1QNOA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
source organism Trichoderma reesei
total genus 146
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnoA00
1FP9A 2DDXA 4ZFMA 4Q7NA 1ZL1A 4OUEA 4LYPA 1JGIA 3B9AA 3BMWA 7TAAA 1E15A 2VTFA 3QHOA 1WDSA 4X0VA 2VZTA 1KBBA 3RILA 4MNLA 1B3WA 4W8BA 3AS0A 3WEOA 5BWFA 1GQLA 1E6QM 3L2MA 2ZUSA 1JZ7A 5HDRA 4BQ5A 4UQ9A 2G3MA 3VMNA 3WELA 4U33A 4X0NA 1NQ6A 3OG2A 4UOJA 2X1IA 5E70A 3WH5A 5GNYA 1OM0A 2WVVB 5FL1A 3W38A 1JDDA 1G5AA 3WQ5A 4ATWA 4NRRA 1PJ9A 3BH4A 5AYIA 1MXGA 2PWGA 2BY1A 2D3LA 2WVSA 3WH9A 2B31A 1UH4A 1X6LA 2BY2A 2GUYA 4QLJA 3SCWA 3T08A 4YN5A 3BAXA 4JHZA 5I2UA 1MXDA 3IK2A 4JFTA 2JIEA 3RO8A 1DTUA 2OYLA 1GOKA 8CGTA 2DH2A 5CXPA 3L4VA 2WXDM 1UZ1A 1EO7A 2WPGA 3QR3A 2WNWA 5A6BD 1ZJAA 1E6ZA 2DSZA 1BYBA 1CXEA 3AHVA 3LPOA 1E72M 3MS8A 3BXWA 1WDPA 3U5UA 4M1RA 1FH8A 3CHEA 5D9OA 3VX1A 1JXKA 4KMQA 3BSHA 5A6BA 4GZIA 3RMEA 2RGMA 2WSKA 1OBAA 3BAKA 3LPGA 3T2OA 1HN1A 3PZVA 1J0HA 3UG3A 2ZX8A 4UOQA 4QLKA 5ECUA 2MANA 3W25A 4B3KA 4DWSB 3AZSA 4PRWA 4ZENA 7CGTA 3IAQA 2XIBA 3PZTA 1KGWA 4LYRA 4AMCA 4PTVA 3QOKA 2Y8VA 2VX6A 1QI2A 3VIPA 3WQ8A 4QCFA 3AI0A 1J01A 6CGTA 2CEQA 1JDCA 1GVYA 1MYRA 3VMPA 2CKSA 4FLSA 3FHAA 5CLWA 2XFYA 4OBRA 1QHPA 1Y7VA 1XSIA 1GQKA 4UFHA 4W5ZA 1AQHA 5AY7A 4AD5A 3CIVA 1I75A 4JHOA 3PZNA 3IJ7A 4LYQA 1B30A 4E4PA 2C8NA 3AHTA 2E9LA 1WCGA 5HOSA 3AMDA 4BS0A 5ABEA 5AC4A 1PIGA 4AEFA 1TFVA 3WFLA 1VBUA 2VX7A 2D0HA 3L2LA 3W0KA 3WFZA 4URIA 2CITA 2WVTA 1BYAA 4HZ7A 5DT7A 3OA5A 3AZTA 4OBSA 2ZIDA 4AISA 1NOWA 2RGLA 1HJQA 2UY4A 5I3DA 1WZKA 2J8GA 3WSUA 1CGUA 5AYBA 4P8XA 3OZPA 1OT2A 2XWEA 3NSXA 1BGGA 1E3XA 3KE0A 4D6IA 1CXKA 5A6AA 4AZCB 4TXEA 1M53A 5C70A 2WMHA 4LPCA 1GORA 4RE2A 1G9HA 1CECA 1E70M 2ESCA 2NSXA 4CU8A 4AZ6A 3HMCA 3IAPA 2CHOA 4XZBA 1FA2A 2ZXQA 3KL3A 2CBVA 4UOZA 1XYFA 2EJ1A 3AIVA 1WDQA 4D1JA 4M82A 4UFLA 1W91A 1XD0A 2WCGA 1ECEA 2VCCA 1CTNA 1OB0A 1B2YA 4TTGA 3BAJA 4LGXA 4N0RA 1KXVA 3AJ7A 1UH3A 2PBGA 5A1AA 1E5NA 1W9BM 3AFBA 1MW3A 4PTWA 3WMSA 2D1ZA 1NWTA 4U2YA 1RD6A 3VO0A 2DT2A 3FXYA 4GINA 3TTOA 2XVGA 2PI6A 4XX6A 4QFUA 4HU0A 3SUTA 4UFMA 3GH4A 4PYSA 1E4LA 3EBVA 4J27A 5EFDA 4PMUA 4A3HA 4W7VA 2CCRA 1O6IA 4HMCA 5LA1A 4L4OA 1LL6A 1OCQA 1JI2A 4PTMA 3ZR5A 3UETA 2X09A 2GJXA 2WMKA 3WNPA 2VVNA 2YJQA 1LWJA 5CGMA 1GOQA 2XVNA 1RPKA 2NT0A 1L8NA 2WAGA 2WHMA 2XG9A 4W88A 3A6OA 1KXQA 1UKSA 1V0KA 3HU7A 4QLLA 2W62A 1VFFA 2XFFA 1NWRA 1TMQA 3WF1A 4H8UA 2CERA 4U5KA 3ZJ8A 4WF7A 3AS3A 1MQPA 3GNOA 1R8LA 2VX4A 3CHFA 1ESWA 2WCAA 4BZYA 3N12A 1VFOA 5FD0A 3BMVA 5ABFB 3WNLA 1VFMA 3APGA 1U2YA 3GZAA 5GNXA 3WN6A 4J7RA 1NOUA 2W67A 2FH8A 4J3SA 1WB0A 4B15A 2J74A 1J10A 3EDFA 2VQTA 3CMJA 3G6MA 1UHVA 1BG4A 1LQ0A 3DHUA 1PZ3A 1TG7A 1F4AA 1A3HA 4AZ5A 2WC3A 3AYRA 4MAVA 3WBAA 1UD2A 5FKYA 4D6FA 5E0CA 1BSIA 3GBEA 1UUQA 3VDCA 4JFWA 3VGGA 1E1EA 1QNSA 3AMGA 4CD5A 3ZT5A 1V02A 5I79A 3ZT6A 3RDKA 1UWTA 1ISXA 2W4XA 4OIFA 3POCA 2JALA 2DT1A 1W1YA 3MO4A 4TOQA 5I24A 2D24A 3ZIZA 1H3GA 4JZ5A 1PX4A 4GZJA 3GH5A 1EH9A 2XM1A 1D7FA 2CNCA 1E71M 3T2PA 1QNRA 1B3XA 3ARSA 3GXMA 4DWSD 4U3AA 3SUWA 2GDVA 2O9PA 1OGBA 3B9EA 4PTXA 2WMJA 3WD0A 1B1YA 5GNZA 1VENA 4CD7A 4HOXA 2F61A 4MB1A 2VZOA 3KL5A 1GONA 1EDGA 3GBDA 1PEZA 5CPTA 3A4XA 4DWSA 1ODUA 2GDUA 5CLTA 1G01A 3U57A 2JF6A 3WKZA 2AMGA 3DC0A 4JIEA 1XCWA 1XGZA 1HJWA 1CLXA 1ZU8A 5BRQA 5M03A 1GJUA 2O92A 4JKLA 1ZBVA 3VDHA 4PMNA 4U2ZA 1JZ5A 3SUUA 1UR9A 1UH2A 2BVDA 3K4DA 3CH9A 3II1A 3BAYA 3RM4A 2VCAA 1CDGA 2V5CA 4PEEA 1V0MA 3VIIA 5BROA 4PMVA 4BCEA 2WVUA 4IPNB 1C3FA 1HP4A 4NF7A 2A3CA 2VR4A 2EPNA 3F5LA 4HMDA 2J7CA 3K8LA 1KCLA 4L4PA 1HNYA 2J75A 1DHKA 4WLCA 1PX8A 2ZWYA 4IUGA 3RIKA 1E43A 1E73M 2X2YA 1TA3A 1V3KA 3SURA 2WBGA 1LG1A 4BF7A 1BG9A 4RE4A 1K6AA 4FLRA 4R5EA 4WKHA 2PB1A 4D6HA 1V3JA 2NT1A 1OGSA 3AIRA 5A6KA 4TVUA 3POHA 4AZCA 1CZ1A 2XGBA 3BSGA 3PZIA 3WQWA 2DSUA 4CU7A 1E0XA 4D6DA 2DSKA 4J3VA 5C8BB 3L4ZA 3WH6A 1SFSA 4M81A 4AW7A 4OZOA 4P7OA 4IM4A 2UWFA 4IPLA 1BYDA 3IJ8A 3AHZA 4JAWA 4CKQA 1XH1A 2CPUA 4CGTA 5A2BA 2E4TA 4Y7EA 1GOIA 5A6MA 2EPMX 4A4AA 2WMGA 3AIQA 1MW1A 2V3DA 5E9AA 1UKOA 3NSMA 3ZO9A 2BXYA 1PPIA 1GHSA 2WC7A 4MB4A 2G8ZA 3CZJA 5IXEA 3GH7A 4W7WA 3T0BA 3CO4A 1UKQA 3AOFA 3M46A 1X1NA 2C0HA 4EK7A 1R7AA 4YHGA 1V3LA 8A3HA 2YDRA 3ZOAA 2VO5A 3OGVA 1HJVA 2J7HA 3VKKA 2A3AA 3ARYA 3W6LA 2EO7A 1TZ7A 2WKLA 1QI5A 3VIHA 3WUBA 4XV0A 1EIBA 4AD1A 1GOWA 3FAXA 4MB5A 1KQZA 2WCSA 1HKIA 3PTMA 1J18A 4TUFA 5FL0A 1VBRA 3N13A 2ZWZA 2D3NA 5LA0A 3AXHA 5A94A 5ABGA 2D0FA 1O7AA 1Q6EA 1QNPA 2FHCA 4M8UA 1FHLA 4UFJA 5HXMA 3AZRA 1BTCA 2X05A 3ARQA 2EPLX 3ZSTA 3VIKA 3WY1A 1UD8A 1KQYA 2Z1SA 5ABFA 1XH0A 3ZSSA 3GXFA 4M56A 2UY3A 2ZX7A 1JXJA 2W63A 3EDJA 3S2CA 3W82A 3ZQ9A 2J7BA 3SUVA 2J8FA 1E6PA 5GQBA 1W1VA 2UY2A 1W32A 4AEEA 1Q6DA 3SCSA 4E8DA 4CN6A 4W7UA 3AXIA 3K4AA 1DWFM 2WHJA 1DWIM 4B3LA 5BYWA 3VD5A 1V02E 5A6JA 5A8OA 4U31A 3EYPA 5A8NA 4F9DA 2VQUA 1I1WA 3WDRA 4CU6A 3AHYA 1KWKA 4UQEA 3VPLA 2GJRA 4PCSA 3WNNA 1M03A 1BQCA 1UR1A 1HL8A 1J0YA 4AZIA 1H2JA 1C93A 1HL9A 1K9TA 3FW6A 1UG6A 4LXFA 2YA2A 4UZSA 5KZ6A 1J0JA 4C7DA 1UR4A 4F8XA 4ZE5A 4Z2KA 5A6LA 2QMKA 1OWQA 1C91A 4AZBA 2ZE0A 1YQ2A 4AIUA 1UWRA 2XVPA 4W86A 4YHEA 4AD2A 2WM0A 4Z2GA 1Q6GA 1U33A 4H04A 5D8WA 2XSAA 3M07A 1NM9A 3WQ4A 1JL8A 1JFXA 1CGWA 5KEZA 1EHNA 3LPPA 2D20A 4DUWA 1M01A 4Z2JA 3CZKA 3TTSA 3AS1A 4W93A 3DYPA 5E09A 1UWIA 4ACYA 1WDRA 3WEMA 2FH6A 3ALGA 4PMDA 1W9VA 4M80A 3BAIA 3VGEA 1C92A 3GNPA 3MMDA 3TOPA 9CGTA 1BAGA 3PZOA 2XUCA 1C8YA 4OOUA 4KH2A 1E1FA 2GK1A 3ARXA 4H41A 3W81A 3VGBA 4DWSC 2AOSA 2VC9A 4CD8A 3F5JA 3U7VA 2QMJA 2WZEA 3PN8A 2DSWA 2JEPA 2OSWA 2EQDA 1H09A 1WZLA 4AC1X 3OZOA 4FLQA 4CVWA 3T0DA 4AYSA 3ZM8A 3PHAA 4V28A 1OD0A 2W61A 3GXIA 5C71A 4GKLA 1NARA 2HISA 4XUYA 3ZJ6A 1HKMA 3GDBA 3MV11 2DIJA 1QBAA 2XVLA 1HXJA 5CZKA 1Z32X 2G41A 4JFSA 3DYOA 1XV8A 3WD1A 2EBNA 2ZUNA 1E56A 1LF1A 2DGAA 3ARPA 3WMBA 3WF4A 4W8LA 5HPCA 1JYXA 4GZEA 3RM9A 4GIAA 2EXOA 4GI9A 3VINA 5DMYA 1BYCA 1H4PA 3LMYA 1K9FA 2OWXA 4Q22A 1CENA 3CLWA 5CQ1A 1U30A 1MFVA 2WBKA 3DECA 3N18A 3EDEA 2XGIA 1CGVA 2CESA 4CN4A 5FOOA 4W84A 4ZEPA 2G3NA 3K46A 1EDQA 3TTQA 4OOZA 4QCEA 2Y4SA 3FN9A 1J0IA 4AZGA 1PZ2A 3PZGA 1GZJA 2YL5A 2J47A 3TTYA 3ZJ7A 1R87A 4MNKA 1EXPA 3AIBA 3F4VA 3W28A 3HN3A 4B9ZA 1W3HA 1E5JA 3THCA 1OINA 2JEQA 2PWFA 2VOTA 2IXVA 1E0VA 4AZHA 1IV8A 3FHQA 3CZLA 2ZXDA 3I3BA 5DFAA 2BNJA 2WMFA 2W66A 2VMFA 3UCQA 1HX0A 5JIPA 3QOMA 2PC8A 3GXDA 1QBBA 4P7NA 4P8UA 3WBEA 5IFPA 2YA1A 4MAZA 1OSEA 3K8KA 1JZ8A 3EMCA 1K9DA 1QI0A 5E0FA 4RL3A 4U3CA 1H5VA 1ISVA 1NWUA 3VGFA 3W37A 1J0KA 1E3ZA 1TR1A 1PX3A 3VGHA 1XCXA 4HA4A 3ARVA 1EOMA 3VM5A 3VMOA 1UQZA 5IDIA 3WDPP 3WNOA 5A8MA 2ZUMA 1DWHM 3OIHA 4R27A 1LL4A 1QW9A 3MKKA 1ZJBA 4HZ8A 4PMRA 3EDDA 4PUDA 3MSGA 2OSYA 2OWWA 1JYVA 4EKJA 2BFGA 2CYGA 4GI8A 4WKFA 1Q6CA 3N11A 2WHKA 2YDQA 1FOBA 4UQAA 3W4RA 3OGRA 1QI3A 1E40A 4ZXOA 1HJSA 3NIYA 2VCBA 5CJ5A 4FLOA 3O6AA 1JZ3A 2F8QA 4PSRA 2DPEA 1QOXA 1XSKA 4W89A 1JF6A 1EDTA 2WW5A 1UD4A 2CKRA 2WVVA 3F5KA 3VUPA 1OD8A 1SR0A 4UTFA 2F2HA 2DSVA 1CNVA 1JG9A 5CSUA 1JYNA 1B3YA 1EQCA 3VD7A 1DWAM 5E6ZA 4TTUA 3VD4A 3SCQA 3DHPA 2FHBA 2ZUUA 1JNDA 3WQ6A 2VL4A 3VU2A 4J3TA 1CGXA 1OIMA 5JUVA 4FMVA 2WWDA 4D1IA 2QPSA 3CUJA 4WK9A 2BS9A 3WUEA 4RE3A 1XRVA 4F79A 3CPUA 2IUZA 3MSDA 1JZ4A 1BLIA 3ZMRA 1HKKA 1E0WA 1XH2A 4XB3A 2CBUA 1UR2A 1UZ4A 5ABHA 1V6VA 4CCEA 3NJ3A 2O9RA 1V6WA 4D6GA 1TVPA 3KEHA 1DEDA 4HU8A 2OLHA 4BQ3A 3M7SA 2E9BA 3PZMA 2WK2A 1YHTA 3FAWA 4EE9A 5A2AA 1J11A 2YLLA 4IISA 4GQQA 3WEZA 1SMDA 2VZVA 4F9JA 3MV01 3IANA 4WSKA 1UKTA 3CZ8A 1BVZA 1MW2A 1GUVA 3EMZA 3NSNA 3VIJA 2QLYA 2V38A 1GOMA 2HVMA 1C7SA 2JF7A 1KBKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FP9 A;  2DDX A;  4ZFM A;  4Q7N A;  1ZL1 A;  4OUE A;  4LYP A;  1JGI A;  3B9A A;  3BMW A;  7TAA A;  1E15 A;  2VTF A;  3QHO A;  1WDS A;  4X0V A;  2VZT A;  1KBB A;  3RIL A;  4MNL A;  1B3W A;  4W8B A;  3AS0 A;  3WEO A;  5BWF A;  1GQL A;  1E6Q M;  3L2M A;  2ZUS A;  1JZ7 A;  5HDR A;  4BQ5 A;  4UQ9 A;  2G3M A;  3VMN A;  3WEL A;  4U33 A;  4X0N A;  1NQ6 A;  3OG2 A;  4UOJ A;  2X1I A;  5E70 A;  3WH5 A;  5GNY A;  1OM0 A;  2WVV B;  5FL1 A;  3W38 A;  1JDD A;  1G5A A;  3WQ5 A;  4ATW A;  4NRR A;  1PJ9 A;  3BH4 A;  5AYI A;  1MXG A;  2PWG A;  2BY1 A;  2D3L A;  2WVS A;  3WH9 A;  2B31 A;  1UH4 A;  1X6L A;  2BY2 A;  2GUY A;  4QLJ A;  3SCW A;  3T08 A;  4YN5 A;  3BAX A;  4JHZ A;  5I2U A;  1MXD A;  3IK2 A;  4JFT A;  2JIE A;  3RO8 A;  1DTU A;  2OYL A;  1GOK A;  8CGT A;  2DH2 A;  5CXP A;  3L4V A;  2WXD M;  1UZ1 A;  1EO7 A;  2WPG A;  3QR3 A;  2WNW A;  5A6B D;  1ZJA A;  1E6Z A;  2DSZ A;  1BYB A;  1CXE A;  3AHV A;  3LPO A;  1E72 M;  3MS8 A;  3BXW A;  1WDP A;  3U5U A;  4M1R A;  1FH8 A;  3CHE A;  5D9O A;  3VX1 A;  1JXK A; 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 3WNO A;  5A8M A;  2ZUM A;  1DWH M;  3OIH A;  4R27 A;  1LL4 A;  1QW9 A;  3MKK A;  1ZJB A;  4HZ8 A;  4PMR A;  3EDD A;  4PUD A;  3MSG A;  2OSY A;  2OWW A;  1JYV A;  4EKJ A;  2BFG A;  2CYG A;  4GI8 A;  4WKF A;  1Q6C A;  3N11 A;  2WHK A;  2YDQ A;  1FOB A;  4UQA A;  3W4R A;  3OGR A;  1QI3 A;  1E40 A;  4ZXO A;  1HJS A;  3NIY A;  2VCB A;  5CJ5 A;  4FLO A;  3O6A A;  1JZ3 A;  2F8Q A;  4PSR A;  2DPE A;  1QOX A;  1XSK A;  4W89 A;  1JF6 A;  1EDT A;  2WW5 A;  1UD4 A;  2CKR A;  2WVV A;  3F5K A;  3VUP A;  1OD8 A;  1SR0 A;  4UTF A;  2F2H A;  2DSV A;  1CNV A;  1JG9 A;  5CSU A;  1JYN A;  1B3Y A;  1EQC A;  3VD7 A;  1DWA M;  5E6Z A;  4TTU A;  3VD4 A;  3SCQ A;  3DHP A;  2FHB A;  2ZUU A;  1JND A;  3WQ6 A;  2VL4 A;  3VU2 A;  4J3T A;  1CGX A;  1OIM A;  5JUV A;  4FMV A;  2WWD A;  4D1I A;  2QPS A;  3CUJ A;  4WK9 A;  2BS9 A;  3WUE A;  4RE3 A;  1XRV A;  4F79 A;  3CPU A;  2IUZ A;  3MSD A;  1JZ4 A;  1BLI A;  3ZMR A;  1HKK A;  1E0W A;  1XH2 A;  4XB3 A;  2CBU A;  1UR2 A;  1UZ4 A;  5ABH A;  1V6V A;  4CCE A;  3NJ3 A;  2O9R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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