2XHY | Genus

Total Genus 175

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	175
sequence length	476
structure length	470
Chain Sequence	KKLTLPKDFLWGGAVAAHQVEGGWNKGGKGPSICDVLTGGAHGVPREITKEVLPGKYYPNHEAVDFYGHYKEDIKLFAEMGFKCFRTSIAWTRIFPKGDEAQPNEEGLKFYDDMFDELLKYNIEPVITLSHFEMPLHLVQQYGSWTNRKVVDFFVRFAEVVFERYKHKVKYWMTFNEINNQRNWRAPLFGYCCSGVVYTEHENPEETMYQVLHHQFVASALAVKAARRINPEMKVGCMLAMVPLYPYSCNPDDVMFAQESMRERYVFTDVQLRGYYPSYVLNEWERRGFNIKMEDGDLDVLREGTCDYLGFSYYMTNAVKAEGGTFEGSVPNPYVKASDWGWQIDPVGLRYALCELYERYQRPLFIVENGFGAYDKVEEDGSINDDYRIDYLRAHIEEMKKAVTYDGVDLMGYTPWGCIDCVSFTTGQYSKRYGFIYVNKHDDGTGDMSRSRKKSFNWYKEVIASNGEKL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	6-PHOSPHO-BETA-GLUCOSIDASE BGLA
publication title	Macro-to-Micro Structural Proteomics: Native Source Proteins for High-Throughput Crystallization. pubmed doi rcsb
total genus	175
structure length	470
sequence length	476
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date	2010-06-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2xhyA00

1TUXA 1E4IA 3UERA 4J3WA 1DWJM 2VNCA 2WC4A 2E9MA 1B31A 3CZGA 2ZXDA 2V5CA 4NRRA 3ZQ9A 2XGIA 2J25A 3GNRA 2X0HA 3PZIA 2CCRA 1JF5A 3EDEA 3NSXA 4ZXLA 4PCSA 3VTRA 3WMBA 1KGXA 1ZBKA 3DHPA 1VFUA 1WNOA 4D6CA 5CSUA 1QNOA 1W1YA 3KEHA 5I24A 2DH2A 1UKQA 4PTXA 2WSKA 4MJ4A 5FCZA 2WANA 2DT2A 1ESWA 4WSJA 1CXEA 4ACZA 4CGTA 5JBFA 2QHAA 5D9PA 3VOCA 4EANA 1JD7A 5EB8A 1LL7A 5HPOA 1VFMA 4PRWA 1BFNA 4AEFA 1JDCA 4LQ1A 2CERA 5E0FA 1JZ4A 4AWEA 3G6MA 3WFZA 1PJ9A 4AD1A 3ALGA 1LL6A 2WCSA 2W62A 5I0DA 5HXMA 2Y8KA 3W53A 3VMPA 3WD2A 1US3A 1V6WA 1E3XA 2YL9A 2D0FA 1I1WA 1EOMA 1M03A 1SYTA 2W91A 3PTQA 3MSGA 1FFRA 1Y7VA 4UFJA 5TD4A 4D6FA 3EDDA 2V3FA 3WH9A 2ESCA 4TVCA 3W28A 3AYRA 1E43A 2CKRA 5M03A 3U5UA 4F8XA 5EFFA 1UZ4A 1RH9A 3NUKA 4V28A 1ODUA 2PB1A 2A3BA 1ISWA 1R87A 4M29A 5IXEA 3EBVA 1XYFA 2DH3A 4QDMA 5BWFA 5IFPA 2OYKA 1CZ1A 2CESA 1TZ7A 1DHKA 1FH8A 1R7AA 3OZPA 3N15A 4QAWA 1BYCA 4AD2A 1OBAA 4PEEA 4KWUA 4CKQA 1UQYA 1XSIA 2CETA 3ZSSA 2J7CA 5M17A 1C8QA 3WMCA 1QNRA 1DWGM 1G0CA 1X6NA 2VURA 5ABGA 1V0MA 2J47A 1UHVA 3AIEA 4UOZA 3ZT5A 4D6EA 3VGHA 2WK2A 4JFVA 1XV8A 3CUFA 3MUZ1 1X6LA 1NWRA 4AMCA 3WUEA 2QPUA 4QFUA 1JZ2A 2PI6A 3PZMA 2DSZA 2WZHA 1OT1A 4CCEA 1GONA 3VD5A 3BAKA 3CBWA 3AMDA 1SMDA 2OWWA 2J8GA 2DIJA 4AIUA 2XIBA 1B90A 5JIWA 1B2YA 3ARRA 3CMGA 1UWUA 3KL0A 2ZOXA 2WHLA 1Q6FA 1UKPA 4Z2GA 2X05A 3L4YA 1J9YA 2BY2A 2Q8XA 2YBTA 2UY2A 1E6ZA 4HPGA 1WPCA 2BV9A 1KWGA 3OZOA 4MNKA 4URIA 3CZLA 1YHTA 1HN1A 3ECQA 3PN8A 3ARWA 1GJUA 3ZT6A 1WB0A 1HL9A 3VGBA 4NZCA 3RCNA 4MB4A 4D1JA 4HOXA 2ZXQA 2V5DA 1HXJA 2YDRA 2F2HA 5F7UA 4D6DA 3AOFA 5CQ1A 3PZVA 1OSEA 1BYAA 2WMFA 3OGSA 3WF4A 2WMIB 3CHEA 4P7RA 5D9MA 7A3HA 1NM9A 3TONA 4B16A 4AZ6A 4F79A 2YLLA 1PIGA 2G3NA 3VDHA 2DSWA 5CLWA 1QHPA 2VT0A 1BTCA 2OWCA 1CXIA 4F9JA 4HZ7A 3PZGA 1VFFA 3ZIZA 3IK2A 3N04A 3VDAA 1HKKA 3AMLA 3UR8A 2EPNA 5I6SA 1E55A 2WM0A 3FNDA 3KE0A 2E0PA 4LYQA 5D8ZA 1PBGA 3WD3A 4TVUA 2WVVB 1OM0A 4DUXA 1VB9A 2YDQA 5FIPA 5A6BD 3VMOA 4JL2A 2HISA 1L8NA 3VVGA 1ISVA 2EQDA 3N13A 3RJXA 4OJYA 1XGZA 1E70M 1GOQA 4M24A 3L4WA 3SIMA 1TFVA 1JIBA 3QHNA 4EE9A 2UWFA 3ARVA 2VRJA 4CD8A 1C92A 1RD6A 4Q7NA 2BXZA 3ARPA 1UKOA 1CGYA 4B9ZA 2XJ7A 2A3CA 3NIYA 1ZU8A 2XFFA 2E9LA 4CU6A 2J7BA 4M82A 1EOKA 3AFBA 4FLOA 3EMZA 1QBBA 4E2OA 1MQQA 1UD5A 3K1DA 4LYPA 1K9TA 4ZXOA 3N12A 1QW9A 3M07A 1KWKA 3WQ5A 3WDJA 1QNQA 1UWTA 4OBSA 4R27A 2XYLA 5A2AA 3L4VA 1H3GA 4MNJA 4D6JA 4UQDA 1E4LA 2WVTA 3WN6A 1A47A 1LWJA 3VDCA 2VQUA 3M46A 5BXSA 4DM2A 2J7EA 4N42A 5A94A 2VZOA 3FHAA 1BG4A 1ZB5A 1GVYA 1WZLA 5C70A 3AISA 2CPUA 3S6TA 3U57A 5AYIA 3S2CA 3WNPA 3VUPA 5D8WA 3SURA 3GH7A 3NJ3A 3SUWA 1BHGA 3AHTA 3EMQA 3AQUA 4UFHA 1UD8A 5CPQA 5EBAA 4PBGA 3SUUA 2FDMA 1XSJA 3VDBA 2WC3A 3AS0A 2OSXA 1TVNA 4FMVA 2VX4A 1TCMA 3LPFA 2W61A 3B9AA 2JIEA 4MPKA 3ZR6A 1W1PA 2WVSA 3SCWA 2XWEA 1HJUA 3VIPA 6A3HA 1OIMA 2WMIA 4PSRA 2PWGA 3VGDA 4HA4A 1JDAA 2C0HA 3MUY1 3CZ8A 1UWSA 1QHOA 4JFWA 1JL8A 4W85A 4AW7A 1BAGA 5GNYA 4P7OA 1KCKA 3W0KA 4XX6A 2JEPA 1E15A 3W81A 3BXWA 1XD1A 1HVQA 4GI9A 3LPGA 3AJ7A 4GQQA 2GUYA 2YIHA 1JD9A 3VNZA 4DWSB 4W7VA 1E56A 1UWQA 5I5RA 1B3WA 4JKLA 1U30A 1BQCA 5CLTA 4MTVA 2VRQA 1CXKA 4IM4A 2YKKA 8A3HA 1UKSA 2WVVA 3BC9A 3THDA 2OLHA 1VJSA 2ZX8A 3T0DA 1V0KA 2GJXB 2YL5A 1UWRA 3MV01 3SCPA 5IFTA 3AYSA 1EDTA 1XH2A 1J01A 1LQ0A 5D9OA 1ZS2A 2JEQA 3CLWA 2FHBA 3AHYA 1Q6GA 1W1TA 4A4AA 2FGZA 1H0GA 2QLYA 4OZOA 1M04A 2BY0A 4MAZA 5FKYA 3T09A 3SCOA 3HN3A 4QCFA 1O6IA 5KZ6A 4XZWA 1H49A 5A6BA 2WBKA 3ARSA 1KQYA 5FL1A 3NYDA 4NI3A 3T2OA 3A47A 2XVNA 2J75A 2WBGA 3WL0A 4GIAA 4P8VA 1CBGA 4JIEA 3VX1A 2FH8A 1OD8A 2Z1SA 4HU0A 5JUVA 1ISZA 3NSNA 2E3ZA 1HJVA 3L4ZA 1PZ3A 4DUVA 2BVDA 2V3GA 2CNCA 3O9NA 4AZIA 4H41A 3A3HA 1FH9A 1BYBA 3OA5A 1GJWA 1OGSA 2XM1A 3D5HA 4BQ2A 4OKDA 4JKMA 1Q6EA 3VIMA 4E8CA 3F5KA 1QHZA 3MMUA 1PX3A 2JFEX 3BGAA 1IT0A 4AD5A 1U33A 1UZ1A 3UEQA 4Z2KA 3POCA 3LPPA 3RIKA 3E1F1 2WLYA 2XVKA 3GZAA 4FK9A 3IANA 5BXRA 1W3LA 1QBAA 4A3HA 4FLRA 1AQMA 1WDRA 4AC1X 4B9YA 3AXHA 2VL4A 2WW5A 4OOZA 1Z32X 3VX0A 4JZ5A 2VX7A 3AIBA 3I3DA 2WXDM 2VVNA 3POHA 1JI2A 1E40A 2WKLA 3K8LA 1UH3A 5LA1A 4UQAA 4S3JA 2BVYA 5DT5A 3MSDA 2X1IA 4MNMA 1MFUA 2Y8VA 3AIWA 3BAXA 1JFXA 2O9TA 1EO7A 2Y4SA 4XUYA 1YQ2A 1J12A 2G3MA 4IUGA 1M7XA 3G6LA 1VIWA 2YL8A 2GK1B 3AMKA 1J10A 1GNXA 5D9NA 1ZBCA 3RJYA 4CD5A 5A6SA 1E73M 3AIQA 2XG9A 3ARTA 4AIOA 1HL8A 3VM7A 1B3ZA 3UG4A 1QOXA 1V3HA 5GQBA 2J78A 4TUFA 4LYRA 1W9BM 1UR1A 4W86A 4UZUA 1DWFM 3BCDA 4CCCA 1H11A 1E72M 2WHJA 3U7BA 2VZSA 2GJPA 3W4RA 3J7HA 4KRTA 3AHVA 1E6NA 4JL1A 4DWSA 3W82A 4XZBA 5DFAA 1E6SM 1DWIM 1A3HA 1W9PA 1ZL1A 5BCAA 3F5JA 3QHOA 5ECUA 2DSUA 4CD6A 1HP4A 1SFSA 1LLOA 1VBRA 2J7GA 2ZX6A 4W5ZA 2WSPA 3F4VA 1JNDA 1XH0A 5GPRA 4AXNA 2GJXA 3TTSA 4M8UA 1CGVA 1VAHA 3OB8A 1AVAA 1VEPA 1MQPA 2DSVA 3RDKA 3CUGA 5AYBA 4P8XA 4W87A 3IJ7A 4H7VA 3IJ8A 3GNPA 1W3JA 1BYDA 2WMJA 2O9PA 2QMKA 5E6ZA 4CD4A 5FD0A 3OLDA 2Y24A 2WB5A 3W25A 3N11A 2PWEA 1P6WA 6CGTA 2YLAA 1EGZA 4BQ4A 3MMWA 1CDGA 1KXQA 1NOUA 3I3BA 3CGTA 1PX4A 3HJEA 4HOWA 1UA7A 2J79A 4UR9A 3APGA 3WIJA 3SCVA 1CLXA 3KL5A 4EAMA 3A6OA 3WY1A 1WZAA 5JBEA 1R86A 3WD1A 3ARXA 3T2QA 3K8KA 1B30A 3AICA 4H8HA 1FFQA 1JFHA 2CIPA 3VIHA 1W1VA 2VQTA 1XHGA 3AMCA 1CLVA 3U7VA 4QCEA 3I3EA 4AISA 1KXHA 5CPSA 1UWIA 3VIOA 4JFUA 3L4XA 2GFTA 2XGBA 4A3YA 1UR0A 1M53A 1QNSA 1KBKA 4OOUA 2GJRA 2EJ1A 5BROA 1VEMA 2E8ZA 2ZIDA 1TVPA 2C8NA 1EHAA 4B15A 1BG9A 2MANA 5A1AA 2XSBA 3CZJA 4GXPA 3VD9A 5A69A 2VTFA 2O92A 4TTUA 1JI1A 3UETA 5BXPA 2PF0A 3T0AA 2GK1A 3FAWA 4N0RA 4D71A 1MW1A 2JF7A 1BGGA 1O7AA 4UFMA 4W7UA 4CD7A 4UCFA 4UOQA 2VVSA 5DT7A 4JCMA 1IV8A 4W7WA 4KGJA 2VRKA 3PZ9A 5JBDA 2XUCA 3PHAA 1KXTA 3O6AA 3OGRA 3MMDA 4HMEA 5E0CA 1W2VA 3SUSA 1K9FA 1JG9A 4AZ5A 1HKIA 1WP6A 3GNOA 1HJQA 3K4DA 4LX4A 4PTMA 1V02E 3EDJA 3AIUA 3K46A 1B3XA 4HA3A 3WH8A 3ZJ7A 1V0NA 1VBUA 3CZKA 4JHZA 1KR0A 3EMCA 3KZSA 5A2CA 4AD3A 4YPJA 4CU7A 4UNIA 3WF0A 2VZTA 3WDHA 3WF3A 3GBDA 3U5YA 2RGLA 1B3YA 4W5UA 4P7NA 5A8MA 1FHDA 3BMVA 4WKAA 4U5KA 3RMEA 2D1ZA 1H1NA 1TMQA 2VC9A 3CTTA 4MDOA 1EA9C 3D3AA 2J74A 1E9LA 1PX8A 3DYOA 4S3KA 2NT0A 2A3AA 2E8YA 1HJSA 2DT1A 1LG1A 3ZOAA 1NP2A 4NF7A 1HP5A 4OUEA 5A6JA 2D24A 3N18A 1MVYA 2G3IA 3WD4A 2D23A 1UKTA 2DDXA 1PIFA 1CYGA 1GHRA 5C8BB 1EDGA 3II1A 3QHMA 1F4HA 3NCOA 2XTKA 1VENA 2J77A 4ZEPA 4DUWA 1MWOA 2X8RA 2G8ZA 1GUVA 1C3FA 1GW1A 4P7LA 3BAJA 4HZ6A 4OIFA 1ECEA 5HBFA 1C91A 1AQHA 1CWYA 4PMDA 1VFOA 2CBJA 9CGTA 3L4TA 2DGAA 3FHQA 3CHCA 2A3EA 3VGEA 2W66A 4PUDA 1DEDA 1N82A 1PPIA 1NH6A 1KGUA 1B0IA 3LMYA 2O9OA 3MS8A 3UG5A 5E9AA 3SCTA 3QOMA 3VIIA 3W6MA 3ZSTA 4CVUA 1JZ7A 1VJZA 4YHEA 5A3HA 4PYSA 1WDQA 1E1FA 4WKFA 1UOKA 5I78A 3BCFA 1E6XM 3VIJA 4QLJA 5A8PA 4KGLA 1NWSA 1CIUA 1QI5A 1W91A 4PMZA 1EHNA 3TTQA 2XWDA 4UQBA 3SEPA 3BSHA 4WF7A 2VCBA 3ALFA 2YBUA 5I3DA 4AEEA 2WYSA 1JAKA 2E40A 4ZE4A 1CGXA 2WMGA 1GCYA 1GZJA 3GTNA 2BY1A 1HX0A 1UQZA 1D7FA 2IXUA 2JALA 3L2MA 3KWXA 5M5DA 1GVIA 1BGAA 1C90A 4LXFA 4AY1A 2Y5EA 2IUZA 3PZOA 1M01A 2JE8A 3WELA 1ZJAA 4PMYA 3OLGA 4GI6A 5DMYA 4AIEA 2WVUA 5DO8A 1BLIA 4ZENA 4U5IA 1H2JA 3FN9A 1QNPA 1CXFA 1E6QM 1JZ5A 5A6MA 2ZX9A 4PMRA 2ZWZA 5A95A 1NP0A 5CG0A 1KQZA 3AROA 1G9HA 1W9DM 1PEZA 7TAAA 2VCAA 2J4GA 2BHZA 3AS3A 4HA1A 3BMWA 2VX5A 3JUGA 1OCQA 1GQJA 2VR5A 3VILA 5I77A 2EPKX 2WC7A 1C7TA 1FHLA 1J0HA 1CGUA 1UA3A 4FLSA 3CUIA 4MB5A 2E4TA 5I2UA 4GQRA 1GOOA 5HDRA 4RE3A 1UH4A 4HZ8A 5CPTA 4CU8A 2VCCA 4GKLA 3ZR5A 3SCSA 2YJQA 1JYVA 1EIBA 2JF6A 4BZYA 2CKSA 2QV4A 3ZJ8A 4W88A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4NRS A;  4PMV A;  1H5V A;  1CEO A;  2VO5 A;  3WD0 A;  4DWS D;  1CXL A;  2D2O A;  1CGW A;  2FGL A;  1HT6 A;  4KH2 A;  2CBU A;  1J0K A;  4MAD A;  1W9V A;  4J3S A;  3WDQ A;  1F4A A;  4HPH A;  4ACZ B;  1SMA A;  1GHS A;  2YDS A;  4HOZ A;  1E6R A;  1OGG A;  3FXY A;  4WJX A;  1HJW A;  1MYR A;  1C93 A;  3FAX A;  1W9U A;  2J62 A;  3VKK A;  3VU2 A;  4M1R A;  5A6K A;  3MU7 A;  1I75 A;  3OLE A;  4LGX A;  4F9D A;  3VIK A;  4D6I A;  4K68 A;  5A6L A;  2X09 A;  2VZU A;  4ATD A;  2EPO A;  3VGG A;  2TAA A;  3WH7 A;  4J3T A;  3FW6 A;  3N9K A;  2PBO A;  1E4N A;  3BAW A;  2CBI A;  3IAQ A;  1UD2 A;  2VX6 A;  4LPC A;  4H8V A;  4M56 A;  4GO9 A;  4D72 A;  1Q6C A;  8CGT A;  2ZUS A;  5A8Q A;  3IAP A;  3HU7 A;  1BPL B;  2YA2 A;  3GYC A;  4JCL A;  3DHU A;  3PZU A;  2C7F A;  4QLK A;  2ZIC A;  1H09 A;  4JFS A;  1JYX A;  4UZS A;  2DIE A;  4DWS C;  1ZBV A;  4PCT A;  1JGI A;  1QI2 A;  4GZI A;  4WK9 A;  2WHM A;  4C7G A;  2WWD A;  3WL1 A;  2W92 A;  1R85 A;  2IXV A;  3AMG A;  2WPG A;  3AIR A;  1EQP A;  3WMS A;  1JYN A;  4XV0 A;  3WH6 A;  3CPU A;  1KGW A;  1HIZ A;  2Y2W A;  4B3L A;  4UQC A;  2B31 A;  3RM9 A;  5GNZ A;  3MAN A;  2ZXA A;  3SCR A;  4J27 A;  3W6L A;  3WF2 A;  2GSJ A;  2NSX A;  1WZK A;  4UQE A;  4Z2J A;  3AZT A;  2G41 A;  4U2Z A;  2PBG A;  4MDP A;  1LJY A;  3CIV A;  2VMF A;  2AOS A;  5HOS A;  1TE1 A;  3WQW A;  2WAG A;  5LYR A;  1JYW A;  1U2Y A;  2V3D A;  5IDI A;  1HF6 A;  1OIF A;  1KB3 A;  4PUE A;  3UG3 A;  1J0Z A;  1C8Y A;  1PAM A;  1GOW A;  2XPK A;  2WCA A;  3T08 A;  1GOR A;  1B3V A;  1UD6 A;  3N17 A;  4PMO A;  4QP0 A;  3AZS A;  3WUB A;  4W84 A;  3AXX A;  1FP9 A;  1G01 A;  4X0V A;  2EBN A;  4NSB A;  4H04 A;  4L4O A;  1BVZ A;  5ABE A;  3WEN A;  4YN5 A;  1QW8 A;  1XCW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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2XHYA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations