4O18 | Genus

Total Genus 165

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	165
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKATDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Structural Basis for Resistance to Diverse Classes of NAMPT Inhibitors. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	165
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-12-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4o18A02

5KINA 3M0ZA 5FF0A 1JCXA 3NO5A 1K8XA 4UMCA 5IBXC 3OBKA 3KVLA 3FLUA 5BMWA 2ZZ6A 5A8GA 2P1FA 3P8IA 3G0UA 1CI1A 3O1NA 3G0SA 5AHMA 1L6YA 1VLIA 1RQHA 1SZGA 3MHFA 2ZDRA 2CLHA 2EF9A 1H7WA 3M1ZA 4Z1BA 1TPH1 5F1UA 4O14A 3QMTA 1WOAA 3M5XA 4D2JA 2YZRA 1TB3A 3LCLA 4RCXA 3INPA 1J2WA 3CQ0A 1B3OA 1CW2A 4EF9A 4TR9A 1I4NA 2E5BA 4Q33A 2A4AA 2ZZ7A 1WOBA 3FKRA 2AQWA 5FEPA 1OABA 5D03A 1YADA 4LWWA 3SJ3A 4UUIA 3NEVA 3QRHA 1LBFA 3PB0A 2H6RA 3KFTA 3BGJA 2W0UA 1GVRA 5K9DA 4UC5A 1I2PA 4UTTA 2NLIA 4LS1A 1H7NA 4O54A 5CSSA 2Y61A 2ZA2A 4XKYA 5HQEA 5D2TA 1EWEA 3LV6A 3LI1A 4N9DA 1K3UA 3MBFA 4ORMA 5K9CA 1PCWA 2EHHA 4GRSA 3PY2A 4Q32A 4IPIA 1AW5A 1KM1A 1FWWA 4M7TA 5HR7A 4LT9A 3N3MA 4X22A 2PCQA 3FA5A 3C4UA 2ZZ1A 4MY8A 2BWGA 3LDVA 3ATYA 3RK8A 3UY8A 4RZ5A 3STFA 1SR9A 4KWWA 4AWUA 3DZ1A 1OFOA 3QJAA 1EUNA 4WX2A 1CX9A 3FJLA 4LVBA 2E6DA 1X1ZA 5F2LA 3T44A 2E6AA 1ICSA 3TJXA 4A21A 2Z6IA 3QMSA 4O0ZA 5EKYA 2I14A 4RV8A 3BGGA 3USBA 1XC4A 4DPPA 3F1QA 1P0NA 4ZL1A 5SWUA 4BI5A 3LM7A 1ZFJA 2O7SA 3G1DA 3LCFA 4DO5A 3RF9A 3I65A 3HF3A 2B7PA 3TKFA 3P74A 3HIJA 5K3VA 4UFJA 4MFEA 2ZZ4A 1W56A 4WQ6A 2ZYFA 1GOXA 3VI2A 4IX2A 3MHGA 1RPXA 1GWJA 1L6WA 5C6MA 1ML1A 3L5LA 4LVDA 1SZNA 2J9ZA 4ZZ9A 4EF8A 4WY0F 3IV3A 1QNVA 4UTWC 1KBIA 3G1AA 1XDMA 2C1HA 3EXTA 4IXXA 3W75A 1VS1A 1FWNA 4QNEA 1ZALA 4GC4A 2WSRA 4K6AA 2HTMA 3LCWA 1PHWA 2B7NA 5FEWA 4MKNA 2CLFA 1QAPA 1GTEA 1YPFA 1DJQA 5BRBA 3KHJA 3SGUA 4IPJA 5LZLA 3HPXA 1A5SA 1G4PA 2C18A 3N2MA 1XUZA 3W1RA 2DZUA 4OE7A 1HL2A 3N73A 5CZSA 3O05A 1JCMP 1K7FA 3NM3A 2YW3A 4JGDA 1EWDA 3UWQA 1SPQA 3F4NA 3N34A 1C29A 4OBTA 1L9WA 2DZPA 4NJKA 2ZRWA 1OX6A 3NL3A 2ZA3A 3B06A 4IQLA 1TPUA 5L9FA 4YMZA 2NX3A 4FNSA 4QNWA 1JCJA 5C55A 4O11A 3W2KA 3BO9A 3PC0A 4XBKA 2QAPA 2ZZ5A 4UTJA 3M5VA 2VEPA 3BG3A 4O52A 3CB8A 4JX6A 1A53A 2HMCA 2GQ9A 3QQ1A 1TTPA 5F2IA 3L9CA 3UWUA 3EKZA 4UTUA 2NXHA 3W1PA 3UD6A 1I8JA 1M6JA 4UFHA 1OK6A 1BWKA 3THQA 1YXCA 4JXCA 4O53A 2A6LA 3W88A 3NVTA 4O28A 1MEIA 1A5BA 3NPUA 4QJ1A 3BW4A 4N6FA 1LOSA 4JICA 3W2UA 2H90A 2OX1A 4Y6GA 3EX1A 4PODA 1MZHA 4M7SA 3EWBX 4HT3A 4OU1A 2QJGA 1B4KA 4NX5A 3F4WA 5CPOA 1W3TA 4FX6M 3NL5A 3MI3A 3BG5A 3FJ6A 2V0TA 1SSGA 5U4NA 4IWWA 1UUMA 1TIMA 2E68A 1FQ0A 2I1OA 4UMBA 3WK2A 4MIMA 5K4ZA 1KFEA 4RLIA 1JJKA 3QW4B 2FIQA 4O50A 4NVTA 5HMSA 1XUUA 1W37A 2VFDA 3HBLA 3TA6A 1I2OA 3W7CA 1LBLA 5HINA 2FTPA 2XN1A 1AL7A 3LRMA 2WJZA 1M7PA 2DZWA 2X30A 2QDGA 4DELA 3W2NA 1EPXA 5EY5A 3QPZA 4PL2A 3W1TA 3NQFA 3H54A 1SFLA 2NXIA 3W2JA 4O8RA 1V5XA 3O15A 4JYEA 5A5WA 1TCDA 1GG0A 2RH9A 4IMFA 3S8HA 7TIMA 3W1MA 3QYQA 1KM3A 1TTJA 2QCHA 3RNDA 2QCDB 4IMGA 3EWUA 3P84A 4AHQA 3GK0A 3MI6A 3DFNA 3PSVA 4Z0SA 1TPC1 3LTSA 4JR5A 3GKFA 1JULA 2FQIA 3S5NA 3PWAA 3AO0A 4Q4KA 1ZJIA 4ZVJA 3S1UA 1HO1A 5F4XA 2UV8G 5J5DA 4R33A 3PULA 2GJLA 3P82A 1QPRA 2YGYA 3I6RA 2EAWA 1GVOA 2DU2A 3V1PA 2NXGA 3DFOA 4I7UA 3NZ1A 3CLMA 1TV7A 1H5YA 3M44A 1TMHA 3BLEA 4RKAA 1FWTA 4AH7A 1KV5A 2DZTA 1ALDA 4FB7A 4UTIA 5DY3A 2D73A 4I7VA 1W5QA 1TSIA 1WBJA 4IGHA 3NAVA 1P0KA 4WZHA 2C14A 5FEXA 1VQTA 3NQDA 1OFAA 2ISWA 3TFXA 2G96A 3TSBA 2ZRUA 2Q3OA 2Z1BA 5TBOA 3QM3A 2HS8A 4BF9A 4IMDA 2VXNA 1XBYA 3S1VA 3JRKA 4E0CA 4Y9AA 3UWYA 4HSOA 3LTYA 2V8ZA 3G22A 3T55A 3M5ZA 1X8FA 1SU5A 3LXBA 2Y7GA 2J6XA 4Z08A 5D09A 2ZBTA 4HPJA 4OHQA 4UR7A 3IIOA 4RXFA 4YL2A 1TJRA 2TSYA 5U7SA 3YPIA 1SZFA 4PH6A 5AC6A 1F2JA 3TH6A 4A2SA 2CU0A 4FF7A 1T8XA 3UY7A 2V81A 1Z44A 3O06A 2YW4A 5I3KA 4UTHA 2OCZA 2OT0A 4CCEA 4PTNA 5AYYA 1RQBA 1AG1O 2J24A 1PV8A 4MZ1A 2ABBA 4ZQCA 4JYDA 3W1UA 2WOQA 4JX4A 2ZCGA 1VZWA 3A22A 1O5KA 1F74A 4M6VA 1H62A 2FPTA 1EIXA 2A7NA 5EL1A 4XZ9A 5KZMA 1ME9A 3GNDA 1G7UA 2ISVA 3H53A 5CPMA 5AHNA 2GUUA 5LNUA 3OVQA 4NUWA 3UWWA 3FKKA 1QOPA 3A5VA 1UB3A 3EX4A 3C3NA 1SW3A 2FDSA 2V2HA 1NFBA 2TPSA 2PRMA 2WNNA 2EGZA 2V5LA 1OYBA 3LB0A 4ML9A 3P8JA 2XN0A 2NX1A 4YCOA 3EWZA 2KZHA 4LC6A 3G18A 1EP2A 1RR2A 2Y7FA 1R2TA 1KFJA 5CZJA 1W5PA 3L65A 4JTSA 3Q2DA 5D32A 3FYPA 8TIMA 4TU1A 5CG7A 2VC6A 4IX0A 1Z48A 1VYRA 1RV8A 2V2CA 4WD0A 1Q6LA 1H7PA 5LNSA 5EPDA 1OHLA 1C8VA 2RHGA 2CZDA 2CLMA 2QCFA 4WXYA 1DJNA 3LHVA 3DXIA 3E0IA 3W7OA 4QM1A 3EX6A 4R7JA 1K7XA 3MP3A 1RZMA 4NX0A 4ONVA 1R2RA 3C2RA 5CGQA 2ZTKA 3E12A 3KXQA 4XWUA 3QQ0A 3NQ6A 4BFAA 4UNLA 4N9EA 4UFIA 1FWRA 2Y63A 5LSMA 1T99A 2QKFA 3GDKA 3OA3A 3G3DA 3O63A 4CQ8A 4UTTC 1QR7A 1UUOA 5F2GA 3GDRA 2GQ8A 2Y88A 3SY5A 4QAIA 1TRIA 1Q6RA 4O17A 3KVJA 4LS2A 5EBUA 3TQKA 2QUTA 2H8XA 4XTDA 1SQ7A 2OZ0A 3NPVA 3L67A 4K8EA 3HB9A 4DPQA 3PVFA 3W87A 1ME8A 1HTIA 5AB3A 2J9XA 2H3DA 4UTLA 3CWOX 2BSLA 4GWEA 3NQ2A 2WSQA 4JYFA 4GE8A 2QUVA 3NQGA 1IGSA 3TSMA 2V30A 3GDLA 4DO4A 5KZDA 1H51A 1QO2A 4LW7A 1ONRA 1MO0A 1SO5A 2ZA1A 4OT7A 3TROA 1THFD 3W1LA 4UNKA 3C2OA 3ZS4A 3IIVA 4GXMA 3UPBA 2AGKA 1VLWA 3SI9A 5J5RA 1WQ5A 4LVGA 3MWAA 2WKJA 1WA3A 3EKLA 3FFSA 3EB2A 3NGJA 5K2ZA 3PG8A 3LHTA 3TXVA 4QIUA 3FIGA 3CIWA 1LLWA 2YX0A 1V7YA 3NOEA 3OVPA 4AWTA 1GVSA 1KFKA 4O1DA 4QITA 3BK0A 1F6KA 3W7RA 4E2DA 4RZ6A 1FCBA 1B4EA 4LTSA 3SSJA 3C61A 1FCUA 3TR2A 2Q8ZA 3HG3A 1Q45A 3KVKA 4K7YA 3IGUA 1OYCA 3ELFA 1OFQA 3P81A 1KM2A 1JQVA 3NNTA 5LGXA 2ALDA 3MMTA 1AW2A 1EA0A 3T40A 2A5HA 5AC7A 1XBXA 3TXZA 4NU7A 1SFJA 5D2WA 1XXXA 2RDTA 4HHPA 1KTNA 3W73A 3S5YA 4UFMA 2A0NA 2ZRVA 1JUBA 4M5PA 3W1AA 5KITA 2J27A 1SO3A 1W5NA 2QCLA 2DJXA 1LYXA 4FXRA 4POCA 4Z1DA 4JTTA 1KFLA 1LOQA 4ZQPA 5HNRA 4TX9A 3G1SA 5CPNA 3Q37A 1YDVA 1NEYA 2E5DA 4JTFA 3KRZA 3G0XA 1W0MA 1H7RA 1KBJA 1LTDA 4JTHA 2R14A 1MEWA 3NPXA 5AHEA 3TCEA 2QCCA 2OMAA 4B5NA 3LXCA 3PB2A 4LOCA 5HJLA 3NA8A 4BK9A 2VFIA 5F1VA 3S1XA 1A5CA 4O4VA 2Y6ZA 2BX7A 3G1HA 1PE1A 4FNTA 1MEHA 3PS7A 2VOMA 3IGSA 3NXFA 2DZVA 4JTGA 5K4XA 2V2DA 2FJKA 2I9EA 4JTJA 4AXKA 3U2OA 1JCNA 1FXQA 2CLLA 3P61A 4WOZA 3CC1A 3UXAA 3EWYA 3LCXA 4O1AA 2PE4A 1QPNA 5D33A 3KVMA 4L4MA 5I3GA 3W7EA 1G6CA 3NR0A 4UMAA 4RX0A 3C2VA 3KOFA 4NJIA 4P61A 5AYXA 1K7EA 3GKAA 2NWRA 3SR7A 1EP1A 3W22A 3M9YA 5G4EA 1SZEA 2H8ZA 3MYPA 2VEKA 4MYAA 1KTCA 3BVJA 2GVGA 3WK1A 2WQPA 1SO6A 2CZFA 3WJZA 3G8EA 4ADSA 1I2NA 2Q8LA 5BNKA 4NZFA 2GOUA 4ZQNA 5AC8A 4MJZA 4XQ6A 1JUKA 1O5XA 2PRLA 1HG3A 3QH2A 3TK7A 1GTHA 3C2FA 4WY0B 4M6PA 5E1QA 4FHAA 3CWNA 1FDZA 3S5OA 3L0NA 3W83A 2A7PA 3P60A 3A24A 2CLKA 4QQ3A 4DF0A 4N4QA 4O4WA 1ZHAA 2RDWA 5HR6A 3EWWA 4NJJA 1IXNA 3GYEA 2VENA 5D05A 1B9BA 2JGQA 2OT1A 3EXRA 1QOQA 1BEUA 5FF4A 3N2XA 2CLOA 1X1OA 2QDHA 1H1ZA 1VRDA 1X6UA 4AF0A 2E5CA 1H7XA 1KLZA 5EMUA 3CEPA 1N7KA 2C13A 3SIZA 3W7DA 3I7SA 3T7VA 3W7GA 2WV8A 3PBUA 4R34A 4GJ1A 4KFNA 2VFHA 4UIOA 1IIHA 3W70A 3C8FA 3R8RA 3NDOA 4FIRA 3UZ5A 3W07A 5C54A 3UPWA 1XM3A 2ZRZA 1S5WA 2FFCA 4LC8A 4DEFA 1DOSA 3P7YA 3LCGA 4OV4A 2F84A 1F7BA 2VFEA 4MJMA 3TC7A 4JTLA 2C19A 4NT0A 5L6UA 3STCA 3GB6A 2Z0IA 2PURA 5DXYA 3HOJA 3TUUA 3UQNA 1QDSA 1OX4B 3HG2A 1KM4A 3CM4A 1AMKA 5F4SA 3THAA 4JX5A 2FPVA 4K39A 1DL3A 3QW3A 2TMDA 3P5ZA 1GYNA 2CLEA 4PC8A 5D38A 2B0MA 1L6SA 1TTQA 3HGOA 3PUDA 3B0UX 1ZAJA 4H6KA 2B7QA 4HNVA 4KFOA 3O8AA 1YLVA 1Q6OA 4C1KA 4AEOA 4E38A 3LCHA 3B0VC 3NL6A 3GR7A 1FDYA 4K7VA 1KM6A 4WOQA 2C3ZA 4JDYA 1K8YA 5DN1A 1AK5A 2DZXA 1I2QA 1K03A 2V5BA 2A1YA 4BI6A 1YYAA 4AHPA 2JK2A 4O18A 3W1NA 4E2BA 2WSYA 4MZYA 4R53A 4A3UA 5CZTA 1LCOA 3EEGA 5TQLA 3W23A 3LLDA 4UTKA 1KLYA 4GUJA 3RLVA 3LCIA 2W79A 3W72A 2Y7EA 4BWLA 4LV4A 1W8SA 1EP3A 2V9DA 3BW3A 5GVJA 2Y85A 4ICNA 1OFEA 5LNRA 3QC3A 3HPSA 4ZQOA 3MP5A 4AAJA 1WX0A 5KZEA 2YPIA 4MZ8A 1FCVA 4UR8A 1LP6A 5CZ0A 3S9YA 5FESA 3LGEA 1UASA 1OVDA 3EX2A 5C5YA 2BTMA 3FS2A 3A21A 3HG4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4O18A

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