0A 1QHOA 2D23A 3RILA 1LG2A 6TAAA 2EPOA 3ALFA 3ZR6A 2XVGA 3WKZA 3T2PA 2E9BA 1VBUA 1WZLA 1AQ0A 2DSUA 4WKFA 3D5HA 1EOMA 4KRTA 2VX4A 1HX0A 2YL6A 2Z1SA 1GJWA 2PWFA 3CO4A 5A8NA 3SCOA 4XZBA 3PHAA 3WEZA 1US2A 3AJ7A 1VFOA 3PTMA 1HN1A 1GPFA 3WH8A 4L4OA 4X9YA 5BRQA 1E56A 3W38A 3CZ8A 1VBRA 5M03A 4M24A 2WVUA 1BFNA 2YLAA 3SCNA 1O6IA 3N11A 4DM2A 3CUJA 1PEZA 3TOPA 1UWUA 2UY4A 3VX0A 1HIZA 2VZSA 4UOQA 2J8FA 1GJUA 3N12A 4UTFA 1LJYA 1W9UA 1J0JA 4HPHA 1LWHA 2J75A 4MNLA 3WQ4A 4HOXA 1UH3A 1ZS2A 3RDKA 2HISA 1B31A 1C90A 1US3A 4W8BA 3CHFA 1CLXA 3VGDA 1TR1A 1V3MA 4C7GA 3ZT7A 3DYMA 3AICA 1JIBA 4P8VA 4KMQA 3MSGA 4GZJA 3W24A 5M17A 4JFWA 3A4AA 3WUFA 5FCZA 4AZ6A 2EPMX 1BQCA 4AZ5A 2O9OA 3BCFA 4QDMA 1BYAA 3GH5A 1EO7A 2GDUA 2VTFA 4YN5A 2YJQA 2CEQA 4PYSA 2XJ7A 3AIWA 2D0GA 1EDGA 3EDKA 4F9JA 2ZUVA 1UKTA 2WVVB 2WBKA 1BAGA 2GFTA 3WSUA 1IZKA 1CGXA 1WNOA 3WL0A 4UQBA 4EAMA 4IUGA 4A3HA 1CBGA 2VO5A 2WKLA 3F5KA 3T09A 3VNZA 3WENA 2V3GA 1JFXA 3M7SA 2EEXA 2D3NA 2BHUA 4NRSA 1W3JA 4OOZA 4HZ7A 5BWFA 2UY2A 4WK9A 4FLRA 3LPPA 3VIPA 4KGJA 2GSJA 1GVIA 2J7CA 3DC0A 4GXPA 4ZENA 5HPOA 5HOSA 4B15A 4P7NA 1V6UA 4B3LA 3VGGA 2W63A 4FF5A 3CH9A 2CNCA 1WDQA 1UR8A 1C8QA 4D6JA 5DEZA 1QNRA 1UWQA 3HU7A 3TONA 1H5VA 5FL0A 3CHEA 4UQ9A 3U7VA 1V0MA 4U3AA 2VURA 1JXJA 2CYGA 2QMKA 5EFDA 5CJ5A 3A4XA 2X09A 1C93A 4CVWA 3SUVA 3PZGA 1JL8A 4WSJA 2BXYA 3W4RA 3WQWA 5ECUA 3ARQA 5D9OA 1UQZA 1B30A 5A2BA 1B3VA 2YKKA 4D6FA 2DH3A 5A6KA 2E4TA 2YIHA 3MUY1 1VFFA 3GBEA 3AOFA 3KL3A 4W5UA 4JHOA 1XSJA 3FAWA 2DSVA 1BTCA 2OSYA 1GQIA 1CWYA 1UA7A 1UQYA 1C92A 1E73M 1GHSA 4IISA 1CECA 4LX4A 5A8OA 4BQ3A 3ZT5A 3AMDA 3QHMA 1XH2A 2PBGA 3EYPA 1PBGA 1TA3B 7A3HA 1HVQA 4AZGA 3WDHA 4U5IA 3CGTA 4W84A 2JEQA 3AHVA 3N17A 3OLIA 3IAPA 4QFUA 3U5UA 1JYNA 1HJWA 4TOQA 2VI0A 3QHOA 3U57A 3W26A 5A1AA 2XVPA 4AMCA 1SYTA 3BAKA 1NWTA 2D2OA 1F4AA 1V02A 4PBGA 1NWSA 2VRJA 3RPMA 2F61A 1SMDA 3SEPA 1DWJM 1H3GA 3ARPA 3PZVA 3O6AA 3L4ZA 1RH9A 3OLDA 4M80A 1TE1A 3GH7A 1TVPA 5I0DA 1L8NA 1GW1A 2WSKA 1ITXA 5CLWA 2YL5A 1K6AA 1UD2A 2WC7A 3WQ5A 2CBUA 2J25A 1JXKA 1HT6A 3GNPA 2XFFA 4QLKA 4E8CA 4QLJA 1WE5A 4TXEA 4CCEA 5GNZA 1HKIA 3PZMA 1W9XA 2IXUA 3B9AA 3SCRA 3VDCA 3MANA 3VINA 2DGAA 2JF7A 3AXIA 3GBDA 4PMZA 1XC6A 5GQBA 1MW1A 1OBAA 3DYOA 3VUPA 1DWIM 2QPSA 2PB1A 3U7BA 2YLLA 2WCAA 1KGXA 4PN2A 1Q6DA 2XSAA 1EH9A 4C7FA 5JIPA 1CGTA 2TAAA 3B9EA 1U30A 3K4AA 4GI9A 3OBAA 2DDXA 4AY1A 1XSKA 2UWFA 4HPGA 1E1FA 3CHDA 4MNJA 4V28A 2W66A 1JDAA 2YBUA 4URIA 2A3AA 2J62A 2WZHA 2EXOA 2CHNA 5I5RA 5CQ1A 1ISYA 2J7FA 4HMCA 3TTQA 2WAGA 3WD2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5C71 A;  1E6N A;  1V6X A;  3K8L A;  5IFT A;  1JNE A;  1H41 A;  2ZXQ A;  4PTW A;  1NQ6 A;  3WEM A;  1JAK A;  1V02 E;  4FLO A;  2GJX B;  4TVC A;  1YQ2 A;  1GQK A;  1V6W A;  4Z2H A;  2BHZ A;  1F4H A;  1PX4 A;  1TVN A;  4U3C A;  1W1T A;  1SFS A;  4PMX A;  3L4V A;  2YA0 A;  3AQU A;  4QAW A;  1XH1 A;  1BGG A;  2ZUT A;  4MJ2 A;  4J7R A;  2XWD A;  1XGZ A;  3APG A;  2EPL X;  2GJR A;  4GI6 A;  1CNV A;  3VIH A;  4JCL A;  4OJY A;  1CXK A;  2WAN A;  1QI5 A;  4B16 A;  1GVY A;  1QOX A;  3K8K A;  3VIL A;  3OGV A;  1JYV A;  2V3D A;  1QNP A;  5BXS A;  4Z2J A;  4F79 A;  4WF7 A;  3FND A;  3VMO A;  4UNI A;  1UR9 A;  1B3W A;  1FH8 A;  4HME A;  2JIW A;  2WMJ A;  4FK9 A;  4XV0 A;  1V3H A;  2VZT A;  4PMQ A;  3T2O A;  2ZIC A;  5JBE A;  4D6I A;  3AHX A;  4B3K A;  3L4X A;  1FH7 A;  2V3F A;  4W7U A;  3MMD A;  4QP0 A;  5A94 A;  1EQP A;  4W93 A;  5D9N A;  4GQQ A;  1EA9 C;  1JFH A;  3VPL A;  1V6Y A;  1LWJ A;  1B3Y A;  3WEL A;  2XM1 A;  4AEE A;  5CPT A;  3CUF A;  1NWU A;  1FP9 A;  3OGR A;  3VNY A;  4P8X A;  4BQ5 A;  3AZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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