5G4E | Genus

Total Genus 66

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	66
sequence length	247
structure length	220
Chain Sequence	MIIPALDLIGGTVVRVVRLHYARLRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIASTALKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDKQVASGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDSNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	SULFATE ION
publication title	Structural and functional innovations in the real-time evolution of new ( beta alpha )8 barrel enzymes. pubmed doi rcsb
source organism	Salmonella enterica
total genus	66
structure length	220
sequence length	247
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date	2016-05-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5g4eA00

2X1RA 3IVUA 5LNWA 4YMZA 3TSBA 2CW6A 4O1CA 1AW5A 4QITA 1TPVA 3NQGA 1JCNA 5CG7A 1H7NA 3HG5A 3C2EA 5HJLA 1LRTA 3L5AA 2GVLA 3G3DA 1ICPA 2NWRA 4LC8A 4CCCA 5D04C 3STGA 4UR7A 5K4XA 4W9TA 3HMJG 1MEIA 3SIZA 1G7UA 2QUVA 3PUOA 1SO6A 4NNAA 1ZAIA 1OFDA 1WV2A 3WJYA 4YCPA 1DBTA 1OF8A 1PIIA 1M7PA 1RD5A 2ZZ2A 5D2TA 4K38A 1X7FA 5I3KA 1TPC1 1SO5A 5D2XA 5LGZA 1M6JA 1H61A 2A85A 1TPH1 5FEZA 4UCGA 2B7PA 5D30A 4M5PA 1WA3A 4MFDA 4X2RA 3WFAA 3LHVA 1VQTA 3W7DA 3DFQA 4EOUA 3PM6A 1FXPA 3LCWA 1LOLA 2TSYA 2GJLA 2H8ZA 3N14A 1EEPA 1QO2A 1L2UA 3MYOA 3W1AA 3N9RA 1ZJIA 3F4WA 1DV7A 4LNYA 1PV8A 2DZPA 1OF6A 1TREA 3QQ0A 3M43A 5HULA 1FWTA 3NOEA 3MUXA 3BW2A 1JR1A 3NQMA 4Z0SA 1SFLA 5DN1A 2GVJA 3W1PA 2JGYA 2E6FA 1YADA 1YTDA 3GNDA 3IGUA 2BTMA 3KFTA 3LBMA 2DZSA 3NDOA 1XBVA 4LS2A 2V82A 1GPWA 2GPTA 3PF3A 1Q6RA 4QSHA 2X1UA 2Y6ZA 2FIQA 1GOXA 3EWUA 4LV4A 3SW6A 4O4WA 3QRHA 4LVGA 2CLIA 4TMBA 1XDMA 3SI9A 3NA8A 3GDMA 4IMCA 1LM1A 3HBLA 4UTLA 5EPDA 3PAJA 3N9SA 4FO4A 3B8DA 3EWYA 3TDFA 1AW1A 5LSMA 2B4GA 2EF9A 3W2UA 2WPBA 4ZQRA 3HJZA 5BMXA 1TYGA 4NU7A 3BGJA 2OX1A 5CKSA 4GE8A 1VCGA 2QCDB 3TQVA 5K9XA 3GDKA 1S3HA 3AO0A 4UFHA 1TTIA 1F6KA 4RXFA 3RK8A 1QAPA 3P60A 1KM4A 4WX2A 2Z6IA 3BLEA 4KFOA 2VFIA 1DQWA 5E93A 3ATYA 3QPZA 2E09A 3TMQA 4HNTA 3TU9A 1IXOA 4RV8A 3DENA 4OWGA 2DZXA 1QR7A 2JK2A 5C54A 2QEZA 5G5IA 5C5YA 3I6RA 3FA5A 2Y61A 1PHQA 4DBDA 5EYWA 3QMTA 1DJNA 5D05A 4UIOA 1Z44A 1A50A 3K30A 3LCFA 3SGZA 2Y63A 4A3UA 2ZZ7A 1SZEA 3NZRA 1E51A 2ZZ5A 3O07A 4JR5A 4TO8A 3TMLA 2QCFA 4GJ1A 3MI2A 1FWWA 3S1WA 3RLUA 3WK3A 2OMAA 3DFSA 2BLEA 2VFHA 3HIJA 4HSOA 4OV4A 5TBOA 1TTJA 4OGZA 2VKZG 1UB3A 3EXRA 4Z0JA 4DF2A 4FXSA 5AFDA 3PWAA 4AXKA 3DZ1A 2QCDA 3PBWA 2CLFA 1MXSA 6ALDA 4UFMA 5J5DA 1W8SA 5AHFA 2H3DA 2QKFA 4A2RA 2CLEA 1T8XA 2HTMA 3CQ0A 3P67A 4LS0A 1GG0A 3TX9A 3YPIA 1LYXA 3M7WA 1Z42A 3I7QA 1Z48A 2A21A 2C15A 5C6MA 3AJXA 3MHUA 5DXYA 4XTDA 1G7VA 1EX5A 1LRQA 1KTBA 2VFEA 3MW7A 4MVAA 3LHWA 4UTUA 1O4UA 3GAYA 5DBUA 3O1NA 3EEGA 3BARA 2OJPA 3GYEA 3N34A 4B5NA 4MJZA 4NQ1A 3EXTA 1WQ5A 1I45A 1BWKA 5LNVA 1B3OA 5LHEA 2G95A 4DBEA 4JX6A 4Z1DA 1FWSA 3T44A 3UPBA 2QDHA 5D37A 3B0UX 1TQXA 3UPWA 3TUUA 1J2WA 3EX6A 1VYRA 2V2HA 1Y0EA 3NQ8A 2A7NA 4DF0A 4PC8A 3LCIA 3NAVA 1X1OA 1ZCOA 4NZFA 2Y62A 2H3BA 2ZDRA 5F2LA 2NUWA 1EP1A 4IPJA 3LOTA 4GBUA 4H3DA 3M5YA 3ABOA 1I2RA 3R5EA 1KFCA 3KVJA 4QIUA 3CWNA 2J6XA 1Q3NA 3MI3A 4IQLA 5F2GA 5FESA 3MP5A 4LW7A 1XFBA 2V9DA 4HNNA 4EF8A 4JD4A 3GLCA 1OYBA 1W5PA 3W6YA 2ZRYA 4LS1A 1YXYA 3N2XA 3W75A 5LZLA 3L67A 3GXPA 3NZ1A 4ZVJA 3N19B 1JCJA 3W7CA 1VS1A 3NQDA 3W1UA 4XBSA 4ADUA 4DPPA 1WOAA 4JTFA 3TW6A 1GQNA 4JGDA 3OIXA 2ZRWA 1VH7A 4BI5A 2NLIA 2ISWA 2HMCA 3M0ZA 1LBMA 1IXNA 3MI6A 2W6RA 4IX0A 3TIMA 2YDAA 1G4SA 4RX0A 2E1DA 1N55A 3BLFA 2G97A 3UWVA 1EUAA 3LHYA 2RKXA 3BG5A 3M1ZA 2YCEA 4FIRA 4MFEA 1I4NA 3BW4A 3G1FA 3PY2A 2WQPA 4FX8A 1H60A 3LXAA 1O5KA 4WXZA 3PUEA 1P5BA 3LLDA 5LHFA 3S9YA 2EAWA 1FXQA 3FFSA 4GXMA 1H7PA 1HG3A 2DZUA 3W88A 3WJZA 2NWSA 1SR9A 3UWQA 1JRCA 1KM6A 2ATSA 2Y89A 3PUDA 3CEUA 1OX5A 1MSSA 3QM3A 4NXKA 5DBTA 4NJHA 4JX5A 3S5ZA 1KBIA 2F84A 3RU6A 3C0JA 1TPFA 1EB3A 1LTDA 3UY7A 1KFEA 4NJIA 3PBYA 4M7TA 3GDTA 4R33A 2NUXA 1DVJA 1RZMA 2IQTA 3G1SA 5L6UA 3W1LA 3NQ6A 1SZFA 2ZZ1A 3BV4A 1HO1A 3I7RA 1GVQA 3LGEA 4JTUA 1NFBA 1SUXA 1KM1A 5AHEA 4UMAA 3HO8A 1W1ZA 4N4QA 1YTEA 3GKAA 3IIZA 1F74A 4AB4A 3LM7A 3NL6A 1YXCA 2QCMA 3W1RA 1JVNA 2BSLA 4XWUA 2B0MA 1OK6A 3G1XA 1JCXA 1F6PA 2CLMA 3C2FA 1TIMA 3P7YA 3QSRA 2WSRA 3GAKA 3LTPA 5CPMA 4N02A 1L6WA 3BG3A 4HKPA 1OFPA 3HOJA 1LOQA 4FNSA 1TV5A 4ALDA 2DU2A 4JTJA 4K7YA 3TCEA 5TQLA 3M47A 3PVFA 3QPYA 4K37A 1VCVA 2HS6A 1NF0A 2ABAA 2EPHA 2XN2A 1F73A 1K7FA 3C52A 3CEPA 1VHCA 5F1VA 4FNUA 5KINA 3E96A 3IVTA 4AMAA 3O63A 5CZTA 3R12A 3G3MA 1IXQA 3L68A 1OYCA 1HUVA 2WNZA 1WBHA 2C0AA 2NV2A 3MO7A 4I9AA 2YR1A 3TXZA 3W1QA 3NL5A 5AHNA 1NSJA 4ADSA 5EKYA 3LV6A 2QCEA 4MYAA 4POCA 4UTKA 5HNRA 3QH2A 1P4CA 3RNDA 4A2SA 3S42A 5AYZA 1UUMA 2CLOA 2NX1A 2XN1A 4S2BA 4UTJA 4RXGA 1VGAA 3W7GA 1H1YA 3V75A 4DF1A 3G24A 1QPOA 1SFJA 4CNPA 4K36A 1OABA 5K2ZA 3W2JA 4BWLC 2CLLA 4N9BA 3W7IA 2O7SA 3W7PA 3W2LA 3WK2A 4UUIA 3TA6A 2YXGA 1ZFJA 2PRHA 4I7WA 3S1XA 4AAJA 4OBTA 2E6DA 1JQVA 4LVFA 1SW0A 1VJIA 3NQ2A 1TO3A 2YZRA 3IVSA 1VLWA 3B4UA 3R13A 4PH6A 4PFMA 3OVRA 2CWNA 3FKKA 3P8IA 1R46A 2FB2A 3G8EA 1OFRA 3QMSA 1XI3A 1C8VA 3O6CA 1G4PA 4YWIA 1H63A 2QUTA 3WJWA 5U4NA 2Q3RA 3IIXA 3HQ1A 1F5ZA 5C2XA 3LTYA 3QF0A 3W76A 3KHJA 3GKFA 4UTTA 3U8GA 2A7PA 1MO0A 3OVPA 2OT0A 1FQ0A 3TK7A 3R2GA 4MY1A 1GJPA 3MJYA 4MUZA 4UFLA 3UY8A 4DEFA 4BI7A 5AC6A 4JTTA 4OT7A 3HPSA 4A22A 1CW2A 5D03A 1KM5A 3SR7A 1TJRA 3C2RA 3CLMA 1OFAA 1EP3A 1JUEA 4UTTC 3L65A 3ABRA 4UMBA 3IIVA 3E12A 1Q45A 3PG9A 3DU0A 3TC6A 3FIGA 3E02A 1YYAA 2Q3OA 4DO6A 4RKAA 2E5CA 3KOFA 2JKEA 1FX6A 4NJKA 2RFGA 4CQAA 1H7OA 1OX6A 1EA0A 3NYZA 4JTEA 4MY8A 3BK0A 3NQAA 1W5MA 1OJXA 3EX3A 1SO4A 3MWAA 2YW4A 5I3IA 4WOZA 5DLCA 2G5WA 4ZL1A 3G1YA 2XFWA 5FI8A 3GDLA 4JIPA 3THQA 1TJPA 1P0KA 1S5WA 4J9JA 1G6CA 1FDJA 1K8YA 1L6SA 5AB3A 4HNVA 1AW2A 3A5VA 3UXAA 3N2MA 5D2WA 4MLJA 4NJJA 3MYPA 1QOQA 3P82A 1C9DA 1IGSA 2YPIA 5KZMA 2PC4A 5AHLA 3N73A 4CQ9A 1ME9A 3TNOA 3UZ5A 1KA9F 2V5LA 3TROA 4LY8A 3S1VA 3BG9A 3LCHA 2VOMA 1N7KA 4FIQA 3B0PA 3M5ZA 5HINA 4TMCA 3VFLA 5K3VA 3LX9A 3SJ3A 4E38A 3W7QA 2X2GA 3WK0A 4O1AA 2X1TA 5CZ0A 3EWBX 1W5NA 1S5VA 1ME8A 4O13A 2A4AA 2FFCA 3ABSA 4FHAA 5A8GA 2V2DA 5KZDA 3EX4A 2GUUA 3A23A 2CLKA 3G1HA 1TMHA 1K3UA 1SZNA 5EBUA 2YFOA 4MZ1A 1FDYA 2PRLA 4NUWA 3T55A 3QYQA 2O7QA 4NVTA 3R89A 2Q8ZA 4RR4A 2CZ5A 1HO4A 3D0CA 3L9CA 1I8JA 3S8HA 5KZEA 3CPRA 2X1SA 1MEHA 4G1KA 4GRSA 4O15A 1FCUA 1BWLA 1H7WA 5E0KA 1LRNA 3DFTA 3NG3A 2NZLA 3W7HA 1EWDA 3HGSA 3QJAA 2YSWA 5I3GA 1O5XA 3NL3A 4HPJA 4NX5A 1QCWA 4O19A 1ALDA 3CIXA 4PODA 5EL1A 3TKFA 4AHOA 4JTHA 3G0SA 1UUOA 4HN4A 2WNQA 5D33A 4AHQA 2QCNA 4NXSA 4X22A 3LI1A 3W1NA 2NV1A 3TJLA 2X16A 4DO4A 5H91A 1EWEA 1GVFA 3A9IA 4CCEA 4UFJA 4RK8A 2ZYFA 4ZQCA 4FEZA 3BW3A 4LTSA 1I2PA 1D3HA 3EWZA 4IXHA 4JIQA 4Y6GA 2V0TA 3WJXA 1YDOA 1VCFA 1Q6QA 4JNMA 4K8HA 1I2OA 4WD0A 3V1PA 1SW7A 4O28A 5E1QA 3LHTA 4C1KA 3TC7A 2QJHA 5F2MA 3W07A 2QAFA 1TQJA 1OVDA 2VENA 2ZZ4A 2QJIA 4BF9A 5AC7A 2Z1BA 1SO3A 2J9ZA 3VE9A 1ZAJA 5DCBA 3UD6A 3W2KA 3FOKA 2NXIA 2ZRUA 3KRUA 2GOUA 1FCVA 2DZWA 5A5WA 1X1ZA 4YLWA 3C2OA 4X9SA 3UWZA 2DORA 4UNKA 3KXQA 3W22A 1PS9A 4KFPA 3HGOA 1QNVA 1DJQA 4NZJA 3C3NA 4LRSA 1JULA 5F4XA 3LRKA 1CI1A 3QW3A 1HFBA 4NNCA 3FS2A 1JCMP 3SGUA 4IX2A 5HUPA 2RDTA 1W3NA 2I9EA 4LT9A 4MJMA 3THAA 2HSAA 2C1HA 1ZENA 2WSYA 2VEKA 4I7VA 3W7KA 4RZ4A 3W7NA 2ZRVA 2WJZA 2ZA1A 4JYDA 1IIGA 2Y7DA 2BXVA 3LXBA 4NX0A 5FF7A 3G1AA 1TPUA 4KKXA 1AK5A 1TTQA 4UFIA 3IV3A 2GQAA 4P2VA 1ME7A 1ZHAA 2C3ZA 5EY5A 1I2NA 4YCOA 1LZOA 5CGQA 3MBDA 3PS7A 4DPQA 1KLZA 3PBUA 1LLWA 4WZHA 4XBKA 1DQXA 2Z2UA 4TIMA 1JCLA 2J9XA 4CNNA 4MKNA 3SY5A 2J24A 5HQEA 5EA9A 4JEQA 3DBPA 3QZEA 3G8RA 2R14A 4AEOA 5DXXA 3I7SA 2YGYA 3M5VA 3TQ0A 1RV8A 4N6EA 2DP3A 2Z6JA 1Q6LA 1DL3A 4OE7A 2J27A 1F76A 1UCWA 1SPQA 2QCLA 4JTSA 2I14A 3Q94A 4AWTA 4IMEA 1NVMA 2ISVA 2JKPA 1CX9A 5G2IA 4AWSA 1OFQA 3M9YA 4E2BA 4PCFA 3W84A 1FBAA 2C19A 3VI2A 3DAQA 2R8WA 3LB0A 3BPWA 4EF9A 2VFDA 1YLVA 2TYSA 3NM1A 1JRBA 3UWUA 1IIHA 4N4PA 4Q4KA 3WJSA 1Q6OA 1GWJA 3PB0A 3P74A 2A2IA 2QCGA 2EGZA 4RJEA 2H8XA 2NUYA 3GXNA 3ZWSA 3NPXA 2C16A 1NF7A 2VEPA 4AWUA 1A5CA 3G0XA 3C61A 4ZQNA 3L5LA 4O8RA 3OEXA 1WOBA 4A21A 3FKRA 1KM3A 1L6YA 2CFFA 4JTIA 1BTMA 4HNUA 3LHUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5G4EA

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