1F7BA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii in complex with 4-oxo-sialic acid
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
total genus 127
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f7bA00
3CPRA 1A50A 1OFOA 5CGQA 3U6WA 3BLIA 4Q32A 1LRQA 2V81A 3I7QA 1YTDA 1ZFJA 3SJ3A 1HG3A 1S5WA 1GTEA 4JTSA 2XN1A 1VYRA 3MMTA 1GT8A 1X1OA 3S5ZA 4DXVA 4YWIA 4FO4A 4NZJA 1TRDA 2FLIA 3NR0A 4ADTA 3EWBX 2I1OA 2FQIA 1QWGA 3KVMA 5CZTA 4YL2A 2O7SA 1PS9A 4HSOA 1WQ5A 4JR5A 1K03A 5FEXA 4UFKA 1JCXA 3F4NA 4LU0A 5KMYA 1VJIA 5C54A 1VS1A 3MUXA 4QM1A 2P10A 3KRZA 5AC6A 1VCGA 3NEVA 2ZQ0A 1HTIA 1KFKA 1M6JA 1SU5A 2ZTJA 1FWWA 2Y7DA 1UJPA 3QFEA 4IOTA 3G3MA 2ABAA 3F4WA 3G1AA 2Z6JA 4FF7A 3LHTA 4PL1A 1ZCOA 4PFMA 3RNDA 2Z6IA 3IVTA 4KFPA 1J5TA 2GQ9A 1YPIA 3O07A 4X22A 2X1SA 4JS3A 4JN6A 1FCVA 3C3NA 3S1XA 3C56A 3LCLA 1QO5A 2B7OA 4JIPA 1VYPX 1XUUA 4JTTA 2Z1BA 1TSIA 3CB8A 4C1KA 1FBAA 3U8GA 3KFTA 2FB3A 3FLUA 1EA0A 1RVGA 2RHGA 4JX5A 2FPTA 3QPYA 1KTNA 2E68A 1G7UA 3DHFA 1LRTA 2GVGA 3ANYA 3OVPA 3BARA 3T40A 3T7VA 1KW1A 2Y85A 4GJ1A 3S9YA 2NUXA 4XTDA 4OU1A 3NQGA 1FX6A 4WY0A 3M5VA 3IRDA 4NXSA 2CWNA 4MUZA 3VI2A 3L9CA 3OA3A 1IIGA 5C5YA 2DP3A 1SO6A 1PV8A 4H4IA 1QOPA 2V82A 3P67A 3C52A 3GDRA 3M41A 4QIUA 1TPDA 3LRKA 2QDHA 4ADSA 5HNRA 3LX9A 5K9DA 2J9YA 1PL9A 4ZVJA 3TQ0A 4BI5A 1VZWA 5HR7A 2NV1A 3W1LA 4HT3A 3TAOA 3DFSA 2TRSA 4LV4A 3UWQA 3C2VA 1ONRA 4M6PA 3TX9A 1OVDA 1Q6LA 4XBSA 5F4SA 3TC7A 4AH7A 1KV8A 1THFD 1GZGA 4DELA 4G1KA 4CNNA 2QCMA 4UNKA 3N3MA 3F03K 3M43A 4IQLA 1G4TA 4O8RA 3C6CA 3K30A 3OVQA 3QC3A 5AHIA 1XC4A 1FUYA 4DBDA 2AGKA 3N73A 3L5MA 4IUOA 4AB4A 1XKYA 3DFPA 5HWJA 1DQXA 4N9BA 4XQ6A 4IGHA 1ME7A 3BG9A 3HG4A 2J9ZA 5AFDA 3HO8A 1SUXA 1IIHA 1LOLA 4OHQA 2Y70A 1W54A 3NZRA 3C2RA 3QYQA 1TPEA 1RQEA 1TTIA 5D04C 1KBIA 3N19B 1JUEA 1QMLA 3DFOA 3NVTA 3FIGA 2Y61A 3KX6A 2ZDRA 5LNVA 3LTSA 3IEBA 1BWKA 3CEPA 2ALDA 3MBFA 4NVTA 1KM2A 4MJZA 1B9BA 3DI0A 1S3HA 3JS3A 3NM1A 5AHLA 4FNQA 2DJXA 3LHUA 4IMGA 5KITA 5K7JA 5HJLA 1DV7A 3T55A 1SFJA 5HUPA 3TXZA 1LRNA 4DO4A 4FHAA 4XKYA 3R13A 1EUNA 2Y88A 4GUJA 1TPFA 4NX0A 3GKFA 3P5YA 3TJXA 3G3DA 4QISA 3O1NA 3A22A 4JEQA 2Q3OA 3TK7A 1R2SA 3B06A 3H53A 1VC4A 1FCUA 4GE8A 5HUOA 2JK2A 5SWUA 3ATYA 3SZ8A 5HINA 1DHPA 1OX5A 1XBZA 1H62A 5F4WA 4YLWA 4GUGA 4GRSA 1AL8A 3GX9A 5FF0A 1VCFA 3P5ZA 1SQ7A 2JKAA 4DBEA 3TNOA 3UWZA 2A6NA 3TA6A 4LC8A 4YCPA 3GNNA 1OFPA 2BLEA 4BWLC 4JTGA 1Q6RA 2Y63A 4UFHA 3TV8A 2FPYA 1TJRA 4N9CA 4ML9A 3IIZA 3W86A 3IGUA 4K36A 4K39A 1QPQA 1RPXA 3W7HA 1KFBA 2E6DA 1YXDA 3M5ZA 2QUVA 3W76A 1I2QA 4LOCA 5G4EA 5E1QA 4Z0SA 2QUUA 5I3IA 1EX5A 1H1YA 1G4PA 3QF0A 3KVJA 4XBKA 4X2RA 3G1XA 2C18A 4UNLA 1QR7A 1TQJA 1LBMA 1OFEA 3GDTA 5EMUA 4M7SA 2GJNA 1MEIA 2G96A 2VFEA 1G4SA 2NX9A 2WKJA 1K7XA 3M16A 5G2WA 1AW5A 4O15A 4LV9A 3UPBA 4UMAA 3W7JA 4JX6A 3IIOA 2RFGA 3MP4A 4N6FA 4MOZA 2F84A 3DKLA 2YW4A 3W7CA 1KM5A 2WQPA 4LNYA 2A21A 1GOXA 3NL6A 2X30A 4JYEA 3VE7A 3TW7A 3SFKA 3P82A 3GDKA 4IPJA 1Z44A 1I2PA 3L0NA 2OT1A 3TUUA 2NXIA 4IXXA 4ZQMA 1PVNA 2QAFA 1GYLA 4LUIA 1GVFA 1ME8A 3CWNA 3ZWTA 3W2KA 4ZQCA 2E6FA 2QKFA 3JRKA 3QM3A 5A5WA 2RDTA 3VKJA 2WSYA 3C2OA 3GLCA 1X6UA 1GJPA 2P0OA 4LT9A 5LZLA 4OQVA 4LY8A 4IJBA 4TMBA 4HN4A 2QJGA 4O1BA 4HPJA 4WOQA 4K8EA 1DOSA 4MY9A 2H3DA 1X1ZA 4GXMA 3GXPA 3NQ7A 2A85A 3PB2A 1JCYA 4AHOA 2VFIA 4FX6M 1DBTA 4L4MA 5AYYA 4UTHA 5FESA 3W7MA 3B0PA 3ATZA 3B03A 1LLWA 1TTJA 4CCCA 1MEWA 4O12A 2BXVA 3LCXA 4ADUA 1GWJA 1EUAA 3H55A 3W83A 3W7IA 1TTQA 4ORIA 1JCJA 2WNQA 3P8IA 1OFQA 3S5NA 1H7WA 3W7LA 2ZRWA 3NDOA 3HOJA 1VHNA 3ZWSA 4IX0A 1V7YA 1YDVA 4OBTA 3L0KA 3O6YX 4LVAA 3WJXA 5LNSA 3HMJG 4EF9A 1T8XA 4M6QA 3GNDA 1N55A 2OZ0A 2Z2UA 3P8JA 3CIWA 5CG7A 4JGDA 4P61A 1C29A 4A21A 3G1FA 5BRBA 3EXTA 3I68A 3STGA 1SZGA 2CLKA 4UTWC 3W2UA 4IWWA 5IBXC 4WQ6A 1OABA 3DFTA 3NA8A 1SW0A 3USBA 4MYAA 1Z48A 3L68A 2OX1A 3PG9A 2J27A 5D2VA 4HSNA 3DU0A 4IMEA 3FYPA 1I2OA 2CLIA 3E0IA 3CLMA 3W7RA 1TV5A 1H7PA 3VE9A 4ZQOA 4MY8A 4U28A 2VFDA 4FNUA 4O17A 3A24A 1HFBA 1SSGA 5AC8A 3GKAA 2YFOA 2YGYA 1EP2A 1NAL1 4NJIA 4O19A 3IGXA 1DVJA 3LXBA 2DZVA 1PE1A 2FDSA 3ZS4A 5KZDA 1PHQA 1K7EA 2VOMA 5A8GA 4TO8A 3LRLA 1O95A 4UXDA 1O5KA 1LM1A 1IGSA 4QSHA 2ISSA 2YXGA 3QH2A 2V2HA 1QPNA 2C6QA 1TPUA 2PRLA 1ZAIA 2GPTA 1FCQA 1FXQA 5BW6A 2ATSA 1YPFA 3R5EA 2W79A 2TPSA 1WA3A 3MHFA 4MVAA 1YTEA 2Y7EA 5EKYA 2XN2A 2CZ5A 3FA5A 5K2ZA 2PC4A 1TRIA 1C8VA 3NQFA 2NXGA 3PWAA 3S6DA 4GUFA 5AHFA 2E6AA 1KM0A 4KWVA 2G95A 4KKXA 3QPZA 3HPSA 3E02A 2VFHA 3PBWA 4JX4A 2A6LA 4EF8A 5KZEA 4UTKA 1JCNA 3IVUA 4JTLA 1LZOA 6TIMA 2DORA 3UY7A 4UTIA 3UWVA 3O06A 4AEOA 2ZA3A 4TIMA 1W0MA 3LCHA 3QW3A 2PURA 4UFMA 5EY5A 3JR2A 3MJYA 4BI6A 3NNTA 3M0ZA 4O1AA 1QFEA 2R8WA 1LLZA 4A29A 4KFNA 1QCWA 2X16A 4ZQNA 5FF7A 1FDYA 3NQ8A 1SO5A 1DJQA 5K9XA 2ZRVA 1JQVA 5LHEA 1W56A 3S0CA 1YXYA 4K8HA 4GFSA 3PUEA 1EEPA 3HGSA 1JQXA 1SFLA 3DXIA 1FDJA 1TIMA 3A5FA 4JYFA 5DY2A 2QF7A 3G1VA 3LI0A 4PTNA 5F4XA 1VRDA 2ZZ4A 3B0VC 1JCLA 3BG5A 5LNWA 4FB7A 1VLWA 1B4KA 1L2UA 1VQTA 5FI8A 3OIXA 3QRHA 4CNPA 1YDOA 2YFNA 4I7WA 2V2CA 1J4EA 4NNCA 3N9RA 1R46A 3S1VA 2QCDB 4UTJA 1JVNA 4EIVA 1KFEA 2PRMA 1SO3A 1OFRA 4WD0A 1DQWA 3QEZA 4NUWA 1EP1A 3MW7A 4LVFA 4RR4A 3LM7A 3W75A 1OHLA 4R33A 3FKRA 5D32A 1IXNA 4X3ZA 1UUMA 2B7QA 1ZAHA 3GYEA 3MI2A 4QNEA 1F73A 1H7XA 4OWGA 3TFXA 5FF2A 3STFA 4QJ1A 4M5PA 3UPWA 1NF0A 2V2DA 1MZHA 3W7PA 4MJMA 1XL9A 3LHVA 4M7TA 5DY3A 3UD6A 3B8DA 4JICA 3KHJA 3AO0A 3H54A 2JKPA 2BX7A 4IMFA 2JGYA 3NL5A 2BSLA 4WJEA 4QITA 3BW2A 3PS7A 3BLEA 4JDBA 1AK5A 1XDMA 1H7RA 4Q4KA 4K7YA 3FOKA 4U4MA 3W71A 4Z1CA 1WOBA 4FNRA 4QQ3A 4PA8A 5C55A 3EX2A 3R8RA 4I9AA 4RX0A 2J9XA 5AYXA 3G1YA 4AMAA 3W1MA 2A1YA 3EWYA 3GVGA 1J2WA 3CC1A 1WV2A 3SGUA 1FWSA 3B4UA 3U2OA 4O11A 1TV8A 2QCFA 1NEYA 3HPXA 1XDLA 3SW6A 3B0UX 2VEMA 1H51A 3LCWA 4BF9A 4DEFA 2E09A 4XTIA 2FTPA 1GVQA 3TCEA 3NPWA 4AAJA 3VFLA 1JJKA 4BWLA 1KTBA 5I3HA 5BOOA 1Z42A 3PG8A 4IXHA 1YXCA 2FJKA 3UY8A 1W5OA 4MLRA 3LDVA 1VGAA 3L67A 5I3GA 5D30A 1XXXA 3TROA 4Y96A 5LGXA 3IGSA 2EKCA 1F7BA 3R2GA 2GVJA 4WX2A 5K3VA 3BW4A 5H91A 3LHWA 4LS1A 1W31A 5DELA 2VEPA 3CEUA 1TMHA 2YX0A 5H2ZA 1D9EA 5IM51 3PULA 2B7PA 4UTLA 1AL7A 1P4CA 1PHWA 1ICSA 3VNDA 4UFIA 3EX6A 3GR8A 3HG5A 1VPXA 3LCGA 1CI1A 4RXGA 2QCGA 4GC4A 4PC8A 3WFAA 1GVRA 3C2FA 4FIQA 3L5AA 3DZ1A 1B4EA 1RV8A 1Q45A 2NX3A 2WPBA 1P0NA 4Y9AA 4JTFA 3NXFA 3HF3A 3GB6A 1GPWA 3W1UA 4DF2A 3Q2DA 1G4EA 1QOQA 2R94A 4JDYA 1C9DA 1KTCA 5AHEA 2Q3RA 2QDGA 1KM1A 3W2MA 1I2NA 2E6YA 3NQDA 3LOTA 4RLIA 5E0KA 2I9EA 5E93A 4RJEA 1LROA 4BR1A 5DCEA 3EX3A 3ABOA 3BV4A 1RZMA 3M1ZA 4RZ5A 2CZFA 2FB2A 1K02A 4MIMA 2KZHA 3ZR4A 4PODA 1TPC1 4CQ8A 4POCA 1TYGA 1U5JA 5FEZA 1TO3A 1ZHAA 1GEQA 2CW6A 3NZ1A 4JNMA 3I6RA 4AF0B 1N7KA 1A5CA 2HSAA 4ONVA 1EIXA 3TU9A 1XCFA 3BGJA 3W87A 3IVSA 5DBTA 3QQ1A 4RCXA 1BKSA 3MYPA 2DZPA 2WO5A 3GAYA 3PUDA 1VHCA 1IXQA 1MEHA 3FKKA 2ISVA 3RF9A 3PSVA 3LBCA 3NQCA 1WOAA 2PCQA 2V8ZA 4Z08A 4O0KA 4E2BA 3S5YA 1TTPA 4KWWA 1AMKA 4EOUA 2X2GA 4IMCA 4MKNA 3UWWA 4B5NA 4FXRA 2QCDA 4BK9A 4EVZA 1JUBA 1W8SA 4R7JA 2JBMA 3UZ5A 3INPA 4O1CA 4KFOA 1OF6A 4MZ8A 3RLVA 3STCA 1F76A 3STEA 3W70A 4QAIA 1SSDA 5G2IA 3HIJA 5G1YA 3W7QA 3G18A 1E51A 1ZAJA 1FWNA 5CPLA 3PB0A 2QAPA 8TIMA 2C14A 3EX1A 3PVFA 2ZTKA 3W72A 1K7FA 1F05A 4WZHA 2WNZA 2ZZ6A 3KAOA 4O13A 2OT0A 4LRTA 5D2WA 2RKXA 1H1ZA 1ICQA 3ZFHA 3NQVA 5AB3A 4M19A 2ZZ5A 1F74A 2J6XA 2VFFA 1UASA 4FX7A 4PL2A 1A5SA 2E5DA 1RQHA 1WBHA 4NJKA 2YW3A 3KVKA 2GQAA 1TV7A 3NPVA 3WJYA 4UTWA 1JR1A 5IBXA 3PR2A 2DZSA 1ME9A 2C3ZA 2A7RA 1I8JA 4HNNA 4WOZA 2ISWA 5D38A 3BLFA 3MBDA 5K9CA 2J88A 3IV3A 2BTMA 1K3UA 3G0SA 5EYWA 1LBLA 4IMDA 3TJLA 2B7NA 2C0AA 2R91A 1VCVA 4X9SA 1H63A 1R30A 4LW7A 1YDNA 4WUIA 4LVDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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