3AXXA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 140
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3axxA00
3N15A 3GNPA 1Q6FA 4U33A 2WHMA 4TX6A 3SCRA 3U7BA 3UR8A 1K9FA 2DSVA 4J27A 1TG7A 2W63A 3E1F1 3VNZA 1MW2A 1CYGA 5DF0A 5DO8A 3SURA 3VKKA 3BCDA 2BS9A 3AICA 5E6ZA 1C8QA 2J77A 1ZJBA 4QFUA 3WF3A 3MU7A 1IV8A 4MPKA 3AQUA 3RILA 3WQWA 3W0KA 3WELA 3PZUA 4JFUA 1J0ZA 3BAYA 3F4VA 1GJUA 4M1RA 2WMKA 2QPUA 3J7HA 3WEOA 4D72A 1W3HA 5EFDA 3NSMA 2XVKA 2O9PA 3QOMA 4MNKA 4JL1A 4AD5A 4AW7A 1W1VA 1B3YA 1CEOA 1J0KA 2GUYA 2CHNA 1E9LA 1XCWA 3CUFA 1E40A 1Q6EA 4H8HA 2ZX8A 1XV8A 1AQ0A 3DHPA 4PUEA 3EDFA 5CZKA 3DECA 1JFHA 3OBAA 1NWTA 4P8WA 4PMOA 3FHQA 7CGTA 3MV01 4GKLA 5EBAA 4PYSA 1QI4A 1VRXA 3VIKA 1EOMA 1JXJA 4KH2A 1CDGA 1GOWA 1TVNA 1DWFM 1KXQA 2OYLA 2VR5A 5LA2A 5BYWA 1BYAA 3CTTA 2OSYA 7A3HA 3VILA 3SUTA 1XD1A 1KQYA 2ZUWA 4TTUA 4ACZB 4C7FA 4BZYA 4J3SA 1B3VA 2XIBA 1CIUA 3EDJA 2WVVA 1HKMA 2VT0A 4W8BA 1SMDA 1EHNA 5M5DA 4EK7A 1JDAA 2VOTA 3VM5A 1CXKA 1HVXA 4OBRA 2E8ZA 1JYXA 1CXIA 2G8ZA 4H8UA 3W29A 4CU6A 3AMCA 1HXJA 1UKSA 2QHAA 3ZIZA 5A8PA 4CN6A 1Q6CA 1VAHA 4B9YA 3NYDA 4MNJA 1WZKA 4W8AA 4BQ4A 2UY5A 2VX6A 1CWYA 1CNVA 3AIUA 1E1FA 2PWGA 1QNRA 2QV4A 1PAMA 4PSPA 4PMRA 2PWFA 3N1AA 4ATLA 1E3ZA 3POHA 6A3HA 2BHZA 2OWXA 1JD9A 3AMDA 5BROA 4A4AA 4U3CA 5CPTA 2XJ7A 3ZMRA 3N11A 4W8LA 1HJQA 1KXTA 4UCFA 2GVYA 4CU7A 5FL1A 3AS2A 4Z2KA 4Q7NA 1CGTA 1FH9A 3T0BA 1FH7A 4ZFMA 3WKZA 4HOXA 3RM9A 2TAAA 4UFMA 2WZHA 4B3LA 2WC3A 4ZEPA 1J9YA 3UG4A 1JF6A 3KL5A 2HISA 2D3NA 2WSPA 1VFFA 2ZX9A 4J7RA 3W6MA 2OYKA 4CCDA 5ABHA 4NZCA 1W9UA 1VBUA 2WMFA 2BY0A 4GINA 1UKOA 4TVDA 5FD0A 4D1IA 4WF7A 3HN3A 5I23A 2VJXA 3L4WA 4MB3A 4URIA 2XFFA 4B3KA 1E15A 3GZAA 1IT0A 4X9YA 3EDDA 4CGTA 1V02E 2C8NA 5JIPA 3AJ7A 3S6TA 2E9BA 3BAIA 1SR0A 1XSKA 5EB8A 3SCUA 1GQJA 4PTMA 2BY2A 2X05A 3BAXA 3AXXA 3DYPA 3RJXA 3AZRA 1KXHA 4BCEA 1OWQA 4QDMA 1GQKA 5LYRA 4W5ZA 3MUY1 2ZUVA 4H41A 2WWDA 2W92A 3AMKA 4AY1A 5F7UA 3RIKA 5A6AA 4PUDA 1VJZA 1QNSA 2O9RA 1QHOA 3K4AA 2J62A 1GVIA 3W24A 1VIWA 2G3NA 1JL8A 1W3JA 3S2CA 3NDZA 2PB1A 4F66A 3VIIA 4GQQA 1RP9A 2RGLA 3ZR6A 4HA1A 2WYSA 1WZMA 1AMYA 1KBBA 5I6SA 1OD0A 1ISWA 1TFVA 4P8VA 2XVNA 4J28A 2XTKA 3EYPA 3VOCA 1J11A 4CCEA 3CBWA 4D71A 4GO8A 4PCSA 4PMDA 2WHJA 3ZQ9A 4MB1A 4GI9A 4D6GA 3ARQA 1LLOA 3CUJA 3IAPA 1CLVA 4C7GA 2VRQA 2YIHA 3EDEA 2DIEA 4GZEA 1HJSA 1QI2A 1OGGA 4BQ5A 1NP0A 4CD5A 2J7FA 2GDUA 3B9AA 3CHEA 3WNMA 3MUAA 2V5DA 5E6YA 1ZBWA 1GQIA 1WNOA 3F5JA 1EA9C 2ZWZA 4JIEA 1W1PA 3AIBA 1GJWA 3DHUA 3ZT6A 3T09A 3L4TA 3ZO9A 3ZSSA 2G3JA 1XYZA 3MMWA 3WD4A 5GNZA 3WDPP 2XVPA 2GSJA 1BPLB 3L4YA 5KZ6A 2CERA 3BLPX 2PWDA 4UR9A 3SUVA 3T2OA 5A8MA 5ABFA 3ZJ7A 1OB0A 3K8MA 5LA0A 2CYGA 1EH9A 1NARA 4CUCA 1C3FA 4OOZA 2EO7A 1V03A 3CHFA 2CXGA 4AZHA 5FKYA 1UWQA 4UQ9A 1NWRA 4QCEA 1W3KA 3SCWA 1PIGA 4GO9A 3WDIA 1WZLA 4V2XA 2Z1KA 3VD7A 3WUGA 4PTVA 4HMCA 3RJYA 3ARXA 2VZVA 4BQ3A 2JIWA 1EIBA 1JXKA 3VDAA 4OBSA 1EQPA 4WIWA 4UQBA 1EOKA 1HKIA 4GQRA 1UWUA 4QCFA 3VD9A 3BC9A 3U57A 1NQ6A 3VO0A 2XM2A 5IXEA 3VNYA 2WANA 4M29A 1V02A 2XUCA 1UA7A 1L0PA 3LPPA 2ZIDA 4JFTA 2V3DA 3GXFA 4LQ1A 4PCTA 1XH0A 1GOKA 3QHNA 3GNOA 5CGTA 1C91A 2YL6A 1H0IA 1PX4A 2EPNA 4OUEA 1OSEA 2VVNA 1WDQA 5C71A 3VX0A 4UFJA 2C7FA 2VNCA 2VC9A 5D8WA 1LWJA 4AZ5A 2JALA 2V3FA 2YKKA 4M8UA 3OZOA 3MMUA 3QR3A 2J7BA 2ZXDA 3RCNA 4HMDA 4XV0A 1W9XA 1B1YA 3WBAA 3RMEA 3AHXA 4AZ6A 2EPOA 3WDRA 2ZX6A 2VQTA 3K8LA 2J47A 1JDCA 9CGTA 1J18A 3VVGA 3N9KA 1H2JA 4D1JA 3KZSA 2G3MA 4RL3A 4GI8A 4U5KA 1ITXA 3WNKA 1V3HA 1V3KA 2DSZA 4MNMA 1CBGA 1OGSA 2WAGA 1E6ZA 2BHYA 1QHPA 2W4XA 1B3WA 1ESWA 1PIFA 4MADA 3ZSTA 4H8VA 2FH6A 3WH9A 1UZ1A 3BAJA 4ATWA 3VD3A 3MSDA 4W93A 4HOZA 1WP6A 1QHZA 4UFHA 4S3JA 2G4FA 4TX8A 2A3CA 4N42A 3AYRA 3WQ5A 3UG3A 8A3HA 2CPUA 3ARUA 4Y7EA 1WDRA 1NWUA 1RD6A 5A6SA 2WWCA 4AZIA 1WCGA 4AZ7A 1OIMA 3FN9A 3VX1A 2D1ZA 1DWIM 2Z1SA 2D23A 3WSUA 1CLXA 4Z2JA 1E43A 2ZXQA 4JFWA 2DIJA 2VO5A 4EE9A 2WXDM 1VFOA 3OGSA 3FAWA 3M7SA 3GNRA 1A3HA 1UWRA 5EFFA 1LWHA 2XVGA 2EPMX 4UQCA 1HF6A 1D7FA 2D0GA 5A6MA 1XSIA 5D9OA 3WF2A 1HJXA 2V5CA 1UHVA 4AD4A 1C93A 2VUYA 3AHZA 3L2MA 3L4VA 1WO2A 1C8XA 4W87A 2EBNA 1JI1A 4QP0A 3OB8A 1TE1A 1H09A 1C92A 1RH9A 3QOKA 5A95A 5D9MA 1UH4A 1QBBA 1HJUA 4HMEA 4X0VA 5JIWA 4AEEA 3WDHA 2XPKA 2V3EA 4HZ8A 4GXPA 1QNQA 4FLRA 2V3GA 3ARYA 3WNNA 3W37A 3B9EA 2JEPA 3ARRA 4Z2HA 3EDKA 3RM8A 4JAWA 4HZ7A 4J3TA 3SCOA 3T0DA 4W5UA 3MMDA 1UKPA 2JF6A 3MANA 4LX4A 1VEOA 5A6KA 1JF5A 1I75A 2VMFA 3GH7A 4YHEA 4PEEA 3VGGA 2DH3A 4HPHA 4DUXA 1VB9A 3CUIA 3OIHA 2WBKA 3A47A 3D3AA 4PSRA 3AROA 3WEMA 2O9TA 4KRUA 1UA3A 5M3WA 1ZBCA 1H5VA 5HBFA 4KRTA 2WB5A 3WDQA 2BVYA 3W28A 1J12A 4R27A 2AOSA 3T2PA 1NOWA 2GFTA 2ZE0A 4B15A 2QF8A 2J8FA 1MQRA 3SUUA 1KXVA 3VIJA 1RP8A 2A3HA 4UQEA 1PX8A 4L4PA 4TVUA 1W2PA 1I1WA 1MVYA 4M80A 1NP2A 1UR8A 4U31A 2VZUA 5E70A 3CGTA 1CENA 3CZKA 2J4GA 1O7AA 1GVYA 4WSKA 3WNLA 5CGMA 1KFWA 1EO5A 2VZSA 3LPOA 4UOJA 4AXNA 3A3HA 3VGHA 6TAAA 2FHBA 5DEZA 3ARPA 2X1IA 1QBAA 1HL9A 3NIYA 2WVTA 5JBEA 1K9DA 1M04A 1LF1A 1UR9A 3WF4A 4RE4A 4M24A 2Y2WA 5CSYA 3CMGA 4ML4A 2DPEA 2WK2A 1SMAA 3ALGA 1E3XA 1UH3A 3VIFA 4QLLA 3SIMA 1H3GA 3QHOA 2FGZA 3ZJ8A 1CGVA 2JIEA 3EBVA 4AZCB 2D24A 2WLYA 2WMGA 1V3LA 1V08A 2D2OA 1JYVA 1J0HA 3DC0A 3U5YA 1KQZA 2QMJA 1Z32X 1BG4A 1J0JA 1GUVA 1UWSA 1HP5A 3KL0A 1US3A 1W9DM 1BVNP 2WBGA 4J3WA 4AISA 1QOXA 1E6QM 1FHLA 2W62A 1VEMA 3VDBA 3AMGA 2PWHA 3NSNA 1LJYA 1ZS2A 3TONA 2ZOXA 2VX7A 3WF0A 3WNOA 1VF8A 4E8DA 3I3BA 2YDSA 2PC8A 1MQPA 2DT3A 1V0KA 2WMIB 4JKMA 4MJ4A 3EMCA 4WJXA 4DWSC 2YDRA 1E0WA 2BFGA 1BQCA 3ARVA 2E0PA 2D3LA 3CH9A 4XUYA 5IHSA 3W25A 1R7OA 4P7LA 1CGYA 1Q6DA 4QAWA 3TTSA 3AZSA 3N17A 3W82A 1UQYA 2GJPA 3I3DA 4UFKA 4HOWA 1P6WA 1MYRA 2HVMA 1GW1A 2VCCA 3PZVA 3WIJA 3WL1A 3IK2A 5BXTA 1CPUA 1HX0A 1CXHA 4D6JA 1KGXA 4DUVA 3LPGA 4L4OA 5A6LA 4LYQA 4J3XA 3ARSA 1B30A 2XIIA 1AQMA 4DWSB 1CZ1A 2FHCA 2D0HA 2BHUA 4UOZA 2OLHA 3WDJA 3ALFA 4D6FA 1EHAA 3GXMA 4FK9A 4B9ZA 5IDIA 3VMOA 2GJXB 3OLEA 4TVCA 2PBOA 3KL3A 3O2LA 2WZEA 1QNOA 3PTQA 3WBEA 1HJWA 1UUQA 3UERA 4Z2LA 4Q22A 4JKLA 1I1XA 3VD5A 4ACYA 1JZ6A 5BRPA 4W86A 1E56A 1B90A 4PRWA 3AIVA 4AD1A 1B31A 4E2OA 1BYCA 4W88A 3PZMA 2E9LA 5E9AA 1B2YA 2W61A 4CKQA 3VTRA 1TA3A 5CPQA 2WVVB 5E0CA 3VGFA 1WDSA 4CD8A 2XFRA 4PMUA 4C7DA 1E71M 1KCLA 1GONA 5AYIA 1AVAA 2C0HA 2CBIA 2VCBA 4RE2A 4UNIA 3FXYA 1HVQA 2J8GA 4Z2IA 2ZX5A 1LL6A 5BXSA 2G3IA 4U2YA 1FP9A 1JDDA 4H04A 3OG2A 1V6XA 5AC4A 3ZR5A 2W66A 3PZ9A 4WSJA 1MQQA 2VRJA 2EQDA 3W26A 3U5UA 3SCNA 3JUGA 2YLAA 1FOBA 4NI3A 3WN6A 4YPJA 1X6NA 1V6UA 5BCAA 5BWFA 5AY7A 1FA2A 3M07A 5A2AA 4LGXA 3WH8A 1R8LA 1X1NA 5DMYA 2E40A 4YN5A 2XGBA 1V3IA 5CG0A 2NW0A 2ESCA 4IPNB 1JFXA 5I77A 2DT2A 1OT1A 4KMQA 1ITCA 5AYBA 2OYMA 1PJ9A 4AC1X 2RGMA 2NSXA 3CZLA 4BA0A 1CTNA 1HKKA 1MW3A 2PBGA 1JAKA 1ZB5A 5BRQA 2VCAA 2XM1A 1OCQA 4AYSA 1XRVA 2X2YA 4A3YA 3NUKA 3EMQA 2YOCA 3WFLA 1W91A 5CLWA 2J7GA 2OWCA 1EXPA 2VR4A 1VFUA 2JF7A 1JNEA 1ISXA 4PMVA 1LL4A 2UY3A 5FCZA 4NSBA 2JFEX 1M7XA 1NOUA 1UQZA 2YL5A 4F9JA 1M03A 2WPGA 1JZ7A 1QVBA 2WKLA 1EGZA 1F4HA 3N13A 2ZXBA 5A8OA 3VPLA 3FW6A 4KGJA 3IAQA 3N12A 1GNXA 1CXLA 3GXIA 1E6XM 1V0LA 1BYBA 1G94A 3HJEA 2VZOA 3CZJA 4UFIA 3B8SA 5IHRA 4W85A 3SCVA 1JD7A 3THDA 2BY1A 4B16A 3WEZA 2WKGA 4EKJA 2Y8KA 4W7WA 2W67A 1EO7A 2GK1B 1E5NA 3BSHA 1ISZA 3A4XA 1FH8A 1SFSA 1XC6A 1IZKA 1UH2A 2XHYA 4PN2A 2FGLA 2A3EA 3AMLA 5CJ5A 3AS0A 1CGXA 2GJRA 4AWEA 1E6PA 2VRKA 2J7EA 1JYNA 4CN1A 1PBGA 4CVUA 4W7UA 4IUGA 5GNYA 1X6LA 1XH1A 2O9OA 5D4YA 5I78A 3AS1A 3RPMA 1W1TA 5M17A 2ZUNA 4GI6A 3II1A 4EAMA 1VFMA 1D2KA 2X0YA 4P8XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N15 A;  3GNP A;  1Q6F A;  4U33 A;  2WHM A;  4TX6 A;  3SCR A;  3U7B A;  3UR8 A;  1K9F A;  2DSV A;  4J27 A;  1TG7 A;  2W63 A;  3E1F 1;  3VNZ A;  1MW2 A;  1CYG A;  5DF0 A;  5DO8 A;  3SUR A;  3VKK A;  3BCD A;  2BS9 A;  3AIC A;  5E6Z A;  1C8Q A;  2J77 A;  1ZJB A;  4QFU A;  3WF3 A;  3MU7 A;  1IV8 A;  4MPK A;  3AQU A;  3RIL A;  3WQW A;  3W0K A;  3WEL A;  3PZU A;  4JFU A;  1J0Z A;  3BAY A;  3F4V A;  1GJU A;  4M1R A;  2WMK A;  2QPU A;  3J7H A;  3WEO A;  4D72 A;  1W3H A;  5EFD A;  3NSM A;  2XVK A;  2O9P A;  3QOM A;  4MNK A;  4JL1 A;  4AD5 A;  4AW7 A;  1W1V A;  1B3Y A;  1CEO A;  1J0K A;  2GUY A;  2CHN A;  1E9L A;  1XCW A;  3CUF A;  1E40 A;  1Q6E A;  4H8H A;  2ZX8 A;  1XV8 A;  1AQ0 A;  3DHP A;  4PUE A;  3EDF A;  5CZK A;  3DEC A;  1JFH A;  3OBA A;  1NWT A;  4P8W A;  4PMO A;  3FHQ A;  7CGT A;  3MV0 1;  4GKL A;  5EBA A;  4PYS A;  1QI4 A;  1VRX A;  3VIK A;  1EOM A;  1JXJ A;  4KH2 A;  1CDG A;  1GOW A;  1TVN A;  1DWF M;  1KXQ A;  2OYL A;  2VR5 A;  5LA2 A;  5BYW A;  1BYA A;  3CTT A;  2OSY A;  7A3H A;  3VIL A;  3SUT A;  1XD1 A;  1KQY A;  2ZUW A;  4TTU A;  4ACZ B;  4C7F A;  4BZY A;  4J3S A;  1B3V A;  2XIB A;  1CIU A;  3EDJ A;  2WVV A;  1HKM A;  2VT0 A;  4W8B A;  1SMD A;  1EHN A;  5M5D A;  4EK7 A;  1JDA A;  2VOT A;  3VM5 A;  1CXK A;  1HVX A;  4OBR A;  2E8Z A;  1JYX A;  1CXI A;  2G8Z A;  4H8U A;  3W29 A;  4CU6 A;  3AMC A;  1HXJ A;  1UKS A;  2QHA A;  3ZIZ A;  5A8P A;  4CN6 A;  1Q6C A;  1VAH A;  4B9Y A;  3NYD A;  4MNJ A;  1WZK A;  4W8A A;  4BQ4 A;  2UY5 A;  2VX6 A;  1CWY A;  1CNV A;  3AIU A;  1E1F A;  2PWG A;  1QNR A;  2QV4 A;  1PAM A;  4PSP A;  4PMR A;  2PWF A;  3N1A A;  4ATL A;  1E3Z A;  3POH A;  6A3H A;  2BHZ A;  2OWX A;  1JD9 A;  3AMD A;  5BRO A;  4A4A A;  4U3C A;  5CPT A;  2XJ7 A;  3ZMR A;  3N11 A;  4W8L A;  1HJQ A;  1KXT A;  4UCF A;  2GVY A;  4CU7 A;  5FL1 A;  3AS2 A;  4Z2K A;  4Q7N A;  1CGT A;  1FH9 A;  3T0B A;  1FH7 A;  4ZFM A;  3WKZ A;  4HOX A;  3RM9 A;  2TAA A;  4UFM A;  2WZH A;  4B3L A;  2WC3 A;  4ZEP A;  1J9Y A;  3UG4 A;  1JF6 A;  3KL5 A;  2HIS A;  2D3N A;  2WSP A;  1VFF A;  2ZX9 A;  4J7R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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