5E0CA

Structural insight of a trimodular halophilic cellulase with a family 46 carbohydrate-binding module
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
531
structure length
531
Chain Sequence
QTDIQSYVADMQPGWNLGNTFDAVGDDETAWGNPRVTRELIKTIADEGYKSIRIPVTWENQMGNAPDYTINEDFFSRVEQVIDWALEEDLYVMLNLHHDSWLWIYNMEHNYDEVMAKYTALWEQLSERFQGHSHKLMFESVNEPRFTRDWGEIQENHHAFLEELNTAFYHIVRESGGSNTERPLVLPTLETATSQDLLNRLHQTMKDLNDPNLIATVHYYGFWPFSVNVAGYTRFEEETQQDIIDTFNRVHNTFTANGIPVVLGEFGLLGFDTSTDVIQQGEKLKFFEFLIHHLNERDVTHMLWDNGQHLNRETYSWYDQEFHNMLKASWEGRSATAESNLIHVRDGEPIRDQDIQLHLHGNELTGLQVDGDSLALGEDYELAGDVLTMKADALTALMTPGELGTNAVITAQFNSGADWHFQLQNVDEPTLENTEGSTSNFAIPAHFNGDSVATMEAVYANGEFAGPQNWTSFKEFGYTFSPVYDKGEIVITDAFFNEVRDDDIHLTFHFWSGEMVEYTLSKNGNHVQGRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cellulase
publication title Structural Insight of a Trimodular Halophilic Cellulase with a Family 46 Carbohydrate-Binding Module
rcsb
source organism Bacillus sp. bg-cs10
total genus 183
structure length 531
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03442 CBM_X2 Carbohydrate binding domain X2
A PF18448 CBM46 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5e0cA01
4UR9A 1JF6A 1UD5A 4YPJA 2PWHA 1UHVA 5BRQA 2DSUA 3WUFA 4BQ3A 2PWFA 1JD7A 1E6RA 1EO7A 2BXYA 2CPUA 1HL8A 1WDSA 1ISWA 4QLJA 4U2ZA 3WEZA 5A8QA 4IPLA 1W1PA 3OGSA 3T2QA 4AW7A 5E0FA 2EBNA 1H5VA 3AZRA 4DWSA 3FXYA 3RM8A 3AZSA 3L4YA 4FLQA 1R86A 4AZBA 4HU0A 4PTVA 3A3HA 2YOCA 4P7NA 4MB4A 4S3KA 4WK9A 1UH4A 2EO7A 3NSXA 4F9DA 3QR3A 5EFFA 1E4LA 3VUPA 1Q6EA 1W1TA 1UKSA 1ZJBA 2WMIA 3K8KA 1S46A 5JIPA 1CDGA 1KCLA 2DT0A 2DQXA 2EEXA 1PJ9A 1E6XM 3VGGA 1IT0A 2UY5A 4WJXA 2AAAA 2V3DA 3CHDA 3WF4A 1X6NA 3TTSA 2XVGA 1U30A 2Z1SA 3WD0A 4V27A 2JE8A 4AZ6A 2ZXBA 3M07A 1J11A 3BAJA 5GNZA 4M81A 1FFQA 2NT0A 1EHNA 1GPFA 1OIFA 2Y2WA 3QHOA 5A6KA 1UR4A 2XPKA 4LXFA 1Z32X 4GIAA 1XSKA 1ZBKA 4CVWA 2FGZA 1BSIA 3VD3A 3UG3A 1FP9A 1J0JA 2ZX9A 5BXSA 5FL1A 4U33A 3HJEA 3WY1A 3SCRA 4EAMA 5I23A 5IHSA 1HF6A 3ZMRA 2WWDA 3SIMA 4BZYA 1HJUA 2HISA 3NSMA 3LPOA 4CKQA 1BG9A 4KRUA 3BCFA 4BQ5A 1E40A 3SUVA 2WKGA 2QMKA 3MUZ1 1XCWA 2XVPA 4Z2HA 1NARA 4LPCA 3UCQA 3CHEA 3MMUA 1DWFM 5D9MA 5A6MA 5I5RA 3I3DA 2XUCA 2XYLA 3SUWA 4BCEA 1EDTA 1VEPA 1Y7VA 1UA7A 1NQ6A 4MDPA 5CLTA 2GSJA 3FHQA 3TOPA 2WVVB 1WDPA 3NSNA 2XVNA 4WIWA 2BVYA 1UR9A 3CZ8A 5A8OA 3ARVA 4UOJA 4H41A 4CCDA 3WDPP 3ARQA 4GZJA 4YHGA 1GOOA 5DT5A 3WEOA 2E8ZA 1OCQA 2VX5A 2ZWYA 2Z1KA 4AD1A 2FHBA 4D72A 3WDQA 1CXKA 4OIFA 3CUJA 2GJRA 4N0RA 3AIRA 3ZM8A 3CUIA 2D0GA 1H3GA 3CBWA 2VQUA 5ECUA 3TA9A 4YHEA 4UQEA 3TP4A 5HOSA 2O9PA 2ESCA 4HA4A 1WCGA 3AS2A 5FIPA 1R8LA 2OWXA 1JZ3A 1WB0A 4ACZB 2A3EA 4H8HA 1OT1A 1TUXA 3EDDA 6CGTA 1NWRA 2CBVA 5A6BD 1E71M 4MPKA 1TCMA 2DEPA 1WP6A 2WMIB 3WD2A 3SCSA 3D5HA 2WSKA 3AFBA 5EBAA 2ZXAA 1J0YA 1QW9A 3FAWA 2WMFA 1EDGA 1CGXA 3WF0A 3LPGA 4P7QA 4PEEA 2DSVA 3BAWA 4AD2A 4AD4A 2J74A 1JYVA 3VIKA 5CZKA 3UG5A 1U2YA 5JIWA 4MDOA 2J7GA 8A3HA 4CU8A 1WZLA 5DF0A 1GOKA 4HA1A 2WCGA 3RDKA 1JYXA 4HA3A 2XFYA 5E0CA 2WCSA 2WVTA 2JEPA 1B3ZA 3AYRA 4HZ7A 1JF5A 1HT6A 3VINA 5I77A 4M1RA 4H04A 1GUVA 4XB3A 1JYNA 3VU2A 3VMPA 3BSGA 4CN4A 2XJ7A 3OLEA 4QCEA 2QPUA 3BAXA 3KL3A 1PX3A 3VIPA 4WF7A 3AIQA 3A4WA 2BVDA 1HP4A 1BF2A 4D71A 3GNOA 1JDCA 1TZ7A 3BGAA 1WZAA 2J62A 3WKZA 4M24A 1F4HA 3VIIA 1ECEA 2XTKA 1JZ7A 3FAXA 5A3HA 1MQPA 3I3BA 3JUGA 2WAGA 3DYPA 1V3JA 1V0KA 3F5JA 3UETA 5BCAA 1PZ2A 3CZEA 1KBBA 1KR1A 3WUGA 4HP5A 4CU7A 1DWGM 4H7VA 2CXGA 2WC4A 1IV8A 3WENA 2WCAA 2A3HA 5I79A 5E6ZA 2DPEA 2QF8A 3T2PA 4CN1A 2WK2A 4WSJA 5JBFA 4HMEA 1QI2A 1B0IA 3WEMA 1E5JA 5DFAA 1XYZA 4UFMA 2V3EA 1JYWA 3VD4A 5A2AA 5BXRA 4S3JA 1CIUA 4TX6A 1UH2A 2XIIA 4YN5A 2PI6A 1BAGA 4KH2A 3AIUA 1VFFA 3WH8A 4W89A 4V2XA 1MWOA 4PMRA 2WHJA 1HVQA 1H0GA 3T0BA 1WPCA 3WFZA 2UY3A 3NDYA 4HMCA 1RD6A 5EFDA 4CD8A 3VPLA 2DT1A 4UFIA 3KWXA 3VGDA 2YJQA 4EANA 1FOBA 3J7HA 1HJVA 1V0LA 4AY1A 4LQ1A 3VIHA 1KBKA 1GJWA 1E6ZA 1KXVA 4ZXLA 3AMLA 3GH4A 4GPNA 1OGBA 1FA2A 2GK1A 2VMFA 5E9AA 1PX8A 2JFEX 2NT1A 4PUDA 1H49A 3AICA 2G41A 4MJ2A 1V6VA 1R85A 2BV9A 1AMYA 3LPFA 3L2LA 1QI3A 4J3XA 2CHNA 1UQYA 1EQCA 5C70A 3WNLA 2GVYA 2V5CA 3SCQA 3M7SA 4GZIA 3NCOA 3W37A 1LWHA 3IANA 4CN6A 1AQ0A 1CGTA 2YL6A 3UR7A 3OB8A 1UZ1A 2CIPA 3AMKA 1LJYA 2E4TA 2WC7A 4J3TA 4W7WA 3MV11 5GQBA 2UY4A 4ZEPA 2ZICA 1G9HA 2D3NA 2J7DA 3CH9A 3CLWA 4MTVA 5HBFA 2ZUMA 1UR8A 3ZJ8A 2VZVA 1UUQA 3VDCA 3ZJ7A 1CWYA 2BHZA 3RO8A 1VIWA 2JEQA 2X2YA 1JIBA 1VF8A 5LYRA 2GFTA 4V28A 4OBSA 2WSPA 3UESA 1H1NA 2D22A 5CGTA 4HOZA 1C93A 1E43A 3WD4A 1N82A 2XM1A 3RJYA 1W2PA 2EXOA 1BVZA 3W6MA 5I3DA 4NF7A 3M46A 4QLKA 4D1JA 1RP8A 4DM2A 2DDXA 1W3JA 4ACYA 1GQIA 2J75A 3WIJA 3ZT5A 1G1YA 3IAQA 2G3JA 5FOOA 2CEQA 3AS0A 2WVUA 3VO0A 3WDRA 4HTYA 3BAYA 1JI2A 3A4XA 1JZ5A 2PC8A 1CXEA 3NDZA 3VD7A 3GXMA 3ZJ6A 1UG6A 1EHAA 1J12A 2X09A 4GKLA 1UH3A 3THCA 3W6LA 1KGXA 2VVSA 3BXWA 4HOWA 1K9FA 2XGBA 2XFRA 1QNQA 3MUIA 2BY3A 1B2YA 3F5LA 4UQ9A 1V3HA 1CEOA 3PBGA 4AMCA 1QVBA 4JKMA 4UFHA 4AIUA 1TVNA 4E2OA 2W67A 5GNYA 3L4VA 1SYTA 2Q8XA 3GBEA 4D6JA 1Q6CA 3APGA 3N17A 4P7OA 5I24A 2ZXQA 1ZBVA 4B9YA 3K8LA 4P7RA 1B31A 2F61A 2C7FA 3WH5A 1CXLA 3U5UA 2VCAA 3WN6A 4UFLA 4OUEA 1JDAA 2GJPA 3PZQA 3PZIA 3CZJA 1RP9A 1JNDA 3PZVA 1IZJA 3GXIA 1QHZA 3FNDA 4CD7A 4JKKA 3AS3A 3MS8A 4ZE5A 4LYPA 2OLHA 2W92A 4FLRA 4RE2A 1GW1A 1UYQA 5ABFA 2BXZA 3VX0A 5I0DA 2V3FA 2ZUUA 3G6MA 4GO8A 3II1A 2HVMA 2J77A 2ZWZA 1W3LA 4ATDA 1J18A 1E9LA 5M5DA 1E3XA 1XHGA 3VIJA 3VIMA 1JGIA 3T2OA 3CMJA 2XM2A 3WQ4A 4PSRA 2W66A 2J8FA 2NSXA 1UOKA 1W9XA 3WBEA 1CGYA 4TVDA 3VVGA 4LYRA 2XVLA 4K68A 1UD4A 3SUSA 3DYMA 3AIVA 1EH9A 2V3GA 2WLZA 3AZTA 1LL6A 2VRJA 1BG4A 4PCTA 1BYBA 3PZ9A 2J7EA 3OGRA 4HMDA 2QMJA 4D6EA 2ZX7A 7A3HA 3GYCA 1MQQA 3GH7A 2PF0A 2CYGA 4HPHA 4U5IA 4D6CA 1HJSA 3KL5A 4ACZA 1UKPA 2CKRA 3F5KA 3OBAA 3AXHA 3WH6A 2IUZA 2WVSA 4FMVA 3U5YA 2Y8VA 1JZ4A 1JAEA 2VI0A 1W3HA 1HJWA 3WMSA 1MXDA 3BAIA 1PAMA 4J27A 3IK2A 2YA2A 5BXTA 5BROA 3TTOA 1VFUA 1JXJA 5KZ6A 1QBBA 3WDJA 4PMDA 1LL7A 4E8DA 1FH7A 3SCWA 4U3CA 1H0IA 4XZWA 5A2BA 2BS9A 3L4TA 3BMWA 3D3AA 2MANA 4WKAA 3K46A 2WZEA 1I1XA 1EIBA 1TVPA 1ISYA 5AYBA 3RJXA 1C91A 2W63A 1UWUA 1AVAA 4J28A 4WLCA 1NWTA 3IJ7A 3MU7A 1BHGA 2IXUA 1JL8A 3CZGA 1UKTA 3CUFA 1OT2A 1W2VA 1EA9C 3DYOA 1HKMA 5ABGA 2WANA 3DHPA 3W27A 5ABFB 4W85A 1I1WA 2YLAA 2X0HA 3VD9A 5CSYA 2VC9A 3S2CA 3SEPA 3VM7A 3SCPA 3CHFA 2ZE0A 1UR0A 1JZ2A 2A3AA 2EPNA 2W4XA 2WMJA 3WNKA 3EYPA 3A47A 3BLKA 6A3HA 4TXEA 3B9DA 3N15A 1P6WA 3AJ7A 1ESWA 4A3YA 3OLDA 3SCTA 2DT3A 4UNIA 1C7SA 1FHLA 1GOWA 2BHUA 4M82A 1J0ZA 3VILA 1E55A 4AZ7A 2D20A 4GI9A 2D0FA 3BMVA 4HPGA 3PZNA 1XSJA 4XZBA 4UOZA 3WDIA 2GDVA 5FCZA 3SCVA 2F8QA 3WL0A 1GOMA 3AISA 2VZSA 2CBJA 4UCFA 3U57A 1MYRA 3ARSA 1KWKA 2CITA 1E5NA 4UZUA 1M53A 3WF3A 1UD6A 2C8NA 2FH8A 4QCFA 1OGGA 4F9JA 1UR1A 3CIVA 1QW8A 3ZSTA 5FL0A 2X1IA 2WHLA 2XG9A 3N12A 5HDRA 2O9RA 5CPQA 4B3KA 4F8XA 3VX1A 3EDKA 3I3EA 1E4MM 3WD1A 1FFRA 3AHYA 4UFKA 5A6LA 3MV01 1RPKA 4NRSA 3GH5A 1JI1A 1ZBCA 1DWHM 2G8ZA 4BQ2A 2FH6A 2XWEA 3WSUA 4AZGA 3WQWA 3AS1A 4U5KA 4W8BA 1HN1A 5E70A 1US3A 1OM0A 4Z2LA 4LGXA 4TX8A 2W5FA 1LG2A 4KWUA 1EQPA 4FF5A 1QI4A 2VQTA 5A8NA 3FW6A 3N11A 1ISXA 5IFTA 2VZUA 4M56A 2CETA 3VIFA 2VJXA 3GBDA 1B3VA 3ECQA 4JL2A 1EOKA 4NSBA 3VDAA 1GQLA 2OWWA 1F4AA 3VGHA 3GM8A 4PMXA 4QAWA 4CU6A 3AIBA 1BYAA 3AHZA 3RMEA 1QBAA 4MAZA 1HJXA 5DO8A 2YBUA 2ZUWA 5I78A 1CENA 1HKIA 2Y24A 3ARXA 5HPOA 5AY7A 4P8XA 1C3FA 2ZUNA 2VT0A 4GQRA 3QOMA 4W7UA 2VO5A 2FDMA 4H8VA 1EO5A 1H2JA 4AD0A 4C7DA 1SFSA 5BYWA 2WC3A 1BTCA 4B16A 3K4AA 2UY2A 2XHYA 2ZUSA 2J7HA 2E9LA 6TAAA 3RCNA 2VL4A 5A95A 3CHCA 4ZFMA 2DIEA 3WMCA 2J78A 4L4PA 2WB5A 2TAAA 3ZQ9A 3AMDA 1CZ1A 1K9EA 2BFGA 1G5AA 2JIEA 3EDEA 4PMNA 3WQ8A 1VJSA 3CMGA 3TTQA 3BC9A 4IM4A 2DIJA 1E6PA 2CKSA 1C92A 1J01A 1UD2A 4GI6A 1KGWA 2WLYA 3W25A 5A1AA 2BY2A 3U7BA 3E1F1 3O6AA 2E40A 3AXIA 4QLLA 3N13A 5I6SA 5D4YA 4M8UA 2J8GA 5A6AA 1L8NA 1VBUA 3HN3A 4AEEA 4JAWA 1KXHA 2WHMA 5D8ZA 1US2A 4RE3A 4W8AA 3W53A 3PZMA 2QPSA 2W61A 4L4OA 4AZ5A 1KGUA 5CLWA 1GQJA 3CUGA 4GXPA 3OA5A 5A8MA 2D2OA 3PTKA 2EPOA 3ZJKA 5A94A 1FH9A 3MSDA 3B9AA 3VM5A 1V02E 2OSYA 3T08A 3WNOA 4JZ5A 4PTWA 1EXPA 4QDMA 1V03A 3TONA 4U3AA 2WMGA 5A8PA 1NOFA 2E9BA 3AIEA 4RE4A 1CLXA 2FGLA 2VX7A 1UA3A 4AISA 2F2HA 3VIOA 4UOQA 1J0KA 4PMQA 4PUEA 3L4WA 3WH9A 4ZE4A 4UQBA 2D1ZA 1H41A 1A3HA 3WF2A 4PMZA 5E6YA 3MKKA 4ZENA 2YKKA 4Z2KA 3G6LA 1SMDA 2WPGA 2D3LA 3ZT6A 2PBOA 2V38A 2CBUA 3CO4A 2JF7A 3L4XA 1MXGA 2CESA 1GHRA 1EGZA 1CBGA 1CNVA 1KXTA 2G3MA 3ARUA 4JFTA 3VKKA 3AHVA 1UD3A 1WE5A 5GPRA 1J10A 3THDA 4FLOA 1MFUA 3TTYA 1NH6A 4P7LA 1LQ0A 1XRVA 2BY0A 3AQUA 3BSHA 4J7RA 4M29A 4X0NA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UR9 A;  1JF6 A;  1UD5 A;  4YPJ A;  2PWH A;  1UHV A;  5BRQ A;  2DSU A;  3WUF A;  4BQ3 A;  2PWF A;  1JD7 A;  1E6R A;  1EO7 A;  2BXY A;  2CPU A;  1HL8 A;  1WDS A;  1ISW A;  4QLJ A;  4U2Z A;  3WEZ A;  5A8Q A;  4IPL A;  1W1P A;  3OGS A;  3T2Q A;  4AW7 A;  5E0F A;  2EBN A;  1H5V A;  3AZR A;  4DWS A;  3FXY A;  3RM8 A;  3AZS A;  3L4Y A;  4FLQ A;  1R86 A;  4AZB A;  4HU0 A;  4PTV A;  3A3H A;  2YOC A;  4P7N A;  4MB4 A;  4S3K A;  4WK9 A;  1UH4 A;  2EO7 A;  3NSX A;  4F9D A;  3QR3 A;  5EFF A;  1E4L A;  3VUP A;  1Q6E A;  1W1T A;  1UKS A;  1ZJB A;  2WMI A;  3K8K A;  1S46 A;  5JIP A;  1CDG A;  1KCL A;  2DT0 A;  2DQX A;  2EEX A;  1PJ9 A;  1E6X M;  3VGG A;  1IT0 A;  2UY5 A;  4WJX A;  2AAA A;  2V3D A;  3CHD A;  3WF4 A;  1X6N A;  3TTS A;  2XVG A;  1U30 A;  2Z1S A;  3WD0 A;  4V27 A;  2JE8 A;  4AZ6 A;  2ZXB A;  3M07 A;  1J11 A;  3BAJ A;  5GNZ A;  4M81 A;  1FFQ A;  2NT0 A;  1EHN A;  1GPF A;  1OIF A;  2Y2W A;  3QHO A;  5A6K A;  1UR4 A;  2XPK A;  4LXF A;  1Z32 X;  4GIA A;  1XSK A;  1ZBK A;  4CVW A;  2FGZ A;  1BSI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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