1NQKA

Structural genomics, crystal structure of alkanesulfonate monooxygenase
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
MSLNMFWFLPTHGDGHYLGTEEGSRPVDHGYLQQIAQAADRLGYTGVLIPTGRSCEDAWLVAASMIPVTQRLKFLVALRPSVTSPTVAARQAATLDRLSNGRALFNLVTGSDPQELAGDGVFLDHSERYEASAEFTQVWRRLLQRETVDFNGKHIHVRGAKLLFPAIQQPYPPLYFGGSSDVAQELAAEQVDLYLTWGEPPELVKEKIEQVRAKAAAHGRKIRFGIRLHVIVRETNDEAWQAAERLISHLDDETIAKAQAAFARDNLEISPNLWAGVGLVRGGAGTALVGDGPTVAARINEYAALGIDSFVLSGYPHLEEAYRVGELLFPLLDVAIPEIPQPQPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkanesulfonate monooxygenase
publication title The crystal structure of the protein Alkanesulfonate monooxygenase from E. Coli
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 115
structure length 345
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.5: Alkanesulfonate monooxygenase.
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1nqkA00
5DQPA 4J2PA 1M41A 1FVPA 2I7GA 1EZWA 4US5A 3RAOA 1XKJA 3B9NA 3C8NA 1YW1A 1F07A 1RHCA 1BRLA 3FGCA 4US5D 1BRLB 4UWMA 3B4YA 2B81A 3FGCB 1NQKA 3B9OA 1LUCA 5LXEA 1NFPA 5AECA 1TVLA 3SDOA 1Z69A 1LUCB 1BSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I9EA 3TVAA 1YBQA 1S5MA 5D8ZA 3A21A 2ZA2A 3I7QA 3EAUA 5D05A 1TPC1 1J4EA 4JFSA 1GTEA 1NP2A 2YB1A 3O6YX 2Z00A 1DJYA 2D2GA 4IGHA 3NQGA 3TCEA 3G8EA 5HDRA 1UMLA 3TN5A 1X6UA 1WDQA 3ARUA 3WDHA 2A3EA 3BCFA 2FGLA 3BDKA 4ZE4A 2V3EA 3LYEA 4B90A 3CH9A 4PCTA 4AHPA 4WOZA 5HUOA 1JZ8A 4PSRA 5A6SA 1EPVA 2ATMA 1ZGDA 2A7PA 2JEQA 3W0KA 4MPQA 1DWGM 3P5YA 3KCLA 4RX0A 4E8CA 3RPDA 3UZYA 4WXYA 3WLMA 3UT0A 5G1MA 2XYLA 3PULA 4YPJA 3MUCA 1YQ2A 4XAYA 2DUXA 1UUOA 1TX0A 2EKGA 1HT6A 4F9JA 3RM8A 3M0ZA 2PE4A 3M6DA 5K3VA 3MYOA 4QBXA 3W1AA 3LCFA 1LRTA 2J9ZA 4UZSA 3T0AA 1YPFA 3DYMA 4MYAA 4WUIA 3PHAA 4OGZA 3IV3A 4Y90A 4ATLA 4AIOA 3CGTA 3WD3A 3GR8A 4JTJA 4BZYA 1XHGA 3LCXA 1F6PA 3R0UA 1ADDA 3EDKA 1FWCC 1GQKA 2ZUWA 3WQFA 1R2RA 1F5ZA 3KP0A 4TOQA 3TZNA 1BVZA 2DDXA 3I3DA 4H01A 4D6EA 1TELA 5CC7A 1JQXA 4J3UA 1UD8A 4PZVA 3N9RA 3TP4A 3B9DA 3LPOA 1SZNA 5D9OA 1O5RA 4YTUA 1KC7A 3P80A 4ZQCA 3VILA 4AEOA 2X7WA 1XRTA 1VGAA 2PDFA 1W9XA 3W6YA 3LXAA 3NDOA 3VDGA 2AAMA 1AH0A 2XHYA 5C6MA 3WFAA 4BEQA 3GKAA 1CBGA 1ZFJA 2OODA 1OZQA 4DBUA 4DXVA 3JR2A 1D3GA 4ACYA 2PRMA 5KZDA 4H3DA 3W7DA 2CZFA 3LPPA 4DZ5A 4E6MA 2OLSA 1SFJA 2WVTA 3MUXA 3HTWA 1O94A 3PZOA 4MZYA 2E25A 4C6EA 3LSBA 1AH4A 1XGEA 5CGQA 1CXFA 5I02A 3QFEA 4M6UA 3H4XA 1KGXA 1XLCA 4H8NA 1WP6A 2XH2A 3PF3A 4IIGA 4P7OA 3HMCA 4DB7A 3MP5A 3WLQA 2G3IA 3M5XA 1SFTA 3OA5A 3USZA 1J9YA 4ADUA 3QSTA 2DH2A 3OP2A 3R11A 4QAWA 3TQKA 3HPXA 3G8RA 1X7IA 4EX4A 1LDCA 2V30A 4RNHA 1DWHM 1UOZA 3KBVA 5BNKA 1X1ZA 4QX4A 4HZ8A 3KWSA 4LBUA 1KR0A 2HBXA 1PEZA 1H1ZA 3F4WA 3HGJA 1WBHA 4HMDA 1E0UA 2DGAA 3MP3A 4HU8A 3VIKA 4L6HA 4KS0A 4GC4A 5F2LA 3VO0A 1OEPA 2VX7A 3KBMA 3MUIA 1Q7MA 4UOJA 2WLYA 4G1KA 4B5UA 5I78A 3NQAA 1RH9A 3R12A 2F38A 2YDAA 1WUFA 3CB3A 4XVEA 5CXPA 1C3FA 3WLRA 2UZ9A 2CERA 1NOFA 4LUTA 1KFKA 2FLIA 1D8CA 1TO3A 4YLWA 1TG7A 4JTCA 1YLVA 4JNMA 3L67A 2Z2BA 1VEMA 2VR4A 1G1YA 5FJOA 3ZJ8A 3G6MA 2XIQA 3BANA 1VJSA 3LM3A 3PPGA 8A3HA 1PX8A 2UY4A 3OVGA 1EEPA 1XLKA 1T96A 4OE7A 4WDWA 1A80A 9RUBA 3TLQA 5EA9A 2C14A 2EKCA 5DY2A 1F74A 3B9EA 3L5LA 2QPSA 3GC4A 3ZVHA 4LYPA 5FKYA 3HPFA 3AS0A 4HTYA 4HP5A 4UNIA 4ZB2A 1GVQA 5CH9A 4WGXA 4GXWA 3CZLA 1TIMA 5T9BG 1J79A 5I3IA 2XIMA 2ZTJA 2GOUA 4RDVA 1A5AA 2G4JA 3CMFA 1EL3A 2XH7A 1LLZA 3MI3A 1ISWA 4XAGA 1EC7A 3KOXA 4MB3A 3IUHA 5HOSA 4N6FA 3WJZA 1J2BA 3CPUA 3KBNA 2VC7A 4F2BA 2YIHA 1G0CA 4NUWA 3P93A 3IVSA 2E67A 4WIWA 4XG1A 1XYAA 5FA5A 4ZXLA 1EBGA 2VFFA 1UP0A 2OZ8A 4MSSA 4AZCA 1KXHA 2CZVA 4V33A 2ZXQA 5AY7A 5F2IA 3WD0A 3UG3A 2D3NA 1JXJA 2A7NA 4FOJA 1VEPA 3IIOA 4TQTA 4GWEA 4KIRA 2CBVA 4W7UA 1W6TA 2QZRA 4IJBA 3EOLA 3U2OA 3VNYA 2H9AB 3VI2A 5JH2A 4MG4A 3E2VA 3AIVA 2OZ3A 3RCNA 4TV5A 3AICA 1JZ3A 3U2EA 4Q7IA 1DWIM 2WB5A 3N25A 3QPYA 2WJZA 4BHYA 3M7WA 4DO7A 2AGKA 2CLHA 3RFAA 1F61A 2V5DA 4DUVA 2AMXA 3T0BA 3FYOA 2QS8A 5MKGA 3UWUA 3LY0A 1TWIA 1OK6A 5ABGA 1VH7A 4A6GA 4GHRA 1GOOA 1EWEA 4CCZA 2NSOA 3T4CA 3PZ9A 2F7FA 4B5SA 1JYXA 1VYPX 1ZNNA 1XLDA 3CQKA 4FR1A 6ALDA 1O4UA 2CCRA 2XFFA 2W0UA 3S5SA 4EANA 1KBIA 1FVPA 4NZFA 1P0KA 3NVTA 3UR7A 1UWQA 1ME9A 2EGZA 5J04A 2MNRA 4GXMA 4I6VA 4PMQA 3G1VA 3VOFA 2Z2AA 1AJ0A 4Q8UA 4AC7C 3UEQA 2DIKA 1KBLA 5LXXA 3PZMA 2FYMA 1EEXA 3GHTA 1S39A 2NT1A 4Q6JA 2YL5A 2Z25A 5EPDA 3QV7A 3RJYA 1P43A 3KZPA 4PR4A 2YCKX 1GVFA 3MBDA 3VDCA 1HL9A 3GDLA 4IFKB 4CNTA 1JF5A 1AVAA 3BGAA 3EB3A 4S2CA 1W2VA 3DBPA 3MSGA 4M5PA 1E6QM 2Z6JA 4XZMX 3UYIA 1EX1A 2BVTA 2A3AA 1TV2A 1LZOA 1CLVA 3Q67A 1DTUA 2CLLA 4B91A 4F4RA 1E4IA 2Y7FA 3NDYA 1DIKA 4WZHA 1M03A 3TYZA 2OU4A 4FHAA 3ME3A 4C6CA 1UH3A 2CNCA 3FCPA 1ONEA 5I24A 1C7SA 1JUBA 3VIMA 4LV4A 3VGFA 3NJ3A 3W71A 1U22A 3U0HA 1REQA 4X22A 1E70M 4AWEA 4AZ5A 4C65A 3SRDA 4XUYA 3FYPA 2RH9A 1QCWA 1EH9A 1P0DA 1BYCA 2V38A 4GC3A 1KO0A 1BWLA 4MWAA 4XQ6A 2R9RA 1W9BM 5LA1A 3T9PA 8RUCA 4MYXA 5CC5A 3I68A 1JAEA 2Y0FA 4R7OA 4JKKA 4Q8WA 3WQPA 3WEMA 3W37A 2OT0A 1BRLB 3QOMA 5DT7A 3VDHA 3G0XA 1XLAA 1OABA 1RP9A 3KRZA 2QUTA 3DHUA 5IOBA 4GQ0A 3AIBA 2YL9A 5I6SA 2Z6IA 5LA2A 1BG4A 4OV4A 1A3XA 3Q2DA 2GL5A 4ZL1A 3MVTA 4QM1A 1B54A 1Z3NA 3FA5A 1SJCA 4PUNA 4DX3A 4IX2A 5D2WA 3AUOA 3O0KA 1O5QA 1WUEA 1PIFA 3GIQA 5AVHA 4PUEA 3CU2A 4EXBA 2OO6A 2FQIA 3WQGA 5TD4A 1DJHA 4UQDA 2QDDA 4MB1A 4S3CA 1OT2A 2YDRA 5AOUA 1T6MA 1KQYA 4CVWA 3SJNA 4OKDA 4GI6A 3RF9A 1KM5A 1PB0A 5T9CE 1WE5A 2PDYA 3L4ZA 1V6TA 1XDLA 3TKFA 1OBAA 3ALGA 4Q7BA 3QPEA 5HINA 3A22A 1OHLA 1XCWA 3AIRA 2YXOA 5FF2A 3G0SA 2FTPA 4DJFA 1B3OA 3ARQA 3CV2A 3TNOA 2WCAA 3NQDA 4IMGA 4G1NA 1WX0A 2O55A 3W2UA 1S2CA 1IT8A 3LNMA 4UTWA 3W26A 5BROA 1U5VA 1TA3B 3T40A 2OXNA 1JPHA 5HJXA 5AHMA 1Z7AA 4IICA 1V3HA 5XIAA 1JDCA 2FB3A 1IXOA 1N8IA 3URAA 2NV1A 2WPBA 4Z08A 1ZQ5A 4JHZA 4LEQA 3AC0A 5DO8A 5EY5A 4BWLA 4G5DA 2KZHA 1FWAC 3NQCA 3G1AA 3RN6A 2REQB 5HR7A 4CEXC 3VCRA 5D30A 4B15A 3SN4A 1G7UA 3SI9A 3HGRA 5BOFA 1XICA 3MC5A 5C9ZA 3L9CA 3GNNA 3LGEA 1DQXA 4UNKA 1TREA 4DJEC 1LUCA 2W9MA 2VL4A 3RCYA 2UV8G 3H54A 1ZLPA 2GWGA 2XU2A 4UFHA 5IXEA 1BYBA 2P8CA 4IP5A 3CIXA 4Q4QA 3SCNA 4AB4A 3DYOA 2C19A 3OZPA 1VR6A 3ZLFA 4HNLA 3FIGA 1KCZA 3KUMA 1FFQA 2FJKA 3CWHA 1YYAA 1QI0A 1JCNA 3A4WA 4IP7A 1O12A 2DSUA 3DU0A 3V3WA 4G8TA 1RAKA 1Z6KA 4XKYB 3GHRA 1OYBA 4PA8A 3KW3A 1W5MA 3KS5A 3C3NA 3OBAA 3B9OA 2A3HA 1WZAA 2QF8A 3RX3A 2VP8A 4FK9A 4JIPA 3CZEA 3P81A 4Z2JA 3DYPA 1VCGA 4IIEA 1V6WA 1GQIA 4QDMA 4JYEA 5FEXA 3UFYA 3VD7A 5BYWA 2DZWA 2QCHA 1FWWA 1D9EA 2D22A 4IFRA 2VCAA 2NVDA 4QJ3B 2XVLA 3PPCA 3QR0A 4IQDA 5AC6A 1E72M 1QBBA 3VX1A 1CGVA 1QPOA 4YHGA 4LTSA 4LVFA 4A21A 3WF4A 4PFHA 3M9YA 1K4GA 2QDHA 3MV01 4MKVA 3V5FA 3INPA 1XSJA 1QNQA 2G3FA 2FH8A 3GD6A 4PMZA 5CZJA 2TSYA 3UXAA 2H9AA 1H4PA 2IUZA 1VBJA 4HSHA 1B4EA 4ECLA 1J6OA 4CKQA 5E0FA 4XK2A 1Q6QA 2X30A 5DANA 3CIWA 4AZBA 1LYXA 3LS9A 3ITYA 2FZ9A 1OINA 4JNYA 3LRMA 4CVUA 4NP7A 4NYUA 1IIHA 3F03K 1EUAA 3AU2A 3M0HA 1SFLA 2OZ0A 3BGJA 4Y9AA 1QNOA 3USBA 4E38A 3M47A 1ZJAA 1E9IA 3EPMA 4GH3A 1LTDA 2V6AA 4PCFA 4L65A 2R8WA 3N34A 1NM9A 4J3VA 3UG8A 1MW2A 4DYEA 2JKPA 4DO4A 3V18A 2VQTA 2J7DA 2Y63A 5CPSA 4AIBA 3AXIA 4ZSUA 3PC0A 4GYPA 4PFMA 1VFSA 4EIVA 4O17A 1E56A 2EPMX 4KFOA 1NDYA 2CLPA 4HA0A 4C7GA 3WIJA 3OHMB 4HPJA 3S5ZA 3FGCA 4QNWA 2JALA 4CD5A 3GNRA 3QEZA 4LEFA 4ZMGA 4IMCA 2D0FA 5DN1A 3LCHA 3TTYA 5HWNA 1OF6A 1OM0A 1UWUA 4Z2IA 1CDGA 3V36A 3W1PA 2INEA 3GU2A 4UCFA 3QLLA 4A3RA 1PVNA 3WQDA 1RHCA 3RGTA 1OIMA 3KBSA 3N04A 1XF0A 3W7KA 1VF8A 1UKPA 3VC6A 2XFWA 3THCA 4IFKA 2V63A 3DZ1A 2WHMA 1X39A 4JQ3A 4U2ZA 2E7FA 2DT1A 1GJWA 2INFA 3N14A 1OCNA 2J9XA 4DF1A 3ZOAA 3W7HA 3IJDA 4C60A 3PR2A 1LBLA 4YVVA 4H6RA 2ZDRA 2XSAA 1VBUA 3WK2A 2RGLA 2VR2A 3NG3A 3OG2A 4QIUA 3QYQA 3VGDA 4XD3A 5CQ1A 4JHOA 3QYSA 5HK4A 3MS8A 2Q09A 3T42A 1RK6A 2PD9A 1IT7A 6A3HA 3NL2A 4L56A 2ZUMA 3NQ6A 2V0TA 4PE8A 3EBVA 2PP1A 3W84A 2ZX9A 4M82A 3H26A 1V93A 3E0FA 4N4PA 3IVTA 4MNLA 1DORA 1IV8A 3UWVA 1N2VA 3TH6A 1LT8A 1UUMA 1JDDA 1SGJA 1TKKA 4TU1A 1ZENA 3KP1A 1AZ1A 1TR9A 4N9CA 3NZPA 3E38A 3GNDA 5GNXA 3TN4A 2NQ9A 3CV7A 2JGQA 2FGBA 3WDPP 4V15A 3GVVA 1UWSA 3M4HA 4NXKA 3IGSA 1XYLA 1V08A 5EFDA 1F7BA 3BG9A 3RG6A 4WGHA 2GUYA 3E9AA 3FDKA 2MANA 5D9NA 3MUY1 2HPMA 3R79A 4OFCA 4MJ4A 2XFYA 3PNZA 4PL2A 2W91A 1XUUA 3RAOA 2E9BA 3EA2A 3DG7A 5FAGA 4QXIA 3QKZA 1ICSA 1QT1A 1TR1A 4NNAA 1BKSA 2ZRZA 2D3LA 3LTSA 4JNZA 3FKKA 3HG3A 5FSEC 1E73M 3TIMA 4BQ2A 2O9RA 1VPQA 2Y88A 4JOMA 5LNUA 3EWZA 1CXLA 1C8VA 1GOWA 4S3FA 1M7XA 3CB8A 3K13A 1KM0A 4Q4RA 2W67A 3SCSA 2XPKA 2CLFA 1CEOA 5G1YA 4B2DD 1V0LA 3P62A 1V6VA 4EOUA 1Y5WA 2BBFA 4DBSA 3NXLA 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