2E6FA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 108
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6fA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6fA01
3TAKA 3JR2A 4JY9A 3DKJA 4WY0F 5AC6A 1JRBA 2GUUA 1OHLA 5AHEA 3UQNA 2ZDRA 2E5BA 2V82A 3GDTA 3LHUA 4QITA 3CWOX 3EXTA 3UPWA 4AHOA 5EPDA 3W3OA 2XFWA 3TK7A 2G97A 1BKSA 2DZUA 4RZ5A 3GK0A 4GUIA 3QQ0A 1EWDA 2R14A 4A22A 4IXHA 4AF0B 2VFIA 1G4PA 5C6MA 4GC4A 3HPZA 1FDZA 1GG1A 4TU1A 4WOQA 3HG4A 5AHLA 4DPPA 1XBYA 1XCFA 3GXNA 2ZYFA 1JCNA 3FJ6A 4Z1AA 4WD0A 4JX6A 3G1HA 2NV1A 3T44A 1SO6A 4YCPA 3MYPA 4FX7A 1W3TA 3G18A 3RLUA 3BG9A 2ZTKA 2GVGA 3M5YA 1I2PA 5CZJA 3L21A 1TV7A 3LLDA 1E51A 3S1XA 1PCKA 1LLZA 1QFEA 1OFPA 4QIUA 4JR5A 1CW2A 2E1DA 4AAJA 4WX2A 1JCLA 3GXPA 3ABRA 3TNOA 4PFMA 1AW5A 3S1WA 2WOQA 3MP5A 3W9ZA 1ZAIA 4UMAA 4UMBA 4PL2A 1QPQA 2NUYA 1G67A 1TPB1 4RXGA 3KHJA 3E96A 2QKFA 1RVGA 3W7QA 2P1FA 1LM1A 3VE7A 2I9EA 5DBTA 3NQAA 1WV2A 4O57A 4NVTA 4NZFA 1WA3A 1OFRA 2DZSA 3CB8A 3QC3A 5DXXA 1PHWA 5BNKA 1DL3A 4FNSA 3GAKA 2C15A 1M5WA 1G6CA 2ZRUA 3O05A 4GXMA 3UPBA 3M5VA 1QO5A 3FEMA 4AHPA 3P5ZA 4LVFA 1ML1A 4DELA 1P4CA 2WPBA 3CPRA 3THAA 2FB2A 1Q6LA 1VHNA 3SZ8A 3N9RA 5K3VA 5KTLA 4K7VA 5CKSA 3HGRA 4MFDA 1TTJA 3G1VA 3QFEA 4N2YA 1FCBA 2FIQA 1SZNA 3WK0A 3MHFA 2GVJA 4ZQOA 4BWLC 3W7MA 4IPIA 3UY8A 4X9SA 1KTBA 2P0OA 1X1OA 3HIJA 1Z42A 1O60A 2YSWA 1XDLA 4P61A 3TW6A 2A2IA 3LHWA 3PULA 5SWUA 3LRKA 1OJXA 2C6QA 1GZGA 4PTNA 2HS8A 4IMEA 3BGGA 4IX2A 1OFAA 1S5WA 4AF0A 2EHHA 1M7PA 1IGSA 5MHBA 4QSHA 1VCVA 1YYAA 2DJLA 5FEXA 5F2MA 4TMBA 4LS1A 3MWAA 4MY8A 4O50A 1QR7A 4CNPA 3ABOA 2PC4A 2R91A 1EUNA 1OK4A 4JTUA 4LW7A 2J9YA 1QAPA 2WNZA 1UUMA 5F2LA 2CLEA 1I2OA 2FQIA 3A5VA 3USBA 2FB3A 4GUGA 4JN6A 2CZFA 3PUDA 4ZMGA 1UASA 2X2GA 3CU2A 2V81A 4S1FA 3S1UA 3MI2A 3LM7A 1LRQA 2CLFA 4Y9AA 3M6YA 2JKAA 3BG3A 5DCBA 1A5AA 1WYIA 2V9DA 1XI3A 3QMRA 3TAOA 2HTMA 2P10A 1GPWA 1JCXA 1XUUA 4K8EA 5F4XA 1GG0A 1FCQA 1O5KA 3MI6A 3TKFA 2FPTA 1WX0A 2A7NA 2YFOA 3BGJA 2C0AA 5TIMA 3TQKA 3EB2A 4IQLA 4QNEA 1NFBA 1F5ZA 1ZFJA 4U4MA 1H63A 3NA8A 3PY2A 4JNMA 3Q58A 3C2FA 3MI3A 1M7OA 2TPSA 4LRTA 1DKWA 1GVSA 4G1KA 3TSBA 3GB6A 1FCVA 1L6YA 3TC7A 1S5TA 2OMAA 4FF7A 2NLIA 2CLLA 1SZEA 4AH7A 1L2UA 5F4WA 2RDWA 1ONRA 2CZ5A 4N6FA 3W7OA 4UR8A 3O15A 1KFKA 1QCWA 3QMSA 1EPXA 4O8RA 1O4UA 3OVQA 2YYUA 5LZLA 3A23A 3S5YA 4MZ1A 4R34A 1JRCA 3U2OA 4UCGA 1I2NA 2Y61A 1SSGA 3QPYA 3ZWTA 3BK0A 1X1ZA 2EGZA 3PBYA 5T26A 3LX9A 4FO4A 4IOTA 1VLIA 5HR6A 1UJPA 4O0KA 1LLWA 4JX5A 1HL2A 1XBVA 4Y90A 3G8RA 3FOKA 1HTIA 1ADOA 4E0CA 4CNOA 1LP6A 4PODA 1F76A 1L6SA 2XN2A 5F1UA 4KWWA 4JDBA 1KM4A 3E0IA 4I7UA 3RMJA 3A21A 1DJNA 3DU0A 2DU2A 4UTLA 2Z2UA 3OA3A 2WNQA 3GIYA 1H7PA 5FESA 4ORMA 4HSOA 4TMCA 1VYRA 2Y7EA 3O07A 1QNVA 3P5YA 3DFNA 1KFEA 3I68A 3CHVA 1H7OA 2QCHA 4MZYA 1IXPA 4J9JA 4D2JA 1YDOA 1O94A 5A8GA 3M47A 2CLKA 4HNVA 1G4EA 1CX9A 3NQEA 2RHGA 4ALDA 4AWTA 1RZMA 2Q3RA 4ZQCA 4FNTA 4IMGA 3IEBA 2GJLA 4MYXA 3S0CA 3MJYA 4FNRA 1EX5A 1TQXA 1ZHAA 2WNNA 4O1DA 3F03K 3EWZA 3FYOA 3L0GA 1TPH1 4HSNA 1F73A 1B4KA 5J5RA 1PIIA 3M0ZA 2E5CA 1D9EA 1HO1A 4U28A 1VLWA 3TFCA 3T4CA 2JGQA 4Y6GA 5C54A 3HPXA 3NL2A 5DCDA 3WK3A 3H55A 3RLVA 1Q6RA 3NPVA 1TTIA 1ZJIA 3N2MA 2VXNA 3LERA 3W23A 4DF0A 4KFOA 1I45A 5L6UA 3KAOA 3G8EA 3B0PA 3P60A 2HMCA 1XL9A 3IGSA 5K9XA 2H6RA 2YCEA 1GT8A 4RKAA 1M6JA 3GZ3A 3G0XA 3FKRA 3PG9A 4PC8A 1AL7A 1KV5A 3SGUA 5FEWA 3C2VA 2OT0A 4AHQA 2F84A 1L6WA 1Z41A 5G2IA 2Y70A 3EWWA 4FNPA 1BWLA 3LCFA 4JDYA 4A3UA 3H54A 2J27A 1T8XA 3W1UA 5D2TA 4FIQA 1LORA 4H4IA 2FPYA 3MMTA 1JR1A 4I7WA 4RJEA 2CLIA 3QMTA 1BWKA 1A5CA 3WFAA 2V2HA 3UZ5A 5BRBA 3TSMA 2GVLA 2QJHA 4A29A 4QISA 4PA8A 2BLEA 5EKYA 1GVFA 3V75A 2QAPA 2ZA2A 5K9DA 1W3IA 1VYSX 1X7FA 3N14A 3MBFA 3KRSA 1B9BA 3KVJA 3O63A 2H90A 4QAIA 3LBCA 1J2WA 1IXNA 2G5WA 2QAFA 4Z0JA 2XN1A 2B7PA 1VZWA 4NJHA 5FF4A 3WK2A 3HBLA 3W1TA 3E12A 2E09A 3QJAA 3G1YA 2X16A 1NF7A 3VCRA 2BTMA 3LXBA 2ALDA 4LVDA 1EP2A 5D2XA 2X1UA 4DEFA 4EOUA 3LCIA 1TRDA 4IWWA 1OFEA 1P0NA 4HN4A 3U6WA 3NQCA 3YPIA 1IF2A 5CSRA 1OF6A 2HS6A 4E38A 3O06A 2GQAA 4HKPA 3W07A 1P1XA 3L67A 3I65A 3NDOA 3W70A 4DQWA 2EPHA 4BK9A 2VEPA 3B4UA 4M6QA 5I3JA 3FKKA 1QDSA 1S3HA 2B4GA 5G1YA 2VENA 5G4EA 1I2RA 2DZPA 2YW4A 4YCOA 1TREA 4QNWA 1GEQA 3QSTA 4JTSA 1N55A 4XTIA 3QZEA 5FF2A 3NPWA 1AMKA 3GLCA 2EKCA 4WY0B 3SIZA 3UXDA 1TPFA 2NX1A 1KM5A 1A5SA 2WV8A 1H7RA 1IXQA 2Y88A 2YYTA 3NPUA 3L5LA 3R13A 1LOLA 2V0TA 1KW1A 1SSDA 3G24A 2PE4A 4S2CA 1ZENA 1W5PA 4B5NA 3PC0A 3HF3A 2QCLA 3LGEA 1TPUA 3L9CA 1YTEA 4XUGA 4GUJA 4EWND 3W2KA 2TMDA 4WQ6A 1X6UA 1YXYA 2QDHA 2ZZ1A 4AMAA 1ICSA 5C55A 3BARA 3NQ8A 2ATMA 5HWNA 2FPVA 1QPOA 3SR7A 3AO0A 1W0MA 4LVGA 3TJXA 2J9XA 3SFKA 2Q3OA 5CG7A 2ZCGA 2ZQ0A 3LCWA 4DF2A 2CLHA 3STGA 2GJNA 2VEIA 4CQ8A 5DXYA 2BZNA 3LCHA 4DO4A 1ICQA 3FYPA 1Z48A 3MP4A 4MJZA 1XUZA 3L0KA 2CU0A 3OG3A 1R30A 4FX8A 4O16A 3DGRA 3LXCA 2QCFA 3G0SA 5FEPA 3KX6A 5AYZA 5KZMA 2CW6A 3W2LA 1H7NA 3Q37A 4GE8A 4S2BA 3LTYA 4UR7A 4BFAA 5AOUA 2QEZA 1S5VA 4JTKA 2A21A 3W2JA 3NPXA 4N9DA 2VELA 4GFSA 1GTEA 3VNDA 6TIMA 1TJPA 2W0UA 3BW4A 4NNBA 3BV4A 2ZZ2A 2OZ0A 2ZRWA 3V1PA 3M9YA 4MY1A 1RQBA 3RF9A 4BF9A 1AW1A 4ADTA 4HT3A 2PRHA 3CQ0A 3IVTA 2AAMA 4LV9A 3F4WA 1YDVA 3PUEA 3DXIA 4JS3A 5CZSA 4AVFA 5LSMA 4JIPA 1FBAA 4NUWA 4RCXA 3LRMA 5LNRA 3IVSA 4Z08A 2NWRA 1G69A 3TQ0A 1YLVA 1N8FA 1R2RA 4WY0A 3E9AA 4UTWA 3M16A 4X2RA 2ZZ3A 3TH6A 1KM2A 5LNVA 1VCGA 3EWBX 1VCFA 1JCJA 1PVNA 1UUOA 4ZZ9A 2ISWA 5D2WA 2JKPA 5EYWA 4O4WA 1KM3A 1TQJA 3UD6A 2A7PA 1PL9A 3EX1A 4Q32A 3G3MA 5BMWA 4IUOA 3NQVA 5D02A 1D3GA 3NM1A 1DOSA 3S5ZA 4MZ8A 4UFKA 4YXGA 3B8DA 5KZEA 5I3HA 3QH2A 3CIXA 4O1CA 1W8SA 4GJ1A 1VGAA 5AC8A 4XBKA 3A22A 3CTLA 4LOCA 1WXJA 1PHQA 3K30A 3LOTA 5BW6A 3GNDA 4JYDA 4IPJA 4MKNA 3W7LA 2EAWA 3R2GA 3GDLA 3SW6A 4DO6A 1XFBA 3WJZA 4O28A 2RKXA 1T96A 2YR1A 3EX6A 3F4NA 1JVNA 1K7EA 4JTLA 4K37A 5D03A 2QCMA 3NGJA 3B0UX 3C56A 3BVJA 3W71A 1EUAA 3HJZA 2ZRVA 3O6DA 1FWSA 3UXAA 2DZTA 2ZBTA 4O1BA 6ALDA 1X8FA 2Z1BA 4K38A 1QO2A 4O13A 2FTPA 3W1MA 2PRLA 2ZRXA 3L5MA 1HG3A 2CZEA 2RFGA 1FY6A 2Y7DA 4CQ9A 2C16A 2I1OA 5D38A 2Y7GA 2E77A 3RNDA 1TYGA 4WXZA 4ORIA 3CT7A 4I7VA 3IIVA 3LTSA 3UYCA 4ADSA 2X1RA 1TV8A 3P67A 2E6FA 1JUBA 5LGZA 4O19A 4OV4A 1TCDA 4UTJA 2QCCA 1W5QA 1I4NA 1I8JA 5LGXA 3M5ZA 4OGZA 4CCCA 4MVAA 3O1NA 1OG0A 3P74A 4IJBA 3GVGA 5A5WA 4ZQPA 5K4ZA 1W56A 4CQAA 3TMQA 3Q94A 2B0MA 2ZRYA 3UWWA 3ELFA 1PV8A 1JUEA 3W1PA 4MUZA 3OVRA 4OV9A 4OWGA 2E6YA 4M7SA 3IRDA 1VRDA 2H8ZA 1H1ZA 3P62A 8TIMA 3MW7A 4AEOA 3ABSA 1XXXA 1KM1A 5LHFA 2ZTJA 3FJLA 5LKYA 3NG3A 2TRSA 3C0JA 2BWGA 5KSWA 1AW2A 3WK1A 4RXFA 2CZDA 3GKAA 4X22A 2ZZ6A 1QMLA 1TPVA 1SFLA 3ATZA 4UNKA 4CNNA 1KM0A 5K7JA 2QCEA 4OU1A 5G1TA 2V8ZA 2FJKA 3PVFA 3NQMA 1EEPA 1ZAJA 1SO3A 2A6NA 4LWWA 3STFA 3VFLA 5TQLA 4NXSA 5F2GA 1QPRA 3W76A 1W1ZA 4UTTA 3S5OA 1DVJA 3LV6A 2VOMA 1OYCA 3HQ1A 5G4WA 3EWUA 1MEWA 3M44A 1XBXA 1DBTA 4MJMA 1ZCOA 3PB0A 2VC6A 4K6AA 4M7TA 1D3HA 1RPXA 5H2ZA 1ME7A 4FXSA 4O54A 1NAL1 4H6KA 1RQEA 3PR2A 1FDJA 2Y89A 1DQWA 3S9YA 3BLFA 1OX5A 3IVUA 1LBMA 2YFNA 2YDAA 2GQ9A 2LLEA 4O18A 3W1XA 1H60A 5DELA 3DFOA 5DY3A 4POCA 3UY7A 5FI8A 3CLMA 2NXGA 3JRKA 2CLOA 3W86A 2B7OA 4LS2A 3HGJA 3IIZA 4WUIA 4E2BA 3UZJA 2ZZ7A 3O6YX 3TU9A 4UUIA 1H51A 2A1YA 4JYFA 5D2VA 1C9DA 1KM6A 2VFHA 3CEUA 4EIVA 2UV8G 2NX3A 4Z1CA 1VC4A 4LC6A 4UTTC 3W22A 2JK2A 3OHIA 4KKXA 3THQA 2KZHA 2C13A 3SI9A 4AWUA 1TTPA 4MIMA 3H53A 2WJZA 2WSQA 4HHPA 4DPQA 1SO5A 3LHVA 2BXVA 1YDNA 2WKJA 1TPC1 4UNLA 2XN0A 1K03A 2NZLA 3EXRA 3W2MA 3DH7A 3IIPA 1KV8A 4RK8A 1GOXA 4UFLA 4ZQRA 1OYAA 4JXCA 1HUVA 3O6CA 2ZA1A 1FDYA 4C1KA 2WSYA 3LV5A 5F4SA 4TR9A 4CCEA 2J6XA 3O16A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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