1N55A

0.83a resolution structure of the e65q mutant of leishmania mexicana triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglycolate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
AKPQPIAAANWKCNGTTASIEKLVQVFNEHTISHDVQCVVAPTFVHIPLVQAKLRNPKYVISAQNAIAKSGAFTGEVSMPILKDIGVHWVILGHSERRTYYGETDEIVAQKVSEACKQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTSAIAAKLTKDAWNQVVLAYEPVWAIGTGKVATPEQAQEVHLLLRKWVSENIGTDVAAKLRILYGGSVNAANAATLYAKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords triosephosphate isomerase
publication title Crystal structure of triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglycolate at 0.83-A resolution
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania mexicana
total genus 95
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2002-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1n55A00
4RX0A 4UR8A 4RLIA 1R2RA 3UY7A 3OG3A 1UUOA 2X2GA 1W3TA 4JS3A 1TB3A 3KVKA 3DH7A 4KKXA 1M7OA 1P4CA 2B0MA 3HPXA 3UYCA 3NL3A 3JS3A 1WXJA 3GDLA 3UQNA 4N9EA 4MZ1A 1EUAA 3NQMA 3P8IA 2E5CA 5FEWA 2VKZG 3DU0A 1OYBA 1EEPA 2JBMA 3TR2A 3LCXA 2E77A 3GXNA 4FXSA 2O7SA 5A8GA 1IIGA 5TBOA 3LI1A 4D2JA 3NG3A 4UXDA 1Z44A 2WSYA 4CCCA 5E93A 1NFBA 2GVJA 3FLUA 3NPVA 2TMDA 3TMLA 4DO6A 2OX1A 3W1AA 5AHMA 4TR9A 1M5WA 3W1MA 3O8AA 3PM6A 3A24A 3MI6A 1ZENA 4ADSA 2V2DA 2VOMA 5FESA 1SFLA 5D02A 1JCJA 1IIHA 2GVLA 1KM5A 1X1ZA 1WV2A 1AW1A 4EF9A 1AL7A 3B0UX 4K6AA 1B9BA 2YFNA 4O17A 3WK0A 1K3UA 5T26A 1KFCA 4O1AA 1R47A 1GTEA 1VYRA 1VJIA 4ML9A 3UWZA 4CLMA 2DZUA 3BW3A 3SW6A 3GZ3A 4M6VA 1FWNA 5D38A 2W0UA 4UR7A 3W7EA 1XUUA 2ZZ7A 3RFAA 4CQ9A 1QAPA 1TPB1 3W2UA 5AHEA 4FXRA 4N02A 3PG9A 3FJLA 5D04C 4QIUA 2W79A 3VE7A 2ZA2A 4FEZA 1NSJA 1QPRA 1XI3A 4A2RA 3GNNA 3C0JA 1TTPA 2OMAA 4DEFA 2Y6ZA 5BW6A 1UASA 1YPIA 3NQ6A 4NVTA 5G2HA 2OZ0A 2EKCA 5AYXA 3L68A 1RV8A 1X1OA 3FEMA 1PS9A 3S1VA 5AYZA 2QDGA 3NQAA 4RZ6A 1Q6LA 2ABBA 4YCOA 3P84A 4Q32A 3GDTA 1I2QA 4K38A 4MOZA 1KV8A 2HMCA 4P2VA 3BW4A 2VFDA 1SR9A 1L6WA 2H90A 1OFEA 4JGDA 4FB7A 1DBTA 2BXVA 3PUDA 3W1PA 4FX7A 1WBJA 3PF3A 2F7FA 3I65A 3TMQA 1XKYA 3NQ2A 1H61A 1FBAA 1BWKA 2FPVA 3LRKA 1XXXA 1ADOA 5FEZA 1SZFA 3NZRA 1IXPA 3SY5A 1Z41A 3PBUA 1UB3A 1LRNA 3CM4A 1FWTA 1MO0A 1N55A 3A9IA 1TJRA 3GKFA 2A7RA 3LX9A 3UZ5A 1O94A 3O6YX 3PBYA 3S0CA 3G18A 4QJ1A 3NQEA 3ZS4A 1K7FA 4AXKA 5AHFA 1WDWA 1G69A 4IX2A 5HUPA 2FQIA 1O60A 3CEUA 5E1QA 2E68A 5G2IA 1UBSA 4IMGA 3SJ3A 2YW4A 2PRMA 1YPFA 3R13A 4A21A 2TPSA 4AB4A 4JN6A 3TQVA 3W84A 4Z0JA 1NVMA 1P0NA 4G1KA 4RXFA 4WX2A 3M44A 2NLIA 2JKPA 2WSQA 3O6DA 3QC3A 4XWUA 3LCHA 2GQ8A 4RJEA 3G1FA 4U28A 1YDOA 1D3HA 2Y7DA 4NJHA 3W71A 4DPQA 4A29A 1RQEA 1OFQA 3O15A 5CKSA 3WFAA 3KX6A 4YXGA 4MVAA 3UPWA 1QOQA 2QCDA 3W88A 3L5MA 2R94A 2Q8LA 4A3UA 1XFBA 1S5TA 2JKAA 5DELA 1KA9F 4JDBA 1H7XA 2B4GA 4IJBA 2YX0A 1OX5A 2DZWA 5DXXA 4GRSA 2YSWA 4JTLA 4N9DA 3C3NA 2V5LA 3C8FA 3EXRA 1ONRA 3WJZA 1SO4A 4W9TA 1KLYA 1AW2A 2CLKA 4O4WA 1RVGA 4JYEA 2A7PA 2D73A 3U6WA 3ABSA 5AN7A 4FNTA 1OK6A 4IXHA 3SGZA 4YLWA 3NQDA 3W1QA 3HG4A 5D2XA 2WO5A 4NJJA 3LV6A 3P81A 1ZAJA 3NQ7A 4UNLA 4K7VA 7TIMA 3LB0A 1FCUA 4DQWA 4FX6M 4O12A 3EX4A 3TQ0A 2C0AA 2DZTA 1NF7A 3S5YA 1KM2A 1OFPA 3KVMA 4POCA 1OFOA 3B05A 3DFNA 3W87A 4I7WA 2O7QA 3ZWTA 2X30A 2Y7EA 2BTMA 3DFTA 3RF9A 3NQFA 2Q3RA 1KFEA 1OFAA 2YGYA 4L4LA 3HJZA 1Y0EA 1DQWA 3G1YA 1YADA 3RK8A 3Q94A 4JTIA 3W86A 2PCQA 3M47A 1PE1A 1TPVA 3W1LA 1W8SA 4XKYA 1XBXA 5HWJA 5LSMA 4WY0F 5I3IA 3TJXA 3STCA 4S2BA 3B8DA 4K8EA 4UMAA 3W2NA 3S1WA 4K7YA 4Q33A 1ZCOA 4K39A 2QCLA 3C6CA 4E2BA 3EWWA 2VXNA 4O0KA 4Y9AA 1OX4A 1I4NA 4LVBA 1SO5A 1KW1A 1N8FA 1LTDA 2CLHA 1ME8A 4LT9A 1JUBA 5HQEA 3TSBA 5G2WA 4QM1A 3E02A 1LLWA 4LTSA 5AHIA 2YZRA 2ZCGA 4JIQA 2ZZ1A 2ZTKA 3W7DA 3PSVA 4I7UA 4O53A 3QW4B 1A50A 3L5LA 1YYAA 3FS2A 4N6FA 4JXCA 3LCLA 4FX8A 4R53A 4Y90A 1FXPA 5FF2A 5G1YA 2C1HA 4JTTA 3CQ0A 4EWND 5LHEA 3STFA 1B57A 2CLOA 1LOQA 4OWGA 1SZGA 4UCGA 2Y7FA 5DCBA 1YDNA 1O5XA 4AH7A 3KXQA 4OBTA 1G4TA 1EP2A 2VENA 3EXTA 3LTPA 5CZSA 2Z1BA 3ABQA 4MZ8A 4MKNA 3UD6A 3BGJA 1XBVA 3GVGA 3DGRA 1LROA 1KM1A 4ALDA 3N19B 2QCCA 4E0CA 1W54A 1E51A 1EIXA 1SW7A 1DHPA 1JCMP 3OIXA 1H5YA 2E5BA 3HGSA 4JTJA 5KSWA 4MPQA 2V0TA 4UTHA 3QQ0A 3DZ1A 4XTIA 4MFEA 1V5XA 3NNTA 4N9BA 1TQJA 3SI9A 2E6DA 5AHNA 3RLUA 3HG5A 1VH7A 1OF8A 3CWNA 1VPXA 4ZL1A 3MP5A 4I9AA 4PL1A 1P0KA 1GZGA 2E5DA 3TNOA 2QAFA 1B4KA 3IVSA 4JYDA 2WNZA 1U5JA 4CNNA 3HIJA 5AHLA 1JCYA 2RFGA 4OE7A 2QDHA 3RNDA 3EKLA 3EEGA 2PRLA 3W70A 5AOUA 2EAWA 3BO9A 3B04A 4FNPA 1W3IA 3HB9A 4GWEA 3W7PA 3MYOA 3CIXA 4BWLA 3YPIA 1G4PA 1KBJA 3FYPA 4UTUA 5KITA 5D09A 1I2PA 2FPTA 2Y85A 3NXFA 1J4EA 2QF7A 1DV7A 1GWJA 3E0IA 4U4MA 1XDLA 2H3DA 3W2JA 3N14A 4IOTA 4FNRA 2W6RA 1EWDA 4LS0A 1MSSA 4GUHA 2A2IA 1XC4A 2E6YA 3LTYA 1FWRA 1YTDA 1W56A 2ATSA 1H60A 1Q6OA 3MHGA 3DFPA 3L5AA 2GPTA 3V1PA 1JQXA 4XTDA 1F74A 1J2WA 2BX7A 3NPWA 1W5OA 5HNRA 1ZHAA 5K9DA 3DFOA 3T78A 3FIGA 3IVTA 1TSIA 1YXDA 3INPA 1EP3A 2EGZA 3BVJA 3W7QA 1OJXA 3W7IA 4O1DA 3C2EA 5J5RA 3EWUA 4NNCA 2FTPA 4GUJA 2GJLA 2QJHA 3B4UA 4LVAA 3GDRA 4HPJA 2ZTJA 3HOJA 1N7KA 4OQVA 3EWZA 3LXCA 3V75A 2ZZ6A 4AHQA 4JY9A 3OA3A 3EX6A 1WQ5A 5EBUA 1EX5A 5G4WA 1IF2A 5K4XA 4QSHA 3O6CA 4HNNA 2WNNA 2ZRYA 2ZRZA 1TPH1 2ZZ2A 2Y88A 5SWUA 4M7TA 3IGXA 2FLIA 3T40A 2CZFA 1K7XA 2AQWA 1OYAA 4AMAA 1AMKA 1TO3A 1QO5A 2G95A 2V9DA 1G6CA 5IBXA 3FYOA 2YR1A 3PBVA 1SPQA 4R7JA 2ZA1A 1W5QA 4O13A 4DO4A 5TQLA 2ZRUA 3G22A 2Y63A 3U2OA 2QUVA 4IGHA 1H51A 3M5YA 1A5SA 3SIZA 1XM3A 3GLCA 4IMFA 3QPYA 2VEKA 4AVFA 2NWRA 5HWNA 1F2JA 3KAOA 3LHWA 4UMBA 4HSNA 3TXZA 2GQ9A 4AWUA 3C2OA 3BK0A 3OVQA 2ZYFA 4RZ4A 4Q4KA 1JQVA 3FFSA 3LDVA 3L21A 1VS1A 4BI7A 4O28A 5CPLA 4UTWA 3AJXA 4JTUA 2X16A 2ZRWA 5K9XA 5K4ZA 1BWLA 4KWWA 1A5CA 3N9SA 5KZDA 3TW7A 1L6SA 2B7NA 2JK2A 3LHYA 3MHUA 1M7PA 2VFGA 5HINA 1CI1A 1TPDA 1YXCA 4CNPA 2RDUA 4MYAA 4UTKA 1H63A 2G97A 3PSWA 4BR1A 3IIZA 1XDMA 4OGZA 1H1YA 1L9WA 1Z48A 3GAKA 2YYTA 1UCWA 2ZFAA 2V82A 5U4NA 3QMSA 3GDKA 3C2RA 2VEPA 4M7SA 1SZEA 2R91A 4ZVJA 3W7OA 4FO4A 1QCWA 3I68A 4P61A 3T44A 4Z1BA 4QNWA 4I7VA 3UWWA 2H8XA 3NPUA 3STEA 2KZHA 3BARA 3R2GA 5DBUA 2I14A 5EL1A 5FF4A 3UWYA 5EPDA 3M7WA 1KFLA 3BG5A 1SSDA 3TW6A 5A5WA 2C6QA 3W7NA 1XUZA 3NM3A 1TTIA 1Q6RA 1QR7A 1LBFA 2DU2A 3W1NA 2P10A 1KFBA 3GAYA 1GVRA 3QH2A 2F84A 1H7OA 1SO3A 4UMCA 4KFPA 5FEPA 4JICA 1GG0A 2FB2A 2AAMA 3HO8A 5D30A 2UV8G 3VE9A 4QQ3A 2VFEA 2C16A 3G1AA 4Z1CA 4GUGA 3WJWA 3MMTA 3GK0A 3MP3A 4YL2A 1ZY9A 1JRCA 5I3JA 3L0KA 1TV5A 1R2SA 4LOCA 3W3OA 1PHWA 1BTMA 2GQAA 2ABAA 4NJGA 5U7SA 5L9FA 3TAOA 3NM1A 5HJLA 2WSRA 3MO7A 3P61A 4BI6A 1IXQA 3MHFA 1SZNA 1Z42A 4RCXA 5F2GA 1PCKA 4PEKA 2BLEA 1GVSA 2H3BA 1TPWA 3IIXA 4TO8A 2YDAA 2NX3A 1I2NA 1HG3A 1ZNNA 1SW3A 3IGUA 4IQLA 3E12A 4PODA 3PBWA 2C19A 1TPFA 2QUUA 1K7EA 3IRDA 4NZFA 2BZNA 2DJLA 3O05A 3W7HA 3Q58A 2E6AA 4HNVA 3P74A 3GIYA 3S1UA 5DXYA 1L6YA 4JTHA 1K8YA 2NV2A 5C6MA 1Q6QA 4R34A 3GB6A 4EVZA 3R8RA 3BG3A 3A22A 4IMDA 3EWXA 4O1CA 3TV8A 4AHOA 2R8WA 1NF0A 4ZQPA 4CCDA 3QPZA 2G5WA 1W5MA 1HO4A 4O50A 3MI3A 5CGQA 1AL8A 1C8VA 2DZVA 3UWVA 1KBIA 4EF8A 3L2IA 1G4EA 2JKEA 3BGGA 3DI1A 3I7SA 1QDSA 3S5OA 5L6UA 4BK9A 2XFWA 4DELA 3TIMA 1W1ZA 3W74A 3QMRA 2G96A 1UJPA 3M6YA 4H6KA 2QKFA 3LRMA 1RPXA 3SGUA 4XQ6A 5EY5A 2GOUA 4UTIA 5CSRA 3W83A 4O15A 1GTHA 2QCEA 3KRZA 1YTEA 5F1VA 5K9CA 4JEQA 1TREA 2A6NA 3NO5A 1RD5A 3L0GA 3S9YA 4FNUA 3K30A 4MJMA 1VCFA 3M1ZA 4Z1AA 3MUXA 4GC4A 4LS2A 4MYXA 4CNOA 3TFCA 2EF9A 4CCEA 3I6RA 4O8RA 3MP4A 4B5NA 1OFRA 4WZHA 4PCFA 4DBEA 3W22A 1R2TA 5D2WA 2YYUA 5LKYA 3NR0A 1XL9A 3WJSA 4JX6A 3SFKA 3HGOA 4HIBA 1WBHA 3FKKA 1PL9A 4O52A 1VLWA 1SQ7A 3DFSA 1JR1A 3G1VA 4KFOA 3LM7A 5AYYA 3KHJA 3CHVA 3KRUA 2NX1A 4DF2A 3PS7A 3H53A 1RQBA 4UTTC 2ISSA 1KTNA 3O07A 4TU1A 1K8XA 3A5FA 1O4UA 3NQVA 1VYSX 3MYPA 3DHDA 5KZEA 2Z6IA 1KFKA 4E2DA 1FCQA 3I7RA 1TPEA 2QR6A 3T4CA 2AGKA 4JR5A 2CZEA 1I45A 2J9XA 3B0PA 3TX9A 3TH6A 4WXYA 4DO5A 4H4IA 2WQPA 4ZQCA 3UXAA 3TUUA 1EP1A 4MFDA 4CQ8A 1F7BA 2YCEA 2VEMA 1QFEA 4MY9A 1QNVA 5AB3A 2VFIA 3M16A 1ZJIA 5MHBA 3S42A 3W1RA 2J9ZA 4Z1DA 3HG3A 2QCFA 3HGJA 4LU0A 1EUNA 1VHNA 3NVTA 4ZZ9A 1YDVA 4JTEA 2A21A 2QJGA 3G0SA 1TTQA 2PE4A 6ALDA 4YCPA 3TXVA 1W3NA 3CLMA 3HGRA 4ADTA 2P1FA 1DQXA 3KVJA 3L66A 5C54A 3E9AA 5DY2A 4JIPA 3TC7A 4LRSA 3N73A 2ZRVA 1TRDA 3NL6A 4FNSA 4YWIA 4LV9A 4NQ1A 4C1LA 1HO1A 3W07A 2Q8ZA 2C3ZA 2XN1A 2XN0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3RG6 A;  1G7U A;  3E49 A;  1P6C A;  3PFR A;  2C14 A;  4JII X;  1J5T A;  1V7Y A;  1C7S A;  4EPK A;  3AIB A;  4UTT A;  2DQX A;  2V3G A;  4GBU A;  2VFH A;  3KVL A;  5MKG B;  4IHC A;  5TF0 A;  1FDZ A;  2ZDS A;  3C52 A;  2QVN A;  3A21 A;  2NXG A;  2NQ5 A;  4LYR A;  1GPW A;  1V8E A;  1NP0 A;  1D9E A;  2OCZ A;  3WN6 A;  1C8Y A;  4QS6 A;  1OG0 A;  5BOE A;  4C65 A;  2O92 A;  3BCD A;  3PB0 A;  5I00 A;  2X8R A;  4G2D A;  1FWC C;  1EIB A;  2E9L A;  4XBS A;  5HMD A;  4RUB A;  4NYU A;  4V2X A;  5CG0 A;  4O18 A;  4RX0 A;  1M03 A;  3PZQ A;  1VFU A;  2X2G A;  4W4Q A;  3M7S A;  1QUM A;  5JBF A;  3DH7 A;  1QTW A;  4KKX A;  1P4C A;  2QDE A;  3UYC A;  4IUG A;  1QRQ A;  1XDJ A;  1XLK A;  4N9E A;  1F4H A;  3DYP A;  3K4W A;  3TJ4 A;  4I6V A;  6PTD A;  4W85 A;  4RPP A;  1XG4 A;  2GJR A;  1IIG A;  4MWA C;  3NG3 A;  4UXD A;  2PDP A;  4ZO6 A;  2PF0 A;  5E93 A;  3ME3 A;  1VEP A;  2TMD A;  3EMQ A;  3TML A;  4UR9 A;  3W1A A;  3MPG A;  3W1M A;  2EQD A;  3PM6 A;  4ADS A;  1MXG A;  1ZEN A;  3N2O A;  2VOM A;  4E2O A;  2PSN A; 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