2ZZ1A

Snapshot of the reaction from 6-cn-ump to bmp catalyzed by orotidine monophosphate deacarboxylase from m. thermoautotrophicum
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 84
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz1A00
1FWSA 1OJXA 1ZALA 3IIZA 3N3MA 4E2BA 4DF0A 1LRQA 4WUIA 3S5YA 5H91A 2J9YA 3KVMA 2NV1A 1FCQA 3UWQA 1KM3A 1J5TA 1ZAHA 4AAJA 3L5LA 3W07A 3W84A 4E38A 3UYCA 1TJPA 4GE8A 3WK1A 4H3DA 5K9XA 3QMSA 3S8HA 3UZJA 2ATMA 1VH7A 1F05A 3NQ6A 4QIUA 1IGSA 1P5BA 1FDJA 3O1NA 5DBUA 4RCXA 1P4CA 1BTMA 4A2RA 3M5VA 4FF7A 3W2KA 1SSDA 3W3OA 4DQWA 3OBKA 1LDCA 2ABAA 3MI2A 5AHMA 1MO0A 5LGXA 3R89A 5D30A 1C8VA 3PAJA 3LV5A 4O17A 4UTWA 3EWWA 3NQCA 4UMAA 1SW7A 2QJGA 2CZDA 2C16A 4LS2A 4N2YA 1PS9A 3ANYA 3C52A 3VE9A 5DELA 2H3BA 3BVJA 3S1UA 3S5ZA 3HMJG 3S5OA 5AC7A 1ZCOA 2PRHA 4NJGA 3W1PA 4Z1CA 3SJ3A 3WJXA 4WY0F 1TIMA 1UUMA 2WNZA 3TW6A 1AMKA 1JCYA 3C3NA 3GAYA 4H6KA 5CGQA 5F2IA 1JRCA 1MZHA 3NL3A 3W23A 4FX6M 3EEGA 4WX2A 4K37A 4AHQA 5AYYA 3P60A 1SW3A 3BLEA 3LHZA 3LTYA 1WV2A 5CPMA 2A1YA 4JY8A 4RZ5A 3MP4A 1OABA 3T7VA 1H7NA 3T40A 2EPHA 4FNSA 3P84A 5HMSA 1Z48A 5G5IA 3M47A 1JCXA 1QO5A 1K7EA 1Y0EA 2YW4A 1VPXA 1OX4A 3TXVA 3EX1A 4LRSA 1WOBA 5L6UA 2QCMA 1L9WA 2JGYA 3GKAA 2V9DA 2IQTA 1YPIA 2CLOA 1G4EA 3BO9A 4ZQPA 4DBEA 2CLEA 4HNNA 5K4ZA 1B9BA 3FKRA 4HN4A 5AHIA 5LSMA 2O7QA 3NL5A 5TBOA 1VLIA 2WKJA 4UTUA 3N2XA 3GDKA 2B7OA 5CKSA 1PV8A 3R8RA 1VZWA 3L5MA 3B0UX 2TSYA 3S42A 1KBIA 5DY3A 4R53A 4O54A 2YYUA 4JR5A 3STGA 1OG0A 2VENA 5D02A 2RFGA 3B05A 3QYQA 3ZR4A 3EWUA 1GVSA 2OMAA 4KWWA 4MZYA 3S0CA 2V0TA 3MBDA 5HR7A 3LCLA 1S5VA 2EAWA 1QO2A 5LNRA 2VEPA 2Y7DA 4LOCA 3GNNA 3HO8A 4DPQA 4Q4KA 4UNKA 2VEKA 1FXPA 3QF0A 5E1QA 3PB0A 3N9RA 1VGAA 2JBMA 3UZ5A 3GDMA 4JTSA 4OGZA 2DZTA 3EB2A 2O7SA 3G22A 5KSWA 4QSHA 2FJKA 2QAFA 1VYRA 3O6DA 1TSIA 5LNVA 3UXAA 4AH7A 5A8GA 4IQLA 1VCGA 2E6DA 1EIXA 4S2CA 3W2MA 4JX5A 3SGZA 1UJPA 2JK2A 3WK3A 5D2XA 1ZAJA 3KAOA 1I45A 4N9BA 3TJLA 1LORA 3LI1A 5BMWA 1U83A 1SW0A 1VQTA 2V5BA 3PR2A 1ZFJA 3VI2A 4AXKA 3W1QA 5FEXA 5AHEA 3W7LA 3DKJA 3R5EA 3QFEA 3W83A 3TSMA 2C19A 5C6MA 1B4EA 1YXDA 2PURA 3M0ZA 4YCOA 3CM4A 4A29A 3TAOA 2JGQA 4HSOA 5HULA 4O50A 4MYXA 1XI3A 1S5TA 3QSRA 4KFNA 4UFIA 4DF1A 2OJPA 3HG4A 3EX3A 1HTIA 3M5XA 3P80A 5D09A 1KTBA 4JIQA 1JJKA 3P8IA 1W3TA 3MHGA 1XC4A 5FF2A 4RV8A 1OFAA 3DHDA 3B04A 3MI6A 4O0ZA 2GVJA 5F2MA 3QJAA 3PWAA 3QQ0A 4CCEA 1BWKA 1XDMA 5BW6A 1W54A 2QAPA 1VCVA 1XBYA 3TMLA 1ME7A 2RDTA 5HUOA 1KTNA 5D2TA 3DI1A 2EF9A 1FBAA 5I3IA 3STCA 3W7JA 3W7NA 4CLMA 1ICQA 4PL2A 3QMTA 1JR1A 1W8SA 3ABOA 3C56A 1H7PA 4UCGA 1SFJA 4JDYA 4AMAA 1JCLA 3LRLA 1FQ0A 4E2DA 2Y7GA 3MYPA 1R47A 3MW7A 5BRBA 1WDWA 1ICPA 1TPUA 4U28A 1RPXA 1OF6A 3UQNA 2RDUA 2BSLA 5G2IA 5U4NA 4AWTA 4EOUA 1XM3A 4LVGA 1FX6A 3L67A 1Q3NA 4ZQCA 4LU0A 4XQ6A 2VFIA 3NOEA 1SO6A 2H90A 4NJJA 3TR2A 2E6AA 3INPA 3W1UA 4LS0A 3NM3A 3G8RA 3IGUA 3NZ1A 4K8EA 2WPBA 3HGRA 1EP1A 5KZDA 4MOZA 2RH9A 5K4XA 4LY8A 1OYBA 4TMCA 5LNSA 1W5QA 4DO6A 2DZWA 1YADA 3TROA 4MKNA 3LHYA 4O15A 3M44A 4ZL1A 3W72A 4S1FA 4UR7A 3QQ1A 1W37A 1FDYA 1GTEA 2FLIA 4FNTA 3C4UA 2X30A 1FWTA 5F2GA 3PY2A 2A6LA 2ZZ3A 2BTMA 3P62A 3W22A 2ISVA 3P67A 4I7WA 3S1WA 2TRSA 1EP3A 2Y61A 3JRKA 2V2CA 1XBZA 2P10A 3MP3A 3UNDA 1QWGA 1ALDA 3P7YA 2VFDA 3A5VA 3FJ6A 2VXNA 4FNPA 4OE7A 4EWND 4XUGA 3GR8A 4R34A 3DZ1A 3B03A 5EYWA 3LLDA 3TMQA 5C2XA 4PC8A 1IIHA 2A7NA 4AVFA 1LCOA 4UC5A 3W7DA 4BI5A 2A7RA 2ZRUA 3Q37A 1TCDA 4MYAA 2Y7EA 4JY9A 3NPVA 3C8FA 4WY0B 5CG7A 1PHWA 2AQWA 4GRSA 4K8HA 1VJIA 1LZOA 5LKYA 1WBJA 3BG9A 4W9TA 3L68A 4EIVA 2QCNA 4L4MA 1GYLA 1OX5A 2BX7A 1ADOA 1ME9A 3NQ7A 2B7PA 5AFDA 1LRNA 2ZZ5A 3OVRA 4IJBA 3W2NA 1H50A 2J9XA 5DLCA 4MVAA 4NNCA 3BW3A 4O8RA 3TAKA 3I68A 1LM1A 2W79A 5CZ0A 3ATYA 4WOZA 1RR2A 2YFOA 3CT7A 2BZNA 4JEQA 5F1UA 1A5CA 3PBUA 2PRLA 1GG0A 2WV8A 1VHCA 3Q94A 3G1HA 2ZRZA 3YPIA 4HHPA 2VFFA 1DOSA 5K3VA 4NNAA 3CB8A 4K7YA 3NQGA 5K9DA 2QJIA 4R33A 3LXCA 1WQ5A 2E68A 3PBVA 2R8WA 1WA3A 4FEZA 3PG9A 3TV8A 1YDVA 1THFD 3MP5A 4JICA 1QPNA 4Z0SA 1KW1A 3SR7A 1KM4A 1QCWA 1GVRA 3LOTA 2YGYA 3LBMA 4JTLA 2J88A 4Y90A 1RD5A 3GXPA 2VFHA 1XBVA 1N55A 4FNQA 4KWVA 1FDZA 4BWLC 1OX4B 4NJHA 1NSJA 3GKFA 4JTUA 3WJZA 2EHHA 4NX0A 1RQBA 4TIMA 5A5WA 3WFAA 3P5YA 2DORA 2C1HA 3FA5A 1R2SA 4OT7A 4RZ6A 2Y63A 4CNPA 1I2OA 2C18A 5G1TA 4AWUA 4GUHA 1GZGA 4WXYA 1CW2A 1UASA 1JCNA 1ZAIA 1Z42A 5AN7A 1HUVA 2ZZ7A 3G1XA 1YTKA 2ZZ4A 3HG5A 2PRMA 3ZS4A 2Y89A 4O1DA 1OK4A 1V5XA 1AW5A 3KRSA 1TPVA 3CPRA 1K7XA 1GQNA 3CQ0A 2XN0A 3OEXA 4S2BA 4K38A 1TTPA 3R12A 4ML9A 3TUUA 3BG5A 3C61A 3TW7A 4UTJA 4ZQRA 4N02A 1C9DA 4IMDA 3ATZA 1GVFA 1B3OA 1NVMA 1FCUA 4JTJA 4RKAA 5EMUA 5K9CA 3G0UA 1XCFA 4P2VA 4IMFA 1H5YA 2P1FA 2YZRA 1TB3A 1W5PA 1AW1A 4O16A 4NU7A 3LHVA 4NNBA 1PE1A 5K2ZA 4TU1A 2QF7A 3UWZA 3SZ8A 4BWLA 4KKXA 1H62A 3B0VC 1SZGA 1G7VA 4XKYB 2A0NA 4AEOA 1ML1A 2DZXA 3LRKA 5HNRA 1SSGA 1LOQA 3W9ZA 1XUZA 3HGSA 5G1YA 1OFDA 3O15A 2QDGA 2Q8ZA 3EKZA 2ZZ6A 2VEMA 2LLEA 2VFEA 4FIQA 1FY6A 1M7OA 2E09A 4ALDA 2NXGA 3DAQA 3TU9A 1QFEA 3CC1A 3TE9A 1SPQA 3C2FA 5U7SA 5D32A 4A3UA 1B4KA 1W31A 4YL2A 3GR7A 2WSQA 1UCWA 1T8XA 3SFKA 2Y62A 3OG3A 1AL8A 3TCEA 3IRDA 2X2GA 1T96A 1M6JA 5CSSA 1LTDA 4N9EA 1KM6A 2CLFA 4RR4A 3F4WA 1YTEA 4YMZA 2R94A 2FB2A 3PS7A 4WY0A 4LUIA 4NJIA 4PODA 3DBPA 3L65A 2QDHA 3TX9A 2D73A 1J2WA 1KBJA 1IXPA 1R2TA 3BW2A 1TPDA 2E5CA 3G24A 2ZRYA 4LRTA 3O63A 2G96A 1Q6RA 2WO5A 1KM5A 5EPDA 4UFKA 3W2JA 1N8FA 2QR6A 5HR6A 5LHEA 2OZ0A 2OCZA 1VLWA 3IEBA 1OFRA 2CLMA 1JCMP 4AHOA 3KFTA 2ATSA 3EWBX 3CHVA 3OIXA 3A5FA 1YXYA 3TKFA 1SR9A 4FXSA 3WJYA 3NPXA 1AW2A 4GJ1A 1W5MA 3R2GA 3CEPA 1ZENA 3HOJA 2EGZA 1BWLA 2NXHA 4GUFA 2YR1A 3GNDA 1O60A 3VFLA 3B4UA 5HJLA 4RLIA 3FFSA 3S6DA 1X7FA 1EB3A 3N19B 2DZPA 2W0UA 3LERA 4HNVA 4PA8A 1TTQA 4FB7A 3UWUA 3DH7A 1EX5A 5LGZA 2I14A 4BFAA 1QAPA 4NXSA 4O4WA 5FEPA 4MIMA 1YXCA 1FUYA 3LCIA 3WJWA 2BWGA 3LV6A 3NZRA 2B0MA 1KM1A 1I2RA 3W7HA 3E49A 3LCXA 2VC6A 2JKEA 4UTIA 2GJNA 4NQ1A 1NF0A 5AYXA 4M19A 1OK6A 5HWNA 1W3NA 1SO3A 3SW6A 4HPXA 3MUXA 4FNRA 3NQAA 3IIOA 3FKKA 3FJLA 1G7UA 3HIJA 3L0KA 3QPZA 1LLWA 2V8ZA 1TO3A 1EWDA 2WOQA 2NX3A 5FEZA 3HPXA 2CU0A 2A6NA 2OT1A 4N6FA 3TNOA 1K3UA 2HS6A 4LW7A 3RMJA 2Z0IA 3W86A 4UIOA 5AC8A 3BLFA 3QZEA 4Y6GA 5AC6A 1R2RA 1QPQA 1KFEA 1I4NA 5LNUA 2QCDA 5H2ZA 4IX0A 3V75A 2HTMA 4MY1A 3N9SA 4IGHA 4CQ8A 4JN6A 3I7QA 4CQ9A 1JQVA 3NM1A 4MFDA 4XKYA 1T0OA 3HF3A 3FS2A 2CLHA 2PE4A 4MY8A 1DKWA 4LVFA 4HNTA 3QM3A 1SU5A 5I3KA 2C14A 3LDVA 3DHFA 4GUIA 1I2PA 1IXOA 2A5HA 3I7RA 1Q6OA 5T26A 4OQVA 3GXTA 2HS8A 2FDSA 3R13A 2H8XA 1VRDA 2Z6JA 1H61A 2YW3A 1TPFA 2V2DA 4JIPA 3NXFA 1SZFA 1O5XA 3HBLA 3IVTA 3L66A 2DZVA 1T99A 1HO1A 4BF9A 1NF7A 1G69A 1R46A 3PUOA 4LNYA 3W7IA 3N2MA 1K03A 2E1DA 4GWEA 5DCDA 2NX1A 4B5NA 5CZTA 1GJPA 3W6YA 2C15A 1KM2A 1SFLA 5MHBA 3C2VA 4O13A 1GOXA 1TRDA 4JNMA 2ZZ1A 4FXRA 2A21A 1PIIA 3PM6A 3DKLA 1JQXA 1L6WA 1W3IA 2ZTJA 3MYOA 4QNEA 3NAVA 1YYAA 2GQ8A 4EVZA 5LHFA 1P0KA 1SO5A 1MEIA 3F4NA 3O06A 3GIYA 1TMHA 3UY8A 2FB3A 2VELA 1OVDA 4QM1A 4O11A 4LV4A 3AJXA 2QCLA 2CZEA 4U4MA 1GT8A 2NLIA 2GPTA 2XFWA 4O12A 5IM51 3DGRA 4O0KA 3TA6A 3RNDA 3IVSA 3NL6A 3P82A 4HNUA 4UTMA 1RVGA 2NXIA 4IOTA 1UBSA 5DXYA 2NUWA 1XDLA 5G4WA 3Q2DA 3T44A 4J9JA 3LXBA 2ZRWA 1IF2A 3RLUA 1I2QA 1MEWA 3Q58A 3L21A 3LCGA 2KZHA 2ABBA 1TYGA 1DJNA 3VCRA 2FPVA 1F6PA 1OFOA 3W2UA 4UTHA 3W1MA 4JTFA 5BNKA 3EWZA 2Y88A 1QPOA 1X1OA 4DF2A 3H53A 4JX6A 3TFXA 2YFNA 1JUKA 1KLYA 1R30A 5EY5A 4UFHA 2NWSA 3A23A 1H7OA 2ZYFA 3I65A 1TTJA 3PSVA 3E0IA 5KTLA 1EUAA 3G0SA 2BXVA 1D9EA 3UPWA 3STEA 2R14A 1FWNA 5BOOA 3A22A 4M6VA 3MJYA 1F6KA 1TPB1 4O1BA 1GG1A 3PC0A 3TH6A 3THQA 4JGDA 4IPIA 3UXDA 1JUBA 3MMTA 3KRZA 1XL9A 5I3HA 1J4EA 3L2IA 1GEQA 4TX9A 3PSWA 2ZTKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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