3AHZA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with tris
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
source organism Neotermes koshunensis
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahzA00
5A95A 4F79A 1GVYA 3IJ7A 1VENA 3AISA 2WW5A 3G6MA 3KL0A 2FDMA 1SYTA 3RIKA 3LPPA 1E3XA 3VGEA 3WQWA 1J9YA 3NJ3A 1WDQA 1VFOA 4RE2A 1UH3A 2BNJA 3SCUA 4M80A 4GINA 2FH8A 3SUTA 1LWHA 4QCEA 4JHZA 3PZGA 2J25A 1GOKA 1W9VA 1AQ0A 3VIMA 2WMIB 2ZXDA 1UR4A 1QNSA 1HF6A 1WZKA 2E0PA 1JAEA 1HX0A 3T2PA 4E4PA 3B8SA 1EOMA 1TFVA 5BWFA 2G41A 4HU0A 4AIUA 4OOUA 2V3EA 4CU7A 4CCCA 3CBWA 3BLKA 1K9FA 1UWQA 3APGA 3A6OA 2EXOA 5C71A 2V3FA 2XFRA 3W24A 3VDBA 4KMQA 3SEPA 4W86A 2CBIA 1CGXA 2DSZA 1JDAA 1NWUA 5CSYA 3WNLA 4P8UA 2ZX7A 1GQJA 4EK7A 1NP2A 2XVPA 2NSXA 1E72M 1W1PA 1ISVA 1W9XA 1TE1A 1KQYA 1OINA 2E3ZA 4FLRA 3U7VA 4D72A 4E8CA 1EHNA 2J47A 3OGSA 4HA1A 3AIEA 5ABHA 3W38A 4KWUA 5A8OA 4UQBA 1E9LA 2XYLA 5ECUA 4HA4A 4GPNA 3DYOA 1PBGA 1QNPA 3DYPA 4KGJA 2YKKA 2Y5EA 4EAMA 2CERA 2V38A 2VCCA 4BCEA 4GI6A 1UD8A 4N0RA 1HVQA 1DWFM 2GFTA 4TTUA 5A2AA 1U33A 2AMGA 4ZENA 1QI4A 5FL0A 1CGTA 1EXPA 1MQRA 2J7EA 3GBDA 1B3YA 2WWDA 4GQQA 3AS3A 1VBRA 5FCZA 3K8LA 4ML4A 4DUVA 4UNIA 4W7WA 1L0PA 1W3LA 3BMWA 1W9UA 5D9MA 2VOTA 2WM0A 3U5UA 1B3XA 3GYCA 1QNQA 1BVZA 1JZ8A 2O9PA 1J0HA 5GPRA 4CN1A 1CENA 3OLIA 3WIJA 1HKIA 2A3AA 2A3HA 4P7RA 3T09A 3OG2A 1FH8A 1WZMA 2NT1A 1OSEA 3LPOA 5EMYA 5FOOA 1JD7A 4H8HA 2XWDA 2CKSA 2JE8A 2ZXBA 2JEPA 1OIMA 1ZL1A 4HMCA 4J28A 2G3NA 4XV0A 3K4DA 1UR8A 5CJ5A 3ZJ8A 1FP8A 2CESA 3MMUA 1HL8A 2E40A 4AWEA 2B31A 1BG4A 1HKKA 1E71M 3CZ8A 1CGWA 4AZ6A 3A4AA 2CITA 3IAQA 3EDJA 4QLJA 4B15A 2J7HA 3MANA 1GOWA 2YBTA 1R86A 3D3AA 5JUVA 2C0HA 1E0XA 1B30A 1LL7A 3N15A 2BY2A 3MMDA 1VFFA 1R7OA 5BXTA 2D0FA 3L4UA 2GUYA 8CGTA 2GJPA 1V0NA 1UD2A 3NSXA 4UZUA 1JDCA 4WLCA 1NOWA 1TG7A 3QGVA 1JF6A 1E5JA 1DWHM 3T0BA 1V02A 2D24A 2YA2A 3K8MA 2HVMA 5HBFA 1E4MM 1EDQA 4Z2JA 2DQXA 2ZX6A 1UKOA 4D6CA 3M46A 4M24A 2JIWA 3ZR5A 4WSJA 4MNJA 1QBAA 1QI3A 1VBUA 1UKTA 1EDGA 2WC3A 2GJRA 3PTMA 4LXFA 1LG2A 3WF2A 1KXVA 4M8UA 2VUYA 1LWJA 3HU7A 4ACZA 5HDRA 4JFTA 5CPQA 2DT0A 4E2OA 3AJ7A 2WMKA 3RMEA 3VDCA 2YL9A 5A2CA 4XB3A 1BYCA 1ITCA 3CIVA 5AC4A 1E15A 2ZX9A 5A6KA 3MUZ1 4OIFA 3MU7A 5I24A 1CLVA 1XCWA 3AMCA 1HKMA 2NT0A 3BAJA 3RCNA 4ACYA 3GXDA 3CZGA 2WKGA 1WCGA 1QI5A 5A94A 2BHUA 1GVIA 1UWRA 5KZ6A 4D6GA 3SCQA 4E8DA 4ZE5A 1E5NA 3RO8A 2BY1A 3OIHA 2ZUNA 4KGLA 1M04A 1GUVA 2WZIA 5BYWA 2VRKA 3CUFA 3EMCA 2YL5A 4MADA 3MKKA 4TTGA 2BV9A 5BRQA 2XM1A 1UWTA 2G3JA 1S46A 1LF1A 1J0YA 2J7GA 1VJSA 2RGMA 2J7DA 1TUXA 1X1NA 1WZLA 2PWGA 4D1JA 2GVYA 3WEOA 4EKJA 4NI3A 4EE9A 2WHMA 3VM5A 1J12A 3EYPA 1UOKA 3N18A 2XWEA 4ACZB 2ZUTA 1E4NA 3WL1A 3M6DA 5FKYA 2VZSA 2PC8A 1PPIA 1HJWA 2JF6A 3CHFA 2WPGA 1VB9A 1G5AA 1PIGA 3VM7A 2J8GA 1W3JA 3KE0A 5GQBA 1DP0A 3VOCA 2OWCA 4CD7A 4WK9A 3GNRA 1CDGA 3J7HA 3QOKA 3UR7A 3HN3A 2OYMA 3WSUA 2ZXQA 4UQCA 1E1EA 1PJ9A 4JFWA 2CIPA 3PZNA 1WE5A 5DT7A 4ZE4A 2O9OA 3WD0A 2WVTA 1KR1A 5I23A 2VX6A 4PMDA 4QLKA 1H11A 4Y7EA 3ZSTA 2C7FA 4W8LA 9CGTA 3TOPA 1MW2A 2XUCA 1W2VA 4CCEA 1KXQA 3WQ5A 3WEMA 4AZIA 3BLPX 3WH9A 3L4ZA 3WDPP 4GZIA 1KR0A 2WLYA 3UR8A 1HVXA 1GJWA 4HOXA 2XIBA 3CUHA 4GKLA 4PMVA 1UG6A 3NDZA 4FLOA 2WANA 3RJYA 1BAGA 2Q8XA 3NIYA 4H41A 1CTNA 4M29A 2DH2A 1JAKA 3AS0A 1Q6GA 1V02E 3PHAA 2Z1KA 4UFIA 3FY1A 2E4TA 1E6QM 2VQUA 1V3LA 3AHZA 1XV8A 4UQDA 3M7SA 3KEHA 3VDHA 3WNOA 2GK1A 2VI0A 2A3BA 4PSPA 1BG9A 3QOMA 4OBRA 1AQMA 1MYRA 4OUEA 4ATLA 4L4PA 1OT1A 2WC4A 4R5EA 1N82A 2WHLA 5E0CA 1NOFA 2D0GA 2BY0A 4BA0A 2W92A 4AIEA 1GNXA 3CUIA 4MJ2A 1CGVA 4JFUA 4NF7A 2VZTA 2DDXA 3CHDA 1MFVA 1RH9A 2XGBA 3CUGA 1E6ZA 1NP0A 1UD6A 5I3DA 2PBOA 3OB8A 2W66A 1JGIA 3CO4A 3ALGA 4QCFA 1FFRA 3AIQA 4X9YA 1LLOA 2EO7A 1V6WA 2JIEA 4TVCA 3SCOA 1D3CA 3AXIA 3NCOA 3W37A 4H8VA 4FMVA 3A4XA 5E09A 3MSDA 1B3VA 4H8UA 3W26A 2EQDA 5IFPA 4J3TA 2XVLA 2WB5A 4UTFA 2GK1B 1E3ZA 2V5CA 4QAWA 5C70A 1SFSA 3ZJ7A 1PAMA 2UWFA 1JL8A 2UY4A 2VTFA 1DWGM 4YN5A 1MWOA 1H4PA 2DEPA 1XH1A 4QLLA 3GNOA 5HNNA 4GZJA 3T2OA 3ZQ9A 1E4LA 3SCTA 3AI0A 3VGGA 3IK2A 3ARSA 4F9JA 4AW7A 2PI6A 3N11A 2WK2A 2UY5A 4MB3A 4MJ4A 3DC0A 1QHOA 3KZSA 3MMWA 2QF8A 3ZT5A 4PUDA 2PWFA 1CPUA 2WSPA 1JYVA 1E6SM 1KBKA 3WQ6A 3W6MA 2RGLA 4MNMA 2W61A 1UUQA 1QI0A 1QI2A 2XFYA 3WNNA 2BVDA 1ZBWA 1UA3A 4AZ5A 1K6AA 4GO9A 1QNRA 1FH7A 1Q6DA 3GXFA 4BQ2A 5CQ1A 3AZSA 2DSVA 3CTTA 3K1DA 2VRJA 3PN8A 2ZE0A 3NDYA 3VINA 3AYRA 4JIEA 1I75A 4W8AA 3CZLA 1V0MA 2PWHA 4AD4A 4ATDA 1US3A 1W91A 1C7SA 1KB3A 1UD4A 1C3FA 3DECA 1JIBA 1CZ1A 5DF0A 2BVYA 4OJYA 1TZ7A 1MFUA 5A3HA 3PZIA 5A6BA 1OGBA 5D8WA 3RPMA 3VGBA 1EH9A 3ARUA 1ISYA 1QHZA 3OA5A 1YQ2A 3ARPA 4W8BA 3VX1A 2JFEX 1P6WA 1GZJA 1J11A 3FAWA 4OKDA 4F9DA 1VEPA 4CVWA 3HJEA 3IANA 1NH6A 3ZJ6A 3CUJA 5IHRA 4JFSA 2DSUA 3WBAA 4AMCA 2WVSA 3SUSA 1W1VA 2YA1A 1A47A 5HPOA 3PZUA 4PMNA 1DHKA 1BYBA 3WD1A 3AQUA 4PTWA 4LYQA 1VFMA 1SMDA 3WUEA 1EHAA 2EJ1A 5TD4A 2OLHA 3KL3A 1Y7VA 1NARA 4BQ3A 3ARTA 3SCNA 4NSBA 5A6LA 1E4IA 3WKZA 2YL8A 3F5LA 2E8YA 1FH9A 2DIEA 3GTNA 3W4RA 4AZBA 4D71A 3EMQA 2D1ZA 2A3CA 4IPNB 3ZOAA 4AZHA 3OZPA 4CU6A 4X0NA 2D22A 1OB0A 3EDKA 2OWWA 3LMYA 2EPKX 1LQ0A 2YIHA 1AVAA 5CLTA 3EBVA 2XVNA 3WD4A 5IDIA 4JL2A 1GOMA 3WY1A 2V3GA 2CBVA 2ZICA 3AXHA 5DT5A 2FHFA 5EBAA 3EMZA 2AOSA 4IUGA 4PCSA 2A3EA 1BF2A 3BAKA 4LQ1A 5HOSA 4ZEPA 1GOQA 4U2YA 2X05A 1DWIM 3TTQA 1UYQA 1JYWA 1XD1A 5FD0A 4GI8A 1Q6EA 1HN1A 4AD3A 4HU8A 2X0HA 3DHPA 5E9AA 1NWRA 1SMAA 3CHCA 1XCXA 4KH2A 2QV4A 5M3WA 1CGUA 4AZGA 1U2YA 2QLYA 1CXLA 4W88A 4IISA 3GH5A 3VD5A 4P7OA 2DGAA 1Q4NX 2YDRA 2XHYA 3WMCA 2ZUSA 4CGTA 1PX4A 2BY3A 2FHBA 3PZOA 1HP5A 1KWGA 5CG0A 3VD9A 5LYRA 1ZJBA 4S3JA 1UR0A 4UFJA 4CD8A 1KXTA 3FXYA 1ZBVA 1NQ6A 1KFWA 2VZUA 1UZ4A 5ABGA 4P8XA 3K46A 3BSHA 4U31A 4V2XA 5A8NA 2WYSA 4AEFA 4WKHA 3WH7A 4CD4A 1KQZA 2G4FA 4RE4A 4DWSA 3KWXA 1K9DA 2FH6A 1XRVA 2Y8VA 3SURA 3CGTA 4A3HA 4AEEA 2VCBA 3BAXA 4PBGA 5BROA 3VGHA 1X6NA 1IZKA 5D9PA 2EPMX 5AYBA 4LPCA 2WMGA 3GXIA 1MXGA 1RP9A 2VL4A 3UERA 3QHNA 4H7VA 1W3KA 2XIIA 5CPSA 4MB1A 2ZUMA 1IV8A 4PYSA 1H3GA 1QW9A 4PMUA 4UQEA 2XSAA 3AHTA 3D5HA 4HZ8A 1EGZA 3RM9A 1VIWA 2CCRA 1EO5A 4CUCA 4Z2IA 1UWSA 4JL1A 4FLQA 4UOZA 4TVUA 5A8QA 2BXZA 2X2YA 4JCMA 2VNCA 4TX8A 3AOFA 1W9DM 4XUYA 2DT3A 1IZJA 1Z32X 1QPKA 3W27A 1NM9A 1B0IA 2CHOA 3ZM8A 1OD8A 1ECEA 1GQLA 4RL3A 1JYNA 3VD7A 3VMPA 1CYGA 3W81A 3FHAA 2XJ7A 3JUGA 2DPEA 1J18A 3GDBA 5JBEA 3BCFA 2VRQA 4KRTA 5I6SA 4DWSB 2CHNA 4U5IA 3WBEA 2OSWA 1DWJM 1PX8A 2C8NA 3IJ9A 3SCRA 4P7LA 2WLZA 1C93A 1UD3A 1E40A 4LYRA 2G3IA 3IJ8A 3W82A 2AAAA 1QW8A 4PMYA 2OYKA 1B31A 3VTRA 4JKLA 3ARWA 3THDA 3NYDA 2YDSA 3WF1A 1CNVA 1UQYA 1RD6A 2YL6A 4XX6A 4HMEA 4YHGA 3OLDA 4Z2GA 3WQVA 3TONA 3QR3A 1JFXA 1QVBA 1CGYA 3A4WA 3I3BA 5E6YA 1GW1A 3WDIA 2Y24A 4UFMA 2CNCA 3THCA 1ZS2A 2W62A 4HZ7A 1HJQA 1C8YA 3GXMA 5D8ZA 3FN9A 4CN4A 4D6DA 1E6PA 1ZU8A 4UCFA 4Z2LA 1E1FA 4QDMA 1R8LA 1GQKA 1BFNA 2WKLA 3OBAA 5BXRA 4W89A 1UR2A 1MQQA 1BYAA 1V6XA 4J3SA 3EDFA 4DUWA 1XSIA 1R7AA 1UR1A 4PMRA 1UQZA 2GSJA 1G9HA 1XSJA 1ZB5A 1LJYA 7CGTA 4JHOA 1G01A 3VMOA 1GOIA 1MW0A 1JNDA 4DM2A 3PTQA 2CKRA 3VIJA 3F4VA 4URIA 4AISA 3O2LA 3WFLA 3AYSA 3OGRA 3WEZA 1V08A 2ZIDA 3U7BA 2G3MA 3TP4A 3WH5A 3NUKA 3N9KA 2IXVA 3FAXA 3ECQA 4GQRA 2VC9A 2WHKA 1XH2A 4PEEA 2VURA 4CN6A 3N17A 2ZX8A 3MO4A 1OT2A 1WZAA 2VQTA 1V3MA 4A4AA 3K4AA 5DO8A 3FW6A 5I78A 3PZQA 1HXJA 3AHVA 2CEQA 4N42A 3VKKA 3BAWA 1B3WA 2OSYA 3I3EA 1BGGA 1W9PA 1W1TA 2WBKA 4CD5A 2QPUA 3VIHA 1VAHA 2EBNA 1JF5A 2W67A 1CXFA 4BQ5A 1UH4A 3VIPA 3WH6A 2ZUVA 2IUZA 3T08A 5BRPA 4GO8A 3BAYA 2VT0A 1DWAM 2WMFA 1BYDA 4MNKA 2Y8KA 3ARRA 3T0AA 4PRWA 4W7VA 3VD3A 1E70M 2PWDA 2X0YA 3UESA 3ZSSA 1E0WA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5A95 A;  4F79 A;  1GVY A;  3IJ7 A;  1VEN A;  3AIS A;  2WW5 A;  3G6M A;  3KL0 A;  2FDM A;  1SYT A;  3RIK A;  3LPP A;  1E3X A;  3VGE A;  3WQW A;  1J9Y A;  3NJ3 A;  1WDQ A;  1VFO A;  4RE2 A;  1UH3 A;  2BNJ A;  3SCU A;  4M80 A;  4GIN A;  2FH8 A;  3SUT A;  1LWH A;  4QCE A;  4JHZ A;  3PZG A;  2J25 A;  1GOK A;  1W9V A;  1AQ0 A;  3VIM A;  2WMI B;  2ZXD A;  1UR4 A;  1QNS A;  1HF6 A;  1WZK A;  2E0P A;  1JAE A;  1HX0 A;  3T2P A;  4E4P A;  3B8S A;  1EOM A;  1TFV A;  5BWF A;  2G41 A;  4HU0 A;  4AIU A;  4OOU A;  2V3E A;  4CU7 A;  4CCC A;  3CBW A;  3BLK A;  1K9F A;  1UWQ A;  3APG A;  3A6O A;  2EXO A;  5C71 A;  2V3F A;  2XFR A;  3W24 A;  3VDB A;  4KMQ A;  3SEP A;  4W86 A;  2CBI A;  1CGX A;  2DSZ A;  1JDA A;  1NWU A;  5CSY A;  3WNL A;  4P8U A;  2ZX7 A;  1GQJ A;  4EK7 A;  1NP2 A;  2XVP A;  2NSX A;  1E72 M;  1W1P A;  1ISV A;  1W9X A;  1TE1 A;  1KQY A;  1OIN A;  2E3Z A;  4FLR A;  3U7V A;  4D72 A;  4E8C A;  1EHN A;  2J47 A;  3OGS A;  4HA1 A;  3AIE A;  5ABH A;  3W38 A;  4KWU A;  5A8O A;  4UQB A;  1E9L A;  2XYL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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