4QCEA

Crystal structure of recombinant alkali thermostable gh10 xylanase from bacillus sp. ng-27
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPFAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNYRVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Alkaline thermostable endoxylanase
publication title Structural insights into N-terminal to C-terminal interactions and implications for thermostability of a (beta/alpha)8-triosephosphate isomerase barrel enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus sp. ng-27
total genus 143
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4qceA00
3NDYA 1J0IA 5BRPA 4U2YA 2AOSA 5BROA 4W93A 2F2HA 2BVTA 4HZ6A 5AC5A 4AD1A 4UZUA 2FH6A 5D4YA 1GCYA 4IPNB 3WDIA 4ATLA 2ZOXA 3GXIA 2EQDA 2DQXA 2B31A 1UH2A 1GZJA 4DUVA 1MW3A 1EOKA 2FDMA 2VVNA 3VNZA 5LYRA 4Q22A 1J0HA 1DWIM 3T0DA 1IZJA 1ISYA 3OG2A 1AVAA 2XFYA 1OINA 4URIA 5DFAA 5JIPA 3KEHA 2WHLA 4BF7A 4Q7NA 1ITXA 4A3YA 4ZXOA 1J12A 4OUEA 2F8QA 4HZ7A 5CSUA 2WWCA 1C8QA 1KXQA 4UFLA 3AIEA 3PZ9A 2D0FA 2E8YA 2XM1A 1NP2A 2WHMA 2VL4A 4HPHA 1CGUA 3PTQA 1A47A 1VB9A 4AMCA 1NM9A 2PWHA 3IANA 4A4AA 1JXJA 1X6LA 2YL8A 3WL1A 1VEPA 1PZ3A 2ZUNA 2VX7A 3W6MA 1M03A 1HN1A 5I23A 1MFVA 1JIBA 2XTKA 1WDPA 1W9XA 3W82A 3AIBA 4UQAA 4YN5A 5FCZA 1QW9A 1HL8A 4KMQA 2JALA 1UQYA 1SR0A 3L4TA 1E6SM 3A6OA 1H3GA 5KEZA 4QLKA 4AY1A 2HISA 4EKJA 3KE0A 3UEQA 2J79A 1UR0A 3A3HA 4AW7A 3VIPA 1K6AA 4PMZA 4QLLA 3WD1A 2VZUA 3MUZ1 2VX6A 1Q6CA 3BH4A 1VFOA 5BXRA 2G3NA 4AYSA 1W2VA 3MKKA 1EDQA 4W8BA 2XVKA 4E8CA 1CGXA 1W91A 3EMQA 3LPPA 4OOZA 4BZYA 2QV4A 1P6WA 4NSBA 4PTXA 2XGBA 3WDJA 5D9MA 4V2XA 2XM2A 3PN8A 3L4YA 4MB4A 4PCTA 4U2ZA 2DIEA 1MW2A 3MANA 2HVMA 5A1AA 1GHRA 1XRVA 4UOZA 1LJYA 2W92A 5LA0A 1PPIA 3W24A 2FGLA 3ZQ9A 4R27A 5GQBA 2EJ1A 3MMUA 3KZSA 3HMCA 4ZE4A 3FXYA 2WYSA 4LYRA 5JUVA 1GOWA 5HDRA 4XZBA 3RM4A 1JYXA 3EDFA 3ZJ7A 1U33A 3BMWA 4PUDA 2G3MA 3OA5A 2J7FA 4TVCA 3VDAA 5BXPA 1LWHA 1BG9A 3MMDA 2DSUA 3TTYA 4Z2GA 4M81A 3S6TA 2NT0A 1QNOA 3VM7A 2VRQA 3PTMA 3WMBA 4D6EA 1CPUA 5CGTA 4WKHA 5I2UA 1KBKA 1JD7A 4XZWA 2BNJA 4X0VA 4ACZA 1XGZA 3EDJA 1HT6A 1QI3A 2WNWA 5A6BA 2CBJA 3W81A 4QAWA 5A8QA 2GUYA 1V02A 1ZL1A 4K68A 1AQHA 2X05A 4U5KA 4CN4A 3WNMA 1ODZA 1F4HA 1GPFA 2PWGA 2WC4A 3FW6A 1V0LA 1NWRA 4PCSA 1CNVA 3WN6A 5CLTA 1DP0A 3WF0A 3W53A 3AS1A 4JKLA 4UFKA 3QOKA 2FHFA 1EDGA 5A8PA 4LYQA 1NH6A 1C8XA 5A6SA 4M8UA 4EK7A 1E1FA 1YHTA 2QMJA 1JZ3A 1GW1A 5GNXA 1KWGA 2VZOA 1HKIA 4Z2LA 3VD7A 1UQZA 4F79A 2DT1A 5CJ5A 5KZ6A 2C0HA 5C71A 3BAXA 4JL2A 4P8VA 3M6DA 1TR1A 1BAGA 3VKKA 4OKDA 2XWEA 5DT7A 3GXMA 1FOBA 1AQ0A 4PMYA 3SCRA 4GZIA 3II1A 3WF2A 1UD8A 1KQZA 1UR9A 2VRJA 2EBNA 2QPUA 4IISA 4HOXA 3CUGA 3A47A 5TD4A 4GQQA 5A2BA 4CKQA 3PZIA 3VUPA 1CLXA 1K9DA 2IXUA 3BLPX 1VF8A 4UFMA 2XJ7A 4NF7A 1LG2A 3WENA 4MPKA 1RPKA 2J7BA 3IJ8A 1JF5A 1Q6DA 2NSXA 2YL9A 2WMKA 4P8XA 4XX6A 3L4VA 2VRKA 5A8MA 1J0JA 2PC8A 2WVTA 4J3WA 3WF4A 1EGZA 1LF1A 3SUSA 3PZUA 4U3AA 5M17A 4CU7A 2WC3A 3ZO9A 4UFJA 2XVPA 4JHZA 3TTQA 3ZR5A 1K9TA 1V3JA 2WLZA 2WVVB 3WBEA 5BXSA 1KXTA 5D9OA 5HOSA 4Z2IA 1XH1A 2CBVA 2DSWA 9CGTA 2UY4A 4H8UA 2CIPA 3ZIZA 2UY5A 2WZIA 1VBUA 3EBVA 4P7OA 3W27A 4H7VA 3BAYA 1JXKA 1VBRA 3CZLA 3ARXA 3ZT5A 2GSJA 4ZEPA 3B8SA 4GZJA 1MQQA 4E8DA 4R5EA 4MNJA 1VJZA 2BXYA 4V28A 1RD6A 1E6ZA 2E3ZA 5A8NA 5LA2A 1GQJA 4V27A 2OLHA 3LPGA 1C7TA 2WBKA 2W63A 4QP0A 4H04A 3WEZA 1BFNA 2YA0A 2OWXA 3DECA 1TMQA 1JYVA 2FHBA 1H0GA 4D6HA 5IHSA 3OGVA 3U7BA 2XGIA 3WDRA 3RDKA 1B3WA 2DT2A 2WCGA 1EDTA 3SEPA 2VR5A 4W7UA 1VFUA 5GNZA 1I1WA 3MUIA 5I78A 3GH5A 3O6AA 1OD0A 3SIMA 5ABEA 3CZEA 3OZOA 3VGFA 3AI0A 1KXHA 4HOZA 2OSYA 1MYRA 2OWCA 3DYPA 4DM2A 2J77A 3ARWA 5EFDA 3OLGA 2V38A 4GI9A 4AD4A 2WMFA 4KGLA 2UY3A 4KWUA 2VURA 1TA3A 3T0BA 1E40A 2EPMX 3W37A 5AYIA 1ZB5A 2ZE0A 2EXOA 4DWSA 3PZMA 1QNQA 1HXJA 1SMAA 2YA2A 1ISXA 2ZWZA 1W9VA 4UQ9A 5BRQA 4A3HA 4P7RA 1E9LA 1D3CA 1HL9A 4N0RA 3W0KA 4HA3A 3VILA 5CPSA 3BAJA 3LPFA 1XH0A 4J7RA 4D6DA 1UR4A 2WLYA 1KB3A 2WK2A 4W5ZA 1UWRA 4P8UA 1E55A 1K9FA 3WQ6A 1HF6A 4AIUA 1HJWA 2WB5A 4GI8A 1E4LA 2ZUVA 1Q4NX 1UKQA 4MAVA 5M5DA 1PIFA 3RJYA 1MWOA 3CMJA 4GPNA 1E4MM 1B1YA 3UERA 1H11A 1CEOA 1KWKA 4H8VA 1EQPA 2CHNA 3BC9A 4XUYA 3EMCA 5E9AA 3F4VA 1XV8A 2UY2A 3K8MA 3BCFA 3WUFA 3U7VA 1BGGA 1HNYA 2WCAA 5CXPA 3SURA 2D0GA 3BXWA 4W7VA 5CGMA 3GBEA 1U2YA 1YQ2A 2GDUA 3ZSSA 3ARVA 1BYAA 4PYSA 1ECEA 1F4AA 3VIJA 4EE9A 1ZBWA 4F9DA 1WDQA 2DIJA 1G0CA 4BQ3A 3WKZA 3MS8A 3HJEA 2E9MA 1PIGA 4W88A 3VU2A 5F7UA 2NW0A 3VX1A 3NYDA 4M24A 3GNRA 2V3DA 4UZSA 1B0IA 1NWSA 1MQRA 3VMPA 2G41A 1BYBA 4MB3A 4OIFA 1D7FA 3PBGA 1B2YA 2OSWA 3KL0A 2QF8A 3GYCA 2ZX5A 2W61A 2YA1A 5E6YA 1WDSA 3N17A 3LPOA 1GHSA 4ZE5A 1VFMA 4LX4A 2XWDA 7CGTA 1UZ4A 4JIEA 3CO4A 1OGSA 2WVSA 5A6LA 1GQIA 1EIBA 1OGBA 1GOIA 4JKMA 1E73M 1W9BM 2VZSA 5E0FA 1DTUA 3K4DA 4L4OA 5M3WA 1R87A 4D72A 5JBEA 5HPCA 8CGTA 1GUVA 1E0XA 4PTVA 2BY2A 4PTMA 2VNCA 3GH7A 1E71M 4CD4A 1UKSA 1G5AA 2CNCA 4W89A 3CZ8A 3ARUA 5A6AA 4WSJA 1VRXA 4CD5A 1LLOA 3L4UA 1NQ6A 3ARZA 1JZ6A 1XSKA 3N04A 1OGGA 4CCEA 1V3IA 3MU7A 3SCUA 2VR4A 2WC7A 1CECA 2WXDM 3BGAA 3HN3A 1WNOA 1J18A 4ML4A 1CGTA 4B3LA 3CHCA 4H41A 3MMWA 1VAHA 4CVWA 2W4XA 1B31A 3WNKA 3AMDA 2EEXA 2GJPA 1LWJA 3M7SA 1UG6A 1OB0A 5CG0A 1KR1A 3G6MA 4PN2A 3AXIA 3OB8A 4WKFA 1HVQA 3ZT6A 1UOKA 1UWQA 4TTGA 4GZEA 1KXVA 3MUY1 1W32A 3NDZA 3RILA 3GH4A 1HKJA 3EDDA 4GINA 4KRUA 1GJUA 3SCNA 3TOPA 3UCQA 1G9HA 1SMDA 4BQ4A 2V5CA 3KL3A 1W1YA 2PB1A 2CESA 4GO9A 3AROA 5EFFA 5AYBA 3SUVA 2XVLA 3RIKA 1B3YA 3T0AA 4B16A 1V6WA 3FAWA 4X0NA 2BHYA 1O6IA 3VIOA 2YLLA 3PZQA 4FF5A 4CU6A 1XYZA 4ZFMA 2J7CA 4AWEA 1BYDA 3WUBA 3VDCA 4AZBA 3AMLA 1QNPA 2BHZA 1CWYA 4MDOA 4W86A 2VQUA 4B9ZA 2XUCA 4U3CA 3WNLA 2G4FA 3ZT7A 3OIHA 2VCBA 2Y8KA 1RH9A 5GPRA 4HZ8A 1CLVA 2OYLA 3WFZA 4MJ2A 1E43A 1C8YA 4J27A 3WMSA 4PTWA 3WFLA 4OBSA 4UFIA 1ITCA 2W66A 4ATWA 2FHCA 3NUKA 1IZKA 2D20A 3SCSA 1E15A 3LMYA 4WJXA 3F5KA 3EMZA 4M56A 3VINA 3A4WA 2YLAA 3VD5A 3BSHA 2ZX7A 1JNDA 3OLEA 3F5LA 2WBGA 1B90A 2IUZA 3AICA 3AXHA 3AJ7A 3AHXA 2C8NA 3QHNA 3POCA 2VI0A 2ZXAA 3RO8A 1GJWA 2GDVA 1JZ5A 1HIZA 2J62A 3SCTA 2WHJA 2QHAA 3QOMA 3WH8A 1CTNA 2CEQA 2CYGA 2YKKA 3AIUA 3CUHA 4QDMA 3WNNA 3VGBA 4PSPA 2XIBA 1LG1A 5DMYA 3U5UA 4YPJA 1V3MA 1B3XA 2ZXQA 1GOOA 1TVNA 1BSIA 2ZX8A 4AISA 2NT1A 1TUXA 1JZ7A 3L4XA 4QFUA 2J47A 3L2LA 1UHVA 2UWFA 2D22A 1MXGA 1XCWA 4M1RA 4U31A 2QLYA 2XYLA 4CGTA 4P7QA 2BFGA 3GNOA 2BVYA 2A3AA 4EANA 1V0NA 1GNXA 3HU7A 5DT5A 2ZXDA 3VIKA 5CPQA 5EB8A 4BA0A 3BLKA 3GNPA 4DWSD 1W3LA 5BCAA 4IPLA 1HJUA 5FL0A 5DEZA 3VX0A 2DT3A 5A95A 1M04A 1QNRA 3AMGA 4P7NA 4JZ5A 2C7FA 4D1JA 3GZAA 5JBDA 2GJXA 1W3KA 3MSDA 2WM0A 3E1F1 2WANA 3M46A 4RE4A 3QGVA 1QVBA 1G1YA 1UD4A 3A4XA 4FMVA 1K9EA 4TUFA 1LL4A 3CTTA 3EYPA 3AIRA 3VD4A 1JD9A 1V3KA 3W26A 1UD6A 1X6NA 2DT0A 3ZJ6A 4GIAA 4AD0A 3RJXA 2J8FA 1E4NA 1JDDA 3ZJ8A 3DYMA 1BGAA 2CCRA 2XIIA 4D1IA 5IHRA 3WDPP 5IXEA 1R8LA 4UQDA 1CXKA 4AZ5A 4MNKA 2EPKX 1A3HA 4NRRA 1IT0A 2DH2A 3BAIA 1KBBA 1FHDA 1EA9C 1R7OA 4GQRA 4D6CA 2CETA 4QCFA 1H4PA 4DWSC 1XCXA 1ZBVA 3CGTA 2OSXA 4MNLA 3AHZA 4TX8A 2O92A 4EAMA 4HU8A 1GOMA 1G01A 4MB5A 2DH3A 2E0PA 4AZCA 2CPUA 2VTFA 1ZU8A 1KGWA 2AMGA 1BG4A 3D5HA 1M53A 1RP9A 3RM9A 4D71A 4IUGA 4PRWA 2ESCA 2OYMA 2GK1A 4D6IA 1FA2A 2O9TA 4PMOA 5E6ZA 1GOQA 1MVYA 3GXDA 3CHDA 1NWUA 3SCQA 4MJ4A 4B3KA 3TONA 3VVGA 1W9UA 3RCNA 1KQYA 4L4PA 4YHEA 4QLJA 1SFSA 3VIHA 1WP6A 2FGZA 4ACZB 2J7HA 3PHAA 1WZKA 7A3HA 2YIHA 2W91A 2XFFA 2QPSA 1M01A 1OT1A 1WKYA 4KGJA 4AZHA 4NI3A 2XFRA 4DUWA 3VNYA 1V3LA 1W1VA 1BPLB 3WD0A 1J01A 1PX4A 2WMJA 1C93A 3W38A 1B3VA 4OZOA 2E4TA 3WQVA 1QI2A 2CKRA 1E70M 1FH8A 2IXVA 1HKKA 1IV8A 1MQPA 2PWDA 5HBFA 4MTVA 4S3JA 1MFUA 4OOUA 2WSKA 1FHLA 1ISWA 3POHA 1JG9A 3AS3A 4MDPA 1ZBCA 2D3NA 4P7LA 5HPOA 1KGUA 1C7SA 1FP8A 2J7EA 1FP9A 2BY0A 3CPUA 2YJQA 1BVZA 1Z32X 4JKKA 3UESA 4Y7EA 1BQCA 1UD2A 4DM1A 1JGIA 3WBAA 1XSJA 2BY3A 3AQUA 4UQEA 3CLWA 1JDCA 1E5NA 1B9ZA 5BXTA 1V0KA 3VGEA 3QHMA 1CGVA 5E70A 6CGTA 5I5RA 2VUYA 4W7WA 4FK9A 4UQBA 1H41A 1HX0A 2DGAA 5JIWA 1UKTA 3A4AA 1KGXA 1OCQA 2J4GA 1JF6A 1WDRA 4LXFA 1WZAA 3MUAA 4CCCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NDY A;  1J0I A;  5BRP A;  4U2Y A;  2AOS A;  5BRO A;  4W93 A;  2F2H A;  2BVT A;  4HZ6 A;  5AC5 A;  4AD1 A;  4UZU A;  2FH6 A;  5D4Y A;  1GCY A;  4IPN B;  3WDI A;  4ATL A;  2ZOX A;  3GXI A;  2EQD A;  2DQX A;  2B31 A;  1UH2 A;  1GZJ A;  4DUV A;  1MW3 A;  1EOK A;  2FDM A;  2VVN A;  3VNZ A;  5LYR A;  4Q22 A;  1J0H A;  1DWI M;  3T0D A;  1IZJ A;  1ISY A;  3OG2 A;  1AVA A;  2XFY A;  1OIN A;  4URI A;  5DFA A;  5JIP A;  3KEH A;  2WHL A;  4BF7 A;  4Q7N A;  1ITX A;  4A3Y A;  4ZXO A;  1J12 A;  4OUE A;  2F8Q A;  4HZ7 A;  5CSU A;  2WWC A;  1C8Q A;  1KXQ A;  4UFL A;  3AIE A;  3PZ9 A;  2D0F A;  2E8Y A;  2XM1 A;  1NP2 A;  2WHM A;  2VL4 A;  4HPH A;  1CGU A;  3PTQ A;  1A47 A;  1VB9 A;  4AMC A;  1NM9 A;  2PWH A;  3IAN A;  4A4A A;  1JXJ A;  1X6L A;  2YL8 A;  3WL1 A;  1VEP A;  1PZ3 A;  2ZUN A;  2VX7 A;  3W6M A;  1M03 A;  1HN1 A;  5I23 A;  1MFV A;  1JIB A;  2XTK A;  1WDP A;  1W9X A;  3W82 A;  3AIB A;  4UQA A;  4YN5 A;  5FCZ A;  1QW9 A;  1HL8 A;  4KMQ A;  2JAL A;  1UQY A;  1SR0 A;  3L4T A;  1E6S M;  3A6O A;  1H3G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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