1R7AA

Sucrose phosphorylase from bifidobacterium adolescentis
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
504
structure length
503
Chain Sequence
MKNKVQLITYADRLGDGTIKSMTDILRTRFDGVYDGVHILPFFTPFDGADAGFDPIDHTKVDERLGSWDDVAELSKTHNIMVDAIVNHMSWESKQFQDVLAKGEESEYYPMFLTMSSVFPNGATEEDLAGIYRPRPGLPFTHYKFAGKTRLVWVSFTPQQVDIDTDSDKGWEYLMSIFDQMAASHVSYIRLDAVGYGAKEAGTSCFMTPKTFKLISRLREEGVKRGLEILIEVHSYYKKQVEIASKVDRVYDFALPPLLLHALSTGHVEPVAHWTDIRPNNAVTVLDTHDGIGVIDIGSDQLDRSLKGLVPDEDVDNLVNTIHANTHGESQAATGAAASNLDLYQVNSTYYSALGNDQHYIAARAVQFFLPGVPQVYYVGALAGKNDMELLRKTNNGRDINRHYYSTAEIDENLKRPVVKALNALAKFRNELDAFDGTFSYTTDDDTSISFTWRGETSQATLTFEPKRGLGVDNTTPVAMLEWEDSAGDHRSDDLIANPPVVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords sucrose phosphorylase
publication title Crystal structure of sucrose phosphorylase from Bifidobacterium adolescentis.
pubmed doi rcsb
source organism Bifidobacterium adolescentis
total genus 181
structure length 503
sequence length 504
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.7: Sucrose phosphorylase.
pdb deposition date 2003-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00128 Alpha-amylase Alpha amylase, catalytic domain
A PF09244 DUF1964 Domain of unknown function (DUF1964)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.220.10 Mainly Beta Single Sheet Glycosyl hydrolase fold alpha-Amylases 1r7aA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1r7aA01
3.90.400.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Oligo-1,6-glucosidase; domain 2 Oligo-1,6-glucosidase; Domain 2 1r7aA02
3CHDA 4JKLA 1UWIA 1W2PA 1W2VA 4H8UA 4JFSA 3AXIA 2CXGA 2X0HA 3WQ8A 3GH5A 3N17A 1JG9A 4WKAA 4V27A 2DH3A 2Y5EA 2ZXDA 1RH9A 2ZIDA 4TX8A 3VNYA 4E2OA 4CU7A 4Q22A 5D8WA 3VINA 4B16A 4JFVA 3THDA 2WHMA 1K9EA 3I3EA 4JKMA 2VMFA 1H3GA 3CZGA 4YHEA 1HVXA 4CVWA 4AZCB 4B9ZA 1Q6FA 3W82A 4P7QA 5F7UA 1J18A 3WDJA 4WF7A 3BAXA 3DHPA 3RDKA 4NSBA 3VDCA 3OLEA 2WMFA 1UR4A 1ISXA 2A3EA 1JAKA 4AD4A 1EH9A 3PZOA 1WKYA 3A47A 5HPCA 1HJWA 4A3YA 5JBFA 4TTGA 4GIAA 4U3AA 1SMAA 1GVYA 2CBIA 1UKPA 4J7RA 2ZICA 3UR8A 2VO5A 4F8XA 1MQQA 1U2YA 2ZE0A 2DEPA 2DDXA 5CGMA 1G1YA 1ZBCA 4U2ZA 4AW7A 3TTSA 2VL4A 2BHZA 3HJEA 3N18A 3RM4A 4KMQA 1J0JA 2C8NA 3RO8A 4CUCA 3NDZA 4HMDA 1I75A 4UOZA 2XVNA 3ARVA 5BYWA 3VGEA 3M6DA 3CHEA 4AXNA 4AEFA 2J47A 5FL1A 1JYXA 1GVIA 2AMGA 3NDYA 1WB0A 2PBOA 5A6MA 1MW3A 3K4AA 5EMYA 3UG5A 4FMVA 2CBUA 1J0ZA 4X0VA 5A6LA 3QGVA 1NQ6A 1XCWA 2CKRA 1UWQA 4UFIA 4D6JA 1PIGA 3CUFA 1OT2A 4FLOA 3CLWA 4AD5A 1UG6A 2BFGA 2GVYA 2IXUA 3T2QA 2J8FA 2W63A 3POHA 3AS2A 4UZUA 2D3LA 2UY4A 1OM0A 5CG0A 1D2KA 3EDKA 2D1ZA 4GZIA 4KH2A 3AYRA 3FAWA 3U7VA 4HU8A 1E5JA 2VX4A 1MW1A 1QBBA 2X8RA 4V28A 1ZU8A 4UQBA 2Y8KA 2WWDA 2PWEA 1B0IA 1UWUA 3AS0A 3A4XA 4Z2LA 1KQYA 1GW1A 1UD8A 2RGMA 4UTFA 1E15A 3HU7A 4QLLA 3NJ3A 4ACYA 1KBKA 3ZSTA 3WDRA 1HL8A 4DWSC 3I3DA 2E40A 1UD6A 4W8LA 2PB1A 2IUZA 1L8NA 4ML4A 1JNDA 5A6SA 2XWDA 3IJ9A 4GI8A 1NWRA 1JD7A 3AIBA 1KR1A 4MADA 3WEOA 3DECA 1J10A 1GJUA 2F61A 1BVNP 2E9BA 2D0HA 4F9JA 1I1XA 4WKFA 5A3HA 2DSZA 2FDMA 3AZRA 2X2YA 3RM8A 1GOMA 2VX5A 5DT7A 1X6NA 2J7DA 1Q6DA 3WN6A 3RMEA 1M01A 1BTCA 2FHFA 1VFOA 3WIJA 1NH6A 3A4WA 1CEOA 4W7VA 9CGTA 2FHBA 1FP8A 5GNYA 4CD5A 5CPQA 2CERA 4JZ5A 2PF0A 1GJWA 1ITCA 4D6GA 5A2AA 2XSBA 1B3YA 2G41A 2WMKA 3DYPA 3N15A 2DSWA 2WHJA 4J27A 1CXLA 3AIWA 1VEPA 4OOZA 4RE3A 4HOZA 2EJ1A 3WQVA 4W88A 1M04A 2VZOA 1UH3A 1H4PA 2DSKA 1JZ4A 1ESWA 1G0CA 1QVBA 4PMQA 4N42A 2CNCA 3O2LA 5DO8A 1KXHA 5I79A 1KBBA 2HVMA 3B9EA 2J7HA 4GINA 2VNCA 4IPLA 3UEQA 3EYPA 4AIEA 4AD1A 2VRQA 1EOMA 3F4VA 2EPKX 1NOWA 3WENA 3GNRA 2WZIA 4GO9A 5D9NA 1GHRA 1K6AA 2VQTA 1ZBKA 4PTWA 1KWKA 3OGRA 5BROA 4ATWA 5ECUA 3GXIA 2BVDA 5JIPA 5EB8A 3TA9A 2EXOA 1CGYA 3OB8A 3WFZA 4P8VA 4ACZA 4BQ4A 1E43A 1E1FA 4FK9A 2OSYA 1GOQA 4M56A 3E1F1 5IFPA 1CGVA 2XIIA 3PZGA 2WMIB 1XD0A 3VOCA 3SCPA 5I23A 2CETA 1JYWA 2EEXA 4P7RA 3UG3A 3B8SA 4TTUA 1UA3A 5E70A 3VX0A 3VIKA 4NRRA 2ESCA 1IZJA 2XVKA 1HL9A 2J4GA 1E72M 3VD3A 1BF2A 2GDUA 4AD2A 3EMCA 1XYZA 1V6VA 4M24A 4M8UA 4GPNA 4FLQA 3VIPA 4NZCA 5ABHA 3SEPA 1UR9A 3VILA 3WMSA 1KQZA 4R5EA 2WPGA 1XGZA 1FA2A 4OOUA 3ARSA 2D0FA 1C8YA 3T2PA 5ABFA 1GPFA 4PYSA 1U30A 2YL6A 3UR7A 3VIHA 1W9DM 3ARXA 3WNPA 2OWCA 3AIEA 1ZL1A 3AJ7A 1CECA 1UR8A 4H7VA 1PPIA 1XH2A 2V3FA 4M81A 2VQUA 3ZT6A 3PHAA 1R86A 1ZJBA 2YL9A 5D8ZA 5A2BA 1K9TA 3TTOA 2CHOA 3NSXA 1M53A 3CZ8A 3MUIA 1DEDA 2EO7A 3SCUA 1V0NA 2VRKA 1OSEA 1PX4A 2WM0A 1GNXA 1D7FA 1GCYA 2WW5A 4P7OA 3L4UA 2NT0A 4DWSD 1SFSA 3WY2A 1ISZA 4MNJA 3N11A 2J78A 2C0HA 3K8LA 1JL8A 3GZAA 2GSJA 4IPNB 3NYDA 4LYPA 2ZX6A 1HKKA 2XPKA 5CGTA 3GNPA 1CLVA 2PI6A 3ZIZA 1JD9A 3KWXA 2A3CA 1W1VA 4DUWA 3CZKA 4X9YA 2XFFA 5JBEA 2UY2A 2XFRA 3VGFA 4B3LA 1C7TA 3T0AA 5E0CA 2WB5A 1GOOA 1VEOA 3W26A 4OBRA 3IJ7A 3FY1A 3ZOAA 1C92A 1KGXA 2AAAA 3JUGA 3NSNA 5FIPA 2BXZA 2DSUA 2WKLA 2YA2A 1H1NA 2OYKA 3OLDA 3VD9A 4MB3A 4PMVA 2ZUSA 4CD8A 1ZBWA 1RP9A 4CCDA 1TZ7A 4NRSA 4KWUA 7TAAA 2PBGA 2WNWA 2YDSA 1VJSA 2CITA 4FLSA 3AS1A 2GJXA 1ISYA 3THCA 5I0DA 3DYMA 3VO0A 4M1RA 5I5RA 4TXEA 4PUEA 3L4TA 2W91A 3AROA 3FHAA 2FH6A 3K46A 1G5AA 2Z1SA 1Q6GA 8CGTA 1E70M 1MXDA 1HNYA 1BPLB 4PTVA 4LQ1A 2WANA 3VD5A 5ABEA 3UG4A 5LA2A 3VKKA 1TUXA 2VZUA 5M5DA 2VR4A 1B3WA 1UUQA 5DT5A 4D71A 1CXIA 5CLTA 3AFBA 3MUAA 4JIEA 4PMUA 3RJYA 2V38A 3AMGA 3BAYA 3VMNA 2JEPA 5FOOA 4QCFA 1VB9A 1V0KA 4P8WA 5JIWA 2WVUA 1WO2A 1JDAA 2O92A 1YQ2A 3G6MA 1QI4A 4JHOA 3AQUA 4BS0A 1HVQA 3W53A 3VPLA 2WC7A 1J0YA 1GQJA 4J3WA 1V0MA 1UQZA 1FFQA 1QW9A 4A4AA 3AIUA 7A3HA 1JDCA 3U5UA 3CMGA 4H2CA 2CPUA 1MFUA 2XUCA 1JDDA 3L4WA 1X1NA 1TFVA 2VJXA 1QNQA 4HMEA 4PBGA 3S2CA 4TVUA 4C7FA 4MNKA 4CD7A 1H5VA 2VCAA 4AEEA 1OT1A 3O6AA 4DM2A 2Q8XA 1GORA 4D1IA 1WCGA 3AYSA 1YHTA 2XGIA 2X0YA 1BAGA 1V3HA 4PN2A 1HT6A 1US2A 4GXPA 3WD4A 2WVVA 1W32A 2ZWZA 1UWSA 4PUDA 1GOKA 1WDSA 3AS3A 4M82A 3VGDA 6A3HA 1OIFA 3WY3A 1WZKA 4QLJA 4S3KA 2NW0A 1CGXA 5AC4A 2J75A 3W6LA 1WP6A 2WMGA 3W38A 3ZT5A 1JZ8A 3WFLA 2DIJA 4MJ4A 3S6TA 1B3ZA 3O9NA 4ZXOA 1H11A 4CU8A 3AIRA 3OGVA 4TVCA 1MQRA 3W0KA 1E40A 1UWTA 2A3BA 4H8VA 3IK2A 1EO5A 1H09A 1E0VA 2BY3A 1GQKA 1VEMA 3VM7A 2W5FA 3GXMA 4HU0A 2WCAA 3HMCA 3QOKA 4PTXA 1L0PA 4EK7A 4XZBA 1AQMA 5TD4A 3OZPA 1ISVA 1E4MM 5GQBA 3T0BA 2F2HA 5FKYA 2X05A 4ZENA 2WAGA 2PWHA 4MPKA 3RILA 2VCCA 2NT1A 3ARUA 1OGSA 2MANA 3VGBA 1CNVA 1JI1A 4FF5A 4PMDA 2WC3A 3SCVA 2OYMA 3BXWA 1UH2A 5FL0A 4TOQA 4EKJA 3WNLA 4N0RA 1E0XA 3WL1A 5A6KA 3SIMA 4XV0A 3PZIA 3CUHA 2DH2A 3SCWA 4UFLA 4QP0A 4LXFA 1VFUA 1G94A 1VFMA 1UZ1A 3WH7A 4W86A 3WNNA 3BAIA 3WD1A 2DT0A 3CH9A 1EDTA 4GQRA 5I6SA 1BLIA 2EQDA 4BZYA 3W29A 3SCQA 2XVLA 3SCOA 5IXEA 2WCGA 3AHYA 1V6YA 5E9AA 1G9HA 2J7BA 3VD7A 1NM9A 4F79A 1JXKA 2QHAA 4BA0A 1XHGA 3GTNA 1J9YA 3D3AA 5A95A 1CTNA 2W92A 4UFKA 4HA3A 3AHVA 3ALGA 4AZ5A 1E3XA 4HOXA 1UD4A 4QCEA 1LL6A 2ZUUA 3L4YA 3BSGA 3BMVA 1F4AA 1DWFM 1J01A 1V03A 4R27A 5EFFA 2CYGA 1OD8A 1E4LA 4UFHA 7CGTA 1V6XA 4ACZB 4E4PA 2VTFA 3B9AA 3BCDA 1KXTA 3F5KA 1QNPA 3GXDA 2QLYA 1ZB5A 5CXPA 1VFFA 4HTYA 3WEZA 3PZQA 4IM4A 2E8YA 1CENA 4PMZA 3MU7A 3BAJA 5EFDA 1R7OA 1R87A 2WMHA 1P6WA 3WF3A 1QHOA 1E56A 1H0GA 1QI5A 2A3HA 2WKGA 2JFEX 3MMUA 5CSYA 2Z1KA 3PZVA 4Z2KA 1UKQA 4HPHA 4HPGA 2BS9A 2GK1A 2OSWA 1Q6EA 3ARZA 5BXRA 2VZSA 3LMYA 3N12A 1UQYA 4IUGA 1TA3A 3ZJ8A 2BY0A 5ABFB 4OJYA 3ZQ9A 1AMYA 4P8UA 1VIWA 4AY1A 2VR5A 4UR9A 5HOSA 1UZ4A 2GFTA 3WBAA 1PIFA 5A8MA 3RJXA 1E3ZA 3KL5A 1JZ5A 2JF7A 4W5UA 3IJ8A 2E9MA 1XCXA 2PWGA 2E3ZA 3ARWA 4YPJA 3PZTA 1KXVA 1V6UA 3BMWA 2VUYA 3G6LA 3PTKA 4AD0A 2CBVA 5I3DA 3VU2A 2OYLA 2F8QA 4PCSA 4RL3A 4UQ9A 2VX7A 2X1IA 4LYRA 4C7DA 1GQIA 2DQXA 3W81A 3CPUA 3GYCA 3M7SA 3VGGA 3B9DA 1WNOA 1QW8A 1OBAA 3ALFA 4NF7A 2J25A 4BQ3A 1D3CA 3WY4A 3T0DA 3MS8A 1OGGA 3MMDA 1VJZA 2ZWYA 4XUYA 5EBAA 4EANA 1PAMA 1QBAA 5IHRA 2XTKA 4JAWA 4KRTA 1V3IA 2WBKA 3ARPA 1B3XA 4U2YA 4Z2GA 1CLXA 3WKZA 4F66A 4L4PA 1PZ3A 4AZIA 1QI3A 3BH4A 4HZ7A 4MB4A 2BY1A 4E8CA 2CESA 3N1AA 3CIVA 4PSRA 4U3CA 1QHPA 1PX8A 2YL8A 1B1YA 1CZ1A 3U7BA 2PC8A 3N04A 3BLKA 1W9PA 1H49A 4PMYA 1EA9C 1E6ZA 3AMDA 3VUPA 3WQWA 4U5IA 1EXPA 2GJXB 1Y7VA 1XRVA 5DF0A 2DPEA 3K8MA 1XH1A 3T08A 3VIJA 4GQQA 5I78A 3WH6A 3PN8A 3AXHA 3MKKA 4TVDA 2QF8A 1TE1A 1V0LA 2WLZA 2V3DA 2ZUVA 1TVPA 4J3SA 2OSXA 4JCLA 2D20A 3MV11 5LA0A 4XB3A 3VDHA 1C91A 1QNSA 2V3GA 3AIQA 4C7GA 4CCEA 2D2OA 1FH8A 1V3LA 3J7HA 2UWFA 1XH0A 1W3KA 2DGAA 2WSKA 3ZM8A 1BYCA 1JZ3A 1BG4A 4BQ5A 3WNOA 1UKSA 4D1JA 2VT0A 4J3UA 4W8AA 3PZNA 1H41A 4J3XA 5HDRA 1SYTA 3VIFA 1JFHA 3KEHA 3FW6A 4XX6A 1JYNA 4CN1A 4B3KA 5E6ZA 5KEZA 1HKJA 4GKLA 1W3LA 3WH5A 5IHSA 1UOKA 3WD2A 1JIBA 3VX1A 1DWHM 4AZ6A 1KWGA 3N9KA 1NP0A 3VM5A 3WQ6A 2Y4SA 2BHYA 5CJ5A 3IAQA 4AZHA 4OBSA 3WF4A 3BC9A 1K9FA 4OUEA 2XIBA 3CMJA 1B3VA 3QR3A 3ZSSA 1J11A 4GI9A 1H0IA 1J0IA 4D6DA 2XM2A 4PSPA 4LYQA 2WXDM 4DUVA 1GOWA 4WLCA 2J7CA 4Z2JA 4CVUA 1H2JA 2VX6A 1V6WA 2G3JA 3APGA 3W4RA 2W4XA 3L4VA 3ZR6A 2WVVB 3M07A 2ZUMA 3UERA 2VC9A 1UR0A 5I77A 1OD0A 2HISA 2ZXBA 4WIWA 3SCRA 3GDBA 1BYDA 2OWWA 1FOBA 1C3FA 4U33A 1OGBA 3CHFA 4JKKA 2W66A 2FGZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CHD A;  4JKL A;  1UWI A;  1W2P A;  1W2V A;  4H8U A;  4JFS A;  3AXI A;  2CXG A;  2X0H A;  3WQ8 A;  3GH5 A;  3N17 A;  1JG9 A;  4WKA A;  4V27 A;  2DH3 A;  2Y5E A;  2ZXD A;  1RH9 A;  2ZID A;  4TX8 A;  3VNY A;  4E2O A;  4CU7 A;  4Q22 A;  5D8W A;  3VIN A;  4B16 A;  4JFV A;  3THD A;  2WHM A;  1K9E A;  3I3E A;  4JKM A;  2VMF A;  1H3G A;  3CZG A;  4YHE A;  1HVX A;  4CVW A;  4AZC B;  4B9Z A;  1Q6F A;  3W82 A;  4P7Q A;  5F7U A;  1J18 A;  3WDJ A;  4WF7 A;  3BAX A;  3DHP A;  3RDK A;  4NSB A;  3VDC A;  3OLE A;  2WMF A;  1UR4 A;  1ISX A;  2A3E A;  1JAK A;  4AD4 A;  1EH9 A;  3PZO A;  1WKY A;  3A47 A;  5HPC A;  1HJW A;  4A3Y A;  5JBF A;  4TTG A;  4GIA A;  4U3A A;  1SMA A;  1GVY A;  2CBI A;  1UKP A;  4J7R A;  2ZIC A;  3UR8 A;  2VO5 A;  4F8X A;  1MQQ A;  1U2Y A;  2ZE0 A;  2DEP A;  2DDX A;  5CGM A;  1G1Y A;  1ZBC A;  4U2Z A;  4AW7 A;  3TTS A;  2VL4 A;  2BHZ A;  3HJE A;  3N18 A;  3RM4 A;  4KMQ A;  1J0J A;  2C8N A;  3RO8 A;  4CUC A;  3NDZ A;  4HMD A;  1I75 A;  4UOZ A;  2XVN A;  3ARV A;  5BYW A;  3VGE A;  3M6D A;  3CHE A;  4AXN A;  4AEF A;  2J47 A;  5FL1 A;  1JYX A;  1GVI A;  2AMG A;  3NDY A;  1WB0 A;  2PBO A;  5A6M A;  1MW3 A;  3K4A A;  5EMY A;  3UG5 A;  4FMV A;  2CBU A;  1J0Z A;  4X0V A;  5A6L A;  3QGV A;  1NQ6 A;  1XCW A;  2CKR A;  1UWQ A;  4UFI A;  4D6J A;  1PIG A;  3CUF A;  1OT2 A;  4FLO A;  3CLW A;  4AD5 A;  1UG6 A;  2BFG A;  2GVY A;  2IXU A;  3T2Q A;  2J8F A;  2W63 A;  3POH A;  3AS2 A;  4UZU A;  2D3L A;  2UY4 A;  1OM0 A;  5CG0 A;  1D2K A;  3EDK A;  2D1Z A;  4GZI A;  4KH2 A;  3AYR A;  3FAW A;  3U7V A;  4HU8 A;  1E5J A;  2VX4 A;  1MW1 A;  1QBB A;  2X8R A;  4V28 A;  1ZU8 A;  4UQB A;  2Y8K A;  2WWD A;  2PWE A;  1B0I A;  1UWU A;  3AS0 A;  3A4X A;  4Z2L A;  1KQY A;  1GW1 A;  1UD8 A;  2RGM A;  4UTF A;  1E15 A;  3HU7 A;  4QLL A;  3NJ3 A;  4ACY A;  1KBK A;  3ZST A;  3WDR A;  1HL8 A;  4DWS C;  3I3D A;  2E40 A;  1UD6 A;  4W8L A;  2PB1 A;  2IUZ A;  1L8N A;  4ML4 A;  1JND A;  5A6S A;  2XWD A;  3IJ9 A;  4GI8 A;  1NWR A;  1JD7 A;  3AIB A;  1KR1 A;  4MAD A;  3WEO A;  3DEC A;  1J10 A;  1GJU A;  2F61 A;  1BVN P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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