4W85 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	339
structure length	339
Chain Sequence	DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
publication title	Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family. pubmed doi rcsb
source organism	Uncultured bacterium
total genus	151
structure length	339
sequence length	339
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date	2014-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4w85A00

3BAKA 1N82A 1JAEA 1M04A 1GOIA 4PSRA 5HNNA 2VX4A 1JF5A 1UA3A 3AICA 1FH9A 2WC4A 4OJYA 4TTUA 4P8VA 4HOZA 3WD4A 3ZMRA 2XFFA 4MB1A 3VD7A 5I2UA 3NYDA 4CGTA 1KGWA 1VAHA 4QCEA 3CUJA 3NSMA 2ZXAA 3KZSA 4L4OA 3CTTA 1J10A 3WELA 5HPOA 2Y8KA 3WD2A 1V3JA 3EDJA 2WCAA 1B3ZA 1OGGA 1KR0A 1W91A 1QBBA 1A47A 3MV01 3UERA 4Q22A 1XH1A 1G94A 2W61A 2ZUUA 3AIQA 4UFJA 2BVTA 1GJWA 1QNQA 1MW0A 1UD4A 1JNDA 1LG2A 2J25A 4U33A 4CCCA 3WSUA 2F2HA 1E6NA 1HVXA 1G0CA 5LYRA 3ZJKA 4TX8A 5A6BA 2A3CA 3N1AA 3WH8A 1V3LA 1QI4A 3AS3A 5I77A 2WPGA 3CZLA 1NM9A 3I3DA 4DUXA 2EXOA 4OIFA 4HMEA 1EQPA 4B15A 3VGHA 1JYXA 2ZXQA 2VCCA 4HP5A 3AOFA 4D6DA 1QW8A 5CQ1A 1G01A 3APGA 3CZEA 4CKQA 4FLSA 5CZKA 4AD1A 1HKMA 1QI3A 3DC0A 4AC1X 2O9TA 3THCA 4K68A 1GCYA 4DM1A 3VNZA 3ZT6A 1V0LA 4UZUA 4NI3A 1KCKA 1TA3B 1ITXA 2GK1A 1JFXA 1UUQA 1KWGA 3VDHA 1E1FA 5AY7A 5I78A 1VJSA 1B3XA 3AMKA 3BH4A 3S6TA 3WF0A 4S3JA 4DUVA 1R8LA 4JFVA 1VJZA 1JZ5A 3CIVA 5I5RA 3RM4A 2ZX8A 4MB4A 4CU6A 4GI6A 3WDIA 2FH6A 4BF7A 4PUEA 3W38A 2VVSA 3RJXA 4W8LA 5A8QA 1L8NA 1AQHA 3ARQA 5HXMA 3SCVA 2RGLA 5FIPA 3CHCA 3N9KA 2JE8A 3WDPP 1CPUA 2VCAA 2VMFA 1E4LA 3QGVA 3CMJA 3AIWA 1ISWA 3UESA 4WSJA 3AHYA 1HJSA 3TP4A 1CLXA 3ZOAA 1E40A 2VQUA 2XPKA 1BYBA 1PPIA 2YL8A 3KWXA 1ZU8A 2JEPA 4AYSA 5C70A 3ZR6A 1Z32X 3PZTA 3BGAA 3WH6A 4W89A 1GOKA 4X0NA 4HU0A 3SCPA 1ECEA 3UEQA 5AC5A 3ARRA 1M7XA 2BY0A 4MNLA 1OB0A 1WO2A 4LQ1A 3CHFA 3TONA 2UWFA 1E15A 1R86A 2WM0A 1E6RA 2QMKA 1E56A 5I3DA 3VIFA 3NSNA 5A3HA 1PIGA 4U5IA 2YJQA 4URIA 1J9YA 2FGZA 2GJPA 4AISA 4AD0A 5AC4A 5E6ZA 1A3HA 3T0BA 4AZBA 3EMZA 2BHZA 3AXHA 5A95A 2GJXA 3W0KA 1XD1A 3VTRA 1E9LA 4UFMA 3AYRA 2BNJA 2YKKA 1M01A 3AMGA 3MANA 3CBWA 2CERA 3AJ7A 3SUSA 3RPMA 1C8QA 5EMYA 2WZHA 5D4YA 1CYGA 1JGIA 4PYSA 2V5CA 1NP0A 2G4FA 2D24A 1H0IA 3DHUA 4JKKA 3VPLA 4V2XA 2J75A 5ABFB 1XSJA 2ZUWA 2Y8VA 5JUVA 4TOQA 3WBEA 2IXVA 3NDYA 2FHCA 1LWHA 4PEEA 3KEHA 1BGGA 4KRTA 3VIMA 2VO5A 1OD0A 1B2YA 1BFNA 3PZNA 2D3NA 2DH3A 1B3VA 4W7WA 3SCTA 3N12A 1HJWA 3AIUA 4AD4A 1JI1A 1VEMA 3FAWA 1RD6A 2G41A 2WANA 5A2AA 5D9OA 2WMIB 2JF7A 1JIBA 1M53A 1QOXA 2PWHA 1M03A 3FY1A 4W8AA 5JBEA 1C91A 1C7TA 1J12A 1CZ1A 1LLOA 4FLQA 2J7HA 2XUCA 3GXFA 3OLGA 1E1EA 1G5AA 1LG1A 1IV8A 5JBFA 5DT7A 1C93A 1ODUA 1EIBA 1EDQA 2QF8A 4FK9A 2A3HA 3I3BA 4QLKA 3RM9A 5BCAA 4TVCA 2XVKA 4C7DA 2GVYA 1GJUA 1LL7A 1B31A 1VFOA 3DHPA 1CBGA 1WZAA 2ZUVA 5E9AA 1C8XA 2YA1A 2WVVA 4H8UA 1NOWA 5E6YA 2UY3A 3ARSA 2QV4A 2G3MA 3L2MA 5BRPA 3J7HA 3CMGA 3ZT7A 3OB8A 4ACYA 5ABEA 1BYCA 3WD0A 4ATLA 4H8HA 1TUXA 5D9PA 4U31A 3VKKA 1R7AA 1RP8A 3FW6A 3ZJ8A 2C7FA 1X1NA 3HU7A 4W88A 4M29A 3SIMA 4E8DA 3EDDA 1BF2A 3AHZA 4HA4A 1SFSA 2WC7A 1WDSA 4XZBA 3PTQA 1LF1A 4MAVA 3IJ8A 1XC6A 3BSHA 3WQ8A 1OWQA 2J7BA 4GI8A 2CYGA 2EEXA 1QI0A 3BAIA 1OCQA 2UY5A 4H41A 1R85A 8CGTA 1ISYA 4LYPA 5IDIA 4OOZA 5CG0A 1GQJA 1QNRA 4DWSA 2DT3A 1TR1A 3GNOA 2VZUA 1VBRA 1QHZA 4RE4A 1UD6A 1ZJBA 2VURA 2Y24A 4KH2A 5DMYA 1XRVA 2V3GA 3SCRA 2ZX9A 4UZSA 1GQIA 3BC9A 5A2BA 4A4AA 2XSBA 1KXHA 1MFUA 3VGEA 8A3HA 1DP0A 2EPNA 4J7RA 3WF4A 3AROA 4PMXA 1O7AA 3AMCA 3I3EA 4WKHA 1XH2A 5FL1A 4AIOA 1BYDA 3WMBA 3K4DA 3CZGA 1J0ZA 1OIMA 3O6AA 3VIJA 1BG4A 1V0MA 2VZTA 3WH9A 1K9FA 4XB3A 3ZT5A 4PRWA 4YHEA 3CZ8A 3BLPX 5DO8A 3OLDA 2W92A 2A3EA 1HKIA 3PTMA 4AZHA 4AZIA 1F4HA 3OLEA 1DTUA 4C7GA 1JYNA 7TAAA 3AISA 4E2OA 3WH7A 3BSGA 4W85A 1K9TA 4Z2IA 3SCUA 1H4PA 2E9BA 4MPKA 3FAXA 1TCMA 4CU8A 3QOKA 1HXJA 1UYQA 3G6LA 3LPOA 4H8VA 4NF7A 4FF5A 4GQQA 3L4VA 4AIEA 3OZOA 1JD7A 2CNCA 1JZ8A 5D9NA 4JL1A 4AEEA 2WHKA 4PN2A 3RJYA 3GNRA 4TVUA 4IPNB 3W28A 1H3GA 5EB8A 1BGAA 3T0AA 3T2OA 1KR1A 2AMGA 4PTMA 3ARWA 1VB9A 1XV8A 1WP6A 4PMUA 1E4IA 4Z2HA 2VTFA 1OGSA 4JZ5A 2OWCA 1GQLA 2BHUA 2WLZA 1V08A 1HKKA 4MAZA 4GPNA 2DDXA 1PAMA 2ZE0A 4AEFA 1CECA 2B31A 4ZFMA 2DIEA 4R5EA 2BVYA 1UR9A 4J3VA 5D8WA 2CBJA 4J3TA 4PMQA 2GDVA 2VC9A 5A8NA 2W4XA 3EYPA 3M7SA 9CGTA 1J18A 3CZKA 1ZJAA 3F5KA 3N18A 4U3AA 3WNNA 4WSKA 2FHFA 2WKLA 2DSVA 4JFTA 4D6EA 1ZBVA 4W86A 4OUEA 1OSEA 2XFRA 1KGXA 1Q6GA 2DSKA 3EBVA 2V38A 1PX8A 3BLKA 2PF0A 4DM2A 2YL5A 3BAWA 4BQ3A 4ACZB 3A3HA 1VEPA 4KRUA 2XWEA 1TZ7A 3GH5A 5M5DA 4Y7EA 3EDKA 1BTCA 2J7CA 2W67A 4GZJA 3AS2A 2UY2A 5GQBA 4IUGA 1VIWA 3UG5A 3PBGA 2V5DA 4HPHA 5BXRA 2QPUA 1H2JA 3VGFA 1JL8A 3WBAA 1CGTA 2WCSA 2VX6A 3K8LA 4D6FA 1JG9A 1CGYA 1ODZA 2WMKA 1UKTA 1BAGA 1O6IA 3DYOA 2XYLA 3WUEA 1J0KA 1WNOA 1NQ6A 3WKZA 2MANA 2YBTA 4BS0A 1V0KA 1TG7A 4MDPA 2XSAA 4KWUA 1W9PA 1CNVA 1E0WA 2CIPA 4PTVA 1HX0A 2WNWA 2XGIA 1BQCA 4F8XA 1PX4A 4GO8A 2CITA 1ZB5A 4UFIA 5ABGA 1US3A 4CD7A 3LPGA 1ZL1A 2W66A 5FOOA 3VIGA 4P7QA 3GXIA 1CGVA 5LA0A 1Q6DA 2XM2A 2XIIA 4P8WA 1XD0A 4JKMA 5DEZA 5IXEA 1GVIA 1GORA 3WF1A 1CDGA 2WHLA 5GNXA 1DEDA 2EJ1A 1CGXA 3TOPA 3KL3A 1V02A 2WSPA 3U7VA 1JZ4A 4CCEA 1EO7A 3O2LA 1JYWA 5C71A 1NWUA 1FA2A 1J0IA 4KGJA 3GXMA 1J0JA 5HOSA 4FMVA 3L2LA 5E0CA 2AOSA 1V6WA 4D6CA 2W91A 3B9DA 2EPKX 2G8ZA 3SEPA 2CBUA 1CWYA 2HISA 2V3EA 1CGUA 3EMCA 1UD3A 2CKRA 1X6LA 4P7RA 1JXJA 4F9DA 1ZBCA 5A1AA 1DWFM 3VGDA 3GYCA 1QW9A 2ZICA 4OKDA 2VX5A 3U5UA 2RGMA 1CXKA 1WB0A 3FHAA 4M81A 2PWFA 2QPSA 1X6NA 3CHEA 3RDKA 2AAAA 2PC8A 2Z1KA 2ZX5A 1UKSA 3VIKA 1HKJA 2FH8A 4UQAA 2O92A 1B30A 5IFPA 3NSXA 3UR8A 3AHXA 1TA3A 2ZXDA 5EFFA 4MNKA 3A4AA 1G1YA 3A4WA 4M8UA 2EBNA 3BAJA 1B3WA 3VDCA 1GOMA 2WB5A 3L4ZA 1W1TA 2J7DA 2D0GA 2XJ7A 3T2PA 3SUWA 1GOQA 2ZXBA 1UG6A 1K9EA 1BHGA 2Q8XA 2VOTA 3ARYA 4E8CA 1OT2A 2CHOA 3TTOA 1Y7VA 4JCLA 1MQRA 2YDQA 1WDRA 4AMCA 2CEQA 4X0VA 1R7OA 4CUCA 3DECA 1CLVA 1QI5A 1OIFA 2ZOXA 2ZX6A 3W27A 5I24A 4CD5A 3D5HA 1CIUA 1UKQA 1HP5A 3W6MA 5I23A 4PMVA 4EANA 3DYPA 4AZ5A 3WY1A 1JZ7A 1WAWA 4PTWA 4ZE4A 5A69A 1BG9A 1EDTA 2WAGA 3CZJA 4P8XA 1BLIA 3NDZA 5D9MA 1W3JA 1BPLB 1EA9C 1LJYA 1TE1A 3OA5A 3LPPA 3N17A 6A3HA 1HL8A 3VVGA 1ITCA 2ZUTA 1KBKA 5TD4A 2WVSA 4QFUA 1ISXA 2IUZA 3AIRA 1KGUA 4J3SA 3GBEA 1KWKA 3POCA 3FNDA 5DF0A 4AZCB 5JIWA 3T0DA 2VUYA 1GZJA 1SYTA 2BS9A 1MQQA 4PTXA 3TTYA 4JHZA 1JZ6A 2VR5A 3O9NA 5C8BB 1MQPA 3GNPA 5M03A 1BVZA 2IXUA 1QPKA 2BV9A 4ZXLA 3ZO9A 1PX3A 2DEPA 4W7UA 4OOUA 4CN4A 4F9JA 1QHOA 3A6OA 1JF6A 2F61A 2QMJA 2J62A 1ZBWA 3ECQA 3RILA 2VRQA 1P6WA 4DUWA 4AZ6A 4IPLA 2J7GA 3OGVA 3VIHA 4GKLA 1PZ3A 1HT6A 1XSIA 1QNOA 4QP0A 4ZENA 4JCMA 4MNJA 5CSUA 1JZ2A 2J74A 5ABFA 1FHLA 1HF6A 1TVNA 3IAPA 4PUDA 1E70M 2DT2A 3BXWA 3GH7A 2JIWA 3A4XA 2VZSA 5JIPA 1VBUA 2D0FA 3AIEA 2YL9A 3AQUA 1JDAA 4CD6A 5CPSA 3OZPA 4UNIA 1VENA 1PIFA 4QLLA 5CXPA 1EXPA 3PZUA 3GBDA 1UH4A 1CEOA 5CLTA 2VX7A 3POHA 1V0NA 4W93A 1ISZA 4MDOA 4GXPA 2OYKA 4LYRA 4M24A 2ZIDA 2WMIA 3F5JA 3WUGA 4QCFA 3SCOA 4LXFA 3UG4A 2BY1A 2E4TA 1VF8A 1FHDA 3VD3A 1JDCA 1W9UA 1W9VA 3VGBA 5A8OA 2PB1A 3QHNA 4OZOA 2G3NA 2WW5A 2VL4A 4GQRA 4TTGA 1D2KA 2ZUNA 2CESA 2X09A 4BA0A 1UD8A 1UOKA 1E4NA 2OLHA 1ESWA 4D1JA 2X05A 1H09A 3RM8A 1XYZA 3WNMA 2GJRA 3WL0A 5FCZA 1E73M 4CVWA 2E40A 1E5JA 3K46A 1DWJM 3MMDA 4XZWA 4EE9A 3SUTA 2FGLA 4B3KA 1XCXA 4KMQA 2C8NA 3T09A 4CVUA 1KXVA 5A8MA 3QOMA 4D1IA 4YHGA 2J47A 3M46A 2DT0A 1QNSA 4TX6A 1H11A 3ARXA 2YDSA 3T2QA 4TVDA 3B9AA 1UH2A 1XH0A 1HJXA 2D2OA 4AY1A 2YLLA 2ZWYA 2NT1A 1NH6A 3ZSTA 1J11A 4ZEPA 3ALFA 2WBKA 2J77A 5E09A 4AD3A 1W1PA 3ARTA 3B8SA 4Z2KA 2J8FA 1W9BM 1E5NA 1UR1A 2FDMA 4UQ9A 1EDGA 1JD9A 2WMHA 1NP2A 4NSBA 3WEMA 5A6LA 2ZX7A 1GQKA 1W2VA 3OG2A 5CPTA 4HOXA 4D6IA 2X2YA 1DWAM 1CXLA 1DWHM 5HBFA 2XM1A 4OBRA 6TAAA 2OWXA 1GNXA 2WBGA 4E4PA 1MFVA 1PJ9A 1C8YA 1KQYA 4FLOA 3AIVA 2DPEA 4HMDA 4X9YA 1UR2A 1UR0A 1W3LA 2V3FA 1EQCA 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4J28A 2Y5EA 3CUIA 1RP9A 3E1F1 1E0VA 3VDAA 3ARVA 2E9MA 1XHGA 2E8YA 3AMLA 1C7SA 4JFWA 2J8GA 2WC3A 1GPFA 1TFVA 4UOJA 7CGTA 3WUBA 3VNYA 3WEZA 1AQ0A 1UZ4A 2E8ZA 4NRRA 2J79A 3MS8A 3AI0A 5LA2A 3WF3A 2G3JA 3PHAA 1W9XA 3UETA 3VX0A 3W53A 2XVLA 1FH7A 1WE5A 1VFMA 2NW0A 2YIHA 4UQCA 3WH5A 4W5ZA 3W37A 1Q6CA 3ZSSA 4V28A 1NOFA 4RE2A 3W25A 4BZYA 4HTYA 1W32A 3NJ3A 4P7LA 2G3IA 2D23A 3ALGA 3RCNA 4C7FA 4B9ZA 1GUVA 2E3ZA 2GFTA 5ECUA 1V6XA 4N0RA 4AXNA 4LYQA 1H0GA 4YN5A 4MB5A 3K1DA 3VIOA 3THDA 1QVBA 2W62A 4TUFA 2GK1B 5CGTA 2Y2WA 4UQBA 1UQYA 3ZIZA 4TXEA 1UD5A 2ZUMA 1V3KA 3CPUA 1D7FA 1UA7A 1E71M 5BRQA 1NOUA 2EQDA 1BSIA 1E3XA 3BMVA 3W82A 3SUUA 1IT0A 1JDDA 4PMYA 1EOKA 1E6SM 3MUY1 1UD2A 4J3XA 4AD2A 3UR7A 1W3KA 4EKJA 2WLYA 3HMCA 4HPGA 4HZ8A 1I1XA 4D6GA 1UWUA 1NARA 1JZ3A 2HVMA 3MU7A 4ATDA 3WMCA 2YLAA 1B90A 3OIHA 3U7BA 1UWIA 5I6SA 1VEOA 1V6YA 1GHSA 4H2CA 5E0FA 3CHDA 3WN6A 1E6PA 3MO4A 2V3DA 3M07A 3PZVA 1HJVA 3GTNA 4Z2GA 1IZJA 1MW2A 1UKOA 3MUAA 2PWDA 4A3YA 1Q6EA 3LPFA 1HNYA 1Q4NX 5A8PA 4WJXA 2VCBA 2WVTA 3PZOA 3TTQA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4W85A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations