2DGAA

Crystal structure of hexameric beta-glucosidase in wheat
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Molecular and Structural Characterization of Hexameric beta-D-Glucosidases in Wheat and Rye.
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 182
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2006-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2dgaA00
1L0PA 3NDYA 3ZJ8A 2VCBA 3EDFA 4F66A 4NI3A 1HL9A 2UY5A 2WHMA 2D3NA 2VX5A 1UR1A 1EXPA 1BTCA 3WQ5A 3GDBA 2WVVA 1LL4A 4E8CA 5CZKA 2GDUA 1MQPA 2W63A 2VC9A 2XFFA 4M56A 3T08A 2DPEA 1CXIA 1G94A 4CVUA 2VO5A 1E4NA 1W9BM 1E15A 4BQ2A 2J7BA 3RDKA 2CBUA 3MKKA 1JXKA 1SYTA 1QVBA 4AZCA 1Q6FA 2VT0A 4ACYA 4AIOA 3VDHA 4CGTA 2D23A 3OIHA 4J3VA 4ZE5A 3VGEA 2QV4A 4UQBA 1Q6EA 4JFVA 5AC4A 3HJEA 3W25A 4CN4A 1V02A 1L8NA 4HPGA 5CPTA 3D3AA 4D6DA 3FW6A 3CLWA 4H7VA 3BAXA 3VIKA 4S3KA 3VUPA 1ZJAA 2OSXA 2PBOA 2WM0A 2J8FA 3LPGA 4P7RA 5CSYA 3DYPA 2ZUVA 1QNOA 4UQCA 4B9YA 4PYSA 2CETA 3L4UA 4WKHA 1ZBWA 5GNYA 3LMYA 3VNYA 5AYIA 1GZJA 3W29A 4ATDA 1ITXA 3UETA 1CGWA 1HKIA 1E55A 3T2PA 2CESA 1R87A 4P7OA 2WHKA 3AIVA 4J3TA 1IZJA 1XV8A 2OYMA 2WPGA 3TONA 2WK2A 3AIQA 4CCEA 3ARPA 3CGTA 1UYQA 2J7DA 3VGHA 1JNDA 2CEQA 3ZSTA 3BGAA 3RJYA 1UR8A 3ZR6A 1FFRA 4PMNA 2E9LA 2G8ZA 1VEMA 2XSAA 5GNZA 4MTVA 1JYVA 2ZUWA 3VGFA 1B3VA 4Z2IA 3RJXA 5BWFA 2DSKA 3HU7A 1LG2A 2D22A 1JF5A 1JFXA 2D24A 1DTUA 3PTMA 4ZXOA 4AIUA 3AS0A 3ZMRA 5BROA 5I2UA 1VFFA 1W3KA 4P7NA 4CD5A 1TUXA 1UR9A 2BS9A 1C7TA 1EHNA 1V6VA 3WQVA 4P8XA 2WHLA 1B9ZA 4IISA 2A3CA 2PWFA 3ARQA 5ABHA 1CGTA 4AISA 5E70A 1LWHA 4M1RA 4XB3A 6A3HA 4TVCA 1WNOA 2WMIB 3T2OA 1QNSA 3U7VA 1E0XA 4PN2A 4N0RA 4GQRA 3W6MA 4EE9A 4GO8A 2XUCA 1QNPA 3MUIA 5FKYA 1UA3A 1PZ3A 2YBUA 2WCAA 4UQAA 3POCA 4D1JA 1MQQA 1OD0A 3SCVA 1E1EA 2QMJA 1JYNA 1WZAA 2V38A 4AXNA 1BFNA 4UFIA 4CKQA 4D6FA 2XVPA 5C70A 7CGTA 4H04A 2BVTA 2Q8XA 3CO4A 4TTGA 1UD6A 3MMWA 4Z2KA 1YQ2A 4EK7A 4U2ZA 2E0PA 3MSDA 4URIA 1H0IA 1ODZA 1GUVA 1NP2A 1ZBKA 1J12A 4UCFA 1SMDA 2EPKX 4U31A 3CIVA 4XUYA 2YDRA 4F79A 4MAZA 1ECEA 2O9RA 1C92A 4AZ6A 3GH5A 5A8NA 1H49A 1MYRA 2VQUA 1E5NA 1WE5A 3MMUA 2PBGA 4H8VA 5I23A 2X09A 2A3AA 2W66A 2DIJA 1J0YA 1EHAA 1VENA 4YHEA 2X0YA 3AFBA 2IXUA 2VL4A 4PSPA 2VJXA 1XSKA 2IUZA 1AMYA 1UWTA 4OZOA 1VAHA 1JZ8A 4LPCA 2BHUA 3WQWA 2VVSA 2X8RA 1VBUA 5HPOA 4U33A 1V03A 2EBNA 5GQBA 4D1IA 3UERA 4D6IA 1HKMA 1WP6A 4TVUA 1IT0A 2CIPA 1QI0A 2VVNA 4TOQA 1HT6A 1TFVA 2E40A 3WMSA 3WQ8A 1VFUA 3M07A 3O9NA 1E3XA 3ZJKA 2V3DA 1V3MA 2F8QA 5A8OA 4TVDA 4QDMA 4EANA 3BC9A 5D9PA 2VR5A 5E09A 2WC7A 5HDRA 3CHEA 3VIOA 1BSIA 1C3FA 4AZHA 4GI9A 4AZGA 1V6XA 4JCLA 4MB3A 5I79A 3K8MA 2TAAA 4JZ5A 3VU2A 2ZXBA 4U3AA 1CECA 2W92A 1XYFA 1JAKA 2W62A 1GCYA 3QHMA 3DYOA 2CKRA 3U5YA 4U5KA 4QCEA 2E9MA 5DT5A 3AOFA 3AIUA 1E3ZA 3L4TA 2FHBA 3BCDA 4TTUA 1CNVA 7TAAA 2JF6A 3W53A 3F5KA 3AHXA 1JYWA 3MUY1 5AC5A 3AQUA 1HJUA 2WYSA 1V3IA 1UH2A 2VOTA 5DFAA 3SUTA 1HIZA 2OSYA 3SUSA 3GXFA 4JKKA 3CMJA 1OINA 1FH8A 2WLZA 2JIEA 1J01A 2WB5A 5DO8A 2ZXDA 2WVSA 1QHPA 5M3WA 1HL8A 4OKDA 3M46A 1Q4NX 1KXHA 3ARUA 4W87A 4BQ3A 2XVNA 2D2OA 3MS8A 2GK1A 4PTXA 1CXFA 3VOCA 4ZXLA 4U2YA 3CZ8A 2EPLX 3WIJA 1DWFM 1W9UA 4KMQA 4GKLA 2JIWA 4BA0A 2Y24A 1ISVA 2UWFA 1QHZA 4DWSC 3CZLA 2BVDA 1EOKA 1ITCA 1FFQA 2EJ1A 3ECQA 2DSZA 1V0MA 1C91A 3CUJA 2BV9A 4JFSA 3GNRA 4GO9A 2JEQA 4JFUA 3E1F1 1CZ1A 3WDJA 3AXHA 1E5JA 3GXDA 1NWSA 3A6OA 4LYPA 2WAGA 4H41A 4P8WA 1KBBA 4JHZA 4GZIA 4BCEA 1CENA 4FLQA 4XV0A 3N13A 4ZFMA 3SUWA 3AMGA 3GNOA 1H1NA 2O92A 1PIFA 5GPRA 1CGVA 3VGGA 2BFGA 2NW0A 1XCXA 5AYBA 3TP4A 3WDQA 3OB8A 3IK2A 3EDJA 2D0HA 2WMGA 3BSGA 2ZUSA 5A6SA 3GH4A 1RPKA 2XFRA 3VILA 1MW0A 1NOFA 1OGGA 4PBGA 3EBVA 2J74A 1RH9A 1JZ7A 3CZGA 1H4PA 4MNMA 4RE3A 3WF1A 2AMGA 5CPQA 1ZJBA 1WDSA 1O6IA 3CZJA 3VIPA 5M17A 2DH2A 3VIIA 3ZIZA 1RD6A 1FHLA 1C7SA 1GORA 3WEMA 3VIHA 1WZMA 1XSJA 2EPOA 3WUGA 4AD4A 2ZOXA 1XH2A 3N12A 1BYBA 1LL6A 3FAWA 4H8UA 1YHTA 4W5ZA 3WN6A 3BMVA 1FP9A 2BY3A 1FOBA 1ZBVA 2JFEX 5A8MA 2J7CA 2VMFA 3AROA 4PMRA 1R8LA 3AMCA 1JZ5A 1UA7A 1E6PA 3SEPA 1KXVA 4FLSA 3WD0A 2ZUUA 1OT2A 3ZR5A 3N11A 4J28A 4AIEA 2Z1SA 1H3GA 3SCOA 3W28A 3N18A 5KEZA 4IUGA 2F61A 2QMKA 3PHAA 5A6LA 5I77A 5EFFA 4XZWA 2W4XA 1JG9A 3ZJ6A 3CUGA 1TVPA 1UWQA 1E40A 4UFMA 1PAMA 4N42A 5A8QA 1BQCA 2EPMX 1DWGM 2D3LA 2BNJA 4AWEA 3KL3A 3AMLA 1M53A 2QPUA 3BSHA 2VX6A 1LF1A 4IM4A 5E6YA 3VIJA 3THDA 1EDTA 4W5UA 3F5JA 3CTTA 5ABGA 3JUGA 4IPLA 3QR3A 3QHOA 3AXXA 1J18A 1M04A 3AHTA 4DWSA 3ZSSA 1ZU8A 1TCMA 3J7HA 4UOJA 1CGYA 3WFLA 2RGLA 2BXYA 2MANA 1W9PA 3NIYA 1PZ2A 2YL5A 1ISXA 1CGUA 1UKQA 3EMZA 3QOMA 5CLWA 3N9KA 1QBBA 4UOZA 1WPCA 1E56A 3AIRA 1XD0A 3OGVA 2ZE0A 2ZIDA 4EKJA 4HA4A 3PZNA 4FK9A 1HJQA 1GOWA 1CTNA 3VIMA 4BF7A 1KXQA 4W7VA 2J75A 3VO0A 3CHCA 3UESA 4W85A 3TTOA 4TXEA 1M01A 1H2JA 3DHUA 4K68A 1JL8A 2QLYA 4CN1A 2CERA 3O6AA 3QGVA 1UG6A 3NUKA 2JALA 2DDXA 3THCA 4GZJA 3MV01 2CXGA 4ZEPA 1PX4A 3VD3A 2XM1A 2JE8A 4AW7A 5DMYA 1HJWA 3POHA 1V3LA 1US2A 4UR9A 2G3NA 2XIIA 1WKYA 3PZIA 1GOKA 1Q6CA 4PMUA 2YOCA 1GHSA 5EMYA 1WB0A 4RE4A 4M81A 4YHGA 3PZQA 3NSMA 4J27A 2Z1KA 4C7FA 1DHKA 1E6RA 1CLXA 4TUFA 5FIPA 4LQ1A 3EDDA 4FLOA 1R7OA 4E2OA 5CJ5A 2O9PA 4AY1A 4KRUA 4HTYA 3N15A 1JD9A 1XYZA 1PBGA 1B0IA 4P8UA 3GH7A 4PMZA 3VDCA 2J7EA 1XCWA 3WD1A 3TTSA 1HNYA 1I1WA 2FHFA 3GYCA 1UQYA 2VNCA 1BG9A 3A47A 1XRVA 1HJSA 3W82A 2WMJA 2G41A 4JIEA 4J3XA 3PZOA 3BLKA 4J3WA 1US3A 3I3DA 3MMDA 3U57A 4Z2JA 3RPMA 3KWXA 2VCCA 1NOUA 2DT2A 1NH6A 1QOXA 1UWSA 4ML4A 4HOWA 1DWJM 1E43A 1WZKA 4PCSA 1H41A 2WZHA 3FHQA 1NOWA 5I24A 2GJXB 4JL2A 3VX0A 3PZVA 1HVXA 1MFUA 1VIWA 1VFMA 1UD5A 1E4MM 4HMCA 4NRSA 2VURA 4CN6A 1XHGA 1R7AA 4L4PA 2XJ7A 8CGTA 3BLPX 1HVQA 2DEPA 1NWTA 1FH9A 1R86A 1D3CA 5I6SA 3VMPA 5LA0A 1HJVA 4DUWA 1MQRA 1E4IA 1AQHA 3VVGA 3AISA 2CCRA 3WL1A 3CHFA 3AIBA 2WLYA 3LPPA 1BGAA 5D9MA 3VPLA 3VTRA 1OIMA 4D72A 1J11A 3WL0A 1GVYA 3AYSA 3LPFA 4X0VA 3GBEA 4MNJA 5I0DA 1QW9A 1B3ZA 3WH6A 1VBRA 2OYKA 3MU7A 5C71A 5A94A 2WMIA 3RCNA 1EQPA 5BXTA 1JZ3A 1CLVA 3ZT6A 1JNEA 4W7WA 5BRPA 2E8YA 1FP8A 2V3GA 1CXEA 3T09A 1X6NA 2EO7A 3F5LA 3DC0A 3RM8A 1KXTA 2V3FA 3K46A 1E6SM 1OBAA 5BXPA 4OOZA 2XVLA 4W89A 5A95A 5E0CA 3PZGA 1W2VA 2OSWA 2XWDA 4HU0A 1PPIA 3T0BA 3WDHA 2WSKA 5BRQA 3D5HA 3ARYA 5A2AA 1J0KA 1B3XA 3WD2A 1JD7A 3MANA 1FH7A 1NP0A 5A3HA 1B30A 1UD4A 1HJXA 3BCFA 2XGIA 1D2KA 2DT0A 5EBAA 4AC1X 4D6HA 4UQ9A 2OWWA 4MAVA 3WBEA 1F4HA 4A4AA 6CGTA 5D9OA 2VRQA 4F9DA 4PEEA 3WDRA 5IHSA 1EDGA 1A3HA 2XYLA 3AMDA 4QCFA 1PX3A 3U7BA 4D6GA 3UG5A 3W4RA 3NSXA 2VZVA 2XM2A 1DWIM 2A3BA 1J9YA 4AYSA 4RL3A 4HPHA 1UR0A 4J3UA 3ALGA 1QI5A 1OM0A 4CU8A 2X05A 4E4PA 1GONA 2A3HA 4BQ4A 4QLJA 5I3DA 1GQKA 3ZO9A 2YA2A 2C7FA 4J7RA 3MV11 2VR4A 2J78A 2HVMA 3IAQA 3VKKA 5KZ6A 3WFZA 3W26A 5CG0A 1ZS2A 1SR0A 4LX4A 4W93A 2CHOA 1BG4A 3AHVA 1V3KA 2WBGA 3S6TA 1BF2A 2CKSA 4AD1A 1BHGA 3ZT7A 4EAMA 5IFTA 1GPFA 2PB1A 4IPNB 3W37A 4P8VA 1FA2A 4MJ4A 3UR7A 4AD3A 1M7XA 1W1VA 1UZ4A 2WCSA 3AMKA 3BH4A 4UZSA 1B2YA 2PI6A 1GQLA 1Y7VA 3A4AA 2WXDM 3GZAA 2DIEA 1KCKA 1AQMA 1KWGA 3WNLA 1UWRA 1B3WA 1CEOA 2CBVA 4OUEA 3WH7A 3AHYA 2WVUA 1QNRA 5M03A 2D0GA 4AEEA 3FXYA 3TA9A 2ZUNA 1CGXA 2G4FA 3A4WA 4WSKA 1QI4A 2W61A 2ZWZA 3OZOA 3CUIA 4AZ7A 4L4OA 1LG1A 4PTVA 4MB4A 3EDEA 2D0FA 2VX7A 3WUBA 2J4GA 2WW5A 4KRTA 1ISYA 4GPNA 4AZBA 5JIWA 4NRRA 2B31A 2YL6A 4V2XA 4J3SA 2Y2WA 3DECA 2ZWYA 1HX0A 5IXEA 1C8XA 4M82A 4FMVA 2J62A 1WCGA 1GJWA 1BVZA 4KGJA 1N82A 4MJ2A 4B16A 1R85A 3W0KA 4D6EA 2CPUA 5DT7A 1OSEA 4PUDA 2JF7A 5A6BD 2FGZA 1RP8A 3W6LA 4CU6A 4ACZB 1V3JA 4NSBA 5EFDA 1W9VA 3K4DA 2YJQA 1AQ0A 5HXMA 1E72M 4HMDA 3ARVA 3SURA 3TOPA 3HMCA 1BYCA 1EGZA 2W5FA 4OOUA 4NF7A 1I1XA 3L4YA 1JF6A 4XZBA 1OWQA 4M80A 4UFJA 2VZUA 4HZ7A 2UY4A 5FL0A 4JKLA 3CZKA 3FNDA 2YA1A 4KGLA 1TE1A 1GOIA 2AOSA 2EPNA 2EEXA 6TAAA 2VX4A 4HZ6A 1LQ0A 3ZQ9A 2WMHA 4Z2HA 4H2CA 2C8NA 1E6QM 1F4AA 4WKFA 3AZRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1L0P A;  3NDY A;  3ZJ8 A;  2VCB A;  3EDF A;  4F66 A;  4NI3 A;  1HL9 A;  2UY5 A;  2WHM A;  2D3N A;  2VX5 A;  1UR1 A;  1EXP A;  1BTC A;  3WQ5 A;  3GDB A;  2WVV A;  1LL4 A;  4E8C A;  5CZK A;  2GDU A;  1MQP A;  2W63 A;  2VC9 A;  2XFF A;  4M56 A;  3T08 A;  2DPE A;  1CXI A;  1G94 A;  4CVU A;  2VO5 A;  1E4N A;  1W9B M;  1E15 A;  4BQ2 A;  2J7B A;  3RDK A;  2CBU A;  3MKK A;  1JXK A;  1SYT A;  1QVB A;  4AZC A;  1Q6F A;  2VT0 A;  4ACY A;  4AIO A;  3VDH A;  4CGT A;  2D23 A;  3OIH A;  4J3V A;  4ZE5 A;  3VGE A;  2QV4 A;  4UQB A;  1Q6E A;  4JFV A;  5AC4 A;  3HJE A;  3W25 A;  4CN4 A;  1V02 A;  1L8N A;  4HPG A;  5CPT A;  3D3A A;  4D6D A;  3FW6 A;  3CLW A;  4H7V A;  3BAX A;  3VIK A;  4S3K A;  3VUP A;  1ZJA A;  2OSX A;  2PBO A;  2WM0 A;  2J8F A;  3LPG A;  4P7R A;  5CSY A;  3DYP A;  2ZUV A;  1QNO A;  4UQC A;  4B9Y A;  4PYS A;  2CET A;  3L4U A;  4WKH A;  1ZBW A;  5GNY A;  3LMY A;  3VNY A;  5AYI A;  1GZJ A;  3W29 A;  4ATD A;  1ITX A;  3UET A;  1CGW A;  1HKI A;  1E55 A;  3T2P A;  2CES A;  1R87 A;  4P7O A;  2WHK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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