5DELA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm59
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
NPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title The X-ray structure of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound to a potent and selective N-phenylbenzamide inhibitor reveals novel binding-site interactions.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 142
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2015-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5delA00
4AXKA 5HWMA 4Y6GA 1P4CA 3CT7A 3UY7A 3L0GA 3VCRA 3GK0A 1K7XA 3NPWA 2QKFA 3P81A 4CNPA 2Z6JA 3NR0A 5BRBA 4IMEA 4GUJA 4O0ZA 3HG5A 1YXCA 3F4NA 3M47A 5HUPA 2Y62A 2VEKA 2A2IA 2DJXA 1WV2A 3NL6A 4WJEA 1NF0A 3T78A 3HPSA 1TREA 2WV8A 3LLFA 4FNRA 2NV1A 3VKJA 2RDTA 1DJQA 4JY9A 3LHWA 2Y89A 2GJLA 2GVJA 4BI6A 1T8XA 2H8ZA 4FXSA 1FCBA 3CPRA 5KMYA 2C18A 4U4MA 1GT8A 2GPTA 2CLKA 4RKAA 5AHMA 5KINA 4IX0A 1UASA 3NXFA 5AN7A 3JRKA 3Q58A 1SU5A 5D04C 1BKSA 2J27A 4BWLA 5FF7A 3W70A 1Q6RA 4L4MA 5D2WA 1F76A 3B8DA 5AOUA 4UFJA 3WFAA 4Z1DA 2QCFA 3TAKA 3OVPA 1I2RA 4TO8A 1IXNA 3TR2A 1A5BA 3LRLA 1G7VA 3DGRA 3NGJA 4O17A 4I7VA 2ZFAA 4ML9A 3T44A 3TQKA 3LBMA 3MWAA 1HUVA 2E6FA 1QOQA 2WJZA 1JCLA 4P2VA 8TIMA 4IQLA 3DAQA 2A85A 3LX9A 1HL2A 1ZAJA 1LYXA 1LTDA 1GJPA 2J9YA 1G69A 3THAA 1OFRA 1QCWA 2DZSA 3SY5A 4N6FA 1LM1A 1AL8A 1OG0A 1SZNA 4JYDA 3WK2A 1GWJA 1MO0A 4FNSA 3QF0A 1WOBA 1S5TA 2H3BA 5L9FA 4Y8FA 3GVGA 1ONRA 4FNPA 5BNKA 4PC8A 1DHPA 4MPQA 3RLUA 3EWBX 3G1XA 1ZHAA 4XQ6A 3W7OA 2OJPA 2ATSA 5DLCA 4NJJA 2YX0A 3M6YA 3O6DA 4AVFA 3GX9A 5F4XA 3Q37A 4WXYA 3A9IA 3B4UA 5A5WA 5DBTA 3L67A 2D73A 2WSRA 1AW2A 2EGZA 4M5PA 3P74A 3LOTA 2C19A 3UXAA 3NVTA 2TPSA 2JK2A 4NNBA 1U83A 3NG3A 5D2TA 2EF9A 3HB9A 5GVJA 1FXQA 1FY6A 3F4WA 3UNDA 3TH6A 4JEQA 1DV7A 1JUEA 1ZNNA 3MHUA 3P82A 2ISSA 4ZQMA 2JGYA 1W31A 1CI1A 3W23A 1UUMA 3MI2A 1GG1A 3C2RA 3G3DA 3SZ8A 3CTLA 1K8YA 4LWWA 5LNVA 3LHVA 3P80A 3IVSA 5HUOA 5G2WA 3RNDA 2WKJA 3GLCA 3NM1A 4GUGA 1EP2A 5D02A 4O52A 1EP1A 4RK8A 2WOQA 4AWUA 3B0VC 3I7QA 2GVGA 1BTMA 2NX3A 4ICNA 2ZRYA 4XTIA 4Z0JA 4DQWA 4UFHA 1TTIA 3LXAA 3NQEA 1XKYA 3TNOA 4KFPA 4UR7A 3M5ZA 4NQ1A 4OHQA 5L6UA 4A2RA 5DCBA 2VFHA 4BI5A 2TSYA 5IM51 5DN1A 2WQPA 3W2NA 1J5TA 2PRLA 1I2OA 1OF6A 2ZA2A 3LHYA 2NUXA 3G1DA 4O1BA 4K8EA 3E0IA 1PHQA 3G1HA 2LLEA 3C61A 3P60A 3GXPA 5BMXA 2VEMA 4K38A 4NVTA 1KFEA 1OVDA 3QSRA 3W87A 4XBKA 4CNOA 1AK5A 4AHPA 2QJGA 2CLMA 3TSBA 3KVMA 5D2XA 3PM6A 1LBLA 2VFDA 1Q6QA 3NQ8A 4LVAA 3W7QA 1CW2A 4K39A 4UTTC 1UCWA 1X1OA 5LGZA 2X1SA 4FIQA 2Y88A 4JN6A 4D2JA 5AC7A 1A5CA 3LLDA 4P61A 3W2UA 2E68A 1PL9A 2RKXA 3DFQA 2V9DA 1FDZA 1O95A 2NV2A 1ICSA 3BW3A 3QH2A 4FNQA 1XBYA 2OT1A 4UC5A 5D30A 1TPWA 3LCWA 3QJAA 4AH7A 1JCYA 2RHGA 3D0CA 1F05A 2P10A 3RLVA 1T99A 4IGHA 3STGA 2OCZA 3LDVA 3P8IA 2ZRXA 2H6RA 4LW7A 3G18A 1XDMA 3I68A 2CLEA 4XKYA 1QOPA 2VC6A 3N2MA 1F73A 1E51A 2NLIA 4X3ZA 6ALDA 1K02A 1T0OA 4OT7A 1KFJA 1W5PA 2BLEA 4W9TA 3CU2A 3GKFA 1KFLA 2WNQA 1A50A 3W83A 1XCFA 4UTWC 1LRNA 3NZRA 3ABSA 5I3HA 1FWNA 4LUJA 5H2ZA 2Q8LA 5D09A 2Z0IA 3HG3A 4FNTA 3UWWA 3NA8A 3PC0A 4K37A 3MP5A 2CLLA 5EA9A 4WY0A 3GDTA 3NM3A 5D37A 3CWNA 2X1UA 3DI0A 3NQCA 4M7TA 3TXVA 4HNUA 3W1MA 5CKSA 3B05A 3UYCA 5BOOA 2I14A 3NO5A 4GNJA 2ZDRA 3A5FA 5CG7A 1IF2A 3EWXA 1G6CA 1VH7A 2NUYA 1ZENA 4FXRA 1F2JA 3R2GA 4TX9A 1HG3A 3O6CA 4PEKA 5DBUA 1LLZA 3W7EA 2ZZ1A 4AWSA 3S1WA 1Z48A 1QWGA 4KWWA 3O8AA 4YCPA 3LERA 3VE7A 2B0MA 3LV5A 3TC6A 2V0TA 5E93A 4OWGA 2H8XA 4ALDA 2OMAA 4JTSA 4DF2A 4MVAA 4QIUA 4OE7A 4H6KA 3GR8A 4GUIA 2O7SA 2WO5A 2V30A 4JX5A 3NQ7A 4Y90A 3MUXA 5BMWA 4HNTA 2V2DA 2EPHA 2OT0A 3ZWSA 1QNVA 1OK4A 4O13A 2F84A 4MUZA 3UY8A 3S1XA 4Z1CA 1LP6A 1UUOA 1WOAA 3W1NA 1LLWA 4R34A 2QAPA 2A0NA 4PFMA 2EAWA 1JRBA 2QCCA 3F1QA 1N8FA 2YR1A 4E2BA 1TTJA 4K6AA 3SI9A 1X1ZA 5K4XA 3BG9A 1GTHA 3IIOA 1H5YA 3W1RA 3FKRA 1KV5A 2Y7DA 1GG0A 1X6UA 3HF3A 3PG9A 2E5BA 3G1VA 1FCVA 5FESA 2AQWA 2J88A 3EWUA 1ME8A 3BVJA 3QYQA 3HOJA 2P1FA 3C0JA 1H7XA 3G1YA 3E96A 3KRZA 3W2JA 1F6PA 2QUVA 3H54A 3GKAA 2YZRA 4C1KA 2KZHA 4GFSA 4LT9A 4HNVA 2V2HA 5KZDA 3IVUA 4HHPA 2ALDA 2YFOA 1PCKA 1QMLA 1KM6A 3L65A 1TQJA 3MJYA 3W1AA 1XUUA 4K36A 1Z42A 5LNUA 3R8RA 4RZ6A 5CZJA 4QISA 3NYZA 4HPXA 4KKXA 3U2OA 1MXSA 2Y63A 5K3VA 5K9CA 4YWIA 3W7KA 2JKPA 3FA5A 1L6WA 1W1ZA 4LVDA 3GYEA 2XN0A 4NJHA 4KFOA 3EXTA 3TAOA 3CHVA 1Q3NA 1C8VA 1W37A 3MYPA 2NXHA 3WJWA 3ZWTA 1DL3A 1TTQA 4NX0A 1TMHA 4GE8A 1QPQA 2GOUA 3P5ZA 1DJNA 5G5IA 1THFD 3TA6A 1F74A 1YDOA 4ORMA 4WQ6A 3W7PA 2CLHA 2EKCA 4UXDA 1VCVA 4WXZA 2YYTA 3NPUA 5G2IA 3TX9A 5FEWA 4N9CA 3G8EA 1XM3A 3DFTA 1N55A 3HG2A 1MEIA 4MJZA 4AB4A 1S5WA 3S8HA 3NDOA 1YDNA 3LRMA 1MEHA 3DHFA 1Q45A 3NPVA 2XFWA 2O7QA 4M7SA 5AC6A 4WZHA 1Y0EA 1KBIA 1GYLA 3A22A 4A21A 3QSTA 1QO2A 1SFJA 2YW3A 3C2VA 3DXIA 1YTDA 1BWKA 2CFFA 3MHGA 1K03A 2P0OA 2GJNA 4UTHA 4GUFA 1O94A 4N2YA 1G4PA 5D38A 5F2LA 2GVLA 3HQ1A 2ZZ2A 4FO4A 1TTPA 1HO1A 4LV9A 3M5YA 5FF2A 1QO5A 1OFBA 2QAFA 2QCGA 1NEYA 4Q33A 1ALDA 4NUWA 2JKEA 4H4IA 1MEWA 4CQAA 3S5YA 3W1TA 3U8GA 3S9YA 2H3DA 5KITA 3A5VA 2Y70A 1IGSA 3TKFA 4HNNA 2RDUA 2YW4A 3W7NA 3GIYA 4TU1A 4YL2A 4M6PA 1EA0A 3MO7A 3HIJA 1SFLA 2WNZA 3C52A 2J6XA 1C9DA 2B7PA 4IMDA 4O14A 4BI7A 4O57A 1KFCA 1OYAA 4O1AA 2GQ8A 3S6DA 3LCFA 3BW2A 1DQWA 4AF0B 1LRTA 3M7WA 3FS2A 4OV4A 2QF7A 3DFNA 5J5RA 2BXVA 3TW7A 2J9XA 3P67A 1IXPA 1OFEA 4JNMA 3O1NA 3NAVA 1PVNA 2Q3RA 1VQTA 2ZZ7A 3HPXA 1P5BA 4MY9A 2QCHA 1OF8A 4TR9A 1NVMA 1FWSA 4N6EA 1OHLA 3OA3A 4MYXA 5EKYA 2WNNA 2PCQA 3H55A 5FF0A 1QAPA 1RQEA 5BW6A 4ADTA 3W1PA 1H7NA 7TIMA 1XBVA 2QCDA 2HSAA 4GUHA 5K2ZA 3N34A 3OHIA 4PL1A 4O4WA 2FB3A 5CPOA 1G67A 3I6RA 4OGZA 4CCEA 5D2VA 1TB3A 4WY0F 3SR7A 2FPTA 4AHOA 4Y9AA 1M7OA 2V2CA 1YXYA 4JTHA 5CSRA 3RK8A 3QZEA 3EX6A 3EX3A 3LI1A 3KXQA 1I4NA 1QPNA 2R14A 3EB2A 4U28A 5I3GA 1P0NA 1KFBA 3C2EA 3VNDA 4GJ1A 5KTLA 4MKNA 1ME9A 3PBWA 4O8RA 3EWWA 1LCOA 3DZ1A 3W75A 2JKAA 1WDWA 5D2YA 5C2XA 1TPFA 3R13A 4M6VA 5C5YA 3ABOA 5DXXA 3W7MA 2ISWA 3HPZA 4ADSA 3B06A 3S5ZA 4ZMGA 1WX0A 1C29A 1HO4A 3BLFA 4N4PA 4BK9A 2BWGA 4LOCA 1VHNA 2ISVA 1VYPX 4LVFA 3MW7A 4ZQPA 1FUYA 4MLJA 1VPXA 1H7RA 2GUUA 2QJHA 1OX4A 3EXSA 3G0XA 3GAKA 3L0KA 4RXFA 1RQBA 3W7JA 3ABRA 4EF9A 5G2HA 1RPXA 3OIXA 1GPWA 1TPB1 3TQVA 4JYFA 2YSWA 3BPWA 3EKLA 3R5EA 1AG1O 5I3KA 4DO6A 3NQDA 3PF3A 3GDKA 3MBFA 1TRIA 2PRMA 1K8XA 3LCLA 3FLUA 3MMTA 1VZWA 2DP3A 3L5MA 1FDYA 4LV4A 5KSWA 4NZJA 1W0MA 1ME7A 1EEPA 2B7OA 5IBXC 3S5OA 4O0KA 1PV8A 4MFEA 5IBXA 3QMRA 1TRDA 3QPZA 5U7SA 4PCFA 1BEUA 1VYRA 2X2GA 4PH6A 4N9DA 3UWQA 2DU2A 3FIGA 3W1XA 5K7JA 2RH9A 4G1KA 4KFNA 1AL7A 2NWRA 2JBMA 2G5WA 3TUUA 2ATMA 4MFDA 4O4VA 2YCEA 4CLMA 4NX5A 4N9BA 3PUDA 3TFCA 2G95A 1I2QA 1LBFA 4EWND 3STFA 2E77A 3THQA 4A2SA 4ZZ9A 3TJXA 1BWLA 1VHCA 3FKKA 3HGRA 2R8WA 1YYAA 1H7WA 2CU0A 2QEZA 2E6AA 3I7SA 3O07A 4MY1A 3ZFHA 4UMCA 1VGAA 1W3NA 3T7VA 3A23A 2C15A 1OFPA 4YCOA 4NXSA 2PE4A 2ZRZA 2ZTKA 3R12A 3T40A 3VFLA 3IGSA 3W1UA 3WJYA 4BR1A 3GNDA 4UFKA 3TV8A 2ZA1A 3I7RA 5FEZA 3P7YA 4RZ4A 3ANYA 1QDSA 2VFIA 1AW1A 3VI2A 1L6YA 3NNTA 3CIWA 3N19B 1OX6A 4J9JA 1KV8A 4UTTA 1TQXA 1ZJIA 3UPBA 3OVQA 3MI6A 3WK3A 2J24A 2CZ5A 4Q4KA 4WUIA 1XL9A 3GB6A 3HMJG 4AEOA 3AJXA 4JTTA 3M44A 1J2WA 1PIIA 4LS2A 1HFBA 2Y6ZA 3CM4A 4R7JA 5AYXA 4K7YA 4QM1A 4NJIA 4LY8A 3NL3A 3ABQA 4WX2A 3UWVA 5LNRA 2FPYA 4DXVA 1EX5A 1YPIA 1W56A 2IQTA 1EIXA 4Z0SA 1WA3A 1B4EA 5CPLA 3FEMA 1LBMA 2CW6A 3QM3A 1RV8A 2X30A 5HULA 3CQ0A 3MI3A 3ZR4A 3YPIA 1KM0A 1SR9A 3W7CA 5EY5A 2DZWA 2CZFA 4TMBA 3SJ3A 1O60A 5EMUA 2H90A 1WQ5A 1OYCA 4UTWA 1EWDA 2PURA 3VE9A 1ZAHA 4JXCA 5HQEA 5HJLA 4CQ8A 4ZQRA 1LOLA 4LC6A 1LRQA 3LTSA 1FDJA 5HWJA 3IIPA 2ZRWA 1I2PA 1OFAA 3CC1A 3QMTA 4DF0A 3HBLA 2V5BA 1I8JA 4AAJA 1NAL1 3CIXA 1VYSX 5FF4A 1XBXA 4JS3A 3B0PA 4YMZA 1XDLA 3KRUA 3N9SA 1XFBA 4LVGA 5CZSA 4DEFA 5HNRA 1WAUA 2QCLA 1R2RA 1HTIA 3CB8A 3TE9A 1RVGA 5E0KA 4OBTA 3TFXA 1R2TA 3OEXA 1FWRA 1QR7A 4M19A 1FCQA 1H63A 1SW0A 4S2CA 4UMBA 4A3UA 1I2NA 3RFAA 4ZQNA 3C6CA 1D3GA 1DORA 1G7UA 3QRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ACU A;  2QKF A;  3NR0 A;  4HMC A;  3W53 A;  3WEM A;  5BRB A;  2G3M A;  3URQ A;  4O0Z A;  4XAF A;  3GNO A;  5CXP A;  2GOK A;  3F4N A;  1XRT A;  3KEH A;  4B4F A;  1MZR A;  5HUP A;  4Q22 A;  3OLG A;  2J13 A;  1PX4 A;  1ZJB A;  1NF0 A;  4WJE A;  2WV8 A;  4P8U A;  3RLH A;  4K3Z A;  2OGY A;  3WIJ A;  1I1X A;  3SAZ A;  2GJL A;  3I3B A;  4KCT A;  3IGH X;  1XRV A;  1XCX A;  4QDW A;  1FCB A;  5CSY A;  3UW6 A;  1D2K A;  1NM9 A;  4ZST A;  4KIE A;  2CLK A;  3LQL A;  4FPS A;  4Y7E A;  2D3N A;  3UEQ A;  2VDI A;  3I10 A;  4DYE A;  1W3J A;  2INF A;  3FAW A;  3U3H A;  5LIU X;  3V36 A;  4BWL A;  5FF7 A;  1VJS A;  1EC7 A;  5D2W A;  4UFJ A;  3IAC A;  3EAU A;  2PF0 A;  1NQ6 A;  3NZP A;  3FY1 A;  1JNE A;  3CUZ A;  4Y9P A;  1PBG A;  3STP A;  5FJP A;  1IXN A;  2AGT A;  1KC7 A;  3WD1 A;  2F6X A;  2XSX A;  1YHT A;  4I7V A;  2ZFA A;  3PZQ A;  4ML9 A;  3T44 A;  1HUV A;  2P53 A;  2YZ5 A;  1QOQ A;  3O3R A;  5BXT A;  1P1M A;  3CHE A;  8TIM A;  4IQL A;  2NSX A;  2BFG A;  3BE7 A;  3UR7 A;  4HK6 A;  4IPN B;  4KRU A;  2J9Y A; 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