3QJAA

Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis indole-3-glycerol phosphate synthase (trpc) in apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
267
structure length
254
Chain Sequence
ATVLDSILEGVRADVAAREASVSLSEIKAAAAAAPPPLDVMAALREPGIGVIAEVKDPAKLAQAYQDGGARIVSVVTEQRRFQGSLDDLDAVRASVSIPVLRKDFVVQPYQIHEARAHGADMLLLIVAALEQSVLVSMLDRTESLGMTALVEVHTEQEADRALKAGAKVIGVNARDLMTLDVDRDCFARIAPGLPSSVIRIAESGVRGTADLLAYAGAGADAVLVGEGLVTSGDPRAAVADLVTAGTHPSCPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
publication title Small-molecule scaffolds for Mycobacterium tuberculosis Indole Glycerol Phosphate Synthase (IGPS) inhibitors identified by high-throughput screening and defined by X-ray crystallography
rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 93
structure length 254
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qjaA00
1TTQA 3M0ZA 3UWWA 5D05A 4TMCA 3TU9A 1RQBA 5K9CA 1TPC1 4PCFA 3TE9A 4UFJA 2J9ZA 4DBEA 2YGYA 3T55A 3WK0A 1J2WA 5C2XA 3KFTA 5DCBA 1VLWA 2TSYA 3W7DA 4ORIA 3C4UA 4C1KA 4Z08A 3UWZA 4FNTA 5LNSA 1DQXA 4FF7A 4ZZ9A 3DI0A 3SFKA 3TH6A 3Q2DA 1W31A 4MZ1A 1KBIA 3QF0A 2VEIA 2FDSA 1NF7A 1GPWA 3VNDA 3ZWSA 5LNUA 4JTUA 1LOLA 1A5AA 1ICQA 3F03K 1NAL1 1OFAA 4J9JA 1TPWA 3THQA 3W1XA 3A5FA 5EY5A 3S1XA 3LCIA 2CLKA 4RCXA 3UD6A 5BNKA 1HG3A 5HUPA 5AHIA 1X8FA 3GR8A 2VFGA 1VCFA 1VRDA 1GJPA 1KA9F 5BRBA 5AHFA 1YLVA 4HT3A 4NZJA 2NUXA 2YFOA 3CEPA 4N9BA 3TFCA 3V75A 3OIXA 3Q58A 4NZFA 4MFEA 4GXMA 1HO4A 5LSMA 2PRLA 4HN4A 1SUXA 4JTFA 4M7SA 2WSYA 4AF0B 2PURA 3NZRA 3P62A 3DI1A 1WA3A 2J9YA 4RK8A 1W1ZA 1C9DA 3L21A 2OT0A 3UZ5A 3C2VA 4BWLA 4NX5A 1SW0A 4JTSA 2JKEA 3NZ1A 3L5LA 5ABTA 2GVGA 3TK7A 3B03A 1QOQA 3PM6A 4I7WA 2ZA3A 3QZEA 3FEMA 3UNDA 3W7EA 2ISSA 4MUZA 4JTHA 4U28A 3NQ7A 4MOZA 2YPIA 3VE7A 2VEPA 4FNRA 4UFMA 5I3JA 4UTTA 1OX4B 2ZRXA 1Q6RA 3F4NA 4WY0A 2YW4A 2H3DA 1OG0A 4O4WA 2C16A 4UR8A 3EWYA 1Z41A 2C0AA 1KM1A 3ABSA 4JYDA 4UIOA 4BWLC 3QPYA 4QISA 4DF1A 4MY1A 1OK4A 4AWSA 2ZQ0A 3MI6A 4BI7A 3MBFA 3TMLA 1GEQA 1GT8A 5DBTA 3INPA 4R34A 5EL1A 5G2HA 2ATMA 2OCZA 3K30A 4O28A 3TQKA 3C61A 3WK2A 1BWKA 1FY6A 3NQ6A 3FFSA 3LERA 5CSRA 1S3HA 1RZMA 4EVZA 2Y85A 3BLIA 3BW3A 4UTTC 3DH7A 3M43A 2YFNA 2E5BA 3U2OA 5BOOA 5G4WA 2HSAA 1JJKA 5FF7A 5D04C 3LDVA 5AHNA 3W2NA 5H2ZA 3T7VA 3T78A 3M5VA 3PVFA 1KW1A 2V82A 4X9SA 4XUGA 1JCJA 2RFGA 1WX0A 4JTGA 4IMCA 3PSWA 1IF2A 4IMDA 5F1VA 4CCDA 2Z6IA 1YTKA 3KRUA 2NUYA 3ATZA 2RKXA 4UTWC 1KM3A 1VLIA 1YXYA 3W87A 5LGZA 1PV8A 1KM0A 4OQVA 1SZFA 5EKYA 4DF2A 5D2YA 3O06A 3GK0A 1M6JA 3HGSA 3LCGA 1UB3A 2E6DA 1IIGA 2D73A 4M6QA 4K8HA 3MO7A 2NX9A 3W7GA 5G5IA 3W86A 3W83A 4WXZA 3EXTA 1QWGA 3TDFA 1KBJA 1TV7A 3HG4A 3BVJA 4HHPA 2YZRA 4DPPA 1XBZA 3AO0A 4M6VA 2XFWA 5I3IA 4NJJA 5G2WA 4GNJA 1H62A 4K7VA 2BXVA 1OABA 2P1FA 4FX7A 3G1VA 3FYOA 1R47A 2AGKA 4OV9A 3VKJA 4ZQOA 1JCXA 2W6RA 1SPQA 1H7XA 4OT7A 4Y90A 3PR2A 4NJHA 4CNNA 4O19A 1XDMA 2HS6A 1A5CA 2I1OA 5E93A 1N8FA 1W5MA 4K36A 3GDRA 1GYLA 4LV4A 2A21A 3KX6A 1O5KA 4AHQA 3QMSA 2A1YA 1XBVA 2ALDA 1DBTA 2Y88A 3G1XA 4A2SA 2FB2A 2ZRWA 2ZYFA 1JQVA 3NGJA 2TRSA 3FJLA 3H54A 3DU0A 3LXBA 3M6YA 1TV8A 3RK8A 3GDLA 3CC1A 4O1BA 2VC6A 5D2TA 4AWTA 1SO6A 1M7OA 5DELA 2X1UA 3W72A 2QJGA 1H7NA 3M5ZA 4XKYA 3W1AA 1HFBA 3TC7A 1IIHA 4UNKA 2Z0IA 4TO8A 3B0UX 4LVDA 1YXCA 1ZAJA 3Q94A 2CLLA 3SGZA 4N6FA 3LRLA 2C18A 2QCHA 3GZ3A 4MZYA 1ZNNA 4JR5A 3NQEA 2V8ZA 4L4MA 1ZAIA 3HBLA 4WQ6A 4DEFA 3TQ0A 2EKCA 2XN1A 2ZRYA 3LX9A 3M5XA 4FO4A 1O60A 4RKAA 1GOXA 5CGQA 4LRTA 4YMZA 4OE7A 2A7RA 2X1SA 3IIVA 3LHWA 4MPQA 4IQLA 1K7EA 4UFIA 5KZDA 4NNBA 2E5DA 3TMQA 1F7BA 3Q37A 3TV8A 3WK3A 5CPOA 5CZSA 3W1PA 3W7PA 4YL2A 1QPOA 2XN0A 4O1DA 3RNDA 3NG3A 3QM3A 2QF7A 3O07A 2BWGA 1LRNA 1OFBA 3B04A 1LP6A 5FEWA 4NJIA 1B9BA 1G7VA 2J6XA 3B06A 3WJZA 3PB0A 3SI9A 3UXAA 3W73A 5GVJA 4GC4A 3S5OA 5LNVA 2FPYA 1TPEA 4U4MA 1D3GA 5J5RA 3L67A 4FNSA 2E6FA 5AB3A 1EEPA 1XFBA 3QC3A 5D33A 3W7IA 3QMTA 2I14A 4RR4A 4UR7A 3MP3A 3GLCA 5DLCA 6TIMA 2W0UA 2WNZA 1L6YA 1UUMA 3N3MA 3UPWA 3PUOA 1JUKA 1VJIA 1Q3NA 3MHUA 1W8SA 1K7FA 4LRSA 4MZ8A 4R53A 4DO4A 2WSRA 4OHQA 3RLVA 2GJNA 1M5WA 3PC0A 4I7UA 3STFA 2GOUA 2P10A 1LBFA 3CIXA 3DAQA 3A21A 1TPB1 3UZJA 3BLEA 3LTPA 3TIMA 1OX6A 3PBYA 5K4XA 2FJKA 1TCDA 5HNRA 1UASA 2H90A 2QKFA 3EXSA 5KMYA 2B0MA 2X1RA 5AC8A 2NXGA 3PSVA 3LCXA 1WBJA 1YTDA 3HG5A 1GQNA 3M7WA 4XKYB 1H60A 2Y7DA 3I7SA 1FXPA 4HSOA 5D38A 4YCPA 3W7MA 4RLIA 4MYXA 2CLEA 3I7RA 1TMHA 2GQ8A 2V0TA 1WYIA 4BI5A 3CQ0A 3NPWA 4IXXA 4EF9A 3GDMA 1QO2A 3P80A 1FDYA 3L66A 5FF0A 3TAOA 4BI6A 2J88A 1LLWA 3MJYA 4LC8A 4AEOA 3IGSA 3BARA 4XTIA 1G6CA 2FB3A 1G7UA 2H6RA 1THFD 4MYAA 5HINA 1FCVA 1L2UA 4YWIA 4FB7A 4GE8A 1QPRA 3PUEA 3OHIA 2ABBA 3R5EA 4DXVA 1F73A 1B4EA 4Y8FA 1KM4A 1YDOA 3UWUA 4S2BA 1K8YA 3L5AA 3O15A 5DBUA 3CWNA 1GG0A 2QCNA 1ZAHA 4ICNA 3G1HA 3STGA 2BSLA 3SECA 3S9YA 4NUWA 4JICA 3M41A 3EEGA 1R46A 3M1ZA 3PWAA 1PHWA 3BG3A 5LHEA 1X1OA 3UWYA 3TW6A 3QPZA 2X2GA 1W5NA 2E6AA 2CZFA 5FEPA 3VCRA 2QCEA 3QEZA 1O95A 1VCVA 4FEZA 4Z1AA 4KWWA 3EX4A 4LOCA 1ZY9A 3BG5A 1XBXA 1K3UA 2VFHA 2F84A 1DVJA 3NPVA 4JX4A 3W22A 4WJEA 2NWSA 2GUUA 1XL9A 4MJZA 1D9EA 1IXQA 1MO0A 4ZL1A 4O8RA 5U4NA 1RV8A 2A85A 1W5QA 1DJNA 3TUUA 5F2LA 4JDBA 3S0CA 3HB9A 1GTHA 2B7PA 4GWEA 1U5JA 4IPJA 1H7OA 4AHOA 4A3UA 3GX9A 4PTNA 2Y7FA 1K03A 4A29A 4IMGA 5HJLA 3W74A 2B7OA 2ZDRA 1KV5A 2QCDB 3CLMA 3EX3A 3HMJG 1VGAA 4QITA 1KFEA 1TJRA 2C1HA 4EWND 3T44A 5CKSA 4AB4A 5I3GA 2V2CA 5AHMA 1NFBA 1DOSA 2C19A 3OVRA 1VHCA 3KRZA 3HG2A 5FI8A 3FKKA 5FF4A 4LW7A 1F5ZA 2GJLA 1AMKA 3W2LA 3YPIA 1JULA 4LVFA 3MP4A 3MMTA 4C1LA 2C15A 3EWWA 1RQHA 5F4SA 5F1UA 4LVBA 3IVTA 3FIGA 4NXSA 4HNTA 3NXFA 3OEXA 2ZZ2A 4LT9A 3A5VA 4IOTA 1AG1O 4Q32A 3DFQA 3W7CA 1OX5A 4RZ4A 2QUVA 5TBOA 4UTJA 5J5DA 1WOBA 1SFJA 1RD5A 4QNWA 2BX7A 3MW7A 3CIWA 4Q4KA 3GDTA 5HULA 1GZGA 3MI3A 3A23A 4JNMA 3HGJA 3QW4B 3LBCA 3WFAA 2A6NA 5AHEA 3PBWA 3MYOA 4AMAA 1G4SA 5K9DA 1W5PA 4NQ1A 3LTYA 1H1YA 2ATSA 1N55A 5T26A 1OVDA 4ADSA 1NEYA 3I6RA 3NQAA 1XI3A 4O13A 4ZQRA 1QAPA 2R14A 1C29A 4QAIA 1FWTA 3PUDA 4DO6A 5E1QA 5C54A 1YXDA 3KVKA 5D30A 8TIMA 1PHQA 4ORMA 3L2IA 1JRCA 3NA8A 3W1NA 4UFKA 2WSQA 4LU0A 4HKPA 3WJXA 1LDCA 2Q3OA 1KFKA 1R2TA 3HGOA 3G0SA 1Q6LA 1O94A 2CLIA 4JXCA 1JCNA 3L68A 3CT7A 1TPVA 1W3TA 3DFPA 4WZHA 4TIMA 5LHFA 1ICPA 3A22A 3P61A 3G1DA 3IIOA 3G1YA 4JYEA 1JCYA 2A5HA 1TO3A 1SO4A 4WX2A 4JX6A 3AJXA 1Q6QA 2JKAA 2Z1BA 3M9YA 1OFPA 3KHJA 2Y62A 1L6SA 3NL3A 3S8HA 3IRDA 3U6WA 3LOTA 4IX2A 3W3OA 1OK6A 3C8FA 3M44A 3ZS4A 4E2DA 1JCMP 1TSIA 4JYFA 4UTWA 2G95A 3QH2A 4UC5A 3R89A 3TJXA 2ZFAA 2C6QA 3LCHA 4JY9A 4HNUA 1RQEA 5CPLA 4ZQMA 4DBDA 2YYUA 5LGXA 1FWSA 3P84A 2V9DA 2G5WA 5I3HA 3TQVA 4QQ3A 5U7SA 4PA8A 4NNAA 5D37A 4YLWA 4QSHA 5BMXA 3L5MA 3TROA 4BK9A 3G0UA 1BWLA 4Y96A 4UCGA 1B3OA 5DXYA 2GQAA 4AXKA 2NV1A 3ZFHA 5HR6A 1DL3A 2CLMA 1EP2A 2VFIA 2HTMA 3CB8A 5DY2A 3GR7A 3IIPA 4FXRA 1F76A 3EXRA 2NX1A 3IGUA 1KFJA 2DZUA 3WK1A 3NQFA 1W3NA 3W1RA 4FNUA 1Y0EA 1Q45A 3CWOX 1H63A 3PAJA 1YDVA 3NPUA 3CM4A 3NL6A 3S42A 1LROA 3HPZA 3JRKA 4X3ZA 5AOUA 4UTKA 4O52A 3LHUA 4HPXA 4MIMA 3SJ3A 2ZZ7A 3CEUA 3EX2A 3S5ZA 1FDZA 3N9RA 1VCGA 2V5LA 2DZTA 3GNDA 1SZEA 1B4KA 3GKFA 4NJGA 3VE9A 1YPFA 1S5TA 1XC4A 4S2CA 4IPIA 3EWXA 1MZHA 3I65A 3UWQA 1OYBA 4JS3A 4O1CA 4Z1CA 3E12A 1VYSX 2BZNA 4OWGA 1PS9A 3NR0A 5EA9A 1A5SA 4O1AA 1OX4A 3S1VA 2YR1A 4UNLA 3NQDA 5K4ZA 4JTEA 1I8JA 2V5BA 2PC4A 2QDGA 2IQTA 1T99A 2JBMA 2WNQA 2HS8A 4HPJA 4WY0B 1TQXA 1P5BA 2R8WA 3HQ1A 4XQ6A 2R94A 4IGHA 1QCWA 2OT1A 3S1WA 1KFLA 6ALDA 3O6DA 4I7VA 2R91A 5KINA 3TJLA 1S5VA 4NX0A 3GNNA 4IMEA 2OMAA 3N19B 4O12A 3BW2A 1DV7A 1VS1A 2Y6ZA 2X1TA 3LM7A 4RXFA 1JVNA 5KZEA 1YYAA 3B0VC 1G4TA 3O1NA 2DU2A 2GVLA 2QUUA 1ME7A 4R7JA 1EUAA 5FF3A 3DHDA 3BW4A 1KTBA 4BR1A 5DY3A 2TYSA 4KFOA 1W56A 1LRTA 3EWBX 3S6DA 3NNTA 5G1TA 5C6MA 1V5XA 1UJPA 4IXHA 1BEUA 3TXZA 2A4AA 2E68A 2GVJA 4PEKA 3DENA 3LBMA 4LS2A 1EX5A 1MEHA 1PL9A 3DFTA 4O0KA 3E49A 4E0CA 2WJZA 1XM3A 4O50A 5G4EA 2ZZ1A 5HWNA 1NSJA 2CWNA 4MY9A 3UQNA 4IWWA 4CLMA 3TFXA 2VELA 1MSSA 1PCWA 4FNPA 4GJ1A 2WV8A 1NVMA 1T96A 4N6EA 3I7QA 1FBAA 4N4QA 1GVQA 2ZBTA 3G8EA 4RX0A 4K38A 4GRSA 3GVGA 3LI1A 3W7OA 4GUFA 2DZVA 1TB3A 1H7WA 5BW6A 1SQ7A 3BK0A 1KFCA 3G8RA 3OVPA 1G69A 3KVMA 5CPMA 2VFDA 4RZ5A 1TTPA 3W2MA 4IJBA 4ZQCA 3N34A 4JTTA 1KV8A 3W7HA 1LZOA 3BG9A 5AYXA 1F05A 4JDYA 1P4CA 1PCKA 3W76A 2PRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OEJ A;  5D05 A;  3E2Q A;  1RHC A;  1KC7 A;  4EPD C;  4M1R A;  5K9C A;  4PCF A;  3AUJ A;  3TE9 A;  4UFJ A;  3U4F A;  4DBE A;  1H49 A;  3R94 A;  5C2X A;  4C1N A;  2BG5 A;  2D2J A;  4Z08 A;  2XII A;  3DI0 A;  2XFF A;  4G2D A;  3TH6 A;  3Q2D A;  1W31 A;  4MZ1 A;  4HYV A;  3UCD A;  5EFD A;  5LIK X;  5JBD A;  3G2G A;  2VEI A;  4F0H A;  5DT7 A;  4Q3M A;  1SMA A;  3DFH A;  1AMY A;  1GW9 A;  4AZ5 A;  3BAW A;  3ZWS A;  1LOL A;  2XFY A;  4ZEN A;  2Z1V A;  2NQL A;  3THU A;  1OFA A;  3THQ A;  1OBA A;  3W01 A;  2PP3 A;  5BNK A;  5FJT A;  2PPG A;  4PR4 A;  1R6W A;  2G4J A;  1VCF A;  2X09 A;  2ACR A;  2JF6 A;  4HT3 A;  5F7U A;  4N9B A;  3TFC A;  2IXV A;  3LA4 A;  2OYK A;  4LEQ A;  3TZN A;  5LSM A;  4HN4 A;  4JTF A;  4M7S A;  4XO7 A;  4B2D D;  3UGR A;  4AF0 B;  3MMU A;  1WA3 A;  1Q6D A;  2J9Y A;  4J3V A;  2NW0 A;  4HHH A;  1JZ5 A;  1KO0 A;  2V69 A;  2OT0 A;  3UZ5 A;  2OQY A;  4BWL A;  4PMO A;  1J10 A;  4AWE A;  1XIF A;  4RDY A;  5ABT A;  2ZX8 A;  2GVG A;  3IAR A;  4HMD A;  3H22 A;  3B03 A;  1XYC A;  2E8Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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