4MYXA

Crystal structure of the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase, with a internal deletion of cbs domain from bacillus anthracis str. ame complexed with p32
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
363
structure length
351
Chain Sequence
SNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHPHHVQITKEAPNYSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase, with a Internal Deletion of CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ame complexed with P32
rcsb
source organism Bacillus anthracis
total genus 102
structure length 351
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4myxA00
3QEZA 4LS1A 1YDVA 5EYWA 1B4KA 3G8RA 3UWYA 1QPNA 4PL2A 2HTMA 4O14A 3E49A 4LRTA 2QCEA 3KVKA 3N2XA 3VI2A 4I7UA 3IGUA 2ISVA 4HNTA 3MMTA 3UZJA 5CPLA 4LV4A 2Q3RA 4IXHA 3M5XA 4LW7A 1KTNA 5FESA 4WX2A 1GVSA 2YZRA 4Z1CA 1LRQA 3MYOA 4WZHA 5LNVA 1PCWA 3EXTA 3LTYA 3P84A 4FX8A 4Y8FA 3MWAA 4IGHA 1KA9F 3CU2A 4GNJA 4M7TA 1KBIA 3DFNA 4DF2A 3KXQA 3C2EA 3F1QA 1NAL1 5T26A 3CWNA 3LX9A 4UFJA 3I65A 1W31A 1J5TA 3NG3A 5DLCA 1DHPA 4RR4A 4UIOA 1XDMA 3U2OA 3WK3A 1VYRA 3H54A 3O8AA 5EPDA 3R13A 4ZL1A 5SWUA 5F4XA 3L0GA 1P1XA 1QNVA 3SZ8A 2ZA3A 2H3BA 1Z42A 4ZZ9A 3LBMA 1GT8A 3CIWA 3QH2A 3G24A 1WYIA 2R94A 2VEIA 3NXFA 3NL2A 5D2TA 5DY3A 4FNRA 3Q37A 3NOEA 3E12A 5F2LA 2DZVA 3W1MA 3EX4A 3ATZA 1KLZA 3NO5A 3PG8A 3S6DA 1WBJA 5DCDA 1RQEA 4IMDA 1PV8A 1QO5A 3KVMA 3RFAA 3W07A 4CNOA 1SPQA 2ZFAA 3L65A 3HBLA 3UXAA 3HO8A 5FEPA 2G97A 1VPXA 3GNNA 5CSRA 2X1SA 3EXRA 4Z1BA 3QFEA 4WD0A 1AG1O 3NZRA 3S1XA 2P10A 3T7VA 4UMBA 1VH7A 3EWYA 3RNDA 2F7FA 2ZRYA 1O60A 5K3VA 1O94A 1BWLA 2E6DA 2TYSA 1TJPA 4RZ6A 1YDOA 1I8JA 5HR7A 3LHWA 4NJGA 3S1UA 2ALDA 2NX3A 5ABTA 3UY8A 4DXVA 2BWGA 4MZ8A 3TQKA 3R2GA 3DFSA 4FXRA 5G4EA 3L66A 4R34A 3F03K 4MZYA 3WJYA 4JNMA 3O6CA 1WOAA 1DV7A 5D38A 3IGXA 5A8GA 1RZMA 3R8RA 2OJPA 3VNDA 2CLMA 4K8HA 3A23A 4PCFA 4UCGA 1Q45A 2Z6IA 3OVQA 3O6DA 4KWWA 3PUEA 3W3OA 2YR1A 3BLIA 1I2QA 4GE8A 1KM3A 2QCDA 2V9DA 2A5HA 1LOSA 1WOBA 3C52A 3TJLA 3ZS4A 1G69A 4O8RA 2Y85A 3BW3A 1DKWA 3W7NA 1WDWA 1P4CA 1EP2A 3KOFA 4XWUA 3W88A 3TFCA 3EX6A 3IVUA 3CPRA 3UXDA 1B4EA 2V81A 1UB3A 4BI7A 1FCUA 3NL3A 3W87A 1EB3A 4MFDA 4AAJA 2CFFA 4MZ1A 1MZHA 4JR5A 1KM2A 3PB0A 5J5DA 1TPEA 1R2TA 2WNNA 3LCIA 2YPIA 3UD6A 1DL3A 2XN2A 3EEGA 3A9IA 4DEFA 2VFIA 3P80A 2QJGA 4A2SA 2Y88A 3TDFA 3B04A 5DCEA 1XFBA 2NUWA 3STEA 3C56A 1PS9A 2A7PA 4CNNA 5HUOA 1FXQA 5K7JA 3N3MA 2FTPA 2Y7EA 4UFLA 5CZSA 2GVLA 5HNRA 4PFMA 3USBA 4HNNA 1SW3A 5U4NA 3GLCA 1HUVA 3GB6A 1W56A 5EMUA 3DFPA 1JRBA 4IPIA 3BARA 3LBCA 4IPJA 3N9SA 3SIZA 4X22A 1Z44A 3B05A 3E0IA 1W5MA 3NQ8A 5F4SA 1GVFA 2G96A 3RLUA 3TAKA 4B5NA 3W9ZA 5D09A 3GKFA 3P81A 4IJBA 3TW7A 1F74A 3TSBA 2B7QA 3NEVA 3BLFA 3HIJA 4N2YA 3H53A 1GQNA 3B4UA 1IGSA 3PULA 3TMQA 3CIXA 5KZEA 4IUOA 1JCXA 3NZ1A 1L2UA 3W2UA 4QJ1A 1DJQA 2RDUA 2G95A 4HT3A 3S5OA 4N9DA 1KTCA 3HPXA 2E77A 2FDSA 2TSYA 1FWSA 3SGUA 1QR7A 2V30A 3WJZA 2V5LA 1J4EA 1XM3A 1DVJA 2A21A 3H55A 1Q3NA 6TIMA 2DJXA 3NAVA 2QDHA 2WV8A 4OQVA 4AB4A 2NV2A 1A53A 1XC4A 4RK8A 2DZWA 5HULA 3ZWTA 3OG3A 4UXDA 2ZQ0A 3C4UA 4LUIA 2X16A 1GJPA 2C13A 1XCFA 3GDTA 1RQHA 4H4IA 1G67A 2CU0A 1G7UA 3NQ6A 4JX6A 1ADOA 1PIIA 4YWIA 4IXXA 2A6NA 2FPTA 3BV4A 3C2RA 2E6FA 1SO3A 4M6VA 2DZSA 1Z48A 2P0OA 1FDJA 1LBFA 4AHQA 3LCLA 4JTFA 4AMAA 3QMTA 1YTDA 1GWJA 3T4CA 1ALDA 4NU7A 3HG2A 4L4LA 4TU1A 5I3KA 1ZY9A 3DKLA 4Z1DA 2QCGA 4A22A 1XKYA 3P60A 5DBTA 5E0KA 2Z1BA 4KFOA 3TC7A 1JRCA 1M6JA 2A7NA 3W2NA 1EX5A 3FEMA 1SO6A 1AW5A 3UWUA 3R89A 2RHGA 3TR2A 4WY0B 4O1BA 4BFAA 3R12A 3BW2A 3TAOA 1ONRA 1F6KA 1D3HA 3ZFHA 3M0ZA 4JTLA 4JTGA 1R2RA 4Y9AA 5A5WA 3GDKA 3W1UA 3B8DA 3NR0A 3W1PA 1GOXA 1JUEA 1O5XA 4JTSA 4AHPA 2CLHA 1L6SA 2XFWA 4AVFA 1G4SA 4BI6A 5K4ZA 3CTLA 5LGXA 1VQTA 4O1DA 1A50A 4NXKA 3G3DA 3G1DA 3W23A 3W7QA 1T8XA 3MO7A 4UTLA 1ZALA 4UTWA 1THFD 4MY8A 2FLIA 2ATSA 1KM0A 1LBLA 1FY6A 1I2PA 2QUTA 3TE9A 4K6AA 3SGZA 1I2OA 3PB2A 2VFGA 3EX3A 2GQ8A 1JVNA 1MSSA 1ZAJA 2EAWA 2O7QA 1ML1A 2YDAA 2NX1A 3HGSA 2V5BA 2HS6A 5FF2A 4JDYA 5DELA 3LXBA 1JCNA 3W1TA 5H91A 2WSQA 5HQEA 2QKFA 2Y63A 2QR6A 2ISWA 1JCYA 3MHGA 3UPBA 4UFIA 4MY1A 1TCDA 1TRDA 4CCEA 2JKPA 2Q3OA 4EF8A 3KRZA 1SFJA 3DXIA 1Q6LA 5D02A 3F4WA 4LNYA 2HS8A 3E96A 1Y0EA 1GVQA 3NM3A 4E0CA 3I6RA 3TV8A 1V5XA 3LI0A 4NJKA 2JGYA 2H3DA 4FIRA 1EPXA 3W2JA 3EKLA 1QFEA 3W7OA 1TV8A 3PSVA 3UWWA 1AL8A 3G22A 1VLWA 4MPQA 4XZ9A 1JULA 4O50A 3W76A 1EP3A 1OHLA 4X2RA 2Y7DA 1OK6A 3W86A 5K4XA 3LLDA 1W8SA 2PRHA 2FPVA 4UUIA 2GOUA 5CGQA 4QNWA 4UTTC 5D2WA 4DO5A 2CLOA 4CQ9A 1FUYA 1VHNA 5IBXA 3FYOA 3W7MA 3OIXA 1A5CA 1QPQA 4OV9A 1ICQA 3CM4A 4WXYA 5AC8A 4ONVA 4JTKA 5C54A 3W71A 3OVPA 4UMAA 2UV8G 2ZZ5A 1T99A 3GDMA 5D05A 3UWQA 4BWLA 2VOMA 2Z2UA 1OX5A 4O54A 3LCGA 3PS7A 1UJPA 1N8FA 4UMCA 4HPXA 3W1RA 2FJKA 3MHUA 1OF6A 4MOZA 4N9CA 1B9BA 3QMRA 2QCMA 3M9YA 2W6RA 3W73A 3ZWSA 4EF9A 1K8XA 5IM51 4FNUA 4GUFA 2YFNA 1SW0A 4JYEA 5AC7A 5AC6A 3MYPA 1H1YA 4KKXA 4JDBA 5D03A 3ABSA 3TX9A 6ALDA 3WK1A 2C14A 3KFTA 5I3HA 2VELA 1SUXA 1OJXA 3HPZA 3LM7A 2A0NA 2Z0IA 2H6RA 1LROA 5H2ZA 5FF0A 3T55A 4FF7A 2ZDRA 3P74A 1X6UA 3VCRA 2VFHA 2ZA2A 1TSIA 2GVJA 3GXTA 3LRLA 4AF0A 3RMJA 4QM1A 1LRTA 2E5DA 3Q94A 3V75A 5AHFA 1GTHA 4U4MA 4WXZA 4FNPA 2B7OA 1OFEA 1OX6A 2C19A 3HQ1A 3LTSA 2ABBA 2GJLA 5LZLA 1C9DA 1YXYA 5F2MA 3M6YA 4M19A 3N2MA 3DFQA 1QOPA 3W7GA 3P7YA 4LVDA 1XBZA 1QPRA 4HNUA 1DOSA 3STGA 1G4TA 1HTIA 4TMCA 5AHIA 2PRMA 1W3TA 4CLMA 3P62A 4S1FA 1IXNA 2RKXA 4JTEA 1OABA 3T44A 3LHYA 1YDNA 3L67A 3TQ0A 4WQ6A 1TTIA 2GQAA 1ZNNA 2QUVA 2JGQA 2NXGA 1T96A 3G1FA 4POCA 4G1KA 1BEUA 3TJXA 4DPQA 4IMCA 4ZVJA 3SJ3A 2FFCA 4MUZA 4ZQPA 1QMLA 1K7EA 3R5EA 1WBHA 4WOQA 1WQ5A 1T0OA 2YX0A 3I68A 4OWGA 1WAUA 1PHQA 3PUDA 3A22A 2Y61A 3DKJA 5AHEA 4N9BA 4ML9A 3OBKA 3DI0A 1P0NA 1F76A 1X1OA 3O16A 3GXPA 1ZENA 3W7PA 5LNUA 4ZQNA 4CQAA 3DAQA 3CHVA 4TR9A 3F4NA 3IIXA 5FEXA 4XBSA 1XXXA 4N02A 4UR8A 2I14A 4DBDA 2V82A 3LV6A 1VCFA 4W9TA 3I7SA 3L21A 5D2VA 3SR7A 4OBTA 4HNVA 5EA9A 3W70A 3SW6A 1OX4A 4MYAA 3NPUA 4MVAA 1YXDA 1TPDA 3DU0A 1MEIA 1GYLA 3BG5A 5D2XA 3TQVA 3W1QA 3STFA 4O10A 3CB8A 2DJLA 3LHUA 1TPFA 5D30A 3PBVA 4LS0A 2QCDB 4LWWA 3MI2A 1VJIA 3FFSA 1K02A 5DBUA 3WJSA 1UUMA 2EF9A 1FWNA 3PBWA 3DH7A 5G2IA 1TPWA 3TW6A 4Q33A 3QYQA 3CEPA 1X1ZA 3DHFA 1H7OA 4JTIA 4LC6A 2E6AA 3ATYA 5LSMA 1OVDA 1IF2A 1C29A 3SY5A 3LGEA 3LV5A 3O07A 4OT7A 3BK0A 1U83A 4JIPA 2O7SA 4E2DA 1VHCA 3IIOA 2NV1A 2V0TA 3NQGA 5HMSA 4JS3A 2GJNA 1EEPA 4NJIA 1VGAA 2OT1A 3M43A 3TH6A 1JUKA 4LS2A 1RPXA 3PWAA 2DZPA 4X3ZA 2Y89A 3N73A 3GVGA 3O63A 3NQEA 4JX4A 2ISSA 1HG3A 1O5KA 4U28A 1LLWA 4YCOA 1LORA 1LYXA 1NEYA 5TIMA 4LC8A 2YW3A 3G0SA 2PRLA 2YYUA 4BF9A 4FB7A 3QZEA 1SO4A 3FA5A 2JKAA 1GVRA 3DZ1A 4PA8A 1VC4A 1GYNA 1OG0A 2X2GA 2R8WA 4AEOA 4LVBA 1SU5A 3QQ1A 1LOQA 4GFSA 3THQA 4P61A 4UTIA 4M6QA 3NQ2A 2JKEA 2QEZA 3PC0A 5EL1A 1TTJA 2NX9A 4IMFA 3FKRA 4FNQA 3SECA 1B57A 2ZYFA 4OU1A 3PSWA 4ALDA 2XN0A 5G1TA 3TK7A 5I3GA 4FNTA 5KSWA 3G8EA 2FB3A 4O53A 3ABQA 2CZDA 3BLEA 5F2GA 5K9XA 1G4EA 1Q6RA 4K7VA 4MLRA 2XN1A 1WA3A 5HWJA 1DQXA 3C3NA 4P2VA 4JGDA 5DCBA 4GUJA 2J27A 5FEZA 1FBAA 2YW4A 4LRSA 5F2IA 3LRKA 4XKYA 1H7RA 4FIQA 3RF9A 4GRSA 1XDLA 1ME7A 3DENA 1RD5A 5AN7A 2RDWA 3LTPA 3BVJA 2BLEA 3EWBX 1FWTA 3Q58A 2GQ9A 3DFOA 4CCDA 3M44A 2B0MA 1OFAA 2WNZA 4M6PA 1KM1A 1HFBA 2YGYA 3L5AA 4YLWA 4O1CA 4GWEA 2YCEA 3UY7A 3NQCA 4ORIA 3MBDA 1JUBA 1NFBA 1SW7A 5G4WA 2QJHA 3QSTA 1H7NA 1IXQA 2A85A 5D32A 3W7RA 2DZXA 3V1PA 5BOOA 3W6YA 3OHIA 4MIMA 1GTEA 4Z1AA 5D33A 3B0VC 1VRDA 3KVLA 1FWWA 2Y7GA 2B4GA 1VLIA 4NNAA 3EWZA 1LP6A 1ME9A 3MP3A 3NQAA 5LHFA 3FYPA 1ZFJA 3GDRA 1A5AA 4JX5A 4UTUA 1TYGA 2VFDA 4JD4A 5CG7A 3S42A 2D73A 2CLLA 3W1LA 3M7WA 2E6YA 1R2SA 3G3MA 1XBXA 3KRUA 4N9EA 3MI6A 3S8HA 2Y6ZA 3W7DA 3W2KA 1TPVA 1BTMA 1IXPA 4BK9A 3EX1A 3UWVA 3P8IA 2VFEA 1N55A 4NXSA 1JCMP 2C3ZA 5EBUA 1FWRA 2DP3A 4FO4A 4GUHA 3M41A 1K8YA 1H7XA 4NVTA 1AK5A 1TJRA 4RX0A 2WSRA 1WX0A 4O13A 4Y96A 1PE1A 1PL9A 3QPYA 2YSWA 3NQFA 4X9SA 2LLEA 1GVOA 3G0XA 1YTKA 2OT0A 3EKZA 3HGJA 3W7HA 3TMLA 3IEBA 2OX1A 2QUUA 4ADUA 3IVSA 4ORMA 3TA6A 3HG3A 2J9XA 1P0KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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