2QUVA

Phosphate ions in fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
363
structure length
351
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Stereospecific proton transfer by a mobile catalyst in mammalian fructose-1,6-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 139
structure length 351
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2quvA00
2WQPA 2A7NA 3KX6A 2TRSA 4IMDA 1GZGA 1KTNA 2VEKA 1A5CA 4N9DA 3B0VC 2BX7A 3EKZA 3TKFA 5K4XA 1H1YA 4UTHA 1QO2A 1MXSA 5CPOA 2WNQA 1DQXA 3HIJA 4AXKA 3CT7A 1QPOA 3PUDA 3T44A 1EP2A 1H7NA 5D37A 2V5BA 2WV8A 3DAQA 3R8RA 1K8YA 1LP6A 4UC5A 3IIOA 3UWQA 3S1UA 4Q32A 1F73A 3FKKA 1VC4A 2JKEA 3WJYA 4GE8A 4QIUA 1OK4A 3M0ZA 5I3KA 4O18A 1U83A 4IMEA 3N9RA 1TTJA 5AC8A 4BWLA 5G1YA 1J2WA 1RQHA 3G24A 3C2OA 4K38A 1XL9A 1L6SA 1XUUA 1M5WA 2PC4A 2NUYA 1OYAA 5D38A 1PL9A 3U6WA 4WY0A 1UUOA 4N9EA 2Z6IA 1B4EA 2ZYFA 1GQNA 1IIHA 1VHCA 1AL7A 4TMCA 2ZRYA 1VJIA 2VFFA 4K8HA 2ATSA 3TMQA 1I2NA 3MI3A 5SWUA 3W71A 3ZS4A 4HKPA 4MFDA 4CCCA 4IGHA 2C15A 1KA9F 4HSOA 3G0UA 5MHBA 3F1QA 4YCPA 3O8AA 4UTIA 1IGSA 4D2JA 1KV8A 1L6WA 1XBXA 3LBCA 2JGYA 2A85A 5K9XA 4NX0A 2NLIA 4LUJA 1LOLA 4W9TA 3TE9A 1BWKA 1N7KA 3W7CA 3QRHA 3PG9A 1SO4A 1GG0A 3GXNA 4ALDA 5EA9A 1K02A 2NX9A 2NUXA 4GC4A 3NAVA 3W2KA 1OYBA 3ABQA 1A5SA 4RZ6A 2OT0A 4XUGA 2B7QA 1TB3A 4WXZA 3USBA 1X7FA 3UZJA 3VFLA 4JNMA 3W7MA 4Z1DA 2ZBTA 3PVFA 3QC3A 3UWYA 3UZ5A 1DOSA 4CQAA 4E38A 2A21A 2R94A 3P82A 1VYSX 4MY1A 2VFDA 3N34A 5AHFA 1TPFA 1UCWA 1R2TA 2ZZ4A 2NXGA 1B3OA 1Q6OA 1TRIA 2QUTA 3SZ8A 3HPZA 3WK2A 3RFAA 2A1YA 3FOKA 2QJGA 5D2WA 3NL3A 1K3UA 4DELA 5I3FA 4IXHA 3W86A 3TIMA 3TSDA 2O7QA 5HWNA 4O1CA 3CM4A 2XFWA 3TNOA 3HF3A 3WFAA 4OV4A 5LGZA 1DHPA 4WQ6A 5LNVA 3W1AA 5AHMA 3DENA 4CCDA 2HMCA 3Q58A 4O0KA 3W3OA 3IVTA 4K6AA 1IXNA 3O1NA 4MYAA 1SZFA 5CZTA 4GJ1A 2QCDB 2E5BA 1P4CA 1FBAA 1KV5A 1WBJA 1XFBA 5J5RA 5HUOA 3NQ7A 5HWMA 3W7HA 4JX6A 4UTWA 4UR7A 3D0CA 3A9IA 4XBKA 3LLFA 1OABA 1O5XA 3W7DA 2CLFA 1EP1A 2PE4A 4S1FA 4XTIA 4LT9A 2EGZA 1JJKA 4LVFA 1DJQA 1FWSA 2WPBA 2BLEA 3OBKA 1W5MA 4MLRA 5LNSA 4DEFA 3EWYA 4UMBA 4N6FA 5LZLA 2OT1A 2G96A 3P8IA 2ZTJA 3E96A 3SY5A 3TAKA 4UFIA 1EIXA 3NQCA 3B04A 1JQVA 5D03A 3LRKA 5DLCA 3STEA 3CIWA 3KXQA 2E68A 2Z0IA 3DKLA 3MHFA 3O63A 2ZFAA 1O95A 1T0OA 2GQ9A 3ATZA 1DBTA 4C1LA 4K36A 1VZWA 1S5TA 3CPRA 5TQLA 1JUKA 1O94A 4RCXA 1Z44A 4ICNA 3L5AA 5FESA 1Z48A 2J9YA 5BW6A 4JIQA 3OG3A 2H3DA 3QSTA 5D2YA 4IPJA 3MW7A 4PEKA 4ZL1A 2Y70A 4RZ4A 5KZMA 3QMSA 3GDKA 5CZ0A 5FF3A 1AW2A 4OV9A 3IGSA 2OZ0A 5E0KA 3H54A 3M5VA 1V7YA 4OE7A 4EIVA 3OVQA 1JVNA 1Q45A 3GDRA 2OX1A 4FX8A 5LHFA 1GTHA 4FF7A 4OU1A 4KWWA 1WBHA 4OBTA 2WO5A 3CHVA 3I6RA 3HB9A 3TQ0A 4JICA 1TYGA 3WK3A 5BOOA 3TJXA 3L66A 5U4NA 1YYAA 1AW5A 4O1AA 1W54A 1BKSA 3NXFA 1W1ZA 4JTFA 2V2CA 4K39A 3W1LA 1PCWA 1ALDA 3QQ1A 3L2IA 1ME9A 1J4EA 1VHNA 1G7UA 5DBTA 4Z1CA 2E5DA 2NV2A 3B03A 2F84A 3DU0A 4NT0A 3W84A 3GZ3A 4Y6GA 5CSRA 5K7JA 1X8FA 2H6RA 2VENA 4RX0A 4QM1A 3MBFA 2FB3A 1TPVA 3GKAA 4Z1AA 3HGOA 1E51A 5LKYA 3PC0A 2ZRUA 1Q3NA 3LOTA 1JULA 2YPIA 1FWTA 1NFBA 5ABTA 3VKJA 3IIPA 1Z42A 3KRSA 2GOUA 2QDHA 4FNTA 4XKYB 3H55A 4AHPA 2QCDA 4X22A 2VKZG 4FXRA 3W85A 5F2IA 2DZXA 3GK0A 5G2HA 4PC8A 1TREA 2E09A 3A21A 3M6YA 2R14A 1I2RA 2V30A 1EWDA 4IPIA 2Y89A 4Z08A 1EPXA 3NDOA 4ZMGA 2CZEA 5HR7A 1XCFA 4FX7A 4AWTA 1ICQA 2D73A 4UTJA 2I1OA 2CW6A 3MYOA 4NZJA 5CPNA 2VELA 4QAIA 4Z0JA 1BEUA 3W7LA 3C56A 4BWLC 1ZAJA 1ZALA 3B4UA 3INPA 3MYPA 1DV7A 1W5PA 3KRUA 4M7SA 1B57A 1GTEA 3W83A 2E6FA 5AHLA 2A0NA 3HMJG 1R46A 5D32A 4O12A 3TAOA 5CSSA 2PCQA 3WJXA 2RKXA 1TJPA 2RHGA 3PB0A 3EKLA 3BW2A 2CLKA 2I9EA 1PV8A 1XM3A 4PCFA 3NQ8A 2YFOA 3EEGA 1MEIA 3NVTA 2C16A 4NNBA 4CNOA 3O06A 2NUWA 3G1SA 5HMSA 5J5DA 1OFRA 1EX5A 1W3IA 3IVSA 4JTUA 1CW2A 1VCVA 4TX9A 3C52A 4NUWA 4QISA 1PS9A 3MHGA 3W7RA 5EYWA 3TXZA 1GVRA 2VFGA 1H61A 4NU7A 3BGGA 3M5XA 3IV3A 2J6XA 5K9DA 3ABSA 5DY2A 1G7VA 4NJHA 3W72A 2ZQ0A 2DU2A 5TBOA 1OFPA 1D3HA 3SR7A 3PBUA 2H90A 4O57A 3ZFHA 1YXYA 3EX2A 1TV5A 5CZJA 2PRMA 3P80A 4QQ3A 4FNPA 1QCWA 1TPC1 2QAFA 1TPWA 3C61A 2O7SA 4S2CA 2I14A 5T26A 1H50A 1ZENA 3L5LA 1ZCOA 3O07A 3L0NA 4R33A 4QSHA 4LNYA 2WOQA 4ZQNA 4X2RA 5G2WA 5F4WA 3GR7A 3CU2A 1QOQA 4I7UA 2QR6A 2FJKA 4UFHA 3W7GA 5EPDA 1EA0A 3LRLA 3RU6A 2AAMA 1A5BA 4ZQOA 4UR8A 1RR2A 4NJIA 2QKFA 1TMHA 4FNRA 1TTPA 2BTMA 5IM51 3C3NA 4O1BA 4XKYA 1HFBA 3W7OA 4BFAA 1FX6A 1YXCA 3TW7A 4JGDA 1G4EA 4KFOA 4E2BA 4MYXA 3QW3A 1EEPA 5LHEA 1L2UA 1ADOA 1OFAA 3C2RA 4MJMA 3M47A 3FJLA 5AC7A 1FWWA 1YPIA 3LTPA 3NQAA 4MKNA 1LROA 1YDNA 4JDYA 4JTKA 4UTWC 1FWRA 2ZA3A 2ABAA 5KZEA 1C9DA 2G5WA 3BG3A 3GR8A 3WK0A 1SPQA 3IIVA 1WV2A 3TFXA 3G3MA 3KVJA 1OG0A 1LRNA 4AF0B 1IXOA 2B4GA 3WK1A 4O50A 4GUIA 1JRCA 5K4ZA 1W8SA 1NF0A 1H5YA 2BSLA 3P7YA 3DGRA 1M7PA 4WOQA 3HGRA 2QAPA 2H8ZA 3LCHA 5G4WA 4M7TA 4JEQA 3W1PA 1TPUA 3UNDA 1GVSA 2CZFA 1H7XA 4UFJA 3HQ1A 3V75A 3TFCA 1TIMA 3A24A 4JX5A 3WJSA 3L0GA 2Y88A 1PHWA 2GVLA 1FDJA 3JS3A 3W87A 3A5VA 4TU1A 4GUGA 3L68A 3NQ6A 2FIQA 4IXXA 3S5YA 3R2GA 3GLCA 3SECA 3G1XA 1AK5A 3BLIA 2GPTA 3LB0A 2ISSA 2ZZ3A 3W6YA 1EWEA 1F2JA 3LRMA 2ABBA 4IMCA 4K7VA 3W1QA 4A3UA 5G5IA 3ZWTA 1HUVA 3P5YA 4BK9A 1KLZA 1ONRA 3CQ0A 4FO4A 4LU0A 5DCDA 1GYNA 3QJAA 2QDGA 4EOUA 5AYYA 3I7SA 4DF2A 2DP3A 3DI1A 1P0KA 4ML9A 1I8JA 3QF0A 5D09A 3S1WA 4HN4A 5EL1A 1G67A 6ALDA 1KM0A 1GEQA 2EAWA 5AHIA 4RKAA 3S5OA 2ZRVA 1G4TA 4ZQCA 3UQNA 3BO9A 1KM4A 1R2RA 1RQBA 3QM3A 1MEWA 4AMAA 4NZFA 2QCLA 5FI8A 2CLOA 3N9SA 3BLEA 3PBVA 3GDLA 4N02A 3SI9A 3HG4A 1UJPA 5F2MA 3NQMA 4NNAA 1LTDA 3W1TA 3LHZA 3C2EA 3W07A 4EWND 3OVRA 1SR9A 4UCGA 1KM3A 3EB2A 4QNWA 4M6VA 3M41A 4XBSA 2HS6A 5D2VA 1SFLA 2YW3A 5EBUA 4DXVA 2NX1A 3STGA 3HPXA 3IIXA 3PULA 1H60A 4BR1A 3I68A 1ZAHA 1UASA 1DL3A 5LNWA 3E0IA 3L65A 4AF0A 3L5MA 5DBUA 1R47A 3QSRA 3SJ3A 3FLUA 3IIZA 1AG1O 1K7EA 4TIMA 1QNVA 1W5OA 3ABRA 2WKJA 5E93A 3O05A 4NXKA 1LRTA 2E5CA 4JYFA 4DF0A 1ZY9A 5HUPA 2VFHA 2ZRXA 3TROA 1HTIA 3MJYA 3TA6A 3W1RA 3M16A 2VEPA 3NQDA 2ZZ6A 3W2NA 5KSWA 3RF9A 3BW3A 4FNUA 1XBYA 1Q6RA 5TIMA 1NVMA 4TR9A 4RV8A 4N2YA 4LVDA 3HO8A 2Y7EA 3WJZA 3C2VA 2VOMA 1OX4A 2DZVA 1ZFJA 2A5HA 4DBEA 3A22A 4AH7A 2TSYA 4P61A 2C18A 1TTQA 3DBPA 4MY9A 4A21A 2WSYA 5F1UA 3KOFA 4AHQA 3GIYA 5BNKA 2EF9A 2OMAA 2ZRZA 3UD6A 1OJXA 5BRBA 1ME8A 1PCKA 4H3DA 4GFSA 1FCVA 3RK8A 2WSQA 4CCEA 8TIMA 4M6QA 1FXQA 3I7RA 1G69A 2NZLA 4AHOA 4ADUA 4ADTA 4JD4A 3EX3A 3S6DA 1SZGA 4GRSA 2YXGA 1M6JA 1KLYA 1PHQA 3HJZA 2XN0A 3NPUA 2QCFA 3W1XA 3DHDA 4UTTA 1KBIA 3IRDA 1ML1A 1N8FA 2R8WA 1W56A 2RDTA 2H8XA 4WXYA 5K3VA 4HIBA 1TCDA 2BZNA 1FQ0A 3PBWA 3E49A 2QJIA 2NXIA 1JCMP 2RDWA 1WOBA 4JN6A 1MSSA 1A53A 4JTEA 4WY0F 3NM3A 4PL2A 1X1OA 3L21A 3AJXA 2YZRA 5FEZA 3T7VA 4FNQA 1YLVA 4YLWA 4UTUA 1W3TA 3S1XA 1SSGA 1PVNA 2DJXA 4OT7A 3O15A 4DPQA 3FYPA 1Q6LA 1P5BA 2FB2A 1TQJA 3HGJA 1P1XA 3NL6A 4NQ1A 5AN7A 3UXDA 3CB8A 4LUIA 4LOCA 4UFKA 3F4NA 5C54A 5DXYA 1IXPA 3KAOA 2PRHA 3LV5A 2V8ZA 4OWGA 4JR5A 3M43A 3LDVA 1K8ZA 2Z1BA 4POCA 6TIMA 3DKJA 3W73A 2C13A 3LCGA 3TSBA 3ANYA 3UWUA 4IUOA 4CNPA 4L4MA 2GUUA 3R5EA 4PODA 2Y62A 1F76A 4JS3A 4GWEA 5L6UA 1IIGA 3DFNA 1YTDA 3TR2A 2QCGA 3P5ZA 1OK6A 1RD5A 4ZQRA 4UMAA 3W23A 3W7NA 1H7RA 1LLWA 3S42A 3IVUA 1VYPX 1VLWA 4O17A 2CZDA 3C8FA 3QYQA 2E6DA 1UUMA 3GDTA 1OYCA 3BVJA 3FIGA 3W1NA 1I4NA 2DZTA 3EWXA 3GXPA 3PBYA 1O5KA 3W7EA 4JTIA 4C1KA 1EP3A 2ZZ1A 1MO0A 2J9ZA 3KVLA 3LXCA 3NQVA 3P62A 4K8EA 1MZHA 1W5QA 4YMZA 1KM2A 1L6YA 3N2XA 2NWSA 2V5LA 5DN1A 1XKYA 2G95A 5KTLA 3GAKA 3B06A 3DFTA 1SZNA 3THQA 3JRKA 3SGUA 2NXHA 1NF7A 1S3HA 4UNLA 2X1TA 4AEOA 4CLMA 2J24A 4XZ9A 3M1ZA 3NM1A 3EWUA 4UNKA 3TMLA 1P0NA 1A5AA 3CC1A 1T8XA 3FKRA 3W9ZA 1SO5A 1VR6A 3G22A 1GYLA 2F7FA 3NQEA 4RLIA 3LTSA 1BWLA 2J9XA 4B5NA 2HTMA 1YTEA 3N73A 1KM5A 3UY7A 3W1UA 2A7RA 1KM6A 4JTJA 5BMWA 5D2XA 3NOEA 1ZHAA 3TH6A 1XDMA 3DXIA 1QO5A 1X1ZA 1OVDA 3DFQA 1IF2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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