4RK8A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a356
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A356
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 139
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4rk8A00
3SI9A 4CCCA 3S1WA 3GB6A 4JS3A 3GDRA 2YFNA 4RKAA 3L67A 4XUGA 2ZFAA 2ZZ4A 4NJGA 3L5LA 2X30A 1XI3A 1QO2A 1N8FA 3MYPA 4A21A 1DVJA 3M5ZA 4LVFA 4IMEA 3W83A 1EP3A 1KTNA 4LRSA 1XFBA 4KWWA 4LVAA 1W8SA 5C2XA 4A2SA 4MY8A 3BLIA 3LCFA 2V9DA 1Z41A 1P1XA 1RVGA 4TU1A 1HUVA 2A4AA 4TIMA 1WA3A 3DFOA 3NO5A 2PRMA 1MSSA 1O4UA 2R94A 4FNQA 3W7HA 4GXMA 3PB2A 2QCEA 4AEOA 1L6WA 3SR7A 3E02A 2E6FA 4GRSA 4NJHA 1UBSA 3R8RA 1J4EA 2YFOA 1O5KA 4UFIA 1VCGA 2G95A 3PSVA 5EA9A 2DZSA 2ZRUA 4IMCA 1D9EA 4FNSA 4MOZA 1SW3A 4UFJA 2WSYA 3O1NA 1KM6A 3G1VA 1OYCA 2A1YA 2QR6A 4Q32A 3W1MA 3OVQA 3M5XA 2Y6ZA 3TJLA 3WJSA 1FUYA 3TU9A 4JDYA 1WDWA 1B9BA 5LNVA 1YXDA 2NXHA 4XTIA 3GLCA 3M1ZA 4M7SA 4X22A 2Y61A 4GUJA 4E38A 4LOCA 3FKRA 4N9DA 4FNPA 1K7FA 2FPYA 5HQEA 3Q94A 4FEZA 1F5ZA 3S42A 3NZ1A 5DN1A 2H8XA 3PB0A 3PR2A 3TSBA 1EP2A 1PHQA 3LV5A 4HNVA 3HPXA 3WJZA 5E1QA 4BI7A 3TAOA 1JQXA 3QYQA 3S6DA 1BWLA 3TK7A 3TE9A 2QKFA 3KXQA 3P81A 3YPIA 1HTIA 2Q8ZA 3DAQA 3KFTA 1FDZA 3G3MA 3QMTA 3EKLA 5E0KA 3HG3A 3O6YX 3P67A 3H54A 3G8RA 1MXSA 1L9WA 5D37A 1L2UA 2ZRXA 3PSWA 5BRBA 1F2JA 2OJPA 4FX7A 4NJIA 3NVTA 4BR1A 3THQA 3QQ0A 1Z44A 4WJEA 3DI0A 2Y70A 3L5AA 1ALDA 1TPB1 2ZYFA 3NL6A 5CPLA 3E96A 4O52A 2J9XA 1G4TA 5LGZA 3G0XA 4JTJA 4ONVA 3BW2A 2B7NA 4FNTA 2PCQA 4NNCA 1A53A 4LRTA 3QF0A 2ATSA 5LNRA 3R2GA 2FJKA 4JXCA 4X2RA 4UTHA 3CU2A 2WSQA 3P8IA 3R5EA 4JTGA 3L66A 3EWYA 3M5YA 3KVMA 1P0KA 1WXJA 1T99A 1R2SA 3K30A 1OK6A 2FPTA 2V0TA 5D30A 1DORA 3EX6A 3VKJA 2GPTA 3HGOA 2ZCGA 2BWGA 1Y0EA 1WBJA 3M9YA 2NXGA 3NL5A 3RLVA 4UTLA 3ZWTA 1KFEA 2JGQA 5CSRA 3NR0A 1W5MA 4UTWA 5A8GA 4CCEA 1EUNA 2QF7A 3LX9A 2QUUA 4K7YA 1I45A 3GDLA 2E6DA 4WOZA 4IGHA 5H91A 3PWAA 5U7SA 1I2NA 5E93A 3O8AA 4O17A 4Y96A 4N6FA 4RXFA 4YXGA 3SGZA 4UTJA 2GVLA 3QW3A 3V75A 1YTDA 2H8ZA 4UIOA 4YWIA 1NF0A 1PIIA 4HHPA 5AHIA 5AHNA 3R89A 3S5OA 3QJAA 2Y7GA 1LBFA 1GJPA 3I7QA 2BTMA 5AB3A 5A5WA 5BMXA 4RXGA 3M0ZA 3WJWA 4ZQOA 1LP6A 1XM3A 5DCBA 4O16A 4FXSA 4O15A 3HB9A 4S2CA 3JR2A 5HUOA 3JRKA 3PM6A 1QPNA 2FPVA 5HR7A 1FCQA 2A6LA 4CQAA 1Z48A 3TUUA 1VPXA 2ISVA 5FF3A 4A2RA 4JTHA 4OQVA 2Z6JA 1K03A 1VYSX 2A0NA 4BI6A 2V2DA 3C4UA 4TR9A 3OG3A 1AW1A 1OF6A 1LLWA 3T7VA 3EX3A 4UTTA 3I68A 4GWEA 1WAUA 4FO4A 4IMDA 3TH6A 1T96A 4JDBA 1V7YA 3G1FA 4ADUA 3W7QA 3LCXA 2VEMA 4U4MA 3W6YA 3LGEA 3F03K 4NNAA 2VXNA 3W2UA 4NUWA 4AXKA 1JCLA 5D38A 1O94A 3W86A 3HGRA 1VH7A 2NV1A 5DXYA 1P5BA 1JCYA 1S5TA 4FF7A 4MZ8A 2VELA 3LLDA 3VCRA 4IWWA 4I7UA 4DBDA 1ML1A 3MHUA 4PH6A 2FQIA 3TXVA 3MMTA 3N14A 4LVDA 2RFGA 1JRCA 2R14A 1KA9F 3W88A 1W5NA 2VFEA 2ZDRA 3UYCA 4OV4A 4L4LA 4LU0A 1K8YA 2RH9A 1B57A 4UCGA 3DFTA 1K7EA 3GX9A 3NQ7A 3TFCA 1NEYA 1HO1A 3UWZA 5IM51 4NX0A 1FXPA 1FXQA 1ZY9A 1VGAA 5CZ0A 4NQ1A 3E49A 4WOQA 2QJGA 2P10A 3NG3A 4WY0A 2YX0A 4UNKA 4QJ1A 3MI2A 3G1HA 3I65A 1QPOA 2W6RA 3LRMA 3NOEA 1LORA 1FCUA 1ZENA 2HSAA 3MP4A 2TRSA 4PODA 4WXZA 4Z1DA 1WYIA 2GVGA 1R2TA 2HTMA 1XBYA 4TMBA 4GUHA 1H7XA 1LDCA 2YR1A 1GQNA 5F4SA 4QISA 3P8JA 3W1UA 3NEVA 5T26A 3BG3A 2BX7A 2ZA2A 2QCCA 3LBMA 3NPXA 4O10A 5F2MA 5IBXA 1N55A 4YL2A 3S5ZA 4ZQNA 2QDHA 1XXXA 3TSDA 2ZBTA 3BW4A 2DZVA 4NJKA 3M41A 2CW6A 3W2JA 3HOJA 5LZLA 4JYEA 3EWXA 4ZZ9A 4JICA 3LHWA 3C2RA 1D3HA 2J6XA 5LKYA 3STFA 1VQTA 1W3IA 3EWZA 2YSWA 5G2HA 5BOOA 3W1LA 2WNQA 1ZCOA 3UWUA 2E6YA 2VFHA 1I2RA 5AHFA 3OA3A 4UUIA 4QSHA 4JY9A 4TMCA 4AHPA 1RQBA 4ZQMA 2C15A 2P1FA 3USBA 1X1ZA 3INPA 3ELFA 3LBCA 2WOQA 4WD0A 1GPWA 3LOTA 5G2WA 3N3MA 1TPEA 1TV7A 2YGYA 3LXAA 4E0CA 2CU0A 4HPXA 2C19A 1YDNA 3HO8A 4EF8A 1F74A 2WSRA 3EXTA 1NSJA 4R34A 4RZ6A 3HPZA 3W1PA 5FEZA 1ME7A 3G1AA 3LHZA 2EF9A 2FDSA 3NXFA 1TREA 5K9CA 3GR8A 1TPH1 3I6RA 1SU5A 2NX9A 3QC3A 3W1NA 1RPXA 3NQ8A 4GFSA 2VKZG 2ZRZA 4OV9A 1A5CA 3THAA 2OX1A 4A29A 1X6UA 4HN4A 4MJZA 4OWGA 4DO5A 4EIVA 3A23A 5AHMA 2R91A 2EGZA 3CPRA 1H60A 3DKLA 3CWNA 2DZTA 4X3ZA 3SSJA 4JTSA 2RHGA 3W2MA 4ZVJA 4JGDA 5AHLA 3LCHA 1G4PA 1SFLA 1TTIA 3QRHA 2F7FA 4XWUA 2WNZA 1TPDA 3Q2DA 3IRDA 4OT7A 4POCA 4WUIA 2FFCA 3PBVA 4FX8A 4UTIA 4Y6GA 3OEXA 3DKJA 5HWJA 4DF0A 1LBLA 4KKXA 4DXVA 4N4PA 3EKZA 1K8XA 2V81A 4MFDA 1H7PA 4R7JA 1WOBA 4A22A 3W7NA 1SZNA 3HGSA 3LCLA 4KWVA 4QITA 4FIRA 1ME9A 1GG1A 4PL2A 3LCIA 2VC6A 4ORIA 4AAJA 2GQ9A 3LCGA 2CZDA 5KZDA 3TV8A 3QPYA 1KM3A 1OFAA 4MPQA 4EF9A 5HNRA 3QQ1A 1H62A 3NQ6A 4GUGA 1KW1A 3TJXA 4O13A 1BTMA 4Y9AA 1LYXA 3TW7A 4LT9A 3E12A 3NL2A 2AGKA 1Q6OA 4HIBA 5DBUA 1W31A 4BWLC 3L9CA 3SY5A 3W2NA 2C16A 1UB3A 4HKPA 3CEUA 3GKAA 3LTYA 5D2TA 1TRIA 3N9SA 3P82A 3JS3A 4GUIA 3EX2A 3LHUA 4O53A 3UXDA 4OHQA 3FIGA 1FBAA 1ME8A 3DHFA 4DF2A 4JIPA 5KTLA 2B7OA 2HS6A 1A5SA 4JN6A 3NPVA 2NX1A 2VEPA 1OK4A 1F73A 4FIQA 3SECA 3DZ1A 1KFLA 4LC6A 1QR7A 3W2KA 4UNLA 1RR2A 5DLCA 1SPQA 3QMSA 1OF8A 4DO4A 5F4XA 3W7EA 1KLYA 2C18A 1R30A 1SR9A 4YCPA 3GNDA 4JTEA 1LRNA 5I3GA 4XKYB 5TQLA 1UUOA 4LS1A 1Q45A 3SZ8A 4K37A 1SSGA 4OGZA 1N7KA 3W7IA 3QFEA 2XN2A 1OYAA 5FF7A 5AC8A 2GJLA 2JBMA 4O0ZA 3F1QA 3HG5A 5K7JA 2ALDA 2Q3OA 3DGRA 1TQXA 2HS8A 5KZMA 4CNOA 4DPPA 3AJXA 3EB2A 4RZ5A 3SGUA 1G67A 5DCEA 1JULA 3IGXA 1YDOA 2D73A 1GWJA 1KFBA 4JYFA 3M47A 4U28A 5I3KA 1GYNA 3CWOX 3OHIA 3TNOA 1B3OA 4ICNA 3LTPA 5AYXA 4CNPA 3P80A 3DFQA 4O4VA 1I4NA 1TPWA 2I1OA 1LROA 3KAOA 1LOQA 1DKWA 4HSOA 1Z42A 3OVPA 4UTKA 1SZGA 2NUWA 2ZRYA 4MYAA 4M5PA 4W9TA 1FWRA 4XBSA 3EXRA 1DJQA 2YW4A 2QUVA 2ISWA 3W76A 3TQVA 3W70A 2O7SA 1KM0A 3NM3A 1RD5A 1X1OA 3GR7A 1R2RA 5F1UA 1S5VA 1LOSA 4AH7A 3HIJA 2B4GA 1OX4A 3OVRA 3I7RA 3FKKA 3P74A 1JUBA 5D32A 4LV9A 4QAIA 1THFD 1EWDA 5D04C 4E2DA 5TIMA 3W7KA 4FNUA 3KRSA 3KVKA 4RLIA 1YTKA 3W1RA 3PULA 1O95A 3O15A 5K9DA 4ADTA 3RFAA 2A2IA 1GOXA 1ZNNA 3T55A 4TX9A 1MZHA 1NAL1 3S9YA 1EEPA 2AQWA 3TKFA 4CNNA 5G4EA 2VOMA 1KV8A 4IX2A 3C2OA 5D2YA 4AWTA 3UQNA 4HNNA 2X1RA 4O19A 5G1YA 3N2MA 3SFKA 3LI1A 2OT0A 4Y90A 1QFEA 1GT8A 3IV3A 4O50A 5I3JA 1PVNA 1C9DA 4OE7A 3C8FA 2A21A 3S1UA 1W0MA 1JUKA 1I8JA 3W7GA 1SSDA 3NYZA 4JNMA 1H1YA 3GAYA 3NQAA 1J2WA 2Y7EA 1GEQA 4JD4A 3TC6A 4EOUA 1AMKA 3MP5A 3G0SA 3UWYA 3FYPA 2ZTKA 4AHOA 1LOLA 2CLKA 2WV8A 4DBEA 2CZFA 5FEXA 4N9EA 4NX5A 3FFSA 3GK0A 1O60A 3L2IA 5BW6A 4QM1A 1AG1O 3TXZA 1TB3A 3C0JA 4I7WA 1ONRA 2F84A 1FCVA 4UR8A 1JCMP 4ML9A 3BPWA 1GVFA 5HMSA 3N19B 1DBTA 1KFCA 3NPWA 3TIMA 1R47A 2YXGA 5DXXA 2JK2A 1KM2A 4UTWC 3WFAA 3TDFA 4H6KA 4MUZA 4JX4A 3W7CA 2YDAA 1QPRA 4P61A 3WK2A 3FJ6A 1W54A 1A5BA 4GE8A 3NM1A 4MY9A 1W1ZA 1UUMA 5F2IA 5CPOA 5L6UA 1ZALA 2A7RA 1P4CA 4IXXA 1SZFA 1NFBA 2W0UA 3NQFA 2OZ0A 3LTSA 3STEA 3B0PA 5HJLA 2H6RA 3BG9A 3PC0A 4FNRA 1UJPA 4MJMA 5F1VA 3W9ZA 3WK1A 8TIMA 1H7OA 1O5XA 2H90A 3KOFA 1H61A 3NAVA 4H4IA 3N73A 1W5OA 4LV4A 3S5NA 1TJPA 4K38A 1KFKA 2Y62A 1GVSA 3C6CA 5D05A 4UMCA 2Q8LA 1G6CA 3GVGA 5D2XA 3STCA 5KITA 4UTTC 3O63A 5EPDA 3PG9A 4DQWA 4LWWA 1TPFA 4Q4KA 4M6PA 2QEZA 3HMJG 5D33A 2PE4A 4NZFA 1VC4A 2PURA 3TROA 1TSIA 3L65A 4Z1BA 1GTHA 2NWSA 2V5LA 3PG8A 2A6NA 4I9AA 4RJEA 1Q3NA 4QQ3A 1IXNA 1TRDA 4EVZA 5SWUA 5HWNA 5DY3A 3IIPA 1VYRA 3ZS4A 5FF4A 4RCXA 2Y63A 1OFRA 3MO7A 3TCEA 1MEIA 2DU2A 2Q3RA 2V82A 1XDLA 2G97A 3G18A 3PS7A 2DZWA 3BGJA 2Y89A 3CTLA 5U4NA 2C6QA 2VEIA 3GYEA 4MIMA 3TA6A 1QWGA 1AL7A 3PBUA 3A5FA 3GXPA 1SQ7A 3MYOA 3G1SA 4PC8A 5AHEA 4NVTA 4WXYA 2A5HA 3EXSA 4PCFA 5F2LA 4R53A 2R8WA 1KTBA 3CLMA 1AW2A 5AC6A 2DZUA 4K7VA 5H2ZA 4MY1A 4LW7A 5HWMA 4MFEA 1TV5A 3S0CA 3HG2A 4AWUA 3WK3A 1OFBA 3SW6A 1F6KA 1X8FA 1CW2A 4WX2A 4UFKA 5FESA 4O1AA 3MI3A 1OJXA 1QMLA 1G7VA 3O16A 1EB3A 2NXIA 4WY0B 3MBFA 3CHVA 3O6CA 5HULA 3DFPA 2ZZ7A 3TQKA 1PHWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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