1LP6A

Crystal structure of orotidine monophosphate decarboxylase complexed with cmp
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
213
structure length
204
Chain Sequence
MDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords orotidine monophosphate decarboxylase
publication title Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Archaea
total genus 72
structure length 204
sequence length 213
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2002-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lp6A00
1O94A 4ZVJA 2JKPA 4HNNA 4WD0A 1UCWA 5F4XA 4JICA 4RV8A 3A23A 4L4LA 1RQBA 3F4NA 1G4SA 4UTTC 4TX9A 3P80A 3T78A 2Y61A 2VENA 3Q37A 1YXDA 3W7MA 4AH7A 1AW1A 3HOJA 2R91A 2B7QA 1VGAA 3TAKA 1P4CA 4R33A 4O15A 2WKJA 4ZL1A 3NPWA 5K7JA 3T7VA 1F73A 1SU5A 1SFLA 4Z1CA 4FXSA 2QJIA 2RDUA 2Y70A 4CCDA 3LCXA 3GYEA 1Z48A 2V81A 3UPWA 3P8IA 3W7KA 1DHPA 2RFGA 4XKYA 4Y90A 1O5XA 1RV8A 3WK2A 2RDWA 1DOSA 3W7OA 5LHFA 1XKYA 1JCNA 1ADOA 5J5RA 4O18A 1J2WA 4OBTA 1Q6LA 1YTKA 2WSYA 2XN1A 4CCCA 3NOEA 1TTIA 1GOXA 4LS2A 1JCLA 1PHWA 1R46A 5FEXA 4O54A 3UZJA 4XZ9A 3HPZA 2P1FA 3HO8A 1TO3A 1D3HA 2H8ZA 4NX0A 3V1PA 4I9AA 3HGSA 3G0SA 2Y7GA 4PC8A 1E51A 3G1AA 1OFOA 3PB2A 1LBFA 3IGUA 4NXSA 3E02A 5D05A 2FB3A 2QCFA 3A9IA 1LBMA 2O7SA 1FX6A 3HIJA 3C61A 4ORMA 3T40A 1QAPA 3GB6A 4ORIA 3EB2A 1EUNA 4O19A 3LGEA 3NEVA 3UNDA 3L5AA 5AYZA 3N2MA 5AHNA 4OE7A 5A5WA 3WK1A 3PUOA 4M6PA 4UFHA 3LLFA 3STEA 3NQ7A 2E5DA 3ZR4A 3NNTA 3NL3A 4X9SA 3QMTA 4N2YA 4YCPA 3DI1A 3NR0A 1KM1A 1TJRA 3M47A 4O10A 4RR4A 1O4UA 4JTKA 2ZRYA 1NFBA 3FJLA 4AWSA 3A22A 1HUVA 5I3IA 4O50A 2CLIA 2Q3OA 4JTLA 1OK4A 2CZFA 1KFKA 2CW6A 3O63A 3LB0A 2WJZA 3G1FA 3L5LA 1GZGA 4RZ5A 3UPBA 1N55A 1EP3A 3W2UA 3NXFA 4HKPA 2JGYA 1ZCOA 4M19A 4MLRA 1AK5A 5D38A 1EWEA 3DH7A 3TQVA 3LI0A 3W88A 1C8VA 4FXRA 4NNAA 3GAKA 4K38A 1GJPA 2CLEA 2X1UA 1WV2A 3A5FA 5AC7A 2W79A 4PA8A 3W70A 1PS9A 1W56A 3W87A 2CFFA 4ADTA 1X7FA 4UTHA 3OBKA 1LLWA 5HWNA 2Z6JA 3W23A 1ML1A 4Z1AA 3L0NA 2V2DA 1PV8A 3PAJA 1M5WA 3M9YA 4JEQA 3GLCA 4CCEA 1K8ZA 4RK8A 2FQIA 4G1KA 3UY7A 4WX2A 5K4XA 2WSRA 4XUGA 3KFTA 5CKSA 3W1MA 3ZS4A 2E6YA 3LLDA 3C3NA 1TREA 2H90A 3L65A 2GJLA 4XBSA 3GR7A 4GC4A 5L9FA 1H63A 3N14A 3LHTA 3O6YX 1TV5A 3DI0A 3W7IA 4UR8A 1JCJA 4UTMA 3G24A 1N8FA 3A5VA 3LHVA 4ZQMA 1WYIA 3VE7A 1TRDA 1PIIA 2V2HA 1KBJA 1VC4A 2BLEA 1M7PA 2VFFA 4O1AA 3CIXA 1W3TA 1H7OA 2FB2A 2W0UA 2NX9A 1VCFA 2A7PA 2J27A 3B0PA 3DFQA 1JCYA 2ISSA 3NM3A 1A5AA 1T8XA 2CWNA 1BTMA 3E0IA 4O1DA 1QFEA 5LSMA 1TPFA 1AW5A 5BNKA 5D32A 1DVJA 3LRMA 5C5YA 1RQHA 2VFEA 1I8JA 4UFLA 4Q32A 3B8DA 1KTCA 4YL2A 3LBCA 4Z1DA 1S5WA 3G3MA 2B7OA 5DBTA 2C1HA 4N4QA 5TQLA 2B4GA 3CB8A 2CLLA 4QIUA 2QCDA 2QKFA 3IEBA 4A21A 2E68A 2WO5A 5DCEA 1N7KA 3WJWA 3JR2A 3QW4B 2J9YA 1P0NA 3P5YA 5BOOA 2VXNA 2ALDA 1YTDA 3EXRA 5HR6A 1B9BA 5CPLA 2ZBTA 3NQAA 4O1BA 3PUEA 2NV1A 4MUZA 1FWWA 4DEFA 4YXGA 4O4WA 1ZAIA 4MPQA 3DHDA 5LNRA 1SSDA 3M43A 1UBSA 2BX7A 2G97A 3W74A 4BI6A 1XDLA 4NJKA 2EF9A 3VE9A 5F2LA 3QSTA 5FF4A 3SSJA 3STGA 4AWTA 3ZWSA 3HG5A 2EKCA 1KLYA 1KM5A 2QCHA 2XN0A 4EF8A 4GUHA 2VEPA 5K9DA 3RF9A 3KVKA 3NPVA 4O11A 4UXDA 2QCGA 3Q58A 3O6CA 4JY9A 3SY5A 1HO4A 1G67A 3W3OA 1TV8A 1OX6A 4ONVA 4QM1A 2VFDA 3UWWA 3W2JA 4ADUA 1TCDA 1LRTA 1J5TA 2VC6A 5C54A 4DPPA 4FNUA 3N9RA 2GQ8A 1B57A 3QRHA 4NX5A 3FJ6A 4O53A 1EP1A 3DFPA 5HJLA 3ZWTA 1L9WA 4UTWA 2GPTA 3D0CA 2ATSA 1OFAA 3ABQA 5TIMA 3C56A 1IIHA 5AFDA 2EPHA 4HT3A 5KINA 3NG3A 1KFCA 3W6YA 2FLIA 1ZHAA 4GWEA 2P0OA 1GG1A 3TKFA 4L4MA 1S5VA 3EXSA 1LROA 2I9EA 3TR2A 3IVTA 1M7OA 2GQ9A 4XWUA 2E6DA 3W7GA 1W3IA 2J24A 5MHBA 5AOUA 5A8GA 4AHQA 5KTLA 3SR7A 3LERA 4AHOA 3W7QA 3O16A 3C2VA 3TFXA 3C0JA 3LRKA 3P81A 1K7FA 3NVTA 3DBPA 5AHFA 1T0OA 1AG1O 3MP5A 2TYSA 1LP6A 5AHLA 3B04A 3S5OA 5CSRA 3EEGA 1G4TA 3E9AA 4GUFA 4K8EA 5D2WA 1WQ5A 2AGKA 3WFAA 2UV8G 5G2HA 3NPXA 3GDRA 1L6WA 4IJBA 1EA0A 3LV5A 4Y9AA 1PCWA 3O05A 2F84A 1A5CA 3AJXA 1TPC1 1YPFA 1KW1A 1GVSA 2Y7EA 3MHGA 1H61A 1RD5A 4ML9A 1L6YA 3WK3A 4AF0A 3G1SA 5FESA 2ISWA 1TQJA 3T44A 2HTMA 4UTTA 3ABSA 2DJLA 3BGJA 1U83A 3M0ZA 3USBA 4K7YA 3B4UA 1VLWA 3BV4A 1TQXA 4JTUA 3QMSA 1ZJIA 3SIZA 4H3DA 1KM3A 3BLIA 3TFCA 2H6RA 4RXFA 5CPNA 3S5NA 1TMHA 4IXXA 1U5JA 4K8HA 4NJHA 1H7PA 4MJZA 1H62A 3DU0A 2CZDA 4RJEA 2ZQ0A 1TSIA 2A1YA 5EA9A 4AWUA 4CNOA 3OEXA 3QMRA 1XFBA 4N9EA 5LNUA 4KFPA 1OFEA 4D2JA 1EIXA 3LXAA 1KM0A 4EVZA 3CHVA 2G5WA 3H55A 3NQ8A 1VHNA 3I7RA 2G96A 1QNVA 2QCMA 4N6FA 3QM3A 5FEZA 1ME7A 1MEHA 3TX9A 4UUIA 3W7PA 4IMEA 3RNDA 1XBXA 4TR9A 4DF0A 4OV4A 2V82A 3P7YA 1JCMP 1C29A 3IVSA 1OYCA 2GJNA 4FNSA 5D30A 1FXPA 1H7RA 1GVOA 1Z44A 3O8AA 5D2TA 3O06A 3A21A 1P5BA 4N9CA 4LY8A 3M6YA 2NUXA 1BWLA 3DKLA 3DXIA 1KM2A 1ONRA 4KWWA 2ZZ7A 3B06A 3BW3A 3N19B 4K39A 2FIQA 4IQLA 2RHGA 2YW3A 1SZGA 1MEWA 1WBJA 5FF3A 2FFCA 1SO5A 1VR6A 2VEIA 4JX5A 4LRTA 5KZEA 1Y0EA 3KRUA 1ZALA 1FWNA 3NA8A 4O1CA 1VH7A 2QF7A 3F4WA 3GKFA 3LM7A 3HMJG 1JUEA 2NV2A 4FO4A 3LCGA 3LDVA 1KTBA 4BI7A 3JRKA 2E1DA 3QW3A 1F5ZA 4IX0A 1Q6OA 4AHPA 5DN1A 1HG3A 1I2NA 1W8SA 3HG4A 4A29A 1DL3A 1NF0A 2ZA1A 3KRZA 5DY2A 1SW3A 3GX9A 1A50A 1OF6A 2BWGA 3NQMA 4NUWA 4NJGA 5G5IA 1O5KA 2EHHA 3GXNA 4JR5A 5EL1A 1ALDA 1TYGA 1K03A 3PULA 2YR1A 4N6EA 3NZRA 1X1ZA 4LTSA 1H5YA 3LCLA 3PBWA 1Z41A 4M6VA 4LS0A 2Q8LA 3PC0A 5H2ZA 1XCFA 3QEZA 4FNQA 3L5MA 1EWDA 2Z1BA 2R94A 3G0UA 4MZ1A 5FEPA 3MI2A 1XXXA 4RCXA 3CU2A 5EYWA 3AO0A 1Q3NA 4PH6A 4LRSA 1QPNA 1A5BA 1CX9A 2NUWA 4P61A 3E12A 2EGZA 2O7QA 4YMZA 3NYZA 1X8FA 4MY1A 3STFA 1GTHA 2NUYA 3W84A 2OMAA 4JN6A 4FIQA 3P82A 1LRNA 3EX2A 3CIWA 1R2SA 3KHJA 2C15A 1QCWA 4NXKA 1SW7A 4JTSA 4XKYB 3W1TA 4NT0A 3A24A 5C55A 3QH2A 1OJXA 3ABOA 3P60A 2QJHA 2CLKA 4RX0A 2J88A 2V5BA 4K7VA 3W7CA 3TXVA 1X1OA 2A21A 1V5XA 3NQDA 1LLZA 3THAA 4BWLC 3HG2A 4FX8A 4I7VA 2ZRZA 3O15A 2IQTA 1QDSA 3CWOX 3NL6A 1LRQA 3VNDA 5CZTA 3TW7A 1SO4A 4AVFA 5HMSA 3L67A 4QITA 3EXTA 1TPEA 2YDAA 2G95A 4MJMA 2ZYFA 1I2PA 2ZZ3A 4YLWA 3TIMA 2B7PA 1JVNA 1UASA 4NQ1A 1I4NA 4LV4A 1AL8A 4JDBA 1H1ZA 2GQAA 4CLMA 1FCVA 3PM6A 2PE4A 4NNBA 3G1VA 5FF2A 5KMYA 4WOQA 1SQ7A 4A2SA 3GR8A 4W9TA 4O0KA 4S2CA 5LNVA 1YDOA 1LORA 2RH9A 3QYQA 3K30A 2QCLA 5CPOA 3R8RA 2JKEA 3V75A 5ABTA 3DHFA 2QR6A 1D9EA 3NQFA 1VLIA 5IM51 4Q4KA 1WAUA 3W7EA 2C6QA 3H53A 5LGXA 3HGOA 3EKZA 4ZQNA 1AMKA 1ME9A 3GAYA 1XBVA 1YADA 3E96A 3MO7A 3PF3A 1SZFA 2F7FA 2TMDA 2OT0A 3ATYA 4R34A 3W75A 1YTEA 3MWAA 1XDMA 4FB7A 4DBEA 4UTJA 3M5XA 1JR1A 1H7WA 1R30A 3FKRA 2PRMA 2C0AA 1VYRA 3CPRA 4K37A 3TE9A 3IV3A 3UXDA 3LHZA 1LYXA 1DJNA 1BKSA 3LHUA 1LTDA 1VHCA 4Z0SA 1B4EA 3VCRA 1QPOA 1H60A 2VEKA 3HQ1A 2ZDRA 5I3JA 4LVDA 1XM3A 2QUTA 2ZTJA 3TU9A 3P84A 1WDWA 1O60A 5HUOA 5DY3A 6TIMA 4GRSA 2OZ0A 4E38A 5D33A 5D2VA 4M6QA 5D2YA 1TPUA 5LHEA 2YYTA 1G4PA 5FI8A 4YCOA 2FPTA 5KZDA 2X2GA 5HQEA 4FIRA 1JQXA 3W85A 3G8RA 4WJEA 5D02A 3TSMA 2NZLA 4IUOA 1GVFA 3MHUA 5K3VA 3W1XA 3KXQA 1OX4B 4UC5A 1XBYA 3MUXA 3U6WA 2WNQA 2X16A 2ZRVA 1H1YA 3BK0A 4BFAA 4TMBA 1Q45A 1FDYA 3MP3A 5DXYA 2HSAA 1SSGA 3PWAA 3C2OA 3ANYA 4LVAA 4WY0A 1FCUA 1SUXA 1JULA 4DO4A 1GPWA 4JGDA 1FY6A 2ZRUA 3W9ZA 4MKNA 4JY8A 2JGQA 2Y88A 2E77A 2ZZ2A 2QUVA 1LBLA 2NX3A 3FKKA 3KAOA 4JS3A 4IMDA 5F1UA 4CQAA 2YW4A 3F03K 5G1YA 3W22A 3N73A 3QC3A 2D73A 1QMLA 3S8HA 5AC8A 3L66A 1GVRA 1FBAA 1GQNA 1MZHA 2I1OA 3UYCA 1LCOA 3NQGA 3VI2A 5I3GA 3OG3A 4LU0A 4EWND 2VFGA 2Z6IA 5TBOA 1PVNA 1NAL1 4UFKA 3Q2DA 5DCBA 1NF7A 2QDGA 4OU1A 1F74A 3PUDA 2WNNA 4JNMA 4XTIA 3GZ3A 4LW7A 3OVPA 3U8GA 4AB4A 3HBLA 4UTKA 4LV9A 3I68A 3IIPA 1TTQA 3TXZA 5EBUA 4Y8FA 4OQVA 3LTPA 1XUZA 3BVJA 1S3HA 4O4VA 4R53A 3UWQA 2VKZG 4TU1A 3DGRA 4MFEA 1VS1A 2Y7FA 3EX6A 4NJJA 5CZJA 1DQXA 2DZWA 1XUUA 3NAVA 3G18A 1ICPA 3TJXA 4MY9A 2A85A 1XL9A 2X30A 1I2OA 4UTLA 1IXQA 3GXPA 1GYLA 3TC6A 7TIMA 1MSSA 1I2QA 4OGZA 3N2XA 1QOQA 1RPXA 3WJYA 3IRDA 4K36A 4N9DA 1P0KA 2EAWA 4PL1A 2J9XA 4JIQA 2DJXA 2A7NA 4MVAA 2HMCA 2NXHA 3MBDA 1T99A 3H54A 3PBYA 5F4SA 5HUPA 1A53A 1DORA 2YSWA 2TPSA 3FYOA 4NJIA 3OHIA 1XC4A 5G4WA 3S5YA 4LOCA 1TPWA 1EX5A 2A4AA 4N02A 4NNCA 4M5PA 1SR9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NQH A;  2JKP A;  3WLH A;  1ZPT A;  4WD0 A;  4JHM A;  1Q6G A;  2FZD A;  3AI0 A;  3PAN A;  2UBP C;  3GVW A;  4IIG A;  1Z9A A;  1UWS A;  5M3W A;  2YDQ A;  4ZE5 A;  1WKY A;  4A8N A;  5CSU A;  3P80 A;  3NGF A;  2ZXA A;  3CMJ A;  1L6F A;  3BE7 A;  4IG2 A;  4IP4 A;  3AS2 A;  2V38 A;  3HOJ A;  3M64 A;  3TAK A;  4MB4 A;  4DLF A;  1P4C A;  4D9P A;  2DPE A;  4ZL1 A;  2PB1 A;  2GSE A;  1F73 A;  1SU5 A;  1VBH A;  2J79 A;  3QOK A;  3TOY A;  4LFY A;  7CGT A;  3BLO A;  3SCU A;  3M6D A;  1TVL A;  4BHY A;  3K13 A;  1ITC A;  4U3A A;  3UPW A;  1Z48 A;  1E0V A;  4H2C A;  4XKY A;  4Y90 A;  1O5X A;  3KLL A;  1IZC A;  3PPC A;  1XLL A;  4K8G A;  4PUJ A;  3UP8 A;  1XKY A;  1JCN A;  1ADO A;  5J5R A;  1UHV A;  4O18 A;  1Q6L A;  2OG9 A;  4I3G A;  3AMK A;  1PHW A;  3E2R A;  3UZJ A;  4HNC A;  2J8G A;  3HPZ A;  4MG4 A;  1JF5 A;  3HO8 A;  2H8Z A;  3V1P A;  3UT0 A;  3HGS A;  3CAS A;  3AC0 A;  4F40 A;  1LBF A;  1OC6 A;  5D05 A;  2R1K A;  2Z7K A;  3HIJ A;  1UD3 A;  3T40 A;  1QBB A;  1QAP A;  3RCM A;  1EQC A;  4GJJ A;  3WLN A; 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