4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
2X8RA 3AXXA 2YL6A 3B8SA 1BFNA 5A2CA 1BQCA 3O2LA 4DUXA 1MQPA 4D6EA 2JALA 4CU8A 1OB0A 1QNPA 1UA7A 2Y4SA 1GORA 1C90A 3POCA 3VD7A 4AWEA 2OYKA 2VNCA 4P7LA 4BQ3A 2CEQA 3VIHA 1Q6GA 1AVAA 1EIBA 2O92A 5C70A 3MV11 4WKAA 1GVYA 1HJWA 3F5JA 4AZ5A 5I2UA 4GINA 5GPRA 1UUQA 4GQRA 4Q22A 4C90A 5CPSA 1PX4A 3CMJA 3WBAA 3ARWA 1W9UA 4B9YA 4E2OA 2W91A 1HP5A 5A8MA 3ZT6A 1CLXA 3PZOA 1Q6DA 5A1AA 1XYFA 2B31A 6TAAA 3T2QA 4D6CA 4Z2IA 5EFFA 2VI0A 4AD5A 1CENA 3NCOA 3PBGA 4E8CA 1UZ4A 4NZCA 4HU8A 3RCNA 4PSPA 4CD4A 4TXEA 2V3FA 2DGAA 2UY5A 3L4TA 3NIYA 2DH3A 4MADA 4QCEA 5JBDA 1CXFA 3NSXA 4GZJA 1ZL1A 1GOMA 2BHUA 1MXDA 2VJXA 4JCMA 1OWQA 2ZX6A 4EK7A 1JZ8A 1JNDA 5IDIA 2VVSA 3LMYA 3FHQA 3QHOA 2DEPA 3AS1A 3BLKA 3WNOA 3ZT7A 2DT3A 2PBGA 3BAKA 4NRRA 1QW9A 5ABHA 1UR2A 4EKJA 1NOWA 3AMGA 1E0VA 2WMIB 5BXTA 5CPTA 4U33A 3L4YA 3L4VA 5CLWA 4YHGA 1HT6A 1WZAA 4UFHA 3U7VA 3N04A 1MW2A 2WBGA 1FH9A 2NW0A 1QPKA 4H8HA 4RE4A 3W53A 3EMCA 1JZ5A 1JZ7A 1E3ZA 1V03A 3WDRA 1TVPA 3AYRA 4ACZB 1DWFM 3ARQA 1RPKA 3UESA 3AOFA 3W26A 2V38A 3WMBA 3SUUA 1EO5A 2WLYA 3I3BA 1XRVA 2YA1A 4H8UA 4HMDA 3W27A 3WDHA 4W8BA 5C71A 3KL3A 2WKLA 3GXIA 4OUEA 3SCQA 4CU7A 1VRXA 2W61A 2NT0A 4RE2A 4J3SA 1DWJM 1QI2A 3OGVA 1MW0A 3N12A 1KCKA 1E6PA 1E4LA 2GJPA 4CN1A 1VBRA 4J27A 4U2YA 5CZKA 3CHDA 1GZJA 2XM1A 3KL0A 3UCQA 2A3CA 3ZJKA 3AIUA 3CZKA 5E6ZA 3SUSA 3AZRA 1H0GA 4A3YA 3T2PA 2ZXAA 4JKLA 1B0IA 1B9ZA 2AAAA 1QNQA 3A3HA 4UZUA 1H3GA 1X1NA 2VQUA 3NJ3A 3KWXA 2ZIDA 1CGUA 2CHOA 1EDTA 4DM2A 1PIGA 1QBBA 4AIUA 1FOBA 4UCFA 1BPLB 3G6LA 4HA1A 3SUWA 5CGMA 3EDJA 1HXJA 4GPNA 3GM8A 1PX3A 1JDDA 3IAQA 2NT1A 1SR0A 4OBRA 4AZGA 2WHMA 3WIJA 3GBDA 5ECUA 2J7CA 2VZVA 1PIFA 4OIFA 4BA0A 2QPUA 1ISZA 5BXPA 3ZSSA 5D9MA 4AD1A 3AZTA 2XJ7A 3WUEA 3VX0A 3WD3A 2WWDA 1J0IA 3W6LA 1C8QA 4CN4A 3CBWA 4CCDA 4Y7EA 5D9PA 4PTMA 3ZT5A 3UG4A 1NOUA 2WSKA 4B3LA 2Y5EA 1IT0A 2WLZA 3JUGA 5D4YA 4WK9A 2OSYA 4Z2HA 2W63A 1CDGA 3CO4A 3VDCA 1B90A 1UKTA 2J62A 2BVYA 1RH9A 5I6SA 2F2HA 1BG9A 3W82A 3OLIA 1V08A 4HZ8A 4JHZA 2FDMA 1GHSA 3VIMA 1KWKA 1EDGA 4S3KA 2VR5A 1A47A 1BYAA 1GUVA 4FLQA 1TA3A 2F8QA 3RM9A 3N11A 2J78A 5A6SA 2CIPA 4CD6A 2JIEA 1SFSA 4AISA 4H8VA 3W28A 5GNXA 2DSWA 2VZTA 1OT1A 1JGIA 1U30A 5E09A 2BY2A 5A2AA 4UTFA 3WNNA 3FXYA 5GQBA 4U31A 4HPGA 2WVUA 3A4AA 5CPQA 2Q8XA 1BHGA 1NP0A 1KXQA 2X05A 1V3IA 1TUXA 1E6RA 1CZ1A 3AIRA 4U2ZA 3W24A 1HVQA 2DIJA 2W67A 2XSBA 4W5UA 1UG6A 4ZE5A 1CEOA 1UR9A 4WSKA 2XHYA 1G0CA 1JDCA 1NM9A 4ZEPA 1E6ZA 1EH9A 2YLAA 2O9RA 2HVMA 3WQ8A 5CSUA 4U5IA 5A8PA 1R86A 1NH6A 2D24A 3BGAA 1VIWA 4AEEA 3PZVA 2D0FA 2A3HA 3PTKA 2OYMA 4NSBA 2E0PA 1E0WA 4QLLA 1EOMA 1WO2A 2D22A 1BGGA 3WUFA 1JFHA 2IUZA 3ARUA 1ITCA 2YOCA 4J3WA 1JZ6A 4HMCA 1YHTA 1E15A 1TG7A 1S46A 1HJQA 4GI8A 3OGRA 3EDDA 5I78A 4KGLA 1OCQA 1OGBA 2VVNA 4PTVA 1JZ2A 4W7WA 1DWIM 1V6XA 4PMDA 4HPHA 3VIOA 2CNCA 2QF8A 2XWEA 3BSHA 3RJXA 1US3A 1A3HA 1EDQA 1JF5A 1BYBA 3GXMA 1LL6A 1UR8A 4JL2A 2MANA 1C7TA 1WP6A 4WIWA 3L2LA 3K8KA 3CIVA 4UFJA 4KMQA 1US2A 1B31A 4PMZA 4EE9A 1QNRA 4LX4A 5FD0A 2WZEA 4QLKA 1GVIA 3DYOA 5BRQA 5CQ1A 4HOWA 1MW3A 2EPLX 3KZSA 4AW7A 3CUFA 1W1PA 1ZJBA 2VRJA 3SUVA 1E55A 1CIUA 1WPCA 1B2YA 4AEFA 4C91A 3WEZA 4JFUA 5A8OA 3CTTA 1UR4A 4D6DA 4ZENA 1UQYA 3VNZA 4JFWA 1LG2A 1C7SA 2QHAA 3FNDA 3VIIA 4HOZA 2DQXA 4WKFA 2G41A 2Y8VA 2FHBA 3SUTA 1MFVA 3WN6A 2J7HA 1UD2A 1UWSA 4F9JA 4B9ZA 3AFBA 1UYQA 4X0VA 3WEMA 2GVYA 1PZ2A 1LL4A 1J18A 3WUBA 4AYSA 4AC1X 3L4ZA 1XD1A 5DF0A 2UY2A 4F79A 2C7FA 3CPUA 1C93A 3IK2A 1I1WA 3RJYA 2HISA 4M1RA 4HTYA 4PMXA 3D5HA 4UFKA 4X9YA 1HIZA 3CHFA 1Z32X 2JEQA 4NRSA 1CYGA 3GXFA 4W88A 3ARZA 1PEZA 1TA3B 1BSIA 3GXDA 1G1YA 2J47A 4LYQA 3AJ7A 6CGTA 3ZJ6A 3CUGA 3WNPA 4UR9A 2GJRA 1V3LA 3W37A 2ZWZA 4A3HA 3QOMA 4MB5A 3ARTA 4GQQA 3UEQA 4IPLA 1HJVA 4MNKA 4CUCA 1M7XA 2D2OA 2BHYA 2QMKA 3U57A 2WZHA 4M82A 2DT0A 2BFGA 1RD6A 4J28A 4IISA 3SCRA 2WCAA 1KQYA 2GK1A 2DIEA 1P6WA 3BMWA 1XD0A 1CXLA 4ATDA 1PX8A 1B3YA 1R7OA 1GOQA 1XV8A 4ZE4A 2RGMA 3VD3A 4CVUA 1MQQA 4JZ5A 1X6NA 1XYZA 4PMUA 4DWSC 5ABEA 2WC4A 2CXGA 3VM5A 3VIKA 4AY1A 4OBSA 1YQ2A 2CBJA 2BNJA 3AIWA 1CECA 2VQTA 5LA0A 4C7GA 3WDPP 1W9VA 1V0MA 2XWDA 1JI2A 1J0ZA 1E73M 1E71M 3WH6A 4M80A 3WF3A 2XM2A 5A6BA 1CWYA 3OGSA 5CG0A 1BF2A 1K9FA 2WCGA 4PMOA 3WQVA 1CLVA 2E40A 1GNXA 2J75A 3MUAA 3T2OA 4QP0A 4LXFA 3LPGA 2EPKX 5M17A 1UH3A 3OLGA 1MW1A 1OT2A 4LYPA 5M03A 3DHUA 1WNOA 3EMQA 3CLWA 2RGLA 2BXYA 4AD2A 2VTFA 5E0FA 3WSUA 1VENA 1TMQA 3M7SA 4AD4A 1E0XA 1E4IA 5A6MA 3PN8A 3VDBA 3J7HA 4W8LA 1WZMA 3AIVA 4Z2KA 4C7DA 5BYWA 2XVKA 1OINA 5HNNA 3AROA 2Z1KA 4BQ2A 3QOKA 1JYVA 3TTQA 2DSUA 3RO8A 2ZUVA 4U3CA 2VX4A 2OWXA 4UFMA 3AHVA 2WC3A 3WD4A 2OSWA 4PMVA 2IXVA 4DM1A 3DYMA 2ZUSA 1K9TA 1HN1A 1G01A 1EQCA 1Q6EA 4P7RA 3SCPA 1XGZA 4P7NA 2G3MA 1F4AA 3VM7A 2WSPA 2BY1A 4YN5A 3W81A 3MSGA 3POHA 2JE8A 2WKGA 2CETA 4L4PA 2D3LA 1D7FA 1C91A 5E0CA 1EO7A 4AD3A 4UFLA 4XX6A 4WLCA 3AHTA 2XG9A 4W84A 1CGWA 3K1DA 1BAGA 1HJUA 1E56A 4B16A 3ZJ7A 3GBEA 5DT5A 4AZ7A 2WB5A 5M3WA 3MO4A 2F61A 2J7FA 5A6BD 1WB0A 1OGGA 1GOWA 1LG1A 3BSGA 3DHPA 3WQ4A 3WF4A 1W9BM 1SMAA 1JD7A 3D3AA 1W32A 3FAWA 2X0HA 1FFRA 2QPSA 2VZOA 1K9DA 3A4XA 3RMEA 1V3KA 1JIBA 5BROA 3ALFA 1QHZA 3CGTA 3WQ6A 1TVNA 1UD8A 1Y7VA 3TA9A 2XGBA 1FA2A 4PBGA 3VUPA 1K9EA 3WD1A 1H1NA 3PZQA 1D3CA 5BRPA 1HKJA 3AHYA 3AS2A 1UWTA 3PZUA 3UERA 4Z2JA 1UA3A 3TTSA 1KR1A 1UZ1A 2GK1B 5CGTA 3VDAA 2WMJA 3U5YA 3ECQA 1ODZA 1MFUA 4JIEA 4MAZA 3EDEA 1CGYA 2DSVA 3UR8A 1QI0A 4WJXA 1QNSA 2X2YA 1W3KA 1E1FA 2WANA 3VX1A 2OWWA 2WMHA 4UOZA 2WZIA 5HOSA 1KBKA 3CUJA 4FK9A 3AS3A 2WMKA 4M81A 5D8WA 3APGA 1KXVA 2VMFA 3T0BA 1OIMA 4PTWA 1HP4A 3IJ9A 5A6KA 3PZ9A 3RM8A 1W9PA 4S3JA 2JF6A 1HNYA 2WPGA 5I3DA 1W91A 2G4FA 2G8ZA 2JFEX 2W4XA 3PZIA 1C92A 1X6LA 1UWRA 2G3IA 4AZCA 3T0DA 1QVBA 1GQJA 1FFQA 1KFWA 3ZR5A 2PWFA 2BV9A 3G6MA 5I77A 4GKLA 3NYDA 2PBOA 3F5KA 3WY1A 1F4HA 5HDRA 5D8ZA 1JXKA 4UQCA 1OGSA 4WKHA 1H2JA 3SEPA 1L8NA 3AISA 1QHPA 1EHAA 3M6DA 4UQAA 5DMYA 3AXIA 2WHKA 4PYSA 1ISYA 1V6WA 3MUZ1 2V3DA 2J4GA 4PTXA 1JDAA 1V6YA 1VB9A 2YL5A 3KL5A 5ABFA 3BCFA 4NF7A 3B9AA 5LA2A 4W8AA 3GYCA 1DHKA 5DEZA 2EPOA 4PUEA 3N9KA 2WAGA 2CPUA 1JD9A 2VCAA 2GJXA 3EBVA 3A47A 1E72M 1W2VA 1VEPA 5HPCA 1KWGA 4M56A 3WQWA 1KB3A 1VFOA 2OYLA 2E8ZA 2XVLA 1J11A 2E3ZA 4HA4A 4PUDA 1CPUA 2JEPA 2V3EA 5FOOA 1HL8A 2NSXA 1VJZA 4FLOA 2D1ZA 3VKKA 1W9XA 4PCTA 1Q4NX 3QHMA 4CD5A 4URIA 4LYRA 1E5NA 1JF6A 2BS9A 4PMNA 2WWCA 1ZJAA 3K8MA 2UY3A 2CBUA 4GI9A 1M53A 3WF0A 2CERA 3WNKA 4D71A 2E9LA 3FN9A 1DWGM 2IXUA 1KXHA 4R27A 2XTKA 3WF1A 2C8NA 2W62A 5IHRA 4RL3A 3PZMA 4FLSA 1XSKA 4BS0A 2CITA 1C8YA 1KGUA 1B3WA 3L4XA 1PJ9A 2WBKA 3B9DA 1V3JA 5IXEA 1V0LA 3BMVA 5I0DA 4GI6A 1G5AA 4BZYA 3LPOA 4MDOA 4OZOA 1K6AA 5A2BA 1OD8A 1KGWA 3K4DA 1NARA 2EXOA 5JIPA 3W6MA 2PC8A 3IJ7A 4J7RA 4MB1A 4U3AA 2BHZA 5C8BB 4MNMA 3UETA 1GQKA 1HKKA 4OOZA 3AXHA 1M01A 1G9HA 1GOKA 1HJXA 3ZIZA 2CBVA 3CZGA 2CHNA 1CNVA 4CKQA 1W3LA 2J8FA 1QI3A 3SCNA 5HXMA 1V02E 2ZUUA 3CMGA 1UD3A 4V28A 1TFVA 4E8DA 1VEMA 5A3HA 4ATLA 5M5DA 1UD5A 1EXPA 5EBAA 3QHNA 2ZX9A 1GJWA 2WXDM 3GTNA 4F66A 4CN6A 3VIJA 4AMCA 2W5FA 2E9BA 4MB3A 4UOQA 3WKZA 5JBEA 1CGXA 4D6JA 1H5VA 2ZE0A 1V6UA 3HN3A 1UWQA 5D9NA 3CHCA 3TP4A 5E9AA 7CGTA 3T0AA 1XH2A 2WW5A 2BVDA 1CXKA 3K8LA 2PWGA 3MSDA 4PMQA 1H0IA 1UWIA 4MPKA 5JIWA 3AYSA 4D72A 2X1IA 3ZJ8A 4JHOA 1MYRA 4HA3A 3PZGA 3VMPA 2WMFA 4JL1A 3WFZA 2D20A 2DDXA 5I79A 4AD0A 4N42A 4ACYA 1W1YA 1HJSA 2XFYA 3LPPA 1JL8A 4Z2GA 4P8WA 4L4OA 5A6AA 4MAVA 2AOSA 2QV4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2QAP A;  1OC5 A;  4F40 A;  5C2X A;  3AQU A;  2XN0 A;  4K0K T;  3HPZ A;  2YCI X;  3C0Q A;  5F4W A;  3W7P A;  4DEL A;  2H7V C;  4MYA A;  3FXD B;  4QRO A;  3UWV A;  4W9T A;  2EBN A;  1EOK A;  3OBE A;  3LDQ B;  5CPL A;  1XH0 A;  3LXC A;  2HBV A;  2WU2 A;  3RCM A;  4WF7 A;  2CM0 A;  4JIH A;  1S2U A;  3ZO9 A;  3UW6 A;  4ZS2 A;  4NZ3 A;  2ICS A;  3MZK B;  1PTD A;  4LFY A;  4JTH A;  5DRI A;  2ZRW A;  5H8U A;  2UXX B;  1GEQ A;  2MNR A;  2XQ6 A;  1M68 A;  2V5C A;  4IT1 A;  2H3D A;  1VPX A;  3GYE A;  4IE0 A;  4MFD A;  3AEB A;  2ZDR A;  3LHT A;  2DVU A;  4O2B E;  3ES8 A;  1ISV A;  1F6Y A;  6ENL A;  3G77 A;  2GQ8 A;  1MRQ A;  5HA7 A;  1EJR C;  3WEN A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X8R A;  3AXX A;  2YL6 A;  3B8S A;  1BFN A;  5A2C A;  1BQC A;  3O2L A;  4DUX A;  1MQP A;  4D6E A;  2JAL A;  4CU8 A;  1OB0 A;  1QNP A;  1UA7 A;  2Y4S A;  1GOR A;  1C90 A;  3POC A;  3VD7 A;  4AWE A;  2OYK A;  2VNC A;  4P7L A;  4BQ3 A;  2CEQ A;  3VIH A;  1Q6G A;  1AVA A;  1EIB A;  2O92 A;  5C70 A;  3MV1 1;  4WKA A;  1GVY A;  1HJW A;  3F5J A;  4AZ5 A;  5I2U A;  4GIN A;  5GPR A;  1UUQ A;  4GQR A;  4Q22 A;  4C90 A;  5CPS A;  1PX4 A;  3CMJ A;  3WBA A;  3ARW A;  1W9U A;  4B9Y A;  4E2O A;  2W91 A;  1HP5 A;  5A8M A;  3ZT6 A;  1CLX A;  3PZO A;  1Q6D A;  5A1A A;  1XYF A;  2B31 A;  6TAA A;  3T2Q A;  4D6C A;  4Z2I A;  5EFF A;  2VI0 A;  4AD5 A;  1CEN A;  3NCO A;  3PBG A;  4E8C A;  1UZ4 A;  4NZC A;  4HU8 A;  3RCN A;  4PSP A;  4CD4 A;  4TXE A;  2V3F A;  2DGA A;  2UY5 A;  3L4T A;  3NIY A;  2DH3 A;  4MAD A;  4QCE A;  5JBD A;  1CXF A;  3NSX A;  4GZJ A;  1ZL1 A;  1GOM A;  2BHU A;  1MXD A;  2VJX A;  4JCM A;  1OWQ A;  2ZX6 A;  4EK7 A;  1JZ8 A;  1JND A;  5IDI A;  2VVS A;  3LMY A;  3FHQ A;  3QHO A;  2DEP A;  3AS1 A; 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