5CSYA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - acarbose soak
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
517
structure length
506
Chain Sequence
SVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPDLFSETGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 180
structure length 506
sequence length 517
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5csyA01
4EANA 2J4GA 1JF6A 3CTTA 1BYCA 3U5UA 4IM4A 7CGTA 4UQBA 3BLKA 2BVDA 1V0MA 4OBRA 3UR8A 1CTNA 2WZIA 4M29A 3IJ9A 1OIFA 3VGFA 4MNJA 5FCZA 1CGTA 1BYDA 3AOFA 3VGBA 2C7FA 1E55A 1G5AA 4UFJA 1WO2A 4JZ5A 5KZ6A 1E6XM 1ZBWA 1H09A 2WWCA 3K8LA 2J8FA 1PZ3A 5ABFA 2HVMA 1UKOA 1UH3A 1V3LA 3VTRA 4P8XA 2VZVA 3QHOA 1QI0A 2DH3A 2BY0A 2VX5A 4AY1A 4MB5A 4AEEA 3POCA 3BH4A 3OB8A 1H3GA 1OSEA 3QOKA 1KXHA 1G9HA 5A6AA 1EA9C 1V3HA 3NSNA 1ZBKA 1NARA 3I3EA 1E6RA 1JYWA 2J7DA 3ZM8A 1UUQA 1V08A 2D2OA 4EAMA 4DWSD 4HA4A 5I5RA 4N0RA 1KR1A 4UCFA 1ZBVA 5DF0A 2CHNA 4HZ6A 2G3IA 4NZCA 5HPCA 4HA1A 1FFQA 2YDRA 4MB4A 1R7AA 3NIYA 3N12A 1CIUA 4UQAA 1A47A 1XYFA 1E5NA 1W3KA 2DSUA 4GI6A 2ZUVA 3SUUA 2PBOA 3GH4A 3PTKA 1YQ2A 5C70A 1UH2A 4WKAA 1OWQA 4U2YA 1HXJA 1D3CA 1EGZA 5HBFA 3T0DA 4QP0A 1JG9A 4IPNB 2XSAA 1UWIA 2IXVA 2VRJA 1W1TA 1K9EA 3CZKA 4A3YA 2WWDA 3NUKA 5CPTA 3CBWA 4ACZB 2W61A 3D5HA 1EIBA 1R87A 1LQ0A 2J8GA 1MVYA 3MSDA 3VKKA 4NF7A 1UR8A 4AD4A 2ZOXA 1OT1A 5AY7A 3SUSA 4MB1A 4DM1A 2OSWA 1BAGA 1XV8A 5ABEA 1TG7A 2Y8KA 1MW0A 1C90A 2ZX5A 4PSRA 4MB3A 2EBNA 1CXEA 1J0JA 4S3JA 1UA7A 1M7XA 2F61A 3HU7A 3SUWA 3T08A 3W82A 4HMDA 2VRKA 5C8BB 1ODUA 4AZCB 4DUVA 4Z2JA 5AYIA 2AOSA 5HNNA 2BS9A 5HDRA 3L4XA 4AMCA 3T0AA 3WQ5A 1UWQA 4M82A 3D3AA 2V3DA 4UQ9A 4C7GA 1KCLA 4JAWA 4AYSA 1EO7A 5GPRA 5CSYA 3RJXA 3MU7A 2PB1A 2OWCA 3W6LA 3VGGA 3UETA 2D0GA 4QLLA 2VURA 4GXPA 4ZXOA 4PMXA 2VC9A 3WDQA 2BVYA 1E6SM 2F8QA 3PTMA 4OZOA 1OM0A 2E40A 2WANA 4AD1A 3O2LA 1MW3A 3IJ7A 1W1VA 1GVYA 3DECA 4W8BA 2DSVA 3WD4A 1V0LA 3MMWA 2J75A 3U5YA 1OD0A 4U33A 3WUGA 3AYSA 3GTNA 1HJUA 1P6WA 4W87A 4WF7A 1WP6A 4BQ3A 4KRUA 4W5UA 1X1NA 2WC4A 4UFMA 1DWGM 2E9MA 2YL5A 2O9PA 1E6ZA 5I3DA 3KZSA 3WNPA 2YBUA 1GNXA 5A8NA 1WZMA 3G6LA 1NWTA 5LA2A 2YL8A 3BAIA 3BAYA 3GH5A 1QBAA 1C8XA 1E3ZA 2CNCA 1HIZA 1GW1A 2A3HA 3AMKA 3WMSA 2DSZA 2EPLX 1JFHA 4YHGA 1OIMA 1E0WA 1JI2A 3FNDA 4H04A 1JF5A 5GNYA 3VGHA 1B3VA 3L2LA 1CXIA 2JALA 2EQDA 2ZWZA 3F5LA 4XZWA 1J0YA 4HP5A 1NP0A 2QLYA 3THDA 1VAHA 1BGAA 1OGGA 4H2CA 3CZ8A 2X05A 1TMQA 4MTVA 3AMLA 1K9DA 3BC9A 1CECA 1PJ9A 2GK1A 4H41A 5FKYA 1UKSA 4JCLA 2XSBA 3MO4A 1W9XA 2FH6A 1C92A 3ZT7A 1CGYA 3A6OA 4OJYA 5CPQA 2VR5A 1JYVA 1K9FA 2ZX6A 1JNDA 1LL4A 1HVXA 2BHZA 3L4YA 3AMGA 4HOZA 2WMHA 1PX3A 5FL1A 5A6BA 4AIOA 5A1AA 2XIBA 2DH2A 2ZUNA 4PN2A 3LPPA 1LG2A 1UQZA 2NSXA 4Y7EA 4WK9A 4ATDA 1US2A 1WDPA 4QLKA 3VM5A 3A4XA 3CHEA 3PZTA 1C7TA 3NDYA 2GJXB 1LWHA 3EDEA 3GNRA 3K1DA 3W25A 4F79A 1GHRA 5A94A 1E4NA 1HP5A 5D9OA 1IZKA 3AZSA 4YHEA 1FP9A 1JAKA 4OBSA 2CBUA 4AZ7A 4LYRA 1WDRA 1OINA 2PF0A 2J7HA 1XCWA 2WMFA 3BAXA 4AD3A 1FFRA 3ZO9A 3UERA 4BF7A 5FIPA 2ZXBA 1SYTA 5LA1A 4GQRA 2PWEA 2UY4A 3WMCA 3WMBA 4BQ4A 4BQ5A 3FAXA 3MMUA 3RM8A 3GNOA 1JL8A 3AS2A 1F4AA 4AZIA 3AROA 1VFUA 3RM9A 1EQPA 1W9BM 4JFTA 1OB0A 4LGXA 1HL8A 4BCEA 4HU8A 1ZS2A 2VX7A 2XWDA 1EHNA 2AAAA 2OSYA 4MADA 3BSGA 2WXDM 4KRTA 1LF1A 4YPJA 3RDKA 1CNVA 4D6EA 2AMGA 2JF6A 2YJQA 1JXKA 5EFFA 3W29A 1HNYA 4LXFA 2FDMA 2FH8A 3ZR5A 3AFBA 3VO0A 5BRPA 2G8ZA 1M53A 4MNLA 2GDVA 2E3ZA 1HP4A 3OLGA 3WH7A 3J7HA 4QFUA 2YDSA 1AVAA 5A2CA 3EMQA 4PTWA 3F5KA 1ECEA 3AIBA 1QI5A 4PMYA 1QI3A 2XGIA 3WDHA 4S3KA 1HKIA 3W28A 1W9PA 5HXMA 1KGUA 4W7UA 4MNKA 3TTYA 5EBAA 3TTQA 1DWFM 3N11A 1QW9A 3K4DA 2XVGA 4A3HA 1TVNA 2CITA 1TUXA 2VJXA 5A6SA 4PYSA 3CMJA 4WLCA 2JEQA 4GZJA 2GUYA 3WD0A 1EHAA 2WCSA 2TAAA 3W37A 2OWXA 3NDZA 2VVNA 1OGBA 5GNZA 4UOQA 2VUYA 3VIHA 1XD0A 2EPKX 4GI9A 4IPLA 2CETA 3ZQ9A 4HTYA 3ZOAA 5D9NA 3A3HA 4NSBA 3WUFA 2CBJA 3FXYA 1VEPA 3PZGA 2VZUA 4NI3A 4D6GA 3SUTA 1C8YA 4AZ6A 1W9DM 2JF7A 1UH4A 1JNEA 3UR7A 1E5JA 4JKLA 1VEMA 1W91A 2Z1SA 1QNQA 1OT2A 1XCXA 4QCEA 1PAMA 3WNOA 2QPSA 2EXOA 2XGBA 3DYPA 5JIWA 3U57A 3B9EA 5DT7A 1O6IA 1VBRA 3WL1A 4XUYA 3VMPA 1GZJA 4QCFA 4MAVA 3T2QA 3SCSA 1JIBA 4JFSA 2E0PA 3MUIA 3AXHA 2A3BA 2YDQA 1JZ4A 1WDQA 2QF8A 2WMKA 4U3AA 2VNCA 4LYQA 5JBDA 1CYGA 1V6VA 1ZB5A 1V6YA 3WY1A 1CEOA 2DT0A 2YBTA 4KGLA 3I3DA 4HMEA 5ABHA 4J28A 3VIOA 3IJ8A 1DWIM 2ZX9A 3S2CA 2X1IA 2OYKA 2A3AA 4F8XA 1CGXA 1VENA 1K6AA 1G01A 1IV8A 1E43A 1QI2A 1MQRA 1GONA 2YA1A 1GOIA 4D6DA 4DUWA 1B3WA 3DYOA 2CERA 1KFWA 1L0PA 3MUY1 1WE5A 5EMYA 5E0FA 3PTQA 1C93A 1ESWA 4CCDA 3BCDA 2WPGA 2WVVB 3VPLA 5E0CA 2VZTA 4XX6A 1RH9A 1TA3A 4P8WA 1JD7A 6CGTA 2GFTA 3ARVA 1X6NA 3OGSA 3VX1A 2XIIA 5ECUA 1M04A 1BVZA 2YL9A 1UWUA 3AS1A 4Z2GA 4B3KA 2FHBA 1B3YA 5KEZA 3K4AA 3CLWA 4HPGA 1W3JA 4Q22A 3WIJA 1J10A 1E6NA 1H11A 5EFDA 3VIKA 4AISA 1UKTA 1CLVA 2DDXA 2YKKA 4TVUA 1CDGA 1PPIA 4W89A 1E73M 4TTGA 2J7EA 2Y24A 2W67A 2J62A 3M6DA 3W6MA 1W3LA 2WMIA 2EPMX 1HT6A 3RJYA 4CN1A 4CD7A 1A3HA 4BQ2A 4JCMA 3TTSA 3SUVA 5CJ5A 5FOOA 4D1JA 2DGAA 3RM4A 2RGMA 3WDRA 4ACZA 4DWSB 1I1WA 2EPNA 3CUHA 5BXTA 1X6LA 4GZEA 3AYRA 1NWUA 1QHZA 2X2YA 1H5VA 1V3IA 3W4RA 1MFUA 1BG4A 2WNWA 3WF0A 5E09A 2WHKA 3DC0A 4XB3A 5CLTA 5FD0A 1H0IA 3VDBA 1VIWA 1CGVA 3SURA 1TVPA 2WCGA 3CHCA 4PCTA 3II1A 4V27A 5F7UA 2XG9A 1FH9A 1US3A 3VNYA 1U2YA 2D20A 4PMNA 2ESCA 3ARRA 4D71A 5M17A 1VFMA 2CESA 3SCUA 2EPOA 1B31A 2QMKA 3FAWA 2XJ7A 1VB9A 3U7BA 5ABFB 1QBBA 1LLOA 5C71A 1E40A 3NJ3A 3KL5A 4Q7NA 5DFAA 1BTCA 3GXMA 2QHAA 4P7OA 1WZKA 3CZLA 2WKGA 2WK2A 1BG9A 1R86A 1SFSA 1MXDA 1DWHM 1DWAM 1QHPA 1K9TA 3L2MA 3VMOA 1M01A 1IZJA 4DM2A 4YN5A 5E70A 2EEXA 3ZSSA 2YOCA 4MAZA 2OYLA 3MV11 2UY3A 3VGDA 1HJVA 3N15A 2UY2A 1UR1A 5A3HA 3WD3A 3THCA 2J7BA 3OA5A 4KH2A 3OLEA 2VL4A 1V02E 1GQLA 3AIQA 5E6ZA 1E6QM 3WF4A 1E71M 4TXEA 1BYBA 3CHFA 1W3HA 5IXEA 2E9LA 3AISA 2VT0A 2VVSA 2YLAA 2W92A 2VQUA 2PWFA 2DT1A 2CKRA 4GO9A 2J7GA 4TX6A 1FOBA 3PZMA 2WCAA 4KMQA 1AQMA 3VD5A 1CENA 3WKZA 1J01A 1XHGA 1GHSA 1XC6A 2CYGA 2D23A 3OIHA 2YIHA 4UOJA 2VX4A 2DQXA 2A3CA 4U2ZA 3B9DA 2CHOA 5I77A 2WSKA 1CLXA 3AIEA 2UY5A 1ISYA 3AZTA 3MANA 3AHYA 1UOKA 5BXPA 1V6WA 4D6CA 1E4LA 4RE2A 1C91A 4R5EA 2IUZA 2VO5A 5CG0A 3CIVA 4JHOA 1V3MA 3GZAA 1NWSA 2ZUMA 3LMYA 1E0VA 3K8MA 1GOQA 3EDDA 2W91A 3VOCA 2X0HA 5IFTA 3RCNA 1U33A 4B3LA 5BCAA 5M5DA 1J0HA 1ISWA 1E56A 4LQ1A 3BLPX 2QPUA 4W86A 3BAKA 2BHYA 3L4WA 4J3UA 1UWRA 2GJXA 3WUEA 2XVLA 1KR0A 3G6MA 5I79A 3WDPP 2DSWA 4P7QA 4ZENA 1Q6EA 2W66A 3EDFA 2DSKA 1VEOA 1JZ7A 3WF1A 2B31A 3GM8A 3A4WA 4M56A 1MQQA 3VUPA 2X09A 4X0NA 3BMVA 1RPKA 4J3TA 4UZUA 1VRXA 1DEDA 3VIJA 3N17A 1JGIA 1B3ZA 3HJEA 4ZEPA 4CD5A 2ZWYA 4PMOA 2WVTA 2ZUWA 3WH5A 3UESA 1NOFA 4FK9A 3WQWA 1MQPA 3W24A 4WKHA 1ZBCA 5BYWA 2Y2WA 1RP8A 3CHDA 2RGLA 3WQ6A 1C8QA 3PBGA 5EB8A 1KBKA 1TZ7A 4D6IA 2MANA 2D3NA 2FGLA 3ARYA 3VIMA 2VCCA 3OBAA 4IUGA 4W85A 4GQQA 3ZMRA 3AXXA 1R7OA 2YA2A 5A2AA 2VOTA 3N1AA 4OUEA 3FW6A 2GK1B 1L8NA 3M46A 4FMVA 1KWKA 4CVUA 2BNJA 1DHKA 2FHCA 1B2YA 3CUFA 4JHZA 3SCPA 4CU6A 3VNZA 3MKKA 4H8UA 8A3HA 1OBAA 4WSJA 5CSUA 1WNOA 4W8AA 3T0BA 1GOWA 4JKKA 2CIPA 1XSIA 1E70M 1XD1A 4A4AA 1MW2A 2V3GA 4BA0A 1B1YA 2XVKA 2XFFA 1B9ZA 1LL7A 2VR4A 4Z2LA 3N18A 5A6BD 1EDGA 3QHNA 1VJSA 3AIVA 1J11A 3BAWA 4EE9A 1AQHA 1H41A 3IAQA 3TTOA 4EKJA 4CN4A 2D22A 2DIJA 3AMDA 3OZOA 1G0CA 5ABGA 4FLQA 2E9BA 3A47A 4CCEA 4PCSA 2C0HA 4M8UA 1UKQA 3ZR6A 3HMCA 1VF8A 3ARPA 3N04A 2D0HA 1S46A 3VD9A 1B3XA 4P8UA 4P7RA 2D0FA 4HOWA 1Q6DA 5JBFA 1ZU8A 1TR1A 4L4PA 1ZL1A 2WKLA 2WVUA 2WHLA 4CD4A 1Z32X 5CGMA 2J7FA 1DWJM 2IXUA 1BLIA 1J0KA 2PI6A 4N42A 5CQ1A 1CXHA 4MPKA 3EDKA 2VQTA 1E15A 1CWYA 2WMGA 3AMCA 5BXSA 1R85A 4PBGA 1E6PA 3AI0A 3CPUA 1BHGA 3WFZA 4E8CA 4MJ2A 1WZAA 4UNIA 1UWSA 2PC8A 4J3XA 2Y8VA 4UQDA 3VD4A 1V02A 2VCBA 4GIAA 3WNKA 1B30A 1KXTA 1O7AA 2CBVA 2ZICA 5JUVA 1CXLA 3L4ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4EAN A;  2J4G A;  1JF6 A;  3CTT A;  1BYC A;  3U5U A;  4IM4 A;  7CGT A;  4UQB A;  3BLK A;  2BVD A;  1V0M A;  4OBR A;  3UR8 A;  1CTN A;  2WZI A;  4M29 A;  3IJ9 A;  1OIF A;  3VGF A;  4MNJ A;  5FCZ A;  1CGT A;  1BYD A;  3AOF A;  3VGB A;  2C7F A;  1E55 A;  1G5A A;  4UFJ A;  1WO2 A;  4JZ5 A;  5KZ6 A;  1E6X M;  1ZBW A;  1H09 A;  2WWC A;  3K8L A;  2J8F A;  1PZ3 A;  5ABF A;  2HVM A;  1UKO A;  1UH3 A;  1V3L A;  3VTR A;  4P8X A;  2VZV A;  3QHO A;  1QI0 A;  2DH3 A;  2BY0 A;  2VX5 A;  4AY1 A;  4MB5 A;  4AEE A;  3POC A;  3BH4 A;  3OB8 A;  1H3G A;  1OSE A;  3QOK A;  1KXH A;  1G9H A;  5A6A A;  1EA9 C;  1V3H A;  3NSN A;  1ZBK A;  1NAR A;  3I3E A;  1E6R A;  1JYW A;  2J7D A;  3ZM8 A;  1UUQ A;  1V08 A;  2D2O A;  4EAM A;  4DWS D;  4HA4 A;  5I5R A;  4N0R A;  1KR1 A;  4UCF A;  1ZBV A;  5DF0 A;  2CHN A;  4HZ6 A;  2G3I A;  4NZC A;  5HPC A;  4HA1 A;  1FFQ A;  2YDR A;  4MB4 A;  1R7A A;  3NIY A;  3N12 A;  1CIU A;  4UQA A;  1A47 A;  1XYF A;  1E5N A;  1W3K A;  2DSU A;  4GI6 A;  2ZUV A;  3SUU A;  2PBO A;  3GH4 A;  3PTK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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