3W72 | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-107 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w72A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w72A01

2WPBA 3GNNA 3S5YA 3G1YA 3TSBA 5FEZA 3L65A 2PC4A 3D0CA 4EWND 5I3FA 1RD5A 3QM3A 4UTIA 2ZZ1A 4MZ8A 4LT9A 1H7NA 5K9DA 3G18A 3W71A 1SZNA 4O18A 1GYNA 1G69A 4AB4A 1I2QA 1I2RA 5KMYA 3OG3A 3LHZA 2Z6IA 4YCOA 2WSQA 2QCDA 2E1DA 1OVDA 1D3HA 3KVJA 2RDWA 3EB2A 4QNWA 5AB3A 3MO7A 4LUJA 4JX4A 2VFEA 3WJZA 2NXHA 4YLWA 2QCGA 3NYZA 1XFBA 3QF0A 4IOTA 4LC6A 4IXHA 3HF3A 2FFCA 4JTIA 3MP4A 2YCEA 3OBKA 1JQVA 2Z1BA 3CPRA 5CZTA 1LOLA 1F6KA 3LCHA 3C2FA 4FF7A 3NO5A 3NPWA 3W2NA 4G1KA 4EF9A 1YTKA 4MY9A 1TPWA 4UTWC 3EWUA 4WY0F 3QSRA 3B06A 1H60A 2R14A 1EPXA 3W70A 4N9BA 3GDKA 3H54A 3IV3A 5CGQA 3THQA 3C4UA 1TPVA 3DXIA 3R5EA 2XN0A 2JBMA 4UTJA 3QPZA 2J27A 2JKEA 1IXQA 2YXGA 4O50A 1L6WA 4JGDA 4Z1CA 3NM3A 5BOOA 2J9XA 3W1XA 5K7JA 4AMAA 1TTQA 1GWJA 4HNNA 5AHLA 4IPJA 1T0OA 3I7QA 3OVPA 5FEWA 4NNCA 2B7OA 1GVRA 2FB2A 3QFEA 1VYRA 2GPTA 5FI8A 1YDNA 4X9SA 1O4UA 3MI2A 3PVFA 2J9ZA 4HSOA 2QCNA 3BPWA 5CZ0A 5TQLA 1FUYA 4E38A 3I6RA 4FNTA 1WOBA 4NZJA 2X1RA 3M6YA 3RMJA 2B4GA 3W7KA 4Q33A 3RNDA 4LC8A 3W1QA 4LS0A 1OX6A 7TIMA 3G0XA 3UYCA 5CZSA 5HQEA 2R91A 2P10A 1X1ZA 5HULA 2BX7A 3I7SA 2E6FA 1OJXA 3SGUA 3WFAA 1EX5A 2HS8A 3EX2A 4AHQA 1D3GA 4NJIA 1WXJA 4HSNA 1MEWA 3FFSA 2ZA1A 3PY2A 3DFNA 3C2OA 3HG5A 2HTMA 2H8XA 3I7RA 1VYPX 3CB8A 4NXKA 1K02A 1JCLA 1K8ZA 1XL9A 3RFAA 1OFAA 2GUUA 5KZMA 4X2RA 3W1AA 1ME7A 4PODA 4AAJA 1KM1A 3FKKA 3CLMA 3G22A 2ZTKA 4XWUA 1KFEA 3TAKA 3PSVA 3USBA 4R33A 3F1QA 3KRZA 1FCQA 2C3ZA 3FEMA 4PA8A 3PB2A 2QUVA 2PRHA 5EYWA 1OYAA 5C54A 3O63A 2NV1A 2DZSA 3UWZA 1OYBA 4GRSA 4EOUA 2A1YA 4LOCA 1FWSA 4M5PA 4H3DA 1TPUA 4MJZA 4QM1A 2W0UA 3R8RA 4IMDA 3W7PA 1W3IA 2Z0IA 5LZLA 3S8HA 3TU9A 1F76A 4ORIA 5CKSA 1SPQA 1LM1A 2QDHA 2V82A 3DFPA 3NQFA 1EWEA 4AHPA 4XBSA 3TNOA 3B05A 1TPEA 2ZZ5A 5BMXA 3LTSA 1JVNA 4PFMA 2TYSA 1ZHAA 3SY5A 1GVOA 4M7TA 3SZ8A 3PR2A 1QOQA 4N2YA 3M7WA 1OFQA 4DO5A 1DQXA 4UR7A 5LHFA 3W7RA 2B0MA 2C19A 3QW3A 1JJKA 1UASA 1SR9A 1P0NA 3JRKA 3NNTA 1J2WA 2X2GA 4DF2A 3PBWA 1EP2A 4A22A 2J9YA 3DGRA 4MKNA 2HSAA 2DJXA 4UTLA 2I14A 1RR2A 1ICPA 4Q32A 3ABOA 5J5DA 5G4WA 2FQIA 4YWIA 4LUIA 1FXPA 5D02A 3H55A 3UWUA 3ELFA 1KFJA 5AYZA 1PHQA 1VGAA 1WDWA 1TYGA 3W72A 5F1UA 3W07A 1LOQA 2ZFAA 4R34A 5I3KA 5I3GA 1QNVA 1EIXA 1H62A 1JRBA 1XUUA 3NZ1A 4AH7A 3OVRA 3UNDA 3ABQA 1KM0A 4I7WA 1SQ7A 1W31A 3LGEA 4MUZA 5D33A 2VFGA 4JY9A 2ALDA 1L6YA 3O06A 3NQAA 4DO6A 4OV4A 5FEXA 4JYFA 1KM5A 4K8EA 4QITA 5CG7A 2WO5A 4OE7A 4HNUA 4DXVA 4K7VA 5D09A 4S2BA 1FX6A 3G1DA 1A53A 3HPZA 2CU0A 1LBMA 3HQ1A 4Z1DA 1ZENA 2OCZA 4IX2A 5MHBA 1L9WA 1MEIA 2AQWA 1XDLA 1K7FA 2VFIA 4RLIA 3MW7A 1S3HA 3F4WA 4EIVA 4RV8A 4M19A 2GVJA 4O0KA 5E1QA 2TMDA 1QAPA 2ZZ6A 1GYLA 5AFDA 1NF7A 2OZ0A 5LNWA 3P5ZA 4N6EA 4PL1A 3QH2A 4O1AA 2YW3A 3TJLA 3PUDA 2Y63A 1OFPA 4YL2A 1GQNA 5D30A 3SI9A 5DCEA 3W7EA 2PRLA 3Q94A 3STEA 3V1PA 3IGUA 2G96A 4LV9A 3N2XA 4JEQA 4XUGA 1R2RA 1GTEA 3QRHA 4UCGA 2QAFA 1QPQA 4O8RA 1SU5A 3NQDA 3NXFA 2E6DA 4RCXA 4HPXA 3HPSA 5AC6A 3W22A 2YGYA 3W75A 1I4NA 2F7FA 2ZRVA 3WK3A 1LRNA 4O10A 1J5TA 4O52A 4O54A 3PWAA 1LROA 4Y9AA 3TFXA 3FS2A 3W7OA 4ZQPA 1TB3A 1OK4A 1DJNA 3NGJA 1TV8A 4FX6M 3LX9A 4ZMGA 4HIBA 3E49A 1YDVA 2Y85A 3L5AA 4OQVA 4MFDA 2E6AA 3M5VA 1UJPA 3CHVA 3CQ0A 4UIOA 5D2XA 4A3UA 3MHGA 2ZTJA 1H51A 2GJNA 3SIZA 2BLEA 3NVTA 5KZEA 5DCBA 1TPH1 3EX4A 3TQKA 1R2SA 1H63A 3O6YX 1XI3A 1VC4A 3TK7A 1XBXA 1M7PA 1OF8A 1A5SA 3NPVA 1DKWA 1M5WA 4WOZA 3LLFA 5AHFA 4LNYA 1XC4A 3HJZA 4A21A 3MHFA 5L9FA 4HN4A 1X7FA 1Q6RA 1H7OA 1W3NA 4UTTA 4JTLA 3W84A 4IJBA 4WJEA 2VC6A 4O1BA 3M9YA 3ZFHA 4DELA 1JCNA 1N8FA 3BG9A 3O6CA 3GLCA 4ORMA 3U6WA 1AL8A 5HR6A 2HS6A 2TRSA 3C56A 1H7XA 4JTGA 4PH6A 4MOZA 3N9RA 2EPHA 3DENA 2PRMA 4O57A 6TIMA 2GQ8A 4DQWA 3LHWA 5AHEA 3R2GA 1OYCA 3S5ZA 5E0KA 1F73A 1M6JA 4LVAA 1FWTA 3DHFA 2Z2UA 1NVMA 4K6AA 1MXSA 1UUMA 3FJ6A 4LVFA 4GBUA 5TIMA 3WK1A 3KVMA 3OIXA 2FPYA 2H3BA 4U28A 2ZQ0A 3G3DA 3TC6A 2JK2A 3T40A 4LRSA 4UTKA 1KFLA 1Z42A 2FJKA 3PM6A 4JDYA 4NXSA 4TMBA 1WBJA 4FNUA 1K03A 3UXDA 2YYTA 2ISWA 1BWLA 5F4SA 3S42A 3EX1A 2DZUA 5LNSA 5D2VA 5HWNA 1WV2A 1QOPA 4J9JA 1A5BA 3C0JA 4PEKA 2EF9A 1GOXA 3CM4A 4K36A 4N9EA 2XN1A 2XN2A 2R94A 1IXPA 3LI0A 4HNTA 2I9EA 1WX0A 5CPMA 1K8XA 1HFBA 1EEPA 1X1OA 3AO0A 4GUIA 5G2WA 2CLIA 4CCEA 1IF2A 4YXGA 2C14A 1QR7A 1Q6LA 1VHNA 4B5NA 3HGOA 1FDYA 3E02A 4FIQA 1OHLA 2E5BA 4JTFA 5A5WA 4QAIA 5LNRA 1XBVA 3LLDA 3PBVA 4I7VA 4ZQCA 3BW2A 3W7QA 1T8XA 2WOQA 4EF8A 5DY2A 4UMAA 2QJIA 3C3NA 2Z6JA 2A0NA 2JGYA 5F2GA 1LBFA 3DI1A 2O7QA 3W73A 3HB9A 3Q37A 1HO4A 1ZJIA 1I45A 1O5KA 1OFEA 5G1TA 8TIMA 1W54A 3NG3A 2H90A 1I2PA 2X1TA 2NV2A 1JQXA 3FOKA 2TPSA 4M6QA 1PE1A 2A6LA 3IIPA 5DXXA 5FESA 2CLMA 1KM2A 3EXTA 1AG1O 2QCEA 5HUOA 3FLUA 3CT7A 3CWNA 4H6KA 4BR1A 2AAMA 2E09A 4XKYB 4UXDA 2NZLA 1YXYA 1P0KA 2A6NA 2Y62A 3PSWA 4NJKA 2WQPA 3JR2A 1PIIA 1VHCA 1YXDA 1G67A 2C6QA 5G2IA 1KTBA 2C13A 3C8FA 4IQLA 3SW6A 3VE7A 3HG2A 2FPTA 2V2DA 5LHEA 3IVSA 3PULA 3C2EA 1W5PA 2BXVA 4PCFA 4XZ9A 2RFGA 2BWGA 1VZWA 1XKYA 3UPWA 3BLEA 3GX9A 1RQBA 3S1UA 4ALDA 1KTCA 3BLIA 3TW7A 5I3JA 1I8JA 1F74A 5DELA 4BI7A 4DF1A 4O4WA 4MYXA 4M7SA 4JTSA 1JCYA 3S1VA 3NQMA 3S5OA 1A50A 4ZL1A 2J24A 1XXXA 3W88A 5LKYA 2VEMA 3LBMA 5C2XA 4UMBA 2QF7A 3YPIA 3S1WA 3NA8A 4N4PA 5EBUA 2B7QA 3L5MA 3O07A 2DP3A 4UTUA 3NQEA 2ZBTA 1Q45A 3NL3A 3GKFA 3B0PA 5FF7A 4JYDA 3GDTA 4ZZ9A 1KV5A 4GFSA 4FXSA 5DLCA 1AK5A 1HG3A 1WA3A 4NNBA 2CZEA 4C1LA 3W9ZA 1DBTA 1OFRA 4H4IA 1I2NA 2BSLA 1ONRA 3BW4A 3MWAA 3G1SA 4MYAA 3B0VC 3G1AA 3MBDA 1KFKA 3TCEA 1FWWA 1SO3A 1TIMA 1FXQA 5CSRA 5EKYA 3LB0A 4N4QA 1YLVA 2R8WA 4YCPA 3DU0A 4Q4KA 5G2HA 1O95A 5BNKA 4KFOA 4UNLA 3HIJA 1YADA 1R47A 4ADTA 4Y8FA 2ZRYA 1LORA 5L6UA 2VXNA 1TV7A 3G1VA 1KW1A 2GOUA 3P82A 3G8RA 4O13A 1PS9A 3M41A 3LM7A 4IMEA 1XM3A 4YMZA 5K3VA 1YPIA 2NUWA 4KWVA 5DN1A 3W7MA 1XCFA 1YXCA 3C2RA 2VEPA 2WNZA 3IRDA 3IGSA 3SECA 1DORA 1ME8A 1IXNA 1SZEA 1AMKA 4OT7A 1B57A 3FIGA 4Z0JA 2A5HA 1DVJA 2RH9A 3STFA 2QUTA 3NDOA 2E77A 4M6VA 1DL3A 4E2DA 2V0TA 3FA5A 4LVBA 4L4LA 4JICA 3IIVA 5K4XA 4CLMA 3GR7A 5IM51 4UUIA 2GQAA 5F4WA 3KVKA 1FDJA 4ML9A 3SSJA 3UZ5A 3HO8A 1KFBA 4HHPA 3ZR4A 2A7NA 5LGZA 1KA9F 2A4AA 1OX4A 3KVLA 3LDVA 3NQ2A 4WOQA 4MY1A 1Q6QA 4PTNA 1NSJA 2DJLA 2C18A 4O1CA 3KFTA 3W74A 1L2UA 4Z08A 1TPFA 2FLIA 4LW7A 1GPWA 2QCFA 1VQTA 1AL7A 3W2KA 2E6YA 2A85A 2CLKA 4JTEA 5D2YA 4MY8A 3M1ZA 2A2IA 4N6FA 2E68A 5FF2A 5FF0A 5LNUA 3BG3A 3G8EA 1VPXA 4JDBA 3VKJA 4O14A 4TR9A 3QYQA 5EMUA 3ZWTA 4UFKA 3TR2A 2WKJA 4KKXA 3A22A 4BI5A 1WAUA 3M43A 5J5RA 1ZFJA 3NQ6A 3IEBA 3LCWA 1O60A 3SFKA 3U2OA 2QCMA 2YR1A 4S2CA 2Y7DA 1KBIA 1ADOA 3DFTA 1PCKA 4ZQMA 1SZFA 2CLOA 3LRMA 4LWWA 4O17A 3W2JA 1TV5A 3S9YA 1H7PA 2Y7FA 4ONVA 1KLZA 2C1HA 4NU7A 1XUZA 2V2CA 2NX1A 4FNQA 5D2TA 3B4UA 4FEZA 1OABA 3RLUA 5F4XA 4ZQOA 1G6CA 4JIPA 3G1FA 3B8DA 1V7YA 4FX7A 3TMLA 3G24A 5TBOA 3F4NA 4LV4A 3LOTA 4HT3A 2ZYFA 5HR7A 3STCA 1KBJA 3GR8A 4UMCA 5EL1A 1F2JA 5AOUA 4BF9A 1V5XA 3W7IA 2KZHA 1QO2A 1SZGA 1DHPA 1TPDA 4LTSA 2ZZ4A 5KSWA 4UFIA 3OHIA 2ISSA 1ZY9A 3BK0A 3RK8A 2Q3OA 2ZRUA 4MFEA 3G0UA 1CI1A 1K7EA 1M7OA 1PVNA 3RF9A 4C1KA 4NJHA 4LS1A 2NWSA 4LVGA 2ZDRA 1OX4B 3QQ1A 4Y96A 3GYEA 3IIOA 2ZRWA 3MP5A 1NF0A 4CCDA 1OFBA 1OF6A 3NOEA 4UTHA 3TMQA 4MLJA 4D2JA 3MYPA 2EGZA 3IIXA 1WOAA 1VR6A 5AHIA 3N2MA 4JIQA 5FEPA 4JY8A 3LXCA 5IBXA 1Z44A 3W6YA 4UFLA 1FCBA 1ZAJA 1JCXA 5HUPA 4GUFA 4GUJA 4IPIA 1THFD 1VLWA 4O53A 3E9AA 3Q2DA 1X6UA 4WUIA 3TW6A 1O5XA 2TSYA 4MPQA 2DORA 3NQVA 1IIHA 3HGRA 3N19B 4JTUA 4AF0B 2Y88A 4KFNA 4ZQRA 3C6CA 3P84A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W72A

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