1GORA

Thermostable xylanase i from thermoascus aurantiacus - xylobiose complex at 100 k
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
publication title Substrate Specificity and Subsite Mobility in T. Aurantiacus Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
total genus 122
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gorA00
1XCXA 3QGVA 1J18A 1J9YA 2YBUA 4HA3A 3S6TA 5A95A 2J75A 2D3LA 4ZFMA 5A2AA 1W9UA 4GI9A 2WXDM 1E15A 3WDQA 3VD9A 1HVQA 4UNIA 1UA3A 1W3KA 3WQWA 2EPNA 2J7DA 3TTQA 1UOKA 2CPUA 1UR9A 1ITCA 2J78A 2XIIA 4H41A 5CPTA 2XVPA 4CU8A 4LX4A 4TX8A 2WPGA 1PX8A 3PZTA 2V3EA 4EE9A 1TR1A 4GZJA 4RE2A 4ACYA 3GTNA 3ZIZA 3ARWA 2VI0A 5I79A 3ZJ7A 2VTFA 1G5AA 3NSMA 4OOZA 1KXQA 2BVDA 4AEFA 3WNNA 3QOMA 2FGLA 3K4AA 4QCFA 1CEOA 1J0YA 4UOJA 3AZSA 2V38A 3D3AA 1ISYA 4D6DA 4PMVA 2ZX7A 4W8LA 3QR3A 2OYKA 3GDBA 1Q6CA 2ZIDA 1BAGA 3L4ZA 3WELA 4W8AA 1GJUA 1GVYA 1EGZA 3CIVA 3AMGA 3SUSA 2WK2A 4LQ1A 1MW2A 3TTOA 4FMVA 2WBKA 5CGTA 4D6FA 1JYXA 1X1NA 2VCAA 1J0HA 2XVGA 5C71A 4JHZA 5M3WA 3L2MA 5BCAA 1US2A 2QPSA 4CCEA 3GNRA 1H11A 5M03A 1SR0A 3CUJA 4OKDA 5A8OA 1EXPA 3WUEA 1W2VA 3AIQA 1E0VA 1QNOA 1TMQA 2ZXDA 3AS0A 1ZBKA 4DM1A 1WDSA 1PAMA 4ZE4A 4FLQA 3AS1A 5BXRA 2VX5A 2QV4A 4HMDA 2J47A 2DDXA 4WKAA 3I3BA 3B8SA 3VX1A 4AIOA 4PRWA 6TAAA 4D1JA 5DO8A 3ARQA 4L4PA 2E40A 4B15A 2BFGA 5ECUA 1HJWA 4X9YA 1CXLA 5JIPA 3OIHA 4UFKA 3CH9A 4AYSA 3SCNA 1NP2A 3WD0A 4TVCA 1D3CA 5DFAA 1C8XA 4WF7A 2WKLA 3OGRA 1DEDA 3RIKA 2D0HA 1MVYA 1Y7VA 4FF5A 4M29A 3A6OA 4AD0A 2PB1A 2QMKA 1QNRA 5A6MA 3VDBA 3I3EA 3AYRA 2OWCA 7A3HA 4U2YA 4PUEA 1JYVA 4W7VA 4UFLA 3KEHA 1QVBA 1K9FA 4Q7NA 1FFRA 3VUPA 1KQZA 3KWXA 2D1ZA 1E55A 5A2BA 1VFOA 5LYRA 3PTMA 2RGMA 2XWEA 1LL4A 3TONA 2ZWYA 3WSUA 2YA2A 3TTYA 1FP8A 1VEMA 3MMWA 3PZOA 3ALGA 4AZCA 4JIEA 4H8VA 5IDIA 1BYBA 1E71M 2J7HA 3PBGA 1LLOA 4P7QA 2CYGA 3PZIA 1NP0A 9CGTA 4NI3A 4JKLA 2YL6A 1CLVA 1OCQA 3L4YA 3OB8A 1UYQA 3OLEA 4MAZA 5A6LA 3UESA 4QDMA 3ZJ6A 1X6NA 1A47A 3N1AA 2WCAA 3AS2A 1V3LA 1KR0A 4CN4A 5A94A 4AXNA 1C7SA 1UKQA 2W61A 2D0FA 1WZMA 4M56A 3SUVA 1BG9A 1W1PA 1VJZA 1VJSA 1JAKA 1V0NA 3CHCA 1N82A 2O9PA 2WC7A 1CXFA 3VGBA 3MV01 1LL6A 1K9DA 3RPMA 1ISXA 3BMVA 2WVUA 1JGIA 2BS9A 1QPKA 3CZEA 2FHBA 3EYPA 3NDYA 5I5RA 3CUGA 3ARSA 4U5IA 4LGXA 1JI2A 3K8LA 5HOSA 5FKYA 1KWGA 1MW0A 1DHKA 1KBBA 3OG2A 3AI0A 4W8BA 1JXJA 4J7RA 1XH2A 3WH7A 4WKFA 3FHQA 5TD4A 4PSPA 3WN6A 1UHVA 3POHA 2JIWA 2AOSA 4S3JA 2UY3A 3B9DA 1M03A 2GJPA 2XVLA 4MJ2A 2BY2A 3GH4A 1CXKA 3IAQA 1GQLA 2XYLA 2C0HA 2D20A 1DTUA 3WH9A 5IHSA 3WIJA 3ZQ9A 3VNYA 2DT3A 2Y2WA 2G41A 3MMDA 3WF4A 4UR9A 2E9LA 1W9PA 3SCRA 2W4XA 2EBNA 3L4WA 2FHFA 4ATWA 4ZXLA 4Z2JA 1WDPA 4BF7A 3A4XA 3WDHA 6CGTA 1R85A 2XFYA 2J7GA 2VCCA 4BQ3A 1H41A 3SCOA 4WIWA 1KXTA 2GJXA 1VRXA 1UR4A 3M46A 1OIFA 2J79A 3AXHA 2VZUA 1WO2A 4GI8A 3NYDA 2G4FA 4RL3A 2V3DA 1VAHA 3HN3A 1KXHA 4XB3A 1WE5A 1CGYA 1QI4A 5AYBA 3VVGA 5JBEA 5EBAA 4L4OA 2XG9A 3GNOA 1E6PA 2CBVA 3A3HA 4BQ5A 4FLRA 4FLOA 2B31A 2YLAA 1B3WA 2WZIA 3IJ7A 2WMGA 3B9AA 5I78A 5CPQA 1H0IA 2NT1A 4NSBA 4MB4A 4UFJA 3NDZA 2WMFA 3CUFA 2JE8A 2Y24A 4UQCA 4QLKA 2YL5A 4JKMA 1NQ6A 4IUGA 1WPCA 4P7RA 4TTGA 2EPKX 1B9ZA 1C92A 4LYQA 3ZT7A 5AY7A 4UZSA 1HJUA 3LMYA 1GCYA 1BYAA 2YLLA 3N18A 4J3WA 1JZ5A 1XRVA 2BVYA 5JUVA 1V08A 2VX4A 2WB5A 3AXXA 1EQCA 1ODUA 3PZMA 1WAWA 4YN5A 1XD1A 3AOFA 3WBEA 5DF0A 3O2LA 1E6NA 3WEMA 3OZPA 1MW3A 1BSIA 1TG7A 3GXFA 5D9OA 1EDQA 4AC1X 2D23A 2NT0A 3AROA 5E9AA 5FL1A 2VR5A 4W85A 2W63A 4B9ZA 4DWSC 3AMLA 1CIUA 2A3AA 4K68A 2CBIA 2WVVA 3KE0A 5GQBA 2YBTA 2WMIB 5HPOA 2Y8KA 2QF8A 1GHRA 4CN6A 3W38A 2XSAA 1LWHA 1I1XA 2WHMA 2W66A 4R27A 1JDAA 1BLIA 5E6ZA 4NF7A 2CCRA 3EMQA 2WNWA 4HA4A 1FHLA 1XCWA 2XSBA 3UEQA 3VNZA 4V28A 3W6MA 1ZU8A 4PMDA 2BV9A 4HTYA 1GZJA 2G3IA 2O9OA 4PTVA 3WQ5A 5FD0A 4B3LA 1SYTA 3DYPA 5HPCA 3CPUA 2GJRA 1VFMA 1B90A 4ATDA 3SURA 4HZ6A 1UKSA 1OWQA 1UZ1A 2PF0A 1CXEA 2WLYA 2X09A 1F4HA 2RGLA 1UQZA 3NIYA 2CITA 3EDFA 1UD6A 3L4XA 1JNEA 3AHTA 2OSWA 3W81A 2W62A 3NSNA 1TA3B 5EMYA 5CPSA 2X2YA 1LJYA 1GW1A 5A69A 1B3XA 1DWGM 1ZJAA 3II1A 4W93A 3PTQA 2DQXA 1BF2A 1TCMA 1QI2A 1UZ4A 1UD2A 4KRTA 2YDQA 3FHAA 4AD2A 2VZOA 1VF8A 1BHGA 3SEPA 3T0BA 3CZKA 3ZOAA 1DWIM 2VRJA 1AVAA 1XD0A 1UKOA 3WBAA 4AEEA 4GKLA 1MQRA 3BAXA 5ABFB 1JXKA 1ZBVA 2OLHA 3U7BA 1HXJA 3PZQA 2X1IA 1FH7A 4WKHA 3EDDA 2J25A 1B3YA 1XYZA 1DWJM 3WNPA 3AFBA 2ZICA 1ZB5A 3FN9A 2QHAA 1HX0A 3EMZA 1BQCA 3BMWA 4GQQA 3ARTA 4XZBA 1QNPA 4PUDA 4P7OA 2XM2A 3VDCA 2XM1A 1FA2A 1EHAA 4PBGA 1HJQA 3AMCA 2G3MA 1E4NA 1UWRA 2XJ7A 1GOIA 1V3KA 2OSYA 3CHFA 5A6SA 4J3UA 4J3TA 3HJEA 4AZGA 4JZ5A 4UCFA 4U2ZA 3VDAA 2DGAA 5JIWA 2GSJA 1A3HA 4PTWA 2ZUWA 1XV8A 4KMQA 1BYDA 4A3HA 5E70A 1HN1A 3VINA 2J7CA 5A6KA 1G01A 2DH3A 2J4GA 4P8VA 1E6XM 3S2CA 1JG9A 1QBBA 3AXIA 3WH6A 2ZXBA 2AAAA 2CXGA 5FOOA 3OGSA 1LWJA 5GNYA 5I6SA 1PPIA 1QI0A 1UD4A 3SCQA 4AD1A 3ZSSA 5A6BD 3ZSTA 1GHSA 3MO4A 4FLSA 3WQ6A 4RE4A 1UUQA 4M81A 2UWFA 5JBDA 4LXFA 2EQDA 2TAAA 2X8RA 4YHGA 4AD4A 4V27A 2OYLA 2PBGA 1O7AA 1VBUA 4CCDA 3BLPX 4QAWA 3U7VA 4CN1A 1EIBA 4BQ2A 4F79A 3CMGA 1MFUA 1E40A 5JBFA 1H09A 4AY1A 3VX0A 3K4DA 1G1YA 2Z1KA 2WSPA 1V6VA 5GPRA 2XUCA 3VGFA 1BVNP 2VMFA 1IT0A 1JZ4A 3BAYA 4J27A 3VD4A 2J7EA 1OT1A 1QW8A 5E0CA 3BSHA 3HU7A 2X05A 2EXOA 3ZR5A 3MUAA 3APGA 1CGWA 5BROA 3AIUA 3E1F1 2YA0A 4R5EA 4F66A 4JFTA 2DT1A 2D22A 3EDKA 3GBDA 1HP4A 3G6MA 4HMEA 1GQIA 3MUY1 2ZUSA 4OUEA 1UR0A 1HJXA 3QHNA 1JF5A 2E9BA 1W32A 1RP8A 4CD8A 3AISA 3WDJA 1DWFM 1W3LA 4AIEA 2JIEA 3CZGA 1HVXA 3G6LA 1CXHA 1OD0A 3WNLA 5A3HA 1W9XA 3F5JA 2ZX6A 2ZUVA 3ZT5A 1QBAA 4D72A 3WD4A 2DSUA 3GM8A 3A4WA 3EDEA 5IFPA 2CKSA 3RMEA 3L2LA 3PTKA 4GZIA 2DH2A 2GUYA 1HJSA 5A2CA 1W2PA 2VQTA 3SCWA 4B9YA 6A3HA 1UG6A 1PBGA 3VIFA 1VEPA 4AZHA 2C8NA 4W89A 3WF2A 4WLCA 4IM4A 1HL8A 3AHVA 1OGSA 4CD7A 1CPUA 5GNXA 3ZR6A 1MQQA 2WAGA 3RJXA 1ODZA 1I75A 3FAXA 2CNCA 3KL0A 2A3EA 1EDTA 4W88A 4TVDA 3L4UA 3FY1A 3MUZ1 4PCSA 1V6UA 1XSJA 4GO9A 4J3SA 3ARXA 3BC9A 5ABGA 1Z32X 4HOWA 2DSZA 2DIJA 3LPFA 4HA1A 5CSUA 1VB9A 3TOPA 1J12A 4D6HA 4YPJA 1RH9A 3RM4A 3WF0A 2VZTA 4YHEA 3AMKA 4CKQA 3WY1A 1E0XA 3WH8A 2VRKA 2ZXAA 4PN2A 1JYNA 5LA0A 4CVWA 3VGDA 2VX6A 3AMDA 5D4YA 4MAVA 4EAMA 3MUIA 3CBWA 1B2YA 4QP0A 1I1WA 2WVSA 1S46A 4PCTA 4GINA 4U31A 3GBEA 3VM7A 2XPKA 2ZWZA 3BSGA 2J7BA 2WCGA 4CD4A 5BXPA 2BHZA 4F9DA 2BXZA 1V0KA 2ESCA 5C70A 5CG0A 1EH9A 3LPOA 3BH4A 2NW0A 1UQYA 1GUVA 2VVNA 2J62A 3GXDA 1KCLA 1W9VA 4AISA 3RO8A 4QFUA 4D6GA 4QCEA 4PYSA 2F61A 1AQMA 2WWDA 2VT0A 2VR4A 1MWOA 2EPLX 1WP6A 2CHOA 1J0IA 1UWQA 1NWRA 4AZBA 1OT2A 1KR1A 2W5FA 4TTUA 2HISA 5I23A 3AYSA 3VM5A 4C7DA 1CTNA 3BGAA 1GPFA 1UWIA 4EK7A 2E8ZA 4W7WA 2GK1B 4JCMA 1HF6A 1LG1A 3CZLA 2JF6A 5CLWA 1E4LA 1JI1A 1JFXA 4C7FA 3ZM8A 4W86A 3CTTA 3RJYA 5DEZA 3U5UA 5F7UA 1E3ZA 1LG2A 4UFHA 1B0IA 3UG5A 4MJ4A 1EA9C 1C8QA 2ZX8A 2WW5A 1R7AA 2WMKA 1GQKA 4S3KA 5E0FA 3UG3A 2JF7A 4JL2A 2UY5A 3PZUA 3CUIA 4OJYA 1JZ2A 3W0KA 4Z2LA 1EHNA 2UY4A 5IFTA 4ML4A 2XWDA 3GYCA 4DWSB 5BRQA 3VIPA 2HVMA 1HJVA 3WNMA 1NOFA 4PMYA 2CIPA 2V5CA 4MNMA 4IPLA 2G3JA 3CO4A 1C8YA 1CGXA 2D2OA 2J77A 1HKKA 2PWFA 4Z2HA 5BRPA 4CGTA 2D24A 2YKKA 4UZUA 5A8MA 2OWWA 1Q4NX 5EFFA 2BY0A 4JFVA 2YDRA 4AZIA 1RPKA 4KGLA 3M6DA 3VIGA 2VRQA 3DHUA 3AQUA 2DEPA 2Z1SA 1NOUA 5BXSA 3THDA 1PZ2A 1C3FA 1MW1A 4PMQA 1QI3A 1JFHA 2ZX9A 3SIMA 4F9JA 4MNJA 3BAWA 2X0YA 1BFNA 4MDOA 5GNZA 2ZUNA 2BXYA 4XV0A 4M24A 3VIOA 5D9MA 2WMIA 3KL3A 2WC4A 1W9DM 4W84A 4ACZB 4CD6A 3SUTA 1QHZA 1L8NA 2EO7A 2DT2A 3OLIA 3VIJA 4DWSD 3CMJA 3WD1A 4AD5A 2VO5A 3PHAA 4NZCA 1E56A 3GXMA 1KGXA 2VQUA 2FH6A 1P6WA 4V2XA 5DT7A 4MB3A 3VMOA 2NSXA 4GQRA 4C7GA 4HZ7A 4AIUA 3TTSA 5CSYA 1VFUA 3WH5A 4ZE5A 4OOUA 1H49A 2QLYA 4HOXA 3FXYA 3WD2A 3DHPA 3BAKA 1LF1A 1ZL1A 4UFIA 1OM0A 4AZ5A 1QOXA 1C91A 4HU0A 1LQ0A 5CGMA 5HBFA 4WJXA 1FFQA 1KXVA 4MB5A 2WSKA 4XUYA 4XX6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XCX A;  3QGV A;  1J18 A;  1J9Y A;  2YBU A;  4HA3 A;  3S6T A;  5A95 A;  2J75 A;  2D3L A;  4ZFM A;  5A2A A;  1W9U A;  4GI9 A;  2WXD M;  1E15 A;  3WDQ A;  3VD9 A;  1HVQ A;  4UNI A;  1UA3 A;  1W3K A;  3WQW A;  2EPN A;  2J7D A;  3TTQ A;  1UOK A;  2CPU A;  1UR9 A;  1ITC A;  2J78 A;  2XII A;  4H41 A;  5CPT A;  2XVP A;  4CU8 A;  4LX4 A;  4TX8 A;  2WPG A;  1PX8 A;  3PZT A;  2V3E A;  4EE9 A;  1TR1 A;  4GZJ A;  4RE2 A;  4ACY A;  3GTN A;  3ZIZ A;  3ARW A;  2VI0 A;  5I79 A;  3ZJ7 A;  2VTF A;  1G5A A;  3NSM A;  4OOZ A;  1KXQ A;  2BVD A;  4AEF A;  3WNN A;  3QOM A;  2FGL A;  3K4A A;  4QCF A;  1CEO A;  1J0Y A;  4UOJ A;  3AZS A;  2V38 A;  3D3A A;  1ISY A;  4D6D A;  4PMV A;  2ZX7 A;  4W8L A;  3QR3 A;  2OYK A;  3GDB A;  1Q6C A;  2ZID A;  1BAG A;  3L4Z A;  3WEL A;  4W8A A;  1GJU A;  1GVY A;  1EGZ A;  3CIV A;  3AMG A;  3SUS A;  2WK2 A;  4LQ1 A;  1MW2 A;  3TTO A;  4FMV A;  2WBK A;  5CGT A;  4D6F A;  1JYX A;  1X1N A;  2VCA A;  1J0H A;  2XVG A;  5C71 A;  4JHZ A;  5M3W A;  3L2M A;  5BCA A;  1US2 A;  2QPS A;  4CCE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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