1K03 | Genus

Total Genus 145

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	145
sequence length	399
structure length	399
Chain Sequence	SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVNLWVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	NADPH DEHYDROGENASE 1
publication title	The role of glutamine 114 in old yellow enzyme pubmed doi rcsb
source organism	Saccharomyces cerevisiae
total genus	145
structure length	399
sequence length	399
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2001-09-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1k03A00

3W2KA 3C56A 1YTDA 3JS3A 5CZ0A 3HGJA 1VYSX 2W79A 2ZRXA 1LOQA 3ZWTA 2YR1A 3UZJA 4LV9A 3QH2A 4ZMGA 4YCOA 1Z48A 3L67A 4IUOA 1SU5A 2VENA 3SGUA 3UQNA 1VQTA 1TV5A 3THQA 1EPXA 5CG7A 4I7WA 4GUIA 1LBFA 1TMHA 4S1FA 4NVTA 2XFWA 3G3DA 4N2YA 4DO4A 3W7IA 1SW3A 4TMBA 1TYGA 1YXDA 3HG3A 5K9XA 3G1DA 2Z6JA 3DFQA 4I7UA 1ME9A 4FXSA 3DFNA 2YYTA 3QQ1A 1H61A 4DBEA 3PBUA 5AHIA 3QMTA 3SECA 4UXDA 5HR7A 2QKFA 4JEQA 3NL6A 5F4XA 3SJ3A 2ISSA 4N4PA 1SZNA 1FCBA 3DBPA 2BZNA 1H7RA 1M7PA 3LHVA 4GUJA 3GYEA 4JN6A 2B0MA 3PAJA 3G1YA 3F03K 4MZ8A 4LVBA 1GOXA 1TO3A 1LROA 3BLEA 1TV7A 3A23A 2J27A 1GVQA 4UTWA 3M5ZA 3G8EA 5C54A 2C0AA 4DBDA 3P62A 4MUZA 5C6MA 1KM5A 2RDUA 5EBUA 3MI2A 3E49A 3K30A 3FYPA 1JRBA 1Q45A 3RFAA 4UMBA 4Q33A 3SW6A 2PC4A 1XKYA 4JTKA 1JRCA 2WNZA 1THFD 3MP4A 1JUBA 1ADOA 2RH9A 1TB3A 4HHPA 3O15A 3TC7A 4DF2A 4TX9A 1N7KA 1H7XA 1TPVA 3OVPA 3STGA 4TO8A 3DHDA 1QCWA 1UUMA 2JGYA 4MY1A 3NOEA 4X2RA 2I14A 2VFIA 5H91A 5D09A 4QISA 4FX7A 5K4XA 3NO5A 3EX4A 2QUTA 1LTDA 4GFSA 2B7PA 5KZEA 5HULA 3S5ZA 1RQEA 3PUOA 2WSQA 1OFPA 2VFDA 1T99A 4N9DA 1WYIA 3O05A 3PBWA 3I7RA 2H3DA 4C1KA 1GTHA 1K7XA 5EL1A 5G2WA 1TPDA 4IXXA 1G7VA 4NNCA 4JX4A 1H50A 2QJIA 3TSBA 1LLZA 2Y89A 1FWSA 5J5RA 3W7JA 3MMTA 1TPUA 2R8WA 3NR0A 3P84A 1PHQA 3LI0A 4QJ1A 1QPNA 1P1XA 3NL3A 3CQ0A 1OJXA 5F2MA 3M5YA 1XI3A 1GJPA 3OG3A 4OHQA 4YL2A 2ABBA 4S2CA 3UWYA 6TIMA 3B0PA 3BG9A 5DXYA 1ZAIA 5KMYA 3EXSA 1TJPA 3W7HA 1UJPA 3KRZA 5BNKA 2X16A 3LTPA 2J24A 1VR6A 4K36A 4M19A 4WX2A 5TQLA 4UNLA 1D3GA 5U7SA 2VFEA 3STEA 1LBLA 4R7JA 3CIXA 1XBXA 5K4ZA 2X2GA 3DKLA 4CNNA 2QCMA 1KM4A 3V75A 3CT7A 4Y90A 4O52A 2ZTJA 1NSJA 2ZRZA 2TMDA 2HSAA 3W7PA 1H51A 3TKFA 2A6LA 3LCIA 3R13A 1VJIA 3W7LA 2ZZ2A 5H2ZA 4UNKA 2E1DA 5D03A 4KFOA 2E6AA 4X3ZA 2ZRUA 3ZS4A 3GKAA 4LVDA 4PODA 3TH6A 1SSGA 4YLWA 3KVKA 3LM7A 1WXJA 1RVGA 3W71A 3TFCA 2QCCA 2UV8G 2A7PA 3W7RA 1FDZA 2E5BA 3MI6A 1GT8A 3LGEA 3P67A 4POCA 2E09A 3SSJA 4A3UA 2HS6A 1R47A 2F7FA 4GUHA 4QNEA 3PB2A 5CPLA 1WAUA 2CZFA 1B4EA 1FDJA 2QEZA 4O8RA 5DCBA 3HOJA 4MZ1A 3S5YA 1ZALA 3LV5A 3H54A 2E6DA 3DFOA 3PG9A 4WZHA 3GDMA 3B0VC 1WBHA 4ZQPA 3W86A 1H1YA 1SUXA 1YXYA 2V2DA 3M6YA 2AGKA 1K7FA 1VCVA 4XUGA 3S9YA 2C15A 3N9SA 2J9ZA 2FTPA 4KWWA 3UWZA 5CPMA 4XKYA 2NZLA 3QW4B 2VFGA 3M47A 4IX2A 1W3IA 5D32A 1Z41A 2JGQA 1GYLA 1IXPA 3HPXA 3PY2A 3NPUA 4K8EA 5AN7A 5IBXA 3TU9A 3O6YX 3L21A 1HFBA 1FXPA 4D2JA 1G4PA 4QIUA 2NX9A 3NL5A 5I3IA 4LNYA 4ZQRA 3IVTA 3IIZA 2B7OA 3BVJA 4IJBA 4JYFA 3NVTA 3G22A 4LTSA 4E2DA 3WJZA 4GRSA 1W54A 1HL2A 5KSWA 5HJLA 1VLIA 3VCRA 5J5DA 2YX0A 4JYEA 3UPWA 4DO6A 3JR2A 1RZMA 4IQLA 1UASA 1PIIA 1EWEA 1WV2A 4QNWA 5AYXA 4X9SA 3Q94A 3FFSA 1K3UA 2V2CA 2J6XA 3TUUA 4JDBA 3N34A 4Z1BA 3G8RA 1J2WA 4QSHA 5G4WA 3WJXA 1I2OA 2J9YA 2BXVA 1PL9A 4FX8A 1KA9F 4J9JA 3O63A 1GZGA 3H53A 3T40A 1IXNA 1H5YA 3LI1A 3PWAA 1UCWA 5F2IA 3M44A 1O60A 5F4WA 4PTNA 4XTIA 4N6EA 5LNVA 2O7SA 5CZSA 3S8HA 2Y7DA 2B4GA 5IM51 3W7NA 1OF8A 2NV2A 4IMDA 4O1DA 3W1UA 1OX4A 4NNBA 1H7WA 4AWTA 4XKYB 2PURA 4OGZA 1W1ZA 2ZZ6A 1LOSA 2HMCA 3NM3A 2DORA 3LOTA 2JKEA 1KFBA 5I3JA 3QQ0A 3P80A 3M16A 2A7RA 4RK8A 2ZA2A 5AHEA 3BLIA 1JR1A 3DFSA 1O5KA 3GDRA 3JRKA 2WQPA 1GEQA 1LZOA 4NXKA 4NX5A 3ANYA 3DHFA 3KHJA 3W87A 5L6UA 4Y6GA 2GVGA 3FKKA 1XDMA 2ZQ0A 4O53A 3TSDA 3HGOA 4N9BA 5C55A 4Q4KA 1H63A 3LLDA 3EB2A 3G1SA 3C2OA 3LHUA 3CEPA 3W7EA 4ALDA 3TQKA 1Q3NA 1FY6A 2A1YA 1P5BA 2JBMA 2QCFA 3BGJA 2HTMA 4U28A 4FO4A 4UR7A 1M6JA 3KRUA 3A5FA 3WK2A 1JQVA 4AWSA 1ICQA 1TREA 3QF0A 1Q6RA 1H7NA 2ZCGA 3S1UA 1FX6A 2NXGA 3QSTA 1SO3A 1DHPA 1AW1A 2EPHA 3P5ZA 4UCGA 3SY5A 5LNSA 1TPWA 3GZ3A 4E38A 3IGXA 1XBVA 2YSWA 2Y61A 5F4SA 4EVZA 4RXGA 3DXIA 4ZQMA 1W5QA 3HMJG 1ZNNA 1WQ5A 2QCLA 1JQXA 5AC6A 5I3HA 4HNTA 4A2RA 2VFFA 3IVUA 3GAKA 4ICNA 1XUZA 1A5SA 1S5VA 2NXHA 4DPPA 1HO1A 1JCLA 1SW7A 1GYNA 2ABAA 4Y96A 1SO6A 1HTIA 3W2LA 4WY0A 1EX5A 3L0GA 1L6YA 1OX4B 4HPXA 1KM6A 3KAOA 1DJNA 4IXHA 2ZRYA 5K9CA 4GUFA 1X1OA 1HUVA 3O16A 4JTFA 1OVDA 1VCGA 5LGZA 4CCCA 3L2IA 1LDCA 3P81A 4NXSA 4A21A 4DEFA 2E77A 4FNRA 2GOUA 4GC4A 4HPJA 2CLHA 1UBSA 5G1YA 4CQAA 1VS1A 4O17A 5CPOA 3TC6A 1ML1A 3M5XA 3CC1A 4AH7A 2NX1A 3CTLA 2QCEA 3MUXA 1NFBA 4MFDA 4LUIA 1I2QA 4O10A 3DKJA 1QWGA 1WOAA 3HO8A 1PS9A 2WPBA 3G0SA 3KX6A 3S1VA 3PUDA 3R8RA 3T44A 3NEVA 1YDVA 1BTMA 3WFAA 3QEZA 4U4MA 1T0OA 2OT1A 1G4TA 4JY8A 5CKSA 3TXZA 1UB3A 1PCWA 3T4CA 3R2GA 1WBJA 1TTPA 2DJLA 1DJQA 3NQ8A 2QCGA 1S5WA 2GQAA 2Z2UA 4NU7A 4NZFA 1F6KA 1K8XA 2V0TA 3MHUA 3TQVA 3N2XA 3W2JA 5E0KA 1A50A 4JDYA 3W2NA 1AW2A 4BWLA 2GQ8A 2H90A 3S5OA 3ABOA 2RDTA 1L9WA 3I6RA 2H6RA 1ZFJA 4RKAA 4YCPA 3QYQA 3LB0A 1R30A 3T78A 4UTTC 3C0JA 3NQAA 4JTGA 4IMEA 3I65A 4MFEA 1TTJA 3A21A 2YGYA 1N8FA 1LLWA 1B9BA 3W83A 1YPIA 5GVJA 4OBTA 3PB0A 2EF9A 3NPWA 3UPBA 3G1HA 4GJ1A 2GJNA 3NAVA 2WV8A 3IGSA 2YW3A 3NPVA 1MSSA 3R5EA 5BOOA 2QJGA 2VEPA 2VFHA 3GXNA 1EA0A 4RCXA 3ATYA 2O7QA 3NM1A 3G1VA 4IMCA 4XZ9A 1YYAA 3OA3A 1DV7A 2YZRA 3P61A 3RMJA 4LT9A 2ZDRA 4M6QA 2VELA 1S3HA 3CLMA 1DBTA 2J88A 3KVJA 2BLEA 4UMAA 3IIVA 2NUWA 4LVFA 4GWEA 4IPIA 1VCFA 2ZRVA 4LOCA 5A8GA 1MEWA 2FB3A 4BI6A 3INPA 3EWYA 4NJIA 1KFEA 1OG0A 3W9ZA 1EIXA 4N02A 3AO0A 4AF0A 3U2OA 3EX1A 3PM6A 2QCDB 2CLLA 5KZMA 4FB7A 3W76A 4NT0A 3HIJA 3B06A 4PH6A 1HG3A 4NJHA 2TSYA 1SPQA 4BI5A 5AC8A 2EHHA 2NLIA 2QAFA 4ADTA 1VH7A 3STCA 4A2SA 2G5WA 1FCQA 4NNAA 3BLFA 1I8JA 4XTDA 3TXVA 4AHOA 2EGZA 3W2MA 5LNWA 5DXXA 4JX6A 3B05A 2A5HA 4LVGA 3C61A 1AK5A 5MHBA 4JIQA 1N55A 4MZYA 3GNDA 1X8FA 2IQTA 1MZHA 3TK7A 5BW6A 3UXDA 1AMKA 5G5IA 1YDNA 2Y62A 4HSNA 5FF0A 1W5PA 4CNOA 1F2JA 3RF9A 5F2LA 1LP6A 5EY5A 3LRKA 4LW7A 5HWNA 4UC5A 3C8FA 3PC0A 3RNDA 5D30A 4LS1A 3W1TA 2Z0IA 3LHYA 1BEUA 4HIBA 1GG0A 4LC8A 3T55A 1XBZA 3QM3A 1ZY9A 2FIQA 1RQHA 1C29A 4FEZA 5D37A 5DN1A 4FHAA 4ADUA 3O6CA 3W22A 4KWVA 2YCEA 1KV8A 3S0CA 1YDOA 2PE4A 3TA6A 3NA8A 4MKNA 4YXGA 5KZDA 3TR2A 1O4UA 4K7VA 4CLMA 5EYWA 4Z0JA 2FDSA 3EWWA 3CWOX 3W1MA 1JJKA 1AG1O 4MY9A 1BWKA 2C13A 5CGQA 4HNVA 1B57A 2ATMA 3BG5A 2EKCA 2Y7EA 4TU1A 3O07A 4JTIA 3M7WA 4AB4A 3HB9A 4OT7A 5FEXA 3W1QA 1GTEA 1K8YA 3LTSA 2V2HA 3HPZA 4ORIA 1FXQA 4AHQA 1I45A 5EKYA 1JCYA 3QRHA 2BSLA 4IWWA 1JUEA 2DZPA 3GX9A 4NJGA 1I2PA 3LHZA 1W56A 2GVJA 3TAKA 4UTTA 4JYDA 4MLJA 4E0CA 5K2ZA 4KFPA 1EP2A 1PHWA 3I7QA 1TIMA 5A5WA 1P4CA 3W07A 3NQGA 5D04C 4I7VA 1H7OA 1OFOA 3MYPA 1YTEA 1B3OA 1QPRA 4JTSA 2RDWA 3ABQA 3LHWA 4YMZA 3HJZA 1RR2A 4CQ8A 4Q32A 2Y85A 3S1XA 3HBLA 1ALDA 5HUPA 1G6CA 1EEPA 1F05A 3W1XA 4ADSA 2P1FA 3G1AA 3SGZA 2KZHA 2YYUA 4AEOA 2VXNA 5AOUA 1XBYA 3G0UA 2FPTA 4WXZA 3CIWA 1QNVA 1AL8A 3N14A 1GWJA 2XN1A 3GDTA 4BF9A 3USBA 1VC4A 2A21A 3EWUA 3FJ6A 5LHFA 1IIGA 4RX0A 5FEPA 3FEMA 2CLIA 1KV5A 1TQXA 5LHEA 1XM3A 3TV8A 4X22A 3HG5A 3DGRA 4O11A 1Z42A 1FCVA 5G4EA 3PS7A 3N3MA 2CLMA 1EUAA 2PRMA 3WK1A 5KINA 1G7UA 5LNUA 1SZEA 3QC3A 4LWWA 4LS0A 3W1AA 5DCEA 3O1NA 1G67A 1U83A 1DL3A 1W5NA 3N2MA 4MVAA 3S6DA 4ZQOA 3E02A 3S5NA 1I2NA 1NVMA 1BWLA 5FESA 2W0UA 3LXCA 4EWND 1W8SA 3A5VA 4Y8FA 2E6FA 1GVOA 1VZWA 2OMAA 3BK0A 4M7TA 1H62A 4RZ4A 4DO5A 4JICA 3TFXA 3FKRA 1E51A 2Q3RA 5F2GA 2DZVA 3P74A 1MEHA 3PBYA 4RXFA 1SZFA 1VLWA 5CZJA 4HNUA 2J9XA 1GG1A 3EX6A 3DENA 1CI1A 3SR7A 4RLIA 3HPSA 1RQBA 3KVLA 4WJEA 1RPXA 2QCHA 2X1SA 4OU1A 2E68A 4GNJA 3NQFA 4UFKA 1IF2A 5AFDA 4O0ZA 3VE9A 4MIMA 3QMSA 5D02A 1G69A 1KBIA 4GXMA 4LS2A 5KITA 1TPEA 2CLFA 2PCQA 4PL1A 1KFCA 3MHGA 4PEKA 3NZRA 3MBFA 4WOZA 1TSIA 3R12A 4BFAA 2XN0A 3SZ8A 2ZZ4A 4DF0A 3NQEA 5F1VA 2ZYFA 1L2UA 4AXKA 1EWDA 1I4NA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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