4CNNA

High resolution structure of salmonella typhi type i dehydroquinase
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
251
structure length
245
Chain Sequence
KTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Mechanistic Insight Into the Reaction Catalyzed by Type I Dehydroquinase
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 97
structure length 245
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnnA00
4N9CA 3PSWA 4S2BA 1OX4A 4LS0A 3SIZA 3G24A 5L9FA 4IGHA 1LDCA 3B05A 2E77A 4O8RA 2C6QA 5DXXA 3SZ8A 1WV2A 4JY9A 4MVAA 4NU7A 1YTEA 1K8YA 5FF3A 1JUBA 2ZQ0A 3LDVA 3C2EA 4AH7A 3OEXA 3S0CA 4BI5A 1Z42A 3QJAA 2CZDA 3PS7A 3W2NA 4NNBA 2V5LA 3H54A 2Y61A 2QCNA 4YLWA 1TV8A 5AC6A 5F4WA 3LV5A 1P5BA 1VPXA 4KFNA 1XUUA 3TXVA 3FS2A 1LRTA 4S2CA 1FXPA 4RZ5A 1HO4A 2ZZ1A 1SW3A 1SFLA 3IRDA 1I2NA 3LCFA 3O16A 5DY3A 4K36A 4AHQA 5G2WA 1K3UA 1IIGA 3EKZA 1LBMA 3G1HA 5IBXC 2P10A 4GWEA 5F4XA 1TRDA 1VLWA 1NF7A 4MLJA 1PV8A 1A50A 1NFBA 2CWNA 1GEQA 5D03A 2WJZA 3LCXA 5HR7A 2VEKA 1IXNA 3A22A 4FX8A 3CWNA 3VKJA 2TSYA 1XBYA 1A5BA 1AL8A 4NX0A 1HFBA 3WK3A 2NXGA 4O54A 1JQVA 3TQVA 3G1DA 5LNRA 1F7BA 2FIQA 1AL7A 1OYCA 1S5WA 2B7OA 3Q94A 3A5FA 1F76A 3TKFA 2VXNA 5TIMA 1VYPX 3OHIA 1SUXA 4I7VA 4HN4A 3W70A 1X6UA 3G3MA 2RHGA 4JD4A 3WFAA 5KZEA 1JR1A 4AF0B 1EUNA 1LM1A 3MBDA 3QMRA 1TB3A 4O18A 4BF9A 1KV8A 1SO6A 3EXSA 3M9YA 2HMCA 1BKSA 3P81A 4LTSA 1FWSA 5FEXA 1YXYA 3EX1A 3DBPA 4HHPA 1RPXA 3TFCA 3GIYA 1FY6A 1LLZA 3O06A 3QM3A 3T4CA 1PIIA 3NA8A 1JJKA 3PBWA 1GPWA 2OZ0A 1U5JA 1Z44A 3S5NA 3L5MA 4N4PA 4NJHA 4UR8A 1H60A 2ZRZA 3GYEA 1RQHA 3G3DA 4Y9AA 3IV3A 3W22A 2E5DA 4K39A 3O8AA 4JTTA 4ZQPA 3UWQA 3WJXA 1F5ZA 2Y89A 2C0AA 4RX0A 5KZMA 4HKPA 3PG9A 3PBUA 1W5PA 2BXVA 3LHUA 3LXBA 1XKYA 2Y7GA 1W5QA 1FCUA 5F1UA 2CFFA 3F1QA 5TBOA 3TC7A 3P60A 3HOJA 3B8DA 4UFHA 3LCIA 1A5SA 3MHFA 2ABAA 1O60A 1LLWA 1SO4A 1PCKA 2W0UA 3BG5A 5KTLA 2ZTKA 3NM1A 4JYDA 1VYSX 2J24A 4K7VA 3W7KA 1U83A 4A2RA 5L6UA 2Y70A 2GOUA 2VEIA 1UB3A 3CIWA 6ALDA 1LTDA 2G97A 2JBMA 1DOSA 4P61A 3ATYA 4M19A 3NL5A 4MJZA 3EXTA 2A4AA 4WY0F 3KVKA 5AN7A 3E9AA 3W73A 1Y0EA 5IBXA 4IQLA 3P84A 4BWLA 1LORA 4JTKA 4ALDA 4JTFA 3ZS4A 3L5LA 4E0CA 2QKFA 3LBCA 3L68A 1T0OA 5FF0A 3W2KA 3W7IA 1LZOA 2X1SA 2ZZ4A 5D2YA 1OFDA 3OVPA 3HG2A 3OA3A 2V2HA 3NQAA 2BWGA 3LERA 1TO3A 4YL2A 1ZENA 1I8JA 4Z1CA 1S3HA 3MWAA 3W7HA 1GVFA 4E38A 1XBVA 4RK8A 3O63A 1O95A 2DJLA 3BV4A 4KFPA 3C2VA 1KM2A 1EP1A 1ZFJA 4NVTA 4LWWA 3LHTA 1TSIA 2CU0A 1WDWA 3K30A 2UV8G 3M16A 2BX7A 2GPTA 1PE1A 3H55A 4LVBA 5DELA 3W1LA 2B7NA 1GVRA 1X1ZA 1H7XA 3HGRA 3Q2DA 5EYWA 1VCVA 1WOBA 3GDKA 4HSNA 4LS1A 4H4IA 5BNKA 3P5ZA 2C14A 4EOUA 3TW6A 4U28A 3AJXA 1ZAJA 2A7RA 3N14A 5FI8A 5D02A 5BMWA 4CQ8A 3TW7A 1FCQA 2B7QA 3WJWA 2QEZA 2YPIA 1Q6QA 4CLMA 1TMHA 1VRDA 3IEBA 3TFXA 2B4GA 1G4EA 4QSHA 4BI6A 1HO1A 1OFOA 1W3NA 4OU1A 1W54A 4DF1A 1OX6A 3DGRA 3TE9A 3WJZA 4JTHA 3SSJA 1TIMA 1GG0A 4B5NA 2QJGA 3G1AA 3HB9A 1C9DA 4OGZA 4NZJA 5SWUA 1MEIA 3GNNA 4WXZA 1YDOA 4UFKA 1WA3A 3BVJA 2AGKA 2PRHA 4UTWC 4GUFA 3LBMA 4UTLA 4GRSA 2X1UA 3FKKA 2DORA 5D38A 3G1YA 5AHIA 4UUIA 3TA6A 1GJPA 3DHFA 1L6WA 1KBIA 1YDVA 2D73A 3LB0A 5U4NA 3EKLA 4N4QA 3HMJG 2Y6ZA 3W07A 3CEUA 3BGGA 2H3BA 4AWTA 1OHLA 3I7QA 1RQBA 3PY2A 4GXMA 4AWUA 4PL2A 3I7RA 1K8XA 3B0PA 4O10A 4EVZA 4NUWA 2ISSA 3QMTA 5FF7A 1C29A 3M5ZA 3NPVA 4MYXA 4I7UA 4S1FA 2NXHA 1MO0A 3E02A 3C6CA 2CLEA 4E2BA 3G1VA 5F2IA 3VFLA 3SGZA 4AVFA 4R33A 2WO5A 3PB0A 1RZMA 2WNQA 4RJEA 1ZHAA 4ORIA 2EGZA 1H1ZA 1ZCOA 4FNQA 2JKAA 2C1HA 2DZVA 3JS3A 1Q45A 1OFEA 3ABSA 3MI2A 4AHPA 4XUGA 1K8ZA 3L21A 3TR2A 1G4PA 2QAPA 2X2GA 2Z2UA 3OVRA 1JVNA 5H91A 5HR6A 2ZZ6A 3P61A 1DBTA 1XC4A 5FF2A 4JDYA 1EPXA 4NXSA 4FNUA 5DN1A 2NWRA 2DZWA 4J9JA 3IGUA 4UIOA 1ZAHA 1R2SA 1EB3A 2WNNA 1WOAA 2B0MA 2Y63A 5G2HA 2FPVA 5AYZA 1DJQA 5DCDA 4A22A 4RZ6A 3W7JA 4JICA 5EMUA 3WK1A 1GYNA 1O5KA 1KFEA 1YYAA 3LI0A 4Y90A 1SU5A 3DFSA 2X1TA 2TMDA 2NV1A 4GBUA 1QNVA 4TMBA 1QCWA 2Y88A 4NZFA 2HS6A 2NXIA 5CZ0A 3FEMA 3DI0A 3NG3A 2ZZ7A 1GTHA 3UNDA 1W5OA 1OVDA 3E49A 4JN6A 4X2RA 2NLIA 1VZWA 4O0KA 3WK2A 1NF0A 3G1SA 4ADSA 1Q6RA 4TU1A 3L66A 4OV4A 1KTCA 3KAOA 3AO0A 3A23A 2AQWA 2LLEA 4O16A 4CNNA 5FF4A 1TPH1 1W1ZA 5CSSA 4M6PA 1QR7A 1GYLA 4UTWA 3I7SA 3UWVA 3NQFA 1OX4B 1UJPA 5KINA 1Z48A 3IVTA 3B04A 4O1DA 1SW0A 1LRQA 3E96A 3LX9A 3PVFA 2YW3A 3DFNA 5FEZA 4UMBA 4O1CA 4A3UA 2YR1A 2ZCGA 4N6EA 3BARA 4MOZA 4LVDA 1GTEA 4QISA 4Z08A 1ONRA 4K8HA 2ATMA 2XN1A 4JGDA 1YADA 3UWZA 1I2RA 1LRNA 3V75A 4DEFA 3B06A 1IIHA 3EWUA 1K03A 2G5WA 2DZUA 3W1MA 1KM6A 4RZ4A 3SR7A 1TYGA 3MYPA 2YYTA 2NUWA 5E93A 4IPJA 1H63A 1KM4A 4JX4A 2VENA 3NDOA 2QCDA 5BW6A 1GZGA 2GVGA 3NQ6A 4XBSA 3UXAA 4FEZA 1JUEA 1LP6A 4Q32A 2ISVA 1TRIA 1B4EA 2FPYA 4IX0A 1JCMP 2V82A 5G1TA 3HJZA 1YPIA 3IIPA 1VHNA 5IM51 1TV5A 2ZZ5A 4UC5A 2Y7EA 3DU0A 1F6PA 3G0XA 4UMCA 2FB3A 4O15A 5AHNA 2E5BA 3NL2A 3NPUA 2RDUA 3C8FA 1FCVA 4IMDA 1XBXA 3C2RA 4ML9A 1R2TA 1K7EA 3BO9A 1H7WA 4MLRA 4DO4A 5F1VA 1KA9F 1R30A 3TUUA 2PC4A 3NO5A 3W7NA 3TSDA 3KRUA 1ME7A 3RMJA 3DKJA 4RR4A 1XM3A 2BLEA 3W1NA 2JKPA 1LYXA 3S5OA 1H1YA 2FDSA 1K02A 2TRSA 4JYEA 4BWLC 1KFJA 3FFSA 2ZDRA 3DZ1A 1T99A 1KM0A 1A5AA 1G7UA 4UFMA 1TQXA 4ZL1A 1KFKA 2NX9A 1ICSA 3BGJA 3W7QA 1UUOA 3N34A 2O7QA 1MZHA 3R8RA 2X16A 3G22A 4GFSA 1L6SA 3NM3A 1NAL1 4MZYA 5EY5A 3KHJA 5AFDA 4O19A 3DFTA 3EWXA 4N9DA 3W7LA 3IGSA 4HPXA 1OK4A 2V2CA 2NUXA 3C52A 1J2WA 1F73A 4WOZA 5D04C 1KFBA 3LTSA 1TPC1 4K37A 4O13A 5K9CA 3M41A 5AHMA 1VQTA 4PA8A 1FDZA 4RLIA 4M6QA 3PULA 3MHUA 3W2UA 1NEYA 1R2RA 1JCYA 1JCXA 4RV8A 3NPWA 1ZAIA 4QM1A 3BW4A 3U6WA 3CPRA 3GB6A 4XWUA 5G2IA 5LKYA 3WJSA 4LRTA 3IGXA 4CNOA 2VKZG 4E2DA 3FYPA 4H6KA 5I3HA 3P67A 5K4ZA 4R34A 2F84A 4LU0A 4UFIA 4YMZA 3LXCA 1F2JA 3CLMA 2YDAA 1WBHA 1UBSA 3EEGA 2GVJA 4N6FA 3W2LA 4MKNA 4P2VA 3LM7A 2V81A 3SY5A 3W23A 1PCWA 3PM6A 3L0KA 2EAWA 4ZMGA 1DORA 1AW5A 1BWKA 5D2XA 3W83A 5C54A 8TIMA 1TTJA 4I7WA 4M7TA 1BTMA 3W7PA 2BZNA 5D32A 1DQXA 4FF7A 3NEVA 1KV5A 4AWSA 3W76A 3S1WA 2QUTA 5E0KA 3I65A 4JX5A 4Z0SA 2CLKA 4EIVA 2QCEA 2F7FA 5AHFA 3W1AA 2V9DA 1IGSA 4UNLA 4DBDA 2DZTA 4LVFA 1H7PA 2GJLA 3ABOA 4LOCA 3L0NA 3N2MA 2ZTJA 2CLIA 3BLIA 3CIXA 3DHDA 3ABRA 1C8VA 2I1OA 1H51A 2W79A 1VGAA 4MPQA 4DXVA 4PH6A 3NVTA 4IWWA 2Z0IA 1YXCA 2QUVA 1OG0A 3TH6A 2QJHA 4LT9A 1XUZA 2C15A 5F4SA 4JY8A 5BRBA 4C1LA 3C2OA 1SO5A 4C1KA 1RQEA 4OV9A 3TU9A 4HPJA 3TQKA 3HGSA 5CPOA 1QDSA 3GDLA 2X1RA 3O6YX 4DO5A 4A29A 5ABTA 2VFFA 3I68A 3W1XA 3IVSA 4LV4A 1TJRA 5F2MA 2DZPA 4GUHA 4WQ6A 5K3VA 2P1FA 5K2ZA 3EX4A 3EX6A 3QW3A 1W5NA 3ZR4A 1D3GA 3A5VA 2E6DA 2OCZA 4ORMA 2Q3OA 3LCGA 1IF2A 1RVGA 2YX0A 5LNSA 4DQWA 1MEHA 2V8ZA 5KZDA 1TREA 5GVJA 5HWMA 4K7YA 3FJLA 3GXPA 1J4EA 3W7EA 1OABA 3SW6A 3P74A 1GOXA 1S5TA 4DPQA 2V0TA 5CKSA 4LVAA 1W5MA 1WX0A 2YSWA 1H7NA 1B3OA 1LOQA 2E6FA 4IMGA 4EWND 3UZ5A 1SZNA 3O6CA 1KM3A 3KX6A 1W56A 4NJGA 5DXYA 3CHVA 3TNOA 3L67A 4O17A 1VLIA 2Q3RA 3GAYA 4IJBA 2VFEA 3T78A 3NNTA 3IIXA 4ZQMA 3QRHA 4R7JA 3LRMA 4QAIA 1VR6A 3GR8A 4FXSA 5MHBA 4NT0A 2QF7A 5D30A 3F4WA 1N55A 1SO3A 1JCJA 1F05A 3BW3A 3UWWA 5I3GA 3NPXA 3LHZA 4PCFA 5FEPA 3HPSA 3UD6A 1M7OA 3IIZA 2J9XA 3H53A 5AB3A 4ZQCA 4O50A 4YWIA 3RK8A 3GLCA 3NQMA 3TXZA 5DBTA 4N9BA 5HMSA 1O4UA 2WQPA 1M5WA 4O0ZA 4OE7A 3GDMA 2A85A 2IQTA 4K8EA 3TROA 5D2TA 1F6KA 3P80A 4LY8A 3W7GA 2NUYA 1MSSA 4G1KA 3LTYA 4QNEA 3CC1A 1ADOA 4JTUA 1YTKA 3THQA 4Q33A 4WXYA 4WUIA 1CW2A 2YFOA 3HGJA 2H6RA 4KFOA 3LI1A 3FKRA 1XBZA 4CCDA 3TJLA 4TIMA 2ZZ3A 1DHPA 3PG8A 3UXDA 4MY8A 3QZEA 3QC3A 4FNPA 4MFDA 3L65A 1MXSA 4LC8A 4CNPA 2A7PA 2WOQA 1EUAA 1B9BA 1XDMA 3KVLA 2ZRXA 1RD5A 2CLLA 1B4KA 4O4VA 1ML1A 4UTTC 4YCOA 2VFGA 4ADTA 4TX9A 5D2VA 4LUJA 2J6XA 3R13A 4YXGA 1KTBA 2JKEA 1UUMA 1O94A 1VHCA 3M5VA 3W9ZA 1OF6A 4M6VA 4AXKA 1KW1A 4UCGA 4QNWA 5AC8A 3TMLA 2WV8A 3UYCA 5A8GA 1FCBA 5H2ZA 5BOOA 2VFIA 1I2PA 4HT3A 3QQ0A 3LTPA 1OJXA 4JIQA 2Y7FA 4X9SA 4XQ6A 4ZQRA 3W84A 4XTDA 3S9YA 3MO7A 3NL3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VJI A;  2EPH A;  3FOK A;  1L6Y A;  1OX5 A;  1K7F A;  3TMQ A;  1W31 A;  2DZS A;  3W1T A;  1YLV A;  3W3O A;  3M6Y A;  1HL2 A;  1CI1 A;  3W75 A;  3LXA A;  1IXP A;  4IX2 A;  1A53 A;  2RFG A;  4FXR A;  5AC7 A;  3MHG A;  1SPQ A;  4QIU A;  3MMT A;  3PWA A;  3NQC A;  5FES A;  3M47 A;  3SEC A;  1GVQ A;  2QR6 A;  3KVM A;  4UFL A;  3W2J A;  4JYF A;  4OQV A;  4CQA A;  2E5C A;  3G18 A;  2Q8Z A;  3NL6 A;  5K9D A;  3UQN A;  3C56 A;  1LOL A;  1P0K A;  5HUO A;  1YTD A;  3S5Y A;  1I2O A;  4DBE A;  2OT1 A;  5CPM A;  4EF9 A;  2ZYF A;  3GDT A;  4OWG A;  4XKY B;  2PE4 A;  1XCF A;  4KWV A;  3M1Z A;  5A5W A;  4IUO A;  1FBA A;  1E51 A;  3KFT A;  3O6D A;  4MIM A;  5D33 A;  1NVM A;  3RF9 A;  2HTM A;  2E6Y A;  1OK6 A;  2GQA A;  5LHE A;  3LCH A;  4L4M A;  4WZH A;  1OFA A;  4K38 A;  2CZF A;  3G1F A;  2CLO A;  4W9T A;  3NQD A;  2ZA1 A;  4KKX A;  3C4U A;  1L2U A;  4LC6 A;  3DFO A;  5DBU A;  5TQL A;  2NZL A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JDE A;  4N9C A;  3PSW A;  1OX4 A;  3HFY A;  3SIZ A;  2BAS A;  1Y5W A;  2OO0 A;  1KBB A;  1NFG A;  5L9F A;  4DNH A;  5A69 A;  1ZL1 A;  4KCU A;  2XFR A;  2FJU B;  5FJJ A;  2E77 A;  4LCS A;  4S3D A;  1TEL A;  1WUE A;  2ACU A;  2VCB A;  1ZRQ A;  4EX4 A;  4MVA A;  3S9I A;  4AEE A;  3NIY A;  2PP1 A;  4KIE A;  1JUB A;  3HN3 A;  4UCF A;  5T91 A;  4AH7 A;  1QI5 A;  3B9O A;  2WJF A;  3GR4 A;  3LZ5 A;  4BI5 A;  4K8G A;  2CZD A;  1DIO A;  3GIP A;  1S46 A;  3PS7 A;  4GI4 A;  1IT7 A;  2VX4 A;  1MVY A;  4PCN A;  1E40 A;  3KBJ A;  2WMI B;  4C90 A;  3VD4 A;  4J3T A;  1LRT A;  2GJX B;  4PB3 A;  1FXP A;  2ZVR A;  1HO4 A;  5BOE A;  1SFL A;  2WCS A;  3LCF A;  3IPW A;  4OBR A;  3NXL A;  3BOX A;  3IJ8 A;  3EKZ A;  1LBM A;  1G9H A;  2WVT A;  1BVN P;  3TTQ A;  2P10 A;  4GWE A;  1CXH A;  1TRD A;  2BXZ A;  3UF9 A;  4RV3 A;  4MLJ A;  4ES4 A;  1GEQ A;  1JYN A;  1NY1 A;  3LCX A;  4UWM A;  4QXI A;  4JHM A;  2GGJ A;  1OEP A;  1AL8 A;  4GXW A;  2EBN A;  1IEI A;  1R8L A;  4A8N A;  1JQV A;  3TQV A;  2QGY A;  1AL7 A;  4J3S A; 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