4GUF | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	260
structure length	252
Chain Sequence	ENLYFQSNAMKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKAGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVISVADLRTVLTILHQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	3-dehydroquinate dehydratase
publication title	Reassessing the type I dehydroquinate dehydratase catalytic triad: Kinetic and structural studies of Glu86 mutants. pubmed doi rcsb
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	93
structure length	252
sequence length	260
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date	2012-08-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01487	DHquinase_I	Type I 3-dehydroquinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4gufA00

3P60A 1QPRA 4O17A 3QMRA 5CSRA 3P74A 4O50A 4WUIA 4Y6GA 3N19B 3IVTA 4LOCA 1PE1A 4FNQA 1KTBA 4UTTA 3S6DA 5FEZA 1GG0A 3NVTA 4NNAA 1AK5A 1Q45A 3W7HA 4Z1CA 2DJXA 5HQEA 1JUBA 4GUJA 5LGXA 1KW1A 2GJNA 1GZGA 2C19A 2R94A 1EWDA 2OZ0A 3UWQA 4LRSA 4UFIA 5I3IA 1XXXA 3FS2A 2XN1A 5AHLA 1M6JA 1J5TA 1A5BA 2DZXA 3B8DA 3B05A 2NV2A 3NPVA 4JNMA 2FLIA 3HPSA 1DL3A 3NQ2A 4YL2A 5DELA 3E49A 4Z08A 4WY0F 4CCDA 4GJ1A 3QRHA 2VEKA 4LVBA 3TCEA 3W74A 3W2JA 1LORA 3GAYA 3M16A 3R12A 3M7WA 5AHMA 3L9CA 4JR5A 4MY8A 3KRZA 1HG3A 2QCDB 2Y85A 4TX9A 2BWGA 5AYYA 3FEMA 1EUNA 4FNRA 4CNOA 2I14A 3H53A 5K9DA 1Q3NA 1T99A 1H63A 2W6RA 2YDAA 1ZNNA 2TPSA 2ISVA 4O52A 3ZR4A 4XQ6A 2QCFA 3MP3A 3RLVA 3TUUA 1VC4A 3G1YA 1ZY9A 2XN2A 4JICA 1I8JA 2F84A 1XFBA 1TPFA 2FIQA 3GDRA 2PC4A 1TIMA 2VXNA 3W72A 5D09A 1SO6A 2ZRWA 2QCGA 3FA5A 4X3ZA 2NUXA 1GVRA 3UPBA 4BI7A 4O28A 2YR1A 5F2MA 3W83A 1NAL1 4KFNA 2ZZ3A 1LRQA 4P61A 1QMLA 4UTIA 1XBYA 2E6YA 1OFQA 5G4WA 4FNSA 1R2SA 3QW4B 1DQXA 1GTEA 4LWWA 1X1ZA 2QR6A 2ZZ6A 5FF7A 2E6FA 1OABA 4BWLC 1ML1A 1GT8A 1P0NA 3MWAA 4DO5A 1FY6A 3VE9A 4IMEA 1YPIA 3PBUA 1LBLA 4PH6A 1VHCA 4NU7A 3NDOA 2YSWA 2QCLA 3NM1A 1UBSA 1AG1O 1G6CA 2H90A 2I1OA 3R89A 1JQVA 1OFDA 3G0SA 3W1PA 4YLWA 3PSWA 4IX2A 4RK8A 2A1YA 1W5NA 3TMLA 1OFBA 3WJYA 2NZLA 3P61A 2YX0A 3NZ1A 3A22A 3RF9A 3E0IA 1I2OA 1S3HA 5K2ZA 1G7UA 4ADTA 4JX4A 4RZ6A 3GKAA 3W07A 2W0UA 3EWBX 2C3ZA 5D33A 3B4UA 3N9RA 5EL1A 3LRMA 3KVMA 4HKPA 3V1PA 4X9SA 1F5ZA 3L65A 4EIVA 3WJSA 2JGQA 3NYZA 4JYDA 3IGSA 3W1AA 4O1CA 5HWJA 1KBJA 3BO9A 2ZRZA 4POCA 1W5QA 2CZDA 4HT3A 5I3GA 1YLVA 2ZRUA 3WK1A 3CWOX 2H6RA 3L0NA 4Q33A 4FNUA 1KFBA 4KFPA 1SZEA 3M41A 3DXIA 4DF1A 5F4WA 4MJZA 1LCOA 3W7MA 1SUXA 1VPXA 4Z1DA 2HS6A 4N6EA 4JX5A 1PCKA 3SY5A 1ME7A 4Q32A 3EB2A 1ZAIA 2VENA 3W76A 3LRKA 3G0UA 3R13A 3DFPA 3LRLA 3PB2A 1XCFA 3W9ZA 5CGQA 2V9DA 3W1LA 2Q3RA 3RK8A 5I3JA 3P67A 5F2IA 5LNUA 3STCA 2BTMA 5DBUA 1H5YA 3AJXA 1AW1A 4A3UA 4B5NA 1VS1A 5IBXC 1G4EA 1G7VA 5DY2A 2GQ9A 1SU5A 3P5ZA 1TPWA 3W86A 4A21A 1JCXA 4K8EA 5D2YA 3W22A 3QSTA 5D03A 3OVRA 3GDMA 1GQNA 1SZGA 3I6RA 3UXDA 5SWUA 5BMWA 2OCZA 1JUEA 4ORMA 4RJEA 2NV1A 5F1UA 4QQ3A 2QCHA 3O6DA 5E93A 3LERA 4UUIA 1I4NA 5D2XA 3W7LA 1S5TA 2QEZA 2ZZ2A 1H7OA 2E6DA 1SW0A 5GVJA 1LOQA 5I3FA 3Q2DA 3RNDA 2FB3A 1G67A 4L4MA 4LC8A 3IGUA 5D38A 3MUXA 3NR0A 1KM0A 3TFCA 2FJKA 5LHFA 4IMFA 1QPNA 4GRSA 3QPYA 5IM51 3DHFA 3UYCA 5EYWA 3W7KA 4IWWA 4QAIA 4O19A 2VELA 3EEGA 3BGGA 5CPLA 3G1HA 1QO5A 3W7PA 3QC3A 4UTTC 4UXDA 5HMSA 4FEZA 1K8ZA 5KSWA 3PM6A 2V0TA 3TSBA 4AEOA 1HO1A 1VCGA 2OJPA 4FXRA 3QMSA 4JIQA 4JTIA 2ZYFA 3YPIA 3CIXA 3LTYA 1GWJA 2I9EA 2J9YA 4AMAA 2CU0A 4N4PA 4TIMA 5E0KA 2JKAA 1W31A 3CIWA 1WQ5A 4BF9A 1WX0A 2J9ZA 3LCFA 3TFXA 2V8ZA 3STGA 2CZ5A 2DZSA 4JTSA 5G2WA 1THFD 3IVSA 1S5VA 1PV8A 1H1ZA 4NT0A 1TRDA 1QOPA 2V82A 3G8EA 1GVQA 4MPQA 4UTHA 2OMAA 5AHNA 4UMCA 1JCLA 1GYNA 4HSOA 4IGHA 1JULA 4LW7A 4LUIA 4IOTA 3BW2A 2WKJA 3CWNA 5DN1A 3E12A 1W5PA 2GVGA 3PY2A 2JKPA 1ZJIA 1HTIA 4M5PA 1RVGA 3G3DA 4UFLA 2QJHA 3U8GA 4MLRA 3G1SA 4M6VA 5J5RA 1QDSA 3W7GA 4GUGA 3TE9A 4ML9A 2NUWA 3EXRA 4GBUA 3S5OA 1AW2A 2VFDA 1LRNA 1M7OA 2DZPA 3EXTA 3IIOA 2C13A 3LB0A 1EB3A 1KTNA 4X2RA 3HGSA 3SZ8A 1XBZA 3W7QA 3QSRA 2EHHA 1DOSA 4MYAA 3OIXA 3NGJA 3UWYA 4IX0A 4RR4A 1KFLA 2NWRA 4XWUA 1CW2A 2G95A 4CQ9A 4M6PA 1TPUA 4O1AA 1VYPX 3BLFA 3M43A 3MYPA 5HINA 1F73A 3I65A 2ATMA 3N34A 3SJ3A 4IMCA 2ZTKA 1Q6RA 5KZEA 3HB9A 4UTKA 3QW3A 5FF0A 3PBYA 4QJ1A 1LM1A 4MLJA 3IIZA 1QCWA 2O7SA 1YADA 2YYTA 3TIMA 3H55A 2TRSA 4ADUA 3PWAA 3WK0A 4UFHA 1F2JA 4YCPA 2CZFA 3O8AA 1SPQA 2Z1BA 2AAMA 4U28A 1A53A 3QFEA 1WYIA 3L67A 1IXPA 2VEIA 4JTEA 2BLEA 4RXFA 5EY5A 3NL3A 1SSDA 4NUWA 3W1XA 2E68A 4JTJA 4O53A 3E9AA 2A7RA 2NLIA 1VYSX 1XBVA 4NJGA 2DZUA 1JJKA 2QJGA 1UJPA 1D3GA 3GXNA 2QCEA 4PC8A 3LV5A 3USBA 4DO6A 1W3NA 5J5DA 1K02A 3G22A 5LSMA 4A2RA 2YW3A 1K8YA 3JR2A 3KVLA 3NNTA 3LCHA 4C1LA 4CLMA 4O16A 2C16A 5AHIA 3QEZA 4O10A 3MYOA 4NXKA 1KA9F 4RXGA 1ZAHA 2H8XA 4PL2A 2BXVA 3NZRA 1FCVA 3EX4A 2YYUA 2B7OA 1HFBA 2ISSA 2VFEA 5CZJA 1IIHA 5D2TA 1CX9A 3IEBA 3PUOA 1W56A 3IRDA 1XI3A 1YXCA 3GXPA 4JY8A 3RU6A 4NJIA 3U2OA 4Z0SA 5HWMA 3FJ6A 1L6WA 1OVDA 2YW4A 3QQ0A 5BRBA 2Z6IA 3FOKA 2WNNA 3NEVA 3VCRA 2B7NA 1VR6A 3T55A 1TTQA 4DPPA 1VCFA 2QAFA 2WO5A 1FDYA 2J9XA 1LLZA 1KFEA 4K8HA 5F2LA 3A5VA 4PA8A 4AHOA 5CZ0A 3F1QA 1VRDA 2YPIA 5AB3A 2ZRXA 1FCQA 1SSGA 2E5DA 3DHDA 3W75A 3UWVA 4DEFA 3TH6A 4PEKA 4IXHA 4IJBA 3G1FA 3DFOA 4KWWA 1TV8A 2HSAA 5D02A 1H7PA 3DKLA 4MZ8A 3OVQA 3P5YA 1XDMA 3INPA 3NQ8A 3W88A 2JBMA 3IIXA 4AXKA 1OYBA 2H3BA 4UTWC 1TPEA 3VE7A 3IIPA 1LTDA 4DO4A 2YFOA 3I7RA 5KITA 1FUYA 3ABSA 3OA3A 1NSJA 3UNDA 2YCEA 4ZQRA 2V5LA 3NAVA 1SO5A 3PUEA 3UZJA 1MSSA 1TSIA 3QYQA 1DJNA 2VFIA 2ZZ1A 2Q8ZA 3TSMA 3TSDA 1FDJA 1FWRA 1YXYA 2BZNA 5LZLA 1OF8A 1SO4A 3W7CA 4GFSA 4K39A 1GOXA 4LUJA 5LNVA 1XBXA 1TPC1 3FKKA 3HMJG 3LI0A 1RQBA 1A50A 3G1VA 1VH7A 1DJQA 1O4UA 6TIMA 1ZENA 3QM3A 3LTPA 3MI2A 3LXCA 4PFMA 2GUUA 3S5YA 2FPTA 5HUOA 3W7DA 1OK4A 2Z6JA 1OX4A 3M5ZA 1DBTA 1ZAJA 3O63A 3GLCA 2A0NA 3FYOA 3W2MA 4UMBA 2WQPA 2WPBA 4IMGA 2DZWA 1JUKA 4QSHA 2C0AA 5DY3A 3W87A 1JRBA 3ABQA 3KAOA 4ZQMA 3RMJA 1VYRA 2WV8A 1OJXA 3TW6A 3RFAA 2A2IA 3W1UA 1SQ7A 1OHLA 1EP2A 4XTDA 4XUGA 1KFCA 4Y96A 2R8WA 3EX2A 1JRCA 3UZ5A 3UY7A 1O5XA 5TIMA 2QUTA 2QCCA 2R91A 2WSYA 3TA6A 1RD5A 3EWZA 4NZFA 4YMZA 4YCOA 1GG1A 2WOQA 3L21A 3TROA 4JTHA 5KMYA 4KKXA 1LDCA 3N3MA 3P8IA 2OX1A 3B0VC 3P81A 3ZWSA 1DKWA 1DVJA 1F7BA 3LXBA 3GDLA 4O0ZA 3W3OA 1OFRA 4I9AA 4Q4KA 1Q6OA 2DZVA 5CPMA 5D05A 3OVPA 4LRTA 1PIIA 1I45A 4NJHA 3CHVA 3N2MA 1YTEA 2NX9A 3L5MA 4UTMA 5I3KA 1Z42A 3G0XA 3LGEA 3WJXA 5CZTA 1WOAA 4IXXA 4OV4A 3WK3A 3WFAA 1L2UA 2GJLA 3NQAA 3THAA 5K3VA 1T96A 3UWWA 5EMUA 4M19A 1YPFA 2ZDRA 3O1NA 4Y9AA 4OBTA 3S42A 2G5WA 3NL5A 4XKYB 3EWXA 3B04A 2ZFAA 3A21A 4NNCA 4JTTA 5LNSA 4JXCA 1R2TA 3F03K 4L4LA 5G1YA 1VGAA 3BLIA 3M44A 3C4UA 2CFFA 1ME9A 1L6SA 2E1DA 1ADOA 3G1XA 3DI0A 4ZQOA 1RPXA 2JGYA 1I2QA 2Z0IA 4JGDA 4PL1A 4OV9A 1D9EA 5G5IA 3GR8A 3C3NA 1OYCA 4O0KA 3I7SA 1T0OA 5D32A 3HGRA 3LX9A 3W7OA 1SZFA 5AYZA 5T26A 3LHUA 3W73A 3KRUA 2DP3A 1U83A 3NQGA 3LM7A 1KBIA 1Y0EA 4UNKA 3CEPA 3N73A 1W54A 3A9IA 4UCGA 4NXSA 3DH7A 1N8FA 2FTPA 4PCFA 4LVAA 1B9BA 1QOQA 2JK2A 2A4AA 1UCWA 4H4IA 4QM1A 4ADSA 3G8RA 1G4PA 5D37A 4C1KA 1PL9A 1MEIA 3LI1A 3R8RA 5L6UA 4R53A 1C29A 1QO2A 2RKXA 4E2DA 3S1WA 5HJLA 4IPIA 2RHGA 4ICNA 3SGUA 1KV5A 2E5CA 3TQVA 2A5HA 1F76A 4TU1A 4AHPA 3T44A 3W71A 1ME8A 2QCMA 2Q8LA 1XKYA 2O7QA 4EWND 4H6KA 3KHJA 3FJLA 2P10A 1LP6A 1UASA 3QMTA 4O11A 3O05A 3W23A 5FESA 3N9SA 1P5BA 3JS3A 2TMDA 3GX9A 2ZA2A 4GXMA 4JDBA 2OT1A 1FCBA 1W0MA 2AGKA 1SFJA 4AAJA 4GNJA 4FX7A 1LRTA 3PS7A 1EA0A 3A23A 3O6YX 4FNPA 4DQWA 3I7QA 1X6UA 5TQLA 1TPDA 3PG9A 1ICPA 1JCNA 3BPWA 3BW4A 3LHTA 3LHZA 5BOOA 4JTGA 4ZVJA 1WBJA 1XM3A 3DENA 4X22A 4K38A 3KRSA 3TMQA 2NX3A 1O95A 1OFAA 1JCMP 2RDWA 3W7EA 4FF7A 3DZ1A 4WZHA 1QPQA 3O07A 2E6AA 4OGZA 2J24A 3SSJA 3ABOA 3NO5A 2V2CA 1Z48A 3W1QA 4MOZA 3TJXA 4NVTA 5BW6A 3C6CA 4K6AA 1N7KA 3LCLA 1GVSA 4TR9A 1FDZA 1VZWA 3H54A 4RZ5A 2P0OA 4FO4A 4K36A 4NZJA 3CPRA 4RLIA 3SW6A 3QQ1A 2NUYA 3NL2A 1KTCA 4LTSA 5DXXA 2Y88A 3AO0A 1LBFA 3ANYA 2Y61A 4JD4A 4CNNA 1TMHA 3MHGA 1LROA 1FX6A 4JTFA 2GOUA 1ZCOA 1RZMA 1KM3A 3EX1A 1PS9A 1BKSA 4CCCA 4MVAA 3TC6A 3NQCA 4UR7A 4G1KA 1SW7A 2H3DA 5CSSA 1VCVA 3G1DA 2YGYA 3BG3A 1W5OA 5CZSA 1LLWA 3O6CA 3C52A 2BSLA 3DKJA 3GDTA 5AHEA 1DHPA 4JX6A 6ALDA 3DAQA 3NPXA 1U5JA 4BI5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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