4JIP | Genus

Total Genus 142

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	142
sequence length	370
structure length	370
Chain Sequence	TSLFEPAQAGDIALANRIVMAPLTRNRSPGAIPNNLNATYYEQRATAGLIVTEGTPISQQGQGYADVPGLYKREAIEGWKKITDGVHSAGGKIVAQIWHVGRISHTSLQPHGGQPVAPSAITAKSKTYIINDDGTGAFAETSEPRALTIDDIGLILEDYRSGARAALEAGFDGVEIHAANGYLIEQFLKSSTNQRTDDYGGSIENRARFLLEVVDAVAEEIGAGRTGIRLSPVTPANDIFEADPQPLYNYVVEQLGKRNLAFIHVVEGATGGPRDFKQGDKPFDYASFKAAYRNAGGKGLWIANNGYDRQSAIEAVESGKVDAVAFGKAFIANPDLVRRLKNDAPLNAPNQPTFYGGGAEGYTDYPALAQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	GTN Reductase
publication title	The Structure of Glycerol Trinitrate Reductase NerA from Agrobacterium radiobacter Reveals the Molecular Reason for Nitro- and Ene-Reductase Activity in OYE Homologues. pubmed doi rcsb
source organism	Agrobacterium tumefaciens
total genus	142
structure length	370
sequence length	370
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-03-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4jipA00

3N19B 3O63A 3QZEA 2NWRA 2W6RA 4MZ8A 3QJAA 3DZ1A 1T96A 4UTLA 3G8RA 2C15A 3W7LA 1F7BA 5AHNA 1KM6A 2G5WA 1ME8A 3AJXA 2QAFA 5D05A 3IGSA 1MEWA 4KFNA 1OVDA 5DY2A 1DHPA 2WSQA 1W5NA 3EKZA 5H2ZA 1J5TA 2Y88A 4DO5A 1HL2A 4NJGA 3LCGA 2CLEA 5CSSA 1I8JA 3L68A 1TPH1 2FLIA 2E5CA 4UFMA 3Q94A 3P67A 1G67A 3GAYA 4A29A 4WOZA 3TQVA 4LRTA 3VNDA 2X1TA 4QAIA 5CZSA 4N9BA 2DORA 1IGSA 2J88A 4JTKA 1P4CA 3QC3A 3DKLA 1W3IA 4I9AA 1XBVA 3JR2A 5KZEA 4YL2A 1I2NA 2GQAA 4P2VA 4H3DA 5FF4A 3DU0A 4RJEA 2X1SA 5AYYA 3RNDA 3NQMA 3MO7A 5CKSA 1NF7A 3NR0A 4PL1A 2E68A 3T40A 4E2BA 1WOBA 1A5AA 3KVMA 3RFAA 1PV8A 3JRKA 4JTUA 3NL2A 1VR6A 3FKRA 3C2EA 4K37A 4NZFA 4L4MA 3IV3A 1SFJA 1VYRA 1OF6A 1XUZA 3UWWA 1TTQA 4N6EA 2H8XA 1X8FA 1K03A 3M41A 2GOUA 3QH2A 3UWZA 5J5RA 3N73A 4Y8FA 4E2DA 3NM1A 1AK5A 4S2BA 1AW5A 2ZZ2A 2J6XA 1TPWA 1XDMA 1W5OA 4CQ9A 4TMBA 3STEA 2A85A 3L2IA 4UIOA 1QR7A 3PM6A 3ANYA 1W0MA 4OQVA 3O15A 3W86A 1K8ZA 3Q2DA 1H1ZA 1VYPX 3TE9A 1WOAA 3FJ6A 1ZAIA 5AYXA 4Y90A 3HPSA 1TREA 3MHFA 5D32A 4AB4A 4FIQA 1KBJA 3G18A 2NUYA 4LVFA 3STGA 3EWXA 1YTDA 4MPQA 4OT7A 1D9EA 4ORIA 4OHQA 1UASA 4K7YA 1SO4A 5EA9A 5G1YA 4AEOA 4FO4A 2Z0IA 2E1DA 1OABA 1IXPA 2GVLA 1UB3A 2VFIA 2VXNA 3TK7A 1LOSA 1ZENA 4LVDA 4JDYA 4FIRA 5CZTA 3ATYA 1Z44A 2QF7A 3TR2A 2VFEA 2ZRVA 3CC1A 4K6AA 3W9ZA 3OVQA 1TTIA 1WX0A 1ICQA 1VYSX 2RH9A 3USBA 3S1XA 1I2PA 1DQWA 3MHUA 3O6YX 4N4PA 8TIMA 2H6RA 2FJKA 1NSJA 1QCWA 1WBHA 5C6MA 1OFDA 3M16A 1NFBA 3TROA 5G1TA 1V5XA 2PC4A 4FNSA 2OCZA 4O13A 3TJLA 1VLIA 5C5YA 1FWTA 1G4SA 1SZNA 3LCIA 3VCRA 3BO9A 2Y70A 2QCMA 3F1QA 3TW6A 3CPRA 1GWJA 3KXQA 3TW7A 1A5CA 1WA3A 1QOQA 1SW3A 2E6YA 3GK0A 2QCDB 1KM1A 4LVGA 4XTDA 3W22A 5F2GA 2Z2UA 4XBKA 3B04A 1FWNA 1LZOA 4LV4A 2GPTA 1DJQA 4JTLA 2TSYA 3OA3A 1LBLA 3HO8A 3T7VA 3CWNA 4GXMA 1LLWA 3S42A 1WQ5A 3S1WA 4O18A 4M7SA 3UPBA 3HGOA 2ZYFA 2BZNA 1QNVA 4LUIA 1ZAHA 4O10A 1P5BA 3HIJA 3IRDA 3BW2A 3QMTA 3LCHA 4LOCA 4Z0SA 5IM51 5G4WA 2J27A 2HSAA 3G3MA 3TUUA 1RPXA 4OV4A 2OMAA 1JCJA 3FKKA 4ADTA 5G2IA 1ME9A 5F1UA 3UPWA 1O4UA 5LZLA 2PRLA 4FX6M 2Y7GA 3SGUA 2R94A 3G1AA 5AC7A 3BARA 4YCOA 4MFEA 1OYCA 3GDLA 2YYTA 1OX4A 3CTLA 3HGJA 1LROA 3L66A 4G1KA 5EBUA 3HMJG 4JTHA 3BG3A 3BLIA 2WO5A 3TXZA 1QPQA 4IMDA 1I2RA 4NU7A 3CLMA 4HNVA 4XTIA 4QIUA 1N8FA 4ADSA 3HG5A 3TU9A 3WJWA 1O94A 4ORMA 4AMAA 2CLIA 2Z6IA 2VEIA 4N2YA 3TX9A 5K9XA 3W7HA 3DXIA 3CQ0A 2PRMA 2QCDA 3PUDA 1UCWA 3NQ8A 2F84A 3LV5A 4YMZA 2WV8A 3O16A 1C8VA 5HR6A 2YYUA 1WV2A 1TV8A 2E6AA 3QW3A 2ALDA 1QOPA 3KVLA 3N2XA 4GJ1A 4XQ6A 3GR8A 5HUOA 5BW6A 1VPXA 1LRNA 5LHFA 3LLFA 2GUUA 1H7PA 3W72A 1QMLA 2V81A 1HO4A 3TJXA 2XFWA 2QDGA 1A5SA 3MMTA 1NAL1 3MBFA 3H54A 2JKAA 4HKPA 4K8HA 1TQXA 1JUEA 3LHYA 2CFFA 2P0OA 4PFMA 3M5VA 2WNZA 4JEQA 4I7VA 3EWBX 1RR2A 2QUVA 4LS2A 3TMLA 2H3BA 5L9FA 4O53A 3DENA 3G1XA 3W2JA 4AF0A 3SY5A 1G4EA 2FB2A 5KZDA 3MWAA 3EWYA 1ML1A 2NWSA 3OEXA 4ZVJA 1H7NA 3DFPA 3O07A 5AHIA 5K7JA 1G7UA 4JS3A 3TDFA 1THFD 1GQNA 1LM1A 3LXBA 2VEKA 1U83A 2JKPA 5HWNA 4M19A 2VELA 2Y85A 1JQXA 1KTNA 3TFXA 2ZRXA 1SZGA 4WY0F 3HF3A 1Q6QA 1JCLA 4DXVA 3TAOA 3KVJA 3NAVA 4WXYA 3W1LA 1B3OA 2DP3A 1OFOA 2B7PA 3LRKA 2ZRWA 3NGJA 4JGDA 4WY0A 3W07A 4NJIA 5G4EA 2CLFA 1G69A 2EAWA 3G1DA 1H7OA 1M7OA 2A2IA 2PRHA 4OV9A 2DU2A 2DZTA 4MUZA 2ISWA 5D2WA 1U5JA 2J9XA 5D2VA 4EOUA 4IPIA 1TV5A 2DZWA 2W79A 1EEPA 3EWWA 3BLEA 4NVTA 2IQTA 3L5MA 3M43A 3S1UA 3CB8A 3RK8A 1P1XA 3W87A 3R5EA 5D37A 3UWQA 2E5BA 4FXRA 3CU2A 4IGHA 3HJZA 1GOXA 4UTMA 3R12A 2QJHA 5D30A 1XC4A 3V75A 2RKXA 4LRSA 3MP4A 4FX7A 2YFOA 3WFAA 4QSHA 5CZ0A 4YWIA 4HPJA 4M5PA 3A21A 1HTIA 1ZNNA 1AG1O 1QPOA 2ZRUA 3I7QA 2YDAA 2X2GA 5TBOA 2CZEA 1KM4A 4GBUA 2DJXA 4RXGA 4MZYA 5H91A 3W2UA 3F4WA 4Z08A 4JYEA 3QFEA 1TPC1 1LRTA 2GVJA 3O8AA 3FS2A 1HO1A 3DGRA 5ABTA 3KAOA 3PR2A 3W71A 2A1YA 3BG5A 2ISVA 1EB3A 1FXPA 1F74A 2DZXA 3GAKA 2Q8ZA 5J5DA 1UUMA 4OBTA 3W70A 1KM2A 4WZHA 4LT9A 1DBTA 2RFGA 4NJKA 1Z42A 1EP1A 3T4CA 4XBSA 3M0ZA 1ZJIA 1TRIA 1SZFA 1WAUA 3OG3A 3QMRA 1H62A 2EGZA 3EX1A 3W7RA 5F2LA 3P5ZA 4RZ6A 4CNOA 2CLLA 5FF0A 5AOUA 2V2HA 1VS1A 4Z1AA 2TYSA 2VFFA 3G1VA 4LW7A 2OZ0A 3W85A 1VH7A 4ZL1A 3LB0A 5D2YA 1SSDA 3PULA 4GUJA 4QNEA 4EF9A 1ICPA 2RDUA 3TV8A 3P7YA 4NX5A 5LNUA 4UFLA 1YDOA 4BFAA 4FNUA 2GVGA 3GKAA 1KFBA 1FXQA 1Q6RA 2JK2A 1LLZA 1PL9A 4IJBA 4NNBA 1LCOA 4Z1CA 3UZ5A 3BW3A 1YXYA 3L67A 3OIXA 1G7VA 2E09A 3DHDA 2E6DA 3W23A 3RU6A 5G5IA 1L6WA 1KBIA 2QAPA 3G1HA 5E93A 1AW2A 4JTEA 4IOTA 2FPTA 3G1FA 3MYOA 5IBXA 3ELFA 1FCQA 4ONVA 4LV9A 2YZRA 5HJLA 2CLOA 5E1QA 3DFTA 3L21A 4UMCA 5KINA 2Q3OA 3ATZA 3L65A 1TSIA 4YLWA 3BVJA 2ZA1A 3C61A 4MYAA 4WOQA 3S9YA 1TTPA 4QJ1A 1LOLA 1GEQA 5K9CA 3CT7A 4KKXA 4IQLA 2J24A 3PY2A 3NNTA 3P61A 1GPWA 3N2MA 2FQIA 1WXJA 4JXCA 2NUXA 3MP3A 2YX0A 3LHVA 5LNVA 3UXDA 2A6NA 5DCBA 1Q6OA 4QISA 3LOTA 4O57A 1K8XA 4AWTA 5D38A 1RQEA 2OJPA 3E0IA 4E38A 3GNDA 3NQ2A 3P82A 1I45A 4WD0A 4ZQCA 1PHWA 3G22A 4MOZA 1MXSA 1OYBA 1EUNA 2CLMA 4HHPA 4IWWA 3SZ8A 4AXKA 3W73A 5A5WA 4ZQNA 4J9JA 2LLEA 2TPSA 1ZALA 3MYPA 3LCXA 1P0KA 2R8WA 3IIOA 4Z1BA 3NXFA 3G0UA 2ZZ1A 4IMFA 4Y96A 3O6CA 4R34A 1GTEA 1XCFA 4HNUA 3YPIA 3NQ7A 4OWGA 3C0JA 4GE8A 1YDVA 3VKJA 3EKLA 4LUJA 1LOQA 3TSBA 3VE9A 3HGSA 1F73A 2TRSA 3UWUA 3JS3A 4U28A 1M7PA 1H51A 3C2RA 1BWLA 1N7KA 3DFQA 5G2WA 3NQFA 2TMDA 3W7QA 1SO3A 2X30A 5HULA 1XI3A 1SPQA 4O4WA 3WJXA 4MFDA 2E77A 1FDJA 3PC0A 4Z1DA 1W1ZA 3DI0A 1C9DA 1QPNA 1F5ZA 5AYZA 1XDLA 4LVBA 4JD4A 4TR9A 3DAQA 1AL8A 1K8YA 1M5WA 4WX2A 5LKYA 3MI2A 4LS1A 1W54A 2E5DA 1GJPA 4RLIA 4TMCA 5D09A 1YPIA 2DZUA 1JCNA 4JX5A 3BGGA 4MLRA 1KTCA 1ME7A 4A22A 1H63A 3TFCA 5HUPA 1FQ0A 2B4GA 3M7WA 1ZHAA 3A23A 3DKJA 4BK9A 1R2TA 1KM0A 2QUUA 2C19A 4FEZA 3HG2A 4K39A 1ZAJA 4O28A 3HPZA 2AGKA 1NF0A 2P10A 2Y6ZA 3QPYA 4DQWA 1H60A 2V82A 1JUBA 1QFEA 2W0UA 4GNJA 4MLJA 4TIMA 5L6UA 4Q4KA 3G1YA 2YGYA 5DXYA 2Y63A 1B9BA 4XKYB 2YFNA 5BMXA 4PC8A 1TJPA 3S6DA 4R53A 3M1ZA 5DCDA 3WJSA 4O17A 4JX4A 1YXDA 1SU5A 1TMHA 3FLUA 4AWUA 5FF7A 3E49A 3TAKA 1VC4A 1W5MA 4HSNA 3PSVA 4C1KA 1KA9F 2CZFA 4NX0A 2E6FA 3NO5A 3NQEA 5KSWA 1DVJA 1R46A 3PBYA 5F1VA 2X1RA 4EIVA 1FY6A 3EX6A 5DELA 1KFCA 3EXTA 5IBXC 3TA6A 3S5YA 4GUFA 3B0PA 1X6UA 4GC4A 3W7KA 1N55A 3CIWA 4O11A 2QCCA 3UWVA 3KOFA 4CLMA 4JTFA 1DORA 4NUWA 4WQ6A 3VI2A 1KLYA 1PCKA 1VLWA 4DF0A 2CU0A 5EL1A 3LRMA 1A50A 3UD6A 1QO5A 1W5PA 1FCBA 2G96A 3FOKA 3RF9A 3E9AA 3F4NA 4IPJA 2JGQA 3NL6A 2OX1A 3QYQA 1VJIA 1SUXA 3BGJA 2B7OA 3LCFA 3DHFA 3L0NA 4X9SA 2ZZ6A 4RZ4A 3ZR4A 3PG9A 4FNQA 1KV5A 3TKFA 2FIQA 3W7DA 4ADUA 2B7QA 3G0SA 4UFJA 4UXDA 3STCA 2ZQ0A 3EWZA 1GT8A 3UNDA 1UBSA 4O19A 3U8GA 1B4EA 3HG4A 2VKZG 2VOMA 3L5AA 1TRDA 2CZ5A 3A24A 3C8FA 4W9TA 2CWNA 3MBDA 2O7SA 2A4AA 4YXGA 2AQWA 1B57A 2V8ZA 3W75A 2QCHA 1AMKA 1L9WA 3KRUA 1IXOA 4NNAA 4L4LA 3W2MA 1XBXA 3DH7A 3EWUA 2UV8G 2A6LA 3D0CA 1QAPA 3MI6A 3P74A 5DLCA 2FPVA 2Y7EA 2C14A 3ABSA 3O05A 3R13A 1EWDA 4RKAA 1X7FA 3TQKA 2XN1A 3C3NA 5BMWA 2I1OA 1HUVA 3W83A 2C13A 1DL3A 2VENA 5CZJA 3GDKA 4EWND 2NX3A 4HPXA 5K3VA 2ZTJA 3SI9A 4UTUA 1A53A 2BWGA 2RHGA 2AAMA 2QKFA 1GZGA 3L0KA 2C18A 3N9SA 2NLIA 2KZHA 4GUIA 3SR7A 4JTJA 1UUOA 3SJ3A 3DI1A 3QMSA 1JVNA 4MY8A 3AO0A 4RK8A 5HMSA 3IGXA 5FESA 2ZCGA 4M6VA 2CLKA 1C29A 3I7SA 3MJYA 3W7JA 4DEFA 3SECA 3B4UA 4ZQPA 4IX0A 3DFSA 3N9RA 4AAJA 5KMYA 2NZLA 3S8HA 4HSOA 5HQEA 1QWGA 2CLHA 5EPDA 4UC5A 1NEYA 1VRDA 4LU0A 5I3GA 3WJZA 3GB6A 3A22A 1HFBA 1SO6A 3A5FA 1XFBA 4GUGA 4CCCA 3UY7A 5AN7A 1L2UA 4NT0A 2ZRYA 2BSLA 1WYIA 1GVFA 1FCVA 3T55A 1OFEA 3W7EA 5BNKA 1OK6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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